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Las clases anteriores se vio la bioquímica genética en cuanto a variantes o mutaciones que
se llegan a presentar a nivel cromosómico ya sea numérico donde se llegan a presentar los
problemas somicos y ploidicos o estructurales, que están las estables e inestables de las
estables vimos deleción duplicación y traslocación.
Las mutaciones que se ven son dentro del ADN o el gen, cuando se habla de mutación las
personas piensan en cosas como estas, ya que se tiene así por la ciencia ficción, también
como un super poder.
la gente cuando llega a una consulta y se les habla de mutación ellos no logran entender que
puede ser que es un cambio de un nucleótido por otro como por ejemplo una adenina por
una tiamina y que eso puede ocasionar problemas.
Esta tabla es para mirar que algunas enfermedades tienen mayor tasa de mutación, las tasas
altas la frecuencia alta habrá más casos, hay una pocas como la enfermedad de Huntington
como es una enfermedad degenerativa del adulto, como estos han tenido hijos y si una
persona tiene 10 hijos de ellos varios van a tener la enfermedad, pero la tasa de mutación
va a ser pequeña
GENETICA CLASE 6 VIERNES 28 AGOSTO 2020
Por niveles se está hablando de mutación cromosómica o a nivel del gen, cuando uno está
hablando de las clases se habla de la somática(que la mutación se presenta solamente en un
órgano del cuerpo ojo o corazón), después de la fecundación y de la germinal que el
espermatozoide o el ovulo venga con la mutación y por lo tanto todos las células de ese
organismo vengan con la mutación, es importante entender esto porque cuando se hacen
estudios se tiene que saber en qué tejido por ejemplo en el cáncer si es hereditario, los
mecanismos todos los seres vivos tenemos mutaciones espontáneas, pero nuestro
organismo corrige eso.
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● THE ONE BIG FLY HAD ONE RED EYE: esta es la frase normal
es importante tener en cuenta que de cada 3 nucleótidos tenemos un aminoácido
Missense
Tenemos una mutación de tipo missense, es la llamada también cambio de sentido, donde
se cambia una “E” por una “Q”, entonces el aminoácido que se va a producir es diferente,
ejemplo, cambio una arginina por una lisina y ese cambio puede que sea un cambio
patogénico al final, pero no sabemos si es un polimorfismo.
Este tipo de mutaciones missense tienen para nosotros un problema, y el problema es, ¿cuál
es el impacto real que tiene sobre la proteína? y el impacto puede ser, que sea patogénico y
que dañe completamente la proteína o que sea tolerable, que la proteína todavía pueda
funcionar y que no cause problema, entonces esos son unos de los problemas que se tiene
hoy en día, en la identificación de mutaciones, ya que se tiene que hacer secuenciación de
genes, de ADN y estamos identificando variantes.
Nonsense
Tenemos una mutación de tipo Nonsense, es sin sentido
En este tipo ocurre que, en un cambio de letra por otra, se genera un codón de stop o de
parada. (al buscar la tabla de nucleótidos con aminoácidos, nos daremos cuenta de que son
3 de stop), entonces al cambiar un nucleótido por otro puedo generar una mutación
nonsense o sin sentido.
Estas en general si son patogénicas, porque me van a generar una proteína truncada, si la
proteína era de gran tamaño, cuando tengo una nonsense, la proteína me queda por la
mitad o menos de la mitad y ahí producen daño.
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Para nosotros cualquier Nonsense fue patogénica siempre, pero hoy en día con muchos
estudios que se han realizado ya se entienden muchas cosas, hay que evaluar muy bien una
mutación de tipo nonsense, para ver si produce un impacto importante en la proteína ( la
mayoría sí lo produce).
¿Qué pasa si yo tengo una alteración de gran tamaño, y resulta que la alteración de la
mutación nonsense, en vez de ocurrir en la mitad, ocurre en uno de los extremos de la
proteína? puede ser que la proteína llegara a ser activa, siempre y cuando conservara el
resto de las funciones; por eso es por lo que una nonsense a pesar de que siempre la
consideramos patogénica, hoy en día debe estudiarse muy bien para saber si es patogénica
o no.
