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Principios Metabolismo Microbiano PDF
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Todos los seres vivos llevan a cabo el procesamiento de los nutrientes que los
mantienen vivos. A este conjunto de procesos, se le conoce como metabolismo y
consiste de un gran número de reacciones químicas destinadas a transformar las
moléculas nutritivas en elementos que posteriormente serán utilizados para la
síntesis de los componentes estructurales; como pueden ser las proteínas. Otra
parte importante del metabolismo es la de transformar y conservar la energía que
está contenida en una reacción química en algún proceso que requiera de energía,
como puede ser el trabajo o el movimiento. Figura N° 1.1.
Hoy se conoce que las transformaciones que sufre la glucosa no ocurren en un solo
paso, sino que, por el contrario, se forman varios productos intermedios que en
muchas ocasiones no tienen una función específica a no ser la de formar parte de
lo que se conoce como vía metabólica. La transformación de los nutrientes en
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compuestos útiles para la subsistencia de un organismo se lleva a cabo por medio
de las reacciones químicas que realizan unas proteínas conocidas como enzimas.
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La energía liberada en las reacciones catabólicas se usa para fosforilar ADP,
generando ATP. La energía almacenada en el ATP se utiliza en la mayoría de los
trabajos celulares. Por lo tanto, el ATP acopla los procesos productores de energía
de la célula a los consumidores de energía. Figura Nº 1.2.
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El metabolismo tiene lugar a través de secuencias de reacciones catalizadas
enzimáticamente, y se divide en anabolismo y catabolismo. El proceso por el cual
la célula bacteriana sintetiza sus propios componentes se conoce como
anabolismo, y como resulta en la producción de nuevo material celular, también se
denomina biosíntesis.
La biosíntesis es un proceso que requiere energía, por lo tanto las bacterias deben
ser capaces de obtenerla de su entorno para crecer y, eventualmente, multiplicarse.
El conjunto de reacciones degradativas de los nutrientes para obtener energía o
para convertirlos en unidades. Figura N° 1.3.
Las bacterias son seres vivos y están compuestas al igual que las células
eucariotas por proteínas, polisacáridos, lípidos, ácidos nucleicos, entre otros. Estas
moléculas a su vez forman parte de estructuras celulares más complejas, como por
ejemplo la pared celular y la membrana citoplasmática. Una característica de los
seres vivos es la capacidad para sintetizar sus propios constituyentes a partir de
nutrientes que toman del medio externo.
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El crecimiento bacteriano se define como el aumento ordenado de todos los
constituyentes químicos de la célula. Se trata de un proceso complejo, que supone
la replicación de todas las estructuras y componentes celulares a partir de los
nutrientes exógenos.
El conocimiento de la fisiología y del metabolismo bacteriano tiene algunas
aplicaciones prácticas:
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Los distintos tipos de metabolismo microbiano se pueden clasificar según tres
criterios distintos:
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Según la forma en la que el organismo obtiene la energía para vivir y crecer:
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• Los quimiolitoheterótrofos obtienen energía de la oxidación de
compuestos inorgánicos, pero no pueden fijar el dióxido de carbono.
Ejemplos: algunos Nitrobacter spp., Wolinella (con hidrógeno como
equivalente reductor), algunas bacterias oxidantes del hidrógeno.
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Figura N° 1.5. Clasificación de nutricional de los organismos
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1.3. SUMINISTRO ENERGÉTICO
Las células bacterianas, poseen una gran variedad de sustancias como fuente de
energía, ilimitada
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reducción frecuentemente incluyen no sólo la transferencia de electrones sino de
átomos enteros de hidrógeno, por lo que se conocen también con el nombre de
reacciones de deshidrogenación. En reacciones de este tipo hay sustancias que
ceden e- (dadoras) y otras que los aceptan (aceptoras). Figura N° 1.7.
Todas las formas de vida están basadas en prácticamente las mismas reacciones
bioquímicas.
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Figura N° 1.7. Visión General del Metabolismo. Se muestran las rutas
metabólicas centrales y algunos de los intermediarios claves.
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• Hay microorganismos que necesitan que en el medio de cultivo
existan fuentes de carbono orgánico (azúcares) y se les denomina
heterótrofos,
• Otros microorganismos necesitan que se les suministren además
otros compuestos orgánicos que ellos no tienen la capacidad de sintetizar (a
estos compuestos se les denomina factores de crecimiento)
• Las células de los animales necesitan un gran número de
compuestos preformados los cuales deben estar en la dieta (se le
denominan vitaminas, aminoácidos esenciales o ácidos grasos esenciales).
Por ejemplo,
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Figura Nº 1.8. Metabolismo Intermediario.
