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4.1.2. Contexto evolutivo: variantes genómicas inducidas por el estrés y su importancia evolutiva
junto con el equilibrio

En las últimas décadas, la investigación del cáncer ha generado una gran cantidad de diversos
mecanismos moleculares individuales [12, 30, 31, 79]. Además de que muchos de ellos entraban
en conflicto entre sí, algunos de ellos claramente podían ser "buenos" y "malos" para el cáncer,
dependiendo del contexto de las etapas ambientales y evolutivas de las poblaciones celulares. Por
ejemplo, el mismo gen puede funcionar como un oncogén o supresor tumoral y el mismo
mecanismo (como la aneuploidía) puede inhibir o promover la proliferación celular de una
población dada. Para unificar estos mecanismos individuales, se propuso el concepto del
mecanismo evolutivo del cáncer basado en las variaciones del genoma inducidas por el estrés y la
selección evolutiva basada en el genoma [20,24,30,31]. Dado que la mayoría de las vías
individuales, cuando están bajo estrés, pueden conducir a variaciones en el genoma y pueden
verse favorecidas por la evolución del cáncer, todas pueden estar relacionadas con el cáncer en
condiciones experimentales, pero a menudo no son el factor causal común del cáncer en la
población de pacientes. El mecanismo del cáncer y su relación con un gran número de factores
moleculares explica por qué la mayoría de los mecanismos moleculares del cáncer no se han
aplicado en la práctica clínica. La misma razón se ha utilizado para explicar cómo la aneuploidía
[22] y los diferentes tipos de NCCA contribuyen al cáncer [12,13]. Dado que los entornos son muy
dinámicos y cualquier variante tiene la capacidad de ser buena o mala dependiendo del contexto,
el factor de predicción basado en rutas moleculares específicas es bajo. Tal incertidumbre también
se puede encontrar en varios sistemas experimentales donde el efecto fuera del objetivo y el
efecto artificial pueden ser muy significativos [80]. Las metodologías de transfección pueden tener
efectos fuera del objetivo, incluso cuando se utiliza un vector vacío como un control negativo
previsto; El estrés ejercido sobre las células durante los experimentos de transfección puede tener
un efecto citotóxico y las células que sobreviven pueden ser irrevocablemente diferentes en su
comportamiento [80]. Esto puede hacer que sacar conclusiones reproducibles sea difícil
conclusiones producibles difíciles. Bajo tales marcos, la condición de estrés puede inducir tanto
micronúcleos como células con genomas alterados (variantes genómicas). Además, el ciclo de
fusión-fisión puede producir efectivamente células con nuevos contextos genómicos a través del
proceso del caos genómico (Figura 2) [7,10,12,13]. A pesar de la muerte celular masiva, algunas
células supervivientes (con nuevos genomas) pudieron seleccionarse por macroevolución.

Por lo tanto, la selección macroevolucionaria se basa en la población celular con nuevos cariotipos
en lugar de micronúcleos, ya que la mayoría de ellos se eliminarán (aunque se produzcan
continuamente cuando el genoma sea menos estable). Tras el éxito de una fase macroevolutiva,
algunas mutaciones genéticas del cáncer pueden promover un aumento en el tamaño de la
población de células cancerosas a través de la fase microevolutiva.

4.1.3. Limitación de vías específicas utilizadas para explicar un comportamiento del sistema
altamente complejo: menor
Agentes de nivel versus emergencia de nivel superior Al igual que la mayoría de los sistemas
biológicos complejos, el fenotipo de un sistema de nivel superior se debe a la aparición de agentes
de nivel inferior y, a menudo, sin una correlación uno a uno entre el comportamiento del sistema y
sus agentes de nivel inferior. [13,21,25]. La misma regla se puede aplicar a la función del MN. Por
lo tanto, la predicción se basa principalmente en cuando la especificidad de las partes es baja.
Incluso los MN transitorios pueden ser un factor participante en el fenotipo emergente, lo que
hace que la capacidad de predicción sea baja debido a demasiadas variantes involucradas (ambas
partes y el proceso dinámico).

