UNIVERSIDAD NACIONAL DE COLOMBIA

SEDE MEDELLN
FACULTAD DE CIENCIAS
ESCUELA DE QUMICA

NOMENCLATURA Y CLASIFICACIN
DE ENZIMAS
Una aproximacin desde la Bioqumica

Por
Jorge Alberto Correa Quiroz

Medelln, mayo de 2012

ii

CONTENIDO
PRESENTACIN

iv

1.

EL NOMBRE Y EL CDIGO DE LAS ENZIMAS....

1.1
1.2
1.3

Nombre de las enzimas...

Clasificacin de las enzimas...
Cdigo numrico de las enzimas..

1
1
2

2.

LAS CLASES DE ENZIMAS..

2.1
xido-reductasas.
2.1.1 Deshidrogenasas...
2.1.2 Oxidasas.
2.1.3 Oxigenasas.
2.1.4 Peroxidasas
2.1.5 Reductasas.

6
6
6
7
8
9

2.2
Transferasas.
2.2.1 Fosfotransferasas..
2.2.2 Aminotransferasas...
2.2.3 Metiltransferasas..
2.2.4 Glicosiltransferasas..
2.2.5 Transcetolasas y transaldolasas.

10
10
11
11
12
12

2.3
Hidrolasas
2.3.1 Lipasas..
2.3.2 Glicosidasas..
2.3.3 Proteinasas
2.3.4 Fosfatasas..

13
13
14
15
16

2.4
Liasas
2.4.1 Descarboxilasas..
2.4.2 Deshidratasas..
2.4.3 Desaminasas
2.4.4 Carboxilasas que no requieren ATP

17
17
18
18
18

Isomerasas.
Racemasas...
Epimerasas..
Cis-trans isomerasas..

19
19
20
20

2.5
2.5.1
2.5.2
2.5.3

iii
2.5.4
2.5.5

Mutasas
Isomerasas de grupo funcional

20
21

2.6
2.6.1
2.6.2

Ligasas
Carboxilasas...
Sintetasas.

22
22
22

3.

LAS ENZIMAS DENOMINADAS SINTASAS.

24

3.1
3.2
3.3
3.4

xido-reductasas...
Transferasas
Hidrolasas
Liasas

24
24
25
25

4.

ENZIMAS CON ALGUNA PARTICULARIDAD.

27

4.1
xido-reductasas.
4.1.1 Enzima mlica...
4.1.2 Superxido dismutasa.
4.1.3 Nitrogenasa
4.1.4 Glutamato deshidrogenasa.
4.1.5 Desaturasas

27
27
27
27
28
28

4.2
Transferasas.
4.2.1 Piruvato, fosfato dikinasa...
4.2.2 Sacarosa fosforilasa..
4.2.3 Glucosa-1-fosfato, UTP, uridiltransferasa

29
29
29
30

4.3
Liasas.
4.3.1 Fosfoenolpiruvato carboxikinasa..
4.3.2 Aconitasa..

31
31
31

4.4
4.4.1
4.4.2
4.4.3
4.4.4
4.4.5

Complejo Piruvato Deshidrogenasa..

Piruvato deshidrogenasa..
Dihidrolipoil transacetilasa..
Dihidrolipoil deshidrogenasa..
Piruvato deshidrogenasa kinasa.
Piruvato deshidrogenasa fosfatasa.

32
32
33
33
34
34

5.

BIBLIOGRAFA

35

iv

PRESENTACIN

La Bioqumica, como tantas ramas de la ciencia, contiene una terminologa

muy especfica y particular, cuyo manejo y comprensin es absolutamente
indispensable para adentrarse en los laberintos propios del rea como tal. Un
entendimiento adecuado del nombre de las enzimas y de su significado
funcional y estructural, facilita enormemente el trasegar con xito por las
intrincadas rutas del metabolismo celular.

