Fundamentos y tcnicas de anlisis microbiolgicos Manual Bergey's - 1

Laboratorio de Diagnstico Clnico. 2 curso U.T. 12 - 0 Bloque temtico III

Manual de Bergey

En 1923, David Bergey, catedrtico de bacteriologa en la Universidad de Pennsylvania, y cuatro

colaboradores ms, publicaron un manual sobre caractersticas de las bacterias de inters mdico
conocidas hasta entonces, que poda utilizarse para la identificacin bacteriana. Este manual, el
Bergey's Manual of Determinative Bacteriology, ha sido utilizado en muchos laboratorios de
Microbiologa de todo el mundo y ha ido actualizndose a lo largo de los aos hasta que apareci la
novena y ltima edicin en 1994. (ver historia )

En 1984, se public la primera edicin de un manual enfocado ms a la clasificacin que a la

identificacin: el Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Esta nueva publicacin constaba de
cuatro volmenes que se fueron publicando en los siguientes cinco aos.

La clasificacin propuesta por esta primera edicin del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology
est basada en la tincin de Gram. As, agrupa a todas las bacterias en un solo Reino: el
Procaryotae, en el que se reconocen cuatro divisiones: Gracilicutes (procariotas, con pared celular,
gramnegativas), Firmicutes (procariotas, con pared celular, grampositivas), Tenericutes
(procariotas, sin pared celular) y Mendosicutes (procariotas filogenticamente anteriores a las
divisiones mencionadas, como las arquebacterias y otras)

En esta primera edicin de la nueva etapa, las bacterias se distribuyen en secciones. Las distintas
secciones se han constituido sobre la base de caracteres descriptivos morfolgicos y metablicos,
por ejemplo, espiroquetas, cocos y bacilos aerobios gramnegativos, cocos grampositivos, etc.

En cada una de las 33 secciones que lo componen se engloban distintos rangos taxonmicos que
varan considerablemente. Algunos llegan a tratar de divisiones, en tanto que otros se ocupan de
gneros. Un carcter que se mantiene constante es el estudio de gneros y sus correspondientes
especies, categoras taxonmicas ambas que son fundamentales en su estructuracin. Los que no
encajan perfectamente en alguna de las familias o secciones se les denomina gnero de afiliacin
dudosa o se incluyen en el de otros gneros. Las especies no bien descritas, definidas sin cepa
tipo, neotipo o de referencia, se catalogan como species incertae sedis.

Las propiedades empleadas para la diferenciacin son: caractersticas morfolgicas microscpicas,

morfologa de las colonias y pigmentacin, condiciones de crecimiento y nutricin, fisiologia y
metabolismo, caracteristicas genticas, plsmidos y bacterifagos, estructura antignica,
patogenicidad y ecologa. En general, en cada especie se incluye la cepa tipo.

Ha habido un progreso considerable en el campo de la taxonoma bacteriana desde 1984, el ao de

la publicacin del primer volumen del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. El nmero de
especies nombrada se ha duplicado, y hay ms de 170 nuevos gneros descritos. En particular, el
anlisis del rRNA, del DNA y de las protenas, ha hecho posible el anlisis filogentico de las
bacterias. A consecuencia de ello, la segunda edicin del Bergey's Manual of Systematic
Bacteriology ser fundamentalmente filogentica en vez de fenotpica, y por consiguiente, muy
diferente de la primera edicin.

En 2001 apareci el primero de los cinco volmenes de la segunda edicin del Bergey's Manual of
Systematic Bacteriology. Esta segunda edicin se publicar en cinco volmenes, y contendr ms
informacin ecolgica que clnica. Hasta ahora no se han publicado ms volmenes.

Gustavo A. Daz Martn. Profesor Tcnico de Formacin Profesional. Curso 2004-2005

I. E. S. Jaime Ferrn Cla. San Fernando de Henares. (28830 Madrid) Cdigo 28038616
Fundamentos y tcnicas de anlisis microbiolgicos Manual Bergey's - 2
Laboratorio de Diagnstico Clnico. 2 curso U.T. 12 - 0 Bloque temtico III

A diferencia de la primera edicin la clasificacin se resume en dos dominios, Archaea y Bacteria

que poseen en total 14 Reinos. La nueva edicin no estar disponible en su totalidad hasta dentro de
algunos aos (hasta la fecha solo se ha publicado el Volumen I), pero conocemos la organizacin de
su estructura, que transcribiremos a continuacin.

