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GUIA DE TRABAJOS
PRACTICOS
Carrera: Bioquímica
Ordenanza: 323/07
Carrera: Farmacia
Ordenanza: 324/07
Año 2017
ÍNDICE
2. COMPARTIMIENTOS CELULARES I 10
El fraccionamiento celular como herramienta para el estudio de los
compartimientos celulares
3. COMPARTIMIENTOS CELULARES II 15
Caracterización morfológica y funcional de los compartimientos celulares
5. BIOMOLÉCULAS II 23
Estructura y función de los ácidos nucleicos. El dogma central de la biología Métodos de
estudio de los ácidos nucleicos
Anexo bibliográfico: Molecular Structure of Nucleic Acids: A structure for Deoxyribose
Nucleic Acid J. Watson, F. Crick, Nature 1953 27
Anexo bibliográfico: El Código Genético 29
Anexo bibliográfico: El dogma central de la biología 30
6. BIOMEMBRANAS I 31
Organización estructural de las membranas biológicas
8. BIOMEMBRANAS II 38
Funciones básicas de las membranas biológicas
9. CICLO CELULAR 41
1
Presentación de la Guía de Trabajos Prácticos
Equipo de cátedra:
COMISIÓN 1 COMISIÓN 2
Lunes 14:00-17:00 hs Martes 9:30-12:30 hs Jueves 9:00 a 13:00 hs
Lugar: Lab. Análisis Clínicos “Virgen María Lugar: Lab. Análisis Clínicos “Virgen María Lugar: Aula Posgrado A (1er piso)
de Fátima” de Fátima” Hospital de Clínicas
“Virgen María de Fátima”
7-11 Agosto -Presentación de la materia, bibliografía, - Seminario: Métodos de estudio de la célula EXCEPCIONALMENTE 10.30 HS
condiciones de regularidad, etc. Comisión 1 y 2 (juntas)
- Asignación de Comisiones 1 y 2 Teórico 1:
Lugar: Aula a designar Introducción a la Biología. Unidad y diversidad de
Lugar: Lab. Análisis Clínicos “Virgen María las células. La célula como unidad de la vida.
de Fátima Células procariontes y eucariontes
- Las moléculas de la vida: biomoléculas
4
4-8 Septiembre TP 3: Caracterización morfológica y funcional TP 3: Caracterización morfológica y funcional Teórico 5: Métodos de estudio de ácidos nucleicos.
de los compartimientos celulares de los compartimientos celulares Duplicación de ADN. Transcripción. Traducción.
5
No hay actividades No hay actividades Segundo Examen Parcial
6-10 Aula Posgrado A, 9.00 – 12.00 hs
Noviembre Lunes 6/11 Martes 7/11 Jueves 9/11
13-17
Noviembre No hay actividades No hay actividades Recuperatorio puntual de TP
Comisión 1 y 2 (juntas)
Aula Posgrado A, 11.00 – 13.00 h
6
Trabajo Práctico Nº 1
Métodos de estudio de la célula
Temario:
-Orgánulos de la célula eucarionte. El citoesqueleto.
-Purificación de las células y de sus partes.
-Visualización de la arquitectura celular. Aumento y poder de resolución de los microscopios. Cálculo de
límite de resolución (D).
-Microscopía: definición de Límite de Resolución, Poder Resolutivo, y aumento (magnificación).
-Tipos de microscopio y uso da cada uno de ellos. Microscopio óptico de campo claro: sus partes.
Microscopio de fluorescencia convencional y confocal. Microscopio de campo oscuro. Microscopio de
contraste de fase. Microscopio electrónico de transmisión y de barrido.
-Preparación de las células para su observación por microscopía óptica y por microscopía electrónica.
Bibliografía:
Para éste primer TP los alumnos podrán consultar:
Cualquier libro de Biología que contenga los temas mencionados.
“Biología Molecular de la Célula” Bruce Alberts y col. 5ra Edición. Ediciones Omega. Capítulo
9 (Hay ejemplares en la Biblioteca Central de la UNLAR)
Objetivos:
Que el alumno conozca las técnicas básicas de la Biología Celular y adquiera la capacidad de
seleccionar las metodologías adecuadas según los problemas a resolver.
Actividades a Desarrollar
Actividad 1: Procedimientos experimentales y estrategias de estudio de las células
Se realizará en forma conjunta un cuadro incluyendo las técnicas que se utilizan comúnmente para el
estudio de las células, incluyendo las técnicas que se utilizarán durante los TP.
Actividad 2: Descripción de las partes de un microscopio de campo claro y uso correcto del mismo.
Se mostrarán las partes de un microscopio óptico de campo claro y se enseñará el uso correcto del mismo.
Para ello se utilizará un preparado de células epiteliales de mucosa bucal que deberán preparar de acuerdo
al siguiente procedimiento:
a) Raspar la mucosa bucal con un hisopo embebido en solución fisiológica para obtener células del
epitelio de la misma que se descaman naturalmente, y colocarlas sobre un portaobjetos
b) Teñir las células con una gota de Azul de metileno, cubrir con un cubreobjetos y observar a 100X
y 400X.
Procedimiento:
a) Identificar las partes del microscopio. Observar el trayecto del haz de luz.
b) Anotar el valor del aumento de los distintos componentes del microscopio (objetivos, oculares y
lentes intermedias), y el valor de la Apertura Numérica (AN) de cada uno.
Objetivo AN
a…………………....X
b…………………… X
c…………………….X
d…………………….X
7
La letra “X” se utiliza para indicar el aumento.
c) Calcular el valor del aumento total que se obtiene con cada objetivo del microscopio:
a: …………….…………..X
b: …………………………X
c: …………………………X
d: …………………………X
Calcular el límite de resolución (D) que se puede obtener con cada objetivo del microscopio.
Considere que la longitud de onda que permite pasar el filtro es de 500 nm.
a:
b:
c:
d:
Actividad 2: Complete el esquema de un microscopio óptico y nombre las partes allí señaladas,
diferenciando si corresponden a la parte óptica o mecánica del aparato
A. …………………………………………………..
B. …………………………………………………..
C. …………………………………………………..
D. …………………………………………………..
E. …………………………………………………..
F. …………………………………………………..
G. …………………………………………………..
H. …………………………………………………..
I. …………………………………………………..
J. …………………………………………………..
K. …………………………………………………..
L. …………………………………………………..
M. …………………………………………………..
8
Se observará un preparado de riñón fijado en etanol e incluido en parafina, sobre el cuál se llevó a cabo
una técnica inmunohistoquímica para detectar la expresión de la proteína PCNA (Proliferating Cell
Nuclear Antigen) que se encuentra en el núcleo de las células sólo en la etapa S del ciclo celular. La
expresión de esta proteína se puso en evidencia utilizando un anticuerpo dirigido contra la proteína PCNA
(anticuerpo primario), que reconoce y se une específicamente a dicha proteína. En un segundo paso, esta
interacción se puso en evidencia por medio de una reacción cromogénica acoplada a un anticuerpo
(anticuerpo secundario) dirigido contra el anticuerpo primario. Se utilizó como contracolor hematoxilina
para facilitar la observación del preparado histológico.
2) Durante el TP, usted utilizó azul de metileno para colorear las células de la mucosa bucal.
a- ¿Qué estructuras celulares se colorean con el Azul de metileno?
b- Compare la intensidad de coloración del citosol y del núcleo de las células de la mucosa bucal. ¿Cuál
presenta mayor intensidad? ¿A que puede deberse esta diferencia?
c- Si hubiera utilizado eosina (colorante ácido) en lugar de azul de metileno, ¿el patrón de coloración
hubiera sido a la inversa (intensidad de coloración citosol: núcleo)? ¿Por qué?
c- ¿Qué características poseen las moléculas que se colorean con los colorantes básicos? Mencione
ejemplos.
9
Trabajo Práctico Nº 2
Compartimientos celulares I
Temario:
1) Compartimientos celulares y transporte intracelular
-Orgánulos delimitados por membrana
-Distribución de las proteínas
-Transporte vesicular
-Vías secretoras
-Vías endocíticas
2) Fraccionamiento celular
-Ruptura de las células
-Centrifugación diferencial
-Centrifugación por gradiente de densidad
Bibliografía:
“Introducción a la Biología Celular” Bruce Alberts y col., 3da Edición, Editorial Médica
Panamericana, 2011. Capítulo 4 pág. 164 y 165 (Lámina 4.4), y capítulo 15.
“BIOLOGÍA CELULAR Y MOLECULAR”, Lodish y col., 5ª Edición, Editorial Médica Panamericana,
2005. Capítulo 5 pág. 180 - 181.
Bibliografía de consulta:
“Biología Molecular de la Célula”. Bruce Alberts y col., 3ra Edición, Ediciones Omega.
Objetivos:
Que el alumno comprenda la importancia de los compartimientos internos de la célula sobre la
base del estudio de la estructura y función de las diferentes organelas celulares.
Que los alumnos interpreten la metodología utilizada para separar organelas.
Que los alumnos apliquen los conocimientos sobre los aspectos metodológicos en la realización
de un ensayo experimental.
