Tema XII: Vas metablicas y de transferencia de energa

Catabolismo y anabolismo. Vas catablicas, anablicas y anfiblicas. Ciclo de la

energa en las clulas. Distribucin intercelular de las enzimas y sistemas enzimticos.

El metabolismo

Es definido brevemente, como la suma total de las reacciones enzimticas que tienen
lugar en la clula. Cuatro son las funciones especficas del metabolismo:
Obtener energa qumica del entorno de los elementos orgnicos nutritivos o de la
luz solar
Convertir los elementos nutritivos exgenos en los precursores de los
componentes moleculares de las clulas.
Reunir los precursores para formar protenas, cidos nucleicos, lpidos y otros
componentes celulares.
Formar y degradar aquellas biomolculas necesarias para las funciones celulares
especializadas.

Las secuencias reaccinales del metabolismo son semejantes en todas las formas de
vida especialmente las que se conocen como rutas metablicas centrales.

Catabolismo y anabolismo

El metabolismo se divide en catabolismo y anabolismo:

El catabolismo: Es lo degradacin enzimtica, mediante reacciones de oxidacin,

de molculas nutritivas relativamente grandes (carbohidratos, lpidos y protenas)
procedentes del entorno de la clula o de sus propios depsitos de reservas
nutritivas, hasta transformarlas en molculas simples y menores, por ejemplo, cido
lctico, cido actico, CO 2 , amonaco o urea. El catabolismo va acompaado de
liberacin de energa libre, la cual se conserva en el ATP.
El anabolismo: Es la sntesis enzimtica de componentes celulares relativamente
grandes de la clula, ejemplo: polisacridos, cidos nucleicos, protenas, lpidos a
partir de molculas precursoras sencillas. Puesto que los procesos sintticos
provocan un aumento en el tamao y la complejidad de las estructuras, se necesita
la energa proporcionada por el enlace fosfato del ATP.

Tanto el catabolismo como el anabolismo son dos procesos simultneos e

interdependientes, que pueden analizarse por separado. Cada uno de los procesos
abarca la secuencia de reacciones enzimticas mediante las cuales se degrada o se
sintetiza el esqueleto covalente de una determinada biomolcula. Los intermediarios
qumicos de este proceso se denominan metabolitos, y este proceso metablico:
metabolismo intermedio. Acompaando a cada una de las reacciones qumicas del
metabolismo intermediario; tiene efecto un cambio de energa caracterstico. En algunas
de las etapas de las secuencias catablicas puede conservarse la energa qumica,
habitualmente en forma de energa del enlace fosfato y en ciertas etapas de las

1
secuencias anablicas puede utilizarse esa energa del enlace fosfato. Esta fase del
metabolismo se denomina acoplamiento energtico. El metabolismo intermedio y el
acoplamiento de energa estn obligatoriamente interconectados y son
interdependientes. Por ello, cuando examinamos los esquemas metablicos deberemos
analizar:
1. Las etapas de reaccin por las que la estructura covalente del precursor se
altera para formar el producto.
2. Los cambios de energa qumica que acompaan a esta conversin.

Transformaciones catablicas, anablicas y anfiblicas

La degradacin enzimtica de cada uno de los principales elementos nutritivos (hidratos
de carbono, lpidos y protenas) tiene lugar a travs de cierto nmero de reacciones
enzimticas consecutivas que se desarrollan en tres fases:
Fase I: En esta fase las grandes molculas de los elementos nutritivos se
degradan hasta los principales componentes. Los polisacridos son
degradados a pentosas o hexosas, los lpidos a cidos grasos, glicerina y
otros componentes, y las protenas a sus veinte aminocidos constitutivos.
Fase II: Los numerosos productos distintos de la Fase I son recogidos y
convertidos en un nmero pequeo de molculas ms sencillas. As, las
hexosas, las pentosas y la glicerina se degradan en el azcar fosforilado de
tres tomos de carbono, el gliceraldehdo-3-fosfato y despus hasta un
compuesto sencillo de dos tomos de carbono, la acetil-coenzima A. Los
aminocidos diferentes son tambin degradados a: acetil-coenzima A, alfa-
cetoglutarato, succinato, fumarato y oxalacetato.
Fase III: Los productos formados en la fase II pasan a la fase III que es el
camino comn final en el cual se oxidan a CO2.
El anabolismo tiene lugar tambin en tres fases, comenzando por las pequeas
molculas originadas en la tercera fase del catabolismo. Por ejemplo, la sntesis
proteica comienza en La Fase III, a partir de los alfa-cetocidos que son los precursores
de los aminocidos. En la Fase II los alfa-cetocidos son aminados por donadores de
grupos aminos y se forman los alfa-aminocidos y en la Fase I se renen los
aminocidos para producir cadenas peptdicas.
Aunque los caminos del catabolismo y el anabolismo no son idnticos la Fase III
constituye un camino central accesible a ambos. Esta senda central, que recibe el
nombre de anfiblica, desempea una doble funcin (amphi: ambos). La ruta anfiblica
puede utilizarse catablicamente para lograr la degradacin completa de pequeas
molculas producidas en la Fase II del catabolismo o puede utilizarse anablicamente
como precursora de molculas para la Fase II del anabolismo.

2
 Lpidos Polisacridos Protenas

Fase I
cidos grasos Hexosas
Aminocidos
glicerina Pentosas

Gliceraldehdo
3-fosfato

Fase II
Fosfoenol
piruvato

Piruvato

Acetil - C o A

citrato
oxalacetato

isocitrato
Fase III malato

Fumarato Alfa - cetoglutarato

Ciclo de los succinato

cidos tricarboxilos
CO 2

LA ENERGA EN LA CLULA

Las molculas orgnicas complejas, tales como la glucosa contienen mucha energa
potencial a causa de su elevado grado de ordenacin estructural; poseen una entropa
relativamente pequea. Cuando la molcula de glucosa se oxida y forma seis molculas
de CO 2 y seis de H2 O , sus tomos experimentan un aumento en el desorden. Como
resultado de esta transformacin, la molcula de glucosa experimenta una prdida de
energa libre que es energa til y capaz de realizar trabajo. La energa libre se conserva,
como energa qumica, especficamente como ATP. Dado que el ATP formado puede
difundirse hacia aquellos lugares en la clula en que se necesite su energa, constituye
una forma de transportar la energa. La energa qumica del ATP se libera despus,
durante la transferencia de su grupo o grupos fosfatos terminales, a determinadas
molculas de un aceptor especfico, que adquiere un nivel superior de energa y puede
realizar trabajo. Un segundo camino para transportar la energa qumica de las
reacciones de xido-reduccin del catabolismo a las reacciones anablicas, que
necesita de energa, es en forma de electrones. En las sntesis de algunas biomolculas
ricas en hidrgeno, tales como los cidos grasos y el colesterol, se requieren electrones
e hidrgeno para la reduccin de los enlaces dobles a simples. En La clula los

3
electrones son transportados enzimticamente desde las oxidaciones productoras de
electrones tales como los dobles enlaces carbono-carbono o carbono-oxgeno, mediante
coenzimas transportadoras de electrones, la ms importante es la nicotinamida-adenin-
dinucletido fosfato (NADP). El NADP desempea de este modo, el panel de
transportador de electrones ricos en energa desde las reacciones catablicas hasta las
reacciones anablicas que los necesitan.

Distribucin intracelular de las enzimas y de los sistemas enzimticos

Las diferentes enzimas y sistemas enzimticos se hallan localizados

caractersticamente, en una u otra organela o estructura intracelular de las clulas.
El sistema enzimtico glicoltico est localizado en el citoplasma mientras que las
enzimas implicadas en la oxidacin del piruvato, de los cidos grasos y de algunos
aminocidos estn en la mitocondria donde tambin se hallan las enzimas de la cadena
respiratoria y de la fosforilacin del ADP.
La ventaja de la compartimentacin la constituye el hecho de que separa reacciones
qumicamente incompatibles.
Por ejemplo, una clula puede realizar, a un mismo tiempo, la oxidacin de los cidos
grasos de cadena larga hasta el estado de cido actico y el proceso inverso de
reduccin del cido actico para formar cidos grasos de cadena larga. Estos procesos
qumicamente incompatibles se producen en diferentes partes de la clula; la oxidacin
en las mitocondrias y la reduccin en el citoplasma extramitocondrial.

Regulacin celular de las sendas metablicas

La velocidad del catabolismo de una clula no es controlada por la concentracin de los

elementos nutritivos del entorno, sino ms bien por sus necesidades energticas en
forma de ATP. La regulacin de una ruta metablica puede llevarse a cabo a varios
niveles. El tipo de regulacin ms sencilla implica los parmetros que afectan a las
velocidades de las reacciones enzimticas (pH, concentracin de enzima, concentracin
de cada intermediario, concentracin de iones metlicos y coenzimas esenciales, etc.).
El segundo mecanismo de regulacin consiste en la accin de enzimas reguladoras que
se hallan localizadas, habitualmente, en el comienzo o en proximidades de una
secuencia multienzimtica. El tercer nivel en que se ejerce la regulacin metablica es a
travs del control gentico de la velocidad de la sntesis enzimtica. En organismos
multicelulares superiores el control se ejerce a travs de sistemas endocrinos. Las
hormonas elaboradas por una glndula endocrina son mensajeros qumicos que
estimulan o inhiben actividades metablicas especficas en otros tejidos u rganos.

4
TEMA XIII: PRINCIPIOS DE BIOENERGETICA Y CICLO DEL ATP

Localizacin y propiedades del ATP y del ADP. Variacin de energa libre estndar de
las reacciones qumicas. Energa libre estndar de la hidrlisis del ATP. Compuesto con
enlace fosfato de bajo y alto nivel energtico. Vas enzimticas de la transferencia de
fosfato. Principio del intermediario comn. Otros ribonucletidos que participan en la
transferencia de energa en la clula 5' difosfato y 5' trifosfato. Papel del AMP y del
pirofosfato.

El sistema ATP - ADP acta como transportador de energa qumica, ya que el ADP es
capaz de aceptar un grupo fosfato en las reacciones acopladas productoras de energa
del catabolismo, y el ATP as formado puede ceder su grupo fosfato terminal, en otras
reacciones acopladas que requieren energa.
En este captulo examinaremos los principios qumicos y termodinmicos en que se
basa el funcionamiento del sistema ATP - ADP.

LOCALIZACION Y PROPIEDADES DEL ATP Y EL ADP

El ATP fue aislado por primera vez, en 1.929 por Fiske y Subbarow, de los extractos
cidos de msculo.
Su estructura se dedujo algunos aos despus, mediante experimentos de degradacin
y fue definitivamente confirmada por sntesis qumica total realizada por Todd y sus
colegas en 1948. Desde los inicios del descubrimiento, se sospech que el ATP
desempeaba un papel en la transferencia de energa celular pero recin en 1939-1941
Lipmann propuso que actuaba como medio principal de transferencia de la energa
qumica en la clula.
El ATP, el ADP y el AMP no son sustancias que existen solo en trazas; la suma de sus
concentraciones en la fase acuosa de los diversos tipos de clulas intactas oscila entre 2
y 15 mM. La concentracin de ATP es por lo comn, muy superior a la suma de las otras
dos concentraciones del AMP, habitualmente es la menor de las tres.
Estos nucletidos estn presentes no slo en el citoplasma, sino tambin en organelas
tales como mitocondrias y ncleo. La compartimentacin intracelular del sistema ATP
constituye una caracterstica importante en la regulacin celular del metabolismo.
A pH 7,0 tanto ATP como ADP son aniones muy cargados, el ATP posee cuatro
protones ionizables en su grupo de cido trifosfrico. Tres de los protones poseen
valores de pK (K = constante de disociacin) bajo entre 2 y3; por lo tanto a pH 7,0 estn
completamente disociados; el cuarto protn tiene un pK' de 6,5; por consiguiente a pH
7,0 se halla disociado en un 75%.

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 NH2

N
N ATP

N N
O O O
HO P O P O P OH 2 C O
OH OH OH
H H
H
H : hidrgenos que cede en su disociacin
OH OH

El ADP posee tres protones ionizables, dos de ellos estn completamente disociados a
pH 7,0 y el tercero que posee un pK' de 7,2 a pH 7,0 se halla disociado alrededor del
39%.
La elevada concentracin de cargas negativas en torno al grupo trifosfato del ATP
constituye un factor importante en su naturaleza de compuesto de alto contenido
energtico.
En la clula intacta existen muy pocas cantidades de ATP y de ADP en forma de
aniones libres, se hallan presentes en su mayor parte en forma de complejos Mg ATP y
Mg ADP a causa de la gran afinidad de los grupos pirofosfato para enlazar cationes
divalentes y de la elevada concentracin de in Mg en el fluido intracelular. La afinidad
del ATP por el Mg es unas diez veces mayor que la del ADP.
mg
-
O O O
-
Adenina Ribosa O P O P O P O mg-ATP
O O O
mg
O O
-
Adenina Ribosa O P O P O mg-ADP
O O

En muchas de las reacciones enzimticas en que participa el ATP como dador de

fosfato, su forma activa es la del complejo mg-ATP.
El ADP y el ATP pueden separarse y medirse con facilidad mediante electroforesis o por
cromatografa en capa fina.

PRINCIPIOS DE TERMODINAMICA QUIMICA

Una descripcin de las bases fsico-qumicas de la funcin del ATP en el ciclo energtico
de la clula, requiere un breve repaso de algunos principios de la termodinmica. El
anlisis termodinmico de los intercambios energticos se inicia por las siguientes
definiciones:
a. Sistema: Es el conjunto de materia que es objeto de nuestro estudio.

6
 b. Entorno: Toda materia del universo, aparte del sistema que se considera. En
el transcurso del proceso en estudio la energa puede pasar del sistema al
entorno, o viceversa.
c. Estado inicial: Es el contenido de energa del sistema y del entorno, al iniciar
el proceso que se analiza.
d. Estado final: Contenido de energa de sistema y entorno una vez que se ha
alcanzado el equilibrio.
El contenido de energa de cada estado es una funcin de diversas magnitudes
medibles (temperatura, presin, volumen, masa, etc.) que se formulan mediante una
ecuacin de estado. A partir de las medidas de los cambios de contenido de energa del
sistema y el entorno, a medida que el sistema evoluciona desde su estado inicial hasta
su estado final, puede realizarse un balance de energa.
(Bloques de cobre)

caliente frio Estado inicial

Estado de equilibrio

La primera ley de termodinmica es el principio de conservacin de la energa. La

energa no se crea ni se destruye, sino que se transforma en una u otra forma (ej.
calorfica, qumica, mecnica, etc.).
La segunda ley establece algunas limitaciones en los tipos de transformaciones
energticas que ocurren en los procesos fsicos-qumicos, y predice la direccin en que
es probable que ocurra un proceso determinado.
Establece que todos los procesos tienden a evolucionar en una direccin tal que la
entropa del sistema ms la del entorno, aumenta hasta alcanzar un estado de equilibrio.
Entropa: Se define como el grado de desorden.
Equilibrio: Se define como aquel estado en que no ocurre ningn cambio fsico o
qumico ulterior, y en el que la temperatura, la presin y la concentracin son uniformes
en todo el sistema.

UN SISTEMA DE EQUILIBRIO

1. Ha agotado su capacidad de realizar trabajo sobre su entorno,

2. El proceso no puede invertirse de modo espontneo y volver a su estado inicial, lo
cual requerir una disminucin de entropa. Un sistema desordenado al azar no se
reordena por si mismo espontneamente.
Los procesos que se realizan con aumento de entropa se denominan irreversibles. Los
procesos que tienen lugar sin cambio de entropa son reversibles.

Ejemplo: si tenemos bloques de piedra dispuestos al azar y queremos disponerlos de tal

modo que formen un arco la entropa o sea el grado de organizacin disminuye y es
reversible porque espontneamente sin cambio de entropa puede pasar del orden al

7
desorden (arco a bloques al azar).

entropa ( S) elevada (desorden) ( S) disminuye

irreversible
reversible
espontneo
endotrmico
exotrmico

S disminuye (orden) S aumenta

En reacciones qumicas los cambios de entropa ( S ) no siempre pueden medirse o

calcularse con facilidad.
Sin embargo, el cambio de entropa durante un proceso est relacionado
cuantitativamente con los cambios de la energa total del sistema por una tercera
funcin, llamada energa libre, mediante una ecuacin que combina la primera y la
segunda ley de termodinmica. Puesto que los cambios de la energa libre de las
reacciones qumicas pueden medirse con relativa facilidad, esta ecuacin resulta muy
til para predecir la direccin y el equilibrio de las reacciones qumicas. El cambio de
energa libre ( G ) cuando la temperatura y presin son constantes se define del
siguiente modo:

G H - T. S (1)

En la que H es la variacin de entalpa, T la temperatura absoluta y S variacin de

entropa. La variacin de entalpa ( H) que tambin se denomina cambio calorfico, se
define mediante la ecuacin:
H E PV (2)
E = variacin de le energa total del sistema.
P = presin
V = volumen

En los sistemas biolgicos las reacciones qumicas tienen lugar en disoluciones acuosas
diluidas, en las que la temperatura, presin y volumen permanecen constantes. En estas
condiciones, PV es cero, por lo tanto:
H E
Si sustituimos en la ecuacin (1)
G E - T. S
reordenamos la ecuacin:
E G T. S

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Con esta ecuacin vemos que a temperatura y presin constantes la variacin de
energa total del sistema ( E ) (que es equivalente al cambio calrico H) es la suma de
T.. S ms la variacin de la energa libre.
La variacin de energa libre puede definirse como aquella fraccin del cambio de
energa total del sistema disponible para realizar trabajo a medida que el sistema
evoluciona hacia su estado de equilibrio, a T y P constantes. Mientras el sistema se
aproxima al equilibrio, la energa libre disminuye hasta un valor mnimo.

VARIACION DE LA ENERGIA LIBRE ESTANDAR EN LAS REACCIONES QUIIMICAS

El cambio de energa libre que tiene lugar durante las reacciones qumicas se calcula
empleando una ecuacin que puede derivarse de la ley de equilibrio qumico. Para una
reaccin general del tipo:
aA + bB cC + dD (3)

en la que a, b, c y d son el nmero de molculas de A, B, C, y D que participan en la

reaccin. El cambio de energa libre ( G ) est dado por la ecuacin:

c d
C .D
G G RT ln a b
(4)
A .B

en la que los trminos A, B, C y D son las concentraciones molares de A, B, C, y D y a,

b, c y d son ahora los exponentes de sus concentraciones. R es la constante de los
gases (1.987 cal mol-1 grado-1); T la temperatura absoluta y G la variacin de energa
libre estndar.
Cuando la reaccin (3) se halla en equilibrio, independientemente de las
concentraciones iniciales de A, B, C y D prevalece la condicin que la energa libre es
mnima y no es posible ningn cambio ulterior; por tanto G 0 . Entonces:

c d
C .D
0 G RT ln a b
(5)
A .B
De donde:
c d
C .D
G RT ln a b
(6)
A .B

Puesto que la constante de equilibrio K'eq para la ecuacin (3) es:

c d
C .D
K' eq a b
(7 )
A .B

Podemos sustituir K'eq en la ecuacin (6) y obtener la ecuacin general:

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 G RT ln (K' eq)
O bien:
G 2.303 RT log10 (K' eq) (8)

Esta ecuacin nos muestra que G , la variacin de energa libre estndar de una
reaccin qumica, puede calcularse a partir de su constante de equilibrio. La G
constituye, por lo tanto, una constante termodinmica para una reaccin qumica dada.
Puede definirse de otro modo, que indica claramente su verdadero significado. La
variacin de energa libre estndar de una reaccin constituye, en realidad, la diferencia
existente entre la energa libre estndar de los reactivos y la energa libre estndar de
los productos, hallndose cada trmino ajustado a la estequiometra de la ecuacin de
reaccin:
G G productos G reaccionantes
Para la reaccin (3) ser:
G (c G C d G D ) (a G A b G B )
La energa libre estndar de un compuesto constituye la medida de la cantidad total de
energa libre que puede proporcionar por descomposicin completa.
Es importante comprender la diferencia que hay entre G , que es la variacin de
energa libre estndar, y G que es la variacin de energa libre medida o real. Esta
diferencia puede explicarse mejor utilizando una analoga. G es un valor constante
para una determinada reaccin a una temperatura tambin determinada.
Por otra parte, G vara con las concentraciones de los reaccionantes y de los
productos.
El valor de G nicamente es igual al de G cuando todos los reactivos y todos los
productos estn presentes a concentracin 1,0M.
El valor de G es el que determina si una reaccin qumica ocurrir en la direccin
escrita, partiendo de unas concentraciones de reaccionantes determinadas.
Recurdese que una reaccin qumica solamente ocurrir si G es negativo, es decir, si
la energa libre del sistema disminuye.
Las reacciones qumicas con un G negativo reciben el nombre de exergnicas; se
realizan espontneamente en la direccin en que estn escritas. Si recordamos el
ejemplo de los bloques:

ordenado

G disminuye, es negativo
exergnica o exotrmica
espontnea
irreversible

desordenado

10
 Las reacciones con un cambio de energa libre estndar positivo reciben el nombre
de endergnicas o endotrmicas, no se realizan de modo espontneo en la direccin en
que se escriben. Volviendo al ejemplo:

desordenado

G aumenta, es postivo
endergnica o endotrmica
no es espontnea
reversible

ordenado

Ahora podemos exponer un ejemplo de la G a partir de la siguiente reaccin:

glucosa_1_fosfato glucosa_6_fosfato

G R T ln(K' eq)

G 1.987 x 298 x 2.303 log19 1745 cal 1.745 Kcal

Puesto que G es negativo, la conversin de glucosa-1-fosfato en glucosa-6-fosfato es

exergnico. El anlisis qumico muestra que parte de una concentracin 0,020 M de
glucosa-1-fosfato con un exceso de enzima y permitimos que la reaccin ocurra en
sentido directo, o si partimos de la concentracin 0,020 M de glucosa-6-fosfato y la
reaccin transcurre en sentido inverso, las concentraciones de la mezcla final en
equilibrio son, en ambos casos, 0.001 M de glucosa-1-fosfato y 0,019 de glucosa -6-
fosfato a 25 C y pH 7,0.
Hay dos tipos de reacciones que tienen lugar con disminuciones especialmente grandes
de G , son la hidrlisis de los anhdridos y las reacciones de oxidacin.

G de la hidrlisis del ATP

El camino ms sencillo para determinar G para la reaccin:

ATP + H2O ADP + fosfato (10)

Es determinar la constante de equilibrio y calcular G empleando la relacin dada por

la ecuacin (8):
G -2.303 R T log10 (K' eq)

La medida directa de la constante de equilibrio de la hidrlisis del ATP no es prctico.

Una de las razones, y la ms importante, es que los mtodos analticos que se disponen
no son lo suficientemente precisos o sensibles para determinar con exactitud las
concentraciones de equilibrio de ATP, ADP y el in fosfato, porque en el estado de
equilibrio el ATP se encuentra casi completamente hidrolizado en ADP y en in fosfato.
En realidad, esto constituye un problema serio para muchas reacciones que poseen

11
grandes valores negativos de G .
Para poder medir el G de la hidrlisis del ATP, se descompone en cierto nmero de
etapas menores, las cuales pueden medirse ms fcilmente.
Veremos un ejemplo: en primer lugar, se deja reaccionar al ATP con la glucosa, en
presencia de hexoquinasa para formar ADP y glucosa-6-fosfato. Se mide la constante de
equilibrio, y a partir de ella se calcula G .

hexoquinasa
ATP + glucosa ADP + glucosa_6_fosfato

K'eq = 661

G = - 4.00 kcal (11)

Se contina despus con la medida de la K'eq y la G de la reaccin de hidrlisis de la

glucosa-6- fosfato catalizada por una fosfatasa.

fosfatasa
glucosa_6_fosfato + H2O glucosa + fosfato Pi

K'eq = 171

G = - 3.30 kcal (12)

La suma de las reacciones (11) y (12) es la ecuacin de hidrlisis del ATP.

hexoquinasa
ATP + glucosa ADP + glucosa_6_fosfato

fosfatasa
glucosa_6_fosfato + H2O glucosa + fosfato Pi

ATP + H2O ADP + fosfato

Puesto que los valores de G de las dos reacciones son aditivas, la G de la hidrlisis
del ATP puede calcularse a partir de ellos:

G G G - 4.00 (-3.30) - 7.30 kcal

Es importante hacer notar que este valor est basado en que pH = 7,0; T = 37 C, en
presencia de exceso de ion Mg y concentraciones 1,0 M de los reaccionantes y de los
productos. El grupo fosfato terminal del ADP tambin posee una G de hidrlisis
relativamente grande. Es igual a -7,30 kcal.

