Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Laboratorio de Diagnóstico Clínico.

2º curso

Taxonomía y Sistemática Bacterianas - 1 U.T. 12 - 2 Bloque temático III

Taxonomía y Sistemática Bacterianas
Introducción
Uno de los aspectos más fascinantes y atractivos de los seres vivos es su extraordinaria diversidad. Parece que la naturaleza haya logrado conseguir prácticamente cualquier modo de forma, tamaño, fisiología y estilo de vida. Debido a esta desconcertante diversidad de los organismos vivos, es deseable clasificarlos u ordenarlos en grupos, en función de sus semejanzas. La taxonomía se define como la ciencia de la clasificación biológica. En un sentido más amplio, se compone de tres partes independientes pero interrelacionadas: clasificación, nomenclatura e identificación. La clasificación es la estructuración de los organismos en grupos o taxones, en función de sus semejanzas o de su parentesco evolutivo. La nomenclatura es la rama de la taxonomía que se ocupa de la asignación de nombres a grupos taxonómicos o microorganismos individualizados, de conformidad con normas publicadas y aceptadas por toda la comunidad científica internacional. La importancia de la nomenclatura radica fundamentalmente en que nos permite referirnos a un microorganismo sin necesidad de describir todas sus características. La nomenclatura es, lógicamente, un proceso previo a la clasificación. La identificación constituye el lado práctico de la taxonomía y consiste determinar a qué taxón o grupo, previamente establecido por la clasificación, pertenece un microorganismo particular aislado. El término sistemática a menudo se emplea para referirse a la taxonomía, aunque taxonomistas la definen como "el estudio científico de los organismos cuyo objetivo caracterizarlos y agruparlos de forma ordenada". Todo estudio de la naturaleza microorganismos, cuando los conocimientos adquiridos se aplican a la taxonomía, forman la sistemática. muchos final es de los parte de

La taxonomía microbiana se encuentra actualmente en un proceso de cambio continuo, debido a la aplicación de técnicas de análisis molecular para el estudio de los microorganismos que aportan nueva y abundante información que permite la definición de nuevos criterios de clasificación. Aun cuando estos avances han generado gran excitación en la comunidad científica y en la literatura especializada, no deja de ser menos cierto que los enfoques más tradicionales siguen siendo válidos ya que se siguen utilizando en muchos laboratorios. La nomenclatura viene regulada por el International Committee on Systematic and Evolutionary Bacteriology (ICSB) a través del International Code on Nomenclature of Bacteria (ICNB). La Lista Aprobada de Denominaciones Bacterianas se publica y actualiza periódicamente desde 1980 en el International Journal of Systematic Bacteriology (IJSB), en su Approbed List of Bacterial Names. El Manual Bergey es un tratado que se ocupa de la identificación y clasificación de las bacterias. Su reconocimiento y prestigio mundial lo han convertido en la referencia y consulta obligada de todos los microbiólogos interesados en taxonomía e identificación.
Gustavo A. Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010