Introducción:
Las células eucariontes han desarrollado diversas estrategias para aislar y organizar sus reacciones
químicas, una de ellas consiste en confinar los diferentes procesos metabólicos, y las proteínas
requeridas para llevarlas a cabo, dentro de distintos compartimientos delimitados por membranas. De
este modo surgieron las membranas internas o endomembranas, independientes de la membrana
plasmática, que dividieron a la célula en compartimientos. Una ventaja de este sistema, es que
permite dividir el trabajo aumentando la eficiencia y la especialización celular, ya que en cada
compartimiento se localizan enzimas específicas, otorgándole a cada uno una función diferente. Esto
permite la simultaneidad de reacciones químicas incompatibles.
La estructura, composición química, y función de cada uno de los compartimientos celulares se puede
estudiar aislando la organela de su entorno celular, mediante ultracentrifugación diferencial, o bien en
el entorno celular, utilizando técnicas histoquímicas, citoquímicas, inmunohistoquímicas,
inmunocitoquímicas o microscopía electrónica.
Actividades a Desarrollar
10
Protocolo experimental: Se obtendrá una suspensión celular a partir de un fragmento del órgano. La
separación de las células requiere la aplicación de diferentes metodologías sobre la base de
procedimientos mecánicos o químicos.
Durante esta experiencia, usted recibirá un fragmento de hígado dentro de una cápsula de Petri, sumergido
en 5 ml de una solución de buffer de homogenización (sacarosa 0.25 M; buffer TRIS/HCl pH 7.5, 25 mM;
MgCl2 3 mM y EDTA 10 mM). Todas las etapas de este procedimiento se llevarán a cabo a 4ºC (sobre
hielo).
¿Por qué es necesario trabajar a baja temperatura si la temperatura corporal del mamífero es
37ºC?
Sobre el material de partida, el alumno debe efectuar los siguientes pasos (ESQUEMA 1):
1. Disrupción mecánica del parénquima del órgano, con la ayuda de material de cirugía dispuesto para
tal fin: el fragmento de hígado deber ser cortado en pequeños fragmentos cuyo tamaño no deberá
superar los 5 mm.
2. Filtrar rápidamente la suspensión de células hepáticas resultante a través de una gasa (previamente
humedecida con solución fisiológica).
3. El filtrado obtenido deberá ser centrifugado durante 10 minutos a 1500 rpm, preferentemente en
centrífuga refrigerada.
4. El pellet conteniendo los hepatocitos aislados se resuspende en 1 ml de buffer de homogenización.
Resuspender la suspensión de hepatocitos con pipeta Pasteur (rotulada SUSPENSIÓN).
5. Separar una alícuota de esta suspensión celular antes de proseguir con el protocolo experimental
descripto en el Esquema 1. Para ello tome una gota de la suspensión con pipeta Pasteur, colóquela
sobre un portaobjeto para su observación microscópica. El resto del material se utiliza para la
obtención de un homogenato celular (ESQUEMA 2).
¿Por qué es necesario incubar el material en una solución buffer que contenga EDTA en su
composición?
¿Qué resultado obtendría si en lugar de realizar una disrupción mecánica usted incuba la muestra
con la enzima colagenasa? ¿Cuál es el sustrato de esta enzima?
¿Por qué razón la suspensión celular se almacena en un buffer conteniendo sacarosa?
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ESQUEMA 1
FILTRACIÓN
Suspensión de
hepatocitos
CENTRIFUGACIÓN
VISUALIZACIÓN
MICROSCÓPICA
RESTO DE LA SUSPENSIÓN CELULAR
EXPERIMENTAL
(I GOTA)
OBT. DE UN HOMOGENATO
HOMOGENADOUNHHOMOGENA
DO
CENTRIFUGACION DIFERENCIAL
B. VISUALIZACIÓN MICROSCÓPICA.
La alícuota separada para este fin se observará con el siguiente procedimiento:
Colocar sobre un portaobjetos una gota de la muestra. Agregar 1 gota de AZUL DE METILENO 6%,
colocar el cubreobjetos y observar al microscopio óptico a 100X y a 400X.
Describir lo que se observa.
B. CENTRIFUGACIÓN DIFERENCIAL.
La centrifugación diferencial es llevada a cabo en centrífugas refrigeradas de alta velocidad, utilizando en
general rotores de ángulo fijo.
El siguiente cuadro (ESQUEMA 2) esquematiza el protocolo experimental a aplicar en la obtención de los
compartimientos celulares hepáticos, requeridos para el estudio durante los siguientes trabajos prácticos.
12
ESQUEMA 2
HOMOGENATO
PELLET 1 SOBRENADANTE 1
10.000 xg
durante 30
minutos
PELLET 2 SOBRENADANTE 2
100.000 xg
durante 60
minutos
PELLET 3 SOBRENADANTE 3
300.000 xg
durante 2 horas
PELLET 4 SOBRENADANTE 4
Pellet 1: resuspender con 0.50 – 1.0 ml de buffer de homogenización y pasar a dos tubos Eppendorf
rotulados P1
Pellet 2: resuspender con 0.25 – 0.50 ml de buffer de homogenización y pasar a dos tubos Eppendorf
rotulados P2
Sobrenadante 2: conservar solo 1.0 ml en un tubo Eppendorf rotulado S2
Los Pellet 1(P1), Pellet 2 (P2), y el Sobrenadante 2 (SN2) deben ser guardados en el freezer a -20ºC
para su utilización en los Trabajos Prácticos Nº 3 y 8.
Nota: Es importante que el rótulo de los mismos sea legible, para su posterior identificación. En los
mismos debe figurar en número de equipo en el cual usted trabajó.
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Complete los cuadros en línea de puntos con las fracciones subcelulares y componentes de
cada una que se obtendrán en cada etapa.
¿Qué protocolo experimental utilizaría para obtener el compartimiento lisosomal puro?
14
Trabajo Práctico Nº 3
Compartimientos celulares II
Temario:
1) Compartimientos celulares y Transporte intracelular
-Orgánulos delimitados por membrana
-Distribución de las proteínas
-Transporte vesicular
-Vías secretoras
-Vías endocíticas
Bibliografía:
“Introducción a la Biología Celular” Bruce Alberts y col., 3da Edición, Editorial Médica
Panamericana, 2011, Capítulo 13 pág. 425-445 y Capítulo 14 pág. 453-465, y Capítulo 15.
Bibliografía de consulta:
“BIOLOGÍA CELULAR Y MOLECULAR”, Lodish y col., 5ª Edición, Editorial Médica Panamericana, 2005.
“Biología Molecular de la Célula”. Bruce Alberts y col., 3ra Edición, Ediciones Omega.
Objetivos:
Que el alumno comprenda la importancia de los compartimientos internos de la célula sobre la
base del estudio de la estructura y función de las diferentes organelas celulares.
Que los alumnos adquieran los conceptos de marcador bioquímico y criterio de pureza
Que los alumnos apliquen los conocimientos sobre los aspectos metodológicos en la realización
de un ensayo experimental.
Actividades a Desarrollar
Cada grupo de alumnos recibirá las muestras obtenidas en el trabajo práctico anterior,
conteniendo la Fracción Nuclear (P1) y la Fracción Mitocondrial (P2), aisladas según los
procedimientos discutidos en el TP 2.
Parte experimental
Fracción mitocondrial
Buffer fosfato 0.2 M, pH 7.2
Succinato de sodio al 5%
Glucosa al 5%
Azul de metileno 0.025%
Vaselina líquida
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Confeccione un cuadro indicando que reactivos agregaría a cada tubo de ensayo para realizar un
protocolo experimental que le permita caracterizar funcionalmente la presencia de mitocondrias en la
fracción estudiada.
Preparar una dilución de levadura de panadería Saccharomyces cerevisiae colocando dos puntas de espátula
en un tubo conteniendo 2 ml de agua corriente, agitar para homogeneizar y conservarlo a temperatura
ambiente (Tubo 1). Preparar un segundo tubo de forma similar, y calentarlo durante 2 minutos a 100ºC
(Tubo 2).
Se colocará sobre portaobjetos una gota de la suspensión de levaduras del Tubo 1 y del Tubo 2, se
agregará una gota de Azul de Metileno 6% y se colocará un cubreobjetos. Los preparados se observarán
con aumentos de 100X y 400x.
16
Nuclear sobre un portaobjetos, se le agregará una gota de Azul de Metileno 6% y se colocará un
cubreobjetos. El preparado se observará con aumentos de 100X y 400x.
¿Qué tipo de colorante es el Azul de Metileno? ¿Por qué colorea los núcleos?
¿Qué técnica citoquímica específica para ADN conoce?
D. RESOLUCIÓN DE PROBLEMAS
1) Indique los resultados que espera obtener en los siguientes ensayos destinados a caracterizar las distintas
fracciones subcelulares mencionadas en el cuadro, justificando en cada caso su respuesta.
