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Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Taxonomía y Sistemática Bacterianas - 1

Laboratorio de Diagnóstico Clínico. 2º curso U.T. 12 - 2 Bloque temático III

Taxonomía y Sistemática Bacterianas

Introducción
Uno de los aspectos más fascinantes y atractivos de los seres vivos es su extraordinaria diversidad.
Parece que la naturaleza haya logrado conseguir prácticamente cualquier modo de forma, tamaño,
fisiología y estilo de vida. Debido a esta desconcertante diversidad de los organismos vivos, es
deseable clasificarlos u ordenarlos en grupos, en función de sus semejanzas.

La taxonomía se define como la ciencia de la clasificación biológica. En un sentido más amplio, se
compone de tres partes independientes pero interrelacionadas: clasificación, nomenclatura e
identificación.

La clasificación es la estructuración de los organismos en grupos o taxones, en función de sus
semejanzas o de su parentesco evolutivo.

La nomenclatura es la rama de la taxonomía que se ocupa de la asignación de nombres a grupos
taxonómicos o microorganismos individualizados, de conformidad con normas publicadas y
aceptadas por toda la comunidad científica internacional. La importancia de la nomenclatura radica
fundamentalmente en que nos permite referirnos a un microorganismo sin necesidad de describir
todas sus características. La nomenclatura es, lógicamente, un proceso previo a la clasificación.

La identificación constituye el lado práctico de la taxonomía y consiste determinar a qué taxón o
grupo, previamente establecido por la clasificación, pertenece un microorganismo particular
aislado.

El término sistemática a menudo se emplea para referirse a la taxonomía, aunque muchos
taxonomistas la definen como "el estudio científico de los organismos cuyo objetivo final es
caracterizarlos y agruparlos de forma ordenada". Todo estudio de la naturaleza de los
microorganismos, cuando los conocimientos adquiridos se aplican a la taxonomía, forman parte de
la sistemática.

La taxonomía microbiana se encuentra actualmente en un proceso de cambio continuo, debido a la
aplicación de técnicas de análisis molecular para el estudio de los microorganismos que aportan
nueva y abundante información que permite la definición de nuevos criterios de clasificación.

Aun cuando estos avances han generado gran excitación en la comunidad científica y en la literatura
especializada, no deja de ser menos cierto que los enfoques más tradicionales siguen siendo válidos
ya que se siguen utilizando en muchos laboratorios.

La nomenclatura viene regulada por el International Committee on Systematic and
Evolutionary Bacteriology (ICSB) a través del International Code on Nomenclature of
Bacteria (ICNB). La Lista Aprobada de Denominaciones Bacterianas se publica y actualiza
periódicamente desde 1980 en el International Journal of Systematic Bacteriology (IJSB), en su
Approbed List of Bacterial Names.

El Manual Bergey es un tratado que se ocupa de la identificación y clasificación de las bacterias.
Su reconocimiento y prestigio mundial lo han convertido en la referencia y consulta obligada de
todos los microbiólogos interesados en taxonomía e identificación.