ADP + H2O AMP + Pi G -7.3 kcal

Sin embargo el nico grupo fosfato del AMP tiene un valor mucho menor:

12
 AMP + H2O adenosina + Pi G -3.40 kcal

Lo que sucede es que los enlaces entre grupos fosfatos adyacentes son enlaces del tipo
de anhdrido, mientras que el enlace entre el fosfato y la ribosa en el AMP es un enlace
ster.

COMPUESTOS CON ENLACES FOSFATO DE ALTO Y DE BAJO NIVEL

ENERGTICO

En la escala termodinmica de G , el ATP es el nico que posee un valor de G ,

intermedio.
Daremos el G de algunos compuestos fosforilados.

G (kcal)

Fosfoenol piruvato .
-14.80
1-3 difosfoglicerato ... - 11.80
G ATP
Fosfocreatina .. - 10.30
Acetil-fosfato .. -10,10
Fosfoarginina .. - 7.70

ATP . - 7.30

Glucosa-1- fosfato ... - 5.00

Fructosa-6-fosfato ... - 3.80
G ATP
Glucosa-6-fosfato ... - 3.30
Gliceril-1-fosfato - 2.20

O sea que la funcin del sistema ATP-ADP, consiste en servir como transportador
obligatorio intermedio de grupos fosfato desde los compuestos con enlaces fosfato de
elevado nivel energtico, situados por encima del ATP en la escala termodinmica,
hasta las molculas aceptoras que forman compuestos con enlaces fosfato de bajo nivel
energtico situados en la escala por debajo del ATP.

COMPUESTOS FOSFATO DE ALTO NIVEL ENERGETICO

Hay dos clases de compuestos fosforilados que poseen una G de hidrlisis ms

negativa que la del ATP:
1. Los compuestos fosfato que se forman durante la ruptura enzimtica de
molculas combustibles.
2. Los compuestos fosfato utilizados como almacenadores de la energa del enlace

13
 fosfato.
Los dos miembros ms importantes de la primera clase son el 1-3 difosfoglicerato y
el fosfoenol piruvato, los cuales se forman durante la fermentacin anaerobia de la
glucosa (gluclisis).
1-3 difosfoglicerato + ADP 3 fosfoglicerato + ATP G -4.5 kcal

ATP + H 2O ADP + Pi G -7.3 kcal

Total -11.80 kcal

Los compuestos fosfato de elevado nivel energtico, que actan como reservorio de la
energa de enlaces fosfato, reciben con frecuencia el nombre de fosfgenos. Los dos
fosfgenos principales son la fosfocreatina hallada en muchos vertebrados, y la
fosfoarginina, presente en muchos invertebrados. Ambos se forman a partir de la
creatina y de la arginina por transferencia de grupos fosfato desde el ATP en reacciones
catalizadas por la creatin-fosfoquinasa y la arginin-fosfoquinasa, respectivamente.
Ambas reacciones son reversibles pero el equilibrio se halla desplazado hacia la
formacin de ATP.
fosfocreatina + ADP creatina + ATP

COMPUESTOS FOSFATO DE BAJO NIVEL ENERGETICO

La mayora de los compuestos fosfato pobres en energa son steres fosfricos de

alcoholes. Se conocen muchas enzimas que catalizan la transferencia de grupos fosfato
desde el ATP a aceptores de fosfato especficos, para formar compuestos fosfato pobres
en energa; entre las enzimas mencionadas se hallan la glicero quinasa y la
hexoquinasa, que catalizan la transferencia de fosfato desde el ATP a la glicerina y
desde el ATP a la D-glucosa, respectivamente.
ATP + glicerina ADP + glicerol_3_fosfato G -4.5 kcal

ATP + D-glucosa ADP + D.glucosa_6_fosfato G -7.3 kcal

RUTAS ENZIMATICAS DE LA TRANSFERENCIA DE FOSFATO

Fosfoenol piruvato
Dadores de P de alta energa
P
Reservorio de fosfocreatina
1-3 difosfoglicerato
P
P
ATP
P
Aceptores de P Glucosa_6_fosfato
de baja energa P

Glicerol_3_fosfato

14
La figura es un esquema de las reacciones enzimticas de transferencia de fosfato en la
clula. Constituye un rasgo importante que el sistema ATP-ADP sea el nexo de unin
obligado entre los compuestos fosfato de elevado y de bajo nivel energtico. Los grupos
fosfato se transfieren, en primer lugar, mediante la accin de fosfotransferasas
especficas, desde compuestos de alto nivel energtico al ADP, como en el ejemplo:
piruvato -
fosfoenol piruvato + ADP piruvato + ATP
quinasa

El ATP as formado se transforma entonces en el dador de fosfato especfico de una

segunda reaccin enzimtica, para formar compuestos fosfato de baja energa.
hexoquinasa
ATP + D-glucosa ADP + D-glucosa_6_fosfato

La reaccin global es la siguiente:

fosfoenol piruvato + D-glucosa piruvato + D-glucosa_6_fosfato

El resultado final es la transferencia de un grupo fosfato desde un donador de energa

elevado a un aceptor de bajo nivel energtico, a travs del sistema ATP-ADP, que acta
como intermediario. El contenido de energa de la D-glucosa se ha elevado al
fosforilarse, la glucosa-6-fosfato puede considerarse una forma de glucosa que ha
recibido energa. En el flujo principal de reacciones transferidoras de energa de la
clula, la transferencia del fosfato nunca se produce directamente desde un compuesto
de elevado nivel energtico como el 1-3 difosfoglicerato a un aceptor de fosfato de bajo
nivel energtico, como por ejemplo, la glicerina, no se han encontrado enzimas capaces
de catalizar tales transferencias directas de fosfato. Esencialmente, todas las reacciones
de transferencia de fosfato en la clula tienen que efectuarse a travs del sistema ATP-
ADP.
La figura tambin muestra el papel de reservorio desempeado por la fosfocreatina, que
se forma por transferencia enzimtica directa de un grupo fosfato desde el ATP a la
creatina; no existe ningn otro camino para su formacin. Adems, la nica ruta principal
conocida para su desfoforilacin es la inversa de la reaccin por la que se forma. El
sistema reservorio de la fosfocreatina es muy importante en el msculo esqueletal.
Tambin se encuentra en el msculo liso y en las clulas nerviosas, y en pequeas
cantidades en el hgado, rin y otros tejidos de mamferos.

PRINCIPIO DEL INTERMEDIARIO COMUN

En dos reacciones consecutivas en que un producto de la primera es un sustrato de la

segunda, como ocurre en las siguientes reacciones:

A + B C + D

D + E F + G

15
ambas reacciones estn ligadas por un intermediario comn, en este caso el
componente D.
El nico camino mediante el cual la energa qumica puede ser transferida desde una
reaccin a otra en condiciones isotrmicas es el de que ambas reacciones posean un
intermediario de reaccin comn. Casi todas las reacciones metablicas de la clula se
realizan mediante secuencias de esta clase.
En las reacciones consecutivas, responsables de la transferencia de energa a travs del
ATP, la energa qumica se transfiere desde un dador fosfato de elevada energa hasta
el ADP, y se conserva en forma de ATP como producto de reaccin. En la reaccin
subsiguiente, el ATP se comporta como un sustrato, y cuando pierde su grupo fosfato
terminal, que cede a la molcula del aceptor, sta ltima aumenta su contenido
energtico. Por lo tanto, el ATP es el intermediario comn.
En realidad, la transferencia de intermediarios comunes constituye un atributo general de
las reacciones qumicas consecutivas y no necesita por fuerza, ni grupos fosfatos, ni
ATP.
En efecto, veremos que muchos grupos funcionales distintos del fosfato, por ejemplo,
tomos de hidrgeno, grupos acetilo, se transfieren enzimticamente mediante
reacciones consecutivas que poseen intermediarios comunes, tales reacciones pueden
analizarse termodinmicamente por los mismos mtodos que se han desarrollado para
el caso especial de las transferencias del grupo fosfato.

CANALIZACION DE GRUPOS FOSFATO POR LA VIA DE OTROS NUCLEOSIDOS 5'

TRIFOSFATO

Aunque el sistema ATP-ADP constituye el transportador obligado de fosfato en el flujo

principal de transferencia de energa en la clula, tambin participan en dichas
transferencias los 5' di y trifosfatos de otros ribonuclesidos y los 2
desoxirribonuclesidos.
Los 5' di y trifosfatos de diversos ribonuclesidos no solamente actan como precursores
en la sntesis de ARN, sino tambin canalizan los grupos fosfato de alto contenido en
energa hacia reacciones biosintticas especficas.

ATP
P UTP
Polisacridos
ATP

P GTP
Protenas
ATP

P CTP
Lpidos
ATP

P CTP
P GTP
ARN
P UTP
ATP

P d ATP
P d GTP
ADN
P d TTP
P d CTP

16
Todas estas canalizaciones conectan con el ATP mediante la enzima nuclesidos
difosfoquinasa presente en las mitocondrias y en el citoplasma de la clula, cataliza las
reacciones del tipo mostrado en el esquema.
Cada tipo de nuclesido trifosfato posee una funcin especializada. Por ejemplo: el
UTP es el dador de fosfato inmediato, y por lo tanto el donador de energa de reacciones
que conducen a la sntesis de polisacridos.

PAPEL DEL AMP Y DEL PIROFOSFATO

Aunque el ADP constituye el producto de muchas reacciones celulares que emplean el

ATP, y el ADP es el aceptor directo del fosfato en las reacciones productoras de energa
de la gliclisis y de la fosforilacin oxidativa de la mitocondria; en muchas de las
reacciones que utilizan el ATP en la clula los dos grupos fosfato terminales de ste se
separan conjuntamente en forma de pirofosfato y se libera AMP como producto.

ATP AMP + PPi

El pirofosfato inorgnico es un compuesto fosfato de nivel energtico elevado que posee

un G de hidrlisis comparable al fosfato terminal del ATP. Para regenerar el ATP a
partir de PPi y AMP intervienen dos enzimas auxiliares: la pirofosfatasa inorgnica y la
adenilato-quinasa. La primera cataliza la hidrlisis del pirofosfato inorgnico (PP i).

PPi + H2O 2 Pi

Esta hidrlisis secundaria del pirofosfato constituye una etapa valiosa de liberacin de
energa, la cual se utiliza para asegurar que ciertas reacciones biosintticas se realicen
por completo.
El Pi formado se utiliza para la regeneracin del ATP a partir de ADP. La adenilato-
quinasa cataliza la refosforilacin del AMP a ADP.

ATP + AMP ADP + ADP

El ATP, el ADP y el AMP de la clula existen en concentraciones constantes.

17
TEMA XIV: GLUCOLISIS

Vamos a considerar los mecanismos por los que las molculas combustibles se
degradan y su energa se conserva en forma de energa de enlace fosfato ATP.
Se estudiarn los procesos conocidos como fermentacin, mediante el cual muchos
organismos extraen energa qumica de la glucosa y otros combustibles en ausencia de
oxgeno molecular.
Nos referimos primeramente el proceso de fermentacin para luego poder hablar de
respiracin.

FERMENTACION Y RESPIRACION

Los organismos inferiores que viven en condiciones anaerobias (ciertas bacterias,

invertebrados inferiores) obtienen su energa de la fermentacin de la glucosa. Los
organismos que viven en condiciones aerobias (hongos, bacterias, mayora de los
animales y plantas superiores) degradan sus combustibles por la ruta anaerobia pero
despus oxidan los productos de la fermentacin utilizando el oxgeno molecular.
En esta fermentacin el oxidante final o aceptor final es una molcula orgnica
producida en el proceso fermentativo.
En los organismos superiores la ruta anaerobia es una primera etapa de la fase aerobia
de la respiracin.

Utilizacin de la glucosa por los organismos inferiores superiores:

La ruta de la fermentacin es comn tanto en la utilizacin anaerobia de la glucosa como

en la aerobia.
Anaerobios Aerobios

glucosa glucosa

sin O2 fermentacin sin O2 fermentacin

productos de la fermentacin productos de la fermentacin

con CO 2

CO2 + H2O

Entre las clases de fermentacin nombraremos la fermentacin homolctica y la

alcohlica.

La fermentacin homolctica: La molcula de glucosa de 6 tomos de carbono

se degrada a dos molculas de cido lctico de tres tomos de carbono. Este

18
 proceso se denomina gluclisis que significa lisis de la glucosa.

La fermentacin alcohlica: La molcula de glucosa de 6 tomos de carbono se

degrada a dos molculas de etanol de 2 tomos de carbono y 2 de CO 2 .
1. Glucosa 2. Glucosa
C C C C C C C C C C C C

triosas triosas

C C C C C C C C C C C C

cido cido etanol etanol

lctico lctico
CH3 CH3
CH3 CH3
CH2 OH CH2 OH
CH OH CH OH
+ +
COOH COOH CO 2 CO 2

En estas reacciones tenemos que hablar de las reacciones de xido reduccin que se
producen en todo organismo donde el agente oxidante recibe los electrones y el agente
reductor entrega electrones.
En este caso de la fermentacin alcohlica el etanol es una molcula relativamente
reducida rica en H 2 , pobre en O 2 . La molcula de CO 2 es relativamente oxidada, pobre
en H 2 .
En el caso de la fermentacin homolctica el grupo metilo se halla ms reducido que el
grupo carbonilo. Veamos la reaccin completa:

1. Glucosa cido lctico

O
C
H CH3
HC OH
HO C H + 2 Pi + 2 ADP 2 CH OH + 2 ATP + 2 H2O
HC OH COOH
HC OH
CH2 OH

2. Glucosa + 2 Pi + 2 ADP 2 CH3 + 2 CO2 + 2 ATP + 2 H2O

CH2 OH

Etanol

19
ANALIZAREMOS LA REACCION ENERGETICA DE LA GLUCOLISIS

1) La conversin de glucosa en lactato es exergnica y 2) la formacin de ATP a

partir de ADP y de Pi es endergnica.

Se deduce de estos datos que la transformacin de glucosa en lactato proporciona

energa para producir la fosforilacin de 2 molculas de ADP a ATP. Esta reaccin es
irreversible. Lo demuestra el G negativo.

ETAPA DE LA GLUCOLISIS:

La gluclisis es catalizada por la accin de un grupo de 11 enzimas. Se cree que estn

localizadas en la porcin soluble del citoplasma. Se pueden considerar dos etapas o
fases. En la primera fase la glucosa se fosforila y se escinde pare formar gliceraldehdo
3 P; y en la segunda fase ste se convierte en cido lctico.
LA FASE I: Constituye un proceso preparativo o de congregacin en el que cierto
nmero de hexosas penetran en el esquema, despus de fosforilarse a expensas
del ATP, y dan un producto comn, el gliceraldehdo 3 P.
LA FASE II: Es la ruta comn para todos los azcares, se produce la fosforilacin
del ADP y se llevan a cabo las reacciones de xido reduccin, obtenindose el
lactato.

En este proceso hay tres tipos de transformaciones interconectadas.

1.- La ruta de los tomos de carbono: o sea degradacin de la glucosa para
formar cido lctico.
2.- La ruta del fosfato: o sea que el Pi (fsforo inorgnico) se transforma en P
del ATP.
3.- La ruta de los electrones: o sea las reacciones del xido-reduccin.

20
 glucosa almidn
glucogeno
ATP Pi

FASE I glucosa-1-P

galactosa ADP
manosa glucosa-6-P
Congregacin de azcares sencillos y pentosa
su conversin en fosfato de fructosa-6-P
gliceraldehdo; entrada de ATP ATP ADP

fructosa-1-6-di P

glicealdehdo-3-P (2)

2 NAD+

Pi

1,3 difosfoglicerato (2)

FASE II 2 ADP 2 NADH
2 ATP
3 difosfoglicerato (2)
Oxidacin - reduccin y formacin
acoplada de ATP; salida de lactato
2 difosfoglicerato (2)

fosfoenolpiruvato (2)

2 ADP
2 ATP piruvato (2)
2 NAD+

2 lactato

21
1. Fosforilacin de glucosa por el ATP: catalizada por dos enzimas: la
hexoquinasa y glucoquinasa.

Mg++
ATP + glucosa ADP + glucosa-6-P G 4 kcal

Es una reaccin irreversible.

La hexoquinasa es de mayor afinidad que la glucoquinasa por la glucosa. La
glucoquinasa solo acta cuando hay alta concentracin de glucosa en sangre; las
dos enzimas necesitan del catin Mg Mn para formar el verdadero sustrato que
es Mg Mn ATP . La hexoquinasa acta tambin fosforilando otras hexosas. La
reaccin es irreversible.

CH2 OH CH2 OPO 3=

O O
H H H H
H H
+ ATP ADP + G -4 kcal
OH H OH H
OH OH OH OH

H OH H OH

glucosa glucosa-6-fosfato

2. Conversin de glucosa-6-P a fructosa-6-P: Catalizada por la

fosfoglucoisomerasa.

CH2 OPO 3=
CH2 OPO 3=
O O
H H CH2 OH
H

OH H OH H G 0.4 kcal
OH OH OH OH (reaccin reversible)

H OH H OH

glucosa-6-P fructosa-6-P

3. Fosforilacin de la fructosa-6-fosfato a fructosa 1-6 difosfato. Interviene una

segunda molcula de ATP. Esta reaccin es catalizada por la fosfofructoquinasa.

CH2 OPO 3= CH2 OPO 3=

O O
CH2 OH CH2 OPO 3=
+ ATP ADP + G -3.4 kcal
OH H OH H
OH OH OH OH (reaccin irreversible)

H OH H OH

22
4. Escisin de la fructosa 1 - 6 difosfato por una aldosa (la fructosa-1-6-difosfato
gliceraldehdo 3-liasa) dando fosfato de dihidroxiacetona + gliceraldehdo-3-
fosfato.

1. CH2 OPO 3=

2. C O H
1. CH2 OPO 3= 4. C O
3. HO CH
G 5.73 kcal
2. C O + 5. H COH
4. H COH
3. CH2 OH 6. CH2 OPO 3=
5. H COH

6. CH2 OPO 3=

fructosa 1-6-di P fosfato de gliceraldehdo 3-P

(cadena abierta) dihidroxiacetona

INTERCONVERSION DE LOS FOSFATOS DE TRIOSA

Solamente uno de los dos fosfatos de triosa, el gliceraldehdo 3-fosfato, puede ser
directamente degradado en las reacciones posteriores de la gluclisis. El otro, el
fosfato de dihidroxiacetona, se convierte reversiblemente en gliceraldehdo-3-fosfato
por accin de la enzima triosa fosfato isomerasa.
O

CH2 OPO 3= C
H
G 1.83 kcal
C O H C OH

CH2 OH CH2 OPO 3=

As en la primera fase una molcula de glucosa da dos molculas de gliceraldehdo

3 P.

SEGUNDA FASE
1. Oxidacin del gliceraldehdo 3 P a 1-3 difosfoglicerato.
La enzima que acta es G_3_fosfato deshidrogenasa, o gliceraldehdo 3 fosfato
deshidrogenasa.

2 gliceraldehdo-3-P + 2 NAD+ + 2 Pi (2) 1,3 di-fosfoglicerato + 2 NADH + 2 H+

23
 O

C O PO 3=
H
C O HC OH

2 H COH + NAD+ + Pi 2 CH2 O PO 3= + NADH + H

+
G 1.5 kcal

CH2 OPO 3=

El NAD+ y el NADH transportan los electrones.

2. Transferencia de fosfato desde el 1-3 difosfoglicerato al ADP.

El 1-3 difosfoglicerato + ADP da 3-fosfoglicerato + 2 ATP; es catalizada la
reaccin por la enzima fosfogliceratoquinasa.

O
1. C 3. CH2 OPO 3=
O PO 3=

2. H COH + ADP 2. H COH + ATP G 4.50 kcal

(reaccin irreversible)
-
3. CH2 OPO 3= 1. COO

3. Conversin del 3-fosfoglicerato dando 2-fosfoglicerato.

Acta la fosfogliceratomutasa.

CH2 OPO 3= CH2 OH

H COH H COPO 3= G 1.06 kcal

- -
COO COO

3-fosfoglicerato 2-fosfoglicerato

4. El 2-fosfoglicerato da fosfoenolpiruvato + H20 por medio de una enzima, la

enolasa, en un proceso de deshidratacin.

24
 CH2 OH CH2

enolasa
H COPO 3= C O PO 3= + H2O G 0.44 kcal

- -
COO COO

2-fosfoglicerato fosfoenolpiruvato

5. Transferencia de fosfato desde el fosfoenolpiruvato al ADP.

El fosfoenolpiruvato da piruvato por una enzima piruvato quinasa en presencia de
ADP y Mg .

CH3
CH2
G 7.5 kcal
C O PO 3= + ADP ATP + C O
(reaccin irreversible)

- -
COO COO

fosfoenolpiruvato piruvato

6. Reduccin de piruvato a lactato. Piruvato da lactato por medio de lactato

deshidrogenasa.

CH3
CH3

+
C O + NADH + H+ H COH + NAD G 6.0 kcal
-
- COO
COO
piruvato lactato

En condiciones anaerobias el lactato es producto final de la gluclisis el cual difunde

a travs de la membrana plasmtica de la clula hacia el entorno como producto de
desecho. Cuando las clulas musculares de los animales superiores actan de
manera anaerobia durante cortos esfuerzos de actividad vigorosa
(excepcionalmente) el lactato escapa desde las clulas musculares a la sangre y es
transformado nuevamente en glucosa en el hgado.

25
BALANCE GLOBAL

2 ADP

glucosa + 2 ATP + 2 NAD+ + 2 Pi + 4 ADP + 2 NADH+ + 2 H+ 2 lactato + 2 ADP +

+ 2 ATP + 2 NADH + 4 ATP + 2 H2O + 2 H+ + 2NAD+

glucosa + 2 Pi + 2 ADP 2 lactato + 2 ATP + 2 H2O

ENTRADA DE LOS OTROS HIDRATOS DE CARBONO

Los polisacridos de reserva el glucgeno, almidn, azcares sencillos distintos de

la glucosa penetran en la primera fase de la gluclisis.
El glucgeno y el almidn penetran por la accin de dos enzimas que actan sobre
los extremos terminales no reductores de la molcula, escindiendo los enlaces alfa
(1-4). Otra enzima acta sobre las ramificaciones alfa (1-6) dando glucosa-1-fosfato
para luego dar glucosa-6-fosfato. Los azcares sencillos una vez fosforilados, por ej.
: manosa-6-P, fructosa-6-P recin penetran al ciclo.
manosa + ATP manosa-6-P + ADP

fructosa + ATP fructosa-6-P + ADP

26
 TEMA XV: CICLO DE LOS ACIDOS TRICARBOXILICOS Y VIA DEL
FOSFOGLUCONATO

Energtica de la fermentacin y respiracin. Plan de organizacin de la respiracin.

Oxidacin del piruvato a acetil CoA. Ciclo de Krebs. Vas del fosfogluconato.

Las clulas aerobias obtienen la mayor parte de su energa de la respiracin, esto

es, gracias a una transferencia de electrones desde les molculas orgnicas
combustibles hasta el oxigeno molecular. La respiracin es mucho ms compleja
que la gliclisis.
En este tema se esboza el plan general de le respiracin y despus se considera
con detenimiento el ciclo del cido tricarboxlico de Krebs, que es la ruta catablica
comn por la que finalmente se degradan todas las molculas combustibles de la
clula (carbohidratos, cidos grasos y aminocidos).
Tambin se describe la ruta del fosfogluconato de oxidacin de la glucosa,
mecanismo que genera potencial de reduccin para las reacciones biosintticas.

ENERGETICA DE LA FERMENTACION Y LA RESPIRACION

En la gliclisis se libera solamente una fraccin muy pequea de la energa qumica

potencialmente asequible en la estructura de la molcula de glucosa. Se libera ms
energa cuando sta se oxida completamente a CO 2 y H2 O como se pone de
manifiesto al comparar las variaciones de energa libre estndar de la conversin
anaerobia de la glucosa en lactato y de su oxidacin a CO 2 y H2 O .
glucosa 2 lactato G 47 kcal

glucosa + 6 O2 6 CO2 + 6 H2O G 686 kcal

Cuando las clulas fermentan a la glucosa anaerobiamente, los productos que ya no

son susceptibles de ulterior empleo, y por ello abandonan la clula, todava
contienen la mayor parte de la energa de la molcula de glucosa original. Por esta
razn, las clulas que viven anaerobiamente, para obtener una misma cantidad de
energa utilizable tienen que consumir mucho ms glucosa que cuando viven en
condiciones aerobias.

Por qu rinde la respiracin mucho ms energa que la gliclisis?

