Presentacion Pruebas Covid-19v3

Nidia Benavides, Médica SST. Julio 25 de 2020.
1
PRUEBAS DIAGNÓSTICAS
APUNTES SOBRE EL USO DE LAS PRUEBAS MOLECURA LES, DE ANTIGENOS
Y SEROLÓGICA S EN LA PANDEMIA COVID - 19
Julio 25 de 2020
Las opiniones e interpretaciones
personales derivadas de la información
presentada en ningún momento
representan la posición de Conssentido y
declaro que no tengo conflicto de intereses
Nidia Benavides, Médica SST. Julio 25 de 2020
3
12/6/2020 PRUEBAS COVID-19, VIDEO PRESENTADO POR LA SOCIEDAD COLOMBIANA DE ANESTESIOLOGÍA, PONENTE: DR. JOSE HUGO ARIAS
4
OBJETIVOS
OBJETIVO 01 OBJETIVO 02 OBJETIVO 03
Repasar los conceptos para evaluar las

Reconocer la utilidad o la aplicación Conocer las implicaciones de estos
pruebas diagnósticas:
de éstas pruebas diagnósticas conceptos para la interpretación de
• -Sensibilidad y Especificidad actualmente disponibles para la las pruebas para SARS-COV2
• -Valor predictivo positivo y negativo COVID-19
• -LR
5
CARACTERÍSTICAS OPERATIVAS DE UNA PRUEBA
Tabla 2x2
¿En que momento se usa la sensibilidad y especifidad? Al momento de escoger la prueba para detectar las personas que tengan la
enfermedad, utilizo pruebas que sean sensibles (tamizaje), si quiero confirmar que la persona tenga la enfermedad debería utilizar
pruebas específicas (confirmatorias).
SENSIBILIDAD DIAGNÓSTICA: Una

prueba muy sensible tiene pocos
falsos negativos. Una prueba con alta
sensibilidad es mas útil cuando su
resultado es negativo. Si la prueba es
negativa, descarta la enfermedad.
12/6/2020 PRUEBAS COVID-19, VIDEO PRESENTADO POR LA SOCIEDAD COLOMBIANA DE ANESTESIOLOGÍA, PONENTE: DR. JOSE HUGO ARIAS 7
Es el nivel de detección de la
prueba, en este caso para las
copias virales.
https://www.minsalud.gov.co/sites/rid/Lists/BibliotecaDigital/RIDE/VS/laboratorios-pruebas-covid-19.pdf
https://www.minsalud.gov.co/Ministerio/Institucional/Procesos%20y%20procedimientos/GIPS21.pdf
9
ESPECIFICIDAD: Una prueba muy específica
es útil cuando el resultado es positivo.
Tiene pocos falsos positivos. Si la prueba es
positiva, detecta la enfermedad.
10
Tabla 2x2
¿Qué pasa si ya nos llega con el resultado de una prueba?

¿Hasta que punto le creemos a la prueba?
11
Analizamos los resultados de las pruebas.
12
Analizamos los resultados de las pruebas.
13
¿Entonces que puedo hacer si no conozco la prevalencia de la enfermedad en el país?
Los resultados de los valores predictivos son limitados pues se afectan por la prevalencia de la
enfermedad.
Si la prevalencia es baja, los valores de VPP no son muy buenos.
Si la prevalencia es muy alta, los VPN se bajan.
A mayor sensibilidad de la prueba, mejor será su VPN.
A mayor especificidad de la prueba, mejor será su VPP.

