GENÉTICA DE POBLACIONES DE PECES

Y MARCADORES MOLECULARES: II-

MARCADORES MOLECULARES Y SUS
APLICACIONES EN LA PESCA Y LA
ACUICULTURA

CATEDRA: GENÉTICA DE ORGANISMOS ACUATICOS

CATEDRÁTICO: ING SHEYLA SEVALLOS FERIA
INTEGRANTES:
 ISAIAS MACURI MAMANI
 JORGUE FLORES QUISPE
 ROSMERY SAIRA CCAMASACARI
Una ciencia de como se distribuye la variación genética entre :
Especies , poblaciones ,individuos, las fuerzas evolutivas de mutación , selección, deriva genética aleatoria,
migración que afecta ala distribución de la variabilidad genética.

Un marcador molecular es una secuencia de ADN utilizada para "marcar" o rastrear una ubicación particular
(locus) en un cromosoma particular, es decir, un gen marcador. Es un gen con una ubicación conocida o una
clara expresión fenotípica que se detecta mediante métodos analíticos o una secuencia de ADN identificable
que facilita el estudio de la herencia de un rasgo o un gen.
El método general para detectar la variación de aloenzimas incluye extracción, electroforesis y detección. La
electroforesis es una técnica de separación basada en el movimiento de partículas cargadas en un campo eléctrico
Los extractos de tejido se introducen en un medio de soporte sólido (un gel) en Origin. Como matriz (gel) para
electroforesis se pueden usar diversos medios, como acrilamida, acetato de celulosa y almidón de patata
hidrolizado.

Cuando se aplica un campo eléctrico, la mayoría de las proteínas tienen una carga neta negativa y migrarán desde
el origen al cátodo (" negativo") terminar hacia el ánodo (" positivo") Fin del campo

Es simple tiene costo relativamente bajo, poco requerimiento de equipo especializado . Los protocolos de
separación electroforética y tinción son fácilmente ajustables de una especie a otra.

Tiene limitaciones. Una desventaja importante ha sido la incapacidad de leer genotipos de pequeñas cantidades de
tejido, lo que hace que las aloenzimas sean inaplicables para organismos pequeños (por ejemplo, larvas).
Se encuentra dentro de los orgánulos en el citoplasma llamado mitocondria:

Las principales características del ADNmt

a) En general, hereda por vía materna una molécula única haploide.

b) Todo el genoma se transcribe como una unidad
c) No está sujeto a recombinación y proporciona marcadores homólogos.
d) Principalmente selectivamente neutral y ocurre en múltiples copias en cada celda
e) Tamaño óptimo, sin intrones presentes

El ADNmt está físicamente separado del resto del ADN de la célula y es relativamente fácil de aislar

las diferencias específicas de sexo en el flujo de genes también podrían revelarse al contrastar el ADN nuclear con el
mitocondrial. el modo de herencia materno y el tamaño relativamente pequeño de ADNmt hacen que el análisis RFLP
(polimorfismo de longitud de fragmento de restricción) de esta molécula sea uno de los métodos de elección para
muchos estudios de población.
a) Análisis RFLP de ADNmt purificado completo obtenido de tejido fresco (generalmente hígado o
gónada) mediante digestión con endonucleasas de restricción.
b) Análisis RFLP o secuenciación de ADN de pequeños segmentos de la molécula de ADNmt obtenidos
mediante la amplificación por PCR.
Las principales desventajas es la necesidad de más muestras que la mayoría de los métodos de ADN, la
necesidad de sacrificar a los animales y el polimorfismo de bajo nivel en algunas especies y poblaciones.

ADN NUCLEAR - es un segmento de ADN con una ubicación física identificable (locus) en un
cromosoma y cuya herencia genética se puede rastrear.
Los enfoques más recientes para recopilar datos relevantes para la pesca y la acuicultura provienen de
evaluaciones directas de la variación de la secuencia del ADN nuclear (ADNn) .

