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Lorena Goetschel
EJEMPLOS :
2 PROTEINAS L.GOETSCHEL
Conformacin D y L
La mayora de aa en la
naturaleza tienen
conformacin L
PROTEINAS L.GOETSCHEL 4
Nomenclatura de los C de los AA
5 PROTEINAS L.GOETSCHEL
Amino cidos
ESENCIALES DESDE EL PUNTO DE VISTA NUTRICIONAL (9)
(el ser humano NO los puede sintetizar)
Son : Leucina, Isoleucina, Valina, Treonina, Triptfano,
Metionina, Fenilalanina, Lisina, Histidina . (Arginina :
AA semiesencial ya que se sintetiza a ndices inadecuados durante
(20)
el crecimiento de los nios
NO ESENCIALES (11) : El ser humano los puede sintetizar
Son : Alanina, Arginina, Asparagina, Acido aspartico, Cistena ,
Acido Glutmico, Glutamina, Glicina, Prolina, Serina, Tirosina.
(Adems se encuentra la Hidroxiprolina e hidroxilisina que no se requieren
para la formacin de protenas peros se forma durante el procesamiento
postraduccional de colgeno).
6 PROTEINAS L.GOETSCHEL
Enlace peptdico
Los aminocidos se unen mediante un enlace peptdico para formar los pptidos y protena
El enlace peptdico se produce entre el grupo amino (NH2) y el grupo carboxilo (COOH)
7 PROTEINAS L.GOETSCHEL
8 PROTEINAS L.GOETSCHEL
MONOAMINO MONOCARBOXILICOS
(CON GRUPOS ALIFTICOS) pKa 1 : COOH
pKa 2 : NH3+
pKa 1 : 2,4
1 pKa 2 : 9,8
pKa 1 : 2,34
2 pKa 2 : 9,69
pKa 1 : 2,2
3 E pKa 2 : 9,7
4 E pKa 1 : 2,3
pKa 2 : 9,7
5 E pKa 1 : 2,3
pKa 2 : 9,8
9 PROTEINAS L.GOETSCHEL
MONOAMINO DICARBOXILICOS (ACIDOS) Y SUS
AMINAS
pKa 1 : 2,1
6 pKa 2 : 9,9
pKa3 : 3,9
pKa 1 : 2,1
7
pKa 2 : 8,8
pKa 1 : 2,1
8 pKa 2 : 9,5
pKa3 : 4,1
9
pKa 1 : 2,2
pKa 2 : 9,1
10 PROTEINAS L.GOETSCHEL
DIAMINO MONOCARBOXILICOS (BASICOS)
pKa 1 : 1,8
10 pKa 2 : 9,0
pKa3 : 12,5
pKa 1 : 2,2
11 E pKa 2 : 9,2
pKa3 : 10,8
pKa 1 : 1,8
12 E pKa 2 : 9,3
pKa3 : 6,0
11 PROTEINAS L.GOETSCHEL
AA CON R - OH
13
14 E
16 E
12 PROTEINAS L.GOETSCHEL
AROMTICOS E
17
18
19 E
IMINOCIDOS
20
13 PROTEINAS L.GOETSCHEL
Propiedades tampn
de la histidina
14 PROTEINAS L.GOETSCHEL
PROPIEDADES DE LOS AMINOACIDOS
Capacidad tampn
de la alanina
15 PROTEINAS L.GOETSCHEL
PROTENAS : ESTRUCTURA Y
FUNCIONES
Lorena Goetschel
Las PROTENAS Son compuestos orgnicos
compuestos por Carbono, Hidrgeno , Oxgeno y
Nitrgeno adems contienen otros elementos como Azufre
(metionina y cistena), Fe (Hb), Fsforo (ADN, ATP)
Pptidos (1,2-100)
-Fibrosas
-Colgenos: en tejidos conjuntivos, cartilaginosos
- Queratinas: En formaciones epidrmicas: pelos, uas, plumas, cuernos.
- Elastinas: En tendones y vasos sanguneos
- Fibronas: En hilos de seda, (araas, insectos)
19 PROTEINAS L.GOETSCHEL
Clases de Protenas
2. CONJUGADAS (Protedos) :
20 PROTEINAS L.GOETSCHEL
21 PROTEINAS L.GOETSCHEL
ENLACES PEPTDICOS
Serina Glicina Tirosina Alanina Leucina
AA 1
Campbell 23
Distribucin de aa en una protena
globular
El polipptido se pliega haciendo que los grupos apolares quedan
en el interior (AA: Val, Ile, Leu, Phe, Tyr, Trp) y los grupos
polares en la superficie hidrfila.