Gustavo A. Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010

2 Bloque temático III Bergey’s Manual En 1923. las bacterias se distribuyen en secciones. ha hecho posible el análisis filogenético de las bacterias. 2º curso U. espiroquetas. la segunda edición del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology es fundamentalmente filogenética en vez de fenotípica. Las especies no bien descritas. Un carácter que se mantiene constante es el estudio de géneros y sus correspondientes especies. sin pared celular) y Mendosicutes (procariotas filogenéticamente anteriores a las divisiones mencionadas. catedrático de bacteriología en la Universidad de Pennsylvania. categorías taxonómicas ambas que son fundamentales en su estructuración. En 1984. agrupa a todas las bacterias en un solo Reino: el Procaryotae. En 2001 apareció el primero de los cinco volúmenes de la segunda edición del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. y por consiguiente. plásmidos y bacteriófagos. 12 . neotipo o de referencia. Los volúmenes 4 y 5 están previstos para 2010. Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010 . se publicó la primera edición de un manual enfocado más a la clasificación que a la identificación: el Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. en cada especie se incluye una cepa tipo. En 2005 se publicó el volumen 2 y en 2009 acaba de publicarse el volumen 3. ha sido utilizado en muchos laboratorios de Microbiología de todo el mundo y ha ido actualizándose a lo largo de los años. estructura antigénica. caracteristicas genéticas.2 Laboratorio de Diagnóstico Clínico. morfología de las colonias y pigmentación. A consecuencia de ello. del DNA y de las proteínas. etc. En esta primera edición de la nueva etapa. el año de la publicación del primer volumen del Bergey's Manual of Systematic and Bacteriology. que podía utilizarse para la identificación bacteriana. publicaron un manual sobre características de las bacterias de interés médico conocidas hasta entonces. Esta publicación constaba de cuatro volúmenes. Las propiedades empleadas para la diferenciación son: características morfológicas microscópicas. Gustavo A. La clasificación propuesta por esta primera edición del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology está basada en la tinción de Gram. como las arquebacterias y otras). con pared celular gruesa. muy diferente de la primera edición. Firmicutes (procariotas. En general. y cuatro colaboradores más. El número de especies nombrada se ha duplicado. cocos y bacilos aerobios gramnegativos. Tenericutes (procariotas. por ejemplo. definidas sin cepa tipo. el análisis del rRNA. el Bergey's Manual of Determinative Bacteriology. hasta que apareció la novena y última edición en 1994. en el que se reconocen cuatro divisiones: Gracilicutes (procariotas. en tanto que otros se ocupan de géneros. se catalogan como species incertae sedis. Las distintas secciones se han constituido sobre la base de caracteres descriptivos morfológicos y metabólicos. Algunos llegan a tratar de divisiones. Ha habido un progreso considerable en el campo de la taxonomía bacteriana desde 1984. Este manual. Así. condiciones de crecimiento y nutrición. cocos grampositivos. En particular. gramnegativas). David Bergey. Los que no encajan perfectamente en alguna de las familias o secciones se les denomina «género de afiliación dudosa» o se incluyen en el de «otros géneros».Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Taxonomía y Sistemática Bacterianas . fisiologia y metabolismo. y hay más de 200 nuevos géneros descritos. En cada una de las 33 secciones que lo componen se engloban distintos rangos taxonómicos que varían considerablemente.T. grampositivas). patogenicidad y ecología. con pared celular fina.

la clasificación de los procariotas se estructura en dos dominios.2 Bloque temático III A diferencia de la primera edición. Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010 .bergeys. Gustavo A.org que os permitirá ver la clasificación taxonómica actualizada de todos los seres vivos. como las Cianobacterias. debéis realizar la búsqueda de las características taxonómicas de la bacteria que os ha sido asignada para hacer la ficha.org . Dividido en cinco secciones (alfa. Los géneros más importantes desde el punto de vista clínico son Chlamydia. conocemos la organización de su estructura. 2º curso U. Nuestro interés se centrará en el Dominio Bacteria que posee un total de 25 Phylum. Por este motivo se sigue utilizando sin mayores dificultades la novena edición del Bergey's Manual of Determinative Bacteriology. El último índice taxonómico publicado de la clasificación de bacterias se actualiza periódicamente y está a vuestra disposición en la página web del Manual Bergey : http://www. Brucella.0 May 2004) Sobre este archivo. Archaea y Bacteria.3 Laboratorio de Diagnóstico Clínico. Haemophilus. Legionella. Treponema. Neisseria. el reino Proteobacteria agrupa a la mayor parte de las bacterias Gram negativas de importancia clínica.bergeys. Borrelia o Bacteroides A pesar de todos estos cambios y avances en los criterios de clasificación. No tienen ningún factor en común. Aunque la edición completa no estará disponible hasta dentro de un año. Volumen III: Tratará sobre los Firmicutes. pertenecen a este reino. 12 . que apenas se han modificado. Campylobacter y Enterobacterias. incluso de virus. En este volumen no hay casi ninguna bacteria de importancia clínica. grupo de Gram positivos con bajo contenido en G+C. la identificación sigue basándose en la distinción entre géneros y especies.Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Taxonomía y Sistemática Bacterianas . beta. que podéis consultar en la página web http://www. También podéis acceder a la página http://www. Publications Volumen I: Trata del dominio Archaea en su totalidad y de algunas bacterias Gram negativas especiales. (Taxonomics outlines  Release 5. Clostridium y Bacillus Volumen IV: Contendrá una sola sección que agrupará a todos los Gram positivos con alto contenido en G+C Los géneros más conocidos de este volumen son Mycobacterium y Corynebacterium. Pseudomonas. agrupadas en ocho secciones diferentes. que podéis bajaros libremente. Volumen II: Proteobacterias.catalogueoflife.T. Streptococcus. El Volumen V trata de otras bacterias Gram negativas (Actinobacterias).org . Enterococcus. Aquí estarán géneros como Staphylococcus. gamma y épsilon proteobacterias). delta. bacterias Gram negativas .