En 1984. y cuatro colaboradores más. publicaron un manual sobre características de las bacterias de interés médico conocidas hasta entonces. El número de especies nombrada se ha duplicado. con pared celular gruesa. Ha habido un progreso considerable en el campo de la taxonomía bacteriana desde 1984. ha sido utilizado en muchos laboratorios de Microbiología de todo el mundo y ha ido actualizándose a lo largo de los años. patogenicidad y ecología.Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Laboratorio de Diagnóstico Clínico. La clasificación propuesta por esta primera edición del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology está basada en la tinción de Gram. En particular. condiciones de crecimiento y nutrición. Este manual. Las propiedades empleadas para la diferenciación son: características morfológicas microscópicas. gramnegativas).2 U. la segunda edición del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology es fundamentalmente filogenética en vez de fenotípica. 12 . en el que se reconocen cuatro divisiones: Gracilicutes (procariotas. En 2005 se publicó el volumen 2 y en 2009 acaba de publicarse el volumen 3. como las arquebacterias y otras). plásmidos y bacteriófagos. Tenericutes (procariotas. neotipo o de referencia. el año de la publicación del primer volumen del Bergey's Manual of Systematic and Bacteriology. y por consiguiente. Los que no encajan perfectamente en alguna de las familias o secciones se les denomina «género de afiliación dudosa» o se incluyen en el de «otros géneros». Los volúmenes 4 y 5 están previstos para 2010. Esta publicación constaba de cuatro volúmenes. definidas sin cepa tipo. David Bergey. sin pared celular) y Mendosicutes (procariotas filogenéticamente anteriores a las divisiones mencionadas. grampositivas). Algunos llegan a tratar de divisiones. se catalogan como species incertae sedis. fisiologia y metabolismo. el Bergey's Manual of Determinative Bacteriology. Así. Gustavo A. 2º curso Taxonomía y Sistemática Bacterianas . Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010 . del DNA y de las proteínas. con pared celular fina. Firmicutes (procariotas. caracteristicas genéticas. en cada especie se incluye una cepa tipo. por ejemplo. A consecuencia de ello. En 2001 apareció el primero de los cinco volúmenes de la segunda edición del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. se publicó la primera edición de un manual enfocado más a la clasificación que a la identificación: el Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Las distintas secciones se han constituido sobre la base de caracteres descriptivos morfológicos y metabólicos. morfología de las colonias y pigmentación. ha hecho posible el análisis filogenético de las bacterias. Las especies no bien descritas. En cada una de las 33 secciones que lo componen se engloban distintos rangos taxonómicos que varían considerablemente. que podía utilizarse para la identificación bacteriana. Un carácter que se mantiene constante es el estudio de géneros y sus correspondientes especies. categorías taxonómicas ambas que son fundamentales en su estructuración. En esta primera edición de la nueva etapa. estructura antigénica. En general. y hay más de 200 nuevos géneros descritos.2 Bloque temático III Bergey’s Manual En 1923. las bacterias se distribuyen en secciones.T. cocos y bacilos aerobios gramnegativos. catedrático de bacteriología en la Universidad de Pennsylvania. cocos grampositivos. hasta que apareció la novena y última edición en 1994. muy diferente de la primera edición. el análisis del rRNA. en tanto que otros se ocupan de géneros. espiroquetas. etc. agrupa a todas las bacterias en un solo Reino: el Procaryotae.

incluso de virus. En este volumen no hay casi ninguna bacteria de importancia clínica. Nuestro interés se centrará en el Dominio Bacteria que posee un total de 25 Phylum. Gustavo A. El Volumen V trata de otras bacterias Gram negativas (Actinobacterias). delta. agrupadas en ocho secciones diferentes. No tienen ningún factor en común. gamma y épsilon proteobacterias). Los géneros más importantes desde el punto de vista clínico son Chlamydia.Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Laboratorio de Diagnóstico Clínico.2 Bloque temático III A diferencia de la primera edición. la identificación sigue basándose en la distinción entre géneros y especies. Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010 .catalogueoflife. Haemophilus. debéis realizar la búsqueda de las características taxonómicas de la bacteria que os ha sido asignada para hacer la ficha. bacterias Gram negativas . conocemos la organización de su estructura. beta. que apenas se han modificado. Aquí estarán géneros como Staphylococcus.org que os permitirá ver la clasificación taxonómica actualizada de todos los seres vivos. Aunque la edición completa no estará disponible hasta dentro de un año. el reino Proteobacteria agrupa a la mayor parte de las bacterias Gram negativas de importancia clínica. Streptococcus. Campylobacter y Enterobacterias.bergeys. Pseudomonas. como las Cianobacterias. El último índice taxonómico publicado de la clasificación de bacterias se actualiza periódicamente y está a vuestra disposición en la página web del Manual Bergey : http://www. Borrelia o Bacteroides A pesar de todos estos cambios y avances en los criterios de clasificación.T. Treponema. que podéis consultar en la página web http://www. Clostridium y Bacillus Volumen IV: Contendrá una sola sección que agrupará a todos los Gram positivos con alto contenido en G+C Los géneros más conocidos de este volumen son Mycobacterium y Corynebacterium. Enterococcus. Neisseria. Legionella.0 May 2004) Sobre este archivo. Archaea y Bacteria.Publications Volumen I: Trata del dominio Archaea en su totalidad y de algunas bacterias Gram negativas especiales. 12 .org . grupo de Gram positivos con bajo contenido en G+C. la clasificación de los procariotas se estructura en dos dominios. que podéis bajaros libremente.3 U. Dividido en cinco secciones (alfa. Volumen III: Tratará sobre los Firmicutes.org (Taxonomics outlines Release 5.bergeys. Por este motivo se sigue utilizando sin mayores dificultades la novena edición del Bergey's Manual of Determinative Bacteriology. También podéis acceder a la página http://www. pertenecen a este reino. 2º curso Taxonomía y Sistemática Bacterianas . Volumen II: Proteobacterias. Brucella.