Frameshift
Frameshift, significa cambio del marco de lectura
En el ejemplo de la diapositiva, se puede ver que las 2 palabras están bien, pero el resto se
desordenó, ¿porque se desordenó? porque hubo una inserción de una “Q”, hubo una
inserción de un nucleótido, al insertar un nucleótido se corre el marco de lectura, cambia el
marco de lectura y de ahí en adelante todos los aminoácidos van a hacer diferentes.
Entonces, este frameshift se va a dar por deleción, inserción o por duplicación, PERO
diferentes a 3.
En la deleción, al quitar 3 nucleótidos, la proteína se queda sin ese aminoácido, lo cual le
puede ocasionar problemas graves a la proteína.
En la inserción, al añadir 3 nucleótidos tengo un nuevo aminoácido que puede dañar la
función proteica.
En la duplicación, al duplicar 3 nucleótidos, se duplica un aminoácido.
Enfermedad de Huntington
Fue escrita por George Huntington, en pacientes que tenían unos movimientos extraños
involuntarios de miembros. Negrette, médico venezolano logró llevar una serie de casos de
un pueblo que está lleno de personas con Huntington a un congreso mundial, donde estaba
la doctora Dressler, el interés de la doctora era muy importante, pues su papá sufría de
Huntington, entonces decide viajar a Venezuela, y se puso a evaluar los árboles
genealógicos de las familias, era tan importante de familias y de afectados que habían en
esa población, que este fenómeno de expansión de tripletas tiene un detalle que es una
enfermedad neurodegenerativa del adulto ( se presenta después de los 50 y 60 años), pero
a medida que se transmite de generación en generación, como la región es inestable se va
expandiendo cada vez más, cada vez que se expande, se daña más la proteína y se daña
más rápido, entonces la enfermedad se presenta más temprano y más severa; lo curioso de
esto, es que la mayoría estaban por arriba de 50 años, pero como ya habían tenido hijos,
nietos, etc. ya habían pasado de generación en generación esta alteración, entonces habían
niños con Huntington (que no es lo usual).
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Lo que hoy en día conocemos, es que las personas que no tienen la enfermedad de
Huntington o no la van a desarrollar, tienen los alelos por debajo o igual a 26 trinucleótidos.
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Cuando la región es 27-35 es normal, pero es inestable, ejemplo, cuando tengo 28 o 30, no
a mis hijos, pero si a mis nietos se podría expandir y presentar enfermedad de Huntington,
porque es un alelo normal, pero si mutable, por lo tanto, es una alteración dinámica.
¿Qué pasa entre 36 y 39? es una región muy compleja, porque si yo tengo una persona
presintomática (no ha tenido síntomas a la fecha) y le sale por ejemplo 38, es considerada
la llamada “zona gris”.
La zona gris es que hay personas con 38 que presentan todo el cuadro con la enfermedad
de Huntington y hay personas con 38 que jamás le da Huntington, eso es lo que se llama
penetrancia reducida, es decir, el alelo si es de Huntington, pero la penetrancia es unos
casos puede ser que le de la enfermedad y en otros casos que no le de la enfermedad.
Esta enfermedad final que lo que hace lo que hace es principalmente neurológica y lo que
va a dañar son los núcleos de la base y también la corteza cerebral
Son los dos puntos importantes que deterioran entonces cuando nosotros vemos
específicamente los núcleos del avance y la corteza lo que va a ocurrir es...
en esta gráfica que se los colocó acá este es un control normal fíjense que desde el punto
de vista de la parte cortical está bien, de la parte de los núcleos de la base están bien.
Pero ya estas tres imágenes que ven acá
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Este es un hd empezando o sea una enfermedad Huntington Iniciando (imagen HD2), esta
ya es cuando llegue por ahí unos cinco años (imagen HD3), esto ya es a los diez años
(imagen HD4) más o menos después de que arrancara sintomatología son diez años o doce
años y fallecen más o menos. Fíjense cómo se va alterando porque las neuronas se van
muriendo o sea las células se van muriendo se van destruyendo y se destruyen los núcleos
de la base, pero además de eso pues hay alteraciones del punto de vista cortical también,
entonces los pacientes tienen dos cosas fundamentales.
