Descripción imagenJ

ImageJ es un programa de procesamiento de imágenes Java, que puede mostrar, editar, analizar,
procesar, guardar e imprimir imágenes de 8, 16 y 32 bits. Puede leer muchos formatos de
imagen, incluidos TIFF, GIF, JPEG, BMP, DICOM, FITS y "raw". Admite "pilas", una serie de
imágenes que comparten una única ventana. Es multiproceso, por lo que las operaciones que
requieren mucho tiempo, como la lectura de archivos de imagen, se pueden realizar en paralelo
otras operaciones.

Puede calcular estadísticas de valor de píxel y área de selecciones definidas por el usuario.
Puede medir distancias y ángulos. Puede crear histogramas de densidad y trazados de perfil de
línea. Admite funciones de procesamiento de imágenes estándar, como manipulación de
contraste, nitidez, suavizado, detección de bordes y filtrado de mediana.

Realiza transformaciones geométricas como escalado, rotación y volteretas. La imagen se puede

ampliar hasta 32: 1 y hasta 1:32. Todas las funciones de análisis y procesamiento están
disponibles con cualquier factor de aumento. El programa admite cualquier número de ventanas
(imágenes) simultáneamente, limitado solo por la memoria disponible.

La calibración espacial está disponible para proporcionar medidas dimensionales del mundo real
en unidades como milímetros. También está disponible la calibración de densidad o escala de
grises.

ImageJ fue diseñado con una arquitectura abierta que proporciona extensibilidad a través de
complementos de Java. Se pueden desarrollar complementos personalizados de adquisición,
análisis y procesamiento utilizando el editor integrado de ImageJ y el compilador Java. Los
complementos escritos por el usuario permiten resolver casi cualquier problema de análisis o
procesamiento de imágenes.
Ventanas
La ventana "ImageJ" contiene una barra de menú (en la parte superior de la pantalla en Mac),
una barra de herramientas, una barra de estado y una barra de progreso. Las imágenes,
histogramas, perfil de línea, etc. se muestran en ventanas adicionales. Los resultados de la
medición se muestran en la ventana "Resultados". Las ventanas se pueden arrastrar por la
pantalla y cambiar de tamaño. Los histogramas y los gráficos son ventanas de imágenes
normales que se pueden copiar al portapapeles, editar, imprimir y guardar.

Barra de herramientas

La barra de herramientas contiene herramientas para realizar selecciones, hacer zoom y

desplazar imágenes, y para cambiar el color del dibujo. Pase el mouse sobre una herramienta y
se mostrará una descripción en la barra de estado. Las herramientas y menús en el lado derecho
de la barra de herramientas se crean usando macros definidas en el archivo ImageJ / macros /
StartupMacros.txt.

Barra de estado

La barra de estado, cuando el cursor está sobre una imagen, muestra las coordenadas y los
valores de los píxeles. Después de ejecutar un filtro, muestra el tiempo transcurrido y la
velocidad de procesamiento en píxeles / segundo. Haga clic en el estado de y mostrará (como se
muestra arriba) la versión de ImageJ, la versión de Java, la memoria en uso, la memoria
disponible y el porcentaje de memoria utilizada.

Barra de progreso

La barra de progreso, ubicada a la derecha de la barra de estado, muestra el progreso de las

operaciones que requieren mucho tiempo. No aparecerá si la operación requiere menos de
aproximadamente un segundo.

Imagenes

ImageJ permite que se muestren varias imágenes en la pantalla a la vez. La ventana activa tiene
su barra de título resaltada. Todas las operaciones se realizarán sobre la imagen activa. ImageJ
admite imágenes en escala de grises de 8 bits, 16 bits y 32 bits (reales) e imágenes en color de 8
bits y 32 bits. Las imágenes de 8 bits se representan usando números enteros sin signo en el
rango de 0 a 255. Las imágenes de 16 bits usan números enteros sin signo (0 a 65,535) y las
imágenes en escala de grises de 32 bits usan números de punto flotante.

Las imágenes en escala de grises de 16 y 32 bits no se pueden visualizar directamente en los

monitores de computadora, que normalmente pueden mostrar solo 256 tonos de gris. Por lo
tanto, los datos se asignan a 8 bits mediante ventanas. La ventana define el rango de valores de
gris que se muestran: los valores debajo de la ventana se vuelven negros, mientras que los
valores arriba de la ventana son blancos. La ventana está definida por valores mínimos y
máximos que se pueden modificar usando Imagen / Ajustar / Brillo / Contraste .

Pilas

ImageJ puede mostrar múltiples imágenes relacionadas espacial o temporalmente en una sola
ventana. Estos conjuntos de imágenes se denominan pilas. Las imágenes que componen una pila
se denominan cortes. Todos los cortes de una pila deben tener el mismo tamaño y profundidad
de bits. Una barra de desplazamiento proporciona la capacidad de moverse por los cortes. La
mayoría de los filtros ImageJ procesarán, como opción, todos los cortes en una pila.

