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Bases físicas de los fenómenos

bioeléctricos
Introducción

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Electroestática
Parte de la física que se
Carga
• Intervienen las encarga de estudiar
masas de los
gravitacional
cuerpos. fenómenos asociados a
cargas eléctricas en
reposo.

• Intervienen fuerzas Carga elemental


Carga de repulsión.
eléctrica • Independientes de
la masa.

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Osorio-Tobón Ph.D.
La carga eléctrica

Fuente: Sears y Zemansky (2010)


BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
¿Qué fue lo que
sucedió con la varilla La suma algebraica de
cuando se carga? todas las cargas
eléctricas en cualquier
sistema cerrado es
constante.
Fuente: Sears y Zemansky (2010)

La magnitud de la carga
del electrón o del
protón es la unidad
natural de carga.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Conductores vs Aislantes
Fuente: Sears y Zemansky (2010)

El citoplasma es muy buen conducto pero la


membrana se comporta como un aislante.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Carga por inducción
Fuente: Sears y Zemansky (2010)

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ley de Coulomb
• En 1784 Charles
Augustin de Coulomb
(1736-1806) estudió
con mucho detalle las
fuerzas de atracción de

Fuente: Sears y Zemansky (2010)


partículas cargadas.
• Usó una balanza de
torsión.

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Osorio-Tobón Ph.D.
𝑞1 𝑞2 1
𝐹 = 𝐾𝑒 𝐾𝑒 =
𝑟2 4𝜋𝜀0

Fuente: Sears y Zemansky (2010)


F: fuerza de atracción o repulsión entre las
cargas. (N).
q1 , q2: cargas en Coulomb. (C). (1 C equivale
a la carga 6 x 1018 electrones)
r : distancia que separa a las cargas. (m).
Ke: constante de Coulomb. (9x109 Nm2/C2
en el aire o en el vacío).
ε0: permitividad en el vacío . (8.84x10-12 C2
/Nm2)

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Osorio-Tobón Ph.D.
¡Nota!

En problemas de ¡Dos cargas de 1 C se-


electrostática es muy paradas 1 m ejercerían
raro encontrar cargas fuerzas entre sí de 9 3
tan grandes como de 1 109 N (cerca de 1
coulomb. millón de toneladas)!

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Osorio-Tobón Ph.D.
Principio de Superposición
La fuerza sobre una carga
en reposo debida a otras
también fijas actuando
simultáneamente, es igual
a la suma vectorial de las
fuerzas ejercidas por cada
una de ellas actuando por
separado como si las
Fuente: http://physicscatalyst.com/elec/charge_1.php
demás no existiesen.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
• Dos cargas puntuales, q1=+25 nC y q2=-75 nC
están separadas por una distancia de 3.0 cm.
Calcule la magnitud y la dirección de:
a) la fuerza eléctrica que q1 ejerce sobre q2.
b) la fuerza eléctrica que q2 ejerce sobre q1.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
• Si la carga q2 no se mueve, halle la carga q3 en
términos de q.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
• Si la fuerza neta que actúa en q2 es F2, determine
la carga de q3 en términos de q.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
• Dos cargas puntuales iguales y positivas, q1=q2 = 2.0 µC se
localizan en x = 0, y = 0.30 m y x = 0, y =-0.30 m,
respectivamente. ¿Cuáles son la magnitud y la dirección de la
fuerza eléctrica total que ejercen estas cargas sobre una
tercera carga, también puntual, Q = 4.0 µC en x = 0.40 m, y =
0?

Fuente: Sears y Zemansky (2010)


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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
• En una reacción química, los dos extremos de
la molécula de ADN de 2,45 µm de longitud
adquieren sendas cargas de valor +e y –e,
respectivamente. ¿Cuál será la fuerza entre los
dos extremos de la molécula?

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
• Determine la fuerza resultante en q2 en el
diagrama si q1 = 3,00 µC, q2 = 5,00 µC, q3 =
4,00 µC, r12 = 0,5 m y r23 = 0,5 m.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
Se colocan 4 cargas
puntuales en las esquinas de +Q + d - -Q
una cuadrado de lado d
como se muestra en la
figura. A) Calcule la fuerza
neta (magnitud y dirección) d
sobre cada carga. B) Si se
coloca una quinta carga de
valor +Q en el centro del
cuadrado ¿Cuál será la -Q - + +Q
fuerza neta que actúa sobre
ella?

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
• Una partícula con carga q1 = -0,4e se ubica en
x = 0 m y otra partícula con carga q2 = +3e se
ubica en x = 0,63 m. En que posición del eje x
se podría colocar una tercera partícula para
que el sistema se encuentre en equilibrio
electroestático.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Campo eléctrico
La fuerza eléctrica sobre un cuerpo
cargado es ejercida por el campo
eléctrico que otros cuerpos cargados
originan.

Fuente: Sears y Zemansky (2010)


Fuente: Sears y Zemansky (2010)

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Osorio-Tobón Ph.D.
El campo eléctrico de una carga
puntual
El campo eléctrico en
cierto punto es igual a la
fuerza eléctrica por unidad
de carga que una carga
Fuente: Sears y Zemansky (2010)

experimenta en ese punto.

𝑞
𝐸 = 𝐾𝑒 𝑟 𝐹 =𝑞∙𝐸
𝑟2

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Osorio-Tobón Ph.D.
• La intensidad del campo El CE puede variar de un
disminuye conforme la punto a otro, no es una
distancia aumenta. cantidad vectorial única,
• Se representa mediante sino un conjunto infinito
líneas que salen de las de cantidades
cargas positivas y entran vectoriales, cada una de
en las cargas negativas. las cuales está asociada
con un punto del
espacio.
Fuente: Sears y Zemansky (2010)

Ex (x, y, z); Ey (x, y, z); Ez (x, y, z)

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Osorio-Tobón Ph.D.
Líneas de campo eléctrico
• Entre más juntas más potente es el campo eléctrico.
• Las líneas tienen una dirección única y nunca se cruza.
Fuente: Sears y Zemansky (2010)

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
• Una carga puntual q =-8.0 nC se localiza en el
origen. Obtenga el vector de campo eléctrico
en el punto del campo x = 1.2 m, y =-1.6 m.

Fuente: Sears y Zemansky (2010)

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Osorio-Tobón Ph.D.
El campo eléctrico de cargas
distribuidas en el espacio
• La mayoría de las
situaciones reales

Fuente: Sears y Zemansky (2010)


implican campos y
fuerzas eléctricas, se
encuentra que la carga
está distribuida en el 𝐹0
𝐸= = 𝐸1 + 𝐸2 + 𝐸3+⋯
espacio. 𝑞0

• Se utiliza el principio de
superposición.
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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
• Dos cargas puntuales q1
(0,0) y q2 (10,0) de +12 nC
y -12 nC, respectivamente
(Dipolo eléctrico). Calcule

Fuente: Sears y Zemansky (2010)


el campo eléctrico
causado por q1, el campo
eléctrico causado por q2,
y el campo total : a)en el
punto (6,0); b) en el
punto (-4,0); y c) en el
punto (5,12).
• NOTA: LAS DISTANCIAS ESTÁN EN
CENTIMETROS.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
• Las proteinas chaperonas tienen una subunidad llamada GroEL, la
cual tiene forma de anillo. Si la Groel tiene un radio a y tiene una
carga total Q distribuida de manera uniforme en todo su perímetro
(figura). Encuentre el campo eléctrico en el punto P que se localiza
sobre el eje del anillo a una distancia x del centro.
Fuente: Sears y Zemansky (2010)

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
• Dos cargas puntuales se encuentran sobre el
eje x, como se ilustra en la Figura. Identifique
todos los lugares donde el campo eléctrico es
0.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Energía potencial
• El trabajo (𝑊) realizado por la fuerza eléctrica sobre una partícula con
carga que se mueve en un campo eléctrico se representa por el cambio en
una función de energía potencial 𝑈.
• 𝑈 aumenta si la carga se mueve en sentido opuesto a 𝐹.
𝑏
𝑊𝑎→𝑏 = 𝐹 𝑑𝑙 = 𝑈𝑎 − 𝑈𝑏 = −∆𝑈
𝑎
Fuente: Sears y Zemansky (2010)

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Osorio-Tobón Ph.D.
Energía potencial
entre cargas puntuales
El trabajo efectuado por la fuerza
• La fuerza no es constante durante
eléctrica para esta trayectoria particular
el desplazamiento, y se tiene que depende
integrar para obtener el trabajo sólo de los puntos extremos.
Wa→b. 𝑟𝑏
• W efectuado depende sólo de los 𝑊𝑎→𝑏 = 𝐹𝑟 𝑑𝑟
puntos extremos 𝑟𝑎
La energía potencial eléctrica entre dos cargas
puntuales q y q0
𝑞𝑞0
𝑈 = 𝐾𝑒
𝑟
La energía potencial siempre se define en
relación con algún punto de referencia
donde 𝑈 = 0.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Energía potencial
eléctrica con varias cargas puntuales
• El campo eléctrico total en
cada punto es la suma
Fuente: Sears y Zemansky (2010)

vectorial de los campos


debidos a las cargas
individuales, y el trabajo
total realizado sobre q0
𝑞1 𝑞2 𝑞2 𝑞𝑖 durante cualquier
𝑈 = 𝐾𝑒 𝑞0 + + +⋯ = 𝐾𝑒 𝑞0
𝑟1 𝑟2 𝑟2
𝑖
𝑟𝑖 desplazamiento es la suma
de las contribuciones de
𝑞𝑖𝑗
𝑈 = 𝐾𝑒 𝑞0 las cargas individuales.
𝑟𝑖𝑗
𝑖<𝑗

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
• Dos cargas puntuales se localizan en el eje x,
q1 = -e en x = 0 y q2 = e en x = a. a) Determine
el trabajo que debe realizar una fuerza
externa para llevar una tercera carga puntual
q3 = e del infinito a x = 2a. b) Determine la
energía potencial total del sistema de tres
cargas.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Potencial eléctrico
𝑈
• Es la energía potencial 𝑉= ó 𝑈 = 𝑞0 𝑉
𝑞0
por unidad de carga.
• 1 V = 1 volt = J/C.
• La diferencia de potencial
entre dos puntos con

Fuente: Sears y Zemansky (2010)


frecuencia se denomina
voltaje.
• El instrumento que mide
la diferencia de potencial
entre dos puntos se llama
voltímetro.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Calculo del potencial eléctrico
Carga 𝑈 𝑞
•𝑉 = = 𝐾𝑒
puntual 𝑞0 𝑟

Conjunto de • 𝑉 = 𝑈 = 𝐾 𝑞𝑖
𝑞 𝑒 𝑖𝑟
cargas 0 𝑖

Distribución 𝑑𝑞
• 𝑉 = 𝐾𝑒
de cargas 𝑟

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
• Un dipolo eléctrico consiste en dos cargas
puntuales, q1 = 12 nC y q2 = -12 nC, colocadas
a una distancia de 10 cm una de la otra.
Calcule los potenciales en los puntos a, b y c.

Fuente: Sears y Zemansky (2010)

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Osorio-Tobón Ph.D.
Superficies equipotenciales
• Superficie tridimensional sobre la que el
potencial eléctrico V es el mismo en todos los
puntos.
• Nos ayudan a visualizar los campos eléctricos.

Fuente: Sears y Zemansky (2010)


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Osorio-Tobón Ph.D.
Gradiente de potencial
• El campo eléctrico y el 𝜕𝑉 𝜕𝑉 𝜕𝑉
potencial se relacionan 𝐸𝑥 = − 𝐸𝑦 = − 𝐸𝑧 = −
𝜕𝑥 𝜕𝑦 𝜕𝑧
estrechamente. 𝜕𝑉 𝜕𝑉 𝜕𝑉
𝐸=− 𝑖 +𝑗 +𝑘
• Si se conoce el potencial 𝜕𝑥 𝜕𝑦 𝜕𝑧
V como función de las
𝐸 = −𝛻𝑉
coordenadas x, y y z, las
componentes del campo 𝜕𝑉
𝐸𝑟 = −
𝜕𝑟
eléctrico en cualquier
punto están dadas por las
derivadas parciales de V.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
• Para un anillo de carga con radio a y carga total Q, el potencial en el punto
P sobre el eje del anillo a una distancia x del centro es.
𝑄
𝑉 = 𝑘𝑒
𝑥 2 + 𝑎2

Encuentre el campo eléctrico en P.


Fuente: Sears y Zemansky (2010)

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Osorio-Tobón Ph.D.
CAPACITANCIA Y DIELÉCTRICOS

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Osorio-Tobón Ph.D.
• Un capacitor es un
dispositivo que
almacena energía
potencial eléctrica y
carga eléctrica.
• Se aíslan dos

Fuente: Sears y Zemansky (2010)


conductores entre un
aislante y es establecido
un campo eléctrico.

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Osorio-Tobón Ph.D.
• La capacitancia es una
Se debe cargar medida de la aptitud
+Q→-Q
el capacitor (capacidad) de un capacitor
para almacenar energía.
𝑄 • 1 F = 1 C2 N-1m-1 =1 C2 J-1.
EyVαQ C= • Del orden de
𝑉𝑎𝑏
𝜇𝐹 10−6 𝑦 𝑝𝐹(10−12 ).
• Para un capacitor de placas
paralelas en el vacío (𝜖0 =
8,85𝑥10−12 𝐹
𝑚).
𝑄 𝐴
𝐶= = 𝜖0
𝑉𝑎𝑏 𝑑

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Osorio-Tobón Ph.D.
Aplicaciones de los capacitores
Circuitos
Flash
eléctricos

Potencial de
membrana
https://www.youtube.com/watch?v=5qwCmyETAvA

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
• Las placas paralelas de un capacitor con vacío
están separadas una distancia de 5.00 mm y
tienen 2.00 m2 de área. Se aplica una
diferencia de potencial de 10,000 V (10.0 kV) a
través del capacitor. Calcule a) la capacitancia,
y b) la carga en cada placa.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Capacitores en serie
• En una conexión en serie, la • En una conexión en serie, la
magnitud de la carga en magnitud de la carga en
todas las placas es la todas las placas es la
misma. misma.

Fuente: Sears y Zemansky (2010)


Fuente: Sears y Zemansky (2010)

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Osorio-Tobón Ph.D.
Capacitores en paralelo
• La diferencia de potencial • La capacitancia equivalente
para todos los capacitores de una combinación en
individuales es la misma. paralelo es igual a la suma
de las capacitancias
individuales

Fuente: Sears y Zemansky (2010)

Fuente: Sears y Zemansky (2010)


BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
• Encuentre la capacitancia equivalente de la
combinación que se muestra en la figura.

¿Cual será
Fuente: Sears y Zemansky (2010)

la carga
neta si se
aplica
un
potencial
de 120 V?

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Osorio-Tobón Ph.D.
Dieléctricos
• Material no conductor o
dieléctrico.
• Mantiene las superficies

Fuente: Sears y Zemansky (2010)


sin que hagan contacto.
• Potencian las diferencia
de potencial.
• Su capacitancia es mayor
que en el vacío.
• Constante dieléctrica 𝐾 =
𝐶
.
𝐶0
• Para el vacío 𝐾 = 1.