Ese es un estudio fotográfico del paciente con enfermedad de Huntington y lo que ustedes
están viendo acá es, miren la cantidad de movimientos que está haciendo durante esta
serie de fotografías porque vamos tomando las fotos de forma seriada y miren la cantidad
de gesticulaciones faciales que hace, los movimientos de los brazos, si se mueven todo el
tiempo, o sea son movimientos involuntarios todo el tiempo, ellos no se pueden quedar
quietos, todo el tiempo se están moviendo. Eso hace que es como si usted estuviera en un
gimnasio las 24 horas del día, por lo tanto, siempre son pacientes que son muy delgados,
son pacientes bien delgados porque todo el tiempo están con este tipo de movimiento
involuntario.
-A parte de su violencia que son dos cosas una es la parte de los movimientos y la otra cosa
es la demencia, son pacientes que comienzan tempranamente a olvidarse de las cosas a
hacer una demencia que ya cuando lógicamente está en los últimos cuatro años cinco años
ya es completa, o sea, los pacientes se pueden perder llegando a la casa, no reconocen a
la gente etc. Es una enfermedad bien compleja.
Bueno muy bien ese es para explicar un ejemplo lo que sería una expansión de tripletas,
hay muchas enfermedades con ese tipo de expansión de tripletas y eso se le llama
mutación dinámica.
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Bueno cuando yo tengo un cambio de un nucleótido por otro, hay otra cosa que tengo que
entender y es como se les llaman a esos cambios, dependiendo de la naturaleza del
cambio. Entonces una cosa es que yo cambié una pirimidina por otra pirimidina, porque si
ustedes recordarán la estructura de la pirimidina es una estructura que es de un solo anillo,
por lo tanto, este cambio es muy diferente a lo cambie una pirimidina por una purina porque
si yo cambio una pirimidina por una purina estoy cambiando un anillo por un doble anillo.
Entonces, digamos esto (Pi>P) es más complejo que lo de arriba (Pi>Pi), por tanto, hay
unos términos importantes:
Un término que significa Transversión y otro término que significa transición.
Qué es Transversión: es cambiar un nucleótido de una naturaleza por otro nucleótido de
una naturaleza diferente sí, o sea cambiar una purina por una pirimidina o una pirimidina por
una purina eso sería una transversión.
Por eso, ustedes ven que acá la línea continua me está diciendo si yo cambio una adenina
que es una purina por una citosina eso es una transversión, si cambio una timina por una
adenina eso es una transversión porque estoy cambiando una pirimidina por una purina.
Si cambio la purina adenina por una pirimidina citosina pues eso es una transversión
entonces aquí están los ejemplos de transversión
Que sería una transición: pues la transición es cambiar una pirimidina por una pirimidina o
una purina por una purina. Entonces si yo cambio una guanina por una adenina estoy
cambiando una purina por una purina, eso es una transición si cambian a citosina por una
timina es una transición porque estoy cambiando una pirimidina por otra pirimidina.
Entonces esto no se les vaya a olvidar porque esta es la forma como se describen en las
pruebas moleculares los cambios. Ha ocurrido una transición entre ta ta ta ta
Esta es la prueba molecular, le salió una variante en fn2 no creo que se vea, pero se lo voy
a leer listo esta es la prueba molecular, les voy a leer el pedacito para que me entiendan
pues porque nosotros vemos esto.
análisis del impacto proteico realizado a través de (human splicing finder) sugiere que la
variante en cuestión podría no afectar el splicing alternativo.
Bien, entonces esa es una variante que está en estudio porque precisamente no me está
diciendo que es patogénica, me está diciendo que es de significado clínico incierto.
Pero lo que les quería decir es que así vienen las pruebas las pruebas vienen diciendo: eso
es una transición o eso es una transversión, y entender eso significa que yo sé que es más
complejo cuando ocurre eso, o sea tener una transversión está más relacionado con
patogenicidad que tener una transición.
