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Manual de Bergey
La clasificacin propuesta por esta primera edicin del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology
est basada en la tincin de Gram. As, agrupa a todas las bacterias en un solo Reino: el
Procaryotae, en el que se reconocen cuatro divisiones: Gracilicutes (procariotas, con pared celular,
gramnegativas), Firmicutes (procariotas, con pared celular, grampositivas), Tenericutes
(procariotas, sin pared celular) y Mendosicutes (procariotas filogenticamente anteriores a las
divisiones mencionadas, como las arquebacterias y otras)
En esta primera edicin de la nueva etapa, las bacterias se distribuyen en secciones. Las distintas
secciones se han constituido sobre la base de caracteres descriptivos morfolgicos y metablicos,
por ejemplo, espiroquetas, cocos y bacilos aerobios gramnegativos, cocos grampositivos, etc.
En cada una de las 33 secciones que lo componen se engloban distintos rangos taxonmicos que
varan considerablemente. Algunos llegan a tratar de divisiones, en tanto que otros se ocupan de
gneros. Un carcter que se mantiene constante es el estudio de gneros y sus correspondientes
especies, categoras taxonmicas ambas que son fundamentales en su estructuracin. Los que no
encajan perfectamente en alguna de las familias o secciones se les denomina gnero de afiliacin
dudosa o se incluyen en el de otros gneros. Las especies no bien descritas, definidas sin cepa
tipo, neotipo o de referencia, se catalogan como species incertae sedis.
En 2001 apareci el primero de los cinco volmenes de la segunda edicin del Bergey's Manual of
Systematic Bacteriology. Esta segunda edicin se publicar en cinco volmenes, y contendr ms
informacin ecolgica que clnica. Hasta ahora no se han publicado ms volmenes.
Volumen I:
Trata del dominio Archaea, en su totalidad y de algunas bacterias Gram negativas especiales, como
las Cianobacterias. En este volumen no hay casi ninguna bacteria de importancia clnica.
Volumen II:
Proteobacterias, bacterias Gram negativas . Dividido en cinco secciones (alfa, beta, delta, gamma y
psilon proteobacterias), el reino Proteobacteria agrupa a la mayor parte de las bacterias Gram
negativas de importancia clnica.
Neisseria, Brucella, Legionella, Pseudomonas, Haemophilus, Campylobacter y Enterobacterias,
pertenecen a este reino.
Volumen III:
Tratar sobre los Gram positivos con bajo contenido en G+C.
Aqu aparecern gneros como Staphylococcus, Streptococcus, Enterococcus, Clostridium y
Bacillus
Volumen IV:
Contendr una sola seccin que agrupar a todos los Gram positivos con alto contenido en G+C
Los gneros ms conocidos de este volumen sern Mycobacterium y Corynebacterium.
El Volumen V tratar de otras bacterias Gram negativas, agrupadas en ocho secciones diferentes.
No tienen ningn factor en comn. Los gneros ms importantes desde el punto de vista clnico
sern Chlamydia, Treponema, Borrelia o Bacteroides
A pesar de todos estos cambios y avances en los criterios de clasificacin, la identificacin sigue
basndose en la distincin entre gneros y especies, que apenas se han modificado. Por este motivo
podemos seguir utilizando sin mayores dificultades la novena edicin del Bergey's Manual of
Determinative Bacteriology (que adems es el nico que poseemos) hasta que se complete la
publicacin de la segunda edicin del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology
El ltimo ndice publicado de la clasificacin de bacterias se actualiz en abril del 2001 y est a
vuestra disposicin en la pgina web del Manual Bergey`s.
Una copia de este ndice est a vuestra disposicin en el Laboratorio de Microbiologa, y sobre
dicha copia debis establecer los rangos taxonmicos del microorganismo que os ha sido asignado.