Tubo 1 2 3 4 5
F. Mitocondrial X X X
F. Microsomal X
F. Citosólica X
Buffer fosfato pH 7.2 X X X X X
Succinato de sodio 5% X X X
Glucosa 5% X X
Azul de Metileno X X X X X
Vaselina X X X X X
Incubar a 37ºC 1 hora X X X X X
Resultados
2) Usted está tratando de aislar peroxisomas puros a partir de un homogenato de hígado de rata utilizando
la técnica de centrifugación diferencial en sacarosa isotónica. Después de finalizado este procedimiento
experimental Ud. piensa que obtuvo una fracción relativamente pura de peroxisomas. Indique cuál o
cuáles de las siguientes determinaciones utilizaría para verificar si la fracción obtenida contiene ésta
organela y descartar una posible contaminación con mitocondrias.
a) Determinar la actividad de la enzima catalasa
b) Determinar la actividad de la enzima succinato deshidrogenasa
c) Determinar la presencia de ácidos nucleicos
d) Determinar la presencia de fosfolípidos
e) Determinar la presencia de proteínas
En todos los casos justifique su respuesta.
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Anexo Bibliográfico
IX Jornadas Nacionales y IV Congreso Internacional de Enseñanza de la Biología 2014
Introducción
El aprendizaje de la Respiración Celular implica el estudio de Procesos Redox. Estas reacciones involucran la
transferencia de electrones desde los combustibles celulares hacia las coenzimas NAD + y FAD que son así
reducidas respectivamente a NADH y FADH2. A su vez, el NADH y FADH2 transfieren estos electrones a la
cadena respiratoria. En este último proceso, las coenzimas son nuevamente oxidadas y sus electrones son
aceptados finalmente por el O2 (Sadava et al., 2009). En general, este tema es enseñado a nivel teórico en cursos
universitarios introductorios de Biología, de Biología Celular o de Bioquímica. Usualmente, las reacciones
Redox, relacionadas con la respiración celular, se explican en las clases utilizando un nivel de representación
simbólico mediante fórmulas (Johnstone, 1991; Galagovsky et al., 2003). Sin embargo, estas explicaciones no
incluyen instancias de enseñanza basadas en un nivel de representación macroscópico que aporte una
demostración visual y empírica (Johnstone, 1991). Este hecho supone una importante dificultad, sobre todo para
los estudiantes novatos que, en general, carecen de la capacidad de movilidad entre los niveles de representación
mencionados. Consideramos, por tanto, que sería conveniente para el aprendizaje de estos tópicos, utilizar
abordajes didácticos que permitan observar macroscópicamente algunos aspectos de estos Procesos Redox que
ocurren en la respiración celular.
El colorante azul de metileno puede funcionar como aceptor de electrones artificial (agente oxidante),
reemplazando al NAD+ en la reacciones enzimáticas en sistemas vivientes (Gunawardena et al., 2008). Cuando
el azul de metileno sustituye al NAD+, se torna incoloro a medida que se reduce, mientras los compuestos
orgánicos involucrados en este metabolismo se van oxidando. El NADH o azul de metileno reducido pueden ser
oxidados nuevamente en presencia de oxígeno molecular, por el sistema de transporte de electrones de la
mitocondria, en la cadena respiratoria. Esta reacción causa que el colorante vuelva a adquirir su color azul propio
de su estado oxidado.
Para llevar a cabo experimentos que permitan trabajar con estos procesos biológicos de óxido-reducción,
planteamos como organismo modelo la levadura de panadería Saccharomyces cerevisiae, ya que es un
microorganismo simple, que puede adaptarse a condiciones aeróbicas o anaeróbicas, y a una amplia gama de
nutrientes. De acuerdo a la metodología descrita por Gunawardena (et al. 2008), la levadura puede utilizarse
como Sistema Redox; de tal forma que mediante su metabolismo energético, reduce y oxida de modo secuencial
al azul de metileno que funciona como un sustituto de las coenzimas de óxido reducción.
Tomando en cuenta estas consideraciones, el objetivo de este trabajo consistió en desarrollar experiencias de
laboratorio que permitan comprobar, desde el nivel de representación macroscópico, la actividad de las enzimas
de óxido, reducción involucrada en la respiración celular, analizando distintas variables en el Sistema Biológico
utilizado.
Desarrollo
Estas experiencias pueden llevarse a cabo con estudiantes de los primeros años de la Universidad que hayan
estudiado la respiración celular como proceso de óxido reducción.
Como Modelo Biológico, se utilizaron una cepa de levadura de panadería silvestre y una mutante, deficiente
respiratoria (rho0), que carece de citocromo C. Estos microorganismos son inocuos y de fácil manipulación, aún
por estudiantes inexpertos (Monti Hughes, 2007). Las células de todos los ensayos se cultivaron en medio
sintético con glucosa al 0.1%. Cuando llegaron a su fase exponencial de crecimiento (DO=1), se tomaron
alícuotas de 800 μl que se transfirieron a cubetas de fotocolorímetro. A cada una de estas alícuotas se le
agregaron 15 μl de azul de metileno al 0.1% y respectivamente 0 μl, 25 μl, 50 μl ó 100 μl de salicilato de sodio al
2.5% (desacoplante de la cadena respiratoria), completando el volumen final a 1000 μl. En una cubeta adicional,
se colocaron 985 μl DE agua destilada y 15 μl de azul de metileno al 0.1% como control. En otra serie de
experimentos, se reemplazó la glucosa 0.1% por glicerol 3.0%. Todas las cubetas se incubaron a 30ºC a distintos
18
tiempos. Los diferentes niveles de oxidación o reducción del azul de metileno fueron cuantificados con un
fotocolorímetro.
Los ensayos propuestos suministraron evidencias macroscópicas de los siguientes conceptos:
a) La cadena respiratoria constituye un Sistema Redox; oxida al azul de metileno que fue previamente
reducido por los Procesos Redox en los que se oxidaron las moléculas combustibles.
b) La cadena respiratoria no transfiere los electrones al O2 si carece de alguno de sus componentes. Al
utilizar la cepa mutante deficiente respiratoria rho 0, el azul de metileno no se oxida del mismo modo que
lo hace en la cepa silvestre.
c) Los desacoplantes, como el ácido acetil salicílico, no inhiben la cadena respiratoria, pero al desacoplar
a la fosforilación oxidativa, aumentan la tasa de funcionamiento de la cadena, lo que se evidencia en el
incremento de la oxidación del azul de metileno.
d) La utilización de distintos combustibles celulares como la glucosa y el glicerol permite comprobar que
la levadura silvestre puede obtener electrones para la cadena respiratoria oxidando no sólo glucosa, sino
otras moléculas como el glicerol, ya que con este sustrato también produce la oxidación del azul de
metileno en la cadena respiratoria. En cambio, la mutante deficiente respiratoria sólo oxida la glucosa.
e) La inhibición de deshidrogenasas del metabolismo respiratorio, que produce el vanadato de sodio,
impide la oxidación del colorante en la cadena respiratoria.
Conclusiones
Las experiencias diseñadas permiten la enseñanza mediante evidencias macroscópicas de los Procesos
Redox que ocurren en los sistemas vivientes a nivel submicroscópico. Asimismo, estos experimentos
dejan visualizar, con el cambio de color del azul de metileno, las respuestas de los diferentes sistemas
biológicos (cepa silvestre / cepa deficiente respiratoria) a las distintas variables que modifiquen el
funcionamiento de la cadena respiratoria. Por consiguiente, esta propuesta didáctica resulta motivadora y
facilitadora del aprendizaje de un tema que, generalmente, presenta dificultades para su comprensión.
Bibliografía
GALAGOVSKY, L.R.; RODRIGUEZ, M.; STAMATI, N.; MORALES, L.F. 2003. Enseñanza de las
Ciencias
21(1): 107-121.
GUNAWARDENA, A.; FERNANDO, S.; TO, F. 2008. Int. J. Mol. Sci. 9: 1893-1907.
JOHNSTONE, A. H. 1991. Journal of Computer Assisted Learning 7, 75-83.
MONTI HUGHES, A; ALONSO, M.; GAROFALO, J; BURGOS, H. I.; STELLA, C.A. 2007 Biochemistry
and
Molecular Biology Education 35(5): 359:363.
SADAVA, D, SELLER, H.C., ORIANS, G.H., PURVES, W.H., HILLS D. M. 2009. Vida, Buenos Aires:
Médica Panamericana.
19
Trabajo Práctico Nº 4
Biomoléculas I
Temario:
-Estructura y función de proteínas
-Métodos de estudio de proteínas
Bibliografía:
“Introducción a la Biología Celular” Bruce Alberts y col., 3da Edición, Editorial Médica
Panamericana, 2011. Capítulo 4, y Capitulo 15 pág. 520-521.
“BIOLOGÍA CELULAR Y MOLECULAR”, Lodish y col., 5ª Edición, Editorial Médica
Panamericana, 2005. Capítulo 3 pág. 86 – 97.
Bibliografía de consulta:
“BIOLOGÍA CELULAR Y MOLECULAR”, Lodish y col., 5ª Edición, Editorial Médica Panamericana,
2005.
“Biología Molecular de la Célula”. Bruce Alberts y col., 3ra Edición, Ediciones Omega.