Paso 3: ¿A qué categoría de bacterias pertenece el microorganismo? De forma práctica. En consecuencia. Eubacterias Gram-negativas que tienen pared celular II. las Rickettsias) o carecen de suficientes características diferenciales (p. no incluye esquemas de identificación para ciertos grupos de géneros o especies porque alguno de ellos requiere métodos muy sofisticados para el cultivo y/o identificación. levadura. las bacterias pueden dividirse en cuatro grandes categorías: I.T. o métodos para el enriquecimiento o aislamiento de diversas especies. alga o protozoo). Aunque este libro contiene muchos datos necesarios para la identificación bacteriana. El capítulo III proporciona una tabla de características que diferencian procariotas de eucariotas. los siguientes seis pasos proporcionan una aproximación a esta tarea. 2º curso U. (p. En cambio.ej. y a las cuales no concierne la clasificación (ordenación de microorganismos en taxones).Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Taxonomía y Sistemática Bacterianas . Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010 . Eubacterias Gram-positivas que tienen pared celular III. Arqueobacterias El capítulo IV proporciona características que permiten la diferenciación de estas cuatro categorías. Paso 2: ¿El microorganismo aislado es eucariota o procariota? Este manual es usado para la identificación de bacterias (procariotas). ni información concerniente a la clasificación o nomenclatura de las bacterias. Este libro ha sido diseñado especialmente para aquellas personas que están comprometidas inicialmente en la identificación de las bacterias. especies de Bacillus). no contiene la abundancia de información descriptiva sobre géneros y especies que proporciona el Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. ha sido actualizado con vistas a los diversos cambios de nomenclatura y nuevos taxones que han sido descritos desde que los volúmenes del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology fueron publicados. El capítulo V proporciona un listado de los grupos que existen en cada una de las cuatro categorías y una breve descripción de los tipos de bacterias contenidos en cada grupo Paso 5: ¿A qué género pertenece el microorganismo aislado? La mayoría de los grupos descritos en el Manual proporcionan una o más tablas o claves indicando las características que pueden ser usadas para diferenciar los géneros dentro del grupo. no contiene información detallada de las especies. Paso 1: La naturaleza de los esquemas de identificación bacteriana El lector debe leer el capítulo II de este libro para familiarizarse con los principios generales usados en identificación bacteriana. Paso 6: ¿A que especie pertenece el microorganismo aislado? La mayoría de las descripciones de los géneros están acompañados por una o varias tablas que permiten la diferenciación de las especies contenidas en los géneros Gustavo A. Por ejemplo.2 Bloque temático III Capítulo I del BMDB: Introducción y uso del Manual Aunque la novena edición del Bergey's Manual of Determinative Bacteriology contiene mucha información derivada de los cuatro volúmenes de la primera edición del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. 12 . ej. Eubacterias carentes de pared celular IV. Además. trata específicamente de un aspecto de taxonomía bacteriana: la identificación de las bacterias.4 Laboratorio de Diagnóstico Clínico. el microorganismo a identificar debe ser una bacteria en vez de un eucariota microscópico (moho. ¿Cómo usar el Bergey's Manual of Determinative Bacteriology? Asumiendo que el lector tiene un microorganismo aislado y desea identificarlo. Además. Paso 4: ¿A qué grupo pertenece el microorganismo aislado? Tras la correcta asignación del microorganismo a su categoría bacteriana. el siguiente paso es determinar en que grupo se puede encuadrar el microorganismo. no debería ser considerada una versión resumida de éste último.