En primer lugar, el producto de la gliclisis, el cido lctico, es una molcula casi tan
compleja como la de glucosa y sus tomos de carbono todava se hallan en un
mismo estado de oxidacin. El CO 2 , producto de la respiracin, es una molcula
mucho ms sencilla y pequea que la glucosa, y su tomo de carbono est
completamente oxidado. En segundo lugar, la cantidad de energa que se libera en
la transferencia de un par de electrones desde una molcula combustible
determinada a un aceptor electrnico, vara con la naturaleza del aceptor. Puede
liberarse mucha ms energa cuando el aceptor electrnico el oxgeno molecular,
como ocurre en la respiracin, que cuando es el piruvato el que acta como aceptor,
que es el caso de la gliclisis.
27
ORGANIGRAMA RESPIRATORIO

En la figura se muestra un diagrama de la respiracin. lkk

Los grupos acetilo procedentes de los carbohidratos, de los lpidos y de los
aminocidos en la fase II del catabolismo, en la siguiente fase III se incorporan al
ciclo de Krebs, que en las aerobias constituye la ruta comn final del catabolismo
oxidativo de todas las molculas combustibles. En este ciclo los grupos acetilo se
desintegran para formar CO 2 y tomos de hidrgeno. Estos ltimos (o sus electrones
equivalentes) posteriormente se incorporan a la cadena respiratoria constituda por
una serie de transportadores electrnicos.
El proceso subsiguiente de transporte de electrones hasta el oxgeno molecular se
realiza con un descenso muy grande de energa libre, gran parte de la cual se
conserve en forma de ATP, gracias a la fosforilacin oxidativa acoplada del ATP.
La reaccin global catalizada por el ciclo de Krebs es la siguiente:

CH3COOH + 2 H2O 2 CO2 + 8 H +

Como puede verse en la ecuacin, no participan en el ciclo ni el oxgeno molecular,

ni el fosfato inorgnico, ni el ATP.
Su funcin primaria consiste en la deshidrogenacin del cido actico para formar,
en ltimo trmino, dos molculas de CO 2 y cuatro pares de tomos de hidrgeno.
Este proceso es catalizado en una serie cclica de reacciones consecutivas, en
contraste con la secuencia glicoltica, que es lineal.
En cada vuelta del ciclo de Krebs se incorpora una molcula de cido actico (dos
tomos de carbono) por condensacin con una molcula del compuesto de cuatro
carbonos, el cido oxal actico, para formar el cido ctrico de seis tomos de
carbono.
Posteriormente, el cido ctrico se degrada con produccin de dos molculas de
CO2 y cido succnico, compuesto de cuatro tomos de carbono. Finalmente, este
ltimo se oxida a cido oxalactico, con lo que puede iniciarse de nuevo una vuelta
del ciclo. En cada una de las vueltas se incorpora una molcula de cido actico y se
eliminan dos molculas de CO 2 , en cada giro completo se emplea tambin una
molcula de oxal acetato para formar citrato, pero aquel se regenera al final del
ciclo.
Por tanto, cuando el ciclo funciona no hay prdida neta de oxalacetato, basta con
una molcula para llevar a cabo la oxidacin de un nmero infinito de molculas de
acetato.
Las reacciones enzimticas del ciclo de Krebs tienen lugar en el compartimiento
interno de la mitocondria (a diferencia de la glucolisis que tiene lugar en el
citoplasma celular).

28
 Carbohidrato

Movilizacin del Amino-

Piruvato cidos
acidos grasos
acetil CoA
2H CO2

Acetil-CoA

oxalacetato citrato

cis-aconitato
Ciclo del cido malato
isocitrato
tricarboxilo CO2
fumarato -oxoglutarato
CO2
succinato

2H 2H 2H 2H

ADP + Pi NAD ATP

flavoproteina

coenzima Q

Transporte electrnico
y fosforilacin citocromo b
oxidativa ADP + Pi ATP

+ citocromo c
2H

citocromo a + a3
+
ADP A Pi ATP

2 H+ + 1/2 O2 H2O

29
Oxidacin del Piruvato a acetil CoA

O
Piruvato
CH3 C COOH
NAD+ NADH2

HS-CoA CO2 O
CH3 C S CoA + CO 2
Acetil-CoA

La ecuacin global es:

Piruvato + NAD + + HSCoA acetil-S-CoA+ NADH2 + CO 2

G 8.0 kcal

La oxidacin de piruvato a acetil-SCoA, catalizada por el sistema piruvato-

deshidrogenasa, en realidad constituye un proceso muy complejo.
A causa del gran descenso de energa libre estndar, la reaccin es esencial-
mente irreversible. Aunque en si misma no forma parte del ciclo del cido
tricarboxlico, constituye una etapa obligatoria, mediante le cual los hidratos de
carbono se incorporan al ciclo.
En este proceso participan dos coenzimas importantes: CoA y cido lipoico.
CoA: Acta como transportador de grupos acilo, efectuando una funcin anloga
a la que desempea el ATP como transportador de grupos fosfato. La forma
acetilada de la coenzima A (acetil CoA) es un tioster del cido actico. El
tioster es un enlace de elevado contenido energtico, es decir, posee un G
fuertemente negativo.

acetil-S-CoA + H2O acetato + CoA - SH G 7.52 kcal

cido lipoico: es un factor de crecimiento para algunos microorganismos, un

cido graso saturado de 8 tomos de carbono, en el que los carbonos 6 y 8 estn
unidos por un grupo disulfuro formando un anillo de cinco trminos.
CH2

S
CH2

CH

(CH 2)4

30
COOH
La decarboxilacin oxidante del piruvato a acetil CoA CO2 necesita tres enzimas
diferentes y 5 coenzimas que constituyen el:

Piruvato-deshidrogenasa
enzimas dihidrolipoil-transacetilasa
dihidrolipoil-deshidrogenasa

Sistema de la
piruvato-deshidrogenasa Coenzima A
cido lipoico
coenzimas Pirofosfato de tiamina (TPP)
NAD
FAD

REACCIONES INDIVIDUALES DEL CICLO DEL ACIDO TRICARBOXILICO

La acetil-CoA formada como producto final de la piruvato-deshidrogenasa se

encuentra ahora dispuesta para incorporarse al ciclo de Krebs.
1. Se produce la condensacin de la acetil-CoA con el oxalacetato, para formar
citrato. La reaccin es catalizada por la citrato-sintetasa.
O

Acetil - CoA CH3 C S CoA CoA SH

COOH

COOH CH2

C O HO C COOH citrato

oxalacetato CH2 CH2

COOH COOH

En esta reaccin el grupo metilo (CH3 ) de la acetil CoA se condensa con el tomo
de carbono carbonlico del oxalacetato con la hidrlisis del enlace tioster y
formacin de la CoA SH libre.
O
C

2. Acta una enzima, la aconitasa que cataliza la formacin de isocitrato con

formacin de un compuesto intermedio el cis-aconitato. En esta reaccin se
produce prdida, y posterior adicin de agua.

OH H2O

COOH CH2 C CH2 COOH COOH CH2 C CH COOH

COOH COOH

citrato cis-aconitato

31
 H2O
COOH CH2 CH CH COOH
COOH OH
isocitrato

3. Se produce una oxidacin del isocitrato y prdida de CO 2 . La reaccin es

catalizada por la isocitrato-deshidrogenasa ligada al NAD , que requiere Mg
Mn para su actividad.

CO2 O
COOH CH2 CH CH COOH COOH CH2 CH2 C COOH
COOH OH NAD+
NADH2
isocitrato alfa-cetoglutarato

La reaccin transcurre con gran descenso de G es una reaccin altamente

exergnica.

4. La oxidacin de alfa-cetoglutarato a succinato se produce en dos etapas.

a. En la primera el alfa-cetoglutarato experimenta una decarboxilacn oxidativa
para formar succinil-S-CoA y CO 2 .

Esta reaccin es comparable a la de la oxidacin del piruvato a CoA y se

produce por el mismo mecanismo con intervencin de:
+ +
NAD pirofosfato de tiamina cido lipoico FAD

que participan como cofactores necesarios ligados a la enzima succinil-CoA-

sintetasa.
b. El producto final de la reaccin la succinil-CoA que es un tioster de elevado
contenido energtico, experimenta prdida de su grupo CoA, pero no por una
simple reaccin de hidrlisis sino por una reaccin con el GDP y fosfato en el
que se conserva la energa.
succinil-CoA + Pi + GDP succinato + CoA SH + GTP

A continuacin el GTP formado en esta reaccin cede terminal al ADP para

formar ATP.
GTP + ADP GDP + ATP

La reaccin es catalizada por la nuclesido-difosfoquinasa. Este tipo de

fosforilacin se designa como fosforilacin a nivel de sustrato, para distinguirla
de las fosforilaciones ligadas a la cadena respiratoria.
5. El succinato es oxidado a fumarato en una reaccin catalizada por la succinato-
deshidrogenasa que contiene FAD como coenzima que acta como aceptor de
32
 hidrgeno.

COOH CH2 CH2 COOH + FAD COOH CH CH COOH + FADH2

succinato fumarato

6. Se produce una hidratacin del fumarato dando malato, actuando coma catali-
zador la fumarasa.
OH
COOH CH CH COOH + H2O COOH C CH2 COOH

Fumarato H Malato
7. En la ltima reaccin del ciclo la malato-deshidrogenasa dependiente del NAD
cataliza la oxidacin del malato a oxalacetato.

OH O
+
COOH C CH2 COOH + NAD COOH C CH2 COOH + NADH2
H

Malato Oxalacetato

Podemos ahora resumir los productos producidos en una vuelta del ciclo del cido
tricarboxlico.
Dos tomos de carbono aparecen en forma de CO 2 equivalentes, aunque no
idnticos, a los dos tomos de carbono del grupo acetilo que ingresa en el ciclo. Por
deshidrogenacin enzimtica se producen cuatro pares de tomos de hidrgeno,
tres pares se utilizan para reducir el NAD y uno para reducir el FAD.
En ltimo trmino, estos cuatro pares de tomos de hidrgeno y electrones se
combinan con el oxgeno, una vez realizado su transporte a lo largo de la cadena
respiratoria.

RUTA DEL FOSFOGLUCONATO O VIA DE LAS PENTOSAS

Muchas clulas disponen, adems del ciclo del cido tricarboxlico, de otra ruta de
degradacin de la glucosa cuya primera reaccin es la oxidacin de la glucosa-6-
fosfato a 6-fosfato gluconato.
La ruta del fosfogluconato, conocida como ruta de los fosfatos de pentosa o
desviacin del monofosfato de hexosa, no es una ruta principal de oxidacin de la
glucosa.
Su objetivo primordial, en la mayor parte de las clulas, es obtener NADP reducido
en el citoplasma extramitocondrial.
Una segunda funcin es la produccin de pentosas en especial D-ribosa, que se
emplea en la sntesis de cidos nucleicos.
Otra funcin importante consiste en participar en la formacin de glucosa, a partir del
CO 2 , en las reacciones de fotosntesis.

Las diversas etapas de la ruta del fosfogluconato tienen lugar en la porcin soluble
del citoplasma extramitocondrial de la clula.
33
1. La primera reaccin de la ruta del fosfogluconato es la deshidrogenacin
enzimtica de la glucosa-6-fosfato por la glucosa-6-fosfato deshidrogenasa
para formar 6-fosfogluconato.

H C OH C O COOH

H C OH H C OH H C OH
O + NADP+ O +NADPH
2
HO C H HO C H HO C H

H C OH H C OH HC OH

H C H C HC OH

CH 2OPO 3= CH 2OPO 3= CH2 O PO 3=

glucosa-6-fosfato 6-fosfogluconato-lactona 6 Fosfogluconato

La enzima es especfica para el NADP como aceptor electrnico.
Realiza la deshidrogenacin del tomo de carbono 1 de la forma piranosa de
la glucosa-6-fosfato y rinde la 6-fosfogluconato lactona. Esta ltima es
inestable y experimenta hidrlisis espontnea a cido libre en presencia de
una lactonasa.

2. En la etapa siguiente el 6-fosfogluconato experimenta una decarboxilacin

oxidativa por accin de la 6-fosfogluconato-deshidrogenasa y se forma una
pentosa la D-ribulosa-5-fosfato, reaccin que produce una segunda molcula
de NDAHP2 .
CH2 OH

COOH C O
H C OH
H COH
H C OH
+ NADP+ H COH + NADPH2 + CO2
HO C H
CH 2OPO 3=
H C OH

CH 2OPO 3=

6-fosfogluconato ribulosa-5-fosfato

3. Por accin de la fosfo-pentosaepimerasa la ribulosa-5-fosfato se transforma

reversiblemente en xilulosa-5-fosfato, su epmero en el tomo de carbono 3.
Por accin de la fosfo-pentosa-isomerasa, la ribulosa-5-fosfato, puede
convertirse, tambin reversiblemente, en su ismero aldo, la ribosa-5-fosfato
que puede emplearse en la sntesis de los nucletidos que contienen pentosa
y el ARN.

34
 CH2 OH

C O

HO C H xilulosa-5-fosfato
CH2 OH
HC OH
C O sa
m era
epi CH 2OPO 3=
H C OH
CHO
H C OH
iso HC OH
me
CH 2OPO 3= ras
a
H C OH ribosa-5-fosfato
ribulosa-5-fosfato

H C OH

CH 2OPO 3=

En ciertas circunstancias, la ruta del fosfogluconato finaliza en este punto, y

entonces su ecuacin global se escribe as:
glucosa-6-fosfato + 2NADP+ + H2O ribosa-5-fosfato + CO2 + 2NADPH2

El resultado neto es la produccin del NADPH necesario para las reacciones

biosintticas de reduccin en el citoplasma extramitocondrial, y la formacin de
ribosa como precursor para la sntesis de nucletidos.
En otras circunstancias, sin embargo, la ruta del fosfogluconato contina ms all,
ya que las pentosas-5-fosfato pueden experimentar otras transformaciones que son
posibles gracias a dos enzimas adicionales: la transcetolasa y la transaldolasa.
*La transcetolasa que contiene pirofosfato de tiamina ntimamente unido como
coenzima y Mg , realiza la transferencia de un grupo glicoaldehdo desde la
xilulosa-5-fosfato a la ribosa 5 fosfato. En este proceso el grupo glicolaldehdo (
CH2 OH CO ) se transfiere en primer lugar al pirofosfato de tiamina unido a la
enzima, que acta como transportador intermediario del grupo glicolaldehdo, que a
continuacin es transferido a la molcula del aceptor, la ribosa-5-fosfato. El resultado
neto consiste en la formacin de un ceto-azcar de 7 tomos de carbono, la sedo
heptulosa-7-fosfato, y un azcar de 3 tomos de carbono, el glicer aldehdo-3-
fosfato.
CH2 OH CHO CH2 OH

C O HCOH C O

HO C H + H C OH HO C H + CHO

H C OH H C OH HC OH HC OH

CH 2OPO 3= CH 2OPO 3= HC OH CH2 O PO 3=

HC OH

CH2 O PO 3=
Debe observarse que uno de los productos de la accin de la transcetolasa es el
xilulosa-5-P ribosa-5-P sedoheptulosa-7-P gliceraldehdo-3-P
35
gliceraldehdo-3-P que es un intermediario de la secuencia glicoltica. Su formacin
constituye un lazo de conexin entre la va glicoltica y la del fosfogluconato.

*La segunda enzima que participa en transformaciones ulteriores de la va del

fosfogluconato es la transaldolasa, que acta sobre los productos de la reaccin
catalizada por la transcetolasa Cataliza la transferencia del grupo dihidroxiacetona
correspondiente a los tomos de carbono 1-2-3 de la sedoheptulosa para formar un
azcar de 6 tomos de carbono, la fructosa-6-fosfato, y otro azcar de 4 tomos de
carbono, la eritrosa-4-fosfato.

CH2 OH CH2 OH

C O C O

HO C H CHO HO C H CHO

H C OH + H C OH H C OH + HC OH

H C OH CH2 O PO 3= H C OH HC OH
CH2 O PO 3=
H C OH CH2 O PO 3=

CH2 O PO 3=

La fructosa-6-fosfato, es tambin un intermediario de la gliclisis y por lo tanto, el

segundo punto de conexin entra las dos rutas: glicoltica y fosfogluconato.

Otra reaccin destacada que cataliza la transcetolasa es:

xilulosa-5-P + eritrosa-4-P fructosa-6-P + gliceraldehdo-3-P

En la que dos intermediarios de la va del fosfogluconato pueden convertirse en

intermediarios de la va glicoltica.
Una consecuencia importante de la accin de las dos enzimas, consiste en que
hacen posible, junto con las enzimas de la secuencia glicoltica la interconversin de
los azcares.
La ltima parte de la va del fosfogluconato no es bien definida, no conduce a un
nico producto final, sino a una ruta ramificada, capaz de gran flexibilidad
metablica.
Es probable que la ruta del fosfogluconato normalmente se rena con el ciclo
glicoltico por interconversin en intermediarios de la gliclisis.

36
TEMA XVI: TRANSPORTE DE ELECTRONES Y FOSFORILACION OXIDATIVA

Reacciones de xido reduccin. Enzimas de xido-reduccin. Va de transporte de

electrones: la cadena respiratoria. Energtica del transporte de electrones.
Fosforilacin oxidativa. Acoplamiento de la fosforilacin oxidativa al transporte de
electrones.

Veremos en este captulo que los pares de electrones derivados de los inter-
mediarios del ciclo del cido tricarboxlico fluyen a lo largo de una cadena de varios
eslabones, constituidos por enzimas de transporte electrnico, con niveles de
energa sucesivamente inferiores hasta reducir al oxgeno molecular, que es el
ltimo aceptor electrnico, en la respiracin. Durante este proceso se conserva gran
parte de la energa libre de estos electrones en forma de energa del enlace fosfato
del ATP; el proceso se denomina fosforilacin oxidativa.
El transporte electrnico y la fosforilacin oxidativa suceden en casi todas las clulas
aerobias, las enzimas que catalizan estas reacciones se hallan localizadas en la
membrana interna de las mitocondrias.

Reacciones de oxidacin-reduccin

Antes de referirnos a oxidaciones biolgicas, veremos que se entiende por oxidacin

y reduccin.
a. Si el hierro (Fe) reacciona con el oxgeno

4Fe + 3O2 2Fe2 O3

Este proceso de ganancia de oxigeno se denomina oxidacin y lo inverso o sea

la prdida de oxgeno, reduccin.
b. Si se combina un elemento con otro distinto al oxgeno.
Zn + Cu++ SO4= Zn++ SO4= + Cu

Lo que ocurri es lo siguiente: el Zn es neutro, de l se desprenden una pareja

de electrones y se convierte en in Zn.
Zn Zn++

carga 0 carga 2

Se produce una oxidacin del Zn porque de carga 0 pasa a carga 2. A su vez el

in Cu capta los electrones.

Cu++ + 2e- Cu metalico

carga 2 carga 0

El cobre se reduce de carga 2 pasa a 0.

37
Resumiendo:

1. La prdida de electrones se denomina oxidacin.

2. La ganancia de electrones se denomina reduccin.

c. En compuestos orgnicos el proceso de oxidacin se acompaa de prdida de

hidrgeno o ganancia de oxgeno.

H H H H
H2O -2H H2O -2H
H C H H C OH H C O H C O CO 2
-2H -2H
H H
cido anhdrido
metano metanol metanal carbnico
metanoico

El carbono llega a su grado mximo de oxidacin.

O sea que la prdida de tomos de hidrgeno o deshidrogenacin equivale tambin

a una oxidacin y el proceso inverso a una reduccin.
gananca de oxgeno
oxidacin prdida de electrones
prdida de hidrgeno

prdida de oxgeno
reduccin ganancia de electrones
ganancia de hidrgeno

Las reacciones de oxidacin-reduccin son aquellas en que tiene lugar una

transferencia de electrones, desde un dador electrnico (el reductor) hasta un
aceptor electrnico (el agente oxidante u oxidante). Es decir que siempre que hay
prdida de electrones por un tomo se produce una transferencia de electrones a
otro tomo. O sea que la oxidacin y la reduccin son simultneas.
Ared. + Boxid. Aoxid. + Bred.

Al equilibrio entre la forma reducida y oxidada se llama sistema de xido reduccin o

sistema redox.
La tendencia de un agente reductor a perder electrones se puede expresar me-
diante el potencial de reduccin estndar. Es decir colocando la especie oxidante y
reductora a concentracin 1.0 M, pH = 7, y a 25 C. Para medir el potencial se
establece como patrn de referencia el potencial de reduccin del H 2 en la siguiente
reaccin.
H2 2H+ + +2e-

El cual por convencin se ha establecido que es igual a 0,0 voltios, cuando la

38
 presin de H 2 gaseoso es de 1,0 atmsfera, la concentracin 1,0 M, el pH 0,0 y
temperatura 25 C. Cuando se corrige este valor a pH 7,0 el potencial estndar del
sistema hidrgeno-in hidrgeno es de -0,42 voltios.

Potenciales de reduccin estndar de algunos pares redox

Reductor Oxidante E voltios

Acetaldehdo Acetato - 0.60
H2 2H - 0.42
cetoglutarato +
Isocitrato CO 2
- 0.38

NAD + H NAD - 0.32

Lactato Piruvato - 0.19
NADH
deshidrogenasa Oxidada - 0.11
(reducida)
Citocromo b
Fe (II) Fe (III) 0.00
Citocromo c
Fe (II) Fe (III) + 0.26
H2 O O2 + 0.82

Los sistemas que poseen un potencial estndar de reduccin ms negativo que el

+
del par H2 2H muestran mayor tendencia a perder electrones que el hidrgeno.
Los que poseen potencial ms positivo tienen menor tendencia a perder electrones.
Obsrvese la pareja agua-oxgeno: posee un potencial estndar de reduccin
fuertemente positivo.
H2O 1/2 O2 + 2 H+ + +2e-

Por dicha razn el agua muestra muy poca tendencia a perder electrones y a formar
oxgeno molecular. Dicho de otro modo, el oxgeno molecular tiene gran afinidad por
los electrones, superior que la de aceptores biolgicos de electrones tales como el
NAD , las flavoprotenas y los citocromos.

Cadena respiratoria:

Sustrato reducido NAD+ FADH2 CoQ Fe++ Fe+++ Fe++

cit. b c a+ a3

Sustrato oxidado NADH2 FAD+ CoQH2 Fe+++ Fe++ Fe+++

2H
ATP
ATP ATP
+ 39
H 2H+ + 1/2 O2 H2O
En el proceso un sustrato que se va a oxidar entrega sus electrones H al primer
constituyente de la cadena que es el NAD y se reduce. El NADH H entrega sus
hidrgenos y respectivos electrones a una flavoprotena y sta a la coenzima Q, que
desempea el papel de transportador electrnico entre las deshidrogenases ligadas
al NAD y FAD y los citocromos.
De aqu en adelante lo que se transfieren ya son electrones y los H irn al medio.
Los electrones son captados por el citocromo b, c y a + a3. Este ltimo es
autooxidable y entrega los electrones al 1/ 2 O 2 que con los H formar H2 O .

Enzimas de xido-reduccin:

Tres son las clases principales de enzimas que participan de la corriente del
transporte electrnico desde los sustratos orgnicos hasta el oxgeno molecular.
De acuerdo al orden en que participan son los siguientes:
1. Deshidrogenasas ligadas a la piridina que requieren NAD o NADP como coen-
zima. Participan en la primera parte del eslabn:
Sustrato reducido NAD+

Sustrato oxidado NADH + H+

2. Deshidrogenasas ligadas a la flavina que tienen como grupo prosttico al FAD

o al FMN. Participan en la segunda parte del eslabn

FADH + H CoQ

FAD CoQH + H +

3. Los citocromos que contienen un sistema nuclear ferroporfirnico. Participan

en la ltima parte del eslabn

Fe++ Fe+++ Fe++

cit. b c a+ a3

Fe+++ Fe++ Fe+++ 2H+ + 1/2 O2 H2O

Analizamos cada una de las enzimas con sus respectivas coenzimas:

40
Deshidrogenasa ligada a la piridina:

Se conocen alrededor de 150 y catalizan la siguiente reaccin:

Sustrato reducido + NAD+ Sustrato oxidado + NADH + H+

Las deshidrogenases ligadas a la piridina transfieren reversiblemente dos

equivalentes de reduccin desde el sustrato a la forma oxidada del nucletido
piridnico; uno de ellos aparece en el nucletido reducido como un tomo de
hidrgeno. El otro tomo de hidrgeno separado del sustrato aparece en forma de
H libre en el medio. Veamos la estructura del NAD:

+ O adenina
HO P O H2C

H H

O OH OH

CONH 2

+ O +
HO P O H2C N

H H
O

OH OH

La parte activa de los nucletidos piridnicos es la nicotinamida, ya que sta es la

porcin de la molcula que va a recibir el hidrgeno del sustrato. Es importante
destacar que la nicotinamida es una vitamina del complejo B. O sea que por su
participacin en los mecanismos de xido-reduccin cumplen un papel fundamental
en la clula. El mecanismo de xido-reduccin se realiza segn el siguiente
esquema:

H H

CONH 2 CONH 2

+ 2H + H+

+
N N

R R

41
Deshidrogenases ligadas a la flavina:

Esta clase de enzimas contienen flavn-adenn-dinucletido (FAD) o bien flavn-

mononucletido (FMN) como grupos prostticos. En la mayor parte de las flavn-
deshidrogenasas el nucletido flavnico se halla firmemente unido y no se separa de
la enzima durante el ciclo cataltico.
Veamos la estructura del FMN:

6-7 dimetil-iso-aloxacina

CH2

CH2

CH2

riboflavina CH2
(vitamina B2)
CH2

FDN
O OH

+ O adenina
HO P O P OCH2
H H
O O
H
OH OH

FDN: resulta de la unin pirofosfrica entre el FMN y el AMP. La parte activa del
FAD y del FMN es el anillo de isoaloxacina.
O H O

H N H
N
CH3 N CH3 N

CH3 CH3
N N O N N O

R R H

En cuanto a la coenzima Q o ubiquinona existen controversias. Importantes

experimentos recientes permiten creer que la CoQ es realmente uno de los
transportadores de la cadena respiratoria, y que funciona, posiblemente, como una
molcula liposoluble que acta a modo de nexo de unin entre las flavoprotenas y el
sistema de los citocromos.