El propsito de este escrito es detallar hasta cierto lmite el tema del nombre y la
clasificacin de las enzimas, que no es lo suficientemente ilustrado en la
mayora de los textos de Bioqumica, haciendo nfasis en la relacin que
lgicamente debe existir entre el nombre, el cdigo numrico y la reaccin
qumica que cataliza. Subyace en el texto el conocimiento estructural que se
debe tener sobre una reaccin qumica para deducir correctamente el nombre y
la clasificacin primaria de la enzima que la cataliza.

Se inicia el escrito con una corta explicacin sobre la forma de construir el

nombre de una enzima, su clasificacin general, y el significado de las partes
del cdigo numrico, que se complementa con seis ejemplos de reacciones
qumicas. Se hace luego un breve pero preciso recorrido sobre las seis categoras
en las que se ubican las enzimas, ilustrndolo con reacciones propias y comunes
del metabolismo celular. Se contina con una alusin a una seudocategora de
enzimas denominadas sintasas, relacionando los principales ejemplos que se
mencionan normalmente en los cursos de Bioqumica. Al final se hace un
recorrido por una serie de enzimas, que adems de ser protagnicas en los
eventos celulares, se vuelven interesantes debido a alguna particularidad que
presentan en el nombre, o en la reaccin catalizada, o en su constitucin, o en la
aparente ambigedad de su clasificacin.

1. EL NOMBRE Y EL CDIGO DE LAS ENZIMAS

En 1964 la Comisin de Enzimas (E.C.) de la Unin Internacional de
Bioqumica y Biologa Molecular (IUBMB) organiz los nombres de las enzimas
y las clasific en seis clases, de tal forma que cada enzima debera quedar
completamente identificada con un nombre completo no ambiguo y con un
cdigo numrico de cuatro partes.

1.1

NOMBRE DE LAS ENZIMAS

En forma sistemtica el nombre de una enzima se construye con la siguiente

informacin:
-Nombre del sustrato (o sustratos).
-Nombre del cambio qumico que realiza la enzima sobre el sustrato.
-Sufijo asa.
-Ejemplo:

NADH

H+

ENZIMA

NAD+

CoQ

-Nombre de los sustratos:

NADH

CoQH2

Coenzima Q.

-Cambios qumicos que realiza la enzima: Oxida al NADH y reduce a la

coenzima Q.
-Nombre de la enzima:

NADH,

coenzima Q xido-reductasa.

1.2 CLASIFICACIN DE LAS ENZIMAS

De acuerdo a la accin qumica de las enzimas sobre los sustratos, aquellas se

clasifican en seis categoras o clases:
Clase 1: xido-reductasas.

2
Clase 2: Transferasas.
Clase 3: Hidrolasas.
Clase 4. Liasas.
Clase 5: Isomerasas.
Clase 6: Ligasas.
Cada clase se subdivide a su vez en subgrupos con el propsito de especificar
en forma inequvoca el tipo de enlace formado, o destruido o transformado, o
los grupos transferidos, o las sustancias dadoras y aceptoras de grupos o de
electrones, y las sustancias realmente implicadas.

1.3 CDIGO NUMRICO DE LAS ENZIMAS

Es una identificacin numrica derivada de la clasificacin, que contiene cuatro
partes separadas por puntos, as:
X. Y. Z. W
El significado de cada parte es el siguiente:

. Indica el cambio
X: Denota la clase a la cual pertenece la enzima.
qumico global que realiza la enzima sobre el sustrato.

Y: Denota la subclase a la cual pertenece la enzima. Indica un cambio

mas especfico en la transformacin del sustrato, como:
-El grupo funcional que se oxida o se reduce.
-El grupo funcional que se transfiere.
-El grupo funcional que se transforma.
-El enlace que se forma o se destruye.

Z: Denota la subsubclase a la cual pertenece la enzima. Indica mayor

especificidad de los cambios qumicos sealados por Y, como por
ejemplo detallar sobre cules tomos se realizan las oxidaciones o
las reducciones, o cules grupos reciben a los que se transfieren, o
cules grupos de tomos se eliminan o desprenden, o cules
enlaces se forman o se rompen.

W: Este ltimo nmero corresponde a la identificacin precisa de las

sustancias sobre las cules acta la enzima, y normalmente indica
el orden en el que cada enzima se va agregando a la lista.

