Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Laboratorio de Diagnóstico Clínico.

2º curso

Taxonomía y Sistemática Bacterianas - 1 U.T. 12 - 2 Bloque temático III

Taxonomía y Sistemática Bacterianas
Introducción
Uno de los aspectos más fascinantes y atractivos de los seres vivos es su extraordinaria diversidad. Parece que la naturaleza haya logrado conseguir prácticamente cualquier modo de forma, tamaño, fisiología y estilo de vida. Debido a esta desconcertante diversidad de los organismos vivos, es deseable clasificarlos u ordenarlos en grupos, en función de sus semejanzas. La taxonomía se define como la ciencia de la clasificación biológica. En un sentido más amplio, se compone de tres partes independientes pero interrelacionadas: clasificación, nomenclatura e identificación. La clasificación es la estructuración de los organismos en grupos o taxones, en función de sus semejanzas o de su parentesco evolutivo. La nomenclatura es la rama de la taxonomía que se ocupa de la asignación de nombres a grupos taxonómicos o microorganismos individualizados, de conformidad con normas publicadas y aceptadas por toda la comunidad científica internacional. La importancia de la nomenclatura radica fundamentalmente en que nos permite referirnos a un microorganismo sin necesidad de describir todas sus características. La nomenclatura es, lógicamente, un proceso previo a la clasificación. La identificación constituye el lado práctico de la taxonomía y consiste determinar a qué taxón o grupo, previamente establecido por la clasificación, pertenece un microorganismo particular aislado. El término sistemática a menudo se emplea para referirse a la taxonomía, aunque taxonomistas la definen como "el estudio científico de los organismos cuyo objetivo caracterizarlos y agruparlos de forma ordenada". Todo estudio de la naturaleza microorganismos, cuando los conocimientos adquiridos se aplican a la taxonomía, forman la sistemática. muchos final es de los parte de

La taxonomía microbiana se encuentra actualmente en un proceso de cambio continuo, debido a la aplicación de técnicas de análisis molecular para el estudio de los microorganismos que aportan nueva y abundante información que permite la definición de nuevos criterios de clasificación. Aun cuando estos avances han generado gran excitación en la comunidad científica y en la literatura especializada, no deja de ser menos cierto que los enfoques más tradicionales siguen siendo válidos ya que se siguen utilizando en muchos laboratorios. La nomenclatura viene regulada por el International Committee on Systematic and Evolutionary Bacteriology (ICSB) a través del International Code on Nomenclature of Bacteria (ICNB). La Lista Aprobada de Denominaciones Bacterianas se publica y actualiza periódicamente desde 1980 en el International Journal of Systematic Bacteriology (IJSB), en su Approbed List of Bacterial Names. El Manual Bergey es un tratado que se ocupa de la identificación y clasificación de las bacterias. Su reconocimiento y prestigio mundial lo han convertido en la referencia y consulta obligada de todos los microbiólogos interesados en taxonomía e identificación.
Gustavo A. Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010