Citocromos: Los citocromos son un grupo de ferroprotenas transferidoras de

42
electrones en las clulas aerobias, que actan secuencialmente transfiriendo
electrones desde las flavoprotenas al oxgeno molecular .Todas ellas contienen
grupos prostticos ferroporfirnicos; en este aspecto se parecen a la hemoglobina y a
la mioglobina. Los citocromos experimentan cambios de valencia reversibles, Fe (II) -
Fe (III), durante el ciclo cataltico. El citocromo terminal de la cadena, que puede
reaccionar con el oxgeno, es la citocromo-oxidasa. Las formas reducidas de los
dems citocromos no pueden reoxidarse directamente por el oxgeno molecular.

Estructura: Los citocromos tienen grupos prostticos hierro porfirnicos. El anillo

porfirnico deriva del compuesto tetrapirrlico llamado porfina que se designa segn
sus cadenas laterales sustituyentes.

HC CH
N +++
Fe

++
N Fe HN

N
HC CH

Forman quelatos (literalmente, cuatro dientes) con iones metlicos como el hierro,
por ejemplo. En los citocromos, el tomo de Fe experimenta cambios reversibles
entre las formas Fe (II) y Fe (III); su funcin real es la de desempear el papel de
transportadores electrnicos.

Potencial estndar de xido-reduccin en la cadena respiratoria

Los potenciales de reduccin de los diferentes transportadores electrnicos, se

hacen ms positivos a medida que los electrones pasan desde el sustrato el
oxgeno. Es decir, que el transportador electrnico ms prximo el extremo inicial de
la cadena, o sea el NAD es el trmino ms reducido, mientras que los
transportadores situados en el extremo del oxgeno (citocromo a + a3) estn casi por
completo en la forma oxidada. Los transportadores intermedios en estados
sucesivamente ms oxidados, segn una escala que va desde el sustrato hasta el
oxgeno.

Energtica del transporte electrnico-Fosforilacin oxidativa

Hemos visto que el G que se produce en el transcurso de cualquier reaccin

qumica es funcin de su constante de equilibrio.
G RT Ink eq
43
 Puede utilizarse una forma modificada de esta expresin para calcular la G
que se produce cuando reaccionan entre s dos pares de xido-reduccin cuyos
potenciales de reduccin estndar son conocidos.
G nFT E '0

G = variacin de energa libre estndar expresada en caloras;

n = nmero de electrones transferidos;
F = equivalente calorfico de Faraday;
E' 0 = la diferencia entre los potenciales de reduccin estndar del aceptor del
dador electrnico.
Se supone que todos los componentes se hallan a concentraciones 1, 0 M, a 25 C y
pH = 7,0
Mediante esta relacin, podemos calcular la G cuando se transfiere un par
equivalentes electrnicos desde el NADH al oxigeno molecular, es decir a lo largo de
toda la cadena respiratoria.
G 2 23062 0.82 0.32 52.700 kcal 52.7 kcal
Se produce, por tanto, una variacin de energa libre muy grande durante el proceso
de transporte electrnico desde el NADH hasta el oxgeno molecular, a travs de la
cadena respiratoria. Este valor puede compararse con la energa libre estndar de
formacin de ATP a partir del ADP y el fosfato.
ADP + FOSFATO ATP + H2O G 7.3 kcal

Puede verse que la transferencia de un par de electrones, desde el NADH al oxgeno

va acompaada de una disminucin de energa libre lo suficientemente grande para
que resulte posible la sntesis de varias molculas de ATP, a partir de ADP y de
fosfato, en las condiciones estndar, siempre que se disponga de un mecanismo de
acoplamiento.
Mediante clculos semejantes se obtienen las G que tienen lugar en cada una de
las etapas principales de transferencia electrnica en la cadena respiratoria, cuyos
potenciales de reduccin estndar son conocidos.
Tres de los pasos de la cadena respiratoria muestran G relativamente grandes;
ellos son:
1. Entre NAD y FAD
2. Entre citocromo b y c
3. Entre citocromo a y el oxgeno

En cada uno de ellos se produce una disminucin de energa libre suficientemente

grande para que se origine la formacin acoplada del ATP a partir de ADP y de
fosfato.
Las G en otros puntos de la cadena son pequeas y, por ello resultan
insuficientes para provocar la formacin de una molcula de ATP.

44
Acoplamiento de la fosforilacin oxidativa al transporte electrnico

La fosforilacin del ADP acoplado a la respiracin representa un mecanismo de

recuperacin aerobia de energa y recibe el nombre de fosforilacin oxidativa.
La ecuacin global para las fosforilaciones de la cadena respiratoria puede escribirse
como sigue:
NADH + H+ + 3 ADP + 3 Pi + +1/2 O2 NAD+ + 4 H2O + 3 ATP

que podemos analizar desde el punto de vista de su componente exergnico.

NADH + H+ + 1/2 O2 NAD+ + H2O G 52.7 kcal

y de su componente endergnico:
3 ADP + 3 Pi 3 ATP + 3 H2O G 3 7.3 21.9 kcal

La fosforilacin oxidativa acoplada de tres molculas de ATP conserva por lo tanto

21,9/52,7 x 100, es decir, alrededor del 40% del descenso total de energa libre.
Slo se formarn 3 molculas de ATP si el sustrato se oxida a nivel del NAD. Puede
ocurrir que el sustrato entregue sus electrones a la flavoproteina (por ej. succinato)
en este caso se producen 2 molculas de ATP; y si entrega sus electrones al
citocromo a, (por ej. cido ascrbico) se forma solamente una molcula de ATP.

Balance energtico de un proceso de respiracin

Es decir, el G , cuando la glucosa se oxida completamente hasta CO2 H2 O por la

secuencia glicocoltica y el ciclo del cido tricarboxlico.
1.
a
glucosa 2 piruvato

glucosa + 2 Pi + 2 ADP + 2 NAD+ 2 piruvato + 2 NADH + H+ + 2 ATP + 2 H2O

2.
2 piruvato 2 acetil CoA

2 (piruvato + NAD+ + HS - CoA) 2 acetil CoA + 2NADH + 2H+ + 2CoA2

NADH H se reoxida en la cadena respiratoria y se producen 3 ATP; como

son 2 moleculas de NADH + H+ 3 ATP x 2 = 6 ATP

3. Ciclo de Krebs se producen 24 ATP

a. 2 isocitrato 2 alfa-cetoglutarato hay deshidrogenacin, los H 2 son

captados por el NAD que se reoxida en la cadena respiratoria y se
45
 producen 6 ATP.
H2O
b. 2 alfa-cetoglutarato 2 succinato, ocurre lo mismo, o sea que
tambin se producen 6 ATP.
H2
c. 2 malato 2 oxalacetato 6 ATP.
H2
d. 2 succinato 2 fumarato. En este caso los hidrgenos son
captados por el FAD. Se producen 4 ATP.
e. 2 succinato CoA 2 succinato, hay una fosforilacin a nivel de
sustrato de producen 2 ATP.

Resumiendo:
a .. 6 ATP
b .. 6 ATP
c .. 6 ATP
d .. 4 ATP
e .. 2 ATP
24 TP

4. El NAD H que se produce en la gliclisis en el pasaje de gliceraldehdo

3 P 3 P glicerato , cuando el proceso es anaerobio se reoxida en el pasaje de
piruvato lactato .
Cuando el proceso es aerobio el NADH H se reoxida en la cadena respiratoria, por
lo tanto se producen 2 ATP x 2 (porque son dos molculas de NADH H ) = 4 ATP.
O sea que el balance global ser:

1. .. 2 ATP
2. ... 6 ATP
24 glucosa + 6 O2 + 36 Pi + 36 ADP
3. ..
ATP
6 CO2 + 36 ATP + 42 H2O
4. .. 4 ATP
36
ATP

Si analizamos el componente exergnico

glucosa + 6 O2 6 CO2 + 6 H2O G 680 kcal

componente endergnico
36 Pi + 36 ADP 36 ATP + 36 H2O G 263 kcal

La eficacia global de la recuperacin de energa resulta ser:

46
 263
100 39%
680

Cmo entra el NADH producido en la gliclisis a la cadena respiratoria?

El NADH 2 citoplasmtico producido en la gliclisis es impermeable a la membrana

mitocondrial, por lo tanto si no penetra en la mitocondria no se puede reoxidar a nivel
de la cadena respiratoria. Aunque el NADH no puede penetrar, sus electrones
pueden hacerlo por medios indirectos denominados lanzaderas. La mejor conocida
es la lanzadera del glicerolfosfato. El NADH citoplasmtico reacciona con la
dihidroxiacetona citoplasmtica para formar glicerol-3-fosfato en una reaccin
catalizada por la glicerofosfato-deshidrogenasa citoplasmtica.

dihidroxiacetona fosfato + NADH + H+ glicerol-3-fosfato + NAD+

El glicerol-3-fosfato atraviesa fcilmente la membrana mitocondrial. En el interior de

la mitocondria otra glicero-3-fosfato-deshidrogenasa reoxida el glicerol-3-fosfato a
dihidroxiacetona fosfato.

glicerol-3-fosfato + FAD dihidroxiacetona fosfato + FADH2

La flavoprotena reducida cede sus equivalentes de reduccin a la cadena

respiratoria a nivel de CoQ y finalmente pasan al oxgeno. La dihidroxiacetona
fosfato formada en esta reaccin difunde fuera de la mitocondria el citoplasma en
donde puede aceptar electrones de otra molcula de NADH extramitocondrial.

NADH + H+ NAD+

DIHIDROXICETONA-P GLICEROL-FOSFATO

NAD

FAD
ATP

ATP MITOCONDRIA

O2

47
TEMA XVIII: Oxidacin de los cidos grasos

Hidrlisis intracelular de los lpidos. Ciclo de oxidacin de los cidos grasos:

activacin y entrada de los cidos grasos a la mitocondria. Primera
deshidrogenacin. Hidratacin. Segunda deshidrogenacin. Clivaje tilico. Oxidacin
de los cidos grasos insaturados. Cuerpos cetnicos y su oxidacin. Oxidacin de
los cidos grasos de carbono impar.

Aunque los hidratos de carbono, a causa de su abundancia constituyen el

combustible principal para la mayor parte de los organismos, los cidos grasos
desempean tambin un papel muy destacado como fuente energtica. La oxidacin
de los cidos grasos es importante en los animales superiores y en las plantas, que
pueden almacenar cantidades grandes de grasa neutra como combustible de
reserva. La grasa neutra posee un valor calorfico elevado (9 Kcal) y puede
almacenarse en forma casi anhidra en las gotitas de grasa intracelulares, mientras
que el glucgeno o el almidn (valor calrico = 4 Kcal) se hallan demasiado
hidratados para poder almacenarse en forma tan concentrada.

Hidrlisis intracelular de los lpidos

Los cidos grasos que experimentan oxidacin en los tejidos de los animales
superiores provienen del fluido extracelular o bien de los lpidos intracelulares
endgenos. La sangre de los vertebrados contiene cantidades considerables de
triacilgliceroles y de fosfoglicridos, as como cantidades muy pequeas de cidos
grasos libres unidos a la protena seroalbmina, que acta transportando los cidos
grasos. Estos ltimos son oxidados en tejidos tales como el corazn y el msculo.
La fuente endgena principal de cidos grasos combustibles es grasa de depsito,
en foma de gotitas de grasa del citoplasma, constituido, en su mayor parte por
triacilgliceroles.

Resumiendo lo expuesto:

de la sangre que contiene

a. fluido extracelular triacilgliceroles, fosfoglicridos,
cidos grasos

cidos grasos a
oxidarse provienen 1. grasa de depsito constituida
por triacilgliceroles.
b. fuente endgena
2. fosfoglicridos de las
membranas

A. Hidrlisis intracelular

Los cidos grasos deben hallarse en forma libre, es decir, no esterificados para que
puedan experimentar el proceso de activacin y oxidacin. Para ello, deben en
primer lugar, hidrolizarse por la accin de lipasas intracelulares para rendir cidos
grasos libres y glicerina. Se sabe relativamente poco acerca de la secuencia y

48
detalles de la hidrlisis intracelular de los lpidos. Sin embargo, en general, no tiene
lugar acumulacin significativa de cidos grasos o de otros productos de hidrlisis
que seran txicos para la estructura de la membrana. Evidentemente, la velocidad y
la ruta de hidrlisis de los lpidos intracelulares est ajustada a la velocidad de
utilizacin de los cidos grasos.

B. Ciclo de los cidos grasos

Activacin y penetracin de los cidos grasos en el interior de la mitocondria

Existen 3 fases en la entrada de los cidos grasos procedentes del citoplasma
extramitocondrial, en el interior de la mitocondria.
1. Esterificacin enzimtica del cido graso libre con la CoA extramitocondrial,
a expensas del ATP, que tiene lugar en la membrana exterior.
2. Transferencia del grupo acilo graso desde la CoA a la molcula
transportadora carnitina, la cual lo conduce a travs de la membrana interior.
3. Transferencia del grupo acilo graso desde la carnitina a la CoA
intramitocondrial.

Activacin de los cidos grasos

Tres enzimas diferentes catalizan la formacin de steres acil-CoA graso; cada una
de ellas se especfica para un determinado intervalo de longitud de cadena de cido
graso.

Acetato-tioquinasa Activa los cidos actico, propinico

y acrlico

Tioquinasa de cido graso Activa los cidos grasos desde

de cadena media cuatro hasta doce tomos de
carbono

Tioquinasa de cido graso Activa los cidos grasos de 12 a 22

de cadena larga o ms; tomos de carbono

Las ltimas dos tioquinasas activan tanto los cidos grasos saturados como los no
saturados. Las tres se encuentran en la membrana exterior de la mitocondria. Las
propiedades y mecanismos de las tres tioquinasas, son ms o menos idnticos. La
reaccin global catalizada por las tioquinasas ligadas al ATP es la siguiente:

R COOH + ATP + CoA SH R CH SCoA + AMP + PPi

A medida que el enlace tioster se forma entre el grupo carboxilo del cido graso y el
grupo tiol de la CoA, el ATP experimenta ruptura pirofosfrica y rinde AMP PPi . A
su vez el PPi formado resulta hidrolizado por la pirofosfatasa inorgnica.

49
 PPi + H2O 2 Pi

El efecto neto de esta hidrlisis es la utilizacin de dos enlaces fosfato de elevada

energa para impulsar el equilibrio global de la etapa de activacin a la formacin de
acil CoA graso.

Transferencia de carnitina

Los cidos grasos superiores poseen una capacidad limitada para atravesar la
membrana interior de la mitocondria en forma de steres de CoA; pero su entrada es
estimulada por la carnitina. En el proceso acta una enzima la acil-CoA graso:
carnitin transferasa de cido graso, que cataliza la transferencia del grupo acilo
graso desde su enlace tioster con la CoA, a un enlace ster con la carnitina que es
un enlace de elevada energa.

CH3 O

+
CH3 N CH2 CH CH2 COOH + R C S CoA

CH3 OH

CH3

+
CH3 N CH2 CH CH2 COOH + CoA SH

CH3 O

C O

El compuesto carnitn-O-acilo graso, as formado, atraviesa con facilidad la

membrana interna de la mitocondria; no se sabe si el paso se realiza por simple
difusin o con intervencin de algn mecanismo transportador de la membrana
mitocondrial.

Transferencia de la CoA intramitocondrial

En la ltima etapa del proceso de penetracin, el grupo acilo graso es transferido

desde la carnitina a la CoA intramitocondrial por accin de la carnitn-transferasa de
cido graso intramitocondrial.

acil-graso-carnitina + CoA SH acil-graso-CoA + carnitina

Este mecanismo de entrada ejerce el efecto de mantener separada la CoA

extramitocondrial de la intramitocondrial. El acil-graso-CoA se emplea entonces

50
como sustrato para el ciclo de oxidacin del cido graso, que tiene lugar en el
compartimiento interno de la matriz. Las mitocondrias contienen otro tipo de acil-
tioquinasas que participan en la activacin del cido graso. Esta enzima necesita
GTP en lugar de ATP y produce GDP Pi .

GTP + RCOOH + CoASH R C SCoA + GDP + Pi

Puesto que la carnitina no es necesaria para su accin, probablemente est

implicada en la activacin de los cidos grasos libres formados en el interior de las
mitocondrias.

C. Primera etapa de deshidrogenacin

A continuacin de la etapa de activacin, las reacciones de oxidacin del cido graso

tienen lugar en el compartimiento interior de la mitocondria. El ster formado
experimenta la deshidrogenacin enzimtica en los tomos de carbono alfa y beta,
es decir, en los tomos de carbono 2 y 3, para formar un acil-graso-CoA no
saturado. La posicin del doble enlace se designa mediante el smbolo 2,3 . Existen
cuatro clases diferentes de deshidrogenasas de acil CoA graso que contienen FAD,
cada una de las cuales es especfico para un determinado intervalo de longitud de
cadena del cido graso.

2 3
R CH2 CH2 C SCoA acil-graso CoA

E FAD oxi.

H O

R C C C SCoA 2,3 trans-enoil CoA + E FAD red.

El enlace no saturado 2,3 formado en esta reaccin es el ismero geomtrico trans.

Los electrones del FAD red. son cedidos a la cadena respiratoria.

D. Etapa de hidratacin
La hidratacin reversible del doble enlace de los steres 2,3 enolicos del CoA
para formar beta-hidroxiacil-CoA es catalizada por la enzima enoil-hidratasa.
51
 H O

R CH2 C C C S CoA 2,3 trans-enoil CoA

OH O

R CH2 C CH2 C SCoA hidroxi-acil-CoA

E. Segunda etapa de deshidrogenacin

El compuesto obtenido se deshidrogena para formar un 3-oxoacil-graso-CoA,

con intervencin de la -hidroxiacil-graso-CoA-deshidrogenasa siendo el NAD el
aceptor electrnico especfico.
OH O
R CH2 C CH2 C SCoA + NAD+

H
O O
+
R CH2 C CH2 C SCoA + NADH + H

El NADH cede sus electrones a la NADH deshidrogenasa de la cadena respiratoria.

Etapa de ruptura tilica

En la ltima etapa de la secuencia de la oxidacin del cido graso, que es

catalizada por la tiolasa, el 3 oxoacil-graso-CoA experimenta una escisin por
interaccin con una molcula de CoA libre para producir un fragmento de dos
carbonos que contiene el carboxilo terminal en forma de acetil-CoA libre, y el ster
del CoA de un cido graso cuya cadena se ha acortado en dos tomos de carbono.
O O
R CH2 C CH2 C SCoA + CoA SH

O
O
R CH2 C SCoA + CH3 C SCoA

La reaccin es muy exergnica, y el equilibrio favorece por tanto la ruptura.

Balance de la oxidacin

Con la reaccin de tilisis se ha completado una vuelta de la secuencia de oxidacin

del cido graso, en la que una molcula de acetil-CoA, y dos pares de tomos de
hidrgeno resultan eliminados de un acil-CoA graso de cadena larga. La ecuacin
52
global de una vuelta de la secuencia de oxidacin del cido graso actuando sobre el
palmitoil-CoA es la siguiente:
palmitoil CoA + CoA + FAD + NAD+ + H2O

miristoil CoA + acetil CoA + FADH2 + NADH + H+

Ahora podemos escribir la ecuacin para las siete vueltas del espiral necesarias
a fin de convertir una molcula de palmitoil-CoA en 8 molculas de acetil CoA (el
cido palmtico tiene 16 tomos de carbono). Cada molcula de FADH 2 cede un
par de equivalentes electrnicos a la cadena respiratoria a nivel de la CoA y se
generan 2 molculas de ATP. De modo anlogo, la oxidacin de cada molcula
de NADH da por resultado la formacin de 3 molculas de ATP. Por lo tanto, se
forman un total de 5 molculas de ATP por molcula de acetil-CoA escindido.
Podemos escribir ahora la ecuacin que tambin comprende las fosforilaciones:
(1) pamitol CoA + 7 CoA + 7 O2 + 35 Pi + 35 ADP

8 acetil CoA + 35 ATP + 42 H2O

Las 8 molculas de acetil CoA formadas en el ciclo del cido graso pueden
incorporarse ahora al ciclo de Krebs
(2) 8 acetil CoA + 16 O2 + 96 Pi + 96 ADP

8 CoA + 96 ATP + 104 H2O + 16 CO2

Combinando la ecuacin (1) y (2) obtenemos la ecuacin global:

pamitol CoA + 23 O2 + 131 Pi + 131 ADP

CoA + 16 CO2 + 131 ATP + 146 H2O

Puesto que se necesita una molcula de ATP ( o de GTP) para activar el cido
palmtico libre al comenzar, podemos suponer que el rendimiento neto de ATP es de
130 molculas.

Oxidacin de los acidos grasos no saturados

Los cidos grasos no saturados, son oxidados por las mismas rutas generales que
los cidos saturados; pero se plantean dos problemas:
1. Los dobles enlaces de los cidos grasos no saturados existentes en la
naturaleza se hallan en la configuracin geomtrica cis, mientras que los
steres 2,3 insaturados del acil CoA que actan como intermediarios en
la oxidacin de los cidos grasos saturados, son trans.
2. Los dobles enlaces de la mayor parte de los cidos grasos no saturados
aparecen en posiciones tales que la eliminacin sucesiva de fragmentos
de dos tomos de carbono rinde un acil-CoA graso 3,4 en lugar de 2,3 .

53
Se ha resuelto este problema con el descubrimiento de una enzima auxiliar, la 3,4 -
cis- 2,3 -trans-enoil CoA-isomerasa que cataliza el desplazamiento del doble enlace
desde la configuracin 3,4 -cis a la 2,3 -trans que es el sustrato normal de la
siguiente enzima de la secuencia de oxidacin del cido-graso.
Cuerpos cetnicos y su oxidacin

En muchos vertebrados el hgado posee la capacidad enzimtica adecuada para

desviar algo de acetil-CoA, hacia la formacin de acetoacetato y -hidroxibutirato,
los cuales son transportados por la sangre a los tejidos perifricos, en donde pueden
ser oxidados por el ciclo del cido tricarboxilico. Estos compuestos reciben el
nombre de cuerpos cetnicos. El acetoacetato proviene de la condensacin de dos
molculas de acetil-CoA catalizado por la tiolasa.

acetil CoA + acetil CoA acetoacetil CoA + HSCoA

La acetoacetil CoA experimenta la prdida de la CoA para transformarse en

acetoacetato, proceso conocido como desacilacin.
La principal ruta para la desacilacin es la formacin y escisin enzimtica del -
hidroxi- -metil glutaril CoA.

CH3 O

HOOC CH2 C CH2 C SCoA

OH

acetoacetil CoA + acetil CoA -hidroxi -metil glutaril CoA + CoA

El acetoacetato libre as producido se reduce enzimticamente a Beta-

hidroxibutirato, por la Beta-hidroxibutirato deshidrogenasa ligada al NAD.

acetoacetato + NADH + H+ Beta-hidroxibutirato + NAD+

La mezcla de acetoacetato y Beta hidroxibutirato resultante de esta reaccin pueden

difundir despus, fuera de la clula heptica, a la corriente sangunea y llegar a los
tejidos perifricos. Normalmente la concentracin de cuerpos cetnicos en la sangre
es muy baja, pero a causa del ayuno o por la diabetes puede alcanzar niveles
elevados.
Esto es debido, a que al no existir glucosa utilizable por la clula, sta se vale de las
grasas, las cuales al degradarse dan como producto acetil CoA en cantidades
elevadas.
Oxidacin de cidos grasos de nmero impar de carbonos
Estos cidos grasos raramente se encuentran en la naturaleza. Son oxidados por el
ciclo de oxidacin del cido graso. Se separan sucesivamente restos de acetil CoA
hasta que se llega a un resto terminal de tres tomos de carbono: propionil-CoA.
El propionil CoA experimenta una carboxilacin enzimtica que lo transforma en
metil-malonil CoA que es isomerizado a succinil CoA, que pierde la CoA para rendir
succinato que se incorpora al ciclo del cido tricarboxlico.
54
TEMA XIX: Degradacin oxidativa de los aminocidos

Esquema de la oxidacin de los aminocidos. Transaminacin y funcin del piridoxal

fosfato. Desaminacin oxidativa. Vas de la acetil CoA y del alfacetoglutorato, del
succinato, del oxalacetato. Formacin de los productos de excrecin nitrogenada.
Ciclo de la urea. Excrecin de amonaco. Formacin de cido rico.