No se afectan tanto con la prevalencia de la enfermedad.

http://revistainfectio.org/index.php/infectio/article/view/890/975
LR mayor de 10: de cada 10 positivos que son enfermos solo una va a salir una persona positiva que este sana.
OBJETIVOS

• -Sensibilidad y Especificidad
actualmente disponibles para la las pruebas para SARS-COV2
• -LR
19
UTILIDAD DE PRUEBAS
https://www.ins.gov.co/Noticias/Coronavirus/Estrategia%20VSP%20COVID-19%2023072020.pdf 20
PCR – Reacción en Cadena de la polimerasa
DETECTA RNA DEL SARS COV 2 PRUEBA NEGATIVA

NO HAY EVIDENCIA DEL VIRUS.
EN NASOFARINGE U OTRAS
MUESTRAS PUEDEN EXISTIR FALSOS NEGATIVOS
ESPECIALMENTE AL INICIO DE LOS
SINTOMAS
PRUEBA POSITIVA
RENDIMIENTO
EL PACIENTE ESTA INFECTADO Y
PUEDE SER CONTAGIOSO DEPENDE DE LA TOMA

21
Se toma aspirado 97% (Antioquia); Isopado 3%

Otras técnicas (Saliva)
Capacitación ACIN: https://www.youtube.com/watch?v=Bc3m9E26ZnI&t=2857s 22

Otras técnicas (Saliva)
Capacitación ACIN: https://www.youtube.com/watch?v=Bc3m9E26ZnI&t=2857s 23

PROBLEMAS PCR
CONOCER EL MOMENTO CLÍNICO DE LA ENFERMEDAD

DIFICIL DE INTERPRETAR EN ASINTOMÁTICOS
SITIO Y CALIDAD DE LA PRUEBA

AFECTA LA EXACTITUD DEL RESULTADO
SENSIBILIDAD JAMA 2020

93% EN LAVADO BRONCOALVEOLAR
72% ESPUTO
63% ISOPADO NASAL Y 32% EN HISOPADO DE GARGANTA
LR
EN COVID -19 NO EXISTE GOLD STANDAR
Y POR ELLO EL DESEMPEÑO DE LA PRUEBA ES DIFICIL DE
ESTABLECER
EL DESEMPEÑO DE LA PRUEBA SE HA ESTUDIADO EN
PACIENTES ENFERMOS, SEGÚN CLNICA, TAC 24
RT -PCR
SENSIBILIDAD
75%
75%
ESPECIFICIDAD
99% -Detecta secuencia de RNA del gen del virus
LR + LR -
7,5 0,25
La PCR mejora su sensibilidad si se conoce la fecha de inicio de

síntomas o la fecha en la que ocurrió el contacto estrecho
Pruebas de detección de Anticuerpos
DETECTA AC CONTRA EL SARS COV 2 PRUEBA NEGATIVA

NO HA ESTADO EN CONTACTO CON EL
EN SANGRE
VIRUS
LLEVA MENOS DE 5D DE INFECCIÓN (20%)
IgM POSITIVA
IgG POSITIVA
INFECCION RECIENTE
EL PACIENTE ESTA INFECCIOSO INFECCION TARDIA O CURADA
LIMITACIONES LLEVA MAS DE 3 SS DE LA INFECCIÓN
AUN PUEDE SER TRANSMISIBLE (+ en día 10)
RENDIMIENTO
DEPENDE DEL MOMENTO DE LA
TOMA (CON O SIN SINTOMAS)
Pruebas de detección de Anticuerpos

27
Puede pasar una semana sin síntomas después del contacto y ninguna prueba sale positiva. PCR al día 11 o 12 de los sx se va a negativizar.
Después del día 4-5 de los síntomas inicia IgM a elevarse. La IgG se eleva posteriormente, hasta mas o menos 3 meses. Tras 8 semanas, el
nivel de AC IgG disminuyó el 81 % en los asx y en el 62% en los sx. Revista Nature. En pacientes asintomáticos no sabe en que fase está.
Pruebas de detección de Antígenos
29
Pruebas de detección de Antígenos
30
31
¿Para cotizar una prueba RT-PCR de COVID-19 que documentos
solicito al laboratorio?
• Instrucción para los pacientes
• Acta de inicio como laboratorio colaborador autorizado por INS
• Habilitación del laboratorio por el Ministerio de Salud
• Informe de validación
• Inserto

32
¿Para cotizar una prueba de anticuerpos de COVID-19 que documentos

• Inserto de la prueba
• Informe de validación

33
¿Para cotizar una prueba de antígenos de COVID-19 que documentos

• Registro sanitario Invima
• Inserto de la prueba
• Informe de verificación o validación