la clasificación puede estar basada en un estudio de hibridación del ADN/ADN. Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010 . está basado en uno o más caracteres o sobre un patrón de caracteres que todos los miembros del grupo tienen y que otros grupos no tienen. la composición lipídica celular o la hibridación de ácidos nucleicos. Su especificidad no es del 100%. por esta razón ofrecen los medios necesarios para la identificación presuntiva y rápida de las bacterias. Las reacciones serológicas. siendo reconocido como diferente de otros microorganismos). Gustavo A. mientras que aquellos que son usados para la clasificación pueden ser bastante difíciles de determinar (tales como los valores de homología del DNA). la identificación puede basarse no en unos pocos tests. mientras que la clasificación puede involucrar un gran número de características. 2º curso U. sobre todo aquellos de importancia médica. tal y como sucede en el estudio de la taxonomía numérica.2 Bloque temático III Capítulo II: La naturaleza de los esquemas de clasificación bacterianos Los esquemas de identificación no son esquemas de clasificación. a menudo tienen enorme valor para la identificación. que generalmente tienen un valor limitado en la clasificación.Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Taxonomía y Sistemática Bacterianas . aunque pueda existir una cierta similitud. se han desarrollado una gran variedad de galerías rápidas y adecuados para usar en la identificación de diversos taxones. Los caracteres estudiados deberían ser también pocos en cantidad. sino sobre un patrón dado por la aplicación de un batería completa de tests. particularmente con géneros o especies que no son susceptibles de ser caracterizados por los tradicionales test bioquímicos o fisiológicos. Los caracteres usados no son generalmente aquellos que se utilizan en la clasificación del grupo. Estas particularidades ideales de un sistema de identificación no siempre pueden ser posibles.5 Laboratorio de Diagnóstico Clínico. mientras que la identificación puede basarse sobre caracteres fenotípicos que se correlacionan bien con la información genética. y es necesaria la confirmación de la identificación por test bioquímicos o fisiológicos adicionales. las técnicas de anticuerpos fluorescentes. Los test de aglutinación en porta. puede ser necesario acudir a procedimientos relativamente complicados para conseguir una identificación correcta - procedimientos tales como la electroforesis de proteínas celulares en gel de poliacrilamida (PAGE). En algunos géneros y especies. los caracteres escogidos para un procedimiento de identificación deben ser fácilmente determinables. por ejemplo. En tales casos. Un esquema de identificación para un grupo de microorganismos será establecido solo después de que el grupo haya sido clasificado inicialmente (es decir. Para disminuir la necesidad de inocular un gran número de medios en tubo. 12 . En general. y otros métodos serológicos.T. pueden ser realizados sencilla y rápidamente y generalmente suelen ser muy específicos. Los miembros de la familia Enterobacteriaceae representan un ejemplo típico de esto.

Volume II : Sections 12-17 III. The Cyanobacteria . Volume III : Sections 18-25 IV. Bergey (1860-1937) • The first edition in 1923 • The second edition in 1925 • The third edition in 1930 • 1934 the 4th • 1939 the fifth • 1948 the sixth • 1957 the seventh • 1966 Index Bergeyana • 1974 The eighth edition. Bacteroides and Fusobacteria.Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Taxonomía y Sistemática Bacterianas .V . Volumes I . Section XXIII . Ninth edition • 2001. Volume II: The Proteobacteria. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Volume V: The Planctomycetes. Sections XV-XIX Section XV: alpha subdivision Section XVI: beta subdivision Section XVII: gamma subdivision Section XVIII: delta subdivision Section XIX: epsilon subdivision . Volume I: The Archaea. Volume I : Sections 1-11 II.Division I Gracilicutes . Bergey's Manual of Systematic Bacteriology.2 Bloque temático III Historia del Manual Bergey's Bergey's Manual of Determinative Bacteriology By David H. Volume IV: The High G + C Gram Positives. 2º curso U. Sections I-XIV . 12 . Spirochaetes. 2nd edition.T. 19 parts in total Kingdom Procaryote . Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010 . Fibrobacteres. Phototrophs. Sections XX-XXII . Cyanobacteria.Division II Firmicutes . Volume IV : Sections 26-33 Kingdom Procaryotae . and Deeply Branching Genera. Bergey's Manual of Determinative Bacteriology.Division III Tenericutes . First edition Volumes I-IV I.Division I.Division IV Mendosicutes • 1994 . Sections XXIV-XXXI Gustavo A.Division II. Volume III: The Low G + C Gram Positives.6 Laboratorio de Diagnóstico Clínico. The Bacteria (19 parts) • 1977 Abbreviated edition • 1981 Supplement to Index Bergeyana • 1984.