T. muy diferente de la primera edición. A consecuencia de ello. el análisis del rRNA. cocos grampositivos. Las propiedades empleadas para la diferenciación son: características morfológicas microscópicas. ha hecho posible el análisis filogenético de las bacterias. Los que no encajan perfectamente en alguna de las familias o secciones se les denomina «género de afiliación dudosa» o se incluyen en el de «otros géneros». Las especies no bien descritas. cocos y bacilos aerobios gramnegativos. publicaron un manual sobre características de las bacterias de interés médico conocidas hasta entonces. con pared celular gruesa. fisiologia y metabolismo. catedrático de bacteriología en la Universidad de Pennsylvania. Un carácter que se mantiene constante es el estudio de géneros y sus correspondientes especies. En 1984. etc. Tenericutes (procariotas. sin pared celular) y Mendosicutes (procariotas filogenéticamente anteriores a las divisiones mencionadas. patogenicidad y ecología. Este manual. plásmidos y bacteriófagos. Los volúmenes 4 y 5 están previstos para 2010. Gustavo A. espiroquetas. ha sido utilizado en muchos laboratorios de Microbiología de todo el mundo y ha ido actualizándose a lo largo de los años. grampositivas). En cada una de las 33 secciones que lo componen se engloban distintos rangos taxonómicos que varían considerablemente. la segunda edición del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology es fundamentalmente filogenética en vez de fenotípica. En 2001 apareció el primero de los cinco volúmenes de la segunda edición del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. En particular.2 Bloque temático III Bergey’s Manual En 1923. Algunos llegan a tratar de divisiones. El número de especies nombrada se ha duplicado. y hay más de 200 nuevos géneros descritos. morfología de las colonias y pigmentación. caracteristicas genéticas. en cada especie se incluye una cepa tipo. agrupa a todas las bacterias en un solo Reino: el Procaryotae. La clasificación propuesta por esta primera edición del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology está basada en la tinción de Gram. Las distintas secciones se han constituido sobre la base de caracteres descriptivos morfológicos y metabólicos. por ejemplo. en tanto que otros se ocupan de géneros.Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Laboratorio de Diagnóstico Clínico. condiciones de crecimiento y nutrición. y cuatro colaboradores más. y por consiguiente. estructura antigénica. Firmicutes (procariotas. se catalogan como species incertae sedis. el Bergey's Manual of Determinative Bacteriology. gramnegativas). Esta publicación constaba de cuatro volúmenes. 2º curso Taxonomía y Sistemática Bacterianas . 12 . Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010 . Ha habido un progreso considerable en el campo de la taxonomía bacteriana desde 1984. las bacterias se distribuyen en secciones. En esta primera edición de la nueva etapa. En 2005 se publicó el volumen 2 y en 2009 acaba de publicarse el volumen 3. que podía utilizarse para la identificación bacteriana. En general.2 U. Así. en el que se reconocen cuatro divisiones: Gracilicutes (procariotas. del DNA y de las proteínas. como las arquebacterias y otras). definidas sin cepa tipo. categorías taxonómicas ambas que son fundamentales en su estructuración. el año de la publicación del primer volumen del Bergey's Manual of Systematic and Bacteriology. hasta que apareció la novena y última edición en 1994. se publicó la primera edición de un manual enfocado más a la clasificación que a la identificación: el Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. con pared celular fina. neotipo o de referencia. David Bergey.

Neisseria. 2º curso Taxonomía y Sistemática Bacterianas . El último índice taxonómico publicado de la clasificación de bacterias se actualiza periódicamente y está a vuestra disposición en la página web del Manual Bergey : http://www. que apenas se han modificado. agrupadas en ocho secciones diferentes. el reino Proteobacteria agrupa a la mayor parte de las bacterias Gram negativas de importancia clínica. Campylobacter y Enterobacterias.2 Bloque temático III A diferencia de la primera edición. Streptococcus. Aquí estarán géneros como Staphylococcus. También podéis acceder a la página http://www. No tienen ningún factor en común. beta. Archaea y Bacteria. que podéis consultar en la página web http://www. pertenecen a este reino.bergeys. Clostridium y Bacillus Volumen IV: Contendrá una sola sección que agrupará a todos los Gram positivos con alto contenido en G+C Los géneros más conocidos de este volumen son Mycobacterium y Corynebacterium.Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Laboratorio de Diagnóstico Clínico. delta. Borrelia o Bacteroides A pesar de todos estos cambios y avances en los criterios de clasificación. Por este motivo se sigue utilizando sin mayores dificultades la novena edición del Bergey's Manual of Determinative Bacteriology. Haemophilus. incluso de virus. Pseudomonas. Nuestro interés se centrará en el Dominio Bacteria que posee un total de 25 Phylum. Volumen II: Proteobacterias.org (Taxonomics outlines Release 5. conocemos la organización de su estructura. En este volumen no hay casi ninguna bacteria de importancia clínica. Aunque la edición completa no estará disponible hasta dentro de un año. la identificación sigue basándose en la distinción entre géneros y especies. Enterococcus. Los géneros más importantes desde el punto de vista clínico son Chlamydia. debéis realizar la búsqueda de las características taxonómicas de la bacteria que os ha sido asignada para hacer la ficha.catalogueoflife. Dividido en cinco secciones (alfa. la clasificación de los procariotas se estructura en dos dominios. Legionella.0 May 2004) Sobre este archivo. como las Cianobacterias. 12 . Volumen III: Tratará sobre los Firmicutes. Gustavo A. Treponema.Publications Volumen I: Trata del dominio Archaea en su totalidad y de algunas bacterias Gram negativas especiales. gamma y épsilon proteobacterias).T. que podéis bajaros libremente.org que os permitirá ver la clasificación taxonómica actualizada de todos los seres vivos. Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010 . bacterias Gram negativas .bergeys. El Volumen V trata de otras bacterias Gram negativas (Actinobacterias).org . Brucella. grupo de Gram positivos con bajo contenido en G+C.3 U.

