Un rbol filogentico es un rbol que muestra las relaciones evolutivas entre varias especies u

otras entidades que se cree que tienen una ascendencia comn . Un rbol filogentico es una
forma de cladograma donde se usa informacin proveniente de fsiles, as como aqulla generada
por la comparacin estructural y molecular de los organismos .
Los rboles filogenticos se construyen tomando en cuenta la teora de la evolucin, que nos indica
que todos los organismos son descendientes de un ancestro comn: la protoclula. As, todos los
organismos, ya sean vivos o extintos, se encuentran emparentados en algn grado.

La interpretacin de un rbol filogentico es muy parecida a leer un rbol genealgico. La

raz del rbol representa el ancestro comn, y las puntas de las ramas representan los
descendientes de aquellos ancestros. A medida que vas subiendo por el rbol desde la
raz hasta las puntas de las ramas, ests avanzando en el tiempo. Cada vez que un linaje
se bifurca se produce un fenmeno de especiacin, que se representa como una nueva
rama dentro del rbol filogentico.

En un rbol filogentico, las especies de inters se muestran en

las puntas de las ramas del rbol. Las ramas se conectan entre s
de manera que representan la historia evolutiva de las especies,
esto es, la manera en la que pensamos que evolucionaron a partir
de un ancestro comn mediante una serie de eventos de
divergencia (separacin en dos ramas). En cada punto de
ramificaicn se encuentra el ancestro comn ms reciente que
comparten todas es especies que descienden a partir de ese
punto de ramificacin. Las lneas del rbol representan largas
series de ancestros que se extienden desde una especie hasta la
siguiente.

Cmo construimos un rbol filogentico? El principio

subyacente es la idea de Darwin de "descendencia con
modificacin". Bsicamente, al ver el patrn de
modificaciones (rasgos nuevos) en los organismos
actuales, podemos determinar o al menos, realizar
hiptesis al respecto de su camino descendente a partir
de un ancestro comn.

Como ejemplo, consideremos el rbol filogentico

siguiente (que muestra la historia evolutiva de un grupo
inventado de especies parecidas a ratones). Vemos que
surgen tres rasgos nuevos en diferentes puntos durante la
historia evolutiva del grupo: una cola esponjada, orejas
grandes y bigotes. Cada rasgo nuevo es compartido por
todas las especies descendientes del ancestro en el que
apareci la caracterstica (indicado por las marcas con
forma de palomita), pero est ausente de las especies
que se separaron antes de que el carcter apareciera.

Cuando construimos rboles filogenticos, las

caractersticas que surgen durante la evolucin de un
grupo y que difieren de las del ancestro del grupo se
llaman carcteres derivados. En nuestro ejemplo, una
cola esponjada, unas orejas grandes y los bigotes son
carcteres derivados, mientras que una cola delgada,
orejas pequeas y la falta de bigotes son carcteres
ancestrales. Un punto importante es que un carcter
derivado puede aparecer por prdida o ganancia de una
caracterstica. Por ejemplo, si hubiera otro cambio en el
linaje E que resultara en la prdida de la cola, la falta de
cola se considerara un carcter derivado.

Los carcteres derivados compartidos entre especies u

otros grupos en un conjunto de datos son claves para
ayudarnos a construir rboles. Como se muestra arriba,
los carcteres derivados tienden a formar patrones
anidados que proporcionan informacin acerca de cundo
ocurrieron los eventos de ramificacin en la evolucin de
las especies.

Cuando construimos un rbol filogentico a partir de un

conjunto de datos, nuestra meta es usar los carcteres
derivados compartidos de las especies actuales para
inferir los patrones de ramificacin de su historia
evolutiva. El problema, sin embargo, es que no podemos
observar la evolucin de nuestras especies de inters y
ver cundo surgieron los carcteres nuevos en cada
linaje.

En su lugar, tenemos que trabajar en retrospectiva. Esto

es, tenemos que ver a nuestras especies de inters
como A, B, C, D y E y averiguar cules carcteres son
ancestrales y cules derivados. Luego, podemos usar los
carcteres derivados compartidos para organizar las
especies en grupos anidados como los que se muestran
arriba. Un rbol hecho de esta manera es una hiptesis
sobre la historia evolutiva de las especies, generalmente,
la que tiene el patrn de ramificacin ms sencillo para
explicar sus carcteres.