Al igual que otros procesos biológicos adaptativos, la dinámica de los micronúcleos presenta
algunas características comunes: la macroevolución (p. Ej., La especiación) a menudo no está
impulsada por la mutación genética, por lo que a menudo no depende de rutas o eventos
específicos fijos; No son los micronúcleos mismos, sino la población celular con el genoma
alterado el objetivo de la evolución. Si incluso los micronúcleos pueden activar el sistema
inmunitario, los nuevos genomas deberían contribuir más a la activación del sistema inmunitario.
Los procesos de los genomas-micronúcleos y los nuevos procesos del genoma son lineales y la
predicción basada en las rutas es insignificante.

Teniendo en cuenta los tres puntos, el estudio mecanicista de los micronúcleos y sus
consecuencias debería ser a través de la lente de un sistema adaptativo donde la herencia del
sistema y la evolución celular juegan un papel clave. A pesar de los intereses de cada mecanismo
individual, el enfoque de investigación en las comunidades de investigación no debe centrarse en
ellos debido al hecho de que hay tantos y debido al cambio frecuente de vías. En contraste,
monitorear el potencial evolutivo general es una mejor estrategia.

Por lo tanto, la síntesis más importante del significado biológico de la dinámica de micronúcleos es
la selección evolutiva basada en la creación de nuevos paquetes de información genómica. El
significado de estas combinaciones estocásticas de micronúcleos es el aumento de la nueva
información genómica a nivel de población celular, en lugar de la especificidad individual. No
importa qué mecanismo conduzca a estos micronúcleos, todos pertenecen a los diferentes
agentes que pueden o no contribuir a la aparición.

4.1.4. El modelo de cómo los micronúcleos contribuyen a los nuevos sistemas del genoma
mediante la creación de nuevos

Codificación genómica Las consecuencias conocidas de micronúcleos incluyen (1) generación de


cromotripsis en condiciones experimentales; están vinculados al caos genómico inducido por
drogas; están asociados con la gemación nuclear y las células gigantes (en condiciones
experimentales, las células gigantes pueden formar muchos grupos micronucleares); están
directamente vinculados a la aneuploidía, (2) pueden cambiar las composiciones cromosómicas e
introducir cromosomas translocados (p. ej., la aneuploidía puede desencadenar translocaciones), y
(3) pueden involucrar mecanismos moleculares muy diversos y, a pesar de su diferencia, un enlace
oculto fundamental es que todos contribuyen a crear nuevos sistemas genómicos por
reorganización genómica.
La Figura 2 ilustra este modelo de cómo los micronúcleos contribuyen a la formación de nuevos
genomas. Como se ilustra en la Figura 1, la generación de grupos de micronúcleos a menudo se
puede observar a partir de líneas celulares de cáncer, especialmente cuando estas líneas celulares
son inestables y están bajo estrés. Estos grupos de MN a menudo implican ciclos de fusión y fisión.
Se ha propuesto que tales ciclos de fusión / fisión representan prueba y error en la búsqueda de
genomas viables [12,13,21]. Los micronúcleos pueden promover claramente este proceso. Este
modelo de diferentes mecanismos para promover la formación de nuevos sistemas genómicos
mediante la reorganización de nuevos cariotipos es claramente aplicable para explicar la dinámica
de los micronúcleos. También puede explicar por qué existe una correlación entre el aumento de
micronúcleos y la resistencia a los medicamentos, metástasis y otras transiciones de fase
relacionadas con la evolución macrocelular [12]. En estos casos, el mecanismo genómico común es
el aumento de la herencia difusa a nivel del genoma, lo que finalmente conduce a una nueva
herencia del sistema. Cabe mencionar que este modelo es similar al modelo de caos genómico que
genera un nuevo genoma reorganizado bajo estrés, una estrategia de supervivencia para las
poblaciones de células cancerosas [10,31]. La clave son los cambios rápidos y masivos en el
contexto genómico al cambiar los cariotipos. En cierto sentido, la participación de micronúcleos es
menos caótica.