trata específicamente de un aspecto de taxonomía bacteriana: la identificación de las bacterias. no contiene información detallada de las especies. 2º curso Taxonomía y Sistemática Bacterianas .Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Laboratorio de Diagnóstico Clínico. El capítulo V proporciona un listado de los grupos que existen en cada una de las cuatro categorías y una breve descripción de los tipos de bacterias contenidos en cada grupo Paso 5: ¿A qué género pertenece el microorganismo aislado? La mayoría de los grupos descritos en el Manual proporcionan una o más tablas o claves indicando las características que pueden ser usadas para diferenciar los géneros dentro del grupo. Paso 1: La naturaleza de los esquemas de identificación bacteriana El lector debe leer el capítulo II de este libro para familiarizarse con los principios generales usados en identificación bacteriana. y a las cuales no concierne la clasificación (ordenación de microorganismos en taxones). Paso 2: ¿El microorganismo aislado es eucariota o procariota? Este manual es usado para la identificación de bacterias (procariotas). En cambio. (p. Además. ej. Este libro ha sido diseñado especialmente para aquellas personas que están comprometidas inicialmente en la identificación de las bacterias. no incluye esquemas de identificación para ciertos grupos de géneros o especies porque alguno de ellos requiere métodos muy sofisticados para el cultivo y/o identificación.4 U. Por ejemplo. Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010 . las bacterias pueden dividirse en cuatro grandes categorías: I. Eubacterias carentes de pared celular IV. no contiene la abundancia de información descriptiva sobre géneros y especies que proporciona el Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. los siguientes seis pasos proporcionan una aproximación a esta tarea.T.ej. el siguiente paso es determinar en que grupo se puede encuadrar el microorganismo. Paso 3: ¿A qué categoría de bacterias pertenece el microorganismo? De forma práctica. no debería ser considerada una versión resumida de éste último. Eubacterias Gram-positivas que tienen pared celular III. Además. el microorganismo a identificar debe ser una bacteria en vez de un eucariota microscópico (moho. Eubacterias Gram-negativas que tienen pared celular II. Paso 4: ¿A qué grupo pertenece el microorganismo aislado? Tras la correcta asignación del microorganismo a su categoría bacteriana. ni información concerniente a la clasificación o nomenclatura de las bacterias. 12 . En consecuencia. levadura. alga o protozoo). ¿Cómo usar el Bergey's Manual of Determinative Bacteriology? Asumiendo que el lector tiene un microorganismo aislado y desea identificarlo. ha sido actualizado con vistas a los diversos cambios de nomenclatura y nuevos taxones que han sido descritos desde que los volúmenes del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology fueron publicados. El capítulo III proporciona una tabla de características que diferencian procariotas de eucariotas. especies de Bacillus). Arqueobacterias El capítulo IV proporciona características que permiten la diferenciación de estas cuatro categorías. o métodos para el enriquecimiento o aislamiento de diversas especies. las Rickettsias) o carecen de suficientes características diferenciales (p.2 Bloque temático III Capítulo I del BMDB: Introducción y uso del Manual Aunque la novena edición del Bergey's Manual of Determinative Bacteriology contiene mucha información derivada de los cuatro volúmenes de la primera edición del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Paso 6: ¿A que especie pertenece el microorganismo aislado? La mayoría de las descripciones de los géneros están acompañados por una o varias tablas que permiten la diferenciación de las especies contenidas en los géneros Gustavo A. Aunque este libro contiene muchos datos necesarios para la identificación bacteriana.