Veamos algunos ejemplos especficos:

Enzima 1: Etanolamina amonio liasa (o desaminasa).

Reaccin que cataliza:

CH2
HO

ENZIMA

CH2
NH2

CH

CH2

NH3

HO

Cdigo E.C. (comisin de enzimas): 4. 3. 1. 7

Significado: La enzima es una liasa (clase 4), que rompe un enlace C-N
(subclase 3), para desprender amonaco (subsubclase 1), en un sustrato que se
llama etanolamina (nmero 7).

Enzima 2: Tripsina (enzima digestiva).

Reaccin que cataliza:

ENZIMA

NH CH C NH CH C
aa
bsico

Cdigo E.C: 3. 4. 21. 4

H2O

NH CH C O
aa
bsico

H3N CH C
R

4
Significado:
La enzima es una hidrolasa (clase 3), que rompe con agua un
enlace peptdico (subclase 4), usando para ello un residuo de serina en su centro
activo (subsubclase 21). Esta enzima es la cuarta (4) agregada a una lista de
proteinasas.

Enzima 3: Maleato, fumarato isomerasa.

Reaccin que cataliza:

COO

ENZIMA

HC
OOC

CH

HC

COO

OOC

MALEATO

Cdigo E.C:

CH

FUMARATO

5. 2. 1. 1

Significado:
La enzima es una isomerasa (clase 5), que interconvierte
ismeros cis-trans (subclase 2), formados a travs de un enlace C-C
(subsubclase 1), y especficamente en este par de sustratos (maleato y fumarato)
(nmero 1).

Enzima 4: Catalasa (perxido de hidrgeno peroxidasa).

Reaccin que cataliza:
ENZIMA

2H2O2

2H2O

O2

Cdigo E.C: 1. 11. 1. 6

Significado: Es una xido-reductasa (clase 1), que usa H2O2 como aceptor de
electrones (subclase 11), y como donador a otra molcula de H2O2 (subsubclase
1). Le toc el sexto lugar en la lista de enzimas.

Enzima 5:

Adenilato Kinasa (ATP, AMP, -fosfotransferasa).

Reaccin que cataliza:

ENZIMA

Cdigo E.C:

2ADP

ATP

AMP

2. 7. 4. 3

Significado:
Es una transferasa (clase 2), que traspone un grupo fosforilo
(subclase 7) desde un nucletido dador (ATP, GTP), hasta un sustrato receptor
que para recibirlo utiliza un grupo fosfato (subsubclase 4). El sustrato receptor
especfico es el grupo adenilato o AMP (nmero 3).

Enzima 6: Acetil CoA carboxilasa.

Reaccin que cataliza:

CH2 C

ENZIMA

CH3

SCoA

ACETIL CoA

Cdigo E.C:

CO2

O
ATP

ADP

Pi

SCoA

MALONIL CoA

6. 4. 1. 2

Significado:
Es una ligasa (clase 6), que forma un enlace C-C (subclase 4)
entre el sustrato y el CO2 (subsubclase 1). El sustrato especfico es el acetil CoA
(nmero 2).

6
2. LAS CLASES DE ENZIMAS
2.1 XIDO-REDUCTASAS
Son las enzimas encargadas de catalizar las reacciones celulares donde se
pierden y se ganan electrones. En la clasificacin de la IUBMB, la subclase
especifica los grupos que actan como donadores de electrones, y la
subsubclase precisa las molculas que los reciben.
En la literatura bioqumica es muy frecuente encontrar las siguientes xidoreductasas: deshidrogenasas, oxidasas, oxigenasas, peroxidasas y reductasas.
2.1.1 DESHIDROGENASAS: Oxidan a los sustratos sustrayendo protones y
electrones, que son recibidos por molculas como NAD+, NADP+ o FAD, que
actan como agentes oxidantes:

PO

GLC-6-P DESHIDROGENASA

PO

O
O

1.1.1.49

OH
GLUCOSA-6-P

NADP

NADPH

6-P-GLUCOLACTONA

Otras deshidrogenasas comunes son: etanol deshidrogenasa (1.1.1.1), lactato

deshidrogenasa (1.1.1.27), glicerol-3-fosfato deshidrogenasa (1.1.1.8), succinato
deshidrogenasa
(1.3.5.1),
6-fosfogluconato
deshidrogenasa
(1.1.1.x),
acetaldehdo deshidrogenasa (1.2.1.3).