Aunque este libro contiene muchos datos necesarios para la identificación bacteriana. y a las cuales no concierne la clasificación (ordenación de microorganismos en taxones). En consecuencia.T. Arqueobacterias El capítulo IV proporciona características que permiten la diferenciación de estas cuatro categorías. Paso 4: ¿A qué grupo pertenece el microorganismo aislado? Tras la correcta asignación del microorganismo a su categoría bacteriana. especies de Bacillus). Por ejemplo. ha sido actualizado con vistas a los diversos cambios de nomenclatura y nuevos taxones que han sido descritos desde que los volúmenes del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology fueron publicados.Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Laboratorio de Diagnóstico Clínico. 2º curso Taxonomía y Sistemática Bacterianas . Eubacterias Gram-positivas que tienen pared celular III. alga o protozoo). los siguientes seis pasos proporcionan una aproximación a esta tarea. Paso 1: La naturaleza de los esquemas de identificación bacteriana El lector debe leer el capítulo II de este libro para familiarizarse con los principios generales usados en identificación bacteriana. Eubacterias carentes de pared celular IV. Paso 6: ¿A que especie pertenece el microorganismo aislado? La mayoría de las descripciones de los géneros están acompañados por una o varias tablas que permiten la diferenciación de las especies contenidas en los géneros Gustavo A. las Rickettsias) o carecen de suficientes características diferenciales (p. levadura.4 U. no contiene la abundancia de información descriptiva sobre géneros y especies que proporciona el Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Paso 3: ¿A qué categoría de bacterias pertenece el microorganismo? De forma práctica. ni información concerniente a la clasificación o nomenclatura de las bacterias. ¿Cómo usar el Bergey's Manual of Determinative Bacteriology? Asumiendo que el lector tiene un microorganismo aislado y desea identificarlo. El capítulo V proporciona un listado de los grupos que existen en cada una de las cuatro categorías y una breve descripción de los tipos de bacterias contenidos en cada grupo Paso 5: ¿A qué género pertenece el microorganismo aislado? La mayoría de los grupos descritos en el Manual proporcionan una o más tablas o claves indicando las características que pueden ser usadas para diferenciar los géneros dentro del grupo. Además.ej. no incluye esquemas de identificación para ciertos grupos de géneros o especies porque alguno de ellos requiere métodos muy sofisticados para el cultivo y/o identificación. 12 . ej. (p. o métodos para el enriquecimiento o aislamiento de diversas especies.2 Bloque temático III Capítulo I del BMDB: Introducción y uso del Manual Aunque la novena edición del Bergey's Manual of Determinative Bacteriology contiene mucha información derivada de los cuatro volúmenes de la primera edición del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. las bacterias pueden dividirse en cuatro grandes categorías: I. El capítulo III proporciona una tabla de características que diferencian procariotas de eucariotas. Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010 . Este libro ha sido diseñado especialmente para aquellas personas que están comprometidas inicialmente en la identificación de las bacterias. el microorganismo a identificar debe ser una bacteria en vez de un eucariota microscópico (moho. Paso 2: ¿El microorganismo aislado es eucariota o procariota? Este manual es usado para la identificación de bacterias (procariotas). trata específicamente de un aspecto de taxonomía bacteriana: la identificación de las bacterias. Eubacterias Gram-negativas que tienen pared celular II. no contiene información detallada de las especies. Además. no debería ser considerada una versión resumida de éste último. el siguiente paso es determinar en que grupo se puede encuadrar el microorganismo. En cambio.