Objetivos:
Que el alumno comprenda la importancia de las proteínas sobre la base del estudio de
su estructura y función en las diferentes organelas celulares.
Que los alumnos conozcan los métodos básicos para la purificación, detección y
caracterización de las proteínas y adquiera la capacidad de seleccionar las metodologías
adecuadas según los problemas a resolver.
Que los alumnos apliquen los conocimientos sobre los aspectos metodológicos en la
realización de un ensayo experimental.
Actividades a Desarrollar
B) Resolución de problemas
20
1) En el TP Nº 3 se ensayó la actividad enzimática de la succinato deshidrogenada (SDH) como
marcador bioquímico para determinar la presencia de mitocondrias en el Pellet 2 obtenido por
fraccionamiento celular a partir de un homogenato de células de hígado de rata.
¿Qué método alternativo puede utilizarse para investigar el mismo marcador bioquímico en el
Pellet 2?
¿Cómo procedería experimentalmente para realizar el ensayo?
Punto de siembra
1 2 3 4 5 6 7 8
21
b) Usando los criterios mencionados en el problema, decida si los resultados obtenidos en
presencia de microsomas indican que la proteína se transloca a través de las membranas
microsomales. Explique la migración de las proteínas en el gel en este caso (presencia de
microsomas)
c) ¿Se trata de una proteína transmembrana o de una proteína luminal?
3) Una proteína marcada radiactivamente contiene una secuencia señal específica para ser
transportada al interior de un orgánulo X. Para determinar si la proteína marcada se ha
translocado al interior del orgánulo X se realizaron los siguientes experimentos:
a) se incubaron células con aminoácidos marcados radiactivamente, y luego se realizó un
fraccionamiento celular observándose que la proteína marcada cofraccionó con el orgánulo X.
b) Utilizando el compartimiento celular en estudio, se realizó una corrida electroforética de
proteínas (SDS-PAGE) y posterior Western Blot de la proteína marcada después de incubar la
proteína marcada con la organela X (i), y en ausencia de la organela X (ii), obteniéndose el
siguiente resultado:
Mencione las posibles organelas que pudieron haber dado estos resultados, justificando su
respuesta. En base a su respuesta, indique:
a) El lugar de síntesis de la proteína marcada
b) Si la translocación de la proteína hacia el orgánulo X es postraduccional, o cotraduccional.
Mencione las organelas que NO pudieran haber dado estos resultados, justificando su
respuesta. En base a su respuesta:
a) Indique el lugar de síntesis de la proteína marcada
b) Esquematice el resultado del Western Blot que hubiera dado la proteína marcada después
de incubar la proteína marcada con la organela (i), y en ausencia de la organela X (ii)
22
Trabajo Práctico N° 5
Biomoléculas II
Temario:
1) Estructura y función de los ácidos nucleicos
-Estructura de los ácidos nucleicos
-Duplicación de ADN
-Organización del ADN celular en cromosomas
-Del ADN a las proteínas: como leen el genoma las células
-Transcripción
-Traducción
2) El Dogma central de la biología
3) El genoma humano
4) Métodos de estudio de los ácidos nucleicos
-Electroforesis en gel de agarosa
-Hibridización de ácidos nucleicos: Southern blot y Northen blot
-Hibridización in situ de ácidos nucleicos
-Micromatrices de ADN
Bibliografía:
“Introducción a la Biología Celular” Bruce Alberts y col., 3da Edición, Editorial Médica
Panamericana, 2011. Capítulo 5, Capítulo 6 pág. 197-211, pág. 223-226, Capítulo 7, y
Capítulo 9 pág. 315-323 y Capítulo 10 pág. 327-333, 350-353.
“BIOLOGÍA CELULAR Y MOLECULAR”, Lodish y col., 5ª Edición, Editorial Médica
Panamericana, 2005. Capítulo 10 Sección 10.4, pág. 424 – 430.
Anexo Bibliográfico
El Código Genético:
Cuadro 4-1 y Cuadro 10-3 extraídos de BIOLOGÍA CELULAR Y MOLECULAR”, Lodish y col., 5ª
Edición, Editorial Médica Panamericana, 2005, pág. 120 y 441, respectivamente.
“El Dogma central de la biología”. Extraído de Educar – El portal educativo del estado
argentino.
Adjuntos al presente capítulos de la Guía de Trabajos Prácticos
Bibliografía de consulta:
“BIOLOGÍA CELULAR Y MOLECULAR”, Lodish y col., 5ª Edición, Editorial Médica Panamericana,
2005.
“Biología Molecular de la Célula”. Bruce Alberts y col., 5ra Edición, Ediciones Omega.
Objetivos:
Que los alumnos conozcan los mecanismos genéticos básicos involucrados en el flujo de
información genética en organismos procariontes y eucariontes. El dogma central de la
biología.
Que los alumnos comprendan la importancia de adquirir un conocimiento sólido sobre
los ácidos nucleicos, el código genético y la síntesis de macromoléculas para su
formación profesional
Que los alumnos conozcan las metodologías utilizadas para el estudio de los ácidos
nucleicos.
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Actividades a Desarrollar
A) ESTRUCTURA DE LOS ÁCIDOS NUCLEICOS
Sobre la base de los conceptos estudiados en el Cap. 5, responda:
¿Qué diferencias entre las estructuras de las moléculas de ADN y ARN
permite explicar la gran estabilidad del ADN?
¿Cuál es la implicancia en la función biológica del ADN?
D) RESOLUCIÓN DE PROBLEMAS
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DNA de células: A B C
DNAasa I 1.5 ug/ml - + - + - +
5 kb
kb
Sobre la base de los resultados obtenidos, indique en cuál de los 3 tipos celulares, el gen en estudio
se encuentra activo. Justifique su respuesta. ¿Qué relación existe entre el grado de acetilación de
las histonas y la resistencia relativa del DNA de la cromatina frente a la digestión por nucleasas?
I- 5´-GTGCTCTTGCAAGACA
II- 5´-AGTATTGTTGCAGGATT
III- 5´-AGTTCTTTTACAGGAC
Utilizando el código genético del Cuadro 4-1 (Anexo Bibliográfico) determine cuál/es de éstas
secuencias puede, potencialmente codificar la siguiente secuencia peptídica: NH2 - Val-Leu-Leu-
Gln-Asp- COOH
a) Indique claramente la secuencia de nucleótidos de los ARNm, y sus extremos 3´y 5´
b) ¿Qué ocurre cuando la maquinaria transcripcional eucariota se encuentra con TAG en la
secuencia codificante?
c) Una secuencia compuesta solamente de residuos C y U en forma alterna (CUCUCUC),
¿Qué tipo de polipéptido codificará? Indique la secuencia de aminoácidos.
6) Los códigos genéticos mitocondriales difieren del código genético nuclear estándar (Anexo
Bibliográfico: Cuadro 4-1 y 10-3 del Anexo Bibliográfico). Por lo tanto, la secuencia de
nucleótidos 5´-AUG AGC CUC AGG UAA – 3´ será traducida en el núcleo y en las mitocondrias
de las células de mamífero como:
a) Met-Ser-Leu-Arg en ambos casos
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b) Met-Ser-Leu en ambos casos
c) Met-Ser-Leu en el núcleo y Met-Ser-Leu-Arg en la mitocondria
d) Met-Ser-Leu en la mitocondria y Met-Ser-Leu-Arg en el núcleo
Indique la opción correcta justificando su respuesta.
7) ¿Por qué le parece que el código genético es idéntico en todas las células sobre la tierra?
8) Las células plasmáticas son las encargadas de sintetizar los anticuerpos responsables de la
respuesta inmune humoral. En un laboratorio se realizaron ensayos para averiguar si el gen que
codifica la inmunoglobulina E (IgE) se hallaba activado o inactivado en las células plasmáticas de
tres personas (A, B y C) que se sospecha que padecen una inmunodeficiencia. Después de extraer
el RNA total de las células en estudio, se sometieron a una electroforesis y posterior Northern blot,
obteniendo el siguiente resultado:
Extractos sembrados: A B C
ARNm de IgE
9) Indique cómo será la secuencia del transcripto primario correspondiente a la siguiente secuencia
que se encuentran en el genoma de un mamífero:
Secuencia no codificante (cadena molde): 5’-GAATGGTAACAACTGTTA-
a) Indique claramente los extremos 3´y 5´ del transcripto primario.
b) Mencione las modificaciones que sufre el transcripto primario para convertirse en un ARN
mensajero maduro (ARNm), y el compartimiento celular donde ocurre cada una de ellas
c) Escriba la secuencia de aminoácidos que codifica el transcripto primario indicando claramente el
extremo amino y carboxilo terminal.
10) Mencione diez proteínas de localización nuclear y diez proteínas de localización citosólica.
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Anexo bibliográfico:
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28
Anexo bibliográfico:
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Anexo bibliográfico:
Watson y Crick sospecharon que una vez elucidada la estructura del ADN, sería más fácil entender
su función. Razonaron, entonces, que si el ADN era la molécula que transmitía la información
genética a las células hijas, esta debía funcionar como un código. Para mitad de los años 1950 se
sabía que la secuencia de nucleótidos en el ADN daba origen a una secuencia de polipéptidos. Es
decir, la molécula de ADN debía dirigir la síntesis de proteínas.