aunque pueda existir una cierta similitud. por esta razón ofrecen los medios necesarios para la identificación presuntiva y rápida de las bacterias. se han desarrollado una gran variedad de galerías rápidas y adecuados para usar en la identificación de diversos taxones. la composición lipídica celular o la hibridación de ácidos nucleicos. mientras que la identificación puede basarse sobre caracteres fenotípicos que se correlacionan bien con la información genética. Estas particularidades ideales de un sistema de identificación no siempre pueden ser posibles.5 U. 2º curso Taxonomía y Sistemática Bacterianas . la identificación puede basarse no en unos pocos tests. sobre todo aquellos de importancia médica. pueden ser realizados sencilla y rápidamente y generalmente suelen ser muy específicos. siendo reconocido como diferente de otros microorganismos). En tales casos. está basado en uno o más caracteres o sobre un patrón de caracteres que todos los miembros del grupo tienen y que otros grupos no tienen. puede ser necesario acudir a procedimientos relativamente complicados para conseguir una identificación correcta procedimientos tales como la electroforesis de proteínas celulares en gel de poliacrilamida (PAGE). y es necesaria la confirmación de la identificación por test bioquímicos o fisiológicos adicionales.Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Laboratorio de Diagnóstico Clínico. los caracteres escogidos para un procedimiento de identificación deben ser fácilmente determinables. Un esquema de identificación para un grupo de microorganismos será establecido solo después de que el grupo haya sido clasificado inicialmente (es decir. por ejemplo. a menudo tienen enorme valor para la identificación. Los caracteres usados no son generalmente aquellos que se utilizan en la clasificación del grupo. Para disminuir la necesidad de inocular un gran número de medios en tubo. Las reacciones serológicas. las técnicas de anticuerpos fluorescentes. mientras que aquellos que son usados para la clasificación pueden ser bastante difíciles de determinar (tales como los valores de homología del DNA). Su especificidad no es del 100%.T. Los caracteres estudiados deberían ser también pocos en cantidad. la clasificación puede estar basada en un estudio de hibridación del ADN/ADN. En algunos géneros y especies. tal y como sucede en el estudio de la taxonomía numérica. que generalmente tienen un valor limitado en la clasificación. En general. mientras que la clasificación puede involucrar un gran número de características. y otros métodos serológicos. Gustavo A. particularmente con géneros o especies que no son susceptibles de ser caracterizados por los tradicionales test bioquímicos o fisiológicos. 12 . sino sobre un patrón dado por la aplicación de un batería completa de tests.2 Bloque temático III Capítulo II: La naturaleza de los esquemas de clasificación bacterianos Los esquemas de identificación no son esquemas de clasificación. Los test de aglutinación en porta. Los miembros de la familia Enterobacteriaceae representan un ejemplo típico de esto. Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010 .

Sections I-XIV Volume II: The Proteobacteria. Volume IV : Sections 26-33 Kingdom Procaryotae . and Deeply Branching Genera. Spirochaetes. Bacteroides and Fusobacteria. The Cyanobacteria .V Volume I: The Archaea. Bergey's Manual of Determinative Bacteriology.6 U.2 Bloque temático III Historia del Manual Bergey's Bergey's Manual of Determinative Bacteriology By David H. Section XXIII Volume V: The Planctomycetes.Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Laboratorio de Diagnóstico Clínico. Volume III : Sections 18-25 IV. Volume II : Sections 12-17 III. Phototrophs.T. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. First edition Volumes I-IV I.Division IV Mendosicutes 1994 . Fibrobacteres. Sections XV-XIX Section XV: alpha subdivision Section XVI: beta subdivision Section XVII: gamma subdivision Section XVIII: delta subdivision Section XIX: epsilon subdivision Volume III: The Low G + C Gram Positives.Division III Tenericutes . 2º curso Taxonomía y Sistemática Bacterianas .Division I Gracilicutes . Volumes I . Volume I : Sections 1-11 II. 19 parts in total Kingdom Procaryote . Cyanobacteria. Sections XXIV-XXXI • • • • • - - Gustavo A.Division II Firmicutes . Ninth edition 2001.Division I. Bergey (1860-1937) • • • • • • • • • The first edition in 1923 The second edition in 1925 The third edition in 1930 1934 the 4th 1939 the fifth 1948 the sixth 1957 the seventh 1966 Index Bergeyana 1974 The eighth edition. 2nd edition. 12 . Sections XX-XXII Volume IV: The High G + C Gram Positives.Division II. Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010 . Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. The Bacteria (19 parts) 1977 Abbreviated edition 1981 Supplement to Index Bergeyana 1984.