Bacterias fotosintéticas oxigénicas 12 .Archaeobacteria sin pared celular 35 . .Otros Géneros Categoría III (Eubacterias carentes de pared celular: Mycoplasmas o Mollicutes). * Bacilos Gram-negativos.Archaeal reductoras de sulfato 33 . .(Halobacteria) Archaeobacteria extremadamente halofílicas 34 .Bacterias desasimiladoras de azufre o reductoras de sulfatos 8. anaerobicos. 1.Bacterias deslizantes frutescentes: Myxobacteriales Categoría II (Eubacterias Gram-positivas que tienen pared celular).Generos con esporangio multilocular 24 .Bacterias quimiolitotroficas aeróbicas y microorganismos relacionados 13 .Bacterias fotosintéticas anoxigénicas 11 .Actinoplanetos 25 .Cocos anaeróbicos Gram-negativos 9 * Rickettsias y Chlamydias 10 .7 Laboratorio de Diagnóstico Clínico. * Cocos y bacilos Gram-negativos aeróbicos o microaerófilos 5. Grupo 30. 2º curso U. helicoidales o vibrioides 3. * Bacterias Gram-negativas aeróbicas o microaerófilas. Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010 . 31 . 12 .T.Bacterias con apéndice y/o que geman 14 . y helicoidales 7. 17 * Cocos Gram-positivos 18 * Cocos y bacilos Gram-positivos formadores de esporas 19 * Bacilos Gram-positivos no formadores de esporas con morfología regular 20 * Bacilos Gram-positivos no formadores de esporas con morfología irregular 21 * Mycobacterias 22 * Actinomycetos nocardioformes 23 .2 Bloque temático III 1994 Novena edición.Thermomonospora y géneros relacionados 28 .Bacterias Gram-negativas curvadas no móviles o rararamente móviles 4.Bacterias con vaina 15 .Metabolizadoras de sulfato extremadamente termofílicas e hipertermofílicas (*) Grupos importantes en patología infecciosa humana Gustavo A. no frutescentes 16 . curvados.Bacterias deslizantes no fotosintéticas. Grupos 31-35.Thermoactinomycetos 29 . 35 Grupos englobados en cuatro grandes categorías de Bacterias Categoría I (Eubacterias Gram-negativas que tienen pared celular).Metanógenos 32 . *. Grupos 1-16. * Bacilos Gram-negativos anaerobicos facultativos 6. . móviles. 30 * Mycoplasmas Categoría IV (Archaeobacteria).Espiroquetas 2. rectos.Streptomycetos y géneros relacionados 26 .Maduromycetos 27 . Grupos 17-29.Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Taxonomía y Sistemática Bacterianas .

or sulfur-reducing Bacteria 8 Anaerobic Gram-negative Cocci 9 The Rickettsias and Chlamydias 10 Anoxygenic Phototrophic Bacteria 11 Oxygenic phototrophic Bacteria 12 Aerobic Chemolithotrophic bacteria and associated organisms 13 Budding and/or appendaged Bacteria 14 Sheathed Bacteria 15 Nonphotosynthetic. Facultatively Anaerobic Gram-negative Rods 6. Curved. Anaerobic. 2º curso U. Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010 . Groups 17-29. Gram-negative curved bacteria 4. Nonmotile (or rarely motile). 31 The Methanogens 32 Archaeal sulfate reducers 33 Extremely halophilic archaeobacteria (Halobacteria) 34 Cell wall-less archaeobacteria 35 Extremely thermophilic and hyperthermophilic S0-metabolizers Gustavo A.2 Bloque temático III 1994 Ninth edition.8 Laboratorio de Diagnóstico Clínico. Dissimilatory sulfate. 35 Groups within 4 major categories of Bacteria The Category I (Gram-negative eubacteria that have cell walls). Helical/Vibrioid Gram-negative bacteria 3. 12 . 1. Group 30. and Helical Rods 7. The Spirochetes 2.T. Nonsporing Gram-positive Rods 20 Irregular. Nonfruiting Gliding Bacteria 16 Fruiting Gliding Bacteria: The Myxobacteria The Category II (Gram-positive eubacteria that have cell walls). 30 Mycoplasmas The Category IV (Archaeobacteria). Gram-negative aerobic/microaerophilic Rods and Cocci 5. Aerobic/microaerophilic. Nonsporing Gram-positive Rods 21 The Mycobacteria 22 Nocardioform Actinomycetes 23 Genera with Multilocular sporangia 24 Actinoplanetes 25 Streptomycetes and related genera 26 Maduromycetes 27 Thermomonospora and related genera 28 Thermoactinomycetes 29 Other Genera The Category III (Cell wall-less eubacteria: The mycoplasmas or mollicutes). 17 Gram-positive Cocci 18 Endospore-forming Gram-positive Rods and Cocci 19 Regular. Motile. Straight.Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Taxonomía y Sistemática Bacterianas . Groups 31-35. Gram-negative. Groups 1-16.