sobre todo aquellos de importancia médica. Los miembros de la familia Enterobacteriaceae representan un ejemplo típico de esto.Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Laboratorio de Diagnóstico Clínico. Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010 . Un esquema de identificación para un grupo de microorganismos será establecido solo después de que el grupo haya sido clasificado inicialmente (es decir. Los caracteres estudiados deberían ser también pocos en cantidad. la clasificación puede estar basada en un estudio de hibridación del ADN/ADN. Su especificidad no es del 100%. 2º curso Taxonomía y Sistemática Bacterianas .2 Bloque temático III Capítulo II: La naturaleza de los esquemas de clasificación bacterianos Los esquemas de identificación no son esquemas de clasificación. pueden ser realizados sencilla y rápidamente y generalmente suelen ser muy específicos. a menudo tienen enorme valor para la identificación. por ejemplo. los caracteres escogidos para un procedimiento de identificación deben ser fácilmente determinables. que generalmente tienen un valor limitado en la clasificación. tal y como sucede en el estudio de la taxonomía numérica. las técnicas de anticuerpos fluorescentes. En tales casos. Las reacciones serológicas. mientras que aquellos que son usados para la clasificación pueden ser bastante difíciles de determinar (tales como los valores de homología del DNA). se han desarrollado una gran variedad de galerías rápidas y adecuados para usar en la identificación de diversos taxones. está basado en uno o más caracteres o sobre un patrón de caracteres que todos los miembros del grupo tienen y que otros grupos no tienen. Estas particularidades ideales de un sistema de identificación no siempre pueden ser posibles.T. Los test de aglutinación en porta. puede ser necesario acudir a procedimientos relativamente complicados para conseguir una identificación correcta procedimientos tales como la electroforesis de proteínas celulares en gel de poliacrilamida (PAGE). la identificación puede basarse no en unos pocos tests. por esta razón ofrecen los medios necesarios para la identificación presuntiva y rápida de las bacterias. aunque pueda existir una cierta similitud. 12 . la composición lipídica celular o la hibridación de ácidos nucleicos. En algunos géneros y especies. Gustavo A. Para disminuir la necesidad de inocular un gran número de medios en tubo. Los caracteres usados no son generalmente aquellos que se utilizan en la clasificación del grupo. siendo reconocido como diferente de otros microorganismos). y es necesaria la confirmación de la identificación por test bioquímicos o fisiológicos adicionales.5 U. mientras que la clasificación puede involucrar un gran número de características. mientras que la identificación puede basarse sobre caracteres fenotípicos que se correlacionan bien con la información genética. sino sobre un patrón dado por la aplicación de un batería completa de tests. En general. y otros métodos serológicos. particularmente con géneros o especies que no son susceptibles de ser caracterizados por los tradicionales test bioquímicos o fisiológicos.

First edition Volumes I-IV I. 12 . Spirochaetes.Division III Tenericutes .6 U.V Volume I: The Archaea. 2nd edition. Ninth edition 2001. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Bacteroides and Fusobacteria.Division II Firmicutes . Phototrophs. Sections XXIV-XXXI • • • • • - - Gustavo A. Volume I : Sections 1-11 II. Fibrobacteres.2 Bloque temático III Historia del Manual Bergey's Bergey's Manual of Determinative Bacteriology By David H. The Bacteria (19 parts) 1977 Abbreviated edition 1981 Supplement to Index Bergeyana 1984. and Deeply Branching Genera. 19 parts in total Kingdom Procaryote . Sections XV-XIX Section XV: alpha subdivision Section XVI: beta subdivision Section XVII: gamma subdivision Section XVIII: delta subdivision Section XIX: epsilon subdivision Volume III: The Low G + C Gram Positives. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Bergey (1860-1937) • • • • • • • • • The first edition in 1923 The second edition in 1925 The third edition in 1930 1934 the 4th 1939 the fifth 1948 the sixth 1957 the seventh 1966 Index Bergeyana 1974 The eighth edition. Section XXIII Volume V: The Planctomycetes. The Cyanobacteria .Division I.Division II.Division I Gracilicutes . Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010 .Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Laboratorio de Diagnóstico Clínico. Cyanobacteria. Volume IV : Sections 26-33 Kingdom Procaryotae . 2º curso Taxonomía y Sistemática Bacterianas . Sections XX-XXII Volume IV: The High G + C Gram Positives. Volumes I .Division IV Mendosicutes 1994 .T. Bergey's Manual of Determinative Bacteriology. Sections I-XIV Volume II: The Proteobacteria. Volume III : Sections 18-25 IV. Volume II : Sections 12-17 III.