Se utiliza en la evaluación indirecta de la variación de la secuencia de ADNn. Debido a su complejidad, la

variación de ADNn no se puede detectar y cuantificar de la misma manera que se describe para ADNmt.
Las RFLP necesitan sondeo (sondas) o amplificación seguidas de resúmenes de restricción.
Estas secuencias repetidas son la clase más importante de ADN repetitivos. Se repiten en tándem; varían en
número en diferentes loci y diferentes individuos dispersos por todo el genoma Según el tamaño de la unidad
de repetición dos clases principales de esta repetitivo y altamente Se ha distinguido el ADN polimórfico:
a) ADN minisatélite, que se refiere a loci genéticos con repeticiones de pequeños longitud (9-65 pb).- pares
de bases
b) ADN de microsatélites, en el que la unidad de repetición tiene solo 2 a 8 (1-6) pb de longitud

El término VNTR se usa con frecuencia para los ADN de mini y microsatélites

Lo más importante, los microsatélites son mucho más numerosos en el genoma de los vertebrados. Los minisatélites
también se clasifican como multilocus y locus único:

: Se refieren a secuencias que se componen de repeticiones en tándem de 9-65

pares de bases y tienen una longitud total que varía de 0.1 a 7kb Muchos loci minisatélite son muy variables y
útiles en el análisis de parentesco o para marcar familias individuales.

:: Los análisis estándar de minisatélites de un solo locus mediante transferencia

requieren cantidades razonables de ADN de alta calidad.El análisis implica la amplificación por PCR del minisatélite.
Un micro satélite es una secuencia de ADN simple que se repite varias veces en varios puntos del ADN del
organismo. Dichas repeticiones son altamente variables permitiendo ese ubicación (locus o loci polimórficos)
para etiquetar o utilizar como marcador.

Existen dos principales tecnicas para Análisis de microsatélites. El primero requiere sondear digests completos de
nDNA con repeticiones de secuencia simples (di-, repeticiones de tri- o tetra-nucleótidos). Alternativamente, se
genotipan usando la PCR usando cebadores dirigidos a las secuencias únicas que flanquean el motivo
microsatélite. La PCR se puede semiautomatizar fácilmente.

Uno de los principales problemas es la presencia de los llamados

"alelos nulos"
Otra desventaja importante de los alelos de microsatélites es que la amplificación de un alelo mediante PCR a
menudo genera una escalera de bandas (1 o 2 pb de separación) cuando se resuelve en los geles de
poliacrilamida desnaturalizantes estándar.
Hay varias revisiones recientes de las aplicaciones de las técnicas de genética molecular
en la pesca y áreas relacionadas.

Variaciones inter especificas -

Por lo tanto, es inapropiado suponer que los marcadores moleculares pueden proporcionar la
respuesta final a la identificación de especies, Por lo tanto, es inapropiado suponer que los
marcadores moleculares pueden proporcionar la respuesta final a la identificación de especies;

La mayoría de los marcadores moleculares se han utilizado en variaciones inter e intraespecíficas. Por
ejemplo, se han aplicado en la identificación de especies y subespecies en tilapia usando RAPD , y en
especies de Sparidae por isoenzima .
La clasificación filogenética intenta específicamente mostrar relaciones
basadas en la reconstrucción de la historia evolutiva de grupos o linajes
genómicos únicos

El análisis de ADN mitocondrial ha demostrado ser una herramienta

poderosa para evaluar patrones filogenéticos intraespecíficos en muchas
especies animales

El ADN nuclear también proporciona una fuente casi ilimitada de

esencialmente independiente loci para análisis filogeográfico.
El objetivo principal es reconocer grupos dentro de una especie que están en gran medida aislados
entre sí reproductivamente.

Debido a que el medio ambiente puede influir en los caracteres morfológicos y merísticos, la
variación en estos caracteres puede no tener una base genética, y estos caracteres no
necesariamente proporcionan información sobre las relaciones genéticas y evolutivas.

Otro importante problema con respecto al muestreo, una población silvestre es evitar el muestreo de
parientes cercanos, por ejemplo, familias de especies de agua dulce y anádromas cuando se
producen como escuelas separadas durante las primeras etapas.
Las especies generalmente se subdividen en subpoblaciones o poblaciones más o menos
discretas, componentes de especies que se explotan en la pesca o se gestionan activamente.

El manejo sostenible a largo plazo de las pesquerías mixtas (múltiples especies, diferentes
poblaciones) puede ser una preocupación importante para los administradores pesqueros

Estas marcas físicas, como clips de aletas, etiquetas de plástico numeradas, cables
codificados, etiquetas de elastómero fluorescente, etiquetas de plástico alfanuméricas visibles
o transpondedores integrados pasivos, son útiles para distinguir individuos pero no son
heredables
El análisis forense es el uso de métodos científicos para hacer inferencias con respecto a eventos
pasados, especialmente con respecto a la discusión, el debate, la argumentación y las preguntas
relacionadas con la aplicación de la ley de pesca, vida silvestre y conservación.