Un género es un grupo bien definido de una o más especies que está claramente separado de otros géneros. morfológicas (morfotipo) o antigénicas (serotipo). Consta de dos partes: género y especie. Las cepas de una misma especie pueden diferenciarse ligeramente por características bioquímicas (biotipo). Los taxonomistas que trabajan con organismos superiores definen el término especie de forma distinta a los microbiólogos. El grupo taxonómico básico en taxonomía microbiana es la especie. Los microbiólogos asignan los nombres a los microorganismos mediante el sistema binomial. Una especie de cada género es considerada la especie tipo. mostrando entre sí un grado elevado de semejanza fenotípica general. 12 . Una cepa de cada especie se designa como la cepa tipo. El epíteto de especie más antiguo de un organismo en particular tiene prioridad y es el que debe utilizarse. En la literatura científica un microorganismo ha podido tener diferentes denominaciones a lo largo del tiempo. Una especie bacteriana puede definirse como un conjunto de cepas que. Gustavo A. El nombre de especie (epíteto) se escribe en minúscula. El epíteto de especie es un nombre estable mientras que el de género puede cambiar si el organismo se asigna a otro género a la luz de nueva información. Una cepa es una población de microorganismos que desciende de un único organismo o de un aislamiento en cultivo puro. La especie de los organismos superiores consiste en grupos de poblaciones naturales que se reproducen entre sí. aunque no tiene por qué ser el miembro más representativo de la especie. aunque en realidad existe un grado considerable de subjetividad al asignar las especies a los géneros. 2º curso U.9 Laboratorio de Diagnóstico Clínico. Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010 . La primera letra del nombre de género se escribe siempre con mayúscula. El nombre del microorganismo debe ser latinizado y escribirse en cursiva o subrayado. difieren en muchas características de otros grupos de cepas relacionados. Suele tratarse de una de las primeras cepas estudiadas y a menudo está más caracterizada que otras cepas.T. pero solo aquellas que hayan sido publicadas por el International Journal of Systematic Bacteriology son las que tienen validez. Esta definición fracasa en los microorganismos porque su reproducción no es sexual.2 Bloque temático III Rangos taxonómicos El anterior sistema de clasificación establecía las siguientes categorías taxonómicas: Reino División Clase Orden Familia Género Especie (subclase) (suborden) (tribu) (subgénero) (subesp ecie) En la última edición del Manual Bergey las categorías taxonómicas utilizadas son las siguientes: Dominio Phylum Clase Orden Familia Género Especie (subclase) (suborden) (tribu) (subgénero) (subespecie) Las secciones o los grupos utilizados en el Bergey's son categorías informales utilizadas para dividir el sistema de clasificación en partes manejables.Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Taxonomía y Sistemática Bacterianas .