En cuanto a la formación de micronúcleos sin la participación del grupo de micronúcleos y el ciclo


de fusión-fisión, todavía cambia los cariotipos de algunas células, lo que cambia el grado de
heterogeneidad del genoma, aunque a menudo es menos drástico.

4.2. La necesidad de más investigación para aclarar cuestiones importantes

4.2.1 Diferenciación de micronúcleos generados a partir de genomas relativamente estables y


grupos de micronúcleos de genomas inestables

Tradicionalmente, los problemas relacionados con las características morfológicas y las frecuencias
de micronúcleos han sido sencillos. La gran mayoría de los estudios de micronúcleos se ha
centrado en la frecuencia de formación de micronúcleos, principalmente como una tasa por
células en división. Sin embargo, muchos conjuntos de criterios publicados que pueden excluir
información importante son restrictivos. La observación de múltiples figuras mitóticas en el
cáncer, por ejemplo, sugiere que la inestabilidad cromosómica puede subestimarse si estas células
no se incluyen en los recuentos de frecuencia de micronúcleos. Más allá de la frecuencia, el
tamaño de los micronúcleos representa otra característica importante. Existe una fuerte
correlación entre el tamaño del micronúcleo y su presencia de centrómero, siendo los
micronúcleos centrómeros positivos más grandes que los micronúcleos centrómeros negativos.
Esto puede permitir la diferenciación entre el estrés principalmente aneugénico y clastogénico
[81]. La cuantificación basada en el tamaño puede tener una precisión similar en la determinación
de la presencia de centrómero a la de FISH (hibridación fluorescente in situ) utilizando sondas de
centrómero [82]. Es importante tener en cuenta que, si bien realizar una evaluación de
micronúcleos después de la exposición a la genotoxina in vitro puede determinar la naturaleza de
la genotoxina, la evaluación del centrómero en las células obtenidas de un paciente puede dar
resultados menos concluyentes ya que la formación de micronúcleos in vivo es la suma
acumulativa de innumerables tensiones celulares. . En la Tabla 2 se incluye información adicional
sobre el tamaño de los micronúcleos y el método utilizado para calificarlos. Se han publicado
pocos datos sobre la forma y la morfología de los micronúcleos; La mayoría de los criterios
publicados indican que un micronúcleo debe ser redondo y liso en orden para ser contado. Sin
embargo, se ha observado que la investigación con algunos mecanismos (como la radiación
ionizante) produce micronúcleos de forma irregular [83].

Ahora, con el mayor estudio del uso de NCCA (incluidos los micronúcleos) para controlar la
evolución del cáncer [13,14,19,24] al vincular los micronúcleos con el caos del genoma, tanto las
frecuencias como la heterogeneidad morfológica se han convertido en cuestiones importantes
que merecen atención inmediata. Si bien las frecuencias inducidas de micronúcleos de muestras
de cáncer o líneas celulares pueden ser muy altas, el tamaño y la forma son muy dinámicos
(Figuras 1 y 3), que difieren significativamente de los micronúcleos tradicionales descritos en la
Tabla 2.

Sorprendentemente, el grupo de micronúcleos puede implicar fusión activa y fisión a pesar de la


muerte celular ([21] Ye et al., Observaciones no publicadas). Dado que para esos núcleos
pequeños solo hay materiales cromosómicos limitados (Figura 3), tiene sentido que el proceso de
fusión sea esencial para formar núcleos viables que tengan suficientes materiales cromosómicos.
Como se ilustra en el modelo (Figura 2), la función biológica clave de fusión / fisión entre el grupo
de micronúcleos es cambiar la información genómica para la generación de nuevos genomas
emergentes. A pesar de que la mayoría de los MN serán eliminados, incluso una pequeña porción
de ellos puede cambiar el juego de la evolución. Esta es la razón por la cual el proceso del caos
genómico es tan importante en el cáncer.

Ahora que conocemos la diferencia (desde la morfología hasta la función biológica) entre el grupo
de micronúcleos y los micronúcleos tradicionales, una pregunta clave es si estos diferentes tipos
de mecanismos están involucrados en su producción. Se sabe que el nivel base de CIN es muy
diferente, por ejemplo. Sería interesante comparar el patrón de muerte celular con el patrón de
aparición del nuevo genoma.