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Osorio-Tobón Ph.D.
• La estructura de la bicapa lipídica actúa como un
excelente capacitor.
• Los canales iónicos crean un arreglo de capacitores en
paralelo.
• La capacitancia de una célula es mayor en cuanto
mayor sea su tamaño.
• La célula tiene una capacitancia de 1 µF cm-2.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Fuente: Sears y Zemansky (2010)

En la membrana de un axón K=8

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Osorio-Tobón Ph.D.
Corriente eléctrica
• Una corriente eléctrica
es todo movimiento de
carga de una región a
otra.
• Si no hay campo

Fuente: Sears y Zemansky (2010)


eléctrico en el interior
de un conductor, un e-
se traslada al azar.
• Con un campo eléctrico,
la fuerza eléctrica causa
movimiento.
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Osorio-Tobón Ph.D.
Intensidad de Corriente Eléctrica
• El campo eléctrico realiza
un trabajo sobre las
cargas en movimiento.
• Las cargas de las

Fuente: Sears y Zemansky (2010)


partículas en movimiento
son positivas o negativas.
• La corriente eléctrica (I)
va en la dirección en la
que hay un flujo de carga
positiva.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Densidad de corriente
• Es corriente por unidad de área de la sección
transversal.
𝐼
• 𝐽= = 𝑛𝑞𝑣𝑑
𝐴
• A m-2.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
• Un alambre de cobre del número 18 (el calibre que
por lo general se utiliza en los cables para lámparas),
tiene un diámetro nominal de 1.02 mm. Conduce
una corriente constante de 1.67 A para alimentar una
bombilla de 200 watts. La densidad de electrones
libres es de 8.5 x 1028 electrones por metro cúbico.
Determine las magnitudes de a) la densidad de
corriente y b) la velocidad de deriva.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Resistividad
• La densidad de corriente J en un • La resistividad es la razón de las
conductor depende del campo magnitudes del E y la J.
eléctrico E y de las propiedades
del material.
• A una temperatura dada, J es casi • (V/m)/(A/m2) = V · m/A
directamente proporcional a E.
• 1 V/A = un ohm = 1 Ω
• Ley de Ohm.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Resistencia
• la un conductor de
sección transversal
uniforme es directamente
proporcional a su
longitud e inversamente
proporcional al área de su
Fuente: Sears y Zemansky (2010)

sección transversal.
• Es proporcional a la
resistividad del material
del que está hecho el
conductor.
𝜌𝐿 𝑉 • 1 Ω = 1 V/A
𝑅= =
𝐴 𝐼

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Osorio-Tobón Ph.D.
¿Como así?
Una manguera angosta ofrece más
resistencia al flujo que una ancha, y
una manguera larga tiene más
resistencia que una corta. Se puede
incrementar la resistencia al flujo si
se rellena la manguera con algodón o
arena; esto equivale a aumentar la
resistividad.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Fuerza electromotriz
• Dispositivo que actúe como la bomba hidráulica
de la fuente.
• La influencia que hace que la corriente fluya del
potencial menor al mayor se llama fuerza
electromotriz (fem).
• No es una fuerza, sino una cantidad de energía 1V = 1 J/C ΔV=cte
por unidad de carga.

𝑉𝑎𝑏 = 𝜀 − 𝐼𝑟

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Osorio-Tobón Ph.D.
Resistores en serie
• La corriente I debe ser la
misma en todos ellos.

Fuente: Sears y Zemansky (2010)


• La resistencia equivalente
de cualquier número de
resistores en serie es igual
a la suma de sus
resistencias individuales.
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Osorio-Tobón Ph.D.
Resistores en paralelo
• La corriente a través de
cada resistor no

Fuente: Sears y Zemansky (2010)


necesita ser la misma.
Pero la diferencia de
potencial entre las
terminales de cada
resistor debe ser la
misma.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
• Calcule la resistencia equivalente de la red que
se ilustra en la figura y obtenga la corriente en
cada resistor. La fuente de fem tiene
resistencia interna insignificante.

Fuente: Sears y Zemansky (2010)


BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
Reglas de Kirchhoff
• Muchas redes de
resistores prácticas no se
pueden reducir a
combinaciones sencillas
en serie y en paralelo.

Fuente: Sears y Zemansky (2010)


• Punto en que se unen

Unión tres o más


conductores.
• 𝐼=0

• Cualquier trayectoria

Espira cerrada de conducción.


• 𝑉=0

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Osorio-Tobón Ph.D.
Convenciones de signo para la regla de
la espiras

Fuente: Sears y Zemansky (2010)


Sears y Zemansky (2010)

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
El circuito mostrado en la figura contiene dos baterías, cada
una con una fem y una resistencia interna, y dos resistores.
Calcule
a) la corriente en el circuito.
b) la diferencia de potencial Vab
c) la salida de potencia de la fem de cada batería.

Fuente: Sears y Zemansky (2010)


BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
• En el circuito que se ilustra en la figura, una fuente de energía eléctrica de
12 V con resistencia interna desconocida r está conectada a una batería
recargable descargada con fem ξ desconocida y resistencia interna de 1 Ω,
y a una bombilla indicadora con resistencia de 3 Ω que transporta una
corriente de 2 A. La corriente a través de la batería descargada es igual a 1
A en el sentido que se indica. Calcule la corriente desconocida I, la
resistencia interna r y la fem ξ.

Fuente: Sears y Zemansky (2010)


BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
La figura muestra un circuito “puente”. Calcule la
corriente en cada resistor y la resistencia
equivalente de la red de cinco resistores.

Fuente: Sears y Zemansky (2010)


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Osorio-Tobón Ph.D.
El circuito eléctrico de la membrana
I
celular
−𝑡 𝑅 𝐶
Ir Ic 𝑉𝑚 − 𝑉𝑟 = 𝑖𝑅𝑚 1 − 𝑒 𝑚 𝑚

Rm Cm
Vm 𝑉𝑚 − 𝑉𝑟 = 0,632𝑖𝑅𝑚
Vr

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Osorio-Tobón Ph.D.
Alometría y fractales

Introducción a la teoría fractal y a la


dinámica del caos
“Hay formas que son posibles para un tamaño determinado,
pero dejan de serlo para un tamaño superior, por lo que se ha
producido una discontinuidad en el diseño de los organismos”

Cusso Perez et. al, (2012)


BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
El tamaño y la forma

3 μm < reino animal El tamaño es una


< 30 m magnitud relativa

Hay formas que son


posibles para un tamaño Aumenta el numero
determinado, pero dejan y variedad en vez del
de serlo para un tamaño tamaño
superior o inferior

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Osorio-Tobón Ph.D.
Cusso Perez et. al, (2012)
BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
Leyes de escala
• Cambios funcionales y estructurales que
tienen lugar como consecuencia de los
cambios de tamaño (cambios de escala) en los
organismos.
Isométicras Alométricas

• Tienen una forma semejante • Tienen una forma funcional


aunque de distinto tamaño del mismo tipo que las
(misma especie o próximas). isométricas pero no hay
estrictamente una forma
geométrica exacta.

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Fuente: http://global.britannica.com/
BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
Leyes de escala isométricas
• Son cuerpos
semejantes.
Cusso Perez et. al, (2012)

• Si 𝑘: relación entre
dimensiones lineales.
• 𝐿1 = 𝑘𝐿2
𝑆2 𝐿2 2
• = = 𝑘2
𝑆1 𝐿1

𝑉2 𝐿2 3
Si la relación entre las alturas dos organismos • = = 𝑘3
es 10 ¿Como es la relación entre las 𝑉1 𝐿1
longitudes de los brazos?

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Leyes de escala: cambios geométricos
• Las longitudes se relacionan entre sí a través de
una ecuación del tipo:
1
𝑑 = 𝑐1 𝐿 ∝ 𝑚 3
• Una superficie y una longitud están relacionadas
por:
2 2
𝑆 = 𝑐2 𝐿 ∝ 𝑚 3
• Los volúmenes y las longitudes están
relacionados por:
𝑉 = 𝑐3 𝐿3 ∝ 𝑚
BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
• En general son del tipo
𝑦 = 𝑘𝑥 𝑎 y se
representan en gráficos
con escalas

Cusso Perez et. al, (2012)


logarítmicas.
• log 𝑦 = log 𝑘 + 𝑎 log 𝑥
• 𝐿𝑏𝑟𝑎𝑧𝑜 = 𝑘𝐿
• 𝐹𝑚𝑢𝑠𝑐𝑢𝑙𝑜 = 𝑘𝑀2 3

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Osorio-Tobón Ph.D.
Cusso Perez et. al, (2012)

Los organismos de distinto tamaño


pertenecientes a la misma especie o a
especies cercanas son aproximadamente
isométricos.

Cusso Perez et. al, (2012)

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Osorio-Tobón Ph.D.
Leyes de escala Alométricas
• Tienen una forma funcional del mismo tipo
que las isométricas pero con exponentes que
no se derivan de la semejanza geométrica
entre los cuerpos.
• 𝑦 = 𝑦0 𝑥 𝑎
• 𝑆 = 𝑆0 𝑥 2 3

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Osorio-Tobón Ph.D.
BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
Comportamiento del exponente
𝑎=0 • No depende de la masa del animal.
• Masa de hemoglobina por unidad de volumen de sangre o el tamaño
de la mayoría de sus células,

0<𝑎<1 • Aumenta con la masa pero a un ritmo menor que proporcional.


• Superficie corporal (𝑎 = 0,67) o ritmo metabólico (𝑎 = 0,75).

𝑎=1 • Estrictamente proporcional a la masa.


• Masa del corazón o el volumen de la sangre en los mamíferos.

𝑎>1 • Aumenta más rápidamente que la masa.


• Peso del esqueleto de los mamíferos (𝑎 = 1,06).

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Osorio-Tobón Ph.D.
Osorio-Tobón Ph.D.
Fuente: http://www.gitta.info/

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe

Fuente: www.mun.ca Fuente: www.mun.ca


Ley de Cope
Pretende explicar el aumento de tamaño de
los organismos como una tendencia evolutiva

Ocupación de
¿Animales grandes = ventaja?
nicho ecológico

Aprovechamiento
Depredador-presa
del combustible

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Osorio-Tobón Ph.D.
𝑀𝑐𝑒𝑟𝑒𝑏𝑟𝑜 = 𝑘𝑀0,67

Fuente: Cusso Perez et. al, (2012)


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Osorio-Tobón Ph.D.
Tipos de alometría
• Interespecífica: Individuos, frecuentemente adultos,
en igual estado de desarrollo, de diferentes
Estática especies.
• Intraespecífica: Individuos, frecuentemente adultos,
en igual estado de desarrollo, de la misma especie.

• Se comparan tamaños medidos en el mismo


Ontogenética individuo en diferentes momentos de su desarrollo.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Metabolismo (kcal) vs Peso (kg)
Animal Peso Metabolismo
Ratón 0,021 3,6
Conejo 2,98 167
Gato 3 152
Perro 6,6 288
Perro 14,1 534
Vaca 435 8166
Chimpancé 38 1090
Mujer 57,2 1368

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Osorio-Tobón Ph.D.
Algunas leyes alométricas

Fenchel Calder
r = aW -1/4 t = aW1/4

Tiempo de
Damuth
Generación
d = aW-3/4
g = aW1/4

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo Especie de dinosaurio
Altura
(m)
Masa corporal
(kg)
Staurikosaurus pricei 2,08 19,0
Coelophysis bauri 2,68 15,3
Coelophysis rhodesiensis 2,15 13,0

• Evalúe la relación entre Elaphrosaurus bambergi


Liliensternus liliensterni
6,2
5,15
210
127
Dilophosaurus wetherilli 6,03 283
la altura de la masa de Ceratosaurus nasicoris
Eustreptospondylus oxoniensis
5,69
4,63
524
218

las siguientes especies Metriacanthosaurus? sp,


Allosaurus fragilis
3,8
7,4
130
1010
Allosaurus atrox 7,9 1320
de dinosaurios. Gorgosaurus (Paul's Albertosaurus) libratus
Gorgosaurus (Paul's Albertosaurus) libratus
5,8
8,6
700
2500
Daspletosaurus (Paul's Tyrannosaurus) torosus 9,0 2300
Tarbosaurus (Paul's Tyrannosaurus) bataar 5,8 760
Tarbosaurus (Paul's Tyrannosaurus) bataar 7,7 2100
Tyrannosaurus rex 10,6 5700
Deinonychus (Paul's Velociraptor ) antirrhopus 3,06 45
Deinonychus (Paul's Velociraptor ) antirrhopus 3,43 73
Velociraptor mongoliensis 2,07 15
Ornithomimus edmontonicus 3,3 110
Datos extraidos de Ornithomimus brevitertius (=edmontonicus) 3,66(www.biology.arizona.edu/)
144
http://www.geol.umd.edu/~jmerck/bsci393/lab5/allometry.html Gallimimus (Paul's Ornithomimus ) bullatus 2,15 27
(G. S. Paul. 1988. Predatory dinosaurs of the world. A complete Gallimimus (Paul's Ornithomimus ) bullatus 6,0 440
illustrated guide. Simon and Schuster, New York, NY, 464 pp.)

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Osorio-Tobón Ph.D.
Fuente: Randall et al.( 2002)
BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo (www.biology.arizona.edu/)

• Para una especie particular cangrejo, se determino la siguiente


ecuación:
Mc = 0,036 · Mb1,356
Donde Mc representa la masa de tenaza mas grande y Mb representa
la masa corporal.
a) Reescriba la ecuación en su forma logarítmica.
b) Cual es la pendiente de la línea cuando se grafica log (s) vs log (f).
c) ¿Que tipo de alometría es?
d) ¿Cual será la masa de la tenaza para un macho de 400 mg?
e) ¿Cual será la masa de un macho cuya tenaza tiene una masa de 53
mg?