Volumen I:
Trata del dominio Archaea, en su totalidad y de algunas bacterias Gram negativas especiales, como
las Cianobacterias. En este volumen no hay casi ninguna bacteria de importancia clnica.

Volumen II:
Proteobacterias, bacterias Gram negativas . Dividido en cinco secciones (alfa, beta, delta, gamma y
psilon proteobacterias), el reino Proteobacteria agrupa a la mayor parte de las bacterias Gram
negativas de importancia clnica.
Neisseria, Brucella, Legionella, Pseudomonas, Haemophilus, Campylobacter y Enterobacterias,
pertenecen a este reino.

Volumen III:
Tratar sobre los Gram positivos con bajo contenido en G+C.
Aqu aparecern gneros como Staphylococcus, Streptococcus, Enterococcus, Clostridium y
Bacillus

Volumen IV:
Contendr una sola seccin que agrupar a todos los Gram positivos con alto contenido en G+C
Los gneros ms conocidos de este volumen sern Mycobacterium y Corynebacterium.

El Volumen V tratar de otras bacterias Gram negativas, agrupadas en ocho secciones diferentes.
No tienen ningn factor en comn. Los gneros ms importantes desde el punto de vista clnico
sern Chlamydia, Treponema, Borrelia o Bacteroides

A pesar de todos estos cambios y avances en los criterios de clasificacin, la identificacin sigue
basndose en la distincin entre gneros y especies, que apenas se han modificado. Por este motivo
podemos seguir utilizando sin mayores dificultades la novena edicin del Bergey's Manual of
Determinative Bacteriology (que adems es el nico que poseemos) hasta que se complete la
publicacin de la segunda edicin del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology

A pesar de que no disponemos de ms referencias sobre los restantes volmenes de la segunda

edicin, s podemos disponer de la clasificacin "oficial" que en ellos se recoger.

El ltimo ndice publicado de la clasificacin de bacterias se actualiz en abril del 2001 y est a
vuestra disposicin en la pgina web del Manual Bergey`s.

Una copia de este ndice est a vuestra disposicin en el Laboratorio de Microbiologa, y sobre
dicha copia debis establecer los rangos taxonmicos del microorganismo que os ha sido asignado.

Gustavo A. Daz Martn. Profesor Tcnico de Formacin Profesional. Curso 2004-2005

I. E. S. Jaime Ferrn Cla. San Fernando de Henares. (28830 Madrid) Cdigo 28038616
Fundamentos y tcnicas de anlisis microbiolgicos Manual Bergey's - 3
Laboratorio de Diagnstico Clnico. 2 curso U.T. 12 - 0 Bloque temtico III

Captulo I: Introduccin y uso del Manual

Aunque la novena edicin del Bergey's Manual of Determinative Bacteriology contiene mucha informacin
derivada de los cuatro volmenes del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, no debera ser
considerada una versin resumida de ste ltimo. En cambio, trata especficamente de un aspecto de
taxonoma bacteriana: la identificacin de las bacterias. Este libro ha sido diseado especialmente para
aquellas personas que estn comprometidas inicialmente en la identificacin de las bacterias, y a las cuales
no concierne la clasificacin (ordenacin de microorganismos en taxones). Adems, ha sido actualizado con
vistas a los diversos cambios de nomenclatura y nuevos taxones que han sido descritos desde que los
volmenes del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology fueron publicados.

Aunque este libro contiene muchos datos necesarios para la identificacin bacteriana, no contiene la
abundancia de informacin descriptiva sobre gneros y especies que proporciona el Bergey's Manual of
Systematic Bacteriology. Por ejemplo, no contiene informacin detallada de las especies, ni informacin
concerniente a la clasificacin o nomenclatura de las bacterias, o mtodos para el enriquecimiento o
aislamiento de diversas especies. Adems, no incluye esquemas de identificacin para ciertos grupos de
gneros o especies porque alguno de ellos requiere mtodos muy sofisticados para el cultivo y/o
identificacin. (p.ej. las rickettsias) o carecen de suficientes caractersticas diferenciales (p. ej. especies de
Bacillus).

Cmo usar el Bergey's Manual of Determinative Bacteriology?