Tabla 2. Comparación de los criterios de puntuación para la prueba de micronúcleos. Varios


criterios de inclusión para contar micronúcleos para determinar frecuencias durante una prueba
de micronúcleos, principalmente en análisis de genotoxicidad. Si bien estos criterios son
efectivos para reducir los falsos positivos y funcionan bien para el protocolo CBMN-Cyt en tipos
de tejido validados, es posible que no sean universalmente aplicables a todos los tipos de células
(especialmente con la alta variación encontrada en las células cancerosas). Además, muchos
rasgos más allá de la frecuencia de micronúcleos no se han investigado a fondo, especialmente
en lo que respecta a la utilidad como biomarcador de inestabilidad cromosómica.
4.2.2 Conciencia de cuestiones confusas

Para obtener la plataforma ideal para la interpretación de datos de micronúcleos, es necesaria la


clasificación de los micronúcleos antes de calificarlos. Por ejemplo, se necesita investigación
para comparar los tipos de micronúcleos y su contribución relativa a la NIC, ya que los
micronúcleos se pueden clasificar en micronúcleos con o sin centrómero (probablemente como
resultado del estrés genotóxico); micronúcleos clásicos o grupos de micronúcleos; y
micronúcleos en líneas celulares con niveles altos o bajos de inestabilidad genómica. En la
literatura de los estudios de micronúcleos, ha habido algunas terminologías / conceptos con
respecto a los micronúcleos que necesitan aclaración.

a. Micronúcleos y muerte celular:

Aunque la mayoría de los micronúcleos serán eliminados, muchos de ellos implicarán


claramente la nueva formación del genoma. La ignorancia hacia las aberraciones cromosómicas
no clonales alteradas en el pasado también estuvo influenciada por el punto de vista del proceso
de muerte celular. Se pensó que tan pronto como se activó la vía apoptótica, se eliminaron las
células objetivo y los micronúcleos, lo que resultó en la actitud de "por qué molestarse". Sin
embargo, el experimento de rastrear la evolución del cáncer en acción demostró lo contrario
[8,17,19,24]. Como se discutió en el tema de la heterogeneidad de la muerte celular [16], la
muerte celular no solo puede ocurrir en una forma incompleta sino que también puede
contribuir a una evolución rápida y rápida al formar nuevos genomas. Las mismas consecuencias
se aplican a los micronúcleos. Primero, no se eliminan todos los micronúcleos. En segundo lugar,
incluso cuando se eliminan muchos de los micronúcleos, todavía contribuyen a la alteración de
la información genómica; además, muchos micronúcleos se eliminan y generan constantemente
y se presentan en un grado dado de herencia difusa; El proceso de muerte celular
paradójicamente produce un caos genómico para permitir que surjan nuevas poblaciones
celulares, lo que muestra nuevos genotipos y fenotipos como la resistencia a los medicamentos.
Los estudios sistemáticos de cómo la terapia de muerte celular máxima podría conducir a una
rápida resistencia a los medicamentos a través del caos genómico ilustra claramente este punto
([13,14] Horne et al., Datos no publicados).