ADN → Proteínas
Pero si esto era cierto, faltaba dilucidar una pieza del rompecabezas ya que se sabía que las
proteínas se sintetizaban fuera del núcleo. ¿Cómo podía el ADN, que estaba dentro del núcleo,
dirigir la síntesis de proteínas fuera del mismo? A Crick se le ocurrió la idea de que debía existir
un intermediario.
ADN → ¿? → Proteínas
Un posible candidato para intermediario era el ARN, que se encuentra en el citoplasma. El ARN
tenía varias características que lo hacían un firme candidato:
a. un esqueleto de azúcares y fosfatos (a pesar de que tiene un azúcar distinto, ya que el ARN
tiene ribosa en vez de desoxirribosa),
b. tanto el ADN como el ARN usan las mismas bases nitrogenadas, pero el ARN tiene uracilo
en vez de timina,
c. el uracilo se puede unir a la adenina como lo hace la timina,
d. el ARN es una cadena simple.
Crick sintetizó esta idea en lo que él llamó el dogma central de la biología, que especifica que el
ADN se traduce ARN y este, a su vez, dirige la producción de proteínas.
Según este postulado, la información fluye de manera unidireccional: no puede moverse de las
proteínas al ADN. Es decir, una vez que la información llega a las proteínas, estas no pueden ser
cambiadas o, lo que es lo mismo, las proteínas no pueden influir los genes. Si bien Crick usó el
término “dogma” en un sentido figurado y quizá con humor, ya que las ideas científicas sólo son
aceptadas hasta que aparezca evidencia experimental que las desmienta, durante algún tiempo esta
idea adquirió cierta dimensión de verdad absoluta en la mayoría de los libros de texto.
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Trabajo Práctico N° 6
Biomembranas I
Temario:
- La bicapa lipídica
- Proteínas de membrana
Bibliografía:
“BIOLOGÍA CELULAR Y MOLECULAR”, Lodish y col., 5ª Edición, Editorial Médica
Panamericana, 2005. Capítulo 5 pág. 147 – 165.
“Introducción a la Biología Celular” Bruce Alberts y col., 3da Edición, Editorial Médica
Panamericana, 2011. Capítulo 11 (opcional).
Bibliografía de consulta:
“Biología Molecular de la Célula”. Bruce Alberts y col., 3ra Edición, Ediciones Omega.
Objetivos:
Que el alumno comprenda los aspectos fundamentales de la estructura y función de las
membranas biológicas.
Actividades a Desarrollar
A- Determinación del perfil proteico de membranas nucleares y mitocondriales
Para estudiar el perfil proteico de las membranas celulares se puede utilizar la electroforesis en gel
de poliacrilamida en condiciones desnaturalizantes (SDS-PAGE). Los fundamentos de dicha
metodología ya fueron discutidos en clases anteriores.
Protocolo experimental.
Preparación de las muestras: colocar en tubos Eppendorf tres partes de cada una de las muestras
(F. Nuclear y F. Mitocondrial, 20 µl) y una parte de buffer muestra Laemmli (7.5 µl) (Tris-HCl
65.5 mM pH 6.8, SDS 2%, 2-mercaptoetanol 5%, glicerol 10% y Azul de Bromofenol, solución
4X). Calentar los tubos a ebullición durante 5 minutos.
Separación de las proteínas de membrana: Se sembrarán cuidadosamente las muestras
preparadas según el punto anterior en el pocillo de siembra del gel de poliacrilamida en
condiciones desnaturalizantes con dodecilsulfato de sodio (SDS-PAGE) al 12.5%. De la misma
manera se sembrará una muestra de 7 µl de estándares de peso molecular. Finalizada la siembra de
las muestras, se conectará la cuba de electroforesis, conteniendo el gel y el buffer de corrida, a una
fuente de poder, a 30 mA. La corrida se desarrollará durante una hora aproximadamente. Después
de desconectar la fuente de poder, se retira el gel para su revelado.
Revelado del gel: Finalizada la corrida electroforética, el gel se colocará en la solución colorante
de Coomassie Brillant Blue durante 24 hs. Después de este tiempo se procederá a la decoloración
del gel con lavados sucesivos en una solución de metanol/ácido acético glacial/agua (45/7/48, v/v)
hasta que las bandas de proteínas se visualicen perfectamente. Los resultados del revelado serán
discutidos durante el próximo trabajo práctico.
Fundamento de la TLC: es una técnica analítica separativa que se utiliza para la resolución
de muestras complejas de sustancias químicamente semejantes. Los componentes de dichas
muestras se separan de acuerdo con su distribución selectiva entre dos fases:
Fase estacionaria: en éste caso silicagel (SiO2), material absorbente inerte.
Fase móvil: es el solvente de corrida o eluyente que se desplaza a través de la fase
estacionaria. En éste caso es una mezcla de solventes orgánicos: cloroformo/metanol/ácido
acético/agua (40:10:10:1 v/v).
C- Resolución de problemas
1- Usted está estudiando la capacidad de unión de ciertas proteínas ubicadas sobre la cara
citoplasmática de la membrana de células cultivadas “in vitro”. Para eso utiliza un método que le
permite obtener vesículas con el lado interno vuelto hacia el exterior (vesículas invertidas). Sin
embargo, a pesar del cuidado que pone en el procesamiento, sus vesículas invertidas siempre están
contaminadas con vesículas del derecho (lado externo hacia afuera). Un amigo suyo le sugiere que
pase las vesículas por una columna de afinidad rellena con esferas a las que se le adosó una lectina
(como la concavalina A), la cual tiene gran afinidad por los hidratos de carbono. ¿Cuál es el
fundamento de la propuesta de su amigo?
2- Un explorador regresa de un viaje por la selva amazónica durante el cual fue mordido por una
víbora desconocida para él. Por ese motivo presentó un episodio de anemia hemolítica aguda que
casi le cuesta la vida. La víbora pudo ser atrapada por sus colaboradores y como estaba muy
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interesado en conocer las razones de la intensa actividad hemolítica del veneno, envió una muestra
del mismo a un laboratorio especializado en el estudio de venenos. Al hacer el análisis se encuentra
que el veneno contiene una proteasa (enzima que rompe las uniones peptídicas), una neuraminidasa
(enzima que degrada glicolípidos) y una fosfolipasa (enzima que degrada fosfolípidos).
El tratamiento de los glóbulos rojos (GR) aislados con cada una de estas enzimas dio los siguientes
resultados:
3- Usted desea determinar la distribución de los fosfolípidos de la membrana plasmática de los GR.
Los fosfolípidos constituyen hasta el 60% de los lípidos de la bicapa de los GR, el colesterol el
23% y los glicolípidos el 3% (los restantes son menos importantes). Los fosfolípidos comprenden a
su vez, fosfatidilcolina (17%), fosfatidiletanolamina (18%), esfingomielina (18%), fosfatidilserina
(7%) y el resto del porcentual está repartido entre varios fosfolípidos. Para medir la distribución de
los fosfolípidos individuales, Ud. hace reaccionar GR intactos y “fantasmas” (F) de GR con:
- dos fosfolipasas diferentes
- un reactivo fluorescente que no atraviesa la membrana (denominado SITS), que marca
específicamente los grupos amino primarios.
El tratamiento con esfingomielinasa degrada hasta un 85% de la esfingomielina presente en los GR
(sin lisarlos) y un poco más en los “fantasmas” de GR. Las fosfolipasas de los venenos de víbora
cuando actúan sobre GR intactos (sin lisarlos) solamente liberan los productos de degradación de la
fosfatidilcolina, también degradan fosfatidilserina y fosfatidiletanolamina. El SITS marca casi
completamente la fosfatidiletanolamina y la fosfatidilserina en fantasmas de GR, pero en GR
intactos reacciona con menos del 1%. Estos resultados se resumen en la siguiente tabla:
Sensibilidad de los fosfolípidos de los GR humanos y de F de GR a las fosfolipasas y a una
sustancia marcadora no permeable:
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Trabajo Práctico Nº: 7
Seminario de Integración de los temas vistos desde TP Nº 1 al TP Nº 5
1) Proponga una secuencia codificante (cadena no molde) de genes nucleares de mamífero que
codifiquen la siguiente secuencia peptídica:
NH2-Trp - Asp - Phe - Trp - Cys - COOH
a. Indique claramente la secuencia de nucleótidos del ARNm, y sus extremos 3´y 5´
b. Indique claramente sobre las secuencias propuestas cuál corresponde a la secuencia
codificante y cuál a la secuencia no codificante.
c. ¿Qué ocurre cuando la maquinaria transcripcional eucariota se encuentra con TAG en la
secuencia codificante?
d. Mencione una técnica mediante la cual podría detectar la presencia de la secuencias
propuesta en células presentes en un corte de tejido.