Aunque la novena edicin del Bergey's Manual of Determinative Bacteriology contiene mucha informacin
derivada de los cuatro volmenes del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, no debera ser
considerada una versin resumida de ste ltimo. En cambio, trata especficamente de un aspecto de
taxonoma bacteriana: la identificacin de las bacterias. Este libro ha sido diseado especialmente para
aquellas personas que estn comprometidas inicialmente en la identificacin de las bacterias, y a las cuales
no concierne la clasificacin (ordenacin de microorganismos en taxones). Adems, ha sido actualizado con
vistas a los diversos cambios de nomenclatura y nuevos taxones que han sido descritos desde que los
volmenes del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology fueron publicados.
Aunque este libro contiene muchos datos necesarios para la identificacin bacteriana, no contiene la
abundancia de informacin descriptiva sobre gneros y especies que proporciona el Bergey's Manual of
Systematic Bacteriology. Por ejemplo, no contiene informacin detallada de las especies, ni informacin
concerniente a la clasificacin o nomenclatura de las bacterias, o mtodos para el enriquecimiento o
aislamiento de diversas especies. Adems, no incluye esquemas de identificacin para ciertos grupos de
gneros o especies porque alguno de ellos requiere mtodos muy sofisticados para el cultivo y/o
identificacin. (p.ej. las rickettsias) o carecen de suficientes caractersticas diferenciales (p. ej. especies de
Bacillus).
Los esquemas de identificacin no son los esquemas de clasificacin, aunque pueda existir una
cierta similitud. Un esquema de identificacin para un grupo de microorganismos ser establecido
solo despus de que el grupo haya sido clasificado inicialmente ( es decir, siendo reconocido como
diferente de otros microorganismos); est basado en uno o ms caracteres o sobre un patrn de
caracteres que todos los miembros del grupo tienen y que otros grupos no tienen.
Los caracteres usados no son generalmente aquellos que se utilizan en la clasificacin del grupo;
por ejemplo, la clasificacin puede estar basada en un estudio de hibridacin del DNA/DNA,
mientras que la identificacin puede basarse sobre caracteres fenotpicos que se correlacionan bien
con la informacin gentica.
En general, los caracteres escogidos para un procedimiento de identificacin deben ser fcilmente
determinables, mientras que aquellos que son usados para la clasificacin pueden ser bastante
difciles de determinar (tales como los valores de homologa del DNA).
Los caracteres estudiados deberan ser tambin pocos en cantidad, mientras que la clasificacin
puede involucrar un gran nmero de caractersticas, tal y como sucede en el estudio de la taxonoma
numrica.
Las reacciones serolgicas, que generalmente tienen un valor limitado en la clasificacin, a menudo
tienen enorme valor para la identificacin. Los test de aglutinacin en porta, las tcnicas de
anticuerpos fluorescentes, y otros mtodos serolgicos, pueden ser realizados sencilla y
rpidamente y generalmente suelen ser muy especficos; por esta razn ofrecen los medios
necesarios para la identificacin presuntiva y rpida de las bacterias. Su especificidad no es del
100%, y es necesaria la confirmacin de la identificacin por test bioqumicos o fisiolgicos
adicionales.
En algunos gneros y especies, la identificacin puede basarse no en unos pocos tests, sino sobre un
patrn dado por la aplicacin de un batera completa de tests. Los miembros de la familia
Enterobacteriaceae representan un ejemplo tpico de esto. Para disminuir la necesidad de inocular
un gran nmero de medios en tubo, se han desarrollado una gran variedad de sistemas multitest
rpidos y adecuados para usar en la identificacin de diversos taxones, sobre todo aquellos de
importancia mdica.
Categora I
(Eubacterias Gram-negativas que tienen pared celular); Grupos 1-16.