Curiosamente, el proceso de muerte celular reversible ha recibido mucha atención. Varios tipos
de muerte celular, incluida la muerte celular mitótica [9,17,84], la apoptosis [85,86], la
necroptosis, una versión programada de necrosis [87] y la entosis [88], pueden revertir su propio
proceso. La mayoría de la investigación se centra actualmente en las vías de muerte celular.
Significativamente, al vincular los cambios dinámicos generales del transcriptoma, el nuevo
genoma identificó la supervivencia en lugar de las vías específicas [16,89]. También se identifica
una gran cantidad de vías para la apoptosis reversible, incluida la activación de la supervivencia
procelular, la antioxidación, la detención del ciclo celular, la modificación de la histona, el daño
al ADN y las respuestas inducibles por estrés, y en momentos retrasados, la angiogénesis y la
migración celular [ 86] En base a las observaciones de que una proporción de células
sobrevivientes (generadas por el proceso de muerte celular reversible) muestran anomalías
cromosómicas y otros defectos genéticos, que están asociados con el crecimiento maligno, es
muy probable que compartan el mismo mecanismo evolutivo del caos genómico. . Con un marco
basado en el genoma, se vuelve mucho más fácil comprender los fenómenos de la muerte
celular inversa. No es la reversión de la muerte de una sola célula, sino un comportamiento de la
población celular después de que algunos de sus miembros emergen con nuevos genomas
[13,14]. Por lo tanto, es útil estudiar si los micronúcleos también contribuyen o no al proceso de
muerte celular reversible. Incluso la entosis, a pesar de su comportamiento extraño, tiene un
mecanismo evolutivo similar de fusión de micronúcleos: cambiar la codificación del genoma
mediante la integración de nuevos materiales genómicos y la creación de nuevos paquetes de
información.

si. Fragmentaciones de ADN, cromosomas y núcleos:

Dado que los micronúcleos están asociados con la fragmentación del ADN (daño del ADN), la
fragmentación de los cromosomas (formación de células mitóticas) y la fragmentación nuclear
(división en ráfagas), es necesario distinguirlos y desarrollar métodos para caracterizarlos. Incluso
para la fragmentación cromosómica hay diferentes subtipos [90]. Para describir los fenómenos de
la fragmentación cromosómica, se utilizan diferentes términos que incluyen pulverización
cromosómica y condensación cromosómica prematura (PCC). Con morfologías similares, la
pulverización cromosómica y la PCC se han estudiado previamente con cierto grado de confusión.

Algunos estudios, por ejemplo, han confundido la pulverización cromosómica con PCC. Tras la
identificación de la fragmentación cromosómica, se compararon las similitudes y diferencias entre
la fragmentación cromosómica y la PCC [90] y existen muchas diferencias entre ellas.

C. Los micronúcleos se pueden vincular al caos genómico (incluida la cromotripsis), así como a
muchos otros factores relacionados con el estrés.
A pesar de la observación de que la cromotripsis se ha inducido experimentalmente con
micronúcleos [91], no debemos considerar que los micronúcleos sean el principal factor causante
de la cromotripsis. En contraste, el alto nivel de estrés representa un factor principal y común que
puede desencadenar el caos genómico (tanto localmente, reflejado como cromotripsis; y todo el
genoma, reflejado como un genoma caótico masivo) [11,15].

Basado en el análisis citogenético del caos genómico inducido experimentalmente, la cromotripsis


representa el 10% de todos los genomas caóticos inducidos. Es probable que esta proporción sea
mucho mayor si la secuencia de ADN de los genomas caóticos se compara con un único perfil
celular. La razón por la que se detectan reorganizaciones cromosómicas menos masivas en las
muestras de los pacientes se debe al hecho de que los métodos de secuenciación no pueden
perfilar las aberraciones cromosómicas no clonales. Además, la mayoría de los genomas caóticos
masivos son tipos de transición, que juegan un papel importante en la transición de fase, pero son
menos detectables en los productos finales de la evolución [12-14,24].

Nuevamente, para todos los subtipos de caos genómico, incluida la cromotripsis, la influencia
principal es el sistema de codificación reorganizado. Los estudios futuros de micronúcleos y la
evolución del cáncer deberían centrarse en este mecanismo evolutivo general. Además, la relación
entre micronúcleos y diferentes tipos de NCCA en otras enfermedades humanas debe ser
estudiada, ya que los NCCA están claramente vinculados a diferentes enfermedades [92-94].
Igualmente importante, cómo los micronúcleos juegan un papel en el mosaicismo somático
necesita más atención. En los últimos años, el tema del mosaicismo somático ha recibido una
mayor atención [95-97].