1.Generos con esporangio multilocular 24 .Otros Géneros Categoría III (Eubacterias carentes de pared celular: Mycoplasmas o Mollicutes). * Bacilos Gram-negativos. y helicoidales 7.Espiroquetas 2.Metabolizadoras de sulfato extremadamente termofílicas e hipertermofílicas (*) Grupos importantes en patología infecciosa humana Gustavo A.T.Bacterias deslizantes no fotosintéticas. Grupos 31-35.Bacterias desasimiladoras de azufre o reductoras de sulfatos 8.Bacterias con vaina 15 .Thermomonospora y géneros relacionados 28 . . Grupos 17-29.Cocos anaeróbicos Gram-negativos 9 * Rickettsias y Chlamydias 10 .2 Bloque temático III 1994 Novena edición. 30 * Mycoplasmas Categoría IV (Archaeobacteria).Bacterias fotosintéticas anoxigénicas 11 . *.Bacterias deslizantes frutescentes: Myxobacteriales Categoría II (Eubacterias Gram-positivas que tienen pared celular).(Halobacteria) Archaeobacteria extremadamente halofílicas 34 . * Bacilos Gram-negativos anaerobicos facultativos 6.Thermoactinomycetos 29 . 12 . curvados. * Cocos y bacilos Gram-negativos aeróbicos o microaerófilos 5. 2º curso Taxonomía y Sistemática Bacterianas . Grupos 1-16. rectos.Archaeal reductoras de sulfato 33 . móviles.Metanógenos 32 .Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Laboratorio de Diagnóstico Clínico. Grupo 30. 17 * Cocos Gram-positivos 18 * Cocos y bacilos Gram-positivos formadores de esporas 19 * Bacilos Gram-positivos no formadores de esporas con morfología regular 20 * Bacilos Gram-positivos no formadores de esporas con morfología irregular 21 * Mycobacterias 22 * Actinomycetos nocardioformes 23 . no frutescentes 16 . Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010 . anaerobicos. 35 Grupos englobados en cuatro grandes categorías de Bacterias Categoría I (Eubacterias Gram-negativas que tienen pared celular). .Bacterias quimiolitotroficas aeróbicas y microorganismos relacionados 13 . * Bacterias Gram-negativas aeróbicas o microaerófilas.Actinoplanetos 25 .Maduromycetos 27 .Streptomycetos y géneros relacionados 26 .7 U. helicoidales o vibrioides 3.Archaeobacteria sin pared celular 35 . 31 .Bacterias fotosintéticas oxigénicas 12 .Bacterias Gram-negativas curvadas no móviles o rararamente móviles 4. .Bacterias con apéndice y/o que geman 14 .

12 . Motile. Gram-negative aerobic/microaerophilic Rods and Cocci 5. and Helical Rods 7.2 Bloque temático III 1994 Ninth edition. Dissimilatory sulfate. Nonsporing Gram-positive Rods 21 The Mycobacteria 22 Nocardioform Actinomycetes 23 Genera with Multilocular sporangia 24 Actinoplanetes 25 Streptomycetes and related genera 26 Maduromycetes 27 Thermomonospora and related genera 28 Thermoactinomycetes 29 Other Genera The Category III (Cell wall-less eubacteria: The mycoplasmas or mollicutes). Gram-negative curved bacteria 4. 2º curso Taxonomía y Sistemática Bacterianas . Nonfruiting Gliding Bacteria 16 Fruiting Gliding Bacteria: The Myxobacteria The Category II (Gram-positive eubacteria that have cell walls). Groups 31-35. Anaerobic.8 U. Straight. Aerobic/microaerophilic. Helical/Vibrioid Gram-negative bacteria 3. Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010 . 17 Gram-positive Cocci 18 Endospore-forming Gram-positive Rods and Cocci 19 Regular. Groups 17-29. 35 Groups within 4 major categories of Bacteria The Category I (Gram-negative eubacteria that have cell walls). Curved. Nonmotile (or rarely motile). Nonsporing Gram-positive Rods 20 Irregular. 31 The Methanogens 32 Archaeal sulfate reducers 33 Extremely halophilic archaeobacteria (Halobacteria) 34 Cell wall-less archaeobacteria 35 Extremely thermophilic and hyperthermophilic S0-metabolizers Gustavo A. The Spirochetes 2. Group 30.T. Gram-negative.Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Laboratorio de Diagnóstico Clínico. Facultatively Anaerobic Gram-negative Rods 6.or sulfur-reducing Bacteria 8 Anaerobic Gram-negative Cocci 9 The Rickettsias and Chlamydias 10 Anoxygenic Phototrophic Bacteria 11 Oxygenic phototrophic Bacteria 12 Aerobic Chemolithotrophic bacteria and associated organisms 13 Budding and/or appendaged Bacteria 14 Sheathed Bacteria 15 Nonphotosynthetic. 1. Groups 1-16. 30 Mycoplasmas The Category IV (Archaeobacteria).