2.1.2 OXIDASAS: Oxidan a los sustratos sustrayendo electrones y a veces

tambin protones, usando al oxgeno molecular (O2) como receptor de los
mismos:

2Fe2+ (cit. C)

2H+

1/2 O2

CIT.C OXIDASA

2Fe3+ (cit. C)

H2O (1.9.3.1)

COOH2O

H2N CH

COO-

ASPARTATO
OXIDASA

C O

CH2
COO

NH3 (1.4.3.1)

CH2
-

O2

H2O2

ASPARTATO

COOOAA

En este ltimo ejemplo la enzima, adems de realizar el cambio qumico

principal: extraer electrones y protones del enlace H2N CH, posibilita tambin
la adicin de H2O al doble enlace recin formado y la posterior eliminacin de
NH3 y formacin simultnea del grupo carbonilo.

2.1.3 OXIGENASAS: Oxidan a los sustratos, incorporando uno o dos tomos

de oxgeno en sus estructuras:
Dioxigenasas: Cuando los dos tomos del oxgeno molecular se incorporan al
sustrato:
CISTEAMINA

HS CH2 CH2 NH2

DIOXIGENASA

O S CH2 CH2 NH2 (1.13.11.19)

HO

O2

CISTEAMINA

HIPOTAURINA

CATECOL-1,2DIOXIGENASA

OH

(1.13.11.1)

COOH

OH
CATECOL

COOH

O2

CIS,CIS - MUCONATO

Monooxigenasas o Hidroxilasas: Cuando solamente uno de los dos oxgenos

del O2 se adiciona al sustrato. El otro formar H2O con los electrones y protones
que debe ceder otra molcula como NADH, NADPH, FADH2,
tetrahidrobiopterina, ascorbato.

8
Se les llama tambin oxidasas de funcin mixta porque oxidan a dos molculas
en forma ligeramente diferente: al sustrato principal le agregan un oxgeno, y al
otro sustrato le quitan electrones y protones:

FENILALANINA-4HIDROXILASA

CH2 CH COO-

CH2 CH COO-

HO

NH3

NH3
O2

PHE

TETRAHIDRO
BIOPTERINA

H2O

TYR

DIHIDRO
BIOPTERINA

(1.14.16.1)

4-HIDROXIFENILACETATO

HO

3-HIDROXILASA

CH2 COO-

CH2 COO-

HO
HO

NADH H

O2

H2 O

NAD

(1.14.13.2)

2.1.4 PEROXIDASAS:
Oxidan a los sustratos sustrayendo electrones y
protones, los cuales son recibidos por H2O2 (perxido de hidrgeno), que acta
como agente oxidante:

NADH

NADH
PEROXIDASA

H2O2

G S

G S

GLUTATION
REDUCIDO

NAD+

(1.11.1.1)

2H2O

GLUTATION
PEROXIDASA

G S
G S

H2O2

2H2O

GLUTATION
OXIDADO

(1.11.1.9)

Se denomina glutatin al tripptido -glutamil cisteinil glicina, un agente

antioxidante presente en plantas y animales.
Otro ejemplo es el de la catalasa, enzima que destruye el H2O2 producido por
algunas oxidasas:

CATALASA

H2O2

O2
H2 O2

(1.11.1.6)

2H2O

2.1.5 REDUCTASAS:
Son las enzimas encargadas de reducir a ciertos
sustratos, cedindoles electrones y protones a partir de un agente reductor
como el NADPH, o como los ditioles tioredoxina (una protena) y cido lipoico
(una coenzima). Algunos ejemplos importantes son:

NITRATO
REDUCTASA

NO3
NADPH

NADP

NO2

H2O

NITRITO
REDUCTASA

NH4OH

NO2
3NADPH
+
3H

3NADP

(1.6.6.2)

OH

(1.6.6.4)

10

BASE

PiPiO

NUCLESIDO DIFOSFATO
REDUCTASA

PiPiO

BASE

H2O
HO

OH

TIOREDOXINA TIOREDOXINA
HS

HN

CH COO-

SH

(1.17.4.1)

HO

D-PROLINA
REDUCTASA

CH2 CH2 CH2 CH2 COO

(1.4.4.1)

NH2
SH

SH
CH2

COO
4

S
CH2

COO
4

2.2 TRANSFERASAS

Son las enzimas que catalizan aquellas reacciones celulares donde un grupo de
tomos se transfiere de un sustrato a otro. La subclase especifica los grupos que
se transfieren (metilos, formilos, carboxilos, acilos, glicosilos, alquilos, arilos,
grupos nitrogenados, fosforilos, que contienen azufre); la subsubclase detalla
aspectos de esos grupos como el tamao, la constitucin ms especfica y los
grupos que actan como receptores.
Las transferasas comunes son: las fosfotransferasas, las aminotransferasas, las
metiltransferasas, las glicosiltransferasas, las transcetolasas y las transaldolasas.
2.2.1 FOSFOTRANSFERASAS:
Comnmente denominadas kinasas.
2Transfieren el grupo fosforilo (-PO3 ) desde un nucletido como ATP, GTP,
UTP, hasta un grupo receptor que puede ser un hidroxilo (HO-), un carboxilo (COO-), un fosfato (-OPO32-) o un grupo amino (-NH2):

11

COO-

COO-

CREATINA
KINASA

CH2

CH2

ATP

ADP

NH2

H2N

(2.7.3.2)

H3C N

H3C N

H2N

NH P O

OCREATINA

P-CREATINA

COO- O
C O P O

COO-

PIRUVATO
KINASA

C O

CH3

CH2

(2.7.1.40)

ADP

ATP

PEP

PIRUVATO

Otras kinasas de comn ocurrencia son: arginina kinasa (2.7.3.3), fructokinasa

(2.7.1.4), fosfofructokinasa-1 (2.7.1.11), fosfofructokinasa-2 (2.7.1.105),
glucokinasa (2.7.1.2), hexokinasa (2.7.1.1), galactokinasa (2.7.1.6), glicerol kinasa
(2.7.1.30), glicerato kinasa (2.7.1.31).

2.2.2 AMINOTRANSFERASAS:
Llamadas tambin transaminasas.
Transfieren el grupo amino (-NH2) desde un -aminocido dador hasta un cetocido receptor. Estas enzimas requieren para su funcin cataltica el
concurso de la coenzima piridoxal fosfato (PLP):

O
H2N

C COOH
CH COOH
CH3
ALA

CH2
CH2
COOalfa KG

ALA, alfa-KG
AMINOTRANSFERASA

(2.6.1.2)

H2N

O
C COOH
CH3
PIRUVATO

CH COOH
CH2
CH2
COOGLUTAMATO

2.2.3 METILTRANSFERASAS:
Transfieren el grupo metilo (-CH3) entre
sustratos, soportado normalmente por la coenzima tetrahidrofolato (THF):

12

H2N CH COOH

SERINA HIDROXIMETIL
TRANSFERASA

CH2

H2N CH2 COOH

(2.1.2.1)

H2O

GLICINA

OH

THF

THF

CH2

SERINA

2.2.4 GLICOSILTRANSFERASAS:
pentosas entre diferentes sustratos:

O
HO

GLUCGENO
UDP-GLUCOSA
GLUCOSILTRANSFERASA

O
O

Transfieren residuos de hexosas o

O
UDP

HO

GLUCGENO (n)

HO

O UDP

GLUCGENO (n+1)

Esta enzima se conoce con el nombre comn de glucgeno sintasa y

corresponde al cdigo EC 2.4.1.11.