1. *.Espiroquetas
2. * Bacterias Gram-negativas aerbicas o microaerfilas, mviles, helicoidales o vibrioides
3. - Bacterias Gram-negativas curvadas no mviles o rararamente mviles
4. * Cocos y bacilos Gram-negativos aerbicos o microaerfilos
5. * Bacilos Gram-negativos anaerobicos facultativos
6. * Bacilos Gram-negativos, anaerobicos, rectos, curvados, y helicoidales
7. - Bacterias desasimiladoras de azufre o reductoras de sulfatos
8. - Cocos anaerbicos Gram-negativos
9 * Rickettsias y Chlamydias
10 - Bacterias fotosintticas anoxignicas
11 - Bacterias fotosintticas oxignicas
12 - Bacterias quimiolitotroficas aerbicas y microorganismos relacionados
13 - Bacterias con apndice y/o que geman
14 - Bacterias con vaina
15 - Bacterias deslizantes no fotosintticas, no frutescentes
16 - Bacterias deslizantes frutescentes: Myxobacteriales
Categora II
(Eubacterias Gram-positivas que tienen pared celular); Grupos 17-29.
17 * Cocos Gram-positivos
18 * Cocos y bacilos Gram-positivos formadores de esporas
19 * Bacilos Gram-positivos no formadores de esporas con morfologa regular
20 * Bacilos Gram-positivos no formadores de esporas con morfologa irregular
21 * Mycobacterias
22 * Actinomycetos nocardioformes
23 - Generos con esporangio multilocular
24 - Actinoplanetos
25 - Streptomycetos y gneros relacionados
26 - Maduromycetos
27 - Thermomonospora y gneros relacionados
28 - Thermoactinomycetos
29 - Otros Gneros
Categora III
(Eubacterias carentes de pared celular: Mycoplasmas o Mollicutes); Grupo 30.
30 * Mycoplasmas
Categora IV
(Archaeobacteria); Grupos 31-35.
31 - Metangenos
32 - Archaeal reductoras de sulfato
33 - (Halobacteria) Archaeobacteria extremadamente haloflicas
34 - Archaeobacteria sin pared celular
35 - Metabolizadoras de sulfato extremadamente termoflicas e hipertermoflicas
The Category I
(Gram-negative eubacteria that have cell walls); Groups 1-16.
1. The Spirochetes
2. Aerobic/microaerophilic, Motile, Helical/Vibrioid Gram-negative bacteria
3. Nonmotile (or rarely motile), Gram-negative curved bacteria
4. Gram-negative aerobic/microaerophilic Rods and Cocci
5. Facultatively Anaerobic Gram-negative Rods
6. Gram-negative, Anaerobic, Straight, Curved, and Helical Rods
7. Dissimilatory sulfate- or sulfur-reducing Bacteria
8 Anaerobic Gram-negative Cocci
9 The Rickettsias and Chlamydias
10 Anoxygenic Phototrophic Bacteria
11 Oxygenic phototrophic Bacteria
12 Aerobic Chemolithotrophic bacteria and associated organisms
13 Budding and/or appendaged Bacteria
14 Sheathed Bacteria
15 Nonphotosynthetic, Nonfruiting Gliding Bacteria
16 Fruiting Gliding Bacteria: The Myxobacteria
The Category II
(Gram-positive eubacteria that have cell walls); Groups 17-29.
17 Gram-positive Cocci
18 Endospore-forming Gram-positive Rods and Cocci
19 Regular, Nonsporing Gram-positive Rods
20 Irregular, Nonsporing Gram-positive Rods
21 The Mycobacteria
22 Nocardioform Actinomycetes
23 Genera with Multilocular sporangia
24 Actinoplanetes
25 Streptomycetes and related genera
26 Maduromycetes
27 Thermomonospora and related genera
28 Thermoactinomycetes
29 Other Genera
The Category IV
(Archaeobacteria); Groups 31-35.
31 The Methanogens
32 Archaeal sulfate reducers
33 Extremely halophilic archaeobacteria (Halobacteria)
34 Cell wall-less archaeobacteria
35 Extremely thermophilic and hyperthermophilic S0-metabolizers