Actividad 2: Enzimas
Las leyes de la termodinámica dictan que no tendrá una interrupción una reacción que parte
espontáneamente a menos que las moléculas que resultan de la reacción - los productos - tengan
energía más baja que las moléculas que comenzaron la reacción - los reactantes. Tales reacciones
se llaman las reacciones exergonicas porque liberan energía. Una reacción de síntesis en la cual los
productos tienen energía más alta que los reactantes puede ocurrir si hay un aporte de energía.
Esto se llama una reacción endergonica.
Aunque las reacciones exergonicas liberan energía, requieren realmente un aporte inicial de
energía para proceder. Este aporte de energía se llama energía de activación. Esto es análogo al
empuje que se debe dar a una bola en la cumbre de una colina para conseguir lanzar su energía
potencial y rodar abajo. Los catalizadores son las moléculas que permiten que las reacciones
ocurran más fácil disminuyendo la energía de activación. En sistemas biológicos, las enzimas
actúan como catalizadores. Los catalizadores funcionan proporcionando un lugar en donde dos
reactantes pueden reunirse y obrar recíprocamente. Después de que los productos se formen y
salgan del catalizador, el catalizador se puede utilizar otra vez.
La mayoría de las enzimas terminan en "asa" y trabajan solamente en reacciones específicas. Las
reacciones metabólicas ocurren en una serie de pasos llamados una vía metabólica. Los productos
de la primera reacción se convierten en los reactivo en la reacción siguiente etcétera hasta que se
forma un producto final. Para facilitar estas reacciones, cada reacción se asocia a una enzima única
. Una enzima permite que una reacción ocurra más fácilmente. Los reactantes se llaman
substratos para esa enzima.
DESNATURALIZACIÓN DE LAS PROTEÍNAS
Cuando la proteína no ha sufrido ningún cambio en su interacción con el disolvente, se dice que
presenta una estructura nativa (Figura inferior). Se llama desnaturalización de las proteínas a la
pérdida de las estructuras de orden superior (secundaria, terciaria y cuaternaria), quedando la
cadena polipeptídica reducida a un polímero estadístico sin ninguna estructura tridimensional fija.
Estado nativo Estado desnaturalizado
Cualquier factor que modifique la interacción de la proteína con el disolvente disminuirá su
estabilidad en disolución y provocará la precipitación. Así, la desaparición total o parcial de la
envoltura acuosa, la neutralización de las cargas eléctricas de tipo repulsivo o la ruptura de los
puentes de hidrógeno facilitará la agregación intermolecular y provocará la precipitación. La
precipitación suele ser consecuencia del fenómeno llamado desnaturalización y se dice entonces
que la proteína se encuentra desnaturalizada (Figura superior).
En una proteína cualquiera, la estructura nativa y la desnaturalizada tan sólo tienen en común la
estructura primaria, es decir, la secuencia de AA que la componen. Los demás niveles de
organización estructural desaparecen en la estructura desnaturalizada.
La desnaturalización provoca diversos efectos en la proteína:
1. cambios en las propiedades hidrodinámicas de la proteína: aumenta la viscosidad y
disminuye el coeficiente de difusión
2. una drástica disminución de su solubilidad, ya que los residuos hidrofóbicos del interior
aparecen en la superficie
3. pérdida de las propiedades biológicas
Una proteína desnaturalizada cuenta únicamente con su estructura primaria. Por este motivo, en
muchos casos, la desnaturalización es reversible ya que es la estructura primaria la que contiene
la información necesaria y suficiente para adoptar niveles superiores de estructuración. El proceso
mediante el cual la proteína desnaturalizada recupera su estructura nativa se llama
renaturalización. Esta propiedad es de gran utilidad durante los procesos de aislamiento y
purificación de proteínas, ya que no todas la proteínas reaccionan de igual forma ante un cambio
en el medio donde se encuentra disuelta. En algunos casos, la desnaturalización conduce a la
pérdida total de la solubilidad, con lo que la proteína precipita. La formación de agregados
fuertemente hidrofóbicos impide su renaturalización, y hacen que el proceso sea irreversible.