(www.biology.arizona.edu/)

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ley de Kleiber
La tasa metabólica en los
animales tiene que aumentar
más lentamente que la masa,
lo que implica que la tasa
específica disminuye con la
masa corporal

Fuente: Cusso Perez et. al, (2012)


Datos existentes sobre ritmo
metabólico en reposo de
mamíferos

3
𝑇𝑀 = 𝐴𝑚 4 = 𝐴𝑚0,75

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Osorio-Tobón Ph.D.
Tasa metabólica vs masa corporal
𝑇𝑀 = 𝐴𝑚𝑝
Teoría de la red de Kleiber (1930)
distribución fractal, que 3
predice que 𝑇𝑀 = 𝐴𝑚 4 = 𝐴𝑚0,75
Kolokotrones et al. (2010)

• Ley de Kleiber no es aplicable a


mamíferos
• el valor del exponente p crece con
el tamaño corporal: la TM crece
El exponente suponiendo más rápido con la masa corporal
que la red que suministra en mamíferos grandes que en los
pequeños.
nutrientes en el cuerpo
tiene una geometría fractal.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Valores de A y p en las relaciones alométricas de la TM con el peso corporal
Grupo Temperatura A (W) p
corporal
Mamíferos euterios Normal 3,3 0,76-0,65
Aves paseriformes Normal 6,3 0,72-0,73
Aves no paseriformes Normal 3,6 0,69-0,75
Lagartos 37ºC 0,68 0,82
Reptiles 20ºC 0,13 0,77-0,80
Anfibios 20ºC 0,75-0,86
Peces 20ºC 0,43 0,70-0,88
Organismos unicelulares 20ºC 0,055 0,83
Tomado de: Alexander (1999) y Willmer (2005)

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Osorio-Tobón Ph.D.
Los animales grandes aprovechan mejor la
energía
• A medida que el tamaño aumenta, el pulso
se hace más lento y la vida se alarga.
• Mamíferos → 1000 millón de
• Ratón → 250 millones
• Ballena vs ardilla.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Semejanza elástica
• En el modelo de semejanza elástica los diámetros y las
longitudes están relacionados por:
2
𝑑 = 𝑐1 𝐿 3
• La masa es igual a:
𝑚 = 𝑐𝑑 2 𝐿
• Los diámetros y las longitudes en función de la masa
vienen dados por:
𝑑 = 𝑐𝑚3 8 𝑦 𝐿 = 𝑐𝑚1 4
• Cualquier superficie lateral verifica:
𝑆 ∝ 𝑑 𝐿 ∝ 𝑚3 8 𝑚1 4 =𝑚5 8 = 𝑚0,625

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Osorio-Tobón Ph.D.
Tasas metabólicas
• La ley de Kleiber nos dice que la tasa metabólica basal
es proporcional a la sección transversal y, por tanto, va
como:
2
𝑑2 ∝ 𝑚 3 8 = 𝑡𝑚3 4 = 𝑡𝑚0,75
4
𝑚 = 𝑡𝑚 3
• La tasa metabólica máxima también es proporcional a
m0,75, con una constante de proporcionalidad diez
veces mayor que la de la tasa basal. La fuerza muscular
también va como m0,75.
• Las tasas metabólicas son proporcionales a las
secciones transversales.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Leyes de escala
en el sistema circulatorio
• La presión sanguínea es básicamente la misma para todos los
animales.
• Los ritmos cardiacos son proporcionales a las longitudes.
• El caudal sanguíneo es proporcional a la tasa metabólica, o sea, a
m3/4.
• El período cardíaco es igual al volumen impulsado en un latido
dividido por el caudal, proporcional a m/m3/4 = m1/4. Va, por tanto,
como una distancia longitudinal.
• El tiempo natural de los relojes biológicos de los mamíferos es
proporcional a m1/4.
• Las vidas medias de los animales son proporcionales a m1/4. Por
tanto, el número medio de latidos cardíacos es el mismo para todos
los animales, aproximadamente igual a 1,5 x 109.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Algunos datos
Humano Elefante
(70 kg) (5 ton)
70 lpm 22 lpm

Rata Musaraña
(100 g) (2,5 g)
410 lpm 600 lpm

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
Un cubo posee un área lateral total 27 veces
mayor que la de otro de 0.2 m de arista. Calcula
la arista y el volumen del primer cubo.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
Estima el ritmo cardíaco de un animal que posea
una vida media de 5 años.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
Un perro pesa el doble que otro, y su altura es
un 20 % mayor que la de éste. ¿Se cumple el
modelo de semejanza elástica?

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejercicios
• ¿Cuál es el radio de una esfera de masa 10 veces mayor que
otra del mismo material y de 0.15 m de radio? ¿Cuál es el
cociente entre las superficies esféricas de ambas esferas?
• La relación entre las alturas de dos árboles es de 2.5. Obtén la
relación entre sus diámetros, suponiendo que satisfacen el
modelo de semejanza elástica.
• Un árbol es 2 m mayor que otro y su diámetro es doble que el
de éste. ¿Cuál es la altura de ambos si satisfacen el modelo de
semejanza elástica?
• Dos animales son semejantes, según el modelo elástico, y la
altura de uno de ellos es 10 cm mayor que la del otro y su
masa doble que la de éste. ¿Cuánto miden ambos animales?

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Osorio-Tobón Ph.D.
Fuente: Pixabay

Irregularidad y estructura

FRACTALES

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Es un objeto geométrico
que puede ser dividido en
partes, cada una de ellas

Julia
es una copia reducida del
total

Mandelbrot
Cada porción del objeto
tiene la información
necesaria para
reproducirlo todo

Fuente: Wikipedia

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Dimensión fractal
• Número de direcciones
ortogonales diferentes
Dimensión que podemos tomar al
topológica movernos por el espacio.
• Vacío (-1), punto (0), plano
(2).

ln 𝑛
•𝑑=
Dimensión ln 1 𝑟
fraccionaria • Donde 𝑛 es el número de
copias y 𝑟 es la escala.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Fractal matemático

Definición esquemática
Repeticiones crecientes,
decrecientes o iguales de
entidades.
Tiene detalles en Es demasiado irregular
escalas para ser descrito en
arbitrariamente términos geométricos Repeticiones multiplicativas
pequeñas. tradicionales. de entidades.

Tiene auto-similaridad
Su dimensión de Repeticiones cíclicas de
Hausdorff-Besicovitch entidades.
exacta o estadística.
no es entera.

Repeticiones no simétricas
de entidades.

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Fuente: http://enciclopedia.us.es/index.php/Copo_de_nieve_de_Koch

Fuente: http://enciclopedia.us.es/index.php/Copo_de_nieve_de_Koch

Osorio-Tobón Ph.D.
𝑑=

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Curva de Koch

log 3
log 4
= 1,2618 …
Triángulo de Sierpinsky

log 3
𝑑= = 1,5849 …
log 2

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Fuente:www.wired.com/2010/09/fractal-patterns-in-nature/ Fuente: www.wired.com/2010/09/fractal-patterns-in-nature/

Amonita
Conchas marinas

Osorio-Tobón Ph.D.
Salares

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Fractales naturales

Fuente: www.wired.com/2010/09/fractal-patterns-in-nature/
Fuente: www.wired.com/2010/09/fractal-patterns-in-nature/ Fuente: www.wired.com/2010/09/fractal-patterns-in-nature/

Montañas

Pavo real

Osorio-Tobón Ph.D.
Hojas

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe

Fuente: www.wired.com/2010/09/fractal-patterns-in-nature/
Fuente: www.mnn.com/earth-matters/wilderness-resources/blogs/14- Fuente: www.wired.com/2010/09/fractal-patterns-in-
amazing-fractals-found-in-nature nature/

nieve
Copo de

Osorio-Tobón Ph.D.
Arboles

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Burbujas en agua

Fuente: www.mnn.com/earth-matters/wilderness-
resources/blogs/14-amazing-fractals-found-in-nature
Se expresan mediante
algoritmos, es decir, por
medio de procedimientos
secuenciales e iterativos, que
por lo general requieren la
ayuda de un computador.

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Fuente: Pixabay Osorio-Tobón Ph.D.
Aplicaciones en biología
Sistemas fractales: red vascular o la red neuronal.

Vasos sanguíneos y capilares: a partir de información simple,


surgen estructuras complejas

Permite optimizar la función de los sistemas, ya que tienen una


gran superficie sin ser órganos demasiados voluminosos.

Los pulmones, por ejemplo tienen un área de intercambio de


aproximadamente de 100 mt² (una cancha de básquetbol),
mientras que el volumen total es de unos 7 a 8 litros.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Fuente: Pixabay
Fronteras de separación

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Árboles
Fuente: Pixabay

Fuente: Pixabay
BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
Osteoporosis

Fuente: http://entrenadorpersonal.pro/osteoporosis/
BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
Comportamientos impredecibles de los sistemas dinámicos

TEORÍA DEL CAOS

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
¿Romper un vidrio? ¿Derramar
agua? ¿tirar una piedra a un rio?
•El desorden no implica
confusión.
•Sistemas caóticos →estabilidad

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
¿Qué es?
Rama de las matemáticas y la física que trata ciertos tipos de
comportamientos impredecibles de los sistemas dinámicos.

Estable Inestable Caótico

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Grafico de Poincaré
Se refiere a un comportamiento
irregular que parece aleatorio, pero
no lo es.

Fuente: Weiss et. al, (1994)


Un conjunto de reglas, mas que el
azar, gobiernan el comportamiento
irregular del sistema.

El comportamiento irregular puede 𝑥𝑛 = 𝛼𝑥𝑛−1 1 − 𝑥𝑛−1


ser predicho, controlado o
eliminado.

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
• Aunque parecían
aleatorias, es dominada
por un modelo.
• Cuando se grafican, la

Fuente: Weiss et. al, (1994)


relación entre un punto
es simple, pero no
lineal.
• Esta ecuación depende
críticamente del valor
de α.

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
• El valor de α
determina si el
sistema se comporta
de una forma estable
o en una forma
caótica irregular.

Fuente: Weiss et. al, (1994)


• Los sistemas caóticos
son extremadamente
sensibles a las
condiciones iniciales.

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Efecto mariposa
Las curvas comienzan a
Ecuaciones divergir después de 20
diferenciales no iteraciones.
lineales ↓
Extremamente sensible
Simular el
comportamiento

Fuente: Weiss et. al, (1994)


del clima

𝑑𝑥
=𝑎 𝑦−𝑥
𝑑𝑡
𝑑𝑦
= 𝑟 𝑥 − 𝑦 − 𝑥𝑧
𝑑𝑡
𝑑𝑧
= 𝑥𝑦 − 𝑏𝑧
𝑑𝑡

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Caos en el corazón
• El corazón tiene su propio
El ritmo regular
marcapasos (modulo Sanos → caótico
puede ser alterado
Ritmos muy regulares
sinoatrial). → patologías
por cambios
pequeños
• Un marcapasos externo y
el modulo sinoatrial
mantienen un ritmo
regular.
• Si el ritmo se vuelve

Fuente: Pixabay
caótico, desencadena una
arritmia.
𝜃𝑛+1 = 𝜃𝑛 + 𝜔 + 𝑘 sin 𝜃𝑛
medicaltie.com

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Caos en el crecimiento poblacional
El modelo mas simple 𝑋𝑛
𝑋𝑛+1 = 𝑎𝑋𝑛 1 −
implica: 𝐾
• No hay superposición de Donde Xn es el numero de
generaciones. individuos en la enésima
• Los adultos se reproducen generación.
con una tasa a > 0. Introduciendo la población
• La limitación de recursos relativa (x=X/K).
induce a la saturación de
la población en un 𝑥𝑛+1 = 𝑎𝑥𝑛 1 − 𝑥𝑛
máximo valor K.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Caos en las neuronas y el cerebro
Eventos externos y aleatoriedad de

Fuente: circuitoaleph.net
los elementos que participan en la
propagación del impulso nervioso

¿El
¿La actividad de una
cerebro en
neurona se refleja en los
masa es
impulsos que emite?

Fuente: www.omicrono.com
caótico?

Neuronas
con Actividades
función motoras
marcapaso

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
El cambio teórico en una población para el siguiente
año esta definido por la ecuación 𝑥𝑛 = 𝛼𝑥 1 − 𝑥 .
Donde x esta entre 0 y 1. Cero es la extinción y 1 es
la máxima población alcanzable.
• Con un valor de α de 2,7 y x0 de 0,02, cual es el
valor de la población para el cual el sistema
alcanza la estabilidad.
• Obtenga los gráficos para este comportamiento
caótico variando los valores de α y analice los
gráficos.

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Termodinámica

Conceptos básicos
Introducción
Anabolismo
Producción
Energía
Metabolismo
Células

Oxidación -
Almacenamiento Enlaces químicos
reducción

Principios que
Procesos rigen las
Fuente de vida
energéticos transformaciones
energéticas

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Conceptos fundamentales

• Potencialidad o capacidad para realizar trabajo.


Energía • Es algo intangible.

• Es un sistema macroscópico formado por un gran


numero de constituyentes elementales (átomos,
moléculas, iones, ...)
Termodinámica • Estudio de los cambios de estado de una substancia
cuando los cambios en la energía interna (ΔU) son
importantes.

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Sistema
Adiabático

Cerrado
Región de estudio
especificado por un
volumen (V) en el espacio.
Aislado

Estable - estacionario

Fuente: Bernal y Gutiérrez (2014)


Fuente: Bernal y Gutiérrez (2014)

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Osorio-Tobón Ph.D.
Tipos de variables
Son observables macroscópicos
característicos, cuyos valores
determinan un estado termodinámico.
Extensivas Intensivas
↓ ↓
Dependen del tamaño del Son independientes del tamaño
sistema (masa, volumen, del sistema (T, P, U, H, S y G). Se
densidad, volumen especifico). pueden volver extensivas.

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Osorio-Tobón Ph.D.
• Designa el estado
termodinámico del
Estado sistema.
• ρ, P, T, U, H, S, G, (x,y).

Fuente: blog.utp.edu.co
• Designa el estado de
Fase agregación del
sistema.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Diagrama de proceso

Fuente: Bernal y Gutiérrez (2014)


BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
Hechos experimentales
• La cantidad de masa, energía y momento generadas en cualquier
sistema siempre serán nulas.
• El trabajo (W) puede ser convertido completamente en calor (Q),
mientras que la conversión de calor en trabajo nunca será total.
• Un sistema sin alimentación de materia o flujo de energía alcanzara
un estado de equilibrio estable.
• Si el sistema alcanza el equilibrio, no saldrá espontáneamente de
ese estado. Es necesario un cambio en los alrededores.
• El estado de equilibrio es estable a pequeñas oscilaciones.
• El estado termodinámico estará definido por 𝜃 = 𝑓𝜃 𝜃1 , 𝜃2 , 𝑀 .
Fuente: http://web.nchu.edu.tw/pweb/users/cmchang/lesson/10072.pdf

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Osorio-Tobón Ph.D.
Tipos de procesos

Fuente: www.intechopen.com
BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
Imagine dos procesos en la industria
biotecnológica: uno en régimen permanente y
otro en régimen transitorio. Defina: 1) el
sistema, 2) los alrededores, 3) las fases
involucradas, 4) el estado de agregación, 5) si
hay o no corrientes de alimentación y salida, y 6)
si el proceso ocurre en batch, fed batch o
continuo.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Balance general para
variables que se conservan
𝜃𝐸,𝐾1 𝑀𝐸,𝐾1
𝜃𝑆,𝐾 𝑀𝑆,𝐾
𝜃𝐸,𝐾2 𝑀𝐸,𝐾2

𝐴𝑐𝑢𝑚𝑢𝑙𝑎𝑐𝑖ó𝑛 𝑡+∆𝑡
𝑡 = 𝑡𝑎𝑠𝑎 𝑑𝑒 𝑎𝑙𝑖𝑚𝑒𝑛𝑡𝑎𝑐𝑖ó𝑛𝑡𝑡+∆𝑡 ∆𝑡- 𝑡𝑎𝑠𝑎 𝑑𝑒 𝑠𝑎𝑙𝑖𝑑𝑎𝑡𝑡+∆𝑡 ∆𝑡 +
𝑡𝑎𝑠𝑎 𝑑𝑒 𝑖𝑛𝑡𝑒𝑟𝑐𝑎𝑚𝑏𝑖𝑜 𝑒𝑛 𝑙𝑜𝑠 𝑙𝑖𝑚𝑖𝑡𝑒𝑠𝑡𝑡+∆𝑡 ∆𝑡 + 𝑡𝑎𝑠𝑎 𝑑𝑒 𝑔𝑒𝑛𝑒𝑟𝑎𝑐𝑖ó𝑛𝑡𝑡+∆𝑡 ∆𝑡

𝜃 𝑡 + ∆𝑡 − 𝜃 𝑡 = 𝜃𝐸 ∆𝑡 − 𝜃𝑆 ∆𝑡 + 𝜃𝑙𝑖𝑚 ∆𝑡 + 𝜃𝑔𝑒𝑛 ∆𝑡

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Osorio-Tobón Ph.D.
Con corrientes de •
𝑑𝜃
= 𝐾𝐸 𝜃𝐸 𝑀𝐸 − 𝐾𝑆 𝜃𝑆 𝑀𝑆 + 𝐾𝑙𝑖𝑚 𝜃𝑙𝑖𝑚 + 𝜃𝑔𝑒𝑛
entrada y salida 𝑑𝑡

Régimen •
𝑑𝜃
=0= 𝐾𝐸 𝜃𝐸 𝑀𝐸 − 𝐾𝑆 𝜃𝑆 𝑀𝑆 + 𝐾𝑙𝑖𝑚 𝜃𝑙𝑖𝑚
permanente 𝑑𝑡

𝑑𝜃
Batch •
𝑑𝑡
= 𝐾𝑙𝑖𝑚 𝜃𝑙𝑖𝑚 + 𝜃𝑔𝑒𝑛

𝑑𝜃
Fed batch •
𝑑𝑡
=− 𝐾𝑆 𝜃𝑆 𝑀𝑆 + 𝐾𝑙𝑖𝑚 𝜃𝑙𝑖𝑚 + 𝜃𝑔𝑒𝑛

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Osorio-Tobón Ph.D.
Balance global de masa (M)
• Para la masa 𝜃𝑙𝑖𝑚 =0, pero para otras variables
como H y S → 𝜃𝑙𝑖𝑚 ≠ 0.
• Del hecho experimental 1 → 𝜃𝑔𝑒𝑛 = 0.