26 PROTEINAS L.GOETSCHEL
ESTRUCTURA PRIMARIA
La estructura primaria de pptidos y de protenas se refiere al
nmero lineal y al orden de los aminocidos presentes. La
convencin para la designacin del orden de los aminocidos
es que el extremo N-terminal (es decir, el extremo que lleva
el residuo con el grupo -amino libre) est al extremo
izquierdo (y es el aminocido nmero 1) y el extremo C-
terminal (es decir, el extremo con el residuo que contiene al
grupo -carboxilo libre) est a la derecha
27 PROTEINAS L.GOETSCHEL
ESTRUCTURAS PEPTDICAS
El nmero y el orden de los residuos aminocidos constituyen su estructura primaria.
Los prefijos como tri u octa denotan el nmero de residuos y por convencin, se escriben
con el residuo que porta el grupo amino libre a la izquierda
El enlace peptdico es rgido con una capacidad de rotacin limitada.
En las hlices el nmero de enlaces Hidrgeno es mximo, cada giro contiene 3,6
aminocidos, para lo que la cadena se enrosca en forma de hlice mediante enlaces de
hidrgeno intracatenarios formados entre el grupo -NH de un enlace peptdico y el
grupo -C=O del cuarto aminocido que le sigue
http://www.youtube.com/watch?v=cgCICHxI6yM&NR=1
ESTRUCTURA SECUNDARIA
arreglo ordenado de aminocidos en
una protena le confiere formas de
Enlaces de H
conformacin intramoleculares
29 PROTEINAS L.GOETSCHEL
ESTRUCTURA SECUNDARIA : HOJAS
BETA
La conformacin B se
caracteriza por ausencia de
enlaces intracatenarios que
conforman una cadena.
Varias cadenas B pueden
interactuar entre s
Las cadenas se pueden
disponer en forma paralela
(grupos amino y carboxilo
orientados en el mismo
sentido), o antiparalela
Las hlices alfa y las cadenas
beta se encuentran conectadas
por regiones llamadas bucles
Grficos : Bioqumica de Harper 28 edicin Giro entre 2 hojas
ESTRUCTURA TERCIARIA
Estructura tridimensional completa de las unidades
del polipptido de una protena dada. Se incluye en
esta descripcin la relacin espacial de diferentes
estructuras secundarias dentro de una cadena
polipeptdica y cmo estas estructuras secundarias por
ellas mismas se doblan en formas tridimensionales de
la protena
31 PROTEINAS L.GOETSCHEL
Caractersticas comunes de la
estructura terciaria
Las estructuras Hlice alfa
terciarias se
Hojas beta
identifican
mediante la Enzima triosa
conformacin de fosfato isomerasa
alfa hlice o (en rojo un anlogo
del sustrato 2-
lmina B, las que fosfoglicerato)
varan en
proporcin y
estructura de
acuerdo a la
Lisozima con sustrato
protena. (N-acetil quitopentaosa
(rojo)
36 PROTEINAS L.GOETSCHEL
ESTRUCTURA Y ACTIVIDAD BIOLGICA
Dentro de los pptidos (3-100 aa) se encuentran algunos con alta
especificidad y funciones como:
Mediadores locales
Antibiticos
Hormonas
Otras hormonas de mayor tamao como la somatotropina y la
prolactina
37 PROTEINAS L.GOETSCHEL
Ejemplo:
Insulina 51 aa
38 PROTEINAS L.GOETSCHEL
PRINCIPIOS GENERALES DEL
PLEGAMIENTO DE LAS PROTENAS
Actualmente se conocen la estructura primaria de unas
500.000 protenas
La determinacin de las estructuras terciarias presenta
dificultades.
Mtodo tradicional : cristalizacin de la protena y su estudio
por cristalografa de rayos X.
Otro mtodo es la espectroscopia por Resonancia Magntica
Se han dilucidado la estructura terciaria de unas 6000
protenas , lo que es muy poco comparado con la estructura
primaria y se han desarrollado mtodos informticos.
Identificacin de dominios y motivos estructurales
Las protenas de mayor tamao (ms de 200 AA) es frecuente la
existencia de regiones aisladas con estructuras plegadas propias,
unidas por un polipptido no estructurado.
Dominio proteco es una unidad modular bien definida que lleva a
cabo una funcin bioqumica especfica (d.funcional) o constituye
un componente estructural estable dentro del a estructura
proteca (d. estructural).
Motivo estructural es un pequeo segmento de la secuencia
proteca que tienen importancia con respecto a la estabilidad o a la
capacidad funcional de la protena.
Los dominios y motivos protecos se relacionan con la actividad
parcial de la protena, especialmente en las enzimas.
Ej : NAD desdhidrogenasa se une por un lado al NADH y por otro al sustrato
a oxidar , la unin a cada uno se produce en dominios diferentes.
CONCEPTO DE FAMILIAS DE PROTENAS
Se han detectado mediante la comparacin de sus estructuras
primarias y en otros casos segn el parecido de sus estructuras
terciarias
Ej las lipocalinas , que se unen a ligandos hidrfobos , ej : serpinas
(inhibidores de las serina proteinasas) , cuyas alteraciones pueden
dar lugar a transtornos de la coagulacin, efisema y cirrosis. :
Alfa antitripsina que inhibe la elastasa
Antitrombina que inhibe la trombina (coag. Sangunea)
Hemoglobina : Constitucin
Hemoglobina
Es el principal componente de los eritrocitos.