aunque muestran pequeñas variaciones que se van acumulando a lo largo del tiempo. Solo es útil para clasificación y no para identificación. Para que dos cepas estén relacionadas deben asociar más del 70% de su ADN.2 Bloque temático III Principales características utilizadas en clasificación e identificación Características clásicas: Características morfológicas Características fisiológicas Características ecológicas Forma celular Fuentes de C o N utilizadas Patrón de ciclo vital Tamaño Componentes de la pared celular Relaciones simbióticas Estructura interna Fuentes de energía utilizadas Preferencias de hábitat Inclusiones Productos de fermentación Esporas Tipo nutricional Estructura externa Temperatura de crecimiento Cápsulas Atmósfera de crecimiento Flagelos Luminiscencia Fimbrias pH óptimo Comportamiento ante tinciones Tolerancia osmótica Características de las colonias Metabolitos secundarios formados Movilidad Sensibilidad a inhibidores Inclusiones de almacén Características moleculares * Ensayos de conjugación y transformación * Tamaño del genoma El PM del ADN bacteriano oscila entre 1 . * Multilocus sequence typing Se basa en diferenciar las enzimas de una especie bacteriana mediante electroforesis (isoenzimas) Gustavo A. * Secuencias de oligonucleótidos firma Son secuencias específicas cortas que aparecen en todos (o en la mayor parte) de los miembros de un determinado grupo taxonómico. * Secuenciación de ácidos nucleicos Es el más complejo pero el más exacto de todos los procedimientos. y establecidas las comparaciones. * Composición de ácidos nucleicos Contenido G+C El contenido G+C de las bacterias oscila entre el 25 y el 75%. y nunca (o raramente) están presentes en otros grupos. * Hibridación de ácidos nucleicos Es un procedimiento que permite comprobar si cadenas simples de ADN de dos microorganismos diferentes pueden formar entre sí cadenas dobles estables. Es también un carácter taxonómico negativo. g /mol Es un carácter taxonómico negativo que no relaciona a aquellos con tamaños muy diferentes. dos cepas con el mismo contenido G+C no tienen por qué estar relacionadas necesariamente. será el grado de similitud entre las secuencias de las rRNA 16S de dos bacterias lo que indique su relación evolutiva. Una vez determinada la secuencia de nucleótidos.10 Laboratorio de Diagnóstico Clínico. Por lo tanto se mide la cantidad de ADN que tienen en común las dos hebras complementarias. es decir. pues permite la comparación total de los genomas bacterianos. presente en los ribosomas de todas las bacterias y que tiene una antigüedad de millones de años.109 y 8 . incluidos los más próximos filogenéticamente. podemos asegurar que no pertenecen a la misma especie. pero que tampoco relaciona a aquellos con tamaños similares. 2º curso U. Sin embargo.T.Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Taxonomía y Sistemática Bacterianas . Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010 . * Oligonucleótidos del rRNA 16S El rRNA 16S es un polirribonucleótido de unos 1500 nt. 12 . Su estructura y función han permanecido constantes. cuando el porcentaje entre dos cepas difiere bastante.109.

dichas características pueden utilizarse para construir un sistema de clasificación. Debido a que el rRNA contiene secuencias variables y constantes. Es evidente que la mejor clasificación es la que se desarrolla por comparación del mayor número posible de atributos. Es el sistema de clasificación que utilizó Linneo. En la actualidad este sistema de clasificación está basado en el análisis de la secuencia del rRNA 16S de la subunidad 30S de los ribosomas bacterianos. mientras que las moléculas rápidamente cambiantes se emplean para el seguimiento de la especiación. Además las diferentes moléculas y distintas partes de la misma molécula pueden cambiar a velocidades diferentes. ya que en este caso cuanto mayor sea la variación en la secuencia constante. Gustavo A. Deben compararse cientos de caracteres para poder establecer una clasificación precisa y fiable. se calcula para cada par de organismos del grupo un coeficiente de asociación. El desarrollo de los ordenadores ha hecho posible el estudio de muchos atributos y muchas cepas simultáneamente. Muchos taxonomistas sostienen que la clasificación más natural es aquella que presenta el mayor contenido informativo. Se cree que las secuencias de muchos rRNA y proteínas cambian lentamente con el tiempo sin destruir ni alterar gravemente sus funciones. puesto que son elementos esenciales de los ribosomas. estructura los organismos en grupos cuyos miembros comparten muchas características. 12 .11 Laboratorio de Diagnóstico Clínico. denominado clasificación natural.T. que determina la concordancia de caracteres que presentan esos dos organismos. basado en relaciones evolutivas más que en semejanzas generales. Los organismos que comparten muchas características constituyen un grupo único o taxón. El proceso comienza con una determinación de la presencia o ausencia de caracteres seleccionados en el grupo de microorganismos que son objeto de estudio. Una clasificación fenética compara muchos rasgos sin suponer que ciertas características son más importantes que otras. debido probablemente a la crucial y constante función que desempeñan. Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010 .2 Bloque temático III Sistemas de clasificación Una vez que se han recogido las características de los microorganismos desde el punto de vista taxonómico. Una vez realizado el análisis de caracteres.Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Taxonomía y Sistemática Bacterianas . Su estructura apenas se modifica con el paso del tiempo. ocurren de forma relativamente aleatoria y aumentan linealmente con el tiempo. es posible comparar tanto microorganismos estrechamente relacionados como de parentesco muy lejano. El sistema de clasificación más sencillo. Por este motivo se los considera indicadores evolutivos. Se supone que estos cambios son selectivamente neutrales. y refleja tanto como sea posible la naturaleza biológica de los organismos. Los organismos pueden agruparse en función de similitudes globales para formar un sistema fenético. dando lugar a lo que se conoce como taxonomía numérica o adansoniana. Por eso las moléculas muy conservadas como el rRNA se utilizan para seguir los cambios evolutivos a gran escala temporal. mayor lejanía evolutiva habrá entre ambos organismos. o pueden agruparse en función de probables relaciones evolutivas para generar un sistema filogenético. La secuenciación de los genomas completos de los microorganismos y la comparación de los mismos permitirá establecer más eficazmente las semejanzas y diferencias evolutivas entre ellos. 2º curso U. El otro sistema de clasificación es el filogenético. Existen dos formas generales de elaborar un sistema de clasificación. Los rRNA son ideales para los estudios de evolución y parentesco microbianos.