34
OBJETIVOS

• -LR
35
¿CÓMO INTERPRETAR LAS PRUEBAS RT-PCR?
RT-PCR
No se puede interpreter una prueba si no se conoce la probabilidad de una
persona de sufrir la enfermedad antes de hacerse la prueba.
1
Para saber si una prueba funciona o no, debería hacer este análisis primero:
1. Signos del paciente
2. Contexto en el que está
3. Conozca la probabilidad pre-test
https://coronability.com/result?id=MzgsQ09MX0JPRyxNLDMsMSw=
2
Evaluar LR (Razón de probabilidad)
Si trazo una linea entre probabilidad pre-test y el LR me va a arrojar una

1 probabilidad post-test
2
36
Tomado de la revista española de calidad asistencial
Si trazo la línea en
LR +, la
probabilidad que
salga positiva es
mayor al 99%
LR -, si la prueba
sale negativa no
podemos
descartar que la
persona
realmente tenga
la enfermedad.
En personas ASX,
la probabilidad
post-test depende
de la prevalencia
de la enfermedad
en la población
general.
37
https://calculator.testingwisely.com/playground/50/75/95/all

38
En estadística se trabaja con una probabilidad de 5%. Como en este ejemplo, si la prueba es negativa en asintomático, no quedamos tranquilos.
https://calculator.testingwisely.com/playground/50/75/95/all 39
https://www.bmj.com/content/369/bmj.m1808 40
¿CÓMO INTERPRETAR LAS PRUEBAS DE ANTICUERPOS?
OMS
Tienen una sensibilidad y especificidad muy variable y por ello no se recomiendan como TAMIZ.
Se ha popularizado porque los resultados salen muy rápido.
Sin validación analítica.

41
10/6/2020 La producción de IgM es muy difícil de interpretar, y la

lectura de la banda en las pruebas de inmunocromatografía
puede generar falsos positivos, y en estudios de ELISA, se ha
encontrado que es inespecífica. De tal forma que a la fecha
los mayores estudios epidemiológicos han encontrado que
la producción de IgM no puede ser interpretada
adecuadamente en el momento, por tanto, no se
recomienda tomar conductas relacionadas con la medición
de este anticuerpo en este momento.
Respecto a la producción de IgG, se ha encontrado que es la

más constante en las diferentes series, con una positividad
que puede estar entre 80% y 965 después de 14 días del
contacto y 11 del desarrollo de síntomas.
Personas COVID-19 Asintomáticas podrían producir menos

anticuerpos.

42
10/6/2020
En pacientes sintomáticos se recomienda anticuerpos + PCR a partir del día 11 del inicio de los síntomas para aumentar la sensibilidad del
diagnóstico.
En caso que solo cuente con anticuerpos, se considera un resultado positivo probable.
Se recomienda realizar la medición de anticuerpos al personal de salud al cumplir los 14 días de aislamiento para el reintegro laboral o
dentro de estudios poblacionales para medir la seroprevalencia.
Respecto a la producción de IgG, se ha encontrado que es la más constante en las diferentes series, con una positividad que puede estar
entre 80% y 96% después de 14 días del contacto y 11 del desarrollo de síntomas.

43
CONCLUSIONES
En algunos municipios
se exige realizar AC
para entrar.
Para tomar
decisiones.
Quedamos mas tranquilos si la

prueba sale positiva.

• Gravedad de cuadro clínico: paciente con cuadros severos tiene mayor excreción viral que casos leves 44
CONCLUSIONES
Lo mejor será la
prevención.
Cuando la prevalencia de la enf

en Colombia supere el 15% se
recomendará tomar pruebas pre
QX electiva.
La prevalencia actual en
Colombia se desconoce. Solo
podemos calcular el % de
pruebas positivas en casos
sospechosos o sintomáticos que
actualmente es del 14,3%
45
OBJETIVOS