1. 35 Grupos englobados en cuatro grandes categorías de Bacterias Categoría I (Eubacterias Gram-negativas que tienen pared celular). Grupos 17-29.Generos con esporangio multilocular 24 .Bacterias fotosintéticas anoxigénicas 11 . .2 Bloque temático III 1994 Novena edición.Metabolizadoras de sulfato extremadamente termofílicas e hipertermofílicas (*) Grupos importantes en patología infecciosa humana Gustavo A. 12 . anaerobicos.Metanógenos 32 . 17 * Cocos Gram-positivos 18 * Cocos y bacilos Gram-positivos formadores de esporas 19 * Bacilos Gram-positivos no formadores de esporas con morfología regular 20 * Bacilos Gram-positivos no formadores de esporas con morfología irregular 21 * Mycobacterias 22 * Actinomycetos nocardioformes 23 . . . 2º curso Taxonomía y Sistemática Bacterianas .Thermomonospora y géneros relacionados 28 .Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Laboratorio de Diagnóstico Clínico. Grupo 30. no frutescentes 16 .Otros Géneros Categoría III (Eubacterias carentes de pared celular: Mycoplasmas o Mollicutes). Grupos 1-16. * Bacilos Gram-negativos anaerobicos facultativos 6.Streptomycetos y géneros relacionados 26 .T. 31 .Cocos anaeróbicos Gram-negativos 9 * Rickettsias y Chlamydias 10 .Bacterias Gram-negativas curvadas no móviles o rararamente móviles 4. Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010 .Bacterias deslizantes frutescentes: Myxobacteriales Categoría II (Eubacterias Gram-positivas que tienen pared celular). * Cocos y bacilos Gram-negativos aeróbicos o microaerófilos 5.Maduromycetos 27 . helicoidales o vibrioides 3.Bacterias deslizantes no fotosintéticas.(Halobacteria) Archaeobacteria extremadamente halofílicas 34 .Bacterias con vaina 15 .Bacterias quimiolitotroficas aeróbicas y microorganismos relacionados 13 .Bacterias con apéndice y/o que geman 14 .Espiroquetas 2. * Bacilos Gram-negativos.Archaeobacteria sin pared celular 35 . *.Thermoactinomycetos 29 . rectos.7 U. curvados. y helicoidales 7. Grupos 31-35. 30 * Mycoplasmas Categoría IV (Archaeobacteria).Actinoplanetos 25 . * Bacterias Gram-negativas aeróbicas o microaerófilas. móviles.Bacterias fotosintéticas oxigénicas 12 .Archaeal reductoras de sulfato 33 .Bacterias desasimiladoras de azufre o reductoras de sulfatos 8.

Straight. Dissimilatory sulfate. Groups 1-16.T. 30 Mycoplasmas The Category IV (Archaeobacteria).Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Laboratorio de Diagnóstico Clínico. Nonfruiting Gliding Bacteria 16 Fruiting Gliding Bacteria: The Myxobacteria The Category II (Gram-positive eubacteria that have cell walls). Nonsporing Gram-positive Rods 21 The Mycobacteria 22 Nocardioform Actinomycetes 23 Genera with Multilocular sporangia 24 Actinoplanetes 25 Streptomycetes and related genera 26 Maduromycetes 27 Thermomonospora and related genera 28 Thermoactinomycetes 29 Other Genera The Category III (Cell wall-less eubacteria: The mycoplasmas or mollicutes). Gram-negative. Aerobic/microaerophilic. 17 Gram-positive Cocci 18 Endospore-forming Gram-positive Rods and Cocci 19 Regular.or sulfur-reducing Bacteria 8 Anaerobic Gram-negative Cocci 9 The Rickettsias and Chlamydias 10 Anoxygenic Phototrophic Bacteria 11 Oxygenic phototrophic Bacteria 12 Aerobic Chemolithotrophic bacteria and associated organisms 13 Budding and/or appendaged Bacteria 14 Sheathed Bacteria 15 Nonphotosynthetic. Gram-negative aerobic/microaerophilic Rods and Cocci 5. The Spirochetes 2. Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010 .2 Bloque temático III 1994 Ninth edition. 31 The Methanogens 32 Archaeal sulfate reducers 33 Extremely halophilic archaeobacteria (Halobacteria) 34 Cell wall-less archaeobacteria 35 Extremely thermophilic and hyperthermophilic S0-metabolizers Gustavo A. 35 Groups within 4 major categories of Bacteria The Category I (Gram-negative eubacteria that have cell walls). and Helical Rods 7. Gram-negative curved bacteria 4. Helical/Vibrioid Gram-negative bacteria 3. Anaerobic. Facultatively Anaerobic Gram-negative Rods 6. Groups 17-29. 2º curso Taxonomía y Sistemática Bacterianas . Nonmotile (or rarely motile). Nonsporing Gram-positive Rods 20 Irregular. Curved. Group 30. 1. Groups 31-35. 12 . Motile.8 U.