𝑑𝑀
= 𝑀𝐸 − 𝑀𝑆
𝑑𝑡
𝐾𝐸 𝐾𝑆

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
Para la preparación de un medio cultivo, se
necesita una composición definida. Considere
un tanque de mezcla que recibe 100 kg/h de
medio A con 3,6% de proteína y 180 kg/h de
medio B con 3,2% de proteína. Determine el
contenido de proteína de la mezcla final.

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
En algunos procesos biotecnológicos, para recuperar los
metabolitos, el agua debe ser retirada en un evaporador.
Primero, es necesaria una etapa de filtración para la
remoción de la biomasa, dando origen a un medio
clarificado. Sabiendo que en el filtro es retenida una torta
con 80% de biomasa y que el medio filtrado tiene 8% de
biomasa, determine: A) cual es el rendimiento (relación
entre el medio concentrado producido y el medio
alimentado) de un proceso en el cual el medio tiene 12%
de biomasa y el medio concentrado 48% de biomasa. B)
Se el filtro se alimenta con 100 kg/h de medio, ¿cual será
la cantidad de agua que deberá ser evaporada para la
obtención del medio concentrado?
BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
Un tanque contiene inicialmente 100 kg de
agua. Por medio de una tubería son alimentados
1,75 kg/min y al mismo tiempo por una válvula
abierta se permite la salida de 2,1 kg/min.
¿Cuánto se demorara el tanque para vaciarse?

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Osorio-Tobón Ph.D.
Balance de energía

PRIMERA LEY DE LA
TERMODINÁMICA
BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
Energía interna
Es una propiedad característica del sistema
y puede ser medida de alguna manera.
Relacionada con los movimientos
Energía interna
microscópicos relativos de los átomos
(U)
de sistema.

↑T→↑agitación
Fuente: cosasdelmundo.net

Fuente: recetasdecocinablog.com

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Osorio-Tobón Ph.D.
Energía externa
Cinética Potencial

• Asociada ala • Asociada a la


velocidad del posición del centro
sistema. de masa del sistema.
1
• 𝐸𝑐 = 𝑚𝑣 2 • Gravitacional,
2 eléctrica, elástica,
etc.
1
𝐸 = 𝑈 + 𝑚𝑣 2 + 𝐸𝑝
2

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Osorio-Tobón Ph.D.
Transferencia de energía:
el balance de energía
• A partir de:
𝑑𝐸
= 𝐸𝐸 𝑀𝐸 − 𝐸𝑆 𝑀𝑆 + 𝐸𝑙𝑖𝑚 + 𝐸𝑔𝑒𝑛
𝑑𝑡
𝐾𝐸 𝐾𝑆 𝐾𝑙𝑖𝑚

𝑑𝐸
= 𝐸𝐸 𝑀𝐸 − 𝐸𝑆 𝑀𝑆 + 𝐸𝑙𝑖𝑚
𝑑𝑡
𝐾𝐸 𝐾𝑆 𝐾𝑙𝑖𝑚

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Osorio-Tobón Ph.D.
¿Cómo se transforma la energía?
• En corrientes de materia → tienen asociadas
energía.
• Calor → La transferencia de calor ocurre
debido a diferencias de T entre el sistema y los
alrededores.
𝑄 → + 𝑇𝑟𝑎𝑛𝑠𝑓𝑒𝑟𝑖𝑑𝑜 ℎ𝑎𝑐𝑖𝑎 𝑒𝑙 𝑠𝑖𝑠𝑡𝑒𝑚𝑎
𝑄 → − 𝐿𝑖𝑏𝑒𝑟𝑎𝑑𝑜 𝑝𝑜𝑟 𝑒𝑙 𝑠𝑖𝑠𝑡𝑒𝑚𝑎
• Este representa 𝐸𝑙𝑖𝑚 .

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Osorio-Tobón Ph.D.
¿Qué tipo de
información nos puede aportar Q?

Información sobre la Estudios de plegamiento Información sobre la


desnaturalización de y desplegamiento de interacción entre
macromoléculas proteínas macromoléculas

Determinación de los
Información sobre la
parámetros que definen
energética de transporte
la unión de ligandos a
de iones
macromoléculas

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Osorio-Tobón Ph.D.
• Trabajo → Energía transferida a través de la
aplicación de una fuerza a lo largo de una
trayectoria.
𝑊 → + 𝑇𝑟𝑎𝑛𝑠𝑓𝑒𝑟𝑖𝑑𝑜 ℎ𝑎𝑐𝑖𝑎 𝑒𝑙 𝑠𝑖𝑠𝑡𝑒𝑚𝑎
𝑊 → − 𝐿𝑖𝑏𝑒𝑟𝑎𝑑𝑜 𝑝𝑜𝑟 𝑒𝑙 𝑠𝑖𝑠𝑡𝑒𝑚𝑎
Tipos de trabajo
Trabajo de eje (𝑊𝑠 )
Ocurre sin deformación de los limites del sistema. Trabajo de compresión o expansión (𝑊𝑒𝑥𝑝 )
En equipos con motores donde hay conversión de
energía mecánica. Involucra la deformación de los limites del sistema.
Bombas (+), Compresores (+) y turbinas (-)

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Osorio-Tobón Ph.D.
Calculo del trabajo de expansión
𝑑𝐿
𝑊𝑒𝑥𝑝 =𝐹
𝑑𝑡
𝐹
A

𝑑𝑉
𝑊𝑒𝑥𝑝 = −𝑃
dL 𝑑𝑡

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Osorio-Tobón Ph.D.
Calculo del trabajo
para un sistema abierto

• La cantidad de fluido
𝑀1 que entra y sale ejerce
𝑀2
una fuerza, la cual
𝑃1 𝑉1 𝑃2 𝑉2 empuja el fluido que
esta en el tubo.

𝑊𝑓𝑙𝑢𝑗𝑜 = 𝑀𝐸 𝑃𝑉 𝐸
− 𝑀𝑆 𝑃𝑉 𝑆
𝐾𝐸 𝐾𝑆

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Osorio-Tobón Ph.D.
Primera ley
La energía total del universo es constante.
Puede estar presente en diferentes formas, pero
su cantidad total no se altera.
“La energía no se crea, ni se destruye, sino que
se conserva”

𝑑𝐸 𝑑𝑉
= 𝑄 + 𝑊𝑆 − 𝑃 + 𝐾𝐸 𝐸𝐸 𝑀𝐸 + 𝐾𝐸 𝑃𝑉 𝐸
𝑀𝐸 − 𝐾𝑆 𝐸𝑆 𝑀𝑆 − 𝐾𝑆 𝑃 𝑉 𝑆 𝑀𝑆
𝑑𝑡 𝑑𝑡

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Osorio-Tobón Ph.D.
• Destacando las 3 formas de energía:
𝑑 𝑈 + 𝐸𝑐 + 𝐸𝑝 𝑑𝑉
= 𝑈 + 𝐸𝑐 + 𝜓 𝑀 −
𝐸 𝐸
𝑈 + 𝐸𝑐 + 𝜓 𝑆 𝑀𝑆 + 𝑄 + 𝑊𝑆 − 𝑃 + 𝑃𝑉 𝑀𝐸 − 𝑃 𝑉 𝑆 𝑀𝑆
𝑑𝑡 𝑑𝑡 𝐸
𝐾𝐸 𝐾𝑆 𝐾𝐸 𝐾𝑆

𝑑 𝑈 + 𝐸𝑐 + 𝐸𝑝 𝑑𝑉
= 𝑄 + 𝑊𝑆 − 𝑃 + 𝐻 + 𝐸𝑐 + 𝜓 𝑀𝐸 − 𝐻 + 𝐸𝑐 + 𝜓 𝑆 𝑀𝑆
𝑑𝑡 𝑑𝑡 𝐸
𝐾𝐸 𝐾𝑆

𝑑𝑈 𝑑𝑉
= 𝐻𝐸 𝑀𝐸 − 𝐻𝑆 𝑀𝑆 + 𝑄 + 𝑊𝑆 − 𝑃
𝑑𝑡 𝑑𝑡
𝐾𝐸 𝐾𝑆

NOTA: Generalmente la contribución de 𝐸𝑐 y 𝐸𝑝 pueden ser despreciadas. Estudiar la


Ilustración 3.4-2 (pagina 72) del libro “Chemical biochemical and engineering
thermodynamics” de Sandler .

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Osorio-Tobón Ph.D.
Actividad
Establecer el balance de energía para las
siguientes condiciones:
• Sistema cerrado.
• Proceso adiabático.
• Sistema en estado estacionario o régimen
permanente.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
Un sistema de cilindro - pistón contiene un
kilogramo de una sustancia a 0,8 MPa con un
volumen especifico de 0,2608 m3 kg-1. La
sustancia sometida a un proceso isobárico hasta
que su volumen especifico es 0,001115 m3 kg-1.
a. Determine el trabajo total hecho por el
sistema.
b. ¿El trabajo fue hecho por o sobre el sistema?

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Osorio-Tobón Ph.D.
Fuente: https://termofisc.files.wordpress.com

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Osorio-Tobón Ph.D.
Fuente: http://www.engineersedge.com

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Osorio-Tobón Ph.D.
Fuente: https://commons.wikimedia.org/wiki/File:T-s_diagram.svg

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Osorio-Tobón Ph.D.
Símbolos de elementos importantes
en bioingeniería

Válvula Compresor o bomba Turbina

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
Vapor de agua a 400 bar y 500 ◦C es sometido a
una expansión de Joule-Thomson hasta 1 bar.
Determine la temperatura del vapor después de
la expansión.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Para una mezcla de dos fases
𝜃 = 𝜔𝐼 𝜃 𝐼 + 𝜔𝐼𝐼 𝜃 𝐼𝐼 = 𝜔𝐼 𝜃 𝐼 +(1-𝜔𝐼 ) 𝜃 𝐼𝐼

𝜔𝐼 + 𝜔𝐼𝐼 = 1
Para mezclas de vapor y agua, la fracción
másica es llamada “Calidad” y frecuentemente
es expresada como porcentaje.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
• Cual es la calidad del una mezcla de vapor de
agua la cual contiene 0,02 kg de agua por cada
kg de mezcla.
• Cual es el valor de la presión, energía interna y
entalpia de una mezcla V-L a 85oC la cual
contiene 80% de vapor. ¿Cómo es esta en
comparación con las fases de vapor o liquido
saturado?

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Osorio-Tobón Ph.D.
Capacidad calorífica

A volumen 𝜕𝑈
•𝐶𝑉 (𝑇, 𝑉) =
constante 𝜕𝑇 𝑉

A presión 𝜕𝐻
•𝐶𝑃 (𝑇, 𝑃) =
constantes 𝜕𝑇 𝑃

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Osorio-Tobón Ph.D.
Balance de entropía

SEGUNDA LEY DE LA
TERMODINÁMICA
BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
En un sistema cerrado, aislado y con volumen
constante:
𝑑𝜃
= 𝜃𝐸 𝑀𝐸 − 𝜃𝑆 𝑀𝑆 + 𝜃𝑙𝑖𝑚 + 𝜃𝑔𝑒𝑛
𝑑𝑡
𝐾𝐸 𝐾𝑆 𝐾𝑙𝑖𝑚

𝑑𝜃
= 𝜃𝑔𝑒𝑛
𝑑𝑡

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Osorio-Tobón Ph.D.
De acuerdo a la observación experimental 4:
• Si el sistema alcanza el equilibrio → 𝜃 no varia
𝑑𝜃
con el tiempo, por lo tanto: = 𝜃𝑔𝑒𝑛 = 0.
𝑑𝑡
• Se define arbitrariamente que 𝜃 esta en un
máximo en el equilibrio.
• Pero si no esta en el equilibrio. En este caso:
𝑑𝜃
= 𝜃𝑔𝑒𝑛 > 0.
𝑑𝑡

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Osorio-Tobón Ph.D.
Balance de entropía
¿Como varia la entropía?

• Entrada y salida de masa.


𝑄
• Transferencia de calor en los limites ( 𝑇 ).
𝑑𝑆 𝑄
= + 𝑆𝑔𝑒𝑛 + 𝑆𝐸 𝑀𝐸 − 𝑆𝑆 𝑀𝑆 Las unidades
𝑑𝑡 𝑇 de S son
𝐾𝐸 𝐾𝑆
(J/K).
𝑄
∆𝑆 = + 𝑆𝑔𝑒𝑛 + 𝑆𝐸 𝑀𝐸 − 𝑆𝑆 𝑀𝑆
𝑇
𝐾𝐸 𝐾𝑆

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Osorio-Tobón Ph.D.
Segunda ley
Sistema cerrado, aislado y con volumen constante
𝑑𝑆 En el equilibrio
= 𝑆𝑔𝑒𝑛 > 0 Por lo tanto
𝑑𝑡 𝑑𝑆
= 𝑆𝑔𝑒𝑛 = 0
𝑑𝑡 𝑆𝑔𝑒𝑛 ≥ 0

“La generación de entropía de cualquier proceso


real siempre será mayor o iguala cero”
“Establece cuales procesos de la naturaleza
pueden ocurrir o no”

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Osorio-Tobón Ph.D.
Procesos reversibles e irreversibles
• Un sistema es llevado desde un estado inicial a un estado final
por un camino dado, pudiendo retornar al estado inicial por el
mismo camino sin que halla perdida o ganancia de energía.
Reversible • 𝑆𝑔𝑒𝑛 = 0.
• En equipos bien diseñados (bombas, turbinas, compresores y
válvulas).

• Es un proceso natural que lleva un sistema de un estado de no


Irreversible equilibrio a un estado de equilibrio.
• 𝑆𝑔𝑒𝑛 > 0

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplos de procesos irreversibles
• Cuando dos objetos que están a diferente
temperatura se ponen en contacto térmico entre
sí, el calor fluye del objeto más cálido al más frío,
pero nunca del más frío al más cálido.
• La sal se disuelve espontáneamente en el agua,
pero la extracción de la sal del agua requiere
alguna influencia externa.
• Cuando se deja caer una pelota de goma al piso,
rebota hasta detenerse, pero el proceso inverso
nunca ocurre.
BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
En una turbina entra vapor de agua a 4 Mpa y
600oC. El vapor de agua sale a 1,6 Mpa. Calcula
la temperatura del salida del vapor de agua y la
cantidad de trabajo generada por la turbina. La
turbina trabaja adiabáticamente.