Asumiendo que el lector tiene un microorganismo aislado y desea identificarlo, los siguientes seis pasos
proporcionan una aproximacin a esta tarea.

Paso 1: La naturaleza de los esquemas de identificacin bacteriana

El lector debe leer el captulo II de este libro para familiarizarse con los principios generales usados en
identificacin bacteriana.

Paso 2: El microorganismo aislado es eucariota o procariota?

Este manual es usado para la identificacin de bacterias (procariotas). En consecuencia, el microorganismo a
identificar debe ser una bacteria en vez de un eucariota microscpico (moho, levadura, alga o protozoo). El
captulo III proporciona una tabla de caractersticas que diferencian procariotas de eucariotas.

Paso 3: A qu categora de bacterias pertenece el microorganismo?

De forma prctica, las bacterias pueden dividirse en cuatro grandes categoras:
I. Eubacterias Gram-negativas que tienen pared celular
II. Eubacterias Gram-positivas que tienen pared celular
III. Eubacterias carentes de pared celular
IV. Arqueobacterias
El captulo IV proporciona caractersticas que permiten la diferenciacin de estas cuatro categoras.

Paso 4: A qu grupo pertenece el microorganismo aislado?

Tras la correcta asignacin del microorganismo a su categora bacteriana, el siguiente paso es determinar en
que grupo se puede encuadrar el microorganismo.
El captulo V proporciona un listado de los grupos que existen en cada una de las cuatro categoras y una
breve descripcin de los tipos de bacterias contenidos en cada grupo

Paso 5: A qu gnero pertenece el microorganismo aislado?

La mayora de los grupos descritos en el Manual proporcionan una o ms tablas o claves indicando las
caractersticas que pueden ser usadas para diferenciar los gneros dentro del grupo.

Paso 6: A que especie pertenece el microorganismo aislado?

La mayora de las descripciones de los gneros estn acompaados por una o varias tablas que permiten la
diferenciacin de las especies contenidas en los gneros
Gustavo A. Daz Martn. Profesor Tcnico de Formacin Profesional. Curso 2004-2005
I. E. S. Jaime Ferrn Cla. San Fernando de Henares. (28830 Madrid) Cdigo 28038616
Fundamentos y tcnicas de anlisis microbiolgicos Manual Bergey's - 4
Laboratorio de Diagnstico Clnico. 2 curso U.T. 12 - 0 Bloque temtico III

Captulo II: La naturaleza de los esquemas de clasificacin bacterianos

Los esquemas de identificacin no son los esquemas de clasificacin, aunque pueda existir una
cierta similitud. Un esquema de identificacin para un grupo de microorganismos ser establecido
solo despus de que el grupo haya sido clasificado inicialmente ( es decir, siendo reconocido como
diferente de otros microorganismos); est basado en uno o ms caracteres o sobre un patrn de
caracteres que todos los miembros del grupo tienen y que otros grupos no tienen.

Los caracteres usados no son generalmente aquellos que se utilizan en la clasificacin del grupo;
por ejemplo, la clasificacin puede estar basada en un estudio de hibridacin del DNA/DNA,
mientras que la identificacin puede basarse sobre caracteres fenotpicos que se correlacionan bien
con la informacin gentica.

En general, los caracteres escogidos para un procedimiento de identificacin deben ser fcilmente
determinables, mientras que aquellos que son usados para la clasificacin pueden ser bastante
difciles de determinar (tales como los valores de homologa del DNA).

Los caracteres estudiados deberan ser tambin pocos en cantidad, mientras que la clasificacin
puede involucrar un gran nmero de caractersticas, tal y como sucede en el estudio de la taxonoma
numrica.

Estas particularidades ideales de un sistema de identificacin no siempre puede ser posibles,

particularmente con gneros o especies que no son susceptibles de ser caracterizados por los
tradicionales test bioqumicos o fisiolgicos. En tales casos, puede ser necesario acudir a
procedimientos relativamente complicados para conseguir una identificacin correcta -
procedimientos tales como la electroforesis de protenas celulares en gel de poliacrilamida (PAGE),
la composicin lipdica celular o la hibridacin de cidos nucleicos.