Aunque la funcin primordial de los A.A. es la de ser precursores de las protenas y

de otras biomolculas, se emplean con frecuencia como fuente energtica. Los
animales superiores oxidan activamente los aminocidos tanto exgenos como
endgenos. An cuando no se haya ingerido cantidad alguna de protenas, los seres
humanos pueden excretar hasta 5 grs. de N 2 cada da, que corresponden a la
oxidacin neta de casi 30 grs. de protena endgena.
El ciclo de los cidos tricarboxlicos es la ruta definitiva para la oxidacin de los
esqueletos carbonados de los aminocidos.
En este captulo describiremos la degradacin oxidativa de los aminocidos
normalmente presentes como unidades estructurales de las protenas, lo que
constituye la corriente principal del catabolismo de los aminocidos.
Aunque las reacciones enzimticas bsicas implicadas en el catabolismo aminocido
son en su mayor parte semejantes en todos los organismos, el ritmo real de
utilizacin y la proporcin de los diferentes aminocidos empleados en un organismo
determinado dependen de muchos factores que incluyen:
La capacidad gentica para metabolizar aminocidos;
La asequibilidad de aminocidos del entorno;
La dependencia nutritiva del organismo respecto de los aminocidos e-
senciales;
La disponibilidad de otros combustibles calorficos;
Las necesidades de aminocidos del organismo para la sntesis proteica;
La necesidad de aminocidos especficos como precursores de ciertas
biomolculas importantes, tales como purinas, pirimidinas, componentes de la
pared celular, hormonas y otras molculas especializadas.

PROTEOLISIS

Antes que las protenas puedan incorporarse a las rutas catablicas deben
experimentar hidrlisis completa hasta transformarse en aminocidos ya que las
molculas proteicas intactas y la mayora de los pptidos no pueden atravesar la
membrana celular, mientras que los aminocidos libres son absorbidos fcilmente.
Los pptidos extracelulares y las protenas con frecuencia son hidrolizados por
accin de enzimas segregadas al entorno, por ejemplo muchos microorganismos
forman y segregan peptidasas y enzimas proteolticas. Sin embargo, la protelisis
extracelular ha sido estudiada con mximo detalle en el tracto digestivo de los
vertebrados (ver proceso en pgina 460 de Lehninger). Por accin combinada de las
enzimas proteolticas segregadas por el estmago, el pncreas y el intestino
delgado, las protenas ingeridas se hidrolizan por completo hasta aminocidos, los
cuales son absorbidos por las clulas epiteliales del intestino delgado, mediante un
transporte activo que requiere energa. Los aminocidos son enviados luego a los
55
tejidos por medio de la sangre. Al entrar en las clulas individuales tambin por
transporte activo, se incorporan a los canales metablicos. Se sabe muy poco de la
protelisis intracelular, que en algunos tejidos como el hgado, tiene lugar a un ritmo
elevado.

ESQUEMA DE LA OXIDACION DE LOS AMINOACIDOS

Para la oxidacin de los 20 aminocidos diferentes existen 20 secuencias

multienzimticas distintas. En ltimo trmino todas convergen en unas pocas rutas
terminales que conducen al ciclo de los cidos tricarboxlicos. Los esqueletos
hidrocarbonados de 10 de los A.A. son convertidos finalmente en acetil-CoA, ya sea
por la va del piruvato o por la del acetoacil-CoA, cinco se convierten en
cetoglutarato, tres en succinil-CoA y dos en oxalacetato. La fenilalanina y la tirosina
se degradan de modo que una porcin del esqueleto hidrocarbonado se incorpora
como acetil-CoA y lo otra como fumarato. Sin embargo no todos los tomos de C de
los 20 A.A. se incorporan al ciclo del cido tricarboxlico ya que algunos se pierden
por el camino de la descarboxilacin. Las rutas del catabolismo no son
necesariamente idnticas a las de la biosntesis, pero hay algunas etapas que son
comunes.

Alanina
Arginina
Cistena Glutamato
Piruvato Histidina
Glicocola
Glutamina
Serina
Prolina
Treonina
Oxoglutarato
Isocitrato
Isoleucina
Leucina Isoleucina
Triptfano Succinil-CoA Metionina
Citrato Valina

Acetil-CoA Succinato

Oxalacetato Tirosina
Fumarato
Acetoacetil-CoA
Fenilalamina
Malato

Aspartato
Fenilalanina
Asparagina
Tirosina
Leucina
Lisina
Triptfano

Los grupos -amino de los aminocidos comparten un destino comn, al menos en

los vertebrados, los cuales excretan el N 2 amnico en forma de Urea, Amonaco o de
cido rico, segn la especie. Los mecanismos por los cuales los grupos NH2 son
eliminados de los A.A. y luego convertidos en cualquiera de los tres productos de
excrecin, son completamente semejantes. Puesto que la eliminacin de los grupos
56
 NH2 constituye la primera etapa en la degradacin de los A.A., examinaremos
ahora los dos procesos principales implicados en esta reaccin, ellos son la
Transaminacin y la Desaminacin Oxidativa.
TRANSAMINACION

Por este proceso el grupo amino de por lo menos 11 aminocidos es separado

enzimticamente por transaminacin y transferido al carbono de uno o tres
oxocidos (piruvato; cetoglutarato o al oxalacetato). Por lo tanto el aminocido al
perder su grupo NH2 se transforma en el oxocido correspondiente y el -oxocido
que acepta el grupo NH2 se transforma en el aminocido correspondiente. Dos
transaminasas importantes son: la ALANIN-TRANSAMINASA; que cataliza la
reaccin:
a minocido cido pirvico oxocido alanina

y la GLUTANATO-TRANSAMINASA, que cataliza la reaccin:

a minocido cido oxoglutrico oxocido cido glutmico

Ejemplo de transaminacin:

R' O O NH2

H C NH2 + R2 C COOH R1 C COOH + R2 C COOH

COOH H

Cualquiera sea la ruta de transaminacin, el -cetoglutarato es el aceptor final de

los grupos NH2 de la mayor parte de los A.A. y luego transporta esos grupos NH2
hasta una secuencia final de reacciones mediante las cuales se forman los
productos nitrogenados finales o de excrecin. Por ejemplo en la reaccin anterior la
alanin-transaminasa cataliza la formacin de alanina a partir de un aminocido
ms cido pirvico, luego esa alanina le transfiere el grupo NH2 al cetoglutarato
por accin de la alanin-glutamato-transaminasa.

Alanina cido oxoglutri co cido pirvico cido glutmico

(aceptor final)
Las transaminasas se encuentran tanto en el citoplasma como en la mitocondria de
las clulas eucariticas; las formas mitocondriales y las extramitocondriales difieren
en sus propiedades fsico-qumicas. Todas las transaminasas emplean una misma
coenzima y comparten un mecanismo de reaccin comn. La coenzima es el fosfato
de piridoxal, un derivado de la vitamina B 6 , necesario como factor de crecimiento y
esencial en la dieta de muchos microorganismos y animales.
H

O
C O
CH2 O P OH El fosfato de piridoxal es tambin el
HO C grupo prosttico de cierto nmero de
C C
OH otras enzimas que catalizan
Fosfato de piridoxal 57
C CH
H3C N
reacciones en las que intervienen -aminocidos. En principio el fosfato de piridoxal
acta como un transportador de grupos O, en algunos casos de aminocidos. La
clave de accin es su grupo aldehdo que puede formar una base de Shiff o
cetimina, con amonaco o con diversas aminas.

Durante su ciclo cataltico en las transaminasas, la coenzima experimenta

reacciones reversibles entre la forma de aldehdo libre (fosfato de piridoxal) y su
forma aminada (el fosfato de piridoxamina). Se produce el ciclo en dos etapas:
El complejo enzima-fosfato de piridoxal, acepta un grupo amino del dador de grupos
NH2 con formacin de un complejo enzima-fosfato de piridoxamina; ello ocurre
mediante dos bases de Shiff intermedias.
El complejo enzima-fosfato de piridoxamina forma una base de Shiff con el aceptor
entrante del grupo NH2 , el -oxocido, al que se cede a continuacin el grupo NH2 .

NH2 O H H

R1 CH COOH + E C H H2O + R1 C N C E

Dador de NH2 COOH

Base de Shiff I

R1 C N CH2 E R1 C COOH + E CH2 NH2

enzima-fosfato de
COOH oxocido piridoxamina
Base de Shiff II

E CH2 NH2 + R2 C COOH R2 C N CH2 E

oxocido COOH
aceptor de NH2
Base de Shiff III

H H O NH2

R2 C N C E E C H + R2 CH COOH

COOH enzima-fosfato aminocido

de piridoxal
Base de Shiff IV

DESAMINACION OXIDATIVA

Este proceso ocurre en la mitocondria y los grupos NH2 recogidos de los diferentes
aminocidos por la accin de las transaminasas, aparecen en el ltimo trmino en
forma de grupos -aminos del L-glutamato.
En algunas clulas, particularmente en las bacterias, el glutamato experimenta una
58
desaminacin oxidativa rpida, catalizada por la glutamato-deshidrogenasa ligada a
la piridina.

L-glutamato + NAD+ oxoglutarato + NH+4 + NADH + H+

Descarga as en forma de iones NH 4 , los grupos aminos recogidos de los dems

aminocidos. La L-glutamato deshidrogenasa puede usar tambin el NADP como
aceptor de electrones, el NADPH as formado, acta como reductor en las
reacciones biosintticas. La mayor parte de los organismos tienden a reutilizar el
NH 4 formado en el catabolismo de los A.A. recuperndolo.

cetoglutar ato NH4 NADH H glutamato NAD

Glutamato deshidrogenasa

RUTAS QUE CONDUCEN AL ACETIL-CoA

Treonina

Cistina
Glicocola

Cisteina Serina Alanina

cido Pirvico

Acetil-CoA

El esquema muestra los portales de entrada por los que penetran en el ciclo de los
cidos carboxlicos, los esqueletos carbonados de los diferentes aminocidos. Las
rutas de los 20 A.A. dependen del punto de entrada. El punto principal de entrada en
el ciclo es por la va del acetil-CoA, diez aminocidos penetran por esta ruta, cinco
de ellos se degradan al acetil-CoA por la va del piruvato y los restantes por la del
acetoacetil-CoA.

59
 NH2

CH3 CH CH COOH

OH

Treonina
O
Glicocola H2N CH2 COOH CH3 C
H acetaldehdo
Serin-
hidroximetil
CH OH tranferasa

NH 2 NAD+
ATP
Serina CH2 CH COOH CoA
OH Serina
deshidrasa
O

cido Pirvico NADH + H+

CH3 C COOH
AMP; Pi
Piruvato O
deshidrogenasa
CH3 C S CoA

Acetil CoA

VIA DEL PIRUVATO

Los cinco aminocidos que penetran por la va del piruvato son la alanina, la
cistena, la glicocola, la serina y la treonina (ejemplo anterior). La alanina rinde
directamente piruvato por transaminacin con el -cetoglutarato. En el ejemplo
puede verse como se degradan hasta piruvato, la treonina, la glicocola y serina.

RUTA DEL -OXOGLUTARATO

Los esqueletos carbonados de cinco aminocidos (arginina, histidina, cido

glutmico, glutamina y prolina) entran en el ciclo de los cidos tricarboxlicos por la
va de -cetoglutarato, cuyo precursor inmediato es el cido glutmico.

Arginina Prolina

Semialdehdo
glutmico
Histidina Glutamina

cido Glutmico

cetoglutar ato

60
El esquema muestra las rutas que conducen hasta el -cetoglutarato de los
distintos A.A. para poder entrar al ciclo de Krebs.

RUTA DEL SUCCINATO

Los esqueletos carbonados de la metionina, la isoleucina y la valina, se degradan

definitivamente, por la va del propionil-CoA y del metilmalonil-CoA, a succinil-CoA
que experimenta una desacilacin para dar succinato, intermediario del ciclo de
Krebs.

METIONINA

cido oxobutrico
Isoileucina

Propionil-CoA
Valina

Metilmalonil-CoA

Succil-CoA

RUTA DEL OXALACETATO

La asparagina y cido asprtico se incorporan finalmente al ciclo de Krebs en forma

de oxalacetato. La asparagina en primer lugar se hidroliza a cido asprtico y
amonaco por la accin de la asparaginasa.
Asparagina + H2O cido-aspartico + NH3

El aspartato as formado, experimenta transaminacin con el cido -cetoglutarato

para formar cido oxalactico.

cido aspartico + cido oxoglutarato cido oxalactico + cido glutmico

De esta manera los cuatro tomos de carbono de estos aminocidos pueden

incorporarse al ciclo de Krebs. En las plantas y en algunos microorganismos el cido
asprtico experimenta una eliminacin directa de NH3 para dar fumarato, catalizada
por la enzima aspartasa, que no se encuentra presente en los tejidos animales.
cido aspartico cido fumrico + NH3

61
FORMACION DE PRODUCTOS DE EXCRECION NITROGENADOS

La mayora de los vertebrados excretan definitivamente cierta fraccin del amonaco

formado en una de estas tres formas: urea, amonaco, o cido rico. El N 2 amnico
es excretado por la mayor parte de los vertebrados terrestres en forma de urea. Son
organismos designados como ureotlicos. Muchos animales acuticos, tales como
los peces telesteos, excretan nitrgeno amnico en forma de NH3 y se les denomina
amonotlicos.
Los pjaros y los reptiles terrestres, cuyo consumo de agua es limitado, excretan el
N 2 amnico en forma de cido rico (en forma semislida) y a estos organismos se
los llama uricotlicos. Los anfibios ocupan una posicin intermedia. El renacuajo,
cuyos hbitos son acuticos, excreta amonaco, despus de la metamorfosis,
durante la cual el hgado adquiere las enzimas necesarias, la rana adulta excreta
urea.

CICLO DE LA UREA

La formacin de urea tiene lugar casi por completo en el hgado de los organismos
ureotlicos, es catalizada por un mecanismo cclico denominado ciclo de la urea.
Penetran en este ciclo dos grupos aminos que proceden inicialmente de los -
aminocidos por desaminacin, junto con una molcula de CO 2 y forman arginina a
partir de la ornitina, diaminocido homlogo de la lisina. Esta parte del ciclo de la
urea tiene lugar en casi todos los organismos capaces de realizar la biosntesis de la
arginina pero solamente los animales ureotlicos poseen grandes cantidades de
enzima arginasa, que cataliza la hidrlisis irreversible de la arginina para formar urea
regenerando ornitina. La urea molcula neutra soluble en H2 O se excreta con la
orina.
- NH2 arginina
cido
- NH2 asprtico arginasa

Grupos oxoglutarato cido

-amino glutmico H2N C NH2
citrulina
O

- NH2 carbamil-
fosfato
C NH2 ornitina

El primer grupo NH2 que entra al ciclo surge en forma de NH3 libre como
consecuencia de la desaminacin oxidativa ligada al NAD del glutamato en las
mitocondrias.

cido glutmico + NAD+ cido oxoglutrico + NH3 + NADH + H+

Entonces el NH3 libre es utilizado junto con el CO 2 para formar fosfato de carbamilo
en una reaccin compleja, catalizada por la carbamil-fosfato sintetasa.
62
 -
O O

-
CO2 + NH3 + 2 ATP + H2O H2N C O P O + ADP + Pi

O
Fosfato de carbamilo

Se necesitan dos molculas de ATP para formar cada molcula de fosfato de

carbamilo que interviene en esta reaccin, la cual es irreversible. El fosfato de
carbamilo es un compuesto rico en energa. El fosfato de carbamilo originado en
esta reaccin, cede a continuacin, su grupo carbamilo a la ornitina para formar
citrulina y fosfato; la reaccin es catalizada por la ornitin-transcarbamilasa.
El segundo grupo NH2 penetra despus en el ciclo de la urea, al que llega en
forma de aspartato que a su vez lo adquiri del glutamato por accin de la aspartato-
glutamato-transaminasa.

cido glutmico + cido oxalactico cido oxoglutrico + cido asprtico

A continuacin el grupo NH2 del aspartato se condensa con el tomo de carbono

carbonlico de la citrulina en presencia de ATP para formar argininosuccinato,
reaccin catalizada por la arginosuccinato sintetasa.
El arginosuccinato es escindido en forma irreversible por accin de la arginin-
succinasa, con formacin de arginina y fumarato libre. Hasta este punto la secuencia
de la reaccin es empleada por la mayora de las clulas en la biosntesis de la
arginasa.
Los animales ureotlicos sin embargo poseen arginasa, la cual desdobla, la arginina
en urea y ornitina que vuelve al ciclo. La ecuacin global del ciclo de la urea es:

2 NH3 + CO2 + 2 ATP + H2O Urea + 2 ADP + 2 Pi + AMP + PPi

EXCRECION DE AMONIACO

Se cree que en los organismos amonotlicos los grupos NH2 derivados a diversos
-aminocidos, se transaminan para formar glutamato, que experimenta despus
una desaminacin oxidativa mediante la glutamato-deshidrogenasa. El NH3 as
formado se convierte despus en N 2 amdico de la glutamina, que es la forma de
transporte del NH3 en la mayor parte de organismos. La glutamina se forma por
accin de la glutamina-sintetasa, a partir de cido glutmico.

NH2 O NH2
Mg++
HOOC CH2 CH2 CH COOH + NH3 + ATP H2N C CH2 CH2 CH COOH + ADP + Pi

Acido Glutmico Glutamina

63
La glutamina rinde NH3 libre en los tbulos renales de la mayora de los vertebrados,
pero esta reaccin predomina en los organismos amonotlicos. La reaccin es:

Glutamina + H2O Glutamato + NH4+

El NH 4 as formado pasa directamente a la orina. Dado que la glutamina no es txica

constituye un medio de transporte eficaz del NH3 .

FORMACION DE ACIDO RICO

En los organismos uricotlicos, el cido rico es la forma principal de excrecin de

los grupos NH2 de los -aminocidos. Es tambin el producto principal de
excrecin del metabolismo purnico en los primates, los pjaros y los reptiles
terrestres. La ruta de formacin de cido rico es compleja, puesto que en primer
lugar debe formarse el anillo purnico a partir de precursores sencillos.

OH
C N C N O2
N C C N C
NH2
Amino cidos C H
Xantin
C C C C
N N HO N N oxidasa
H
H

Anillo de Purina Xantina

O H
H C N
N C
C O
C C
O N N
H H
Acido Urico
(forma oxo)

64
TEMA XX: BIOSINTESIS DE CARBOHIDRATOS

Principales vas de la sntesis de carbohidratos. Formacin de fosfoenol-piruvato a

partir de piruvato. Conversin de fosfoenol-piruvato a glucosa. Gluconeognesis a
partir de los intermediarios del ciclo de Krebs, de la acetil CoA y de los aminocidos.

Hemos visto que la transformacin de la glucosa en piruvato es la senda principal del

metabolismo de los carbohidratos en la mayora de las clulas, tanto en condiciones
aerobias como anaerobias.
El proceso inverso, la conversin del piruvato en glucosa es el camino ms
importante. Convergen sobre esta senda central biosinttica otras dos sendas las
cuales provienen de dos precursores diferentes que no son carbohidratos. Una de
ellas est dada por productos intermedios del ciclo de Krebs, que se transforman en
piruvato. Este proceso se denomina gluconeognesis. El otro camino est dado por
las reacciones que provocan la reduccin del CO 2 para formar glucosa (es en las
clulas fotosintticas).
1.- Formacin de fosfoenol-piruvato
La conversin del piruvato en fosfoenol-piruvato no puede realizarse en
presencia de la piruvato-quinasa ya que el G 75 kcal . La fosforilacin del
piruvato se consigue tanto en el citoplasma como en la mitocondria mediante una
secuencia reaccional de rodeo que necesita de la intervencin de varias enzimas.
La primera reaccin es la catalizada por la piruvato-carboxilasa (de la
mitocondria).
H2O

piruvato + CO2 + ATP Acetil CoA + oxalacetato + ADP + Pi

G 0.5 kcal

La enzima piruvato carboxilasa que se encuentra en la mitocondria necesita de le

accin de la acetil CoA para actuar.
2.- El oxalacetato es reducido a malato por el NADH 2

NADH2 + oxalacetato NAD+ + malato G 6.7 kcal

3.- El malato formado difunde al citoplasma donde es reoxidado por la forma

citoplasmtica de la malato-deshidrogenasa ligada al NAD para formar
oxalacetato extramitocondrial.

malato + NAD+ oxalacetato + NADH2 G 6.7 kcal

Esta reaccin es muy endergnica, se desplaza hacia la derecha porque los

productos finales se eliminan rpidamente.

4.- El oxalacetato se transforma en fosfoenol-piruvato por la accin de los fosfoenol-

piruvato-carboxiquinasa. En esta reaccin el donador de fsforo es el GTP (o el
ITP).
65
 Mg++
oxalacetato + GTP fosfoenol-piruvato + CO2 + GDP

G 0.7 kcal
Sumando todas las reacciones, escribimos la ecuacin global, teniendo en cuenta la
suma algebraica de los G .

piruvato + ATP + GTP fosfoenol-piruvato + ADP + GDP + Pi

G 0.2 kcal

Esta reaccin global es reversible, puesto que su variacin de energa libre estndar
es muy pequea. Tender a desplazarse a la derecha siempre que el cociente (ATP)
/ (ADP) tenga un valor elevado y que haya presente un exceso de piruvato. Para
fosforilar una molcula de piruvato se consumen dos enlaces de alto valor
energtico. Practicando le direccin energtica de la ecuacin, se observa que el
proceso endergnico que requiere energa es:

piruvato + GTP fosfoenol-piruvato + GDP G 7.5 kcal

Mientras que el proceso que cede energa es:

ATP + H2O ADP + Pi G 7.3 kcal

Conversin en glucosa del fosfoenol-piruvato

El fosfoenol-piruvato se convierte fcilmente en fructuosa 1 - 6 difosfato por

inversin de las reacciones de la gliclisis que comienzan con la enolasa y terminan
en la aldolasa.

enolasa
fosfoenol-piruvato + H2O 2-fosfoglicerato

(1)
2-fosfoglicerato 3-fosfoglicerato

(2)
ATP + 3-fosfoglicerato ADP + 1,3-difosfoglicerato

(3)
1-3 difosfo-glicerato + NADH2 gliceraldehido-3-fosfato + NAD+ + Pi

(4)
gliceraldehdo-3-P dihidroxiacetona-P

(5)
gliceraldehdo-3-P + dihidroxiacetona-P fructosa-1-6-di P

(1) fosfoglicerometasa - (2) - fosfoglicerato-quinasa - (3) - gliceraldehdo-3 P- 66

deshidrogenasa - (4) - triosa-fosfato-isomerasa (5) - aldolasa
La reaccin siguiente no se realiza en direccin a le sntesis catalizada por la
fosfofructoquinasa. Esta reaccin es catalizada por la fructosadifosfatasa.

fructosa-1-6-difosfato + H2O fructosa-6-P + Pi

G 0.4 kcal

En la etapa siguiente en camino hacia la glucosa la fructosa 6 P se convierte de

modo reversible en glucosa 6P por la accin de la fosfohexoisomerasa o
fosfoglucoisomerasa.

fructosa 6-P glucosa 6-P

En la mayora de las clulas la glucosa-6-P formada durante la gluconeognesis se

emplea como precursor en la produccin de polmeros de reservas como glucgeno,
almidn, de otros monosacridos de la glucosa, de disacridos y polmeros
estructurales. Sin embargo en determinadas clulas como en el hgado, rin,
epitelio intestinal de los vertebrados, la glucosa-6-P puede desfosforilarse y libera
glucosa. El hgado constituye la fuente ms importante de la glucosa sangunea. La
escisin de la glucosa-6-P; no puede tener efecto por inversin de la reaccin de la
hexoquinasa, a causa del gran cambio de energa libre estndar positiva que hay en
la direccin de formacin de la glucosa libre.

glucosa-6-P + ADP glucosa + ATP G 4.0 kcal

Sin embargo la produccin de glucosa libre es inducida por la glucosa -6-fosfatasa,

que cataliza la siguiente reaccin exergnica de hidrlisis.

glucosa-6-P + H2O glucosa + Pi G 3.3 kcal

Esta enzima se encuentra de modo caracterstico en el hgado y rin de los

vertebrados. Su actividad es dependiente de los lpidos y de la estructura de la
membrana. La glucosa-6- fosfatasa no se encuentra en los msculos, ni en el
cerebro, por lo que estos rganos no poseen la capacidad de donar glucosa libre.