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
Una bomba para cargar un biorreactor lleva un
medio de fermentación (20°C) hasta una presión
de 5 Mpa (20°C). Si la bomba requiere de una
potencia de 370 W (1 W=1 J s-1) y procesa 35 l
min-1, calcule la tasa de generación de entropía
de la misma.

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Eficiencia (𝐸𝑓 )
• La eficiencia de las maquinas reales esta
definida por la relación entre las potencias del
proceso reversible y del proceso real
(irreversible).

𝑊𝑆 𝑖𝑟𝑟𝑒𝑣𝑒𝑟𝑠𝑖𝑏𝑙𝑒
𝐸𝑓 =
𝑊𝑆 𝑟𝑒𝑣𝑒𝑟𝑠𝑖𝑏𝑙𝑒

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
• Una turbina trabaja con 100 kg s-1 de vapor a
10 MPa y 800 °C. Si el vapor es expandido
hasta 0,1 Mpa y 600 °C, calcule la eficiencia de
la turbina.

NOTA: desprecie las perdidas por calor.

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Osorio-Tobón Ph.D.
CICLO DE CARNOT

CALOR, TRABAJO, MAQUINAS Y


ENTROPIA
BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
“Importante para la transformación de
calor en energía mecánica o trabajo”
𝑇1 − 𝑇2
−𝑊 = 𝑄1 − 𝑇2 𝑆𝑔𝑒𝑛
𝑇1
𝑄1 𝑄2
Maquina
térmica
𝑇1 𝑇2

𝑇1 − 𝑇2
−𝑊𝑚𝑎𝑥 = 𝑄1
𝑇1
𝑊

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
Un inventor declara que una maquina de calor
absorbe 1kJ de energía a partir de un reservorio
que esta a 737oC y entrega 0,6 kJ de trabajo
cuando la temperatura ambiente es 27oC. ¿Esta
usted de acuerdo con esta declaración?

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Eficiencia de las maquinas (𝜂)
𝑓𝑟𝑎𝑐𝑐𝑖ó𝑛 𝑑𝑒𝑙 𝑐𝑎𝑙𝑜𝑟
𝑝𝑟𝑜𝑝𝑜𝑟𝑐𝑖𝑜𝑛𝑎𝑑𝑜 𝑞𝑢𝑒 −𝑊 𝑄1 + 𝑄2
𝜂= = 𝑜𝜂=
𝑠𝑒 𝑐𝑜𝑛𝑣𝑖𝑒𝑟𝑡𝑒 𝑒𝑛 𝑄1 𝑄1
𝑡𝑟𝑎𝑏𝑎𝑗𝑜
“Normalmente todas las maquinas industriales solo
alcanzan la mitad de esta eficiencia”
“Es imposible convertir todo el calor suministrado
en trabajo”
𝑇2
−𝑄2 = 𝑄1 + 𝑇2 𝑆𝑔𝑒𝑛
𝑇1
BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
Maquina de Carnot
Son máquinas
cíclicas ideales
Reservorio a
Temperatura 𝑇1

consta de dos
transformaciones
isotérmicas y dos
adiabáticas
Reservorio a
Temperatura 𝑇2
Utiliza dos fuentes
una de Baja
temperatura y otra
a Alta temperatura

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Fuente: www.sc.ehu.es/sbweb/fisica/estadistica/carnot/carnot.htm

Fuente: www.sc.ehu.es/sbweb/fisica/estadistica/carnot/carnot.htm

Osorio-Tobón Ph.D.
BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
𝜂𝐶 = 1 −
𝑇1
𝑇2
La eficiencia de Carnor (𝜂𝐶 ) esta definida por:
Ejemplo
Una máquina térmica que trabaja entre dos
focos térmicos a 100 K y 500 K, absorbe en cada
ciclo 1000 J de calor del foco caliente. Si su
rendimiento es del 20%, responder a las
siguientes preguntas:
a. ¿La máquina funciona reversible o
irreversiblemente? ¿Por qué?
b. Determine la generación de entropía de la
maquina en cada ciclo.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
• Un nuevo equipo es fabricado. El dispositivo toma agua caliente a alta
presión y genera trabajo a través de la conversión en dos corrientes: vapor
y agua a baja presión. Le preguntan si debe comprar el equipo. En el
catalogo dice que el dispositivo produce 10 kW (1 W=1 J s-1) de trabajo
bajo las siguientes condiciones:
Entrada Salida 1 Salida 2
Flujo másico (kg s-1) 1,0 0,5
T (oC) 260 100 300
P (MPa) 5
Estado de agregación Liquido Calidad Liquido saturado
comprimido desconocida

a. ¿Cuál es la calidad del vapor en la salida 1?


b. ¿Este dispositivo en termodinámicamente posible?

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
Un vendedor ofrece una bomba para el
bombeamiento de un medio de cultivo al
interior de un biorreactor. De acuerdo al
vendedor, la bomba requiere de 373 W para su
funcionamiento. En el catalogo dice que agua
liquida saturada a 50oC entra a la bomba y sale
180 oC y 50 Mpa. El caudal nominal de la bomba
es 100 l min-1. (1 W=1 J s-1)
¿Usted compraría la bomba?

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Osorio-Tobón Ph.D.
Conceptos básicos

TERMODINÁMICA EN SISTEMAS
BIOLÓGICOS
BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
U y H en reacciones bioquímicas
¿Nos permite la Primera
ley predecir si un proceso
ocurrirá o no en forma
Calorímetro
cerrado • ∆𝑈 = ∆𝑄 espontánea?
Reacción ∆𝑯 Tipo
NaNO3 en agua ∆𝐻 > 0 Endotérmico

NaOH en agua ∆𝐻 < 0 Exotérmico

Difusión de ∆𝐻 = 0
Na+ a favor de

• ∆𝐻 = ∆𝑄
Calorímetro un gradiente
de
abierto concentración

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Cambio de entalpia con reacciones
• Producto de la actividad enzimática o del
metabolismo celular.
• Calor de reacción (∆𝐻𝑟𝑥𝑛 ).
∆𝐻𝑟𝑥𝑛 = 𝑀ℎ − 𝑀ℎ
𝑝𝑟𝑜𝑑𝑢𝑐𝑡𝑜𝑠 𝑟𝑒𝑎𝑐𝑡𝑎𝑛𝑡𝑒𝑠

∆𝑯 Tipo
∆𝐻 > 0 Endotérmico
∆𝐻 < 0 Exotérmico

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Calor de combustión (∆ℎ𝑛 )
• Calor liberado de la oxidación de una
sustancia a CO2 (g), H2O (l) y N2 (g).
• Calor estándar de combustión (∆ℎ𝑐° ): cambio
de entalpia asociada con la reacción a
condiciones estándar (25oC y 1 atm).

°
∆𝐻𝑟𝑥𝑛 = 𝑛∆ℎ𝑐° − 𝑛∆ℎ𝑐°
𝑟𝑒𝑎𝑐𝑡𝑎𝑛𝑡𝑒𝑠 𝑝𝑟𝑜𝑑𝑢𝑐𝑡𝑜𝑠

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Osorio-Tobón Ph.D.
Doran (2008)
BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
Ácido fumarico (C4H4O4 , ∆ℎ𝑐° =-1334,8 kJ gmol-1)
es producido a partir de ácido málico (C4H6O5,
∆ℎ𝑐° =-1328,8 kJ gmol-1) usando la enzima
fumarasa. Calcule el calor estándar de
combustión de la siguiente reacción enzimática.
C4H6O5 → C4H4O4 + H2O

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Balance de energía para un cultivo
celular
• Poca diferencia de T entre las corrientes de
entrada y de salida.
• Calor de reacción.
• Cambio de fase.
• Trabajo de eje.

0 = ∆𝐻𝑟𝑥𝑛 +𝑀𝑣 ∆ℎ𝑣 + 𝑄 + 𝑊𝑠


BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
0 = ∆𝐻𝑟𝑥𝑛 +𝑀𝑣 ∆𝐻𝑣 + 𝑄 + 𝑊𝑠
Despejando el
En el caso de un
calor
agitador, los
𝑄 = −∆𝐻𝑟𝑥𝑛 −𝑀𝑣 ∆ℎ𝑣 − 𝑊𝑠 alrededores hacen un
trabajo sobre el
sistema, o sea que es
positivo (+)

𝑀𝑣 : Masa de agua que se


evapora
𝑣
∆𝐻 : Se busca en la tabla
Aeróbico Anaeróbico
de vapor de agua. Es
positivo (+)

∆𝐻𝑟𝑥𝑛 = 𝑀𝑂2 ∆ℎ𝑂2 ∆𝐻𝑟𝑥𝑛 = 𝑀∆ℎ𝑐0 − 𝑀∆ℎ𝑐0


𝑝𝑟𝑜𝑑𝑢𝑐𝑡𝑜𝑠 𝑟𝑒𝑎𝑐𝑛𝑡𝑎𝑛𝑡𝑒𝑠

Masa de O2 460 KJ gmol-1


Los valores de ∆ℎ𝑐0 se toman
negativos (-) tal como están en la
tabla de Doran (2008)

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
° = 460 kJ mol-1 O consumido
Para procesos aeróbicos ∆𝐻𝑟𝑥𝑛 2

En procesos anaeróbicos:

𝐶𝑤 𝐻𝑥 𝑂𝑦 + 𝑏𝐻𝑔 𝑂ℎ 𝑁𝑖 → 𝑐𝐶𝐻𝛼 𝑂𝛽 𝑁𝛿 + 𝑑𝐻2 𝑂 + 𝑒𝐶𝑂2 + 𝑓𝐶𝑗 𝐻𝑟 𝑂𝑧

°
∆𝐻𝑟𝑥𝑛 = 𝑛∆ℎ𝑐° + 𝑛∆ℎ ° − 𝑛∆ℎ ° − 𝑛∆ℎ °
𝑏𝑖𝑜𝑚𝑎𝑠𝑎 𝑐 𝑝𝑟𝑜𝑑𝑢𝑐𝑡𝑜𝑠 𝑐 𝑠𝑢𝑠𝑡𝑟𝑎𝑡𝑜 𝑐 𝑓𝑢𝑒𝑛𝑡𝑒 𝑑𝑒 𝑁

∆ℎ𝑐° para bacterias =-23,2 kJ g-1


∆ℎ𝑐° para levaduras =-21,2 kJ g-1

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Osorio-Tobón Ph.D.
Fuente: Doran (2008)
BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
El ácido cítrico es fabricado usando Aspergillus
niger en un cultivo aerobio a 30oC. Como fuente
de carbono se utiliza glucosa y amoniaco como
fuente de nitrogeno. En un periodo de 2 días
son consumidos 2500 kg de glucosa y 860 kg de
oxigeno. Se producen 1500 kg de ácido cítrico,
500 kg de biomasa y otros productos y se
evaporan 100 kg de agua. Si son requeridos 15
kW de agitación, calcule los requerimientos de
enfriamiento.

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
Saccharomyces cerevisiae crece en un cultivo continuo anaeróbico a
30oC. La fuente de carbono es glucosa y la fuente de nitrógeno es
amoniaco. Es producida una mezcla de glicerol y etanol. Calcule los
requerimientos de enfriamiento, si en el estado estacionario, los flujos
másicos son:
Material Entrada (kg h-1) Salida (kg h-1)
Glucosa 36 -
Amoniaco 0,4 -
Biomasa - 2,81
Glicerol - 7,94
Etanol - 11,9
CO2 - 13,6
H2O - 0,15

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Osorio-Tobón Ph.D.
Se tienen los siguientes datos adicionales:
Pesos moleculares: glucosa = 180, NH3 = 17,
glicerol = 92 y etanol = 46.
Los calores de combustión son:
glucosa = -2805,0 kJ gmol-1, NH3 = -382,6 kJ
gmol-1, biomasa = -21,4 KJ g-1, glicerol = -1655,4
kJ gmol-1 y etanol = -1366,8 kJ gmol-1

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
Diferentes especies de Propionibacterium son evaluadas para la
producción comercial de ácido propiónico. Este ácido y otros
ácidos son producidos en condiciones anaeróbicas usando
sacarosa como como sustrato y amoniaco como fuente de
nitrógeno. Se tienen los siguientes rendimientos:

Ácido propiónico 40% (w/w)


Ácido acético 20% (w/w)
Ácido butírico 5% (w/w)
Ácido láctico 3,4% (w/w)
Biomasa 12% (w/w)

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
La bacteria es inoculada en un fermentador que
contiene sacarosa y amoniaco. Un total de 30 kg
de sacarosa y de 15 kg de amoniaco son
consumidos en un periodo de 10 días. Estime los
requerimientos de enfriamiento.

Elemento Peso molecular ∆ℎ𝑐𝑜


Ácido propiónico 74,1 g gmol-1 -1527,3 kJ gmol-1
Ácido acético 60,1 g gmol-1 -874,2 kJ gmol-1
Ácido butírico 88,1 g gmol-1 -2183,6 kJ gmol-1
Ácido láctico 90 g gmol-1 -1368,3 kJ gmol-1
Biomasa 25,9 g gmol-1 -552 kJ gmol-1
Sacarosa 342,3 g gmol-1 -5644,9 kJ gmol-1

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Osorio-Tobón Ph.D.
POTENCIALES TERMODINÁMICOS

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Osorio-Tobón Ph.D.
Energía libre Helmholtz
• Expresa la cantidad de energía disponible para
realizar trabajo en sistemas isotérmicos
cerrados a volumen constante que
intercambian calor con un único foco térmico.

∆𝐴 = ∆𝑈 − 𝑇∆𝑆

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Energía libre de Gibbs
• Valido para sistemas biológicos (intercambian
energía con un foco térmico a presión
constante).
• Es una variable que sirve para calcular el grado
de espontaneidad de una reacción.
• Se mide en julios, como energía que es.