Cada reacción metabólica está regulada no sólo con respecto a otras reacciones
sino también con respecto a la concentración de nutrientes en el medio. La
regulación se realiza a diferentes niveles:
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1.4.1. Mecanismos de Regulación enzimática
Las proteínas alostericas son aquellas cuyas propiedades cambian si se les unen
moléculas específicas denominadas efectores. Existen dos clases de proteínas
alostericas: las enzimas alostericas cuya actividad se incrementa o se inhibe
cuando se combinan con sus efectores, y las proteínas alostericas reguladoras que
modulan la actividad de enzimas específicas.
Las proteínas alostericas estudiadas con mayor detalle han sido las enzimas
alostericas, cuyo ejemplo lo constituye la aspartato transcarbamilasas (ATCasa),
que cataliza la primera reacción de la biosíntesis de las pirimidinas y cuya actividad
es inhibida por un producto final, la citidina trifosfato (CTP). concentraciones
elevadas de CTP inhiben el funcionamiento de la ATCasa y, en consecuencia, la
formación de más CTP hasta que su concentración disminuye a un nivel optimo. el
ATP, un segundo efector de la ATCasa, activa la enzima, sirviendo para coordinar
la síntesis de nucleótidos de purina y pirimidina. las enzimas alostericas son
siempre proteínas de peso molecular relativamente elevado, compuestas por
múltiples subunidades. por regla general estas subunidades son idénticas
poseyendo cada una un lugar catalítico y otro alostérico. no obstante, la ATCasa se
compone de dos clases diferentes de subunidades, una con función catalítica y otra
con funciones reguladoras.
En las bacterias anaerobias facultativas la fermentación (como única vía de
generación de energía) es bloqueada en presencia de oxígeno, asegurando que el
suministro de energía se produzca por la respiración, que consume menos glucosa
y acumula menos lactato. En este fenómeno, conocido como efecto Pasteur, la
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enzima fosfofructoquinasa es activada o inhibida según la relación ATP/ADP,
regulando así el consumo de glucosa.
Este es un ejemplo de regulación de la actividad enzimática por una enzima
alostérica. El ejemplo clásico de regulación a nivel de la síntesis de enzimas lo
constituye el operón lactosa. Hay 3 enzimas que participan en la utilización de la
lactosa (ß-galactosidasa, galactósido permeasa y galactósido transacetilasa) que
tienen un promotor único.
En ausencia de lactosa, la transcripción para estas enzimas está bloqueada por
acción de un represor que se une al promotor inhibiendo la acción de la ARN
polimerasa. Cuando se agrega lactosa al medio, ésta se une al represor,
bloqueando de este modo su unión al promotor, permitiendo así la acción de la
ARN polimerasa y la síntesis de las tres enzimas.
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son indispensables. Algunos nutrientes son utilizados sólo como precursores de
macromoléculas celulares y otros sólo como fuente de energía sin ser incorporados
directamente al material celular, mientras que otros cumplen las dos funciones a la
vez. También se pueden clasificar como macro y micronutrientes según la
cantidad requerida.
MACRONUTRIENTES
La primera está bastante extendida entre las bacterias mientras que la segunda
sólo es común en bacterias anaerobias y anaerobias facultativas. El fósforo es
utilizado para la síntesis de ácidos nucleicos y fosfolípidos. La mayoría de las
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Aunque requeridos en cantidades muy pequeñas los micronutrientes son
importantes para la nutrición. Entre estos destacamos, cobalto, cobre y manganeso.
Son sustancias que deben ser aportadas preformadas, ya que la bacteria que las
requiere no las puede sintetizar a partir de los nutrientes más simples, por falla o
ausencia de una vía metabólica.
Estas sustancias incluyen vitaminas del complejo B, aminoácidos, purinas y
pirimidinas. Las bacterias que no requieren factores de crecimiento de denominan
prototróficas y las que los requieren, auxotróficas para ese factor.
II. Dióxido de carbono: Algunas bacterias como Neisseria y Brucella tienen varias
enzimas con baja afinidad por el CO2 y requieren una concentración más
elevada (10%) de la que habitualmente está presente en la atmósfera (0.03%).
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Estos requerimientos atmosféricos deben ser tenidos en cuenta cuando se
realice el cultivo de estas bacterias.
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1.5. METABOLISMO HETERÓTROFO
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- Las bacterias tienden versatilidad a intercalar fácilmente los nutrientes y
productos metabólicos terminales
Hay muchas variaciones en este tema, pues diversos organismos pueden degradar
diversos polímeros y secretar diversos residuos. Algunos organismos pueden
incluso degradar los compuestos más recalcitrantes tales como pesticidas y
petróleo, realizando su reciclado.
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Figura Nº 1.9. Metabolismo Intermediario.