Resumiendo:

2 piruvato + 4 ATP + 2 GTP + 2 NADH2 + 6 H2O glucosa + 2 NAD+ + 4 ADP + 2 GDP + 6 Pi

Por cada molcula de glucosa que se forma se consumen seis enlaces fosfato de
alto valor energtico y se requiere dos molculas de NADH2 como reductor.

67
La reaccin global es exergnica.

glucgeno

UDP-glucosa
UTP

glucosa-1-P

glucosa libre glucosa-6-P

disacridos
fructosa-6-P
Pi monosacridos
ATP Pi

fructosa-1-6 P

gliceraldehdo-3-P

3-P-glicerato

2-P-glicerato

fosfoenolpiruvato
GTP
CO2

oxalacetato

malato

malato

oxalacetato

piruvato

piruvato

68
Gluconeognesis a partir de los intermediarios del ciclo de los cidos
tricarboxlicos

Dijimos anteriormente que la sntesis de glucosa podra tener varios precursores.

Entre ellos los principales son los productos intermedios del ciclo de los cidos
tricarboxlicos que pueden experimentar oxidacin a malato. Entonces el malato
puede abandonar las mitocondrias y experimentar su oxidacin a oxalacetato en el
citoplasma extramitocondrial; donde tiene lugar la formacin de fosfoenol-piruvato
por la accin de la fosfoenolpiruvato-carboxiquinasa del citoplasma. Tres tomos de
carbono de los distintos intermediarios del ciclo de los cidos tricarboxlicos se
convierten, finalmente en tres tomos de carbono del fosfoenol-piruvato. Estos
carbonos proceden de los tomos alfa-carboxlicos (alfa-carboxlicos) y beta del
oxalacetato.

Acido oxalactico.
COOH

CH2

C O

COOH

Gluconeognesis a partir de acetil CoA

En los tejidos de los animales superiores no hay formacin neta de nueva glucosa a
partir de los dos tomos de carbono del grupo acetilo del acetil CoA. Lo que s
sucede es que la condensacin de la acetil CoA con el oxalacetato de citrato que al
oxidarse para dar fosfoenol-piruvato pierde 3 tomos de C en forma de CO 2 . Se
deduce que no puede formar ms glucosa que el oxalacetato. En los tejidos
animales la acetil CoA no puede convertirse directamente en piruvato o en succinato.
En los animales superiores no existe senda metablica alguna por lo que los tomos
de carbono de los cidos grasos puedan ser utilizados para producir nueva glucosa.

Gluconeognesis a partir de los aminocidos

Como se ha visto, algunos o todos los tomos de carbono de los distintos

aminocidos derivados de protenas son finalmente convertibles en acetil CoA o en
intermediarios del ciclo de Krebs. Aquellos aminocidos que pueden servir de
precursores del fosfoenol-piruvato y por consiguiente de la glucosa son aminocidos
glucognicos. Ej: alanina, arginina, glicina, histidina, valina, prolina, etc. Los
aminocidos que por degradacin son capaces de formar acetoacetato se los
denomina cetgenos. Ej.: leucina. La fenilalanina y la tirosina constituyen ejemplos
de aminocidos que a la vez son glucognicos y cetognicos puesto que por
degradacin se escinden para formar cido fumrico (glucognico) y acetil CoA
(cetognico).

69
TEMA XXI: BIOSNTESIS DE LPIDOS
Biosntesis de cidos grasos saturados. Formacin de malonil CoA. Pasos en la
sntesis de cidos grasos. Prolongacin de los cidos grasos saturados en la
mitocondria y los microsomas. Biosntesis de triacil-gliceroles. Biosntesis de
colesterol.

La ruta biosinttica que conduce desde la glucosa a los cidos grasos es importante
en la mayora de los organismos. Puesto que la capacidad de los animales
superiores para almacenar polisacridos es bastantes limitada la glucosa ingerida en
exceso, respecto a las necesidades calricas inmediatas y a la capacidad de
almacenaje, se convierte en cidos grasos, y stos a su vez, en triacilgliceroles que
pueden almacenarse en grandes cantidades en el tejido adiposo. Constituye otro
proceso importante la biosntesis de fosfoglicridos de las membranas, puesto que la
mayora de las clulas experimentan un recambio relativamente veloz. Tambin se
ver la biosntesis de colesterol. Aunque desde el punto de vista cuantitativo se trata
de una va secundaria, el gran nmero de esteroles, biolgicamente activos, que
derivan del colesterol le confiere considerable importancia.

BIOSINTESIS DE LOS CIDOS GRASOS SATURADOS

La sntesis completa de cidos grasos saturados de largas cadenas tiene efecto,

solamente en la fraccin soluble del citoplasma. Esta catalizada por un complejo de
siete enzimas que se denomina complejo sintetasa de cidos grasos. Los acil-
derivados intermediarios del proceso no son los tiosteres de la CoA, como en el
caso de la oxidacin de los cidos grasos, sino tiosteres de una protena de bajo
peso molecular denominado protena transportadora de cil os (o ACP). Esta
protena puede formar complejos con las enzimas sintetasas a manera de un racimo.

Malonil transferasa

Acil transferasa
Palmitil
transferasa
Enzima condensante
( citonil sintetasa)

Deshidrogenasa
(2 reduccin) SH (resto fosfopantotenil
con grupo SH terminal que
enlaza los intermediarios
aclicos)

Deshidrogenasa
Deshidratasa (1 reduccin)

SH

(resto SH perteneciente a la protena

transportadora de grupos acilos)
70
La malonil CoA es el precursor inmediato de 14 de los 16 tomos de carbono del
cido palmtico; se forma a partir de la acetil-CoA citoplasmtica (que deriva de la
acetil-CoA mitocondrial) y del CO 2 por la accin de la acetil-CoA-carboxilasa.

O O
biotina
CH3 C SCoA + CO2 + ATP HOOC CH2 C S CoA
++
Mn

El CO2 se convierte en el carbono carboxlico libre distal de la malonil CoA. Los

grupos acilos de la acetil-CoA y de la malonil CoA son transferidos al grupo tiol de la
ACP por accin de dos enzimas acil-transferasa y malonil-transferasa.

O O
acil
SH + CH3 C SCoA S C CH3 + HSCoA
transferasa

SH SH

O O O
malonil
S C CH3 + COOH CH2 C SCoA S C CH3 + HSCoA
transferasa

SH S
C O
CH2

COO H

Acetil-S-ACP y malonil-S-ACP reaccionan entre s de manera que el grupo acetilo

del primero pasa a formar los carbonos 3 y 4 del grupos acetoacetilo, con
desplazamiento del CO 2 .

71
 SH + CO2

condensante

S
C O
CH2
C O
CH3

La acetoacetil-S-ACP se reduce por accin del NADPH.

SH SH SH

NADPH+ + H+ NADP NADPH+ + H+ NADP

deshidratasa
S S S
deshidrogenasa
C O C O C O
H2O
CH2 CH2 CH
C O H C OH CH
CH3 CH3 CH3
Hidroxibutiril - S- ACP crotonil-S-ACP

SH S
C O
acil
transferasa CH2
S
CH2
C O
SH CH3
CH2
CH2
CH3

butiril-S-ACP

72
La formacin de butiril-S-ACP completa el primer ciclo, el cual se repite seis veces
ms en el cual una molcula de malonil-S-CoA se incorpora a la ACP para dar
malonil-S-ACP la cual experimenta prdida de CO 2 y condensacin con el acilo
graso que se encuentra en el otro brazo. De sta manera el producto es el cido
palmtico de 16 tomos de carbono. Al final del ciclo se libera la ACP por la accin
de una desacilasa hidroltica.

SH + CH3 (CH 2)14 COOH

cido palmitico

SH

Las reacciones enzimticas de la sntesis de cidos grasos difieren de la oxidacin

en:
Su localizacin dentro de la clula.
En el portador de grupos acilos.
En la forma en que las unidades de dos tomos de carbono se adicionan
o eliminan.
El NADPH necesario en la reduccin proviene de la va del
fosfogluconato.

PROLONGACION DE LOS ACIDOS GRASOS SATURADOS EN LAS

MITOCONDRIAS Y LOS MICROSOMAS

El cido palmtico que es el producto final normal del sistema de la sintetasa de los
cidos grasos del citoplasma, puede prolongarse mediante dos tipos diferentes de
sistema enzimticos: el de las mitocondrias y del retculo endoplasmtico.
En las mitocondrias los cidos grasos saturados de 12 a 16 tomos de carbono, en
forma de steres de la CoA, se alargan por adiciones sucesivas de acetil-CoA. La
ruta mitocondrial se realiza por inversin de las mismas etapas implicadas en la
oxidacin, con excepcin de la reduccin del doble enlace que conduce al cido
graso saturado, que se verifica a expensas del NADHP como reductor, y no de la
flavoprotena. El sistema mitocondrial es capaz de alargar tambin los cidos grasos
no saturados.
En los microsomas tanto los steres de cidos grasos saturados, como los de los no
saturados pueden prolongarse, pero en este caso es la malonil-CoA la fuente de
grupos acetilos.

FORMACION DE ACIDOS MONOENOICOS (con doble enlace)

Los precursores de los cidos grasos monoenoicos son el:

73
 Acido palmtico (C16) Acido Esterico (C18)

Acido palmitoleico ( ) Acido oleico ( )

Aunque la mayora de los organismos tienen capacidad para formar cido

palmitoleico y cido oleico, la ruta y el mecanismo utilizado dependen si el
organismo es anaerobio o aerobio.
En los organismos aerobios los dobles enlaces son introducidos por una oxigenasa
especfica localizada en la fraccin microsmica, especialmente del hgado y del
tejido adiposo.
No se conocen detalles completos del mecanismo enzimtico, pero se sabe que se
utiliza la molcula de oxgeno como aceptor de dos pares de electrones, uno de los
cuales procede del sustrato acil-CoA y el otro del NADPH, que se requiere en la
reaccin.

palmitol-CoA + NADPH + H+ + O2 palmitolel-CoA + NADP+ + 2 H2O

1 par 1 par

FORMACION DE ACIDOS POLIENOICOS

Todos los cidos polienoicos se forman a partir de cuatro precursores:

1.- Acido palmitoleico
2.- Acido oleico
3.- Acido linoleico
4.- Acido linolnico

Los cuales sufren ulterior alargamiento y/o desaturizacin. Los cidos linoleicos y
linolnicos no pueden ser sintetizados por los mamferos quienes tienen que
tomarlos de fuentes vegetales por esta razn se denominan cidos grasos
esenciales.

BIOSINTESIS DE TRIACIL GLICEROLES (TAG)

Los TAG, que actan como lpidos de depsito o de almacenamiento, son

activamente sintetizados por las clulas hepticas y adiposas de los mamferos.
Para la sntesis se requieren dos precursores principales:
1.- Glicerol 3-fosfato
2.- Acil CoA graso
El glicerol 3-fosfato procede de dos fuentes:
1.- Dihidroxiacetona-fosfato que se produce en la gliclisis.

Dihidroxiacetona-fosfato + NADH + H+ glicerol-3-fosfato + NAD+

74
 2.- Tambin puede formarse por la accin de la gliceril-quinasa
ATP + glicerina glicerol-3-fosfato + ADP

ETAPAS DE LA BIOSINTESIS

- Primera etapa: Acilacin de los grupos oxidrilos libres del glicerol-3-fosfato por
dos molculas de acil-CoA graso, produciendo un cido fosfatdico.
O
CH2 O C R
CH2 OH
O O
+ 2 R C S CoA CH O C R' + 2 HSCoA
CH OH

CH2 O PO 3H2
CH2 O PO 3H2

- Segunda etapa: El cido fosfatdico experimenta una hidrlisis por accin de una
fosfatasa especfica formando diacilglicrido.
O O
CH2 O C R CH2 O C R
O O
CH O C R' + H2O CH O C R' + Pi

CH2 O PO 3H2 CH2 OH

- Tercera etapa: El diacilglicrido reacciona con una molcula de acil-graso CoA

dando triacilglicerol.
O O
CH2 O C R CH2 O C R'
O O O
CH O C R' + R'' C S CoA CH O C R'' + HSCoA
O
CH2 OH CH2 O C R'''

BIOSINTESIS DE FOSFOGLICERIDOS

Los principales fosfoglicridos que sirven como componentes de las membranas y

las lipoprotenas de transporte se forman por ramificaciones de la ruta biosinttica a
partir del cido fosfatdico. Adems intervienen los nucletidos citidnicos. Todas
estas reacciones tienen lugar en el retculo endoplsmico.
1) El cido fosfatdico con el CTP se convierte en citidn-difosfato-diacilglicrido
que es el precursor comn de todos los fosfoglicridos formados por sta ruta.

Acido fosfatdico + CTP citidn-difosfato-diacilglicrido + PPi

75
Su porcin CMP puede considerarse la portadora del cido fosfatdico. En las
reacciones subsiguientes, cada una de las cuales es catalizada por una enzima
especfica la porcin CMP es desplazada por los alcoholes: serina, inositol, fosfato
de glicerilo.

O
CH2 O C R
O
CH O C R'

CH2

HO P O

HO P O

CH2 O citosina

H H
H

OH OH

1). CDP - diacilglicrido + serina fosfatidil-serina + CMP

2). CDP - diacilglicrido + inositol fosfatidil inositol + CMP
3). CDP - diacilglicrido + glicerol-fosfato fosfatidil-glicerol-fosfato +
CMP

La descarboxilacin enzimtica del resto de la serina de la fosfatidilserina conduce a

la formacin de la fosfatidil-etanolamina.
La fosfatidil-etanolamina es precursora de la fosfatidil-colina, la cual se forma por
transferencia de tres grupos metilos.
El fosfatidil-gliceril-fosfato es precursor de dos lpidos. Por desfosforilacin rinde
fosfatidil-glicerina que es uno de los componentes de la membrana celular de
muchas bacterias. El fosfatidil-gliceril-fosfato con una segunda molcula de CDP -
diacilglicrido rinde cardiolipina.

76
 Acido fosfatdico

CTP

CDP - diacilglicrido Fos

ina fato
Ser glice de
Inositol rilo

Fosfatidil-serina Fosfatidil-inositol Fosfatidil-glicerol-fosfato

CO2 Pi

Fosfatidil-etanolamina Fosfatidil-glicerina

3 CH3- + CDP-diacilglicrido

Cardiolipina
Fosfatidil-colina

BIOSINTESIS DE COLESTEROL

Comprende tres etapas:

1.- Conversin de acetato en cido mevalnico
2.- Conversin de cido mevalnico en escualeno
3.- Conversin de escualeno en colesterol.

1). Conversin de acetato en cido mevalnico:

El cido mevalnico tiene seis tomos de carbono por lo que se forma por
condensacin de tres molculas de acetil-CoA.

Acetil CoA + acetoacetil CoA hidroxi - metil - glutaril CoA + CoA

NADPH2
hidroxi - metil - glutaril CoA cido mevalnico + NADP + HSCoA

2). Conversin de cido mevalnico en escualeno:

El cido mevalnico es fosforilado por el ATP y se convierte en cido-3-fosfo-5-

pirofosfomevalnico.

CH3 OH OH
COO H CH2 C CH2 CH2 O P O P OH
O O
O
HO P OH
O

77
 El compuesto es muy inestable pierde H3PO 4 y se descarboxila dando
isopentenil-pirofosfato que se isomeriza y d el 3-3'-dimetil-alil-pirofosfato.

CH2
OH OH
C CH2 CH2 O P O P OH
O O
CH3

CH3
OH OH
C CH CH2 O P O P OH
O O
CH3

Estos dos compuestos se condensan con prdida de PPi dando geranil--

pirofosfato.
- PPi
geranil-pirofosfato + isopentenil pirofosfato farnesil pirofosfato

El cual experimenta condensaciones reductoras y conducen al escualeno.

3). Conversin de escualeno en colesterol

El escualeno sufre un ataque del oxgeno formando el 2-3 epxido, el cual sufre
una ciclizacin a lanosterol en el cual se producen desplazamientos electrnicos
con el cierre de los cuatro anillos y formacin de colesterol.-

78
TEMA XXII: BIOSNTESIS DE LOS AMINOACIDOS

La biosntesis de los aminocidos a partir de precursores sencillos, es vital para

todas las formas de vida, puesto que los aminocidos son los precursores de las
protenas. Sin embargo los organismos vivos difieren considerablemente en lo que
se refiere a las formas de N 2 que son capaces de utilizar con dicha finalidad.
Los animales superiores pueden utilizar NH3 como fuente de N 2 para la sntesis de
aminocidos no indispensables, pero son incapaces de utilizar, nitritos y nitratos o
N 2 . Los rumiantes pueden utilizar los nitritos y nitratos pero solo despus que las
bacterias de su panza los reducen a NH3 .
Las plantas superiores pueden producir todos los aminocidos requeridos para la
sntesis de protenas, a partir tanto de NH3 como de nitratos, como fuentes de N 2 .
Pueden utilizar el NH3 como tal o despus de su oxidacin a nitrato por accin de las
bacterias del suelo. Las leguminosas son capaces de fijar N 2 atmosfrico como NH3
por accin de las bacterias que se encuentran en sus ndulos radiccolas.
Los microorganismos difieren ampliamente en cuanto a su capacidad de efectuar
sntesis de aminocidos. Algunos no pueden crecer si no se le suministran algunos
aminocidos ya formados. Otros como E.Coli pueden obtener todos sus aminocidos
a partir de NH3 .
Los veinte aminocidos se sintetizan gracias a unas secuencias polienzimticas,
algunas de las cuales son extremadamente complejas como es el caso en las
mayora de las vas biosintticas, las sendas de las sntesis aminocidas son, en su
mayor parte, diferentes a las seguidas en sus degradaciones.
Por una parte los aminocidos sirven no slo como bloques de montajes en la
sntesis de protenas sino tambin como precursores de muchas biomolculas que
poseen gran variedad de funciones especializadas. Es frecuente que las rutas de
sntesis y degradaciones aminocidas incluyan ciertas ramificaciones o extensiones
conducentes a la formacin de tales productos especializados.
Ya hemos visto que las formas biolgicas de N 2 disponibles son relativamente
escasas en los ambientes inanimados, porque el proceso de fijacin de N 2
atmosfrico est circunscrito a unos pocos organismos
Adems las propias sntesis de las enzimas que catalizan la formacin de los
aminocidos se hallan tambin bajo control, tales sntesis pueden resultar
reprimidas, si la clula dispone de un suministro exgeno de aminocido. Ambas
formas de regulacin constituyen el reflejo de una intrnseca economa celular que
prevalece en la sntesis y en la utilizacin de los aminocidos.

BIOSINTESIS DE LOS AMINOACIDOS NO ESENCIALES:

Se definen a stos como aquellos aminocidos que pueden ser sintetizados por la
rata albina. Conviene considerar en primer lugar este grupo de aminocidos, porque
la mayora de los organismos pueden realizar su sntesis. Adems este grupo se
distingue porque sus rutas biosintticas son ms bien cortas y muestran variaciones
relativamente pequeas de unas especies a otras.

79
BIOSINTESIS DE ACIDO GLUTAMICO, GLUTAMINA Y PROLINA:

Las rutas biosintticas de estos aminocidos que estn ntimamente relacionados

son idnticas en todas las formas de vida. Los tres se degradan por sendas que
conducen al cetoglutarato, y los mismos caminos que se emplean para su
sntesis. El cido glutmico se forma desde luego a partir de NH3 y de cido
cetoglutrico por accin de la L-glutamato ~ deshidrogenasa.

NH3 + cido oxoglutrico + NADPH + H+ cido L-glutmico + NADP+

Esta reaccin es de importancia fundamental en la biosntesis de cualquier

aminocido en todas las especies, pues se trata de la ruta primaria sino la nica de
formacin directa de grupos amino a partir de NH3 . La transaminacin de los
cidos -ceto con el cido glutmico como donador de grupos NH2 , constituye la
senda principal de introduccin de grupos -amino en la biosntesis de la mayora
de los aminocidos.
La Glutamina se forma a partir del cido glutmico por la accin de la glutamina ~
sintetasa.
NH3 + cido glutmico + ATP Glutamina + ADP + Pi

Esta reaccin es bastante compleja e implica dos o ms etapas intermedias. Se ha

observado que el ~glutamil fosfato acta como intermediario de alta energa ligado
a la enzima.

O OH

C O P OH

CH2 O

CH2
cido glutamil-fosfrico
H C NH2

COOH

ATP + Acido glutmico ADP + glutamil~fosfato

glutamil~fosfato + NH3 glutamina + Pi

La prolina se sintetiza a partir de cido glutmico por inversin de la ruta metablica,

antes descrita para la oxidacin de la prolina.

Los restos de hidroxiprolina que se encuentran en el colgeno y en otras protenas

fibrosas, se forman a partir de determinados restos de prolina de esas protenas por
accin de la prolin-hidroxilasa. Esta oxigenasa de funcin mixta utiliza el
cetoglutarato como correductor y el oxgeno corno aceptor electrnico. En la
80
reaccin se requieren Fe y cido ascrbico como cofactores. Sin embargo la
prolin-hidroxilasa no transforma la prolina libre en hidroxiprolina.
NH 2
OH-C-CH 2-CH 2-CH-COOH
O
Acido Glutmico
NADH
2

NH2

H C CH2 CH2 CH COOH semialdehdo

glutmico

O
H2C CH2
inhibicin

H
HC C Acido 1~pirroln
N COOH 5 carboxlico

NADH 2

H2C CH2
H
H2C C
N COOH

H
Prolina

BIOSINTESIS DE ALANINA: ACIDOS ASPARTICO Y ASPARAGINA:

En muchos organismos la alanina y el cido asprtico se forman por transaminacin

de cido pirvico y del cido oxalactico respectivamente.

ALANINA

O NH2 NH2 O
CH3 C COOH + HOOC CH2 CH2 C COOH CH3 C COOH + HOOC CH2 CH2 C COOH

H H
cetoglutarato
Acido pirvico Acido glutmico Alanina

ACIDO ASPARTICO

O NH2
HOOC CH2 C COOH + Acido glutmico HOOC CH2 C COOH + Acido -oxoglutmico

Acido oxalactico H
Acido Asprtico

En algunas plantas estos dos compuestos se producen por Aminacin reductora. El

81
cido Asprtico es el precursor directo de la asparagina. En muchos organismos
sta se forma por una reaccin similar a la catalizada por la glutamin-sintetasa.

NH2 NH2
NH2
HOOC CH2 C COOH + NH3 + ATP C CH2 C COOH + ADP + Pi
O H
H
Acido Asprtico Asparagina

TIROSINA

Aunque la Tirosina es un aminocido no indispensable, su sntesis requiere el

aminocido esencial feniIalanina, como precursor. La tirosina se forma a partir de la
fenilalanina por una reaccin de hidroxilacin catalizada por la fenil-alanin-
hidroxilasa. La cual como hemos visto participa de la degradacin de la fenilalanina.

Fenilalanina + NADPH + H+ + O2 Tirosina + NADP+ + H2O

BIOSINTESIS DE AMINOACIDOS ESENCIALES

Las sendas de la sntesis de los aminocidos esenciales se han deducido en gran

parte, de estudios bioqumicos y genticos practicados con bacterias. En general los
caminos son idnticos en la mayora de las especies bacterianas y plantas
superiores. Sin embargo en algunos casos se observan diferencias de especie en
algunas etapas individuales. Las sendas que llevan a la biosntesis de los
aminocidos esenciales son ms largas que las que llevan a la sntesis de los no
esenciales. Tambin son ms complejas posiblemente porque varios intermediarios
sirven tambin como precursores de muchas otras clases de biomolculas.

BIOSINTESIS DE METIONINA Y TREONINA

Estos dos aminocidos esenciales tienen un denominador comn: sus esqueletos

carbonados proceden de la homoserina. Anlogo de la serina con cuatro tomos de
carbono. A su vez la cadena de carbonos de la homoserina deriva del esqueleto del
cido asprtico, luego de una serie de reacciones que no tienen lugar en los
mamferos.
El camino metablico de la reduccin del grupo -carboxlo de cido asprtico al
correspondiente aldehdo se parece a la reduccin de 1-3 difosfoglicerato al 3
gliceraldehdo-fosfato de la ruta de la gliclisis.
La homoserina formada en la primera etapa se fosforila a fosfato de homoserina
mediante una reaccin que requiere ATP.
El fosfato de homoserina se convierte en Treonina por accin de la Treonn-
sintetasa, enzima que requiere fosfato de Piridoxal.
En esta reaccin se elimina cido fosfrico de los carbonos 3 y 4, se obtiene as un
82
doble enlace 3,4 que se isomeriza a la posicin 2,3
y despus se hidrata para
formar Treonina.