Los cariotipos anormales se han relacionado con una mayor probabilidad de malos resultados en
pacientes con leucemia mieloide aguda, lo que respalda el uso de cariotipo como herramienta de
diagnóstico [12-15]. La teoría del genometría es capaz de explicar estos hallazgos como un alto
nivel de NIC junto con la heterogeneidad cariotípica entre las células tumorales, lo que permite
que el genoma mencionado anteriormente "reorganice" para encontrar un nuevo sistema viable.
El análisis citogenético consistente puede permitir la evaluación de la capacidad de un tumor para
adaptarse rápidamente al estrés y debería ampliarse mediante la inclusión de NCCA como
micronúcleos [15,21,22]. Como la inestabilidad cromosómica y, por lo tanto, la capacidad del
sistema genómico para cambiar cuando se aplican tensiones pueden medirse mediante NCCA, es
importante que las anomalías cromosómicas y los NCCA previamente ignorados se investiguen
más a fondo. La evaluación de la heterogeneidad cariotípica aumenta en importancia cuando se
usan medicamentos genotóxicos para la quimioterapia, ya que estos pueden obligar a las células
tumorales a "adaptarse o morir", lo que resulta en la muerte del tumor original, pero también
impulsa la generación de una variedad de nuevos sistemas genómicos que puede formar un nuevo
cáncer [93,94]. La máxima expresión de la heterogeneidad cariotípica se presenta en forma de
mosaicismo cromosómico somático, en el que una porción significativa de las células de un
individuo muestra cariotipos variados; esto tiene el potencial de proporcionar una mayor
variabilidad inicial y puede predisponer a estos individuos a la enfermedad [95-97]. Un estudio
más profundo de tales individuos y su predisposición a enfermedades complejas como el cáncer
puede ayudar a desarrollar formas de evaluar el vínculo entre la heterogeneidad cariotípica y la
progresión de la enfermedad [13,14].

5. Conclusiones

Al revisar brevemente el campo de la investigación de micronúcleos, y particularmente al discutir


algunas diferencias importantes entre los micronúcleos clásicos (detectados a partir de células con
genomas relativamente estables) y los grupos de micronúcleos (detectados a partir de células con
genomas inestables), nuestro manuscrito ha enfatizado la importancia fundamental de estudiar
los micronúcleos. a través de la lente de la complejidad y la evolución mediada por el genoma.
Para comprender la relación dinámica entre los micronúcleos (así como otras variantes genómicas)
y las enfermedades humanas, la clave es apreciar la información genómica definida por el
cariotipo y sus cambios respondiendo a diversas tensiones. Por lo tanto, el modelo de
micronúcleos que contribuyen a los nuevos sistemas genómicos es importante y puede ayudar a
construir el futuro de la investigación de micronúcleos.

Con respecto a algunos de los problemas mencionados anteriormente, debe investigarse la


relación entre los MN y otras aberraciones cromosómicas. Particularmente, cómo m
cuantitativamente NCCAs y cómo tratar los valores atípicos entre el promedio. Al igual que otros
NCCA, la mayor heterogeneidad de los micronúcleos puede aumentar el potencial evolutivo, que
puede funcionar para mejorar la adaptación celular o aumentar las probabilidades de
enfermedades como una compensación [21,22,29].

Finalmente, todo el proceso de generar micronúcleos y terminar con un nuevo genoma es


altamente dinámico, con lo cual pueden estar involucrados tantos mecanismos moleculares
individuales. Centrarse en el comportamiento del sistema a un nivel superior es mucho más útil
que caracterizar cada una de estas rutas individuales. En otras palabras, simplemente no es útil
centrarse en crear una larga lista de mecanismos moleculares individuales, una lección aún por
aprender en la investigación actual sobre el cáncer. Como señaló el Dr. Robert Weinberg, más de
medio siglo de investigación sobre el cáncer ha generado una enorme cantidad de datos
moleculares, desafortunadamente ". . . esencialmente no hubo ideas sobre cómo la enfermedad
comienza y progresa a sus conclusiones potencialmente mortales”[73]. Claramente, la
investigación de micronúcleos debe evitar los mismos métodos incompetentes que el estudio del
mecanismo evolutivo en última instancia es importante [13,14,21,22,74].

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