Los agentes que provocan la desnaturalización de una proteína se llaman agentes
desnaturalizantes. Se distinguen agentes físicos (calor) y químicos (detergentes, disolventes
orgánicos, pH, fuerza iónica). Como en algunos casos el fenómeno de la desnaturalización es
reversible, es posible precipitar proteínas de manera selectiva mediante cambios en:
la polaridad del disolvente
la fuerza iónica
el pH
la temperatura
Clasificación de las enzimas
De manera tradicional, a las enzimas se les ha puesto en nombre del sustrato sobre el que actúan
terminado en "asa", por ejemplo, la palabra sacarasa es el nombre de una enzima cuyo sustrato es
la sacarosa, una peptidasa se refiere a una enzima que tiene como sustrato a péptidos y la lipasa
degrada lípidos. Sin embargo esta forma de llamar a las enzimas es poco formal y se presta a
muchas confusiones, puede haber dos enzimas diferentes que tengan un mismo sustrato y por lo
tanto llevarían el mismo nombre.
Existe una clasificación internacional de las enzimas, la cual se basa en el tipo de reacción que
catalizan, a continuación se presentan de manera simplificada los principales grupos de enzimas
que existen:
1: Oxidoreductasas: Este tipo de enzimas catalizan la transferencia de electrones de un
compuesto a otro. Casi siempre los electrones van acompañados de protones. Fórmula 6.2 y
Figura 6.3.
6.2
2: Transferasas: La reacción que catalizan estas enzimas es la de transferir un grupo químico de un
compuesto a otro. Fórmula 6.3 y Figura 6.4.
6.3
3: Hidrolasas: Como su nombre lo dice, estas enzimas catalizan reacciones de hidrólisis. Ecuación
6.4 y Figura 6.5.
6.4
4: Liasas: Las enzimas de este tipo agregan (o sustraen), grupos químicos a dobles ligaduras.
Ecuación 6.5 y Figura 6.6.
6.5
5: Isomerasas: Estas enzimas transforman un compuesto en alguno de sus isómeros. (Recuerde
que los isómeros son compuestos que tienen los mismos átomos pero diferente arreglo en el
espacio). En la Ecuación 6.6 se representa la conversión de la glucosa en fructosa.
6.6
6: Ligasas: Estas enzimas forman uniones covalentes entre dos compuestos, la reacción es
endergónica y requieren de la ruptura de moléculas de ATP que proporcionen energía. Ecuación
6.7 y Figura 6.7.
6.7
Mecanismo de acción de un catalizador
La cinética química es el estudio de las velocidades de las reacciones químicas y la cinética
enzimática es el estudio de las velocidades de las reacciones catalizadas por enzimas.
La gráfica que se presenta en la Figura 6.8 y el esquema de la Figura 6.9, nos permite entender la
forma en la que un catalizador aumenta la velocidad de una reacción: en ella se representa el
curso de la misma. En el estado inicial se encuentran los reactivos, los cuales tienen una
determinada cantidad de energía, determinada por su posición con respecto al eje de las
ordenadas. Al ocurrir la reacción se llega al estado final en donde se encuentran los productos, los
cuales tienen menos energía que los reactivos (están en una posición mas baja con respecto al eje
y), y por lo tanto la reacción es exergónica.
Figura 6.8 Diferencias energéticas entre las reacciones con catalizador y sin él. (Figura elaborada
por el autor).
Se han diferenciado dos curvas, una en negro que representa el curso de una reacción en ausencia
de un catalizador y la otra en rojo, que representa la presencia de un catalizador. El cambio total
de energía libre, ocurrido cuando se convierten los reactivos en productos, es el mismo con o sin
catalizadorenergía de activación. Nótese también que para que los reactivos se conviertan en
productos, es necesario proporcionarles una cantidad de energía adicional (energía de activación).
Cada una de las moléculas de reactivo tienen diferente contenido energético. En un extremo se
encuentran las moléculas que poseen muy poca energía y en el otro, las que contienen altas
cantidades, pero la mayoría tiene un contenido energético intermedio (siguen una curva de
distribución normal). Para que una molécula de reactivo se transforme en producto tiene que
aumentar su contenido energético, con lo que logra vencer la barrera representada en la curva
como energía de activación. Mientras más alta sea la energía de activación menos moléculas
podrán transformarse en producto, ya que únicamente las más energéticas podrán hacerlo, y es
aquí en donde intervienen los catalizadores puesto que éstos disminuyen la energía de activación,
permitiendo así, que una mayor cantidad de moléculas de reactivo puedan transformarse. Por lo
tanto: un catalizador disminuye la energía de activación de una reacción.
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