SINTESIS DE TREONINA

O OH
H
NAD+ C CH2 OH
COOH ATP ADP C O P OH NADH NADH NAD+
O
CH2 CH2
CH2 CH2 O
apartil H C NH2
H C NH2 quinasa H C NH2 H C NH2
COOH COOH
COOH COOH
Acido aspartil Semialdehdo Homoserina
asprtico fosfato asprtico

OH CH2
ATP ADP H+
CH2 O P OH - Pi CH
CH2 O C N CH ENZ.
Complejo enzimtico
C N CH ENZ. -homoserin-fosfato COOH
COOH

CH3 CH3 CH3

+
H CH H2O H C OH H2O H C OH + O CH ENZ.
C N CH ENZ. H C N CH ENZ. H C NH2
COOH COOH COOH
Treonina

Se cree que la secuencia completa tiene lugar con el grupo NH2 del sustrato
unido al grupo aldehdo del fosfato de piridoxal de la enzima como una base de
Schiff, en ste complejo el tomo de H2 es lbil.
El producto final de la secuencia, la treonina, es un inhibidor modulador de la
primera enzima del sistema que es la enzima regulador aspartil-quinasa.

METIONINA

La conversin de la homoserina en metionina comienza con la formacin enzimtica

de la O~succinil homoserina por transferencia de un grupo succinilo del succinil-CoA.
En la reaccin siguiente se forma cistationina a partir de la O succinil-homoserina y
de la Cistena la cual, a su vez escinde, para dar homocistena cido pirvico y NH3 .
La Cisitationina puede experimentar dos tipos de escisin, uno a cada uno de los
lados del tomo de azufre, as puede servir como intermediario de la conversin de
Metionina en Cistena en los mamferos y de la transformacin de Cistena en
Metionina en las plantas y bacterias.

83
 O
CH2 OH Succinil CoA CH2 O C CH2 S CH
Cistena
CH2 CH2 CH2 CH2 H C NH2
H C NH2 H C NH2 CH2 H C NH2 COOH
COOH COOH COOH COOH

Homoserina O succinil - homoserina Cistationina

CH3
SH S
CH2 CH2
Piruvato DA ~ Cobalanina
CH2 CH2
5
N ~ Metil
+ NH2 H C NH2 H C NH2
tetrahidroflorato
COOH COOH
Homocisteina Metionina

La metilacin de la Homocistena a Metionina en E. Coli tiene lugar por transferencia

del grupo Metilo de N5 metil tetrahidrofolato.
D. A. ~ Cobalamina
N5 metil tetrahidrofolato + homocistena tetrahidrofolato + metionina

En esta reaccin se requiere Desoxiadenosilcobalamina, coenzima que contiene

vitamina B12 , su accin como portador de grupo metilo ( CH3 ) del N5 metil-
tetrahidrofolato el cual puede provenir originalmente de varios donadores de grupos (
CH3 ) metilo, tales como la colina o la 5-adenosil-metionina. A su vez, la
homocistena es uno de los posibles aceptores de grupos
( CH3 ) metilo.

Funciones Precursoras de los Aminocidos: Biosntesis de Porfirinas

Los aminocidos son precursores de muchas biomolculas (aparte las protenas)

que ejercen importantes funciones biolgicas, tales como hormonas, vitaminas,
coenzimas, alcaloides, porfirinas, antibiticos, pigmentos y sustancias
neurotransmisoras.
Es digno de mencin especialmente, el hecho de que los aminocidos cromticos,
sean los principales precursores de buen nmero de alcaloides entre ellos la
morfina, la codena, y la papaverina, as como de muchas otras sustancias con
intensa actividad biolgica, tales como la hormona tiroxina, la hormona de
crecimiento vegetal: cido indolactico, el poderoso vasocontrictor neurohumoral:
serotonina y las hormonas catecolamnicas: epinefrina y norepinefrina.
Los aminocidos son precursores de pequeos pptidos, como el glutatin y de las
hormonas pptidas, como la bradiquinina, oxitocina y la vasopresina.
El pptido glutation se sintetiza segn las siguientes reacciones:

84
 Mg++
Acido glutmico + Cistena + ATP Glutamilcistena + ADP +P i

Glutamilcistena + Glicina + ATP Glutatin + ADP + Pi

La biosntesis de las Porfirinas cuyo principal precursor es la Glicina requiere

especial atencin por la importancia central del ncleo porfirnico en la funcin de la
hemoglobina, de los citocromos y de la clorofila. Los tetrapirroles se construyen a
partir de cuatro molculas del derivado monopirrlico Porfobilingeno, que a su vez
se sintetiza segn las siguientes etapas:

COOH COOH COOH

HSCoA COOH
CH2 CH2 NH2 CH2 CH2
+
CH2 COOH CH2 CH2

C S CoA C O C O
Glicina
O
H C NH2 CH2
Succinil~CoA
COO H NH2
Acido amino
Acido amino levulnico
oxoadpico

En la primera reaccin la glicina reacciona con el succinil-CoA para dar cido -

amino oxoadpico quien luego se descarboxila para dar cido amino-levulnico
reaccin que es catalizada por la amino~levulnico~sintetasa; enzima que requiere
fosfato de piridoxal y se encuentra en el retculo endoplsmico de las clulas
hepticas.
Luego dos molculas de amino-levulnico se condensan para formar porfobilingeno
bajo la accin de la aminolevulnico deshidrasa.

COOH COOH
HOOC CH2 COOH
CH2 CH2
2 H2O CH2 CH2
H C H + CH2
C C
C O C O
CH2 C C H
CH2 H C H N
NH2
NH2 N H H
Porfobilingeno
H

85
Como precursores de la Protoporfirina actan cuatro molculas de porfobilingeno, a
travs de una serie compleja de reacciones, la primera de las cuales la cataliza la
porfobilingeno~desaminasa. Algunas de las etapas de la serie permanecen an
oscuras.
El hierro no se incorpora hasta que se ha completado la molcula de la
protoporfirina. Esta incorporacin requiere una enzima, la hemo-sintetasa o
Ferroquelatasa que est localizada en las mitocondrias.

CH3 CH CH2

C C
HOOC CH2 COOH
CH C C CH
CH2 CH2
H
CH3 C C C C CH3
C C
N H H N
CH2 C C H
N CH2 C C C C CH CH2
NH2 CH2 H
H HC C C CH
COOH
Porfobilingeno
C C
CH2 CH3
CH2
COOH

Protoporfirina IX

La degradacin de la protoporfirina IX, conduce a la bilirrubina y a biliverdina, que

son pigmentos segregados en la bilis.

86
TEMA XXIII: BIOSINTESIS DE LOS MONONUCLEOTIDOS

Biosntesis de los nucletidos de purina. Vas del cido inosnico hacia los cidos
adenlico y guanlico. Biosntesis de los nucletidos de pirimidina.

La biosntesis de ribonucletidos y desoxiribonucletidos es un proceso vital ya que

estos compuestos son precursores directos del ADN y del ARN as como de las
coenzimas nucleotdicas.
Las rutas metablicas de formacin de sus bases (pricas y pirimidnicas) tienen
una importancia central.

Biosntesis de nucletidos purnicos: Origen biosinttico de los tomos del anillo

purnico.
Proviene de los experimentos realizados por Bucherer quin administr a animales
precursores marcados y luego determin los sitios del ncleo purnico a los que se
haban incorporado los tomos marcados. Esta experiencia se realiz en aves, que
excretan el N 2 en forma de cido rico que es un derivado de las purinas.
cido rico:
CO 2
7 Glicina
C N
6
Aspartato N C
1 5

C Formiato
8

Formiato C C
2 4
N N
3 9

amida de la glutamina

Construccin del ncleo prico:

N9
NH2 de la glutamina glicina
ATP

aminotransferasa
ADP + P
NH 2
PP cido glutmico

R P
O fosforibosilamina
P P O CH2 OH

H H
H H

OH OH 87
fosforibosilpirofosfato (FRPP)
 C4 y C5 N7
C8

NH2 NH
CH "CHO" CH2 glutamina
CHO
CoF cido glutamnico
C C
NH NH
O O
R P R P

glicinamida ribtido formil - glicinamida ribtido

N3 O C6
N1
N C N
CH CO2 NH2 CH "CHO"
CH CH
C Acido asprtico CoF
NH2 N NH2 N

R P R P

5 aminoimidazol ribtido 5 aminoimidazol 4 carboxamida ribtido

C2
O

C N
NH
CH
CH
N N

R P
Inosina 5' - fosfato
Acido Inosnico IMP

88
Vas del cido inosnico hacia los cidos adenlico y guanlico

H N N
IMP (H+ inosnico)

N N

R P
NAD aspartato
[O]
NADH2 GTP GDP + Pi

O H

HOOC CH2 C COOH

H N N
NH

N N H N N
O

H R P
N N aspartato
AMP
glutamina H+ glutmico H+ Xntico
R P

ATP AMP + PP fumarato

O
NH2
H N N
H N N

N N
NH2
N N
R P
R P

GMP (H+ guanlico) AMP (H+ adenlico)

89
Vas de la biosntesis de nucletidos purnicos:

ATP AMP base prica

Ribosa 5 P 5 P Ribosil PP Nucletido
Pi

base prica ATP AMP

Ribosa 1 P Nuclesido Nucletido
Pi

Biosntesis de GDP, GTP y ADP, ATP:

GMP + ATP GDP + ADP

GDP + ATP GTP + ADP

AMP + GTP ADP + GDP
ADP + GTP ATP + GDP

Regulacin de la sntesis de Nucletidos Purnicos:

E AMP ADP ATP

PRPP 5 fosforibosilamina H+ inosnico

GMP GDP GTP

En este caso el exceso de ATP, ADP o AMP o de GTP, GDP o GMP producen una
inhibicin a nivel de la enzima que cataliza la reaccin entre el fosforibosilpirofosfato
y la 5 fosforibosilamina, por lo tanto se frena la secuencia metablica y se inhibe la
biosntesis. Es un caso de retroalimentacin negativa.

Biosntesis de Nucletidos de Pirimidina

Es una ruta similar a la de los nucletidos purnicos, pues las bases libres no son
productos intermedios.
Esta ruta es ms simple y se diferencia en que la D-Ribosa se acopla despus que
se ha formado el anillo pirimidnico. El precursor es el cido Ortico.
O

C
H N C H

C C COOH
O N
90
cido ortico
 H2O
carbamil PO4
Acido Asprtico Acido Carbamil Asprtico
PO4 Dihidrotasa

NAD PRPP PP
Acido Dihidrtico Acido Ortico Acido Orotidlico
NADH2 fosforibosil-tr OMP
ansferasa

CO2

Acido Uridlico
OMP
descarboxilasa UMP (uridin monofosfato)

UMP + ATP UDP + ADP

UDP + ATP UTP + ADP

Biosntesis de CTP (citidin trifosfato)

O NH2

C C
H N C H ATP ADP + Pi N C H
+ NH3
C C H C C H
O N O N

R P P P R P P P

triofosfato de uridina (UTP) triofosfato de citidina (CTP)

En Escherichia Coli (bacteria) el que dona el grupo NH2 es el NH3 libre. En los
mamferos es el grupo amino de la glutamina.

Regulacin de la biosntesis de nucletidos de pirimidina

Cuando hay un exceso de UTP y de CTP este exceso determina la inhibicin de la

aspartato carbamil transferasa, enzima que inicia la ruta de biosntesis, por lo tanto
se produce el fenmeno de retroalimentacin negativa o feed-back.

91
 Acido Asprtico

aspartato carbamil transferasa

Acido carbamil Asprtico

UMP

UTP

CTP

Biosntesis de desoxi-TMP (timidn-monofosfato)

O O

C C
N5; N10.Metilen FH2
H N CH H H N C CH3
Tetrahidrofolato Dihidrofolato

C CH H C C H
O N O N

desoxi R P (dUMP) desoxi R P (d-TUMP)

Reacciones fosfotransfersicas:

ATP + d ADP ADP + d ATP

ATP + d CDP ADP + d CTP

ATP + d TDP ADP + d TTP

ATP + d GDP ADP + d GTP

Los precursores del ADN (cido desoxiribonuclico) son desoxi-ribonucletidos. Los

precursores del ARN (cido ribonuclico) son ribonuclotidos.

92
TEMA XXIV: NATURALEZA, ESTRUCTURA Y REPLICACION DEL MATERIAL
GENETICO

Evidencias de que el ADN es el material gentico. Estructura del ADN: Ley de

Chargaff, estudios de difraccin con rayos X. Modelo de Watson y Crick. El dogma
central de la Biologa Molecular. Replicacin del ADN: replicacin semiconservativa.

La gentica estudia la transmisin hereditaria y la variabilidad de los caracteres de

los organismos.
En este captulo veremos las bases bioqumicas de algunas cuestiones centrales,
que plantea la continuidad gentica y la evolucin de los organismos vivos.
Cul es la naturaleza molecular del material gentico y de sus unidades
fundamentales, los cromosomas, los genes, los smbolos de cdigo?
Cmo se replica la informacin gentica para pasar de una generacin a otra?
Cmo se transcribe la informacin en la clula?
Cmo se traslada la informacin gentica a la secuencia de aminocidos de las
molculas proteicas?
Los extraordinarios avances en el conocimiento de la base molecular de la gentica
han provocado una revolucin intelectual en biologa, que se considera comparable
a la que comenz con la teora de Darwin sobre el origen de las especies. Todos los
campos de la biologa han resultado profundamente infludas por tales avances, de
tal modo que en la actualidad no se puede estudiar problema bioqumico alguno
prescindiendo de su fondo gentico. El conocimiento actual de la base molecular de
la gentica deriva de los avances realizadas en tres campos cientficos diferentes: la
gentica, la bioqumica y la fsica molecular.
A. En el campo de la gentica, qu progresos hubieron?
Al principio el nico medio de llevar a cabo anlisis genticos consista en realizar
experiencias con apareamientos debidamente orientados, es decir ya teniendo un
conocimiento de los resultados de la reproduccin sexual. Experiencias de esta
clase presenta grandes limitaciones en cuanto al tiempo de generacin que es
relativamente grande y el nmero de descendientes que es relativamente
pequeo.
Supongamos por ejemplo, que se investigan fenmenos genticos utilizando
cobayos como animales de experimentacin. Se eligen progenitores apropiados y
se identifican por anticipado los caracteres de la descendencia. El perodo de
gestacin es de 10 semanas y el nmero de descendientes es de 2 a 4. Con este
nmero de descendientes se revela una pequea parte de los rasgos potenciales
capaces de ser transmitidos por los padres y para estudiar la reproduccin de los
descendientes hay que esperar que los cobayos alcancen la madurez sexual.
El desarrollo de la gentica microbiana ha aportado un gran avance. Los
microorganismos y particularmente las bacterias se multiplican rpidamente
(algunos a intervalos de 15').
Otro progreso experimental que es el uso de rayos X y otros agentes
mutagnicos, que incrementan la velocidad de mutaciones espontneas.
MUTACION: alteracin de un gen que puede ser espontnea o inducida (rayos X,
radiacin U.V., etc.

93
 Como las propiedades de la clula estn controladas por genes los caracteres
pueden cambiar por mutacin. De esta manera se pudo conocer la secuencia de
los genes en los cromosomas y saber que los genes poseen un gran nmero de
locus que pueden experimentar mutacin; y que qumicamente estn constituidos
por cido desoxiribonuclico.
Pero el desarrollo ms importante en el campo de le gentica fue:
La enunciacin de la hiptesis de "un gen - una enzima", por Beadle y
Tatum que dice que los genes se expresan a travs de protenas, por lo
tanto, las mutaciones darn origen a protenas alteradas.
El descubrimiento de Avery y Col, que demostraron que el ADN contiene
la informacin gentica.

B. En el campo de la bioqumica, muchos avances experimentales importantes se

hicieron posibles gracias a la mejora de mtodos cromatogrficos, que hicieron
posible el anlisis cuantitativo de la composicin aminocida y de la secuencia de
las protenas y mostraron que le secuencia vara segn funcin de la protena.
Tambin se lleg a establecer la composicin y estructura covalente de los
cidos nucleicos.Uno de los desarrollos ms significativos consisti en el
descubrimiento de la equivalencia de ciertas bases del ADN que se convirti en
un elemento importante para deducir su estructura tridimensional.
C. En el campo de la fsica molecular la aplicacin de difraccin de rayos X a la
conformacin de molculas de protenas fibrosas y globulares llev al concepto
de que cada tipo de molcula proteica posee una conformacin especfica, que
determina su funcin biolgica. Pero el hecho fundamental fue la aplicacin de
los rayos X al anlisis de la estructura tridimensional del ADN. En 1953 Watson y
Crick postularon una estructura de doble hlice para el ADN que sugiri un
mecanismo sencillo por medio del cual la informacin gentica puede transferirse
de la clula progenitora a la clula hija. La hiptesis de Watson y Crick fue pronto
ampliada y extendida hasta llegar a lo que Crick denomin el dogma central de la
gentica molecular, el cual establece que la informacin gentica fluye del ADN
al ARN y de ste a las protenas; relacin frecuentemente simbolizada as:
ADN ARN protenas
El dogma central defini tres procesos principales de la preservacin y
transmisin de la informacin gentica.
1. Rplica, es decir, la copia del ADN con formacin de molculas hijas idn-
ticas.
2. Transcripcin, por el cual el mensaje gentico del ADN es transcripto en
forma de ARN para ser llevado a los ribosomas.
3. Traduccin, por la cual el mensaje gentico es descifrado y convertido en
el alfabeto de 20 letras de la estructura proteica.

Evidencias de que el ADN es el material gentico

Aunque el ADN se descubri en los ncleos celulares en 1.869, no se identific

como portador directo de la informacin gentica hasta 1.943.
Avery y Col hallaron que una cepa no virulenta de la bacteria Pneumococcus puede
transformarse de modo hereditario, en una cepa virulenta por simple adicin de un
94
ADN extrado de un neumococo virulento. Lo que sucede es que el ADN se
incorpora covalentemente al ADN de la clula receptora donde se replica con la
clula husped.
De especial significacin son los experimentos de Hershey y Chase. Marcaron el
ADN de las partculas vrales e incubaron con la clula husped mientras que la
protena viral no.
En 1955 Pauling mostr que en la anemia falciforme los glbulos rojos se presentan
en forma de hoz debido a una alteracin de la molcula de hemoglobina. Lo que
ocurra es que en la hemoglobina normal su cadena tiene un cido glutmico en
posicin G, mientras que en la anemia falciforme tiene valina. Este hallazgo deja en
claro algo fundamental: una mutacin puntual en el ADN puede determinar el cambio
de un aminocido de la secuencia polipeptdica de una protena.

ESTRUCTURA DEL ADN

Se hicieron numerosos estudios tendientes a conocer la Estructura del ADN. En

1.938 Astbury observ que sometiendo al ADN al anlisis de difraccin de rayos X
presentaba reflexiones que corresponden a un espaciado regular de 3,4 a lo largo
del eje de la fibras. Si bien el significado de sta observacin no estaba bien clara,
porque se saba que el ADN utilizado era impuro.
Sin embargo, ms tarde Franklin y Wilkins obtuvieron datos ms precisos operando
con fibras de ADN altamente purificadas y encontraron dos periodicidades de 3,4 y
de 34 . En el periodo 1.949 1.953 Chargaff y Col explicaron mtodos
cromatogrficos cuantitativos para la determinacin analtica de las 4 bases del
ADN. De dichos estudios se obtuvieron las siguientes conclusiones:
Las muestras de ADN aisladas de diferentes tejidos de una misma especie
poseen igual composicin de bases.
La composicin de bases del ADN vara de una especie a otra.
La composicin de bases del ADN de una determinada especie no cambia con
la edad, con el estado de nutricin, ni con los cambios ambientales.
En todos los ADN examinados el nmero de restos de adenina es igual al de
restos de timina (es decir: A = T); el nmero de restos guannicos es igual al de
los citosnicos (G = C ).

La equivalencia de bases observadas en el ADN plantearon la posibilidad de que

existe un nivel de organizacin estructural de las molculas del ADN que sea
compatible con ciertas equivalencias de bases, pero incompatibles con otras.
Adems ya se pens en una conformacin tridimensional para el ADN. De esta
manera el escenario ya estaba dispuesto para proponer la conformacin
tridimensional del ADN. Es decir se contaba con tres elementos.
1. Tamao de las bases;
2. Periodicidades observadas;
3. Equivalencia de ciertas bases.

El inters en el problema se acrecent ante la difcil interrogacin de como poda

replicarse el ADN con tanta fidelidad.
En 1.953 Watson y Crick postularon un modelo tridimensional preciso para la
estructura del ADN, basado en los datos de rayos X de Franklin y Wilkins y en las
95
equivalencias de bases observadas por Chargaff. Este modelo no solo explicaba las
propiedades fsicas y qumicas del ADN, sino que sugera un mecanismo por medio
del cual la informacin gentica poda replicarse con exactitud. El modelo estructural
del ADN de Watson y Crick consiste en dos cadenas polinucleotdicas dextro-
helicoidales, arrolladas a un mismo eje y constituyendo una doble hlice. Las bases
pricas y pirimdicas de cada hebra se encuentran en el interior de la doble hlice.
El aparejamiento de las bases apartadas por ambas hebras es tal que solamente
ciertas bases encajan en el interior de la estructura de manera que puedan unirse
unas a otras por puentes hidrgeno. Las bases son:

A-T y G-C

Que son las parejas que muestran exacta equivalencia:

N N
ncleo de ncleo de
AyG TyC
N N N

Si el par sera A - G seran demasiado grandes para poder encajar dentro de la

doble hlice de estas dimensiones.
Si la pareja fuera G - T las bases se encontraran muy distanciadas para poder
formar enlaces hidrgeno estables.
A T
A T
G C
A T
T A
C G
A T
G C

Adems los enlaces hidrgeno entre A G y C T son ms dbiles que A T y G

C, o sea que la doble hlice implica aquellas parejas que poseen el mximo de
estabilidad. Por qu las dos periodicidades observadas con los rayos X?. Se
postul que la periodicidad de 3,4 se debe a que las bases estn apretadamente
apiladas al eje y mantienen una distancia de 3,4 de centro a centro. En cada
espira de la hlice hay 10 nucletidos y de una espira a otra hay 34 .
Las bases hidrfobas estn en el interior de la hlice, los restos carbohidratos y los
fosfatos que poseen carga elctrica estn expuestas al H2 O . As resulta que la doble
hlice est estabilizada no slo por los puentes hidrgeno entre les bases
complementarias sino tambin por interacciones hidrofbicas entre dichas bases
apiladas. Las dos cadenas polinucletidas de la doble hlice no son idnticas ni en la
composicin ni en la secuencia de bases. Ambas cadenas son complementarias una
de la otra. Esta estructura conduce a un mecanismo por medio del cual la
informacin gentica puede replicarse con precisin. Dado que las dos hebras son
complementarias una de la otra, y contienen informacin gentica complementaria,
se postul que durante la divisin celular la rplica del ADN podra ocurrir por
separacin de las dos hebras, con lo que cada una hara de patrn especificador de
la secuencia de bases de una nueva hebra complementaria sintetizada. EI resultado
96
final de este proceso consistira en la formacin de dos molculas hijas de un ADN
de doble hlice, cada una de las cuales contendra una de las hebras del progenitor.

REPLICACION DEL ADN

De acuerdo al dogma central de la gentica molecular, qued establecido que:

ADN ARN protenas

O sea que ste dogma defini tres procesos fundamentales de los cuales el primero
es el de REPLICA, es decir la "copia" del ADN con formacin de molculas hijas.
Veremos como sucede ste proceso a nivel molecular. La caracterstica ms
sorprendente de la hiptesis de Watson y Crick, desde el punto de vista gentico, en
su postulado de que las dos hebras del ADN duplohelicoidales son complementarias.

La rplica de cada una de ellas conduce a dos molculas hijas de ADN; cada una
contiene una hebra del ADN progenitor. Este proceso se denomina rplica
semiconservadora.
Pero Cmo pueden replicarse simultneamente las dos hebras del ADN de modo
que se formen al mismo tiempo.
ste mecanismo requiere tres enzimas:
ADN - polimerasa dependiente del ADN
ADN - ligasa
Endodesoxiribonucleasa

ADN polimerasa

Cataliza la sntesis de enlaces internucletidos. Posee los siguientes requerimientos:

1). Presencia da ADN preformado
2). Presencia de los cuatro desoxiribonucletidos trifosforados, los mono y
difosforados son inactivos.
3). Mg++

Qu papel desempea el ADN preformado? Se han propuesto dos alternativas:

1. Que acta como cebador, es decir, que al proporcionar un extremo o puntos
de crecimiento, se pueden adicionar nuevos mononucletidos.