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Bioquímicamente, el metabolismo heterótrofo procarionte es mucho más versátil
que el de los organismos eucariontes, aunque muchos procariontes comparten los
modelos metabólicos más básicos con los eucariontes, por ejemplo, usando la
glicolisis (también llamada ruta EMP) para el metabolismo del azúcar y el ciclo del
ácido cítrico en la degradación del acetato, produciendo energía bajo la forma de
ATP y reduciendo energía bajo la forma de NADH o quinona.
Estas rutas metabólicas básicas están muy extendidas porque también están
implicadas en la biosíntesis de muchos componentes necesarios para el
crecimiento de la célula (a veces en la dirección contraria).
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* En Bacterias, ** en Hongos
Esta diversidad y capacidad metabólicas de los procariontes que les permite utilizar
una variedad enorme de compuestos orgánicos se debe a una historia y diversidad
evolutivas mucho más profundas que las de los eucariontes. Es también
significativo que las mitocondrias se originaron en los eucariontes por
endosimbiosis de una bacteria relacionada con los parásitos intracelulares
Rickettsia, y también los simbiontes de las plantas Rhizobium o Agrobacterium.
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Cuadro Nº 1.2. Patrones de reacciones de oxido reducción suministradoras de
energía utilizadas por las bacterias.
Aceptor de
O2 H2 NO3=, Compuestos
Donador (Respiració SO4=, orgánicos
de H2 n fumarato (Fermentación
anaerobia) (Respiració )
n
anaerobia)
III. Respiración
anaerobia
I. Respiración (Ninguno)
de
aerobia de sustancias
Sustancia
sustancias inorgánicas.
s
inorgánicas Ej.:
inorgánica
Ej.: (Thiobacillus
s
(Nitrosomonas) denitrificans)
NH3 � NO2= S � SO 4=
O2 � H2O =
NO3 � N2
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Figura Nº 1.11. Alternativas del metabolismo microbiano.
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La fosforilación a nivel de sustrato es un sistema usado por ciertas bacterias
quimiorganotrofas. el sustrato orgánico (donador de electrones) pasa por una ruta
catabólica (p.ej., la ruta glucolítica), y uno de los intermediarios de esa ruta es
oxidado por un coenzima (p. ej., NAD+), de manera que se origina un intermediario
no fosforilado con una gran energía de hidrólisis. Dicho intermediario experimenta
enseguida una sustitución con un fosfato, para dar la correspondiente forma acil-
fosfato (siendo este enlace de alta energía). Finalmente, este acil-fosfato dona su
fosfato de alta energía al ADP, que pasa a ATP. Ejemplo: gliceraldehido-3-p à 1,3-
difosfoglicérico à 3-fosfoglicérico.
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El flujo de electron es desde el NADH o el FADH2 al O2 a través de complejos
proteicos localizados en la membrana interna mitocondrial, provoca el bombeo de
protones hacia el exterior de la matriz mitocondrial. Se genera una fuerza
protomotriz que está formada por un gradiente de pH y por un potencial eléctrico
transmembranal. Cuando los protones regresan a la matriz mito condrial a través de
un complejo enzimático, se sintetiza ATP (fig. 1). De esta forma, la oxidación y la
fosforilación están acopladas por un gradiente de protones a través de la membrana
interna mitocondrial. (Figura Nº 1.13).
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1.5.3. La fermentación
1. Anaerobios estrictos.
2. Facultativos.
3. Anaerobios aerotolerantes.
para oxidar NADH a NAD+ y por lo tanto deben tener un método alternativo para
usar esta energía reductora y mantener una fuente de NAD+ para el funcionamiento
apropiado de las rutas metabólicas normales, como por ejemplo, la glicólisis (Figura
Nº 1.14). Puesto que no requieren oxígeno, los organismos fermentantes son
anaerobios. Muchos organismos pueden utilizar fermentación bajo ciertas
condiciones anaerobias y respiración cuando el oxígeno está presente.
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Estos organismos son anaerobios facultativos. Para evitar la superproducción de
NADH, los organismos fermentantes obligados generalmente no tienen un ciclo
completo del ácido cítrico. En vez de usar ATPasas como en la respiración, el ATP
en organismos fermentantes es producido por la fosforilación a nivel de substrato
donde un grupo fosfato se transfiere de un compuesto orgánico de gran energía al
ADP para formar el ATP. (Figura Nº 1.15).
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metabólicos producidos por cada especie bacteriana específica son los
responsables del gusto y características de cada alimento.
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electroquímico para mover un protón (o sodio) y así realizar la síntesis de ATP.
Ejemplos de estas formas inusuales de fermentación incluyen la fermentación del
succinato por el Propionigenium modestum y la fermentación del oxalato por
Oxalobacter formigenes. Estas reacciones son de rendimiento energético
extremadamente bajo. Los seres humanos y otros animales también utilizan la
fermentación para consumir el exceso de NADH produciendo lactato, aunque ésta
no es la forma principal de metabolismo como en los microorganismos
fermentantes.
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