La especie de los organismos superiores consiste en grupos de poblaciones naturales que se reproducen entre sí.9 U. pero solo aquellas que hayan sido publicadas por el International Journal of Systematic Bacteriology son las que tienen validez. Una cepa de cada especie se designa como la cepa tipo. Una cepa es una población de microorganismos que desciende de un único organismo o de un aislamiento en cultivo puro. Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010 . mostrando entre sí un grado elevado de semejanza fenotípica general. Los microbiólogos asignan los nombres a los microorganismos mediante el sistema binomial. El epíteto de especie más antiguo de un organismo en particular tiene prioridad y es el que debe utilizarse. Gustavo A. morfológicas (morfotipo) o antigénicas (serotipo). 12 . Una especie bacteriana puede definirse como un conjunto de cepas que. El nombre del microorganismo debe ser latinizado y escribirse en cursiva o subrayado. El nombre de especie (epíteto) se escribe en minúscula. aunque en realidad existe un grado considerable de subjetividad al asignar las especies a los géneros. 2º curso Taxonomía y Sistemática Bacterianas .Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Laboratorio de Diagnóstico Clínico. Los taxonomistas que trabajan con organismos superiores definen el término especie de forma distinta a los microbiólogos. En la literatura científica un microorganismo ha podido tener diferentes denominaciones a lo largo del tiempo. difieren en muchas características de otros grupos de cepas relacionados. Consta de dos partes: género y especie. aunque no tiene por qué ser el miembro más representativo de la especie. Esta definición fracasa en los microorganismos porque su reproducción no es sexual. El epíteto de especie es un nombre estable mientras que el de género puede cambiar si el organismo se asigna a otro género a la luz de nueva información. Suele tratarse de una de las primeras cepas estudiadas y a menudo está más caracterizada que otras cepas. Las cepas de una misma especie pueden diferenciarse ligeramente por características bioquímicas (biotipo).T. Una especie de cada género es considerada la especie tipo. La primera letra del nombre de género se escribe siempre con mayúscula. Un género es un grupo bien definido de una o más especies que está claramente separado de otros géneros.2 Bloque temático III Rangos taxonómicos El anterior sistema de clasificación establecía las siguientes categorías taxonómicas: Reino División Clase Orden Familia Género Especie (subclase) (suborden) (tribu) (subgénero) (subesp ecie) En la última edición del Manual Bergey las categorías taxonómicas utilizadas son las siguientes: Dominio Phylum Clase Orden Familia Género Especie (subclase) (suborden) (tribu) (subgénero) (subespecie) Las secciones o los grupos utilizados en el Bergey's son categorías informales utilizadas para dividir el sistema de clasificación en partes manejables. El grupo taxonómico básico en taxonomía microbiana es la especie.