2) Para averiguar si una proteína (PM 96 kDa) ingresa o no al núcleo celular, en un laboratorio se
realiza lo siguiente: el ARNm se traduce a proteínas usando un sistema libre de células al que se le
incorporó todo lo necesario para que ello ocurra, en ausencia y presencia de núcleos puros, y
preparando las muestras de 4 maneras diferentes: sin tratamiento, con el agregado de proteasa, con
el agregado de detergente, y con el agregado de proteasa + detergente.
Luego a cada una de las muestras obtenidas se le realizó un Western blot, obteniéndose el siguiente
resultado:
PM 96 KDa
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5) Suponiendo que Ud. Dispone de los siguientes microscopios: MO de campo claro, MO de
campo oscuro, M de contraste de fase, M de Fluorescencia, M Confocal, ME de transmisión, y ME
de barrido.
Mencione qué microscopio utilizaría para visualizar los siguientes preparados:
a- células vivas sin colorear
b- una suspensión de bacterias
c- la ultraestructura de una célula muscular
d- tubulina marcada con un anticuerpo fluorescente en una célula en mitosis
e- un corte de histológico de páncreas coloreado con hematoxilina – eosina
f- las características superficiales de la membrana de un glóbulo blanco
g- la forma de un glóbulo rojo en suspensión
6) Se puede observar el brote de las vesículas recubiertas con clatrina desde fragmentos de
membrana plasmática de células eucariontes cuando se agregan adaptina, clatrina y dinamina-GTP
a la preparación. ¿Qué observaría si omitiera:
a- adaptina
b- clatrina
c- dinamina
¿Qué observaría si los fragmentos de la membrana plasmática fueran de una célula procarionte?
7) Indique los resultados que espera obtener en los siguientes ensayos destinados a caracterizar las
distintas fracciones subcelulares mencionadas en el cuadro, justificando en cada caso su respuesta.
Tubo 1 2 3 4 5
F. Mitocondrial X X
F. Microsomal X X
F. Citosólica X
Buffer fosfato pH 7.2 X X X X X
Succinato de sodio 5% X X X
Glucosa 5% X X
Azul de Metileno X X X X X
Vaselina X X X X X
Incubar a 37ºC 1 hora X X X X X
Resultados
8) Una proteína marcada radioactivamente contiene una secuencia señal específica para ser
transportada al interior de un orgánulo X. Para determinar si la proteína marcada se ha translocado
al orgánulo X se realizaron los siguientes experimentos: a) se incubaron células con aminoácidos
marcados radioactivamente y luego se realizó un fraccionamiento celular observándose que la
proteína cofraccionó con el orgánulo X. b) utilizando el compartimiento celular en estudio, se
realizó un Western blot de la proteína marcada después de incubarla con el orgánulo X (i) , y sin
incubación previa (ii), obteniéndose el siguiente resultado:
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i ii
Siembra
Mencione:
a- las posibles organelas que podrían haber dado estos resultados, justificando su respuesta.
En base a su respuesta en a), indique:
b- el lugar de síntesis de la proteína marcada
c- si la translocación de la proteína hacia el orgánulo X es postraduccional o cotraduccional.
9) En un laboratorio de química medicinal se diseñó una nueva droga, y se sospecha que como
efecto colateral provoca la inactivación del gen kas, que en condiciones fisiológicas se halla
activado. El biólogo celular a cargo de corroborar o descartar dicha sospecha decide incubar
fibroblastos de un cultivo celular en ausencia (control) y en presencia de la droga. Luego de una
serie de ensayos concluye que efectivamente la droga provoca la inactivación del gen kas.
a) ¿Cómo será el grado de acetilación de las histonas asociadas al ADN del gen kas en las células
tratadas y no tratadas (control) con la droga?
b) Explique a nivel molecular la relación que existe entre el grado de acetilación de las histonas y
la posibilidad del gen de ser transcripto.
c) ¿Cómo será la resistencia relativa de la cromatina en ambas situaciones (control y tratadas con
la droga) frente a la digestión por DNAasa? Justifique su respuesta.
d) Mencione las posibles técnicas utilizadas por el biólogo celular para determinar la actividad del
gen kas, esquematizando los resultados obtenidos en ambas situaciones (control y tratadas con
la droga).
10) El viernes próximo pasado fue encontrado el cuerpo de un individuo de sexo masculino, cuya
esposa se declaró culpable de haberlo envenenado con una sustancia X. El Dr Pinto, especialista en
medicina forense perteneciente a esa dependencia, sospecha que la muerte fue consecuencia de un
infarto de miocardio posterior a in infarto renal. Según nuestro experto, la sustancia X es un veneno
que actúa induciendo la síntesis de la proteína VEN que se acumula específicamente en la matriz de
las mitocondrias renales alterando su función.
En su carácter de Perito Experto en Biología Celular Molecular, el Juez le solicita:
a) Que certifique la alteración en la morfología de la estructura renal y de las mitocondrias de
las células renales.
b) Que certifique la sobreexpresión de la proteína VEN en el tejido renal
c) Que certifique que la sustancia X es la que induce la sobreexpresión de VEN y el
mecanismo por el cuál ingresa a la matriz mitocondrial
d) Que adjunte a su informe la metodología utilizada en sus estudios detallando los pasos de
la misma.
Sus resultados serán utilizados como elemento probatorio por la Fiscalía dependiente de esta
Juzgado. Como material de estudio se le envía una muestra extraída por necropsia del cuerpo del
individuo en cuestión.
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Trabajo Práctico N° 8
Biomembranas II
Temario:
- Transporte a través de la membrana
Bibliografía:
“BIOLOGÍA CELULAR Y MOLECULAR”, Lodish y col., 5ª Edición, Editorial Médica
Panamericana, 2005. Capítulo 5 pág. 147 – 165, y Capítulo 7 pág. 271-273 (Acuaporinas).
“Introducción a la Biología Celular” Bruce Alberts y col., 3da Edición, Editorial Médica
Panamericana, 2011. Capítulo 12 pág. 387 – 400.
Bibliografía de consulta:
“BIOLOGÍA CELULAR Y MOLECULAR”, Lodish y col., 5ª Edición, Editorial Médica Panamericana,
2005.
“Biología Molecular de la Célula”. Bruce Alberts y col., 3ra Edición, Ediciones Omega.
Objetivos:
Que el alumno comprenda los aspectos fundamentales de la estructura y función de las
membranas biológicas.
Actividades a Desarrollar
A) Permeabilidad de la membrana plasmática del glóbulo rojo
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Tubo 1 Tubo 2 Tubo 3
Solución isotónica de NaCl (Solución fisiológica) 2 ml - 2 ml
H2O destilada - 2 ml -
Solución isotónica conteniendo 0.1% Tritón X-100 - - 3 gotas
Sangre 1 gota 1 gota 1 gota
Homogeneizar suavemente y observar que ocurre en cada tubo
Resultados
B) Resolución de problemas
4- La mayoría de las células eucariontes tienen en su membrana plasmática uno o varios tipos de
sistemas de transporte de intercambio impulsados por Na+ que regulan el pH intracelular
manteniéndolo alrededor de 7.2. Uno de estos sistemas es el intercambiador Na+ - H+, que acopla la
entrada de Na+ a la salida de H+.
a) ¿Qué tipo de transportador es el intercambiador Na+ - H+?
b) ¿Qué características moleculares posee el intercambiador Na+ - H+ para poder insertarse en la
membrana plasmática y ejercer su función?
c) ¿Qué tipo de transporte es (activo o pasivo)? Justifique su respuesta.
Teniendo en cuenta que para eliminar H+, ingresa necesariamente Na+, indique:
d) ¿Cuál es el mecanismo que utiliza la célula para mantener la concentración de sodio dentro de la
concentración fisiológica?
e) ¿Qué ocurriría con el transporte de H+ hacia el exterior si en el medio extracelular se encontrara
presente ouabaína?
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+2
5- La concentración intracelular de Ca es menor que la del medio extracelular, y su aumento
intracelular induce contracción en las células musculares. Las células musculares cardíacas poseen
un antiportador que intercambia Ca+2 por Na+, lo que permite que la célula muscular se relaje. La
ouabaína interrumpe la acción de la bomba de Na+-K+ y se lo puede utilizar como fármaco para el
tratamiento de los pacientes con cardiopatías para aumentar la fuerza de contracción del músculo
cardíaco, es decir, para lograr que el músculo cardíaco permanezca más tiempo contraído.
a) Explique la relación que existe entre el antiportador Ca+2 - Na+, y la bomba Na+-K+ que hace que
se justifique el uso de ouabaína para el tratamiento de cardiopatías.
b) ¿Cuál sería la consecuencia de una sobredosificación de este fármaco?
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Trabajo Práctico N° 9
Ciclo celular
Temario:
-Control del ciclo celular eucarionte
Bibliografía:
“BIOLOGÍA CELULAR Y MOLECULAR”, Lodish y col., 5ª Edición, Editorial Médica Panamericana,
2005. Capítulo 21 Sección 21.1 y 21.2 (pág. 853-864), Sección 21.4 (pág. 868-874), Sección
21.6 y 21.7 (pág. 881-890).