La conservación sistemática de las poblaciones de diádromos a través de la cría artificial y la

liberación en ambientes marinos naturales es, como hemos visto, una práctica establecida desde
hace mucho tiempo, especialmente en el caso de los salmónidos y esturiones templados.
Teóricamente, la mejora de las pesquerías mediante la liberación y la recaptura tiene un gran
potencial para aumentar la producción pesquera.
También se conoce como mejora cuando los peces salvajes todavía están presentes. en
ubicación objetivo, restauración / reintroducción si la población silvestre se ha extinguido, cría
en granjas en caso de anádromos e introducción cuando se utilizan especies exóticas.

Las interacciones entre peces de cultivo y silvestres pueden ser problemáticas por muchas
razones : Genética, Competencia, Enfermedad

Acuicultura :
comparación de criaderos y poblaciones silvestres: identificación genética y discriminación de
las poblaciones de incubación: monitorear la endogamia u otros cambios en la variación
genética : asignación de progenie a los padres mediante etiquetas genéticas; identificación de
loci de rasgos cuantitativos
 ANÁLISIS DE PARENTESCO Y PEDIGRÍ
EN LA CRÍA SELECTIVA
Suponiendo que hay varios cientos de reproductores
potenciales disponibles, se elige peces de la misma edad
justo antes de la madurez sexual. El pez más grande se
Varios estudios tienen Loci
tipifica, mediante muestreo no destructivo, para varios
de microsatélites utilizado
loci de ADN de microsatélites. El siguiente pez más
empíricamente para
grande se muestrea y solo se incluye en la cría si se
reconstruir con éxito
relaciona más distantemente que medio hermano con el
pedigríes en poblaciones de
primero. Este proceso continúa, excluyéndose la mitad o
peces con familias mixtas
la mitad de los Hermanos, hasta que se haya identificado
desde la eclosión
un número adecuado de reproductores potenciales para
minimizar la endogamia.

• El microsatélite se ha
descrito como el tipo más
útil de marcadores para
evaluar la paternidad
genética.
Se trata de la genealogía de un
animal y del documento en que
ésta consta
 MAPEO DEL GENOMA Y DETECCIÓN DE
LOCI DE RASGOS
CUANTITATIVOS (QTL)

• Los mapas del genoma facilitan

el mapeo de genes y
Quantitative Trait Loci (QTL: se detectan mediante el
marcadores de ubicación
análisis de fenotipos con mapas de marcadores
desconocida y también
vinculados y la identificación de marcadores vinculados
permiten identificar genes a QTL puede proporcionar ganancias significativas
mapeados en una especie con para los rasgos que son difíciles o
regiones homólogas en otra. caros de medir (conversión de alimento) y solo se
pueden medir; solo un sexo (p. ej., fecundidad),
después de la fecha de selección (rasgos
reproductivos), después de matar al pez (calidad de la
carne) o en peces separados ambientalmente del stock
de reproducción principal (resistencia a la enfermedad)
(Davis y Hetzel, 2000).

El método consiste en aislar un gran número (generalmente

más de 100 loci) de marcadores altamente variables
(generalmente loci de microsatélites, RAPD o AFLP) y
luego buscar la correlación entre cada alelo a su vez y en
combinación, y varios rasgos de producción.
 DIAGNÓSTICO DE ENFERMEDADES Y
PARÁSITOS

• En los últimos años, las técnicas

moleculares se han desarrollado
cada vez más con fines de
diagnóstico de enfermedades en
animales acuáticos. Los ensayos
de PCR se han convertido en
herramientas relativamente
económicas, seguras y fáciles de
usar en muchos laboratorios.
Sin embargo, con una o dos excepciones, las técnicas
moleculares actualmente no son aceptables como
métodos de detección para demostrar la ausencia de un
agente de enfermedad específico en una población de
peces con el fin de obtener la certificación sanitaria en
relación con el comercio internacional de peces vivos y / o
sus productos
ELECCIÓN DE MARCADORES

• Hay que tener en cuenta:

• 1.- el marco de tiempo evolutivo de la
pregunta que se hace.
• 2.- la velocidad y el modo de evolución
del marcador genético.
• 3.- el modo de herencia (Materno ,
biparental) y expresión (dominante,
codominante)