Para que dos cepas estén relacionadas deben asociar más del 70% de su ADN.Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Laboratorio de Diagnóstico Clínico.109. * Multilocus sequence typing Se basa en diferenciar las enzimas de una especie bacteriana mediante electroforesis (isoenzimas) Gustavo A. Es también un carácter taxonómico negativo. pues permite la comparación total de los genomas bacterianos. Su estructura y función han permanecido constantes. Sin embargo. * Composición de ácidos nucleicos Contenido G+C El contenido G+C de las bacterias oscila entre el 25 y el 75%. y establecidas las comparaciones. * Secuenciación de ácidos nucleicos Es el más complejo pero el más exacto de todos los procedimientos.10 U. incluidos los más próximos filogenéticamente. Solo es útil para clasificación y no para identificación. g /mol Es un carácter taxonómico negativo que no relaciona a aquellos con tamaños muy diferentes. pero que tampoco relaciona a aquellos con tamaños similares. 12 . Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010 .2 Bloque temático III Principales características utilizadas en clasificación e identificación Características clásicas: Características morfológicas Forma celular Tamaño Estructura interna Inclusiones Esporas Estructura externa Cápsulas Flagelos Fimbrias Comportamiento ante tinciones Características de las colonias Movilidad Características fisiológicas Fuentes de C o N utilizadas Componentes de la pared celular Fuentes de energía utilizadas Productos de fermentación Tipo nutricional Temperatura de crecimiento Atmósfera de crecimiento Luminiscencia pH óptimo Tolerancia osmótica Metabolitos secundarios formados Sensibilidad a inhibidores Inclusiones de almacén Características ecológicas Patrón de ciclo vital Relaciones simbióticas Preferencias de hábitat Características moleculares * Ensayos de conjugación y transformación * Tamaño del genoma El PM del ADN bacteriano oscila entre 1 . dos cepas con el mismo contenido G+C no tienen por qué estar relacionadas necesariamente. será el grado de similitud entre las secuencias de las rRNA 16S de dos bacterias lo que indique su relación evolutiva. 2º curso Taxonomía y Sistemática Bacterianas . * Secuencias de oligonucleótidos firma Son secuencias específicas cortas que aparecen en todos (o en la mayor parte) de los miembros de un determinado grupo taxonómico.109 y 8 . y nunca (o raramente) están presentes en otros grupos. cuando el porcentaje entre dos cepas difiere bastante. podemos asegurar que no pertenecen a la misma especie. aunque muestran pequeñas variaciones que se van acumulando a lo largo del tiempo.T. * Hibridación de ácidos nucleicos Es un procedimiento que permite comprobar si cadenas simples de ADN de dos microorganismos diferentes pueden formar entre sí cadenas dobles estables. presente en los ribosomas de todas las bacterias y que tiene una antigüedad de millones de años. es decir. Una vez determinada la secuencia de nucleótidos. * Oligonucleótidos del rRNA 16S El rRNA 16S es un polirribonucleótido de unos 1500 nt. Por lo tanto se mide la cantidad de ADN que tienen en común las dos hebras complementarias.

ya que en este caso cuanto mayor sea la variación en la secuencia constante. 2º curso Taxonomía y Sistemática Bacterianas . El desarrollo de los ordenadores ha hecho posible el estudio de muchos atributos y muchas cepas simultáneamente. dando lugar a lo que se conoce como taxonomía numérica o adansoniana. se calcula para cada par de organismos del grupo un coeficiente de asociación. Los organismos pueden agruparse en función de similitudes globales para formar un sistema fenético. Se cree que las secuencias de muchos rRNA y proteínas cambian lentamente con el tiempo sin destruir ni alterar gravemente sus funciones. Los rRNA son ideales para los estudios de evolución y parentesco microbianos. Se supone que estos cambios son selectivamente neutrales. La secuenciación de los genomas completos de los microorganismos y la comparación de los mismos permitirá establecer más eficazmente las semejanzas y diferencias evolutivas entre ellos.Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Laboratorio de Diagnóstico Clínico. Es evidente que la mejor clasificación es la que se desarrolla por comparación del mayor número posible de atributos. Una clasificación fenética compara muchos rasgos sin suponer que ciertas características son más importantes que otras. El sistema de clasificación más sencillo. Debido a que el rRNA contiene secuencias variables y constantes. Muchos taxonomistas sostienen que la clasificación más natural es aquella que presenta el mayor contenido informativo. es posible comparar tanto microorganismos estrechamente relacionados como de parentesco muy lejano. Una vez realizado el análisis de caracteres. 12 . Por eso las moléculas muy conservadas como el rRNA se utilizan para seguir los cambios evolutivos a gran escala temporal. o pueden agruparse en función de probables relaciones evolutivas para generar un sistema filogenético. dichas características pueden utilizarse para construir un sistema de clasificación. mientras que las moléculas rápidamente cambiantes se emplean para el seguimiento de la especiación. En la actualidad este sistema de clasificación está basado en el análisis de la secuencia del rRNA 16S de la subunidad 30S de los ribosomas bacterianos. El proceso comienza con una determinación de la presencia o ausencia de caracteres seleccionados en el grupo de microorganismos que son objeto de estudio. Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010 . puesto que son elementos esenciales de los ribosomas.11 U. El otro sistema de clasificación es el filogenético. estructura los organismos en grupos cuyos miembros comparten muchas características. Existen dos formas generales de elaborar un sistema de clasificación. ocurren de forma relativamente aleatoria y aumentan linealmente con el tiempo. denominado clasificación natural. Gustavo A. Por este motivo se los considera indicadores evolutivos. y refleja tanto como sea posible la naturaleza biológica de los organismos. Además las diferentes moléculas y distintas partes de la misma molécula pueden cambiar a velocidades diferentes.2 Bloque temático III Sistemas de clasificación Una vez que se han recogido las características de los microorganismos desde el punto de vista taxonómico. que determina la concordancia de caracteres que presentan esos dos organismos. Deben compararse cientos de caracteres para poder establecer una clasificación precisa y fiable. Los organismos que comparten muchas características constituyen un grupo único o taxón. debido probablemente a la crucial y constante función que desempeñan. basado en relaciones evolutivas más que en semejanzas generales.T. Su estructura apenas se modifica con el paso del tiempo. Es el sistema de clasificación que utilizó Linneo. mayor lejanía evolutiva habrá entre ambos organismos.