• -LR
46
HOMBRE TRANSPORTE
EDAD 38 AÑOS BUS.
SIN COMORBILIDAD
SIN SINTOMAS
SIN NEXO EPIDEMIOLOGICO EJEMPLO
RESIDENCIA TRABAJO Y PROTOCOLOS
BOGOTA VIGILANTE EN UN BANCO
CUMPLE LOS PROTOCOLOS (LAVADO
DE MANOS, ETC.)
https://coronability.com/
Una empresa nos llama para interpretar un resultado 47

Población de habitantes en
Bogotá (DANE2018) =7.181.469
habitantes en la capital.
PREVALENCIA PUNTUAL: frecuencia de una enfermedad en un tiempo

determinado.
Prevalencia puntual = Ct / Nt
Ct: número de casos existentes (prevalentes) en un momento o edad determinados.

Nt: número total de individuos en la población en ese momento o edad
determinados.
Ej: Prevalencia al 21/6/2020 = 20709 / 7181469 *100 = 0,29%
49
Encuesta de síntomas y nexo epidemiológico= Negativo
50
Los resultados de los valores predictivos son
limitados pues se afectan por la prevalencia de la
enfermedad. La prevalencia puntual de COVID en
Bogotá es baja.
Si la prevalencia es baja, los valores de VPP no son

muy buenos. Es decir, ese resultado positivo puede
ser un falso positivo.
A mayor sensibilidad de la prueba, mejor será su

VPN. Que en este caso no se aplica porque el
hombre del ejemplo no ha tenido síntomas.
A mayor especificidad de la prueba, mejor será su

No tenemos la razón de probabilidad (LR)
No se recomienda en Colombia VPP. No se puede interpretar dado a que el hombre
Respecto al uso de las pruebas serológicas basadas en detección de IgG e IgM, la positividad depende del momento no ha tenido síntomas.
en que sean tomadas luego de inicio de síntomas y en el caso de asintomáticos, luego del contacto con personas
confirmadas y sospechosas. Diferentes estudios muestran que las pruebas son positivas a partir del día 7 aumentando el
porcentaje de positividad a partir del día 10 y siendo 100% positivas al día 14 de la infección.
51
52
https://www.ins.gov.co/Pruebas_Rapidas/4.%20Informe%20de
%20validaci%C3%B3n%20PR%20SD%20Biosensor.pdf

53
54
https://www.mscbs.gob.es/profesionales/saludPublica/ccayes/alertasActual/nCov-China/documentos/COVID19_Estrategia_vigilancia_y_control_e_indicadores.pdf
IgM +
Les comparto una herramienta de la FDA para conocer o predecir cuantos casos positivos y negativos tendrían en una grupo o
empresa en caso de aplicar masivamente pruebas rápidas, para lo cual deben conocer la sensibilidad y especificidad del kit
utilizado, pero lo más importante es partir de la prevalencia pues esta determina los valores predictivos. Suponiendo que
tuviésemos una prevalencia hipotética de 1% (la cual probablemente es inferior), los valores predictivos positivos son
sumamente bajos, y por lo tanto los falsos positivos serían tan altos que incluso excederían los verdaderos positivos, con todas
las consecuencias que ello implica. En conclusión, mientras no se tenga una prevalencia suficientemente alta, las pruebas
rápidas carecen de utilidad para identificar casos, adicionalmente a la falencia respecto de la ventana inmunológica de 1 a 2
semanas.
Calculator for Positive Predictive Value (PPV) and Negative Predictive Value (NPV) for individual tests and combine
Prevalence 0,3%
Test 1 Test 1
%Pos1 PPV1 for %Neg1 NPV1 for
Sen1 Sp1 (Test1=pos) (Test1=pos) (Test1=neg) (Test1=neg)
81,8% 96,6% 3,6% 6,5% 96,4% 99,9%
https://www.fda.gov/news-events/press-announcements/coronavirus-covid-19-update-daily-roundup-july-24-2020
https://www.fda.gov/news-events/press-announcements/coronavirus-covid-19-update-fda-authorizes-first-diagnostic-test-screening-people-without-known-or