97
 hebra patrn hebra cebadora

2. O bien podra ser utilizado como patrn sobre el cual la enzima podra
construir una hebra complementaria al ADN preformado.

ADN
|
nd ATP
d AMP
nd GTP ADN preformado |
d GMP + 4 PPi
nd CTP Mg++ |
nd TTP d CMP
|
d TMP

Teniendo en cuenta estos requerimientos la reaccin global sera as.

Mecanismo de accin de la ADN Polimerasa

Si partimos de una hebra cebadora de ADN o sea de un ADN preformado:

OH

HO P H2C
O Base
O
H H
H
O H
O Base
HO P O
H H
H
H2C
OH + PPi
O O H
Base
H H O P OH
H
OH H PPi H2C
OH
O Base
O O P
H H
H
O P O P O P OH
OH H
OH OH OH
H2C
O Base
98
H H
H OH
OH H
Hay un ataque al tomo de fsforo alfa del nucletido trifosforado entrante y provoca
el desplazamiento de su grupo pirofosfato, con formacin de enlace internucletido.
El PPi formado es rpidamente hidrolizado por una pirofosfatasa por lo cual la
reaccin es muy exergnica. La direccin de la sntesis es por lo tanto 5 --- 3'.

ADN ligasa
1. Enlaza extremos de molculas de ADN produciendo formas circulares. Ej.:
bacterias.
2. Cataliza la reparacin de roturas de una cadena de ADN.

Requerimientos de la ADN ligasa

1. Presencia de NAD que acta como fuente de grupos adenilo.

2. Una hebra intacta de ADN.

Mecanismo de accin de la ADN ligasa

O
NMN
Dinucletido
Base CH2 O P OH NAD constitudo
NMN y AMP
5' AMP
OH
H OH
3'
H
Base O

1. Enzima + NAD --------------- En - AMP + NMN.

Se forma un complejo entre En y AMP y se forma NMN como producto
secundario.
2. El grupo adenilo es transferido por la Enzima al extremo 5 fosfato.
3. El extremo 3' OH desplaza al grupo adenilo y forma el enlace fosfodister.

99
 OH
O O

Base O CH2 O P O P H2C Base O CH 2 O

OH OH Adenina HO P O

O
OH

Base O
Base O

Mecanismo de replicacin

Antes de hablar de la replicacin es importante acotar que la cadena de ADN

recin sintetizada se prolonga en direccin opuesta a la cadena de ADN patrn, es
decir, tiene una polaridad opuesta o antiparalela.

P 3'
T
A T
5' 3' 5'
cebadora 3' P
P 3' 5' 3'
5'
T A
T
3'
P
P

Kornberg: postul que la rplica comienza con la produccin de una mella o una
rotura en una hebra por accin de una endonucleasa. Unidades de MN adicionadas
por la ADN polimerasa:

5'
5'

3' 3' 5' 3'

La ADN polimerasa se fija a dicha rotura y comienza a prolongar el extremo 3'

unidades de mononuclotidos.
El extremo 5' se desplaza de la estructura duplex. Se sugiere que el extremo 5'
100
puede estar sujeto por adherencia a la membrana celular. La rplica continua
durante cierto trecho mientras que el extremo 5' se va "pelando". La ADN polimerasa
se desplaza de lugar, o salta, desde la hebra patrn intacta a la hebra mellada en el
sitio donde se separan ambas hebras y comienza a adicionar unidades de
mononucletidos utilizando como patrn la fibra mellada. La replicacin contina
hasta que el extremo se ha replicado por completo y entonces la enzima se retira.
La endonucleasa rompe en la horquilla la hebra formada y el proceso vuelve a
repetirse con la ADN polimerasa, que adiciona nuevas unidades de mononu-
cletidos. Los dos nuevos segmentos formados sobre la hebra patrn son unidos por
la ADN ligasa y comienza un nuevo ciclo.

3' 5' 3' 5' 3' 5'

endonucleasa ADN polimerasa ADN ligasa

101
TEMA XXV: LA TRASCRIPCION DE LA INFORMACION GENTICA
ARN mensajero: teora y propiedades del mensajero. La polimerasa del ARN
dependiente del ADN. Mecanismo de accin: unin, iniciacin, elongacin y
terminacin de la trascripcin. La rplica del ARN.

Evidencias de que el ARN transporta la informacin gentica:

El ARN m es un buen candidato para transportar la informacin por una serie de

evidencias:
1. El ARN tiene una estructura semejante a las cadenas del ADN y sus bases
nucleotdicas pueden formar puentes hidrogeno con las bases del ADN
siguiendo las reglas de complementariedad de Watson y Crick.
2. El ARN puede contener y transmitir informacin gentica; sto lo demuestra el
hecho de que algunos virus no contienen ADN y su ARN puede actuar como
agente infeccioso. Ej., el virus del mosaico del tabaco que causa infecciones
virales en las hojas de las plantas.
3. El ARN se sintetiza en el ncleo, pero los ribosomas que estn en el
citoplasma, donde se realiza la sntesis proteica, contienen ms del 70% del
ARN celular.

PROPIEDADES DEL ARN MENSAJERO

1. Recambio. En bacterias el ARN m tiene un activo metabolismo, se sintetiza y

degrada rpidamente. Esta propiedad fue la clave de su aislamiento e
identificacin. Sin embargo existen ARN muy estables Ej.: el ARN m de los
reticulocitos.
2. Relacin entre la secuencia de bases del ADN y el ARN celular. El ARN m
se sintetiza sobre una matriz de ADN o sea que el ARN m es el portador de la
informacin. La enzima que cataliza esta sntesis es la ARN polimerasa
dependiente del ADN.

Mecanismo de accin de la ARN polimerasa

Para obtener esta enzima en forma pura, Richard Burgen realizaron una
electroforesis en gel de poliacrilamida. As se pudo detectar 4 bandas por tincin de
los polipptidos.
Lo que interesaba saber era si los 4 polipptidos intervenan en la actividad de la
enzima. Para ello eliminaron uno de los polipptidos que denominaron factor
(sigma).
La eliminacin de este factor cambi las propiedades de la enzima ya que perdi su
capacidad de usar como matriz al ADN. La adicin de factor restauraba la
propiedad de la enzima de usar ADN como matriz.

102
Mecanismo de accin de la ARN polimerasa

A. Unin de la ARN polimerasa al ADN:

unin reversible unin estable: reconoce al promotor

las hebras del ADN se separan

La ARN polimerasa se une reversiblemente al ADN en varios sitios de ste. Sin

embargo cuando esta unin se hace en una regin especfica que es el gen
promotor el factor reconoce la secuencia nucleotdica y estabiliza el complejo
ADN-ARN polimerasa.
Esta estabilizacin permite que la enzima inicie la separacin de las hebras de la
doble hlice del ADN permitiendo la iniciacin de la trascripcin.
B. Iniciacin de la trascripcin

A T C T G A G A C T A T C T G A G A C T

T A G A T A G A

G T G T

A A

C T C C T C

G G A
3'
P P P OH P P P OH
OH

P
5'

P
103

P
 A T C T G A G A C T

T A G A

G T
Se forma el primer enlace
internucletido A

C T C

G A

P P P P OH + P P
5'

Una vez unida la enzima a un promotor en el ADN, se inicia la transcripcin por

unin de dos nucletidos trifosforados a la enzima. En general todos los ARN
comienzan a sintetizarse por ATP y GTP. Al tomar posicin los dos primeros
sustratos, el OH 3' del nucletido trifosforado iniciador ataca el enlace fosfodister
entre los fosfatos alfa y beta del segundo nucletido y se forma el primer enlace
internuclotido.

Elongacin de las cadenas nucleotdicas:

A T C T G A G A C T

T A G A

G T

A La enzima se desplaza
por la hebra del ADN
C T C

G A G A

P P P P P P OH

104
Cuando el producto de la elongacin llega a un tamao crtico el factor se libera.
Las cadenas nucleotdicas crecen por adicin secuencial de ribonucletidos al
extremo 3' del dinucletido iniciador.
La entrada de los diferentes sustratos depende de la complementariedad con las
bases de la hebra del ADN que sirve de matriz.

Terminacin de la transcripcin:

1.

secuencia terminadora
reconocida por la enzima

2.
factor de terminacin

Ro

ADN ARN enzima

Ocurre por medio de dos mecanismos:

Terminacin codificada por una secuencia de ADN que es reconocido por la
enzima.
Por medio de un factor proteico adicional el cual tiene la propiedad de causar
la terminacin de la trascripcin en sitios donde no funciona el primer
mecanismo.

Conclusin: la clula resuelve el "problema geogrfico" transcribiendo la

informacin gentica contenida en el ADN del ncleo en un ARN que acta como
mensajero, pues lleva la informacin a los ribosomas citoplasmticos donde se
realiza la sntesis proteica.

105
TEMA XXVI: EL CODIGO GENETICO

El codn: unidad de informacin, primeras ideas sobre la clave gentica. Uni-

versalidad de la clave gentica.

Vamos a considerar dos cuestiones:

1. Cmo se traslada el lenguaje de cuatro letras de los cidos nucleicos al de
veinte letras de las protenas?
2. Cul es la correspondencia entre la secuencia nucleotdica y la secuencia de
aminocidos?

Mediante consideraciones matemticas, pareca probable que cada aminocido

fuera codificado por un nmero pequeo de nucletidos consecutivos de la cadena
ADN. Puesto que el ADN contiene slo cuatro bases y las protenas contienen veinte
aminocidos, es obvio que se requiere ms de un nucletido para codificar cada
aminocido. Si se disponen los nucletidos en grupos de dos, rinden 4 2 16
combinaciones. Las 4 bases en combinaciones de 3, pueden codificar 4 3 64
aminocidos distintos. O sea que un cdigo de tripletes es utilizado para codificar
aminocidos.

Composicin de los Tripletes

Los experimentos que se realizaron para conocer la composicin de los

tripletes fueron utilizando polirribonucletidos sintticos como mensajeros de
ribosomas aislados de E. Coli. Incubaron cido uridlico (poli - U) en una serie de
tubos que contenan ribosomas de E. Coli privados de mensajero, adems de todo lo
necesario para la sntesis proteica, incluyendo todos los aminocidos. Este estudio
demostr que la cadena polipeptdica recin formada contena solamente
fenilalanina. En consecuencia, sugirieron que el vocablo del cdigo para la
fenilalanina era el triplete UUU.
Por experimentos similares hallaron que el poli C codifica prolina, el poli A
lisina, etc. Posteriormente prepararon polmeros de nucletidos variando la relacin
cuantitativa de los distintos mononucletidos que permiti identificar la composicin
de 50 vocablos del cdigo para los distintos aminocidos. Estos experimentos no
slo permitieron establecer como se "deletrea" el vocablo del cdigo de cada
aminocido, sino que permitieron comprobar que algunos aminocidos eran
codificados por ms de un triplete.

Por ejemplo:
fenilalanina es cofificada por UUU UUC

serina es cofificada por UCU UCC UCA UCG

El triplete de bases nucleotdicas que se encuentran en el ARN m y que codifica un

aminocido de denomina codn.

106
Caractersticas generales del cdigo

El cdigo aminocido es un cdigo degenerado, es decir que hay ms de un

vocablo de codificacin para la mayora de los aminocidos.
Otra caracterstica del cdigo gentico consiste en que no requiere seal
indicadora del final de un codn y comienzo del siguiente.
3 de los 64 tripletes no codifican ninguno de los aminocidos y son: UAG -
UAA - UGA. Estos tripletes constituyen una seal de terminacin de las
cadenas polipeptdicas.
Universalidad del cdigo
Los vocablos del cdigo aminocido son idnticos en el hombre, en virus y en
bacterias, es decir, es universal. A esta conclusin se lleg luego de una serie de
ensayos. Se compar 50 aminoacil - ARNt diferentes procedentes de especies muy
distantes, y observaron sus respectivas capacidades para ser reconocidos por los
codones aminocidos previamente establecidos de E. Coli. Para ello se ensay la
capacidad de tales aminoacil - ARN t para unirse a ribosomas de E. Coli empleando
sintticos y se hall que en todos los casos los aminoacil - ARN t respondan
perfectamente a los codones de E. Coli unidos a los ribosomas de este
microorganismo. Considerando conjuntamente este hallazgo sugieren que el
lenguaje gentico es idntico en todas las especies.

107
TEMA XXVII: LA TRADUCCION DE LA INFORMACION GENETICA

Necesidad de una molcula adaptadora: el ARN de transferencia. El anticodn.

Funcin de los ribosomas. El mecanismo de traduccin: iniciacin, elongacin,
translocacin y terminacin.

Vamos a considerar ahora la tercera gran cuestin que plantea la continuidad

gentica de los organismos vivos.
Cmo se traslada la informacin gentica contenida en la secuencia nucletida del
ARN m , de tal suerte que los aminocidos se engarcen formando una cadena
polipeptdica con una secuencia aminocida especfica?
Trataremos los mecanismos enzimticos por medio de los cuales se constituye la
cadena polipeptdica, es decir, como se realiza la sntesis proteica. Adems veremos
el funcionamiento de los ribosomas asegurando la adecuada transferencia de la
informacin del ARN m , y el papel adaptador del ARN t .

Estructura ribosmica

Los ribosomas sometidos a condiciones especiales se disocian en dos subunidades

50 S y 30 S cada uno de los cuales contiene ARN y varias protenas.

contiene dos componentes

50 S
ARN y 30 proteinas diferentes

contiene una molcula de ARN

30 S
ribosomtico y 20 protenas diferentes

Estructura del ARN de transferencia ( ARN t)

El ARN t , posee una conformacin tridimensional similar a una hoja de trbol de

manera que presentan sus cadenas el mximo de aparejamiento intracatenario.

A
| Locus de enlace aminocido
C
|
G C

108

Anticodn (unin al ARNm)

Todas las molculas de ARN t tienen en un extremo la misma secuencia terminal
C C A . El ltimo resto, el cido adenlico, es el locus que se esterifica al resto
aminocido. Adems existe un triplete de bases que es distinto en todos los ARN t y
representa el anticodn es decir, el triplete nucletido especifico complementario de
los tripletes del codn del ARN m .
La molcula de ARN t contiene otro locus de unin para la enzima activadora. Una
caracterstica de la estructura es la presencia de bases secundarias adems de las
normales A U G y C. La mayora son formas metiladas de las bases principales.
El ARN t es solamente un "adaptador" de manera que puede ser adaptado al
lenguaje de tripletes nucletidos del cdigo gentico.

Estados de la sntesis proteica

Primer estadio: activacin

Los 20 AA se eterifican al ARN t correspondiente. Las enzimas que participan

son: aminoacil- ARN t -sintetasas que tienen:
a. tres locus de unin:
o para el AA
o para el ARN t
o para el ATP
b. son especficos:
o para cada AA
o para el correspondiente ARN t

La reaccin tiene lugar en el citoplasma.

Primera fase de activacin

Se forma un producto intermedio unido a la enzima:

Mg++
ATP + AA cido amino acil adenlico + PPi

O
H O
P O P O P O CH2
O
R C C OH +
OH
NH2 Adenina

H O O

R C C O P O CH2 + PPi
O Adenina
NH2 OH 109
Segunda fase de activacin

Consiste en la transferencia del grupo aminoacilo del AMP al ARN t :

cido-aminoacil.adenlico + ARNt aminoacil - ARNt + cido adenlico

O sea que la reaccin global sera

AA + ARNt + ATP aminoacil - ARNt + AMP + PPi

Tenemos entonces cada AA con su correspondiente ARN t .

Segundo estado: ribosomal

En ribosomas. Los ribosomas tienen que captar al ARN m y al ARN t AA .

30 S

LP LA
50 S

Los ribosomas tienen dos locus de unin.

1. El locus peptidlico: (LP) para el ARNm que tiene unido el AA iniciador de
la sntesis que es la metionina, la cual tiene su grupo amino bloqueado por
un grupo formilo con el objeto de:
a. que el grupo amino no forme enlace peptdico.
b. que el locus peptidlico slo acepte alARN t que tiene metionina.

2. El locus aminoaclico: que permite la entrada secuencial de los

ARN t AA .

El ribosoma para que puedan unirse el ARN m y el ARN t AA debe disociarse en sus
dos subunidades. Participan en este proceso factores proteicos F1 F2 F3 (llamados
tambin disociasaribosomal) y GTP. Estos factores permiten la disociacin de los
ribosomas y adems la unin del ARN m en el lugar donde se inicia el mensaje.

110
 30 S 30 S 30 S

50 S

AA AA

50 S

Tercer Estado: Elongacin

La prolongacin de una cadena tiene efecto en tres fases principales:

1.- Los ribosomas con su ARN m , tienen unido en el LP el ARN t AA iniciador de
la sntesis (metionina). En el estado de elongacin, al locus aminocido se
une por su anticodn el ARN t AA de acuerdo al triplete de bases del
codn. Este proceso requiere GTP y un factor T que es una protena que
cataliza este proceso de elongacin.

LP LA

(metionina) AA AA

2.- En la segunda fase se forma el enlace peptdico por reaccin entre el grupo
amino del nuevo aminoacil - ARN t captado con el grupo carboxilo del AA ya
existente en el LP.

111
 NH NH

R CH
R CH
C O LP HO LP descargado
O C
O

NH
NH2
R C H
R CH
C O
C O LA LA
O O

ARNm

Para la formacin del nuevo enlace peptdico es necesario una enzima

denominada peptidil-transferasa. El ARN t "descargado" que ya no lleva su
AA, contina unido al LP. El peptidil ARN t recin alargado est unido al LA.

3.- En la tercera fase del ciclo de alargamiento el peptidil - ARN t se desplaza

fsicamente desde el LA al LP y desaloja de este ltimo al sitio del ARN t
descargado. Esta compleja reaccin de translocacin se cree que es
resultado de un cambio de conformacin en el ribosoma, que tiene lugar a
costa de la hidrlisis del GTP. Para esta fase se requiere una protena
especifica denominada factor G. Simultneamente con la translocacin del
peptidil - ARN t tiene lugar la del ARN m que desplaza un codn a lo largo del
ribosoma.

O CH
NH
R C H
C O LP
O

LA

El proceso se repite, es decir entrando ARN t AA al LA hasta que el ARN m

codifica la terminacin.

112
 Cuarto Estado: Terminacin de la cadena polipeptdica

La terminacin de una cadena polipeptdica completa y su despegue del

ribosoma est sealada en el ARN m por tres codones especiales de terminacin. La
liberacin del polipeptidil- ARN t del ribosoma, es inducido por un factor de liberacin
protico que est unido al ribosoma y provoca la hidrlisis del enlace ster entre el
polipptido y el ARN t . El ribosoma 70 S se aparta del ARN m y queda libre. Cuando
experimenta disociacin en sus subunidades 50 S y 30 S puede recomenzar un
nuevo ciclo.-

113
TEMA XXVIII: REGULACION DE LA SNTESIS PROTEICA

Teora de Jacob y Monod: Regulacin transcripcional. Induccin. Represin.

Las clulas vivas disponen de mecanismos que regulan la cantidad de protenas que
se sintetizan.
Estos mecanismos de regulacin fueron estudiados en clulas bacterianas y se
observ que la cantidad de enzimas que se acumula en el medio depende de la
naturaleza de los nutrientes. En base a todos estos estudios se distingui dos tipos
de respuestas:
De induccin enzimtica
De represin enzimtica

INDUCCION

Si estamos en presencia de una induccin a la enzima que se induce a que se

sintetice se denomina enzima inducible. Esta enzima inducible se encuentra en
pequea cantidad en el medio, pero cuando se agrega un sustrato sobre el cual
debe actuar su concentracin aumenta para transformar a ese sustrato en un
metabolito que puede ser utilizado por la clula. Ej.: un tipo de E. coli usa como
fuente de carbono a la glucosa. Si en el medio en lugar de colocar glucosa
colocamos lactosa, la clula inmediatamente comienza a sintetizar -galactosidasa
que desdobla la lactosa en galactosa y glucosa. Si volvemos a colocar glucosa, la
enzima -galactosidasa deja de sintetizarse y alcanza un nivel bajo. La mayora de
las enzimas inducibles catalizan las reacciones del catabolismo. Estas enzimas
inducibles son diferentes a las enzimas constitutivas que se forman a velocidades
constantes independientemente de la presencia del sustrato (por ej. las enzimas de
la gliclisis).

REPRESIN ENZIMATICA

La clula tiene enzimas requeridas para la sntesis de los 20 aminocidos. Si

agregamos al medio un aminocido, por ej. histidina, la enzima que le sintetizaba es
reprimida y desaparece de la clula. Todas las enzimas inducibles estn codificadas
por genes. En los genes hay locus que determinan la formacin de las enzimas. Un
locus se denomina gen estructural, que es el que determina la secuencia de
aminocidos de la enzima. El otro locus, llamado gen regulador, es interruptor, es
decir, que est determinando si el gen estructural se transcribe o no. O sea que el
gen estructural codifica una enzima que se sintetiza normalmente siempre que el
gen regulador no reprima su sntesis.

Regulador

Estructural

114
Cmo funciona el gen regulador tanto en la represin como en la induccin?

Jacob y Monod formularon una hiptesis general respecto a la funcin de los genes
estructural y regulador) en los 2 procesos.
Induccin
El gen regulador transcribe un ARN mensajero que codifica una protena
denominada represor.
ARNm
regulador

operador

estructural represor

Este represor tiene un locus de unin especfico prximo al gen estructural. Este
locus se denomina operador.
Qu sucede en una induccin, es decir, cuando se agrega al medio un sustrato que
debe degradarse? El sustrato, que sera el inductor, se combina con el represor
formando un complejo inductor-represor inactivo, que no puede unirse al operador.

represor

inductor

El gen estructural queda libre y comienza a transcribirse y por lo tanto se sintetiza la

enzima. La unin represor-inductor es reversible, o sea que cuando se elimina el
inductor la sntesis de la enzima que lo degrada es reprimida.

Represin
Si agregamos al medio un aminocido por ej. histidina, la clula no necesita utilizar
las enzimas que lo sintetizan.

ARNm
regulador

operador

estructural represor
115
En este caso, la histidina se une al represor y forma un complejo represor-
correpresor que se combina al operador; el gen estructural no se transcribe y por lo
tanto no se sintetiza histidina.

Regulacin coordinada

Tambin existe un mecanismo de regulacin coordinada por el cual un grupo de

enzimas puede ser reprimida o inducida por un slo represor o por un slo inductor.
Por ejemplo, para sintetizar histidina se necesita un grupo de enzimas. Todas se
encuentran codificadas en los genes ocupando locus vecinos.

operador z x a b

codifican las sntesis de histidina

Este grupo de genes relacionados constituyen un opern; o sea que el opern se

encuentra codificando todas las enzimas que participan en la biosntesis de histidina.

Cmo se reprime un opern completo actuando un represor?

Cuando el represor se une al operador no se sintetiza ninguna de las enzimas del

opern. Si se elimina el represar se sintetizan todas las enzimas que codifica el
opern.

116
 BIBLIOGRAFIA

1. Blanco, A., (2008) Qumica Biolgica. 8 Ed. Buenos Aires.

2. Griffihs, A. Miller, J., Suzuki, D., Lewontin, R., y Gelbart, W., (1995) Gentica.

5Ed. Editorial Interamericana. Mxico.

3. Murray, R., Darylk, Granner, Meyer, P, & Rotewell, V., (1994) Bioqumica de

Harper 22 Ed. Editorial El Manual Moderno. Mxico.

4. Kuchel, P., & Ralston, G., (1994) Bioqumica General. Editorial Mac Graw Hill

Interamericana. Mxico.

5. Lehninger, A., (1981) Bioqumica Ediciones Omega. Barcelona.

6. MC Keen, T., 2003. Bioqumica. La base molecular de la vida. Mac Graw Hill

Interamericana.

7. Smith, C., & Wood, E., (1998) Biosntesis. Tercera Edicin. Editorial Addison.

Wesley Ibero

8. americana. USA.

9. Strayer, L., (1990) Bioqumica. Tomo I y II. Tercera Edicin. Editorial Revert.

Buenos Aires.

10. Strayer, L.,(1995) Biochemistry. Quinta Edicin. Freedman and company.

USA.

11. Torres, H., Carminatti, H & Cardini, C., (1983) Bioqumica. Editorial El Ateneo.

Buenos Aires.

12. Watson, J., (1978) Biologa molecular del gen. Fondo Educativo

Interamericano. Espaa.

117