ImageJ abre archivos TIFF de varias imágenes como una pila y guarda pilas como TIFF de
varias imágenes. El comando Archivo, Importar, Sin formato abre otros archivos sin comprimir
de varias imágenes. Archivo, Importar, Secuencia de imágenes abre una carpeta de imágenes
como una pila. Para crear una nueva pila, simplemente elija Archivo, Nuevo, Imagen y
establezca el campo "Rebanadas" en un valor mayor que uno. El submenú Imagen,
Pilas contiene comandos para operaciones de pila comunes.

Trozos escogidos

Las selecciones son áreas o líneas definidas por el usuario dentro de una imagen. Solo una
selección puede estar activa a la vez. Las selecciones de área se crean utilizando las
herramientas de selección rectangular, elíptica, poligonal y a mano alzada. Las selecciones de
área se pueden medir (Analizar, Medir), filtrar, rellenar (Editar, Rellenar) o dibujar (Editar,
Dibujar) . Las selecciones de línea se crean utilizando las herramientas de selección de línea
recta, segmentada y a mano alzada. Utilice Editar, Dibujar para dibujar la línea en el color
actual. La longitud de las selecciones de línea se puede medir usando Analizar, Medir.

Las selecciones se pueden mover haciendo clic y arrastrando. La barra de estado muestra las
coordenadas de la esquina superior izquierda de la selección (o el rectángulo delimitador para
selecciones no rectangulares) mientras se mueve. Observe que el cursor cambia a una flecha
cuando está dentro de la selección. Para mover el contenido de una selección rectangular, en
lugar de la selección en sí, Editar> Copiar (c), Editar> Pegar (v), y luego hacer clic dentro de la
selección y arrastrar. Utilice las teclas de flecha para mover las selecciones un píxel a la vez en
cualquier dirección.

Las selecciones rectangulares y elípticas se pueden cambiar de tamaño. A medida que se cambia
el tamaño de la selección, el ancho y el alto se muestran en la barra de estado. Utilice las teclas
de flecha con la tecla alt hacia abajo para estirar las selecciones rectangulares o elípticas un
píxel a la vez.
Para eliminar una selección, elija cualquiera de las herramientas de selección y haga clic fuera
de la selección, o use Editar> Selección> No seleccionar ninguna (shift-a). Use Editar>
Selección> Restaurar selección (shift-e) para restaurar una selección después de haberla
borrado.

Una selección se puede transferir de una ventana de imagen a otra activando la ventana de
destino y usando Editar> Selección> Restaurar selección. Las selecciones se pueden guardar en
el disco usando Archivo> Guardar como> Selección y restaurar usando Archivo> Abrir. Utilice
el Administrador de ROI para trabajar con múltiples selecciones.

Formatos de archivo
El comando Archivo> Abrir abre imágenes TIFF, GIF, JPEG, PNG, DICOM, BMP, PGM y
FITS. También abre tablas de búsqueda y selecciones. Además, el submenú Archivo>
Importar proporciona acceso a complementos para leer archivos "sin procesar", imágenes en
formato ASCII y para cargar imágenes a través de la red mediante una URL. Para importar un
archivo sin procesar, debe conocer cierta información sobre el diseño, incluido el tamaño de la
imagen y el desplazamiento de los datos de la imagen. Los archivos se pueden guardar en
formatos TIFF, GIF, JPEG, PNG, PGM, FITS, texto delimitado por tabulaciones y sin
formato. Agregue soporte para formatos adicionales descargando o escribiendo
complementos. El complemento Bio-Formats de la Universidad de Wisconsin abre 69 formatos
de archivo de imágenes de ciencias biológicas diferentes.

Complementos
La funcionalidad de ImageJ se puede ampliar mediante el uso de complementos escritos en
Java. Los complementos pueden agregar soporte para nuevos formatos de archivo o pueden
filtrar o analizar imágenes. Los complementos ubicados en la carpeta "complementos" de
ImageJ se instalan automáticamente en el menú Complementos o se pueden instalar en otros
menús mediante Complementos / Teclas de acceso rápido / Instalar complemento. Los
complementos se pueden crear o modificar usando Complementos / Editar. Más de 150
complementos de ejemplo están disponibles para descargar desde el sitio web de ImageJ.

Tablas de búsqueda Las

imágenes en escala de grises se muestran mediante una tabla de búsqueda de colores que
describe el color que se utilizará para cada uno de los 256 posibles valores de píxeles
mostrados. Seleccione paletas de colores alternativas en el submenú Imagen / Tablas de
búsqueda. Utilice Imagen / Ajustar / Brillo / Contraste para mejorar las imágenes cambiando
dinámicamente el mapeo de la tabla de búsqueda y Analizar / Mostrar LUT para mostrar la tabla
de búsqueda de la imagen activa.