56
A S I N T O M AT I C O _ _ S I _
JUAN C O N TA C T O E S T R E C H O _ N O _ _ _
Puede ser:
Día 9 del contacto? *COVID+ EN CURSO ASX
No contacto Podría estar *COVID+ RESUELTO
No hubo contacto en el día 26 o
<5 días de contacto en el día 30?
22/5 PCR NEG IgG + RECOMENDACIÓN
3/6/2020 Asintomático
Sin nexo
HACER PCR 22/6 – osea en 72horas

IgM + CERRADO Si es negativo Cierra el caso y no hacer mas
pruebas a este trabajador except si reporta
Asintomatico y sin nexo NO CASO
19/6 contacto o síntomas. Sería un caso COVID-19
epidemiológico
Asintomático
29/5 Si es positivo reporte caso a INS, EPS, ARL para
Puede ser:
*La IgM es inespecífica y no se que se encarguen del seguimiento.
recomienda tomar conductas
según este resultado
57
A S I N T O M AT I C O _ _ S I _
ELIAS C O N TA C T O E S T R E C H O _ N O _ _ _
Puede ser:
Día 9 del contacto? *COVID+ EN CURSO ASX
No contacto/Falso + Día 9 del contacto?
No hubo contacto
No contacto/Falso +
<5 días de contacto
22/5 PCR NEG IgM +/IgG- RECOMENDACIÓN
5/6/2020 Asintomático
Sin nexo
29 días
HACER PCR de una vez
Si es negativo Cierra el caso y no hacer mas
IgM + CERRADO
pruebas a este trabajador except si reporta
Asintomatico y sin nexo NO CASO contacto o síntomas. Sería un NO CASO
epidemiológico
19/6
Si es positivo reporte caso a INS, EPS, ARL para
28/5 que se encarguen del tratamiento.
Puede ser: No mas pruebas serológicas.
*La IgM es inespecífica y no se
recomienda tomar conductas
según este resultado
58
BIBLIOGRAFÍA
A P U N T E S S O B R E E L U S O E N L A PA N D E M I A C O V I D - 1 9
AGRADECIMIENTOS POR SU APORTE ACADÉMICO:

DR. JOSE HUGO ARIAS 12/6/2020 PRUEBAS COVID-19, VIDEO, SOCIEDAD COLOMBIANA DE ANESTESIOLOGÍA
CAJA DE HERRAMIENTAS UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA https://bit.ly/2xtRvHO
ASOCIACIÓN COLOMBIANA DE INFECTOLOGÍA

https://www.acin.org/index.php/guias/coronavirus
http://revistainfectio.org/index.php/infectio/article/view/890/975
59
BIBLIOGRAFÍA
CONSULTA DIARIA:
MINISTERIO DE SALUD: https://covid19.minsalud.gov.co/
https://www.minsalud.gov.co/Ministerio/Institucional/Procesos%20y%20procedimientos/GIPS21.pdf
https://www.minsalud.gov.co/Ministerio/Institucional/Procesos%20y%20procedimientos/PSSS03.pdf
INSTITUTO NACIONAL DE SALUD: https://www.ins.gov.co/Noticias/Paginas/Coronavirus.aspx
https://www.ins.gov.co/Noticias/Coronavirus/Anexo_%20Instructivo%20Vigilancia%20COVID%20v11%2012052020.pdf
https://www.minsalud.gov.co/sites/rid/Lists/BibliotecaDigital/RIDE/VS/laboratorios-pruebas-covid-19.pdf
60
BIBLIOGRAFÍA
REVISIÓN BILBIOGRÁFICA: UpToDate; DynaMed, Medscape
EXPERIENCIAS DE CASOS EN EMPRESA:

ASINTOMÁTICOS, PRESINTOMÁTICOS, SINTOMÁTICOS, CONTACTOS ESTRECHOS:
https://www.ins.gov.co/Noticias/Coronavirus/Estrategia%20VSP%20COVID-19%2023072020.pdf
https://www.ins.gov.co/Noticias/Coronavirus/Apendice%201.%20Ficha_IEC_COVID-19%2006032020.pdf
61
Nidia Benavides, Médica SST. Julio 25 de 2020. 62

Presentacion Pruebas Covid-19v3

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Nidia Benavides, Médica SST. Julio 25 de 2020.