PREGUNTA DE CLASE 2:
¿Entonces uno podría tener una mutación en algún gen codificante y que estos otros que
regulan la arreglen?
RTA: De hecho, al final de la clase precisamente nos vamos a dedicar a esa parte, vamos a
ver lo que es la parte de que es lo que nos genera una mutación , de qué forma espontánea
o inducida se genera y los mecanismos de reparación. De hecho, cuando falla alguna
proteína de los mecanismos de reparación tenemos enfermedades que son llamadas así:
enfermedades de los mecanismos de reparación, entonces siempre que se presente una de
estas alteraciones los mecanismos estén allí para arreglarlo.
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Bien, una parte importante acá, digamos para poder entender este cuento es que las
mutaciones que nosotros tenemos no son ni buenas ni malas, para nosotros una mutación
es mala claro porque se genera enfermedad pues es mala.
Hay variantes que pueden darle mayor capacidad a una persona por ejemplo en deporte,
hay algunas variantes que producen mayor capacidad metabólica de oxigenación, etcétera
y esas variantes están demostradas y ya se reconoce y esa persona va a tener más
capacidades que otras desde el punto de vista biológico, el punto de vista natural. Son
variantes que están ahí establecidas y que no son de enfermedad, sino que potencian a una
persona.
Hay otras variantes que a pesar de que no sean enfermedad sí pueden causar algún
problema, o sea, la gente ni siquiera sabe si realmente tiene ese problema, por ejemplo
ustedes han escuchado el término de amusia, es, o sea la persona escucha perfecto
escucha perfecto, no tiene un problema de sordera, es un problema de reconocimiento de
notas y de reconocimiento de tiempos o sea, puede existir una amusia de tipo temporal y
puede existir una amusia de tipo de notas. De hecho, hay una página donde uno se mete y
le dan unos ejercicios, hay unos sonidos y uno dice si está arriba, si está abajo, hay unos
tiempos que uno tiene que seguir y con el teclado le tiene que dar a los tiempos y ahí se
hace un test para ver si usted es una persona amúsica o no.
Eso sería muy importante hacérselo a toda persona que, entre un conservatorio musical, o
sea, a mí me puede gustar demasiado los instrumentos y la música y decir, pero es que yo
quiero ser músico, pero si usted tiene una variante en un gen que genera amusia, usted
podrá decirlo todo lo que quiera, pero mejor póngase hacer otra cosa.
Cuando ustedes vean una persona bailando y vean que esa persona tiene un tiempo en el
otro, piensen que esta persona puede ser amúsica, puede tener amusia, mejor dicho. Por
qué, porque no reconoce la rítmica no hay forma de reconocer la rítmica, y uno dice, pero
esta persona si baila, pero desastrosamente, bueno, pero es porque sucede tiene amusia
pues.
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Entonces hay variantes que generan problemas como enfermedades muy importantes y
otras como ésta, que la gente ni se da cuenta que es una persona con amusia, pero que sí
puede ser muy frustrante para una persona que entró en un conservatorio musical que no
puede rendir y no rinde porque simplemente tiene amusia y la gente le cae encima diciendo:
no pero usted porque no afina, usted por qué no pega esa nota, porque no pega la rítmica,
porque no está con el clic todo el tiempo, es una persona con amusia y no lo puede hacer.
Las variantes no son ni buenas ni malas, son variantes, allí las tenemos y es ver como se
colocan, como se coloca ese individuo y como sobrevive al ambiente.
Mutaciones Fortuitas: Todo el tiempo las estamos presentado, digamos que el primer grupo
importante son las deaminaciones o desaminaciones, lo van a conseguir con ese término
también desaminación o deaminación: ¿qué significa eso? significa que algún nucleótido
que tienen este grupo de tipo amino, acá, de forma espontánea lo pierde. No hay un
mecanismo, simplemente lo pierde y se cambia por un oxígeno, a eso se llama
desaminación de una espontanea.
La adenina por su parte, si pierde el grupo amino y se cambia por el oxígeno, va a cambiar
hacia una hipoxantina que tampoco es componente de nucleótido presente en el ADN, por
lo tanto, eso genera mutación.