la mayor parte de las bacterias solo pueden identificarse por lo que hacen a nivel bioquímico. El estudio de estas propiedades funcionales de la bacteria lleva aparejada la realización de experimentos. la realización de un elevado número de pruebas incrementa notablemente tanto el coste de la identificación como el tiempo dedicado a cada una de ellas.T. Por ello. y la caracterización de genotipos incompleta.Fundamentos y técnicas de análisis microbiológicos Laboratorio de Diagnóstico Clínico.. R.2 Bloque temático III Sistemas de identificación Las especies bacterianas deberían caracterizarse basándose en la descripción completa de sus fenotipos o. Bibliografía Microbiología. Por eso. 2ª ed. efectiva y relativamente barata. sean estructurales o bioquímicos. Está claro que encontrar un término medio que satisfaga ambas necesidades permitirá hacer las identificaciones de una manera rápida. De aquí que la clasificación biológica continúe. incluso la descripción del fenotipo es fragmentaria. Pero la clasificación de las bacterias constituye una excepción. Por un lado la identificación. los caracteres fenotípicos de más fácil determinación son los estructurales y anatómicos que pueden observarse directamente. casi enteramente basada en propiedades estructurales. en la mayor parte de los grupos de seres vivos.Y. Por regla general. L. 4ª ed. Pero por otro. 12 . Editorial Reverté Microbiología. aunque todas ellas pongan de manifiesto alguna característica. Prescott et . Eso representa un problema adicional para el microbiólogo. La clasificación de las bacterias se basa. ya que. Su extremada simplicidad estructural implica que se disponga de un rango demasiado reducido de caracteres para poder hacer una caracterización adecuada.12 U. Díaz Martín Centro de Formación Profesional Instituto Villaverde Curso 2009-2010 . en el sentido de contribuir a la diferenciación del microorganismo objeto de estudio de otros pertenecientes a grupos relacionados.. McGraw Hill Interamericana Gustavo A. de sus genotipos. El número de experiencias posibles por realizar es extremadamente grande y. necesita la caracterización de muchos rasgos bacterianos.bioquímicas. Pero la práctica taxonómica no llega a esos ideales. en atributos funcionales. No existe una forma clara de superar esta dificultad. fisiológicas o ecológicas . y no solamente por su apariencia. 2º curso Taxonomía y Sistemática Bacterianas .M.. para ser fiable.que permitan tener más datos que poder comparar y añadir a estos rasgos estructurales. en grado mucho mayor que la de cualquier otro grupo de seres vivos. en la mayoría de los niveles. no todas van a ser necesariamente significativas desde el punto de vista taxonómico. los taxónomos bacterianos se han visto forzados a buscar otros tipos de propiedades .. Stanier et . mejor incluso.

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