Nidia Benavides, Médica SST. Julio 25 de 2020

Nidia Benavides, Médica SST. Julio 25 de 2020.

OBJETIVO 01 OBJETIVO 02 OBJETIVO 03

Repasar los conceptos para evaluar las

Nidia Benavides, Médica SST. Julio 25 de 2020.

Nidia Benavides, Médica SST. Julio 25 de 2020.

SENSIBILIDAD DIAGNÓSTICA: Una

Nidia Benavides, Médica SST. Julio 25 de 2020.

Nidia Benavides, Médica SST. Julio 25 de 2020.

Nidia Benavides, Médica SST. Julio 25 de 2020.

¿Qué pasa si ya nos llega con el resultado de una prueba?

Nidia Benavides, Médica SST. Julio 25 de 2020.

Nidia Benavides, Médica SST. Julio 25 de 2020.

Nidia Benavides, Médica SST. Julio 25 de 2020.

Si la prevalencia es baja, los valores de VPP no son muy buenos.

Si la prevalencia es muy alta, los VPN se bajan.

A mayor sensibilidad de la prueba, mejor será su VPN.

A mayor especificidad de la prueba, mejor será su VPP.

Nidia Benavides, Médica SST. Julio 25 de 2020.

Nidia Benavides, Médica SST. Julio 25 de 2020.

Nidia Benavides, Médica SST. Julio 25 de 2020.

OBJETIVO 01 OBJETIVO 02 OBJETIVO 03

Repasar los conceptos para evaluar las

Nidia Benavides, Médica SST. Julio 25 de 2020.

Nidia Benavides, Médica SST. Julio 25 de 2020.

DETECTA RNA DEL SARS COV 2 PRUEBA NEGATIVA

Nidia Benavides, Médica SST. Julio 25 de 2020.

Se toma aspirado 97% (Antioquia); Isopado 3%

Nidia Benavides, Médica SST. Julio 25 de 2020.

Capacitación ACIN: https://www.youtube.com/watch?v=Bc3m9E26ZnI&t=2857s 22

Otras técnicas (Saliva)

Nidia Benavides, Médica SST. Julio 25 de 2020.

Capacitación ACIN: https://www.youtube.com/watch?v=Bc3m9E26ZnI&t=2857s 23

CONOCER EL MOMENTO CLÍNICO DE LA ENFERMEDAD

SITIO Y CALIDAD DE LA PRUEBA

SENSIBILIDAD JAMA 2020

La PCR mejora su sensibilidad si se conoce la fecha de inicio de

DETECTA AC CONTRA EL SARS COV 2 PRUEBA NEGATIVA

Nidia Benavides, Médica SST. Julio 25 de 2020.

Nidia Benavides, Médica SST. Julio 25 de 2020.

Nidia Benavides, Médica SST. Julio 25 de 2020.

• Instrucción para los pacientes

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• Instrucción para los pacientes

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OBJETIVO 01 OBJETIVO 02 OBJETIVO 03

Repasar los conceptos para evaluar las

Nidia Benavides, Médica SST. Julio 25 de 2020.

Si trazo una linea entre probabilidad pre-test y el LR me va a arrojar una

Nidia Benavides, Médica SST. Julio 25 de 2020.

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Nidia Benavides, Médica SST. Julio 25 de 2020.

10/6/2020 La producción de IgM es muy difícil de interpretar, y la

Respecto a la producción de IgG, se ha encontrado que es la

Personas COVID-19 Asintomáticas podrían producir menos

Nidia Benavides, Médica SST. Julio 25 de 2020.

Nidia Benavides, Médica SST. Julio 25 de 2020.

Quedamos mas tranquilos si la

Nidia Benavides, Médica SST. Julio 25 de 2020.

Cuando la prevalencia de la enf

OBJETIVO 01 OBJETIVO 02 OBJETIVO 03

Repasar los conceptos para evaluar las