para ser fiable. Editorial Reverté Microbiología. No existe una forma clara de superar esta dificultad. y la caracterización de genotipos incompleta. y no solamente por su apariencia. Pero por otro. 4ª ed. fisiológicas o ecológicas .M.que permitan tener más datos que poder comparar y añadir a estos rasgos estructurales. Su extremada simplicidad estructural implica que se disponga de un rango demasiado reducido de caracteres para poder hacer una caracterización adecuada. Por un lado la identificación. Pero la clasificación de las bacterias constituye una excepción. los caracteres fenotípicos de más fácil determinación son los estructurales y anatómicos que pueden observarse directamente... Está claro que encontrar un término medio que satisfaga ambas necesidades permitirá hacer las identificaciones de una manera rápida. Eso representa un problema adicional para el microbiólogo.2 Bloque temático III Sistemas de identificación Las especies bacterianas deberían caracterizarse basándose en la descripción completa de sus fenotipos o. Por ello.Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Taxonomía y Sistemática Bacterianas . Stanier et . sean estructurales o bioquímicos. en atributos funcionales. La clasificación de las bacterias se basa. la mayor parte de las bacterias solo pueden identificarse por lo que hacen a nivel bioquímico.Y. 2ª ed. L. Bibliografía Microbiología. efectiva y relativamente barata.T. en grado mucho mayor que la de cualquier otro grupo de seres vivos. los taxónomos bacterianos se han visto forzados a buscar otros tipos de propiedades .. de sus genotipos. Por regla general. De aquí que la clasificación biológica continúe. Prescott et . Por eso. casi enteramente basada en propiedades estructurales.. R. El número de experiencias posibles por realizar es extremadamente grande y. ya que. McGraw Hill Interamericana Gustavo A. no todas van a ser necesariamente significativas desde el punto de vista taxonómico. incluso la descripción del fenotipo es fragmentaria. la realización de un elevado número de pruebas incrementa notablemente tanto el coste de la identificación como el tiempo dedicado a cada una de ellas. en el sentido de contribuir a la diferenciación del microorganismo objeto de estudio de otros pertenecientes a grupos relacionados. mejor incluso. aunque todas ellas pongan de manifiesto alguna característica. 2º curso U. necesita la caracterización de muchos rasgos bacterianos. en la mayor parte de los grupos de seres vivos. en la mayoría de los niveles.12 Laboratorio de Diagnóstico Clínico. Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010 .bioquímicas. El estudio de estas propiedades funcionales de la bacteria lleva aparejada la realización de experimentos. 12 . Pero la práctica taxonómica no llega a esos ideales.