Bibliografía de consulta:
“BIOLOGÍA CELULAR Y MOLECULAR”, Lodish y col., 5ª Edición, Editorial Médica Panamericana, 2005.
“Biología Molecular de la Célula”. Bruce Alberts y col., 3ra Edición, Ediciones Omega.
Objetivos:
Que el alumno conozca las generalidades del ciclo celular eucarionte.
Que el alumno comprenda los puntos de control del ciclo celular.
Que el alumno comprenda la importancia de la biología celular para la comprensión de los
eventos moleculares involucrados en enfermedades proliferativas
Introducción:
La dinámica de una célula se comprende mejor si se examina el curso de su vida. La mayoría de las
células eucarióticas progresan a través de una secuencia de fases denominada: ciclo celular. El avance a
lo largo de este ciclo es controlado por puntos de control estratégicos que comprueban el estado de la
célula.
Los controladores maestros que participan en dos acontecimientos decisivos en el ciclo celular, como la
replicación del ADN y la mitosis, son unas pocas proteínas kinasas que contienen una subunidad
catalítica y una subunidad reguladora.
Actividades a Desarrollar
A-Determinación de la fase S del ciclo celular en la que se encuentra una célula mediante una
técnica inmunohistoquímica.
El PCNA (Proliferating Cell Nuclear Antigen: antígeno nuclear de la célula proliferante) es una proteína
auxiliar de la ADN polimerasa δ (se une a la ADN polimerasa δ durante la duplicación del ADN), y
solamente ingresa al núcleo durante la etapa S del ciclo celular.
El preparado que usted observará durante el TP fue realizado mediante una técnica inmunohistoquímica
aplicada sobre un corte de riñón de rata de pocos días de edad, utilizando un anticuerpo primario dirigido
contra PCNA. El anticuerpo primario reconoce y se une a ésta molécula, y ésta interacción se pone en
evidencia por medio de una reacción enzimática acoplada a un anticuerpo secundario. Además, se utilizó
hematoxilina como contracolor, para facilitar la observación del preparado histológico.
Solo las células que se hallen en la etapa S del ciclo celular expresan PCNA en el núcleo, y por lo tanto,
mostraran una marca color marrón en el núcleo poniendo en evidencia la presencia de dicha proteína.
Las células que no se hallen en la etapa S del ciclo celular, exhibirán una coloración violeta en sus
núcleos, debido a la hematoxilina utilizada como contracolor.
Procedimiento: observe los preparados solamente en la zona de la corteza renal a 100X y 400X, y
responda las siguientes preguntas.
¿Todas las células del preparado están en la etapa S del ciclo celular?
¿Cómo procedería para averiguar en qué etapa del ciclo celular se encuentran las células que
no están en la etapa S?
¿Qué otra forma conoce para detectar células en la etapa S?
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B-Regulación del ciclo celular en células eucariontes
a) Se proyectará una animación que muestra los mecanismos moleculares que regulan la progresión
de las distintas etapas que conforman el ciclo celular en células eucariontes.
b) Se realizará un esquema de cómo se induce el pasaje de una célula de G0 a G1 del ciclo celular.
C-Resolución de problemas
Indique en qué fase/s del ciclo celular (G1 – S- G2 – M) se llevan a cabo los procesos indicados en el
esquema como 1 (Duplicación), 2 (Transcripción), y 3 (Traducción).
2) La siguiente figura representa la curva de actividad del MPF (factor promotor de la maduración)
aislado de células embrionarias de rana.
Actividad
del MPF
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b) Las ciclinas se unen a Cdk inhibiendo su actividad de proteincinasa. Cuando las
condiciones del entorno celular son favorables, las ciclinas se degradan rápidamente liberando Cdk
activa permitiendo a la célula continuar con el ciclo celular.
c) Cada ciclo de división celular requiere la síntesis de novo de ciclina.
d) Cuando el ADN no se ha duplicado completamente, la célula se detiene en el punto de
control G1.
5) Durante la división celular existe la posibilidad de que se generen alteraciones a nivel del
número de cromosomas, ya sea células con menor número de cromosomas (por ejemplo
monosomías) o células con mayor número de cromosomas (por ejemplo trisomías). Explique a
nivel molecular el control que ejercen las células para evitar la formación de éste tipo de anomalías.
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Trabajo Práctico N° 10
División celular - Apoptosis
Temario:
-Mecanismos moleculares de la división celular
-Mitosis y meiosis
Bibliografía
“Introducción a la Biología Celular” Bruce Alberts y col., 3da Edición, Editorial Médica
Panamericana, 2011. Capítulo 18 pág. 625-647, y Capítulo 19 pág. 651 – 663.
Bibliografía de consulta:
“BIOLOGÍA CELULAR Y MOLECULAR”, Lodish y col., 5ª Edición, Editorial Médica Panamericana, 2005.
“Biología Molecular de la Célula”. Bruce Alberts y col., 3ra Edición, Ediciones Omega.
Objetivos:
Que el alumno conozca los mecanismos moleculares que regulan los fenómenos mitóticos y
meióticos.
Que el alumno comprenda la diferencia entre la muerte celular programada y la muerte celular
por necrosis
Introducción:
El crecimiento y la división celular son decisiones muy bien reguladas por el organismo. Esta regulación
asegura que un individuo adulto reemplace las células desgastadas o produzca más células en respuesta a
una nueva necesidad. La muerte celular programada (apoptosis) también desempeña una importante
función en el control de la población celular, al establecer un equilibrio entre la multiplicación y la
muerte de las células. La pérdida de control lleva en última instancia al cáncer.
La meiosis involucra un ciclo de replicación de los cromosomas seguido por dos ciclos de división
celular para producir exclusivamente células germinales haploides a partir de una célula diploide.
Actividades a desarrollar
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A B
3) Resolución de problemas
1) Complete el siguiente cuadro indicando la cantidad de ADN (en pg), el número de cromosomas, y el
número de cromátides por cromosoma de una célula 2n=6 (diploide) que contiene 100 pg. de ADN en el
estadio G1.
2) Los siguientes esquemas representan células que están desarrollando alguna forma de división
celular. La célula que les dio origen era 2n=4. Indicar, para cada figura, que etapa se está llevando a
cabo en la célula, ya sea que se trate de mitosis, meiosis I o meiosis II.
3) Si observamos una imagen de una célula en anafase, ¿podemos decir si se trata de anafase
mitótico o meiótica? Justifique su respuesta mediante la realización de esquemas.
4) Dibuje esquemáticamente una célula diploide (2n=6) en metafase mitótica. Indique la posición
que ocupan los cromosomas en el huso mitótico, señale los principales componentes de dichos
cromosomas y diferéncielos por su origen (materno o paterno) ¿Qué características presentan los
cromosomas en cuanto a su condensación?
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5) En el siguiente eje de coordenadas grafique las variaciones que se producen en la cantidad de ADN
durante los períodos de la mitosis, partiendo de una célula que contiene 6 picogramos de ADN en G1
(núcleo diploide). Grafique en el mismo eje de coordenadas qué ocurriría en presencia de colchicina.
ADN
(pg/núcleo)
12
10
0
G1 S G2 Profase Metafase Anafase Telofase (con citosinesis)
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Trabajo Práctico Nº 11
Seminario de integración de los temas vistos en los TP Nº 6 a TP Nº 10
1) Las células eucariontes tienen en su membrana plasmática uno o varios tipos de sistemas de
transporte impulsados por Na+ que regulan la entrada o salida de solutos de la célula. Uno de estos
sistemas acopla la entrada de Na+ a la incorporación de aminoácidos al interior celular.
a) ¿Qué tipo de transportador es?
b) ¿Qué características moleculares debe poseer para poder insertarse en la membrana
plasmática y ejercer su función?
c) ¿Qué tipo de transporte es (activo o pasivo)? Justifique su respuesta.
d) Teniendo en cuenta que para ingresar aminoácidos a la célula, ingresa necesariamente Na+,
indique:
e) ¿Cuál es el mecanismo que utiliza la célula para mantener la concentración de este catión
dentro de la concentración fisiológica?
f) ¿Qué ocurriría con el transporte de aminoácidos si en el medio extracelular se encontrara
presente ouabaína?
2) Imagine un experimento simple en el cual se incuban células en cultivo con timidina tritiada
(3H-timidina) por un corto período de tiempo. Ésta se incorporará en forma covalente al ADN de
las células que estén en ese momento en una determinada etapa del ciclo celular. El ADN
radioactivo puede detectarse en los núcleos de las células mediante autorradiografía (es decir,
colocando una película radiográfica sobre las células, las células radioactivas dejan una impronta
en la película y aparecen como puntos negros cuando se las observa con el microscopio).
a) ¿Qué período del ciclo celular se pone en evidencia con éste procedimiento?
b) Cuando se fijaron y examinaron por autorradiografía éstas células, se observó que:
todas las células que estaban en mitosis, en el momento que se agregó 3H-timidina,
incorporaron 3H-timidina en sus cromosomas.
ninguna célula que estaba en mitosis, en el momento que se agregó 3H-timidina, incorporó
3H-timidina en sus cromosomas
todas las células, mitóticas e interfásicas, en el momento que se agregó 3H-timidina,
incorporaron 3H-timidina en sus cromosomas
ninguna célula, ni mitótica ni interfásica, en el momento que se agregó 3H-timidina,
incorporó 3H-timidina en sus cromosomas
Indique con una cruz cuál de las siguientes opciones es la correcta. Justifique su respuesta.
