FILOGENIA

Análisis Filogenético: ​Reconstrucción de las relaciones genealógicas entre taxa. El análisis

filogenético busca establecer las relaciones genealógicas entre las especies a partir de las
características biológicas de las mismas (caracteres)

Una de las diferencias entre las teorías evolutivas de Lamarck y Darwin esta relacionada al
origen de las especies.
● Mientras que Lamarck planteaba que el origen de las mismas era por generación
espontánea.
● Darwin introduce el concepto de “comunidad de descendencia”. Planteaba que a partir
de una especie podían formarse otras nuevas especies, existiendo de esta manera una
relación de parentesco entre las mismas.
La inferencia filogenética intenta establecer tales relaciones de parentesco entre especies.
Las relaciones filogenéticas suelen representarse como una árbol filogenético.

PARTES DE UN ÁRBOL FILOGENÉTICO

Grupo Clado: ​agrupación que contiene un antepasado común y todos los descendientes de
ese antepasado.

Permite establecer definiciones del tipo:

- “El hombre está más relacionado con el perro que con el caracol”
- “El grupo formado por el hombre y el caracol comparten un ancestro común más reciente
con el caracol que con el helecho”

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- El hombre y el perro presentan pelos debido a que tal característica fue heredada de un
ancestro”
- El linaje que conduce al helecho divergió antes que el linaje del caracol divergiera de aquel
que conduce al hombre y el perro.
NO permite establecer definiciones del tipo:
- “El hombre es más evolucionado que el helecho”
- “El hombre y el perro descienden del caracol”

EVIDENCIA
Las características de las especies que pueden ser definidas en los organismos estudiados.
Como requisito tales estructuras deben ser heredables (estén definidos por el genotipo del
individuo y no sea variación debida al ambiente)
❖ Caracteres Morfológicos:
➢ Presencia / ausencia de estructuras
■ Presencia /ausencia de tejidos de conducción en plantas
■ Presencia /ausencia de flores
■ Presencia /ausencia de columna vertebral
■ Presencia /ausencia de cilias
➢ Variantes de las estructuras
■ Número
■ Forma
■ Color

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 ❖ Caracteres de comportamiento:
➢ Cuidado parental
➢ Sociabilidad
➢ Alimentación

❖ Caracteres moleculares (genéticos):

➢ Alineamiento de secuencias

MATRIZ DE DATOS PARA ANÁLISIS FILOGENÉTICOS

Sistematizar las observaciones para poder establecer la hipótesis filogenética que mejor
explique las observaciones.
Carácter: ​atributo de un organismo.
Estados del carácter: ​diferentes variantes que puede tomar el carácter.

Ejemplo:
Carácter 1:​ Forma cuerpo.
​ Estados​:​ largo
corto

Carácter 2:​ Color de la alas

​ Estados​: ​Amarillo
rojo

Carácter 3:​ Alas

​ Estados​: ​presente
ausente

Carácter 4:​ Pinzas

​Estados​:​ presente
ausente

Carácter 5: ​Posición nucleotídica (base) 245 en el gen rbcL

​ Estados​: ​Adenina (A)
Guanina (G)
Timina (T)
Citocina (C)

¿Para que puede resultar relevante los estudios filogenéticos?

● Establecer Clasificaciones Biológicas: consiste en el ordenamiento de la diversidad
biológica en grupos, son JERARQUICAS (grupos dentro de grupos).
● Sistematiza el conocimiento biológico y transmite la información biológica.

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SISTEMÁTICA FILOGENÉTICA: plantea que los grupos de las clasificaciones deben
corresponderse con grupos presentes en la filogenia.

❏ GRUPOS MONOFILÉTICOS: Son aquellos que incluyen a todos los descendientes

de un nodo. Pueden formar parte de clasificaciones para la sistemática filogenética.
❏ GRUPOS POLIFILÉTICOS: Grupo formado por terminales dispersos en el árbol.
No son grupos válidos en una clasificación para la sistemática filogenética.
❏ GRUPOS PARAFILÉTICOS: No incluye a todos los descendientes del nodo
compartidos por los integrantes del grupo. No son grupos válidos en una clasificación
para la sistemática filogenética.

¿Para qué sirve?

1. Establecer clasificaciones
2. Epidemiología
3. Estudios evolutivos: establecer cambios históricos que presentó un cierto carácter,
estados ancestrales para un caracter, relaciones entre huésped y parásito.