Los microbiólogos asignan los nombres a los microorganismos mediante el sistema binomial. La especie de los organismos superiores consiste en grupos de poblaciones naturales que se reproducen entre sí. Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010 . El nombre de especie (epíteto) se escribe en minúscula. aunque no tiene por qué ser el miembro más representativo de la especie. mostrando entre sí un grado elevado de semejanza fenotípica general. pero solo aquellas que hayan sido publicadas por el International Journal of Systematic Bacteriology son las que tienen validez. morfológicas (morfotipo) o antigénicas (serotipo). Consta de dos partes: género y especie. Los taxonomistas que trabajan con organismos superiores definen el término especie de forma distinta a los microbiólogos.T.2 Bloque temático III Rangos taxonómicos El anterior sistema de clasificación establecía las siguientes categorías taxonómicas: Reino División Clase Orden Familia Género Especie (subclase) (suborden) (tribu) (subgénero) (subesp ecie) En la última edición del Manual Bergey las categorías taxonómicas utilizadas son las siguientes: Dominio Phylum Clase Orden Familia Género Especie (subclase) (suborden) (tribu) (subgénero) (subespecie) Las secciones o los grupos utilizados en el Bergey's son categorías informales utilizadas para dividir el sistema de clasificación en partes manejables. La primera letra del nombre de género se escribe siempre con mayúscula. Una especie de cada género es considerada la especie tipo. Una cepa de cada especie se designa como la cepa tipo. Una especie bacteriana puede definirse como un conjunto de cepas que. 12 . Una cepa es una población de microorganismos que desciende de un único organismo o de un aislamiento en cultivo puro.Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Laboratorio de Diagnóstico Clínico. 2º curso Taxonomía y Sistemática Bacterianas . Las cepas de una misma especie pueden diferenciarse ligeramente por características bioquímicas (biotipo). El epíteto de especie más antiguo de un organismo en particular tiene prioridad y es el que debe utilizarse. El epíteto de especie es un nombre estable mientras que el de género puede cambiar si el organismo se asigna a otro género a la luz de nueva información. aunque en realidad existe un grado considerable de subjetividad al asignar las especies a los géneros. Gustavo A. El nombre del microorganismo debe ser latinizado y escribirse en cursiva o subrayado. difieren en muchas características de otros grupos de cepas relacionados. Esta definición fracasa en los microorganismos porque su reproducción no es sexual. Suele tratarse de una de las primeras cepas estudiadas y a menudo está más caracterizada que otras cepas. Un género es un grupo bien definido de una o más especies que está claramente separado de otros géneros. El grupo taxonómico básico en taxonomía microbiana es la especie. En la literatura científica un microorganismo ha podido tener diferentes denominaciones a lo largo del tiempo.9 U.