La depurinaciones pues
básicamente como está ahí escrito, son las rupturas del enlace n-glicosídico, que es este
enlace que esta acá, se rompe y luego queda libre, se libera la guanina por ejemplo, esto
ocurre tanto para guaninas como para adeninas y una célula de mamífero pierde 10.000
purinas cada 20 horas a 37°c de forma a espontanea, es decir que de la noche a acá
ustedes han perdido una gran cantidad de purinas, lo que pasa es que afortunadamente
esos sitios apurinicos son reparados, pero donde no se reparen causan mutación y por
tanto problemas.
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O sea cuando yo tengo un gen saltarín quiere decir una secuencia que va a ser un transposón al final,
lo que va a ser un proceso de inserción en un ADN imagínese Uds. que esta secuencia se inserta en
el axón 3 del gen para Marfan por ejemplo, pues me daña la proteína, la daña completamente, eso
es una forma fortuita que es al azar, afortunadamente la evolución ha hecho que la gran cantidad de
elementos transponibles que se dan naturalmente evolutivamente han quedado como inactivos, o
sea, hay una buena parte de secuencias que tienen toda la estructura de un elemento transponible
pero que ya no hacen ese proceso de movimiento, no sabemos porque, evolutivamente ha sido así,
y existen se han hecho unos cálculos de diferenciación entre los primates y los seres humanos, o sea
los primates digo es un primate, lo que quiero decir es comparativamente con otras especies que
pertenecen a nuestra misma rama y se ha visto evolutivamente hablando como han sido los
cambios, los cálculos de elementos transponibles y se han calculado unos 6 millones perdón en estos
últimos 6 millones de años digámoslo así se han calculado 11mil millones de transposiciones entre
las especies que en los últimos no sé cuántos años exactamente, más o menos unos 300 o 400 años,
se ha visto específicamente que esos elementos de transposición se han venido guardando,
aplacando en el contexto del paso del tiempo, afortunadamente porque estas son alteraciones que
pueden dañar muchos genes si fueran muy frecuentes. Esas son alteraciones fortuitas, al azar.
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Las radiografías dan un proceso de radiación, pero por ejemplo hacer una tomografía de tórax
equivale más o menos a 500 o 600 radiografías de tórax, así que la radiación de una tomografía es
bastante grande si, entonces todo ese tipo de cosas son fundamentales porque eso genera
mutaciones.
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Entonces cualquiera de estos agentes nos puede generar e inducir las alteraciones o las
mutaciones. Una cosa importante la idea es que todos utilicemos protector solar, esa es la
idea si, lo único que puede más o menos verificar en nosotros y protegernos algo y
protegernos digamos en contra del envejecimiento, porque contra eso no hay protección o
sea es algo que todos vamos a tener que pasar, entonces ya lo que tenemos es un crema
maravillosa para no envejecer, no la compren, no sirve para nada no toda seguridad se los
puedo decir, no sirve para nada, que es lo único que si sirve cremas hidratantes y
protectores solares, eso es lo único que sirve, si ustedes en este momento tienen una
crema que dice con colágeno, con células madre, la pueden botar jajaja o sea terminan esta
clase, la leen y la botan a la basura, uy colágeno a la basura, no sirven para nada, o sea el
colágeno es una macromolécula que no logra ingresar a través de la epidermis, no sirve
para arreglar nada, las célula madres menos, las células madre que posiblemente están
muertas, o sea no tiene ni sentido, las cremas hidratantes si mantienen o mejoran por el
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Peor aún si tienen por allá colágeno tomado, si ustedes o sus papas son los que tienen
colágeno tomado, vean ese colágeno tomado lo que hizo fue perder la plata, porque, así
como lo toma lo bota.
Estudiante: Profe es que yo me hecho colágeno en el cabello, ¿el cabello es como algo
aparte o no?
Estudiante: Profe, por ejemplo, ¿aquellas personas que tienen enfermedades genéticas
relacionadas con deficiencias de colágeno, ellas no tomarían o no les sirve de nada
consumir colágeno?