HIPÓTESIS FILOGENÉTICA
La hipótesis filogenética preferida no se obtiene automáticamente a partir de la evidencia
(caracteres). Es necesario seguir un procedimiento para ello. Estos procedimientos se
denominan métodos de reconstrucción filogenético. Cada método está basado en un criterio
diferente que surgen de concepciones epistemológicas diferentes

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 MÉTODOS FILOGENÉTICOS
❖ Parsimonia: Elige la hipótesis filogenética que puede explicar por ancestralidad
común la mayoría de las similitudes observadas.
➢ SIMILITUDES OBSERVADAS
➢ EXPLICAR POR ANCESTRALIDAD COMÚN:
■ Proviene de la teoría Darwiniana de Descendencia con modificación.
■ La explicación de la similitud que da una filogenia es la que se debe a
■
■ Gancestralidad común
Desde un punto de vista práctico elegir el árbol bajo el criterio de parsimonia se resumen en
calcular la cantidad de pasos de cada uno de los caracteres y se suman para calcular el
LARGO DEL ÀRBOL.
1. Dado un árbol se calcular el numero de pasos para cada carácter
2. Se suman los pasos de todos los caracteres. Esa suma será el largo del árbol
3. Aquel árbol con menor cantidad de pasos es el árbol ó los árboles Óptimos.
4. De la misma manera se calcula el largo para otros árboles. El árbol elegido por
parsimonia (la hipótesis preferida) es aquel que tenga el mínimo número de pasos.
5. Esta será la hipótesis que permitirá explicar por ancestralidad común la mayor
cantidad de similitudes.
6. Además ese árbol tendrá la menor cantidad de homoplasia, es decir tendrá la menor
cantidad de similitudes NO explicadas por ancestralidad común.

❖ Homoplasia:​ similitud no explicable como debido a ancestralidad común.

Que haya homoplasia en los caracteres quiere decir que existe evidencia contradictoria con
respecto a los agrupamientos. Es el criterio de parsimonia el que define entonces cual va a ser
el agrupamiento preferido en función de maximice la similitud explicable por ancestralidad
común. Cuando uno hace esto también está minimizando las homoplasias.

Búsquedas: ​Cuando en número de especies es muy pequeño, se pueden evaluar cada una de
las hipótesis (árboles). Sin embargo cuando el número de especies aumenta la cantidad de
árboles a evaluar puede ser enorme y la tarea se hace imposible.
❏ Nodo dicotómico: ​surgen dos ramas de un nodo.
❏ Nodo politómico: surgen tres o más ramas de un nodo. ocurre cuando no hay
información suficiente para definir las relaciones entre las especies del grupo

Métodos basados en Modelos Probabilísticos

➔ Análisis Bayesiano
➔ Distancia
➔ Máxima Verosimilitud: método que se basa en un modelo explícito de evolución.

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Elección de la hipótesis filogenética mediante Máxima Verosimilitud: elige el árbol que
(dado el modelo de evolución) haga más probables mis observaciones (los estados de carácter
para cada especie incluida en el análisis. El método NO elige el árbol más probable.
Al elegir un árbol bajo máxima verosimilitud también hay que hacer búsquedas filogenéticas
como en parsimonia pero solamente el criterio de elección no es parsimonia sino máxima
verosimilitud-
MODELOS: Estadística (Modelos evolutivos son modelos estocásticos ya que se basan en un
proceso estocástico como es la mutación )
Determinísticas
INFORMACIÓN Y CLASIFICACIÓN
El análisis filogenético no solo sirve para definir los grupos monofiléticos que podrán ser
grupos en una cierta clasificación, sino que también permite determinar las características que
definen a tales grupo.
❖ Sinapomorfías​: caracteres que son compartidos por los integrantes de un grupo
monofilético y que son derivados en el nodo ancestral del grupo en cuestión.
Ejemplo​: La presencia de pelos (estado 1) es una sinapomorfía del grupo Mamíferos
porque es un estado compartido y derivado (cambio en la rama que conduce al
ancestro de Mamíferos
Los mamíferos también comparten otras características como por ejemplo presentar
columna vertebral. Sin embargo esa característica no es derivada para el grupos sino
que es compartida con todos los vertebrados.
❖ Simplesiomorfías: características que son compartidas dentro de un grupo pero que
son primitivas (es decir no son derivadas).
Debido a que el concepto de “primitivo” o “derivado” se aplica tan solo a la condición que
está presente en un nodo del árbol. Está mal considerar que un estado es derivado o primitivo
si no se hace referencia a un determinado nodo.