Peso molecular : 66.684 Daltons
Es la responsable del transporte eficaz de
los gases: O2 y CO2
Nivel normal de Hb en la sangre :
- en el hombre: 14-16 g / dl
- en la mujer: 13-15 g / dl
A concentraciones normales de Hb: el total del volumen
sanguneo transporta 210 ml de O2,es decir que cada
gramo de Hb es capaz de transportar 1.34 ml de O2.
Conformacin de las cadenas
La hemoglobina puede tener diferentes tipos de cadenas :
- ALFA : 141 aa
- BETA : 146 aa
- GAMMA : 146 aa
- DELTA : 146 aa
La Hb contiene 36 residuos de histidina amortigua pH
sanguneo, no. 58 : His distal, no, 87 : His proximal.
Entre las cadenas tambin existen diferencias de los residuos de
aa
CARACTERISTICAS DE LA PORCIN GLOBINA
Transporte de O2 en la sangre
Transporte de O2:
Unido a hemoglobina (97%) (=20 ml O2/100 ml sangre
normal)
Disuelto en plasma 3% (=0,3 ml O2/100 ml sangre)
Reacciones de carga y descarga
Reaccin de carga
Los eritrocitos con
desoxihemoglobina
a su paso por los pulmones
captan el O2
Desoxihemoglobina
(sin O2)
Oxihemoglobina
(con O2)
Reaccin de descarga
Los eritrocitos con Pulmones
oxihemoglobina descargan
DesoxiHb +O2 OxiHb
el O2 a los tejidos Tejidos
REACCIONES DE LA
HEMOGLOBINA:
Con O2 (oxgeno): oxihemoglobina
4 N de los anillos
pirrol
Histidina
proximal
Fe 3+ : 5 sitios-
no se une al O2
Efecto Bohr : respiracin
HEMOGLOBINA GLUCOSILADA (HbA1c)
La glucosa sangunea que entra a los eritrocitos produce la
glucosilacin de algunos grupos amino de la Hemoglobina.
La fraccin de HbA1c normalmente se ubica alrededor de 5% y es
proporcional a la concentracin de glucosa en la sangre.
La vida media de un eritrocito es de aproximadamente 60 das, la
concentracin de HbA1c refleja la concentracin media de la
glucosa sangunea durante las 6-8 semanas precedentes , por lo
que proporciona informacin valiosa en el tratamiento de diabetes
mellitus
La glucosa tambin se une a la albumina y forma en la mayor
proporcin la fructosamina glucosilada , cuya semivida es 3
semanas y refleja las variaciones de glucosilacin ms rpidamente
que la HbA1c
Propiedades de las Protenas
Especificidad : sus propiedades dependen de la estructura tridimensional
. Un pequeo cambio provoca cambios en la estructura primaria,
secundaria, terciaria, y por tanto prdida de la actividad biolgica.
62 PROTEINAS L.GOETSCHEL
CROMATOGRAFA DE INTERCAMBIO INICO
Para determinar la proporcin y la clase de los aa presentes en
lquidos biolgicos como suero o lquido cfalo raqudeo se puede
utilizar resinas de intercambio inico (catinico o aninico)
63 PROTEINAS L.GOETSCHEL
TAMAO DE LAS PROTENAS
Antiguamente se utilizaba el peso molecular, pero ahora se
prefiere la masa molecular (Mt) y se expresan :
La masa molecular de X protena es 10 5 Da o
El pptido de 16.000 Da
El Dalton es una unidad de masa que equivale a la
duodcima parte de la masa de un tomo de Carbono 12. El
kilodalton = 1000 Da
64 PROTEINAS L.GOETSCHEL
65 PROTEINAS L.GOETSCHEL
Bibliografa
Murray, Bender, Botham, Kennelly, Rodwell, Weil .- Harper Bioqumica ilustrada .- 28 Edicin, Ed.
McGraw Hill 2010
Campbell P, Smith A, Peters T .- Bioquimica ilustrada , 5 edicin, Barcelona Espaa 2006
Bioqumica mdica http://themedicalbiochemistrypage.org/spanish/spanish-index.html
Presentaciones Power Point del libro de Bioqumica de Lehninger Principios de Bioqumica
David L. Nelson y Michael M. Cox http://laguna.fmedic.unam.mx/lenpres/
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Protenas Plasmticas .- Universidad Nacional del Nordeste , Facultad de Medicina 2008
Ctedra de Bioqumica (en lnea) , fecha de consulta : 2 de octubre 2011.
http://med.unne.edu.ar/catedras/bioquimica/pdf/proteinas.pdf