* Secuenciación de ácidos nucleicos Es el más complejo pero el más exacto de todos los procedimientos. aunque muestran pequeñas variaciones que se van acumulando a lo largo del tiempo. Sin embargo.T. Una vez determinada la secuencia de nucleótidos. y establecidas las comparaciones. Su estructura y función han permanecido constantes. cuando el porcentaje entre dos cepas difiere bastante. es decir. Para que dos cepas estén relacionadas deben asociar más del 70% de su ADN. * Hibridación de ácidos nucleicos Es un procedimiento que permite comprobar si cadenas simples de ADN de dos microorganismos diferentes pueden formar entre sí cadenas dobles estables. Es también un carácter taxonómico negativo. * Multilocus sequence typing Se basa en diferenciar las enzimas de una especie bacteriana mediante electroforesis (isoenzimas) Gustavo A. podemos asegurar que no pertenecen a la misma especie.2 Bloque temático III Principales características utilizadas en clasificación e identificación Características clásicas: Características morfológicas Forma celular Tamaño Estructura interna Inclusiones Esporas Estructura externa Cápsulas Flagelos Fimbrias Comportamiento ante tinciones Características de las colonias Movilidad Características fisiológicas Fuentes de C o N utilizadas Componentes de la pared celular Fuentes de energía utilizadas Productos de fermentación Tipo nutricional Temperatura de crecimiento Atmósfera de crecimiento Luminiscencia pH óptimo Tolerancia osmótica Metabolitos secundarios formados Sensibilidad a inhibidores Inclusiones de almacén Características ecológicas Patrón de ciclo vital Relaciones simbióticas Preferencias de hábitat Características moleculares * Ensayos de conjugación y transformación * Tamaño del genoma El PM del ADN bacteriano oscila entre 1 .10 U. * Secuencias de oligonucleótidos firma Son secuencias específicas cortas que aparecen en todos (o en la mayor parte) de los miembros de un determinado grupo taxonómico. * Composición de ácidos nucleicos Contenido G+C El contenido G+C de las bacterias oscila entre el 25 y el 75%. pero que tampoco relaciona a aquellos con tamaños similares. Por lo tanto se mide la cantidad de ADN que tienen en común las dos hebras complementarias. g /mol Es un carácter taxonómico negativo que no relaciona a aquellos con tamaños muy diferentes. y nunca (o raramente) están presentes en otros grupos. será el grado de similitud entre las secuencias de las rRNA 16S de dos bacterias lo que indique su relación evolutiva. 12 .Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Laboratorio de Diagnóstico Clínico. incluidos los más próximos filogenéticamente. Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010 . dos cepas con el mismo contenido G+C no tienen por qué estar relacionadas necesariamente.109 y 8 . * Oligonucleótidos del rRNA 16S El rRNA 16S es un polirribonucleótido de unos 1500 nt.109. presente en los ribosomas de todas las bacterias y que tiene una antigüedad de millones de años. Solo es útil para clasificación y no para identificación. 2º curso Taxonomía y Sistemática Bacterianas . pues permite la comparación total de los genomas bacterianos.

Debido a que el rRNA contiene secuencias variables y constantes.Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Laboratorio de Diagnóstico Clínico. Los rRNA son ideales para los estudios de evolución y parentesco microbianos. y refleja tanto como sea posible la naturaleza biológica de los organismos. El desarrollo de los ordenadores ha hecho posible el estudio de muchos atributos y muchas cepas simultáneamente. dichas características pueden utilizarse para construir un sistema de clasificación. ocurren de forma relativamente aleatoria y aumentan linealmente con el tiempo. Se cree que las secuencias de muchos rRNA y proteínas cambian lentamente con el tiempo sin destruir ni alterar gravemente sus funciones. basado en relaciones evolutivas más que en semejanzas generales. mientras que las moléculas rápidamente cambiantes se emplean para el seguimiento de la especiación. mayor lejanía evolutiva habrá entre ambos organismos. El sistema de clasificación más sencillo. Además las diferentes moléculas y distintas partes de la misma molécula pueden cambiar a velocidades diferentes. o pueden agruparse en función de probables relaciones evolutivas para generar un sistema filogenético. Por este motivo se los considera indicadores evolutivos.2 Bloque temático III Sistemas de clasificación Una vez que se han recogido las características de los microorganismos desde el punto de vista taxonómico. que determina la concordancia de caracteres que presentan esos dos organismos. 12 . ya que en este caso cuanto mayor sea la variación en la secuencia constante.T. puesto que son elementos esenciales de los ribosomas. Muchos taxonomistas sostienen que la clasificación más natural es aquella que presenta el mayor contenido informativo. Gustavo A. debido probablemente a la crucial y constante función que desempeñan. Existen dos formas generales de elaborar un sistema de clasificación. La secuenciación de los genomas completos de los microorganismos y la comparación de los mismos permitirá establecer más eficazmente las semejanzas y diferencias evolutivas entre ellos.11 U. Es el sistema de clasificación que utilizó Linneo. Una clasificación fenética compara muchos rasgos sin suponer que ciertas características son más importantes que otras. Su estructura apenas se modifica con el paso del tiempo. Se supone que estos cambios son selectivamente neutrales. estructura los organismos en grupos cuyos miembros comparten muchas características. es posible comparar tanto microorganismos estrechamente relacionados como de parentesco muy lejano. Por eso las moléculas muy conservadas como el rRNA se utilizan para seguir los cambios evolutivos a gran escala temporal. se calcula para cada par de organismos del grupo un coeficiente de asociación. 2º curso Taxonomía y Sistemática Bacterianas . El otro sistema de clasificación es el filogenético. Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010 . En la actualidad este sistema de clasificación está basado en el análisis de la secuencia del rRNA 16S de la subunidad 30S de los ribosomas bacterianos. Es evidente que la mejor clasificación es la que se desarrolla por comparación del mayor número posible de atributos. Una vez realizado el análisis de caracteres. denominado clasificación natural. El proceso comienza con una determinación de la presencia o ausencia de caracteres seleccionados en el grupo de microorganismos que son objeto de estudio. Los organismos que comparten muchas características constituyen un grupo único o taxón. Deben compararse cientos de caracteres para poder establecer una clasificación precisa y fiable. dando lugar a lo que se conoce como taxonomía numérica o adansoniana. Los organismos pueden agruparse en función de similitudes globales para formar un sistema fenético.

