Ciclo de Krebs

Destino del piruvato. Descarboxilacin oxidativa.

Aspectos estructurales y mecanismos de la piruvato
deshidrogenasa.
Relevancia del ciclo de Krebs dentro del metabolismo en general.
Descripcin y caractersticas de las reacciones que lo componen.
Sitios de conservacin de energa.
Regulacin metablica, integracin con la gluclisis.
Efecto Pasteur.
Ciclo del glioxilato. Reacciones que lo componen. Reacciones
anaplerticas.
Los mamferos no
pueden convertir
los cidos grasos
en glucosa
Del acetil-CoA no
se puede ir a
gluconeognesis.

Respiracin es la oxidacin
completa del Pyr a CO2 y
H2O.
Respiracin celular:
procesos moleculares
mediante los cuales las
clulas consumen O2 y
producen CO2.
Etapas de la respiracin celular.

Etapa 1: oxidacin de combustible

orgnico (cidos grasos, glucosa y
algunos AA) a acetil-CoA.

Etapa 2: Oxidacin de grupos acetilos

en el ciclo del cido ctrico/de los
TCA/de Krebs, a CO2 y 4 electrones son
extrados (NADH y FADH2).

Etapa 3: NADH y FADH2 son llevados

a la cadena respiratoria mitocondrial (o
en bacterias a la membrana plasmtica)
para finalmente reducir el O2 a H2O.
Este flujo electrnico lleva a la
produccin de ATP.
Etapa 1:
oxidacin de
cidos grasos,
glucosa y
algunos AA
que dan acetil-
CoA.
Etapa 2: Oxidacin de
grupos acetilos en el ciclo
del cido ctrico, que
incluye 4 etapas en la cual
los electrones son extrados.
Etapa 3: Los electrones aportados por el NADH y FADH2 son llevados a la cadena respiratoria
mitocondrial (o en bacterias a la membrana plasmtica) para finalmente reducir el O2 a H2O.
Este flujo electrnico lleva a la produccin de ATP.
 Reaccin global catalizada por el complejo de la Piruvato
deshidrogenasa.
Cinco coenzimas y 3 enzimas participan de este complejo que
catalizan una decarboxilacin oxidativa.

Reaccin irreversible

4 vit. esenciales: tiamina, riboflavina,

nicotinamida y pantotenato
Localizacin mitocondrial y prototipo de DH
 Coenzima A (CoA o CoASH)

Tioster de alto poder

de transferencia de
grupos acilos

No se encuentra en la molcula de ADP

Lipoato transportador de
electrones (hidrgeno) y de
acilos (acetilo)
Complejo de la PDH
por microfotografa
crioelectrnica de
rin de bovino

Ms de 5 veces el tamao de un
ribosoma
 Imagen tridimensional del complejo de la PDH:
E1: PDH (TPP)

E2: dihidrolipoil transacetilasa

E3: dihidrolipoil DH (FAD)

60 molculas de E2
ordenadas en 20 trmeros para
formar un dodecahedro
pentagonal

Sitio de unin del

grupo lipoilo al
dominio lipoilo de
E2
Dominio lipoilo
que toca el sitio
Varias subunidades E3 activo de E1
tambin estn unidas al ordenada
centro, donde el brazo alrededor de E2
oscilante de E2 puede
alcanzar el sitio activo.
E2 complejo de la PDH

E2 tiene 3 tipos de dominios unidos por polipptidos de unin cortos: un dominio

cataltico acetiltransferasa, un dominion de unin de E2 a E1 y E3 y uno o ms
dominios lipoilcos dependiendo de las especies.
 Descarboxilacin oxidativa del piruvato a acetil-CoA por complejo PDH.
Un ejemplo de canalizacin de sustratos

El destino del Piruvato est marcado en rojo

1: decarboxilacin (ms lento, limita la veloc. reaccin y ejerce especificidad de sustrato; 2:
transferencia de electrones y grupo acetilo; 3: transesterificacin; 4: transferencia de 2H; 5:
transferencia de H+ de FADH2 a NADH
Reacciones del ciclo del cido ctrico

El destino del
acetato del Acetil-
CoA est marcado
en rosa.

Reacciones 1, 3 y 4
son irreversibles en
la clula

4 de las 8
reacciones son
oxidaciones
(conservacin de
la E)
Precursores de
otros productos
 Formacin de citrato

(condensacin de Claisen)
Estructura de la Citrato sintasa

Forma abierta Forma cerrada con OAA unido, que

provoca aparicin de sitio de unin de
acetil-Coa
En mamferos, el OAA se une
primero, el orden de reaccin es
estrictamente ordenado.
Centro Fe-S de la aconitasa, participa tanto en la unin al sustrato como en la catlisis
Isocitrato deshidrogenasa
Semejante al complejo de la PDH, E1 es diferente
Fosforilacin a nivel de sustrato
Inhibidor competitivo de SDH
 cis
FUMARASA: trans
ltamente
estereoespecfica
Citrato: molcula simtrica que reacciona asimtricamente
 Unin del citrato al sitio activo de aconitasa

Naturaleza proquiral del citrato

Productos de
una vuelta del ciclo
TCA incompleto en
bacterias anaerbicas (no
poseen 2-OGDH)
Reacciones de relleno que permiten reponer los intermediarios del
ciclo resultando en un equilibrio dinmico. As, las concentraciones
de los intermediarios del ciclo permanecen prcticamente
constantes.
Fosforilacin de E1
Inactiva PDH

Inh. alostrico de FFK1

Efecto Pasteur
Louis Pasteur fue el primero en describir el gran incremento, ms
de 10 veces, en el consumo de glucosa por un cultivo de levadura
cuando pasaba de condiciones aerbicas a anaerbicas.
Este efecto Pasteur se produce sin un cambio significativo de la
conc. de ATP o de la mayora de los centenares de intermediarios
metablicos y productos derivados de la glucosa.
Plantas, ciertos invertebrados y
algunos microorganismos
(incluidas E.coli y levaduras)
convierten acetato en glcidos por
el ciclo del glioxilato

2 acetil-CoA + NAD+ + 2 H2O

succinato + 2 CoA + NADH + H+

Semillas de pepino en germinacin
 Evita las 2
decarboxilaciones y
por eso da sntesis
neta de succinato,
OAA y otros
intermediarios

Asp
Regulacin coordinada
de ambos ciclos por IDH