Las reacciones serolgicas, que generalmente tienen un valor limitado en la clasificacin, a menudo
tienen enorme valor para la identificacin. Los test de aglutinacin en porta, las tcnicas de
anticuerpos fluorescentes, y otros mtodos serolgicos, pueden ser realizados sencilla y
rpidamente y generalmente suelen ser muy especficos; por esta razn ofrecen los medios
necesarios para la identificacin presuntiva y rpida de las bacterias. Su especificidad no es del
100%, y es necesaria la confirmacin de la identificacin por test bioqumicos o fisiolgicos
adicionales.

En algunos gneros y especies, la identificacin puede basarse no en unos pocos tests, sino sobre un
patrn dado por la aplicacin de un batera completa de tests. Los miembros de la familia
Enterobacteriaceae representan un ejemplo tpico de esto. Para disminuir la necesidad de inocular
un gran nmero de medios en tubo, se han desarrollado una gran variedad de sistemas multitest
rpidos y adecuados para usar en la identificacin de diversos taxones, sobre todo aquellos de
importancia mdica.

Gustavo A. Daz Martn. Profesor Tcnico de Formacin Profesional. Curso 2004-2005

I. E. S. Jaime Ferrn Cla. San Fernando de Henares. (28830 Madrid) Cdigo 28038616
Fundamentos y tcnicas de anlisis microbiolgicos Manual Bergey's - 5
Laboratorio de Diagnstico Clnico. 2 curso U.T. 12 - 0 Bloque temtico III

Historia del Manual Bergey's

Bergey's Manual of Determinative Bacteriology By David H. Bergey (1860-1937)

The first edition in 1923

The second edition in 1925
The third edition in 1930

1934 the 4th

1939 the fifth
1948 the sixth
1957 the seventh
1966 Index Bergeyana

1974 The eighth edition, 19 parts in total

Kingdom Procaryote
- Division I. The Cyanobacteria
- Division II. The Bacteria (19 parts)

1977 Abbreviated edition

1981 Supplement to Index Bergeyana

1984. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, First edition Volumes I-IV

I. Volume I : Sections 1-11
II. Volume II : Sections 12-17
III. Volume III : Sections 18-25
IV. Volume IV : Sections 26-33
Kingdom Procaryotae
- Division I Gracilicutes
- Division II Firmicutes
- Division III Tenericutes
- Division IV Mendosicutes

1994 . Bergey's Manual of Determinative Bacteriology. Ninth edition

2001. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2nd edition, Volumes I - V

- Volume I: The Archaea, Cyanobacteria, Phototrophs, and Deeply Branching Genera.
Sections I-XIV
- Volume II: The Proteobacteria. Sections XV-XIX
Section XV: alpha subdivision
Section XVI: beta subdivision
Section XVII: gamma subdivision
Section XVIII: delta subdivision
Section XIX: epsilon subdivision
- Volume III: The Low G + C Gram Positives.
Sections XX-XXII
- Volume IV: The High G + C Gram Positives.
Section XXIII
- Volume V: The Planctomycetes, Spirochaetes, Fibrobacteres, Bacteroides and Fusobacteria.
Sections XXIV-XXXI

Gustavo A. Daz Martn. Profesor Tcnico de Formacin Profesional. Curso 2004-2005

I. E. S. Jaime Ferrn Cla. San Fernando de Henares. (28830 Madrid) Cdigo 28038616
Fundamentos y tcnicas de anlisis microbiolgicos Manual Bergey's - 6
Laboratorio de Diagnstico Clnico. 2 curso U.T. 12 - 0 Bloque temtico III

1994 Novena edicin, 35 Grupos englobados en cuatro grandes categoras de Bacterias

Categora I
(Eubacterias Gram-negativas que tienen pared celular); Grupos 1-16.
1. *.Espiroquetas
2. * Bacterias Gram-negativas aerbicas o microaerfilas, mviles, helicoidales o vibrioides
3. - Bacterias Gram-negativas curvadas no mviles o rararamente mviles
4. * Cocos y bacilos Gram-negativos aerbicos o microaerfilos
5. * Bacilos Gram-negativos anaerobicos facultativos
6. * Bacilos Gram-negativos, anaerobicos, rectos, curvados, y helicoidales
7. - Bacterias desasimiladoras de azufre o reductoras de sulfatos
8. - Cocos anaerbicos Gram-negativos
9 * Rickettsias y Chlamydias
10 - Bacterias fotosintticas anoxignicas
11 - Bacterias fotosintticas oxignicas
12 - Bacterias quimiolitotroficas aerbicas y microorganismos relacionados
13 - Bacterias con apndice y/o que geman
14 - Bacterias con vaina
15 - Bacterias deslizantes no fotosintticas, no frutescentes
16 - Bacterias deslizantes frutescentes: Myxobacteriales