Profe: nada, en lo absoluto, nada es nada, esa es una pregunta que me hacen cada vez
que yo hago ese diagnóstico de mutaciones COL1A1, COL1A2, COL1A7 que son
elementos de colágeno, esa pregunta es constante en las familias, doctor ¿y si toma
colágeno?, nopppp, no es no, no le sirve y siempre me hacen esas preguntas.
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Entonces si yo tengo cualquiera de esas mutaciones, que vimos anteriormente, voy a tener
sistemas de reparación, algunos van a ser de reparación directa, el cual en nosotros es un
mecanismo que existe, pero es muy ineficiente, no funciona muy bien como lo hace en
procariotas u otro tipo de organismos, lo que a nosotros nos funciona muy bien es el
mecanismo de reparación indirecta, como lo son:
- Escisión de base
- Escisión de nucleótidos
- recombinación de regiones homóloga
Acá hace falta uno que vamos a ver ahorita, que es la reparación por error de apareamiento
de base, pero en esta tabla están como resumido los diferentes mecanismos de reparación,
faltando ese.
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Hay una forma de reparación directa, por ejemplo, en lo procariotas, para una cosa que se
llama formación de dímeros de timina, los dímeros de timina se generan o producen por la
luz ultravioleta, y esa luz genera unos enlaces, cuando yo tengo timina y timina, cuando yo
sé que están al lado, hacen unos enlaces que no deben estar ahí, por que generan
problemas de reproducción y transcripción. Las procariotas tienen una enzima que se llama
fotoliasa, y cuando se aproxima al dímero, y automáticamente en conjunto con liz, se hace
un proceso de activación, y se elimina el enlace que hay entre las 2 timinas, y la enzima
simplemente sale y ya, digamos que el enlace adicional, tomen en cuenta que este sería
como el enlace adicional (el que se encuentra como una montañita en la imagen, el A), este
sería el enlace normal que existe entre un nucleótido y otro (el sencillo, el D), luego se
libera.
Nosotros también generamos dímeros de timina todo el tiempo, pero nuestro mecanismo de
reparación para dímeros de timina no es una fotoliasa, es un conjunto de proteínas, de
estos mecanismos de forma indirecta.
Tenemos que hay mutágenos químicos, que pueden generar este tipo de alteración,
cualquiera de estos que ven acá (imagen), que los tenemos también en medicamentos
(flecha), en comidas, que tiene elementos tipo mutágeno, que nos pueden generar cambios,
pero afortunadamente para estos elementos químicos donde tenemos esos cambios, una
gran mayoría sí se pueden corregir por los mecanismos de reparación, pues estamos
sometidos a un montón de cancerígenos y de cosas químicas, entonces afortunadamente
tenemos estos mecanismos, para poder hacer la reparación.
Estos elementos químicos (imagen), cuando se tiene que hacer un proceso de reparación,
porque esos elementos químicos producen una alteración, principalmente participan los
mecanismos indirectos, no mecanismos directos.
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entonces va a transportar ese punto hasta la parte de su nucleasa, para que se corrija y
luego siga el proceso de polimerización, ese es un mecanismo hasta cierto punto directo,
funciona, pero no es tampoco tan eficiente, pero de alguna manera, por lo menos reduce la
cantidad de mutaciones que se pueden llegar a presentar
Ahora miremos los sistemas que son independientes de la polimerasa, que son:
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el sistema de
apareamiento correcto, que este no está en la tabla que yo les mostré anteriormente.
Pero, el sistema NER, que es el sistema de escisión de nucleótidos, y el sistema BER, que
es el sistema de escisión de bases, y por último sería el sistema de reparación de ruptura
de ADN, esta ruptura de ADN es la más agresiva y compleja, por que rompe la cadena de
ADN.
Ahí yo les estoy colocando esas enzimas, pero pueden ser otras, acá por ejemplo están
estas otras, esto es un complejo enzimático completo, que hace este proceso de
reparación, por error de apareamiento de bases, entonces acá lo importante es que es
diferente a la reparación directa, porque en esa al nucleótido se le hace un cambio
bioquímico, pero en esta hay que retirarlo y volverlo a poner, pero con ese sitio de control
de regulación.