Está claro que encontrar un término medio que satisfaga ambas necesidades permitirá hacer las identificaciones de una manera rápida. y no solamente por su apariencia. Por un lado la identificación. Por eso.bioquímicas. Bibliografía Microbiología. La clasificación de las bacterias se basa. efectiva y relativamente barata. L. en la mayoría de los niveles.. los caracteres fenotípicos de más fácil determinación son los estructurales y anatómicos que pueden observarse directamente. de sus genotipos. fisiológicas o ecológicas .2 Bloque temático III Sistemas de identificación Las especies bacterianas deberían caracterizarse basándose en la descripción completa de sus fenotipos o. El número de experiencias posibles por realizar es extremadamente grande y. necesita la caracterización de muchos rasgos bacterianos. Por ello. Prescott et . en atributos funcionales. 4ª ed. incluso la descripción del fenotipo es fragmentaria. 2º curso Taxonomía y Sistemática Bacterianas . en grado mucho mayor que la de cualquier otro grupo de seres vivos. Pero por otro. Stanier et . la mayor parte de las bacterias solo pueden identificarse por lo que hacen a nivel bioquímico. 12 . De aquí que la clasificación biológica continúe. Editorial Reverté Microbiología.. Por regla general. y la caracterización de genotipos incompleta.T.Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Laboratorio de Diagnóstico Clínico. 2ª ed. Eso representa un problema adicional para el microbiólogo. en la mayor parte de los grupos de seres vivos. Su extremada simplicidad estructural implica que se disponga de un rango demasiado reducido de caracteres para poder hacer una caracterización adecuada.M. la realización de un elevado número de pruebas incrementa notablemente tanto el coste de la identificación como el tiempo dedicado a cada una de ellas. ya que. aunque todas ellas pongan de manifiesto alguna característica. para ser fiable. El estudio de estas propiedades funcionales de la bacteria lleva aparejada la realización de experimentos. casi enteramente basada en propiedades estructurales. Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010 . No existe una forma clara de superar esta dificultad. R.que permitan tener más datos que poder comparar y añadir a estos rasgos estructurales. no todas van a ser necesariamente significativas desde el punto de vista taxonómico.. mejor incluso. Pero la clasificación de las bacterias constituye una excepción..Y. McGraw Hill Interamericana Gustavo A.12 U. Pero la práctica taxonómica no llega a esos ideales. sean estructurales o bioquímicos. los taxónomos bacterianos se han visto forzados a buscar otros tipos de propiedades . en el sentido de contribuir a la diferenciación del microorganismo objeto de estudio de otros pertenecientes a grupos relacionados.