∆𝐺 = ∆𝐻 − 𝑇∆𝑆
BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
“La entropía puede utilizarse como criterio de espontaneidad,
pero deben estimarse los cambios entrópicos tanto en el sistema
cómo en los alrededores”
Sistema Biológico Denominación del proceso
∆H > 0 Se calienta Endotérmico
∆H < 0 Se enfría Exotérmico
∆H = 0 No hay transferencia Equilibrio
∆S > 0 ¿Aumenta desorden? Favorable termodinámicamente
∆S < 0 ¿Aumenta orden? Desfavorable termodinámicamente
∆S = 0 Equilibrio Equilibrio
∆G > 0 Aumenta capacidad de realizar trabajo No espontáneo (Endergónico)
∆G < 0 Disminuye capacidad de realizar trabajo Espontáneo (Exergónico)
∆G = 0 Equilibrio Equilibrio

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Criterios de espontaneidad
H S G Resultado
+ No espontáneo a baja temperatura
+ +
Espontáneo a alta temperatura
-
+ No espontáneo a alta temperatura
- -
Espontáneo a baja temperatura
-
+ - + No espontáneo a cualquier temperatura

- + - Espontáneo a cualquier temperatura

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Ley de Hess
“En una reacción química
expresada como la suma (o
diferencia) algebraica de
∆𝐻 = 𝐻𝑝𝑟𝑜𝑑 − 𝐻𝑟𝑒𝑎𝑐𝑡 = 𝑞𝑝
otras reacciones químicas, la
entalpia, entropía o energía
libre de Gibbs de reacción ∆𝑆 = 𝑆𝑝𝑟𝑜𝑑 − 𝑆𝑟𝑒𝑎𝑐𝑡
global es también la suma (ò
diferencia) algebraica de las ∆𝐺 = 𝐺𝑝𝑟𝑜𝑑 − 𝐺𝑟𝑒𝑎𝑐𝑡
entalpias, entropías o
energías libres de Gibbs de
otras reacciones”
BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
Utilizando los valores tabulados, calcule el
cambio de entropía de la reacción:
1
2𝐶𝑂 𝑔 + 3𝐻2 𝑔 → 𝐶2 𝐻5 𝑂𝐻 𝑙 + 𝑂2 (𝑔)
2
Compuesto Sº (Kcal/molK) Compuesto Sº(Kcal/molK)

H2(g) 31,21 C2H5OH(l) 38,40


CO(g) 47,30 O2(g) 49,00

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
La reacción de síntesis del acetileno, C2H2, es :
2 C(grafito) + H2(g) = C2H2(g)

Calcula su variación de entalpía a partir de las siguientes


ecuaciones:
C(grafito) + O2(g) ------------ CO2(g) ; ΔH= - 393,5 KJ

H2(g) + 1/2O2(g) ------------ H2O(l) ; ΔH= - 285,8 KJ


2C2H2(g) + 5O2(g) -------------- 4CO2(g) + 2H2O(l) ; ΔH = - 2598,8 KJ

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
• Determine el calor de reacción de:
N2H4 + O2 ---> N2 + 2H2O

Dadas las siguientes ecuaciones:


2NH3 + 3N2O ---> 4N2 + 3H2O ΔH = -1013 kJ
N2O + 3H2 ---> N2H4 + H2O ΔH = -317 kJ
2NH3 + 1/2O2 ----> N2H4 + H2O ΔH = -142.9 kJ
H2 + 1/2O2 ---> H2O ΔH = -285.8 kJ

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejercicio
¿La siguiente reacción es endotérmica o
exotérmica?
𝐹𝑒𝑂 𝑠 + 𝐶𝑂 𝑔 → 𝐹𝑒 𝑠 + 𝐶𝑂2 (𝑔)
Utilice las siguientes reacciones químicas:

3𝐹𝑒2 𝑂3 𝑠 + 𝐶𝑂 𝑔 → 2𝐹𝑒3 𝑂4 𝑠 + 𝐶𝑂2 ∆𝐻 = −47,0 𝑘𝐽


𝐹𝑒2 𝑂3 𝑠 + 3𝐶𝑂 𝑔 → 2𝐹𝑒 𝑠 + 3𝐶𝑂2 ∆𝐻 = −25,0 𝑘𝐽
𝐹𝑒3 𝑂4 𝑠 + 𝐶𝑂 𝑔 → 3𝐹𝑒𝑂 𝑠 + 𝐶𝑂2 ∆𝐻 = +19,0 𝑘𝐽

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Osorio-Tobón Ph.D.
TRANSFERENCIA DE CALOR

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Osorio-Tobón Ph.D.
Conducción
𝐾𝐴 𝑇𝑐 − 𝑇𝑓
• A través de un material 𝑄=
sólido. 𝐿
𝑄 = Flujo calórico. (J/s = watt)
𝐾 = Conductividad del
material. (Watt./mK)
𝐴 = Área de transferencia.
(m2)
𝑇𝑐 = Temperatura extremo
caliente. (K)
𝑇𝑓 = Temperatura extremo
Fuente:http://phys.org/news/2014-12-what-is-heat-conduction.html
frío. (K)
𝐿 = Espesor del material. (m)

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Osorio-Tobón Ph.D.
Convección
• sólido-fluido, fluido-fluido. 𝑄 = ℎ𝐴 𝑇𝑠 − 𝑇𝑔
• No es posible escribir una 𝑄 = Flujo calórico. (J/s = watt)
ecuación simple. Para el ℎ = Constante de transmisión
caso de aire calentado por por convección. (Watt/m.m.K)
una superficie caliente, se
𝐴 = Área de transferencia.
utiliza la fórmula empírica.
(m.m)
𝑇𝑠 = Temperatura de la
Fuente: www.thinglink.com

superficie. (K)
𝑇𝑔 = Temperatura del fluido
lejano. (K)

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Osorio-Tobón Ph.D.
Radiación
• Ley de Stefan -Boltzmann. 𝑄 = 𝜀𝜎𝐴 𝑇𝑒4 − 𝑇𝑟4
𝑄 = Flujo calórico. (J/s = watt)
𝜀 = Coeficiente de emisividad
Conducción Convección del cuerpo radiante.
𝐴 = Área de transferencia. (m2)
Radiación
𝜎 = Constante de S-B.
(Watt/m2K4)
Fuente: www.ces.fau.edu

𝑇𝑒 = Temperatura del cuerpo


Radiación radiante. (K)
𝑇𝑟 = Temperatura del cuerpo
receptor. (K)

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
Para mantener constante una temperatura de 30 ºC
en una colonia de bacterias debemos suministrar
30 W de potencia calefactora. Las bacterias están
en un recipiente de vidrio (Kvidrio = 0,2 cal/(s m K))
de área 20 cm2 y cuyas paredes tienen un espesor
de 0,5 mm. En el exterior del recipiente la
temperatura es de 15 ºC. ¿Cuál es el ritmo
metabólico de la colonia de bacterias? (Suponer
que las bacterias solo pierden calor por conducción
a través del vidrio).
Nota: Qrecipiente = Qsuminitrado+RM

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Osorio-Tobón Ph.D.
CALORIMETRÍA

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Osorio-Tobón Ph.D.
Introducción
Calor • Energía que recibe un cuerpo que
hace que aumente su temperatura
sensible y cambio de fase.
• Energía requerida por una cantidad
latente de sustancia para cambiar de fase.

Estimación del
calor y la • 𝑄 = 𝐶𝑝 𝑚∆𝑇
capacidad • 𝐶𝑝𝑀 = 𝑥𝑖 𝐶𝑝𝑖
calorífica

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Osorio-Tobón Ph.D.
Calculo de 𝐶𝑝 para la biomasa
Para biomasa se utiliza la ley de Kopp para un compuesto sólido
que responde a la fórmula 𝐶𝛼 𝐻𝛽 𝑂𝛾 𝑁𝛿 .
Aporte Cp (J/átomo. K)

Elemento Sólido Líquido


C 7,524 11,704
H 9,614 17,974
O 16,720 25,080
P 22,572 30,932
S - 30,932
Otros 25,916 33,440
Cp (J/mole. K) = α(7,524) + β(9,614) + γ(16,720) + δ(25,916).

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Osorio-Tobón Ph.D.
• Para algunos microorganismos se conoce su fórmula
molecular promedio. De lo contrario puede utilizarse
la fórmula general 𝐶𝐻1,8 𝑂0,5 𝑁0,2 .

Microorganismo Fórmula Masa molar

A. aerógenes CH1,78 O0,33N0,24 22,5

Otras bacterias CH2O0,5N0,25 25,5

Klebsiella CH1,74O0,43N0,22 23,7

C. utilis CH1,82O0,47N0,19 24,0

Otras levaduras CH1,66O0,4N0,13 23,5

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
Calcule la capacidad calorífica específica de una
crema de levadura S. cereviciae que circula en el
proceso de producción de alcohol etílico por vía
fermentativa y que contiene 13 % de levadura
en agua.
La capacidad calorífica específica del agua es de
4,18 J g-1K-1

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Osorio-Tobón Ph.D.
Biofísica de Macromoléculas
Introducción
Organización
estructural y
procesos biológicos

Organización y
Proteínas Propiedades
fisicoquímicas
funcionamiento
de la vida

ADN
BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
Fuente: mrmitchellsbiology.weebly.com
PROTEÍNAS

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Osorio-Tobón Ph.D.
Introducción
Genes que
contienen Membrana
los codones nuclear

Funciones de los aa

dinámicas Transcripción

• Catálisis. mRNA que


contiene los
codones de los aa
• Transporte.
• Control Traducción

metabólico. Proteína con la secuencia


especifica de aa

• Contracción.
BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
Estructura general
• Estos dos grupos se
pueden ionizar en medio
acuoso.
• El grupo carboxilo se
comporta como un ácido
Fuente: depa.fquim.unam.mx

débil y el grupo amino,


como una base débil.
• Lys, Arg, His, Asp y Glu
tienen otro grupo
ionizable en su cadena
lateral .

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Osorio-Tobón Ph.D.
Carga y propiedades
Liberan y captan protones
Los aminoácidos pueden
actuar como ácidos o
bases. En condiciones de
pH fisiológico se
encuentran
predominantemente en la
forma zwiteriónica.
Fuente: www.ehu.eus

Fuente: www.vi.cl
BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
Punto Isoeléctrico
pH en el cual un aa es eléctricamente neutro y
esta en forma zwitteriónica
𝑝𝐾𝑎 𝐶𝑂𝑂𝐻+ 𝑝𝐾𝑎 𝑁𝐻3+
• 𝑝𝐼 =
2

Fuente: apuntesbioquimicageneral.blogspot.com
• Es constante para un compuesto determinado
en unas condiciones definidas de fuerza iónica
y temperatura.
• Es posible predecir la carga eléctrica de los aa.

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Osorio-Tobón Ph.D.
La disociación de un
protón de un acido se
caracteriza por una
Constante de disociación aa • Los grupos R tienen
acida (𝑲𝒂 ): básicos átomos de N.
𝟏
𝒑𝑲𝒂 = log 𝟏𝟎 aa • Los grupos R tienen
𝑲𝒂 átomos de -COOH
ácidos
• El 𝒑𝑲𝒂 real depende
del medio en que se
encuentre el medio
acido.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
1
𝑝𝐼 = 2,34 + 9,60
2
= 5,97
• La glicina tendrá carga
negativa a cualquier pH
por encima de su 𝑝𝐼.
• Cuanto más alejado del
Fuente: Lehninger (2010)

𝑝𝐼 mayor será la carga


eléctrica neta.

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
pI en a.a. con grupos R ionizables

Fuente: Lehninger (2010)

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
• Usando los valores de pKa dados en la tabla,
calcule la forma iónica de la lisina a los
siguientes pHs: 1, 7 y 13.
• Calcule su punto isoeléctrico.

Fuente: Lehninger (2010)


pK1 (−𝑪𝑶𝑶𝑯) pK2 (𝑵𝑯+
𝟑) pKR (𝑮𝒓𝒖𝒑𝒐 𝑹)
2,18 8,95 10,53

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Fuente: Lehninger (2010)
Ejemplo
Calcule el 𝑝𝐼 para Tyr e Ile.
aa pK1 (−𝑪𝑶𝑶𝑯) pK2 (𝑵𝑯+
𝟑) pKR (𝑮𝒓𝒖𝒑𝒐 𝑹)
Tyr 2,2 9,11 10,07
Ile 2,36 9,68
Fuente: Lehninger (2010)

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejercicio
• Escribir la estructura iónica predominante a
pH 3.0 y 13.0 de los siguientes aa.

Glutamato Glicina

Fuente: www.biorede.pt
R -CH2CH2COOH -H
pK1 (−𝑪𝑶𝑶𝑯) 2.13 2.35
pK2 (𝑵𝑯𝟑+) 9.95 9.78
pKR 4.32 -----

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Osorio-Tobón Ph.D.
Enlace peptídico

• Formado por la

Fuente: Lehninger (2010)


deshidratación del
grupo los grupos
carboxilo y amino.
• Reacción de
condensación.

Fuente: Lehninger (2010)


• Dipéptido, tripéptido,
oligopéptido,
polipéptido.

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Solo pueden ser
ionizados los
grupos terminales
y algunos radicales

Fuente: Lehninger (2010)


El comportamiento
acido base puede
ser predicho a
partir de estos

Estos péptidos
tienen curvas de
titulación y pI
característicos

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
Calcule la carga neta eléctrica del polipéptido a
pH 1, 7 y 10:
Glu-Gly-Ala-Lys

Fuente: Lehninger (2010)

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
• El enlace C-N en un péptido es mas corto que el mismo
enlace en grupo aa.
• Los enlaces peptídicos son incapaces de rotar libremente.
• La rotación solo es permitida en los enlaces N-Cα y Cα-C.
• 𝜙(𝑝ℎ𝑖) → 𝑁 − 𝐶𝛼 .
• 𝜓(𝑝𝑠𝑖) → 𝐶𝛼 − 𝐶.
• -180o y +180o.

Fuente: Lehninger (2010)


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Osorio-Tobón Ph.D.
Diagramas de Ramachandran
• Presenta los valores
permitidos para 𝜙 y 𝜓.
• Conformaciones permitidas.
• Azul oscuro:
Conformaciones que no
implican sobre posición.

Fuente: Lehninger (2010)


• Azul medio:
Conformaciones permitidas
al limite del contacto.
• Azul claro: Conformaciones
permitidas con una
pequeña flexibilidad en los
ángulos.

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Osorio-Tobón Ph.D.
APLICACIONES BASADAS EN LA
CARGA ELÉCTRICA
BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
Electroforesis
Movimiento de las Afecta la
proteínas en un estructura y por lo
campo eléctrico tanto la función

También es
Gel actúa como un
afectada por el

Fuente: Lehninger (2010)


colador
tamaño

𝑉 𝑍
𝜇= =
𝐸 𝑓

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Determinación del pI

Es establecido un
gradiente de pH

Fuente: Lehninger (2010)


Se distribuyen en
un campo eléctrico
generado a lo largo
del gel
BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
Solubilidad de las proteínas
Depende de:

• Su composición en aminoácidos (una proteína rica


en aminoácidos polares es en general más soluble
que una rica en aminoácidos hidrofóbicos).
• Su estructura tridimensional (las proteínas fibrosas
son en general menos solubles que las globulares).
• El entorno de la propia proteína ( temperatura;
constante dieléctrica del medio; pH y fuerza iónica.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Solubilidad y pH
Repulsión La solubilidad de las proteínas depende
+ + + en gran medida del pH
+ +
+ + pH = pI
Carga neta 0
pH < pI
Carga neta +
+
- - -+
+ +
- - - + - -+
- -
-- -
Puentes salinos e interacciones
pH > pI Van der Waals
Carga neta -

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Solubilidad y fuerza iónica (I)

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Osorio-Tobón Ph.D.
DESNATURALIZACIÓN DE
PROTEÍNAS
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Osorio-Tobón Ph.D.
Introducción
Los agentes que provocan la desnaturalización de
una proteína se llaman agentes desnaturalizantes
- La polaridad del
disolvente
Agentes físicos
Desnaturalización - La fuerza iónica
(calor) y químicos
reversible
(hidrólisis) - El pH
- La temperatura.

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
• La perdida de
estructura una parte,
desestabiliza las otras.
• La mayoría de la
proteínas poseen una

Fuente: Lehninger (2010)


temperatura de fusión
(Tm), temperatura a la
cual el 50% de la
proteína se encuentra
desnaturalizada) a
determinado pH y
fuerza iónica.

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
La paradoja de Levinthal
En los seres vivos, las proteínas se forman a
partir de aa a una tasa muy alta.
Una proteína pequeña como la RNAsa A, que tiene
124 aminoácidos tiene 1050 conformaciones posibles.
Si la molécula pudiese probar una configuración cada
10-13 segundos, serían necesarios 1030 años para
probarlas todas. Sin embargo, se ha comprobado in
vitro que la RNAsa de pliega en aproximadamente 1
minuto.
Su plegamiento no puede ser un proceso
completamente aleatorio.