3) La molécula “X” posee carga y es de bajo peso molecular. Se encuentra en mayor concentración
fuera que dentro de la célula.
a) Mencione el mecanismo que utilizará la molécula X para entrar a la célula.
b) Mencione ejemplos de moléculas que se encuentran en el entorno fisiológico normal de las
células que cumplen con éstas características.
d) Suponiendo que la molécula “X” se encuentra en menor concentración fuera que dentro de la
célula: ¿Qué mecanismo utilizaría para salir de ella?
e) Mencione ejemplos de moléculas que se encuentran normalmente dentro de las células que
cumplen con éstas características.
47
6) Una célula en G1 tiene 10 pg de ADN. Indique la cantidad de ADN por célula en los siguientes
estadios:
- metafase
- telofase con citocinesis
- G2
- profase
9) Marque con una cruz en qué periodo del ciclo celular ocurren los hechos citológicos enumerados
en la columna de la izquierda:
Producción de
ATP
Síntesis de
proteínas
histónicas
Condensación
cromosómica
10) Un biólogo interesado en estudiar los factores citosólicos que controlan las fases del ciclo
celular realizó dos experimentos de fusión celular:
A) Fusionó células que se encontraban en el estadio G1 con células que se encontraban en el
estadio S
B) Fusionó células que se encontraban en el estadio G2 con células que se encontraban en el
estadio S
Luego incorporó al medio de cultivo timidina tritiada (3H-timidina) y al cabo de un tiempo
examinó al microscopio los núcleos de las células G1 y G2 por radioautografía (permite ver la
incorporación de 3H-timidina en el ADN).
Indique:
a-¿Qué evidencia con el ensayo de incorporación de 3H-timidina?
b-¿En cuál de los experimentos se produjo incorporación de 3H-timidina en los núcleos? Justifique
su respuesta.
c-¿Qué hubiera ocurrido con las células que se encontraban en el estadio G2, si le hubiera
inyectado un extracto citosólico de células en fase M? Justifique su respuesta.
48
Trabajo Práctico Nº 12
BUSQUEDA BIBLIOGRAFICA
Introducción:
Se entiende por búsqueda bibliográfica una serie de actividades destinadas a localizar y recuperar
un conjunto de documentos relacionados con un determinado tema.
TIPOS DE BÚSQUEDA
a) Búsqueda de Actualización:
Se realiza cuando se parte del conocimiento previo del tema. En este caso, solo interesa conseguir
información sobre nuevos avances en un campo en particular.
b) Búsqueda Restrospectiva:
Se realiza cuando necesitamos información para la solución de un problema en particular:
• Queremos un documento o un dato específico sobre un tópico
• Buscamos uno o más documentos sobre un tema en particular
• Necesitamos una búsqueda exhaustiva en la cual se recupere el mayor número posible de
literatura publicada sobre el tema en un periodo de tiempo específico.
Clases de fuentes:
- Primarias: Tienen información original (libros, revistas, informes científicos y técnicos, actas de
congresos, entre otros) elaborada por el investigador o equipo responsable.
- Secundarias: Contienen los datos y la información referentes a documentos primarios (resúmenes,
catálogos, de bibliotecas, bibliografías). Son medios. Están elaboradas por un tercero no
relacionado con la investigación. Al realizar la revisión bibliográfica, deben consultarse las fuentes
primarias siempre que sea posible
1. Planear la estrategia
2. Realizar la búsqueda
3. Evaluar los resultados
4. Obtener los documentos
1. Planear la estrategia
ESTRATEGIA DE BÚSQUEDA
Son las operaciones lógicas que se deben llevar a cabo en un proceso de búsqueda, y el orden en
que éstas deben realizarse para el logro de los mejores resultados.
b-Definir la utilización de operadores lógicos (operadores boleanos) (AND, OR, NOT) y relación
entre los componentes
AND: solo registros que contengan ambos términos
OR: todos los registros que contengan cualquiera de los dos términos
NOT: solo los registros que contengan el primero y no contengan el segundo termino
49
Por ejemplo, si necesito buscar información sobre la “célula eucarionte”, pero no me interesa otro
tipo celular, usare “AND” para acceder solo a los registros que contengan ambos términos: “célula”
AND “eucarionte”.
2. Realizar la búsqueda
51
j) https://www.scopus.com/home.uri Scopus es la mayor base de datos de citas y resúmenes
de publicaciones revisadas por pares: revistas científicas, libros y actas de congresos
Actividades a Desarrollar
A-Realización de una búsqueda bibliográfica
Los alumnos realizaran una búsqueda bibliográfica sobre un tema de biología celular. Para ello, se
distribuirán formando equipos de trabajo que no superen el número de cinco integrantes. Cada
equipo seleccionará un tema de la lista que se presenta a continuación. Una vez seleccionado el
tema, cada equipo asistirá a una clase de tutoría en día y hora a convenir con el docente.
52
Lista de temas para la búsqueda bibliográfica:
ACTIVIDAD OPTATIVA
Objetivo:
Que el alumno pueda elaborar una revisión escrita sobre un tema de biología celular con
el resultado de la búsqueda bibliográfica
Una revisión bibliográfica escrita consiste en organizar y resumir las referencias, de tal
manera que revelen el estado actual del conocimiento sobre el tema elegido. La tarea de revisar la
bibliografía comprende identificación, selección, análisis crítico y descripción escrita de la
información existente sobre el tema de interés.
53
Para preparar una revisión escrita es necesario seguir los pasos que se resumen a
continuación. Con frecuencia, algún texto incluye otras referencias importantes, que aportan
fuentes adicionales. Debe registrarse la referencia completa para incluirla en la bibliografía.
Formato de la revisión:
Se sugiere una longitud máxima de tres páginas en tamaño A4 incluyendo la siguiente información:
a) En la parte superior de la primera página colocar el título del trabajo, centrado, en tamaño 14
negrita y fuente Times New Roman.
b) Seguidamente y dejando un espacio, colocar el nombre completo de los autores separados por
comas, centrado, en tamaño 10, fuente Times New Roman y cursiva.
c) Dejando dos espacios desarrollar el contenido de la revisión del tema seleccionado, citando las
referencias entre paréntesis (Ej: Simons, 1997).
d) Concluir listando en forma alfabética las referencias completas consultadas para elaborar la
revisión. Se sugiere el siguiente formato para mencionar las citas en el apartado Referencias:
- Simons K, Ikonen E (1997) Functional rafts in cell membranes. Nature 387:569–572
54
ANEXO
Seguridad en la Práctica de Laboratorio
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21. Al encender el mechero hágalo con la menor apertura posible del robinete.
22. No abandone el laboratorio sin haber apagado los mecheros.
23. Antes de manipular un aparato o montaje eléctrico, desconectarlo de la red eléctrica.
24. Al terminar la práctica de laboratorio, limpiar y ordenar el material utilizado.
Laboratorios de Biología
Leer reglas básicas
1. Se deben utilizar mascarillas descartables cuando exista riesgo de producción de aerosoles
(mezcla de partículas en medio líquidos) o polvos, durante operaciones de pesada de
sustancias tóxicas o biopatógenas, apertura de recipientes con cultivos después de
agitación, etc.
2. Está prohibido descartar material biológico por los desagües de las piletas, sanitarios o
recipientes comunes para residuos. En cada caso se deberá seguir los procedimientos
establecidos para la gestión de residuos.
3. La superficie de trabajo se deberá descontaminar una vez terminada las tareas o luego de
cada derrame de material viable, utilizando productos probadamente efectivos contra los
agentes con los que se trabaja.
4. El derrame o acida de muestras contaminadas, diluciones y medios sembrados o inoculados
será informado al docente de inmediatos. Se procederá a tratar el área afectada con la
solución desinfectante que corresponda, la cual se dejará actuar y se recogerá con papel
absorbente que sería luego descartado con los residuos patogénicos.
5. En caso de rotura de recipiente de vidrio que contiene microorganismos, proceder de igual
forma pero no tocar los residuos antes que el desinfectante haya actuado.
6. Cuando proceda a la limpieza de una superficie con alcohol, verifique que no haya
mecheros encendidos.
Consulte con el docente si el material biológico debe ser descontaminado previo a su descarte en
recipiente de residuos patogénicos (bolsa roja).
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ANTE CUALQUIER DUDA CONSULTE CON EL DOCENTE
57
Cortar esta Ficha, completar y entregarla para el Docente Titular o Jefe de Trabajos Práctico
MATERIA……………………………………………………………..
Laboratorio:………………………………………………………….
En caso de emergencia llamar al:……………………………………………
Firma:
Aclaración:
Matrícula Nº:
58