Categora II
(Eubacterias Gram-positivas que tienen pared celular); Grupos 17-29.
17 * Cocos Gram-positivos
18 * Cocos y bacilos Gram-positivos formadores de esporas
19 * Bacilos Gram-positivos no formadores de esporas con morfologa regular
20 * Bacilos Gram-positivos no formadores de esporas con morfologa irregular
21 * Mycobacterias
22 * Actinomycetos nocardioformes
23 - Generos con esporangio multilocular
24 - Actinoplanetos
25 - Streptomycetos y gneros relacionados
26 - Maduromycetos
27 - Thermomonospora y gneros relacionados
28 - Thermoactinomycetos
29 - Otros Gneros

Categora III
(Eubacterias carentes de pared celular: Mycoplasmas o Mollicutes); Grupo 30.
30 * Mycoplasmas

Categora IV
(Archaeobacteria); Grupos 31-35.
31 - Metangenos
32 - Archaeal reductoras de sulfato
33 - (Halobacteria) Archaeobacteria extremadamente haloflicas
34 - Archaeobacteria sin pared celular
35 - Metabolizadoras de sulfato extremadamente termoflicas e hipertermoflicas

(*) Grupos importantes en patologa infecciosa humana

Gustavo A. Daz Martn. Profesor Tcnico de Formacin Profesional. Curso 2004-2005

I. E. S. Jaime Ferrn Cla. San Fernando de Henares. (28830 Madrid) Cdigo 28038616
Fundamentos y tcnicas de anlisis microbiolgicos Manual Bergey's - 7
Laboratorio de Diagnstico Clnico. 2 curso U.T. 12 - 0 Bloque temtico III

1994 Ninth edition, 35 Groups within 4 major categories of Bacteria

The Category I
(Gram-negative eubacteria that have cell walls); Groups 1-16.
1. The Spirochetes
2. Aerobic/microaerophilic, Motile, Helical/Vibrioid Gram-negative bacteria
3. Nonmotile (or rarely motile), Gram-negative curved bacteria
4. Gram-negative aerobic/microaerophilic Rods and Cocci
5. Facultatively Anaerobic Gram-negative Rods
6. Gram-negative, Anaerobic, Straight, Curved, and Helical Rods
7. Dissimilatory sulfate- or sulfur-reducing Bacteria
8 Anaerobic Gram-negative Cocci
9 The Rickettsias and Chlamydias
10 Anoxygenic Phototrophic Bacteria
11 Oxygenic phototrophic Bacteria
12 Aerobic Chemolithotrophic bacteria and associated organisms
13 Budding and/or appendaged Bacteria
14 Sheathed Bacteria
15 Nonphotosynthetic, Nonfruiting Gliding Bacteria
16 Fruiting Gliding Bacteria: The Myxobacteria

The Category II
(Gram-positive eubacteria that have cell walls); Groups 17-29.
17 Gram-positive Cocci
18 Endospore-forming Gram-positive Rods and Cocci
19 Regular, Nonsporing Gram-positive Rods
20 Irregular, Nonsporing Gram-positive Rods
21 The Mycobacteria
22 Nocardioform Actinomycetes
23 Genera with Multilocular sporangia
24 Actinoplanetes
25 Streptomycetes and related genera
26 Maduromycetes
27 Thermomonospora and related genera
28 Thermoactinomycetes
29 Other Genera

The Category III

(Cell wall-less eubacteria: The mycoplasmas or mollicutes); Group 30.
30 Mycoplasmas

The Category IV
(Archaeobacteria); Groups 31-35.
31 The Methanogens
32 Archaeal sulfate reducers
33 Extremely halophilic archaeobacteria (Halobacteria)
34 Cell wall-less archaeobacteria
35 Extremely thermophilic and hyperthermophilic S0-metabolizers

Gustavo A. Daz Martn. Profesor Tcnico de Formacin Profesional. Curso 2004-2005

I. E. S. Jaime Ferrn Cla. San Fernando de Henares. (28830 Madrid) Cdigo 28038616