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Fuente: Glaser (2012)
Fuente: Glaser (2012)

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Ejercicio
Predecir la dirección de migración (es decir,
estacionario, hacia el cátodo (+) o hacia el
ánodo (-)) de los siguientes péptidos, durante la
electroforesis sobre papel a pH 1,9 y 10,0 del
polipéptidos :
a) Lys-Gly-Ala
b) Gln-Gly-Ala-Lys
c) Determina el punto isoeléctrico de cada
péptido.

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
ÁCIDOS NUCLEICOS

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Osorio-Tobón Ph.D.
Introducción
Los nucleótidos constan de
una pentosa (ribosa en
RNA y desoxirribosa en
DNA), una base y de 1 a 3
Proteínas fosfatos.

Secuencia de
nucleótidos

Fuente: bifi.es
Componentes
Biomolecular
celulares

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Fuente: profesorobles.blogspot.com
Bases nitrogenadas

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Propiedades fisicoquímicas
• Las bases son
Azúcar estructuras polares.
• Papel básicamente
y estructural. • Tienen momentos
fosfatos dipolares que pueden
ser elevados.
• Funcional.
• Modulan de un modo
específico las
Bases interacciones que
suceden en los ácidos
nucleicos

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Protonación
• Al igual que los aminoácidos, las
bases nitrogenadas tienen
grupos ionizables que pueden
alterar la estructura de los ácidos
nucleicos.
• Son las reacciones de mayor
trascendencia funcional.

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Fuente: Blackburn y Gait (1995)

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Estructura del ADN

Juegan un papel
Muy flexible importante en
el metabolismo

B es el mas
A → Agua
estable

Fuente: web.uconn.edu
Z → hacia la
izquierda

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Fuente: Lehninger (2010)
BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
Desnaturalización del ADN
El Tm es un indicativo de la estabilidad
térmica de la molécula de interés.

pH 7 y T ambiente
→ Viscosidad
La
pH extremo o T por
viscosidad
encima de 80oC
decrece

Fuente: cbc.arizona.edu
Su adsorción Efecto
UV hipocrómico
disminuye o o
aumenta hipercrómico

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Osorio-Tobón Ph.D.
• Cada especie de ADN tiene una Tm
característica.
• Entre mas 𝐺 ≡ 𝐶 mas alto es el Tm.
• 𝐴 = 𝑇 se pueden desnaturalizar
selectivamente.
• RNA tienen mayores Tm que el ADN.

Fuente: Lehninger (2010)


Fuente: Lehninger (2010)

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
• La ecuación lineal utilizada para calcular el Tm
(oC) de una molécula de ADN es:
500
𝑇𝑚 = 81,5 + 16,6 log 𝑁𝑎+ + 𝐾 + + 0,41 %𝐺 + 𝐶 −
𝑛ú𝑚𝑒𝑟𝑜 𝑑𝑒 𝑛𝑢𝑐𝑙𝑒𝑜𝑡𝑖𝑑𝑜𝑠

• 𝑁𝑎 + en (mol l-1).
• Valida para concentraciones mayores a 0,2 M.

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
• Cual es la Tm de una molécula de ADN que
tiene una longitud de 450 pb y tiene un
contenido de GC de 50%. Asuma que la
concentración de iones de sodio es 1000 mM.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejercicios
1. Cual es el porcentaje de GC de una molécula
de ADN de 800 pb que tiene una Tm de 92oC.
La molecula esta en una solución 900 mM de
Na+ y 200 nM de K+.
2. Suponga que tiene dos muestras de ADN. La
muestra 1 tiene 1050 pb y la muestra 2 tiene
640 pb. Si ambas tienen el mismo porcentaje
de GC, cual de las dos tendrá la mayor Tm.

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Desde un punto de vista
termodinámico
En cadenas cortas (diseño de
• Favorable.
H • AT → -8,5 kcals mol-1.
• GC → -9,4 kcals mol-1.
Tm se
primers)
Tienden a
separarse Requieren
incrementa
sin pasar un modelo
con el
por más

S • Desfavorable. aumento de
estructuras refinado
la cadena
• -24,85 cal mol-1K-1. intermedias

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Osorio-Tobón Ph.D.
Modelo del vecino más cercano
1000∆𝐻
𝑇𝑚 °𝐶 = − 273,15 + 16,6 log 𝑁𝑎 +
𝐶𝑇
−10,8 + ∆𝑆 + 𝑅𝑙𝑛 4
Donde:
∆𝐻 𝑒𝑛 𝐾𝑐𝑎𝑙 𝑚𝑜𝑙 −1
∆𝑆 𝑒𝑛 𝑐𝑎𝑙 𝑚𝑜𝑙 −1 𝐾 −1
𝑅 = 1.99 𝑐𝑎𝑙 𝑚𝑜𝑙 −1 𝐾 −1
𝐶𝑇 𝑦 𝑁𝑎 + 𝑒𝑛 𝑀
Generalmente en PCR:
𝐶𝑇 = 0,5 𝜇𝑀 𝑦 𝑁𝑎+ = 50 𝑚𝑀

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Osorio-Tobón Ph.D.
ΔHo(kcal mol-1) y ΔSo(cal mol-1 K-1)

Breslauer et al. Allawi & Sugimoto et al.


SantaLucia (1996)
Secuencia (1986) SantaLucia (1997) (1996)
ΔHo ΔSo ΔHo ΔSo ΔHo ΔSo ΔHo ΔSo
AA/TT -9,1 -24,0 -8,4 -23,6 -7,9 -22,2 -8,0 -21,9
AG/TC -7,8 -20,8 -6,1 -16,1 -7,8 -21,0 -6,6 -16,4
AT/TA -8,6 -23,9 -6,5 -18,8 -7,2 -20,4 -5,6 -15,2
AC/TG -6,5 -17,3 -8,6 -23,0 -8,4 -22,4 -9,4 -25,5
GA/CT -5,6 -13,5 -7,7 -20,3 -8,2 -22,2 -8,8 -23,5
GG/CC -11,0 -26,6 -6,7 -15,6 -8,0 -19,9 -10,9 -28,4
GC/CG -11,1 -26,7 -11,1 -28,4 -9,8 -24,4 -10,5 -26,4
TA/AT -6,0 -16,9 -6,3 -18,5 -7,2 -21,3 -6,6 -18,4
CA/GT -5,8 -12,9 -7,4 -19,3 -8,5 -22,7 -8,2 -21,0
CG/GC -11,9 -27,8 -10,1 -25,5 -10,6 -27,2 -11,8 -29,0
Fuente: http://web.nmsu.edu/

Iniciación con uno o dos G·C 0,0 -20,1 0,0 -5,9 0,6 -9,0
Iniciación con un solo A·T 0,0 -16,8 0,0 -9,0 0,6 -9,0
Corrección de simetría 0,0 -1,3 0,0 -1,4 0,0 -1,4 0,0 -1,4
5' T·A corrección 0,4 0,0
A·T par de bases fina 2,3 4,1
G·C par de bases final 0,1 -2,8

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
• Calcule el Tm para la secuencia
GTTTTCCCAGTCACGAC
• Asuma que la concentración de la cadena de
ADN es 200 nM y la concentración de Na+ es
de 900 mM.

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
MEMBRANAS BIOLÓGICAS

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Introducción
Son barreras de permeabilidad selectiva que
permiten a la célula mantener una
composición citoplasmática distinta del
medio extracelular y la formación de
compartimentos internos.

Fuente: elprofedebiolo.blogspot.com
Recepción y transmisión
Permeabilidad selectiva

Producción, control y
conservación de

electroquímicos

de señales
gradientes

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Composición y arquitectura
En promedio: 55% de
Básicamente están
proteínas, 25% de
conformadas por
fosfolípidos, 13% de
lípidos, proteínas y
colesterol, 4% de otros
glúcidos
lípidos y 3% de glúcidos

Fuente: Lehninger (2010)


BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
Todas las membranas biológicas comparten las mismas
propiedades fundamentales

Fuente: Lehninger (2010)


BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
Periféricas Integrales
Proteínas de membrana
• Se encuentran fuertemente
ligadas a la bicapa por
interacciones hidrofóbicas.
• Solo pueden disolverse
utilizando detergentes,
solventes orgánicos o
desnaturalizantes.

Fuente: Lehninger (2010)


• Sólo interactúan con la
superficie polar de la
membrana y pueden
disociarse mediante cambios
de pH o fuerza iónica.

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Función de las proteínas
Canales
• Proteínas integrales que actúan como poros.
(integrales)

Transportadoras • Cambian de forma para dar paso a determinados


(integrales) productos.

Receptores • Reconocen determinadas moléculas a las que se unen o


(integrales) fijan.

Enzimas
• Catalizan reacciones en la superficie de la membrana.
(integrales o periféricas)

Anclajes del citolesqueleto • Se encuentran en la parte del citosol de la membrana y


(periféricas) sirven para fijar los filamentos del citoesqueleto.

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Permeabilidad
selectiva de las membranas

Fuente: www.abpischools.org.uk
BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
Fuente: Lehninger (2010)
BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
Tipos de transporte
a través de membranas
Transporte Pasivo
No requiere energía
Transportadores
Difusión simple.

(facilitado)

Canales

Fuente: Lehninger (2010)


Este proceso se realiza a favor de un
gradiente de concentración y/o carga.
∆G < 0

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
El paso a través de la
membrana de un soluto polar o
cargado debe dejar y
establecer ciertas interacciones
Las proteínas de
membrana disminuyen
la energía de activación
para el transporte

Fuente: Lehninger (2010)


Los transportadores al
igual que las enzimas
tienen especificidad
estereoquímica
BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
Requiere energía para mover el Transporte activo
de concentración y/o eléctrico.
soluto en contra del gradiente

• Hidrólisis del
ATP (T.A.P).

Fuente: Lehninger (2010)


• Acoplamiento
del
movimiento
de una
sustancia por
otra (T.A.S).

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Osorio-Tobón Ph.D.
Cantidad de energía
𝑃
para transportar el
soluto a través del • ∆𝐺 = ∆𝐺 ′𝑜 + 𝑅𝑇 ln 𝑆
gradiente

Cuando solo se
transporta de una 𝐶2
región con C1 hasta • ∆𝐺𝑡 = 𝑅𝑇 ln 𝐶1
otra con C2

Cuando e soluto es un 𝐶2
ion • ∆𝐺𝑡 = 𝑅𝑇 ln 𝐶1 + 𝑍𝔉∆𝜓

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Osorio-Tobón Ph.D.
• Transporte de iones en a
∆G < 0 favor de un gradiente
electroquímico.

• Transporte de iones en
∆G > 0 contra de un gradiente
electroquímico.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
Calcule el costo energético de mover un soluto
a través de una membrana de una región con
C1=1 M hasta una región con C2=10 M. La
temperatura es de 25oC y la membrana tiene un
potencial eléctrico de 0.1 V. Considere:
• Un soluto no cargado.
• Un soluto con carga +2.

R = 8.315 J mol-1K-1, 𝔉 = 96480 J V-1 mol-1

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Osorio-Tobón Ph.D.
MECANISMOS FÍSICO-QUÍMICOS DE
BIOPOTENCIALES
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Osorio-Tobón Ph.D.
Difusión pura a través de membranas
Los gradientes de concentración y el movimiento de iones a través de la
membrana crean una diferencia de potencial eléctrico entre el interior y el
exterior.

Potencial de membrana ∆𝜓

Estas diferencias en la distribución iónica se fundan en dos hechos

La actividad de las bombas


La difusión pasiva de iones
de iones

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Osorio-Tobón Ph.D.
𝐺 = 𝑓 𝐻, 𝑆 • Sistema cerrado.
• No hay trabajo
mecánico.
• Proceso reversible.

𝐺 = 𝑓 𝑇, 𝑃 𝑑𝐺 = −𝑆𝑑𝑇 + 𝑉𝑑𝑃

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Osorio-Tobón Ph.D.
Para sistemas abiertos
𝑑𝐺 = −𝑆𝑑𝑇 + 𝑉𝑑𝑃 + 𝜇𝑑𝑛
𝜕𝐺
Donde 𝜇 =
𝜕𝑛 𝑇,𝑃

𝑑𝐺 = −𝑆𝑑𝑇 + 𝑉𝑑𝑃 + 𝜇𝑖 𝑑𝑛𝑖


𝜕𝐺
Donde 𝜇𝑖 =
𝜕𝑛𝑖 𝑇,𝑃,𝑛
𝑗=𝑖

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Osorio-Tobón Ph.D.
Imagina un sistema cerrado reversible donde
se desarrollan los siguientes tipos de trabajo

𝑊𝑞 = 𝜓𝑑𝑞 𝑊𝑐 = −𝑃𝑑𝑉 𝑊𝑛 = 𝜇𝑑𝑛

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Osorio-Tobón Ph.D.
Para un sistema cerrado en el cual se suministra
calor: 𝑞 = 𝑛𝑧𝐹 𝑟

𝑑𝐺 = −𝑆𝑑𝑇 + 𝑉𝑑𝑃 + 𝜇𝑖 𝑑𝑛𝑖 + 𝜓𝑑𝑞


𝑖=1

Donde la carga de 𝑛 moles será 𝑞 = 𝑛𝑧𝐹 y 𝐹 es la


constante de Faraday (9,65x104 C/mol).
𝑟 𝑟 𝑟

𝜇𝑖 𝑑𝑛𝑖 + 𝜓 𝑧𝑖 𝐹𝑑𝑛𝑖 = 𝜇𝑖 + 𝑧𝑖 𝐹𝜓 𝑑𝑛𝑖 = 𝜇𝑑𝑛𝑖


𝑖=1 𝑖=1 𝑖=1

Potencial electroquímico

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Osorio-Tobón Ph.D.
Potencial electroquímico (𝜇𝑖 )
Hace referencia a las propiedades eléctricas y químicas de la
membrana celular y determina la dirección termodinámica
favorable para el movimiento de un ión a través de la membrana.

La combinación de ambos factores


El componente químico es resultado de la
determina la dirección termodinámica
diferencia de concentración diferencial de
favorable para el movimiento de un
iones a través de la membrana.
ión a través de la membrana.

𝜇 = 𝜇0 + 𝑅𝑇 ln 𝐶 + 𝑧𝐹𝜓

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ecuación de Nernst
Considere un sistema a P y T constante separado
en dos compartimientos por una membrana Si hay distintos componentes,
𝑒𝑥𝑡 𝑖𝑛𝑡 los potenciales
electroquímicos son iguales.
𝐶𝑖𝑒𝑥𝑡 𝐶𝑖𝑖𝑛𝑡
𝜇𝑖𝑒𝑥𝑡 𝜇𝑖𝑖𝑛𝑡 𝑅𝑇 𝐶𝑖𝑒𝑥𝑡
𝜓𝑖𝑒𝑥𝑡 𝜓𝑖𝑖𝑛𝑡 ∆𝜓 = ln 𝑖𝑛𝑡
𝑧𝑖 𝐹 𝐶𝑖

𝑅𝑇 𝑧𝑖 𝐹∆𝜓
A 25oC → = 25 𝑚𝑉 𝐶𝑖𝑖𝑛𝑡 = −
𝐶𝑖𝑒𝑥𝑡 𝑒 𝑅𝑇
𝑧𝐹

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Osorio-Tobón Ph.D.
La ecuación de Nernst permite…
• Calculo de la distribución de iones en función del
potencial eléctrico.
• Calculo del potencial eléctrico que se produce como
consecuencia de la distribución no uniforme de los iones.
• En general NO se pueden utilizar para calcular el
potencial de una célula viva.
• Solo cuando los iones se distribuyen pasivamente
(Cloruro).

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Osorio-Tobón Ph.D.
Para los diferentes iones

𝑅𝑇 𝐾 + 𝑒𝑥𝑡 𝑅𝑇 𝑁𝑎+ 𝑒𝑥𝑡 𝑅𝑇 𝐶𝑎2+ 𝑒𝑥𝑡


∆𝜓𝐾 = ln ∆𝜓𝑁𝑎 = ln ∆𝜓𝐶𝑎 = ln
+1 𝐹 𝐾 + 𝑖𝑛𝑡 +1 𝐹 𝑁𝑎+ 𝑖𝑛𝑡 +2 𝐹 𝐶𝑎2+ 𝑖𝑛𝑡

𝑅𝑇 𝐻 + 𝑒𝑥𝑡 𝑅𝑇 𝐶𝑙− 𝑒𝑥𝑡


∆𝜓𝐻 = ln ∆𝜓𝐶𝑙 = ln
+1 𝐹 𝐻 + 𝑖𝑛𝑡 −1 𝐹 𝐶𝑙− 𝑖𝑛𝑡

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Osorio-Tobón Ph.D.
El potencial de membrana es la diferencia de potencial eléctrico
a un lado y al otro de la membrana plasmática de una célula.

Concentración Concentración
Ion Potencial de equilibrio
intracelular extracelular
Sodio(Na+) 15 mM 145 mM 𝜓Na = +60,60 mV
Potasio (K+) 150 mM 4 mM 𝜓K = −96,81 mV
Calcio (Ca2+) 70 nM 2 mM 𝜓Ca = +137,04 mV
Ion hidrogeno (protón,
63 nM (pH 7,2) 40 nM (pH 7,4) 𝜓H = −12,13 mV
H +)
Magnesio (Mg2+) 0,5 mM 1 mM 𝜓Mg = +9,26 mV
Cloruro (Cl−) 10 mM 110 mM 𝜓Cl = −64,05 mV
Bicarbonato (HCO3−) 15 mM 24 mM 𝜓HCO3- = −12,55 mV

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
Para los siguientes iones calcule, el potencial
eléctrico. Las concentraciones están en mM.
Ion Interior Exterior
Na+ 14 140
K+ 140 4
Cl- 4 108

¿Hacia donde se mueven los iones? ¿Hacia el


interior o hacia el interior?

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
El potencial de equilibrio para el sodio es +58mV
cuando la concentración de sodio en el exterior
de la célula es 10 veces mayor que la del
interior. Que le pasaría al potencial si la
concentración extracelular de sodio se
incrementa en un valor de ¿10?, ¿100? ¿o si
disminuye en un factor de 10?
Explique porque el potencial cambia

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Osorio-Tobón Ph.D.
Ecuación de Nernst-Planck
• Explica como el flujo
1 𝑑𝑛𝑖 de una especie iónica
𝐽𝑖 =
𝐴 𝑑𝑡 a través de una
membrana depende
del gradiente de
potencial y del
gradiente de
𝑑𝜓 𝑑𝑐𝑖
𝐽𝑖 = −𝑢𝑖 𝑐𝑖 𝑧𝑖 𝐹 − 𝑢𝑖 𝑅𝑇 concentración.
𝑑𝑥 𝑑𝑥 • Procesos de difusión
pura a través de la
membrana.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Teoría de campo constante
Exterior Interior
𝐶𝑖𝑒𝑥𝑡 𝐶𝑖𝑖𝑛𝑡
𝐶𝑖𝑒𝑥𝑡 𝐶𝑖𝑖𝑛𝑡
𝜓𝑖𝑒𝑥𝑡 𝜓𝑖𝑖𝑛𝑡
Δx
x=0

• Estado estacionario: el flujo para cualquier componente es constante.


• La movilidad (𝑢𝑖 ) es constante en toda la membrana.
𝑑𝜓 ∆𝜓
• El campo eléctrico es constante en toda la membrana = con ∆𝜓 = 𝜓 𝑖𝑛𝑡 −
𝑑𝑥 ∆𝑥
𝜓 𝑒𝑥𝑡 .
𝑑𝜓
• 𝜓(x) es una función lineal de x → =cte.
𝑑𝑥

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Osorio-Tobón Ph.D.
• Relaciona explícitamente el flujo de la especie
𝑖 a través de la membrana en función de las
concentraciones y los potenciales
electrostáticos en el interior de la membrana
en la interfase exterior.
𝑢𝑖 𝑧𝑖 𝐹∆𝜓 𝑐𝑖𝑒𝑥𝑡 − 𝑐𝑖𝑖𝑛𝑡 𝑒 𝑧𝑖 𝐹Δ𝜓/𝑅𝑇
𝐽𝑖 = −
∆𝑥 1 − 𝑒 𝑧𝑖 𝐹Δ𝜓/𝑅𝑇

¿Qué pasaría en el caso de que no exista flujo


de la especie 𝒊?

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
• ¿Como debe ser el valor de la movilidad del
Sodio en comparación con la del potasio para
que el flujo de ambas especies sea igual si el
potencial de membrana es -90 mV? Las
concentraciones están en mM.
Ion Interior Exterior
Na+ 15 145
K+ 150 4

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Osorio-Tobón Ph.D.
Difusión iónica

Principio de electroneutralidad

• La suma de cargas negativas es igual a


la suma de cargas positivas en
cualquiera de los dos compartimientos
separados por una membrana.

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Osorio-Tobón Ph.D.
Potenciales de Gibbs-Donnan
∆𝜓 = 𝜓𝑖𝑛𝑡 − 𝜓 𝑒𝑥𝑡
Ext Int
𝑐𝐴𝑖𝑛𝑡 𝑐𝐵𝑒𝑥𝑡
𝑒𝑥𝑡 = 𝑖𝑛𝑡 = 𝑟
X- B- 𝑐𝐴 𝑐𝐵
• El potencial es determinado
A+ A+ por la cantidad de
componentes cargados de
la célula no intercambiables
• A+ y B- difunden. que provocan la distribución
• X- no difunde. asimétrica.
• En el equilibrio hay una 𝑅𝑇
∆𝜓 = − ln 𝑟
distribución asimétrica. 𝐹

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
Para un equilibrio de Gibbs-Donnan, las
concentraciones iniciales en la solución interna de NaCl
es 3 mM y en la externa de NaP es de 3 mM. La
membrana es impermeable a P-. Asuma volúmenes
iguales y que la presión necesaria para el equilibrio
osmótico no involucra el flujo de agua. Calcule:
• Las concentraciones de equilibrio de los iones.
• La magnitud del potencial de membrana y su
dirección.
R = 8.315 J mol-1K-1 F = 9.65 x 104 C mol-1

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Creación de potenciales de difusión
𝑑 𝑐+ 𝑑𝜓
𝐽+ = −𝑢+ 𝑅𝑇 − 𝑢+ 𝑧+ 𝑐+ 𝐹
Ext Int 𝑑𝑥 𝑑𝑥
B- 𝑑 𝑐− 𝑑𝜓
𝐽− = −𝑢− 𝑅𝑇 − 𝑢− 𝑧− 𝑐− 𝐹
𝑑𝑥 𝑑𝑥

A+
𝐽+ = 𝐽−

• La movilidad de A+ es
menor que la de B-.
𝑢+ − 𝑢− 𝑅𝑇 𝑐 𝑖𝑛𝑡
• Ambos se difunden con la ∆𝜓 = − ln 𝑒𝑥𝑡
misma velocidad. 𝑢+ + 𝑢− 𝐹 𝑐
• Velocidad intermedia (𝑢)

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
Comparar el potencial de difusión antes y
después de aumentar la concentración en el
compartimiento interior 2 veces. Las
concentraciones iniciales eran de 70 mM y 3
mM en el interior y exterior, respectivamente.

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Ecuación de Goldman Hodgkin Katz
• En un axón aplicando la
𝐽+ = 𝐽−
teoría del campo
+ −
constante, con varios
aniones y cationes
monovalentes.
𝐹∆𝜓 𝑅𝑇 ∑+ 𝑝+ 𝑐+𝑖𝑛𝑡 + ∑− 𝑝− 𝑐−𝑒𝑥𝑡
𝑝+ 𝐹∆𝜓 𝑐+𝑒𝑥𝑡 − 𝑐+𝑖𝑛𝑡 𝑒 𝑅𝑇 ∆𝜓 = − ln
𝐽+ = − 𝐹 ∑+ 𝑝+ 𝑐+𝑒𝑥𝑡 + ∑− 𝑝− 𝑐−𝑖𝑛𝑡
𝑅𝑇 𝐹∆𝜓
1−𝑒 𝑅𝑇
−𝐹∆𝜓
𝑝− 𝐹∆𝜓 𝑐−𝑒𝑥𝑡 𝑖𝑛𝑡
− 𝑐− 𝑒 𝑅𝑇
𝐽− = −𝐹∆𝜓
𝑅𝑇
1−𝑒 𝑅𝑇

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
En el caso de un axón de una neurona,
el potencial se debe a los iones Na+, K+
y Cl-
Fuente: cinpla.org

𝑖𝑛𝑡 𝑒𝑥𝑡
𝑅𝑇 𝑝𝑁𝑎 𝑐𝑁𝑎 + 𝑝𝐾 𝑐𝐾𝑖𝑛𝑡 + 𝑝𝐶𝑙 𝑐𝐶𝑙
∆𝜓 = − ln 𝑒𝑥𝑡 𝑒𝑥𝑡 𝑖𝑛𝑡
𝐹 𝑝𝑁𝑎 𝑐𝑁𝑎 + 𝑝𝐾 𝑐𝐾 + 𝑝𝐶𝑙 𝑐𝐶𝑙

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
¿Qué pasaría si la permeabilidad de
uno de los iones es mucho mayor que
la de los demás?

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Ejemplo
Calcular el potencial eléctrico de membrana en
una célula de mamífero según los datos de la
tabla:
Concentración (mM)
Ion Citosol Medio Permeabilidad
(cm/s)
K+ 139 4 10-7
Na+ 12 145 10-8
Cl- 4 116 10-8

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
En resumen
𝑅𝑇 𝐶𝑖𝑒𝑥𝑡
Nernst • Solo para una sola especie. ∆𝜓 =
𝑧𝑖 𝐹
ln 𝑖𝑛𝑡
𝐶𝑖

𝑑𝜓 𝑑𝑐𝑖
Nernst-Planck • Explica el flujo de materia. 𝐽𝑖 = −𝑢𝑖 𝑐𝑖 𝑧𝑖 𝐹 − 𝑢𝑖 𝑅𝑇
𝑑𝑥 𝑑𝑥

Teoría de campo • Estudio e integración. 𝑢𝑖 𝑧𝑖 𝐹∆𝜓 𝑐𝑖𝑒𝑥𝑡 − 𝑐𝑖𝑖𝑛𝑡 𝑒 𝑧𝑖 𝐹Δ𝜓/𝑅𝑇


constante • Nernst-Planck. 𝐽𝑖 = −
∆𝑥 1 − 𝑒 𝑧𝑖𝐹𝜓/𝑅𝑇

Gibbs-Donnan • Cuando una especie no difunde. 𝑅𝑇


∆𝜓 = − ln 𝑟
𝐹

𝑢+ − 𝑢− 𝑅𝑇 𝑐 𝑖𝑛𝑡
Potenciales de difusión • Cuando la movilidad es diferente. ∆𝜓 = − ln
𝑢+ + 𝑢− 𝐹 𝑐 𝑒𝑥𝑡

𝑖𝑛𝑡 𝑒𝑥𝑡
• Varios aniones y 𝑅𝑇 𝑝𝑁𝑎 𝑐𝑁𝑎 + 𝑝𝐾 𝑐𝐾𝑖𝑛𝑡 + 𝑝𝐶𝑙 𝑐𝐶𝑙
Goldman Hodgkin Katz • cationes monovalentes.
∆𝜓 = −
𝐹
ln 𝑒𝑥𝑡
𝑝𝑁𝑎 𝑐𝑁𝑎 + 𝑝𝐾 𝑐𝐾𝑒𝑥𝑡 + 𝑝𝐶𝑙 𝑐𝐶𝑙
𝑖𝑛𝑡

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Potencial de reposo
Valor del potencial de membrana en estado
estacionario. Es siempre negativo, la cara interna de
la membrana siempre es negativa en relación a la
externa. Se cree que el Na+ es el responsable de la
creación del potencial de reposo.

Fuente: Aurengo y Petitclerc (2015)

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Teoría de Boyle y Conway

Fuente: Aurengo y Petitclerc (2015)


𝑅𝑇
∆𝜓 = − ln 𝑟
𝐹
• La membrana es impermeable al Na+.
• Se utiliza la ecuación de Donnan.

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Limites de la teoría de Boyle
• Existe en la realidad un
gradiente de salida de
potasio superior al
gradiente eléctrico de
entrada.
• Si se varia la 𝐶𝐾𝑒𝑥𝑡 + el
potencial de membrana Fuente: Aurengo y Petitclerc (2015)

no varia linealmente.
• En realidad la membrana
celular es permeable al
sodio.

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Teoría de Hodgkin y Huxley
• La permeabilidad a
ciertos iones no es la
misma.

Fuente: Aurengo y Petitclerc (2015)


• El potencial es el
necesario para
mantener la
electroneutralidad.
• Se utiliza la ecuación de
Goldman.
𝑖𝑛𝑡 𝑒𝑥𝑡
𝑅𝑇 𝑝𝑁𝑎 𝑐𝑁𝑎 + 𝑝𝐾 𝑐𝐾𝑖𝑛𝑡 + 𝑝𝐶𝑙 𝑐𝐶𝑙
∆𝜓 = − ln 𝑒𝑥𝑡 𝑖𝑛𝑡
𝐹 𝑝𝑁𝑎 𝑐𝑁𝑎 + 𝑝𝐾 𝑐𝐾𝑒𝑥𝑡 + 𝑝𝐶𝑙 𝑐𝐶𝑙

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Mantenimiento del potencial de
reposo
• Tiende a desaparecer

Fuente: Aurengo y Petitclerc (2015)


espontáneamente.
• Existe un flujo de salida
de Na+ y uno de entrada
de K+.
• La membrana
Fuente: Aurengo y Petitclerc (2015)

proporciona la energía
necesaria para el
transporte (Activo).
• Entra un ion de K+ y sale
un ion de Na+.

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Potencial de acción
Cambio muy rápido en la polaridad de la membrana
de negativo a positivo y vuelta a negativo.

Es una onda de descarga eléctrica que viaja a lo largo de la


membrana de la célula. Se utilizan para llevar información
entre unos tejidos y otros.

Plantas → flujos de potasio y


Animales → potasio y sodio
calcio

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.
Fuente: Aurengo y Petitclerc (2015)
BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe
Osorio-Tobón Ph.D.
El potencial de acción es un
fenómeno…
Drástico Rápido

Irreversible Todo o nada


Fuente: Aurengo y Petitclerc (2015)

De gran
amplitud
Transitorio
https://www.youtube.com/watch?v=HYLyhXRp298

BIO403 Biofísica – Notas de clase – J. Felipe


Osorio-Tobón Ph.D.

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