2.2.5 TRANSCETOLASAS Y TRANSALDOLASAS: Son enzimas que se

encuentran preferencialmente en la Ruta de las Pentosas (ambas) y en el Ciclo
de Calvin-Benson (slo la transcetolasa). Transfieren respectivamente el grupo
cetol y el grupo -hidroxicetol:

C CH2OH

CH C CH2OH

OH O

GRUPO CETOL

GRUPO alfa-HIDROXICETOL

Dos ejemplos comparativos son los siguientes:

13

CH2OH
C

CH2OH

O CH

O CH

TRANSCETOLASA

(2.2.1.1)
CH2OP

CH2OP

G-3-P

XILULOSA-5-P

CH2OP

CH2OP
RIBOSA-5-P

SEDO
HEPTULOSA-7-P

CH2OH
C

CH2OH

C
HC

HC

TRANSALDOLASA

(2.2.1.2)

CH2OP

CH2OP

G-3-P

CH2OP

CH2OP

ERITROSA-4-P

FRUCTOSA-6-P
SEDO
HEPTULOSA-7-P

2.3

HIDROLASAS

Son las enzimas que realizan la ruptura de un gran nmero de biomolculas

usando como cosustrato a la molcula de H2O. La subclase especifica el tipo de
enlace que se rompe (ster, ter, glicosdico, peptdico), y la subsubclase indica
los tomos involucrados en esos enlaces.
Las hidrolasas ms comunes incluyen a las lipasas, las glicosidasas, las
proteinasas y las fosfatasas.
2.3.1 LIPASAS:
Son las enzimas que actan sobre los lpidos, hidrolizando
enlaces tipo ster. Realmente son esterasas:

14
O
O

TRIACILGLICEROL
LIPASA

CH2O C R

R C OCH

CH2OH
H OCH

CH2O C R

CH2OH

O
3 H2 O

3 R

(3.1.1.3)

Existen lipasas sublinguales, gstricas y pancreticas.

2.3.2 GLICOSIDASAS:
Hidrolizan los enlaces glicosdicos de los
carbohidratos. Dependiendo del sustrato especfico, toman diferentes nombres:
-Amilasa (3.2.1.1): Rompe los enlaces -1,4 internos del almidn y el
glucgeno, liberando glucosa, maltosa y maltotriosa.
-Amilasa (3.2.1.2): Rompe los penltimos enlaces -1,4 del almidn y le
glucgeno, iniciando por el extremo no reductor. Libera unidades de -maltosa.
Sacarasa o Invertasa (3.2.1.26):
Rompe el enlace 1 - 2 de la sacarosa,
liberando D-glucopiranosa y D-fructofuranosa. Se puede considerar como una
-D-fructofuranosidasa o como una -D-glucopiranosidasa.
Celulasa (3.2.1.4):
Rompe los enlaces -1,4 de la celulosa, liberando Dglucopiranosa. Realmente es una -D-glucohidrolasa o -D glucopiranosidasa.
Lactasa (3.2.1.108):
Rompe el enlace -1,4 de la lactosa, liberando Dgalactopiranosa y D-glucopiranosa. Se puede considerar como una -Dgalactohidrolasa:

O
O

LACTOSA

LACTASA

H2O

(3.2.1.108)
alfa-D-GALACTO
PIRANOSA

alfa-D-GLUCO
PIRANOSA

15
2.3.3 PROTEINASAS:
Llamadas tambin enzimas proteolticas. Cuando
actan sobre pptidos se denominan peptidasas. Todas ellas hidrolizan los
enlaces peptdicos que existen en estas biomolculas. Son comunes las
siguientes proteinasas:
Pepsina (3.4.23.1): Es una enzima digestiva que acta en el estmago,
hidrolizando enlaces peptdicos cuyos extremos amino pertenecen a restos de
aminocidos aromticos.
Tripsina (3.4.21.4):
Enzima digestiva que acta en el intestino delgado,
hidrolizando enlaces peptdicos cuyos extremos carboxilo pertenecen a restos
de aminocidos bsicos.
Quimotripsina (3.4.21.1): Enzima digestiva que acta en el intestino delgado,
hidrolizando enlaces peptdicos cuyos extremos carboxilo pertenecen a restos
de aminocidos aromticos.
Elastasa (3.4.21.36):
Enzima digestiva que acta en el intestino delgado,
hidrolizando enlaces peptdicos cuyos extremos carboxilo pertenecen a restos
de aminocidos pequeos (alanina, glicina, serina, cistena).
Enteropeptidasa (3.4.21.9): Se conoce tambin con el nombre de enterokinasa.
Es una enzima digestiva que secreta la mucosa intestinal con el fin de hidrolizar
el tripsingeno y generar la tripsina.
Renina (3.4.23.15):
Peptidasa producida por el rin que contribuye a
aumentar la presin arterial. Acta sobre el pptido angiotensingeno,
generando angiotensina I.
Trombina (3.4.21.5): Se denomina tambin fibrinogenasa porque acta sobre
la preprotena fibringeno, inductora del proceso de coagulacin de la sangre.
Insulisina (3.4.24.56): Es una peptidasa que acta que acta sobre la hormona
insulina y sobre el tripptido glucagn, degradndolos. Tambin se conoce con
el nombre de insulinasa:

COO

H
N

O
O

H 3N
O

CH2

N
H

COO

INSULISINA

(3.4.24.56)
O

H 3N
O

CH2

H 3N

SH

SH
GLUTATIN

H3N

2 H 2O

GLICINA

GLUTAMATO
CISTENA

16

2.3.4 FOSFATASAS:
Son las enzimas que rompen hidrolticamente los enlaces
fosfoster y fosfoanhdridos:
Ruptura de un enlace fosfoster:

PO

FRU-1,6-BP
HIDROLASA

OP

PO

OH

(3.1.3.11)
H2O

Pi

FRU-1,6-BP

FRU-6-P

Esta enzima se conoce normalmente con el nombre de fructosa-1,6-bifosfatasa.

Otras fosfatasas de esta subclase son: glucosa-6-fosfatasa (3.1.3.9) y fructosa-2,6bifosfatasa (3.1.3.46).

Ruptura de enlaces fosfoanhdridos:

O P O P OH
O

PIROFOSFATASA
INORGNICA

H2O

2 O P OH
O

PIROFOSFATO

ATP

(3.6.1.1)

H2O

FOSFATO

ATP

asa

ADP

Pi

H+

(3.6.1.36)

17

2.4 LIASAS

Son las enzimas que causan rupturas no oxidativas, no reductivas y no

hidrolticas en las molculas. Tales rupturas ocasionan normalmente la salida
de otra molcula como CO2, H2O, NH3, SH2, R-NH2 y OHC-COOH. La subclase
indica el tipo de enlace que se rompe (C-C, C-O, C-N, C-S), y la subsubclase
especifica el grupo funcional implicado en el enlace (carboxi, aldehdo, cetona,
etc.).
Las liasas mas comunes son: descarboxilasas (carboxi-liasas), deshidratasas
(hidro-liasas), desaminasas (amonio-liasas), y las carboxilasas que no requieren
ATP.
2.4.1 DESCARBOXILASAS:
Se agrupan aqu las enzimas que separan la
molcula de CO2 de un sustrato, generalmente cuando ste es un o un cetocido:
Descarboxilacin en un -cetocido. Requiere el concurso de la coenzima
tiamina pirofosfato (TPP):

COOC O

PIRUVATO
DESCARBOXILASA

C O
(4.1.1.1)

CH3

H
CO2

CH3
ACETALDEHDO

PIRUVATO

Descarboxilacin en un -cetocido. No requiere ninguna coenzima:

COOCH2
C O
CH3
OXALOACETATO

H+

ACETOACETATO
DESCARBOXILASA

(4.1.1.4)

CH3
C O
CH3
PIRUVATO

CO2

18

2.4.2 DESHIDRATASAS:
Son las liasas que al romper un sustrato eliminan
o sustraen una molcula de H2O, generando un doble enlace en aquel. Pueden
catalizar tambin la reaccin inversa, es decir, la hidratacin:

COO-

2-P-GLICERATO
DESHIDRATASA

COO-

H2O

C OP

CH OP
(enolasa)

CH2 OH

(4.2.1.11)

CH2
PEP

2-P-GLICERATO

2.4.3 DESAMINASAS:
Enzimas que al rompen los sustratos aminados,
eliminan NH3 y forman un doble enlace. Estas enzimas normalmente no
pueden catalizar la reaccin inversa, es decir, la adicin de NH3:

CH2 CH COO
NH3

FENILALANINA
AMONIOLIASA

CH CH COO

(4.3.1.5)

trans

FENILALANINA

NH3

CINAMATO

2.4.4 CARBOXILASAS QUE NO REQUIEREN ATP:

Son enzimas que
adicionan CO2 a un sustrato sin gastar energa de un nucletido (ATP, GTP),
porque el mismo sustrato u otra especie provee la energa para la carboxilacin.
Estas enzimas se clasifican como liasas porque al funcionar en sentido inverso,
implican realmente una ruptura de una molcula. Los ejemplos ms notorios
son la fosfoenolpiruvato carboxilasa y la fosfoenolpiruvato carboxikinasa
(PEPCK):

COO-

COOC OP
CH2
PEP

CO2

H2O

PEPCARBOXILASA

(4.1.1.31)

C O
CH2
COOOAA

Pi

19

COO-

COO

CO2

C OP

PEPCK

C O

(4.1.1.32)

CH2

GDP

CH2

GTP

COO-

PEP

OAA

Dos liasas importantes son: citrato liasa (4.1.3.8), que hace parte del sistema
lanzadera del citrato, e isocitrato liasa (4.1.3.1), que participa en el ciclo del
glioxilato.

2.5

ISOMERASAS

Comprende las enzimas encargadas de catalizar conversiones entre los

diferentes tipos de ismeros: estructurales, geomtricos y pticos. La subclase
indica el tipo de isomera implicada (ptica, cis-trans, de grupo funcional, de
posicin), y la subsubclase especifica el grupo funcional sobre el cual se acta, o
el que se convierte o se transpone.
Entre las isomerasas mas frecuentes estn las racemasas, las epimerasas, las
mutasas, las cis-trans isomerasas y las isomerasas de grupo funcional.
2.5.1 RACEMASAS: Estas enzimas catalizan la interconversin de un par de
enantimeros (ismeros pticos que son imgenes especulares entre s):

COOH
H2N

ASPARTATO
RACEMASA

COOH
H

NH2

CH2

CH2

COOH

COOH

L-ASPARTATO

D-ASPARTATO

(5.1.1.13)

20

Otras racemasas son: Alanina racemasa (5.1.1.1), glutamato racemasa (5.1.1.3) y

fenilalanina racemasa (5.1.1.11).

2.5.2 EPIMERASAS:
Catalizan la conversin entre epmeros (diastermeros
que se diferencian en la configuracin de uno de sus centros quirales):

CH2OH
C

RIBULOSA-5-P
3-EPIMERASA

CH2OH
C

(5.1.3.1)
CH2OP

CH2OP

D-RIBULOSA-5-P

D-XILULOSA-5-P

Otras epimerasas son: Metil malonil CoA epimerasa (5.1.99.1), 3-hidroxibutiril

CoA epimerasa (5.1.2.3), UDP-glucosa epimerasa (5.1.3.2) y L-ribulosa-5-p-4epimerasa (5.1.3.4).

2.5.3 CIS-TRANS ISOMERASAS: Catalizan la interconversin de un par de

ismeros geomtricos:

COOCH
OOC

MALEATO FUMARATO
ISOMERASA

CH
COO

MALEATO

CH

CH

(5.2.1.1)

OOC
FUMARATO

Otra cis-trans isomerasa es la maleil piruvato isomerasa con el cdigo E.C

5.2.1.4.

2.5.4 MUTASAS:
Catalizan la conversin entre un par de ismeros
estructurales de posicin:

21

COO-

FOSFOGLICERATO
MUTASA

COO-

CHOH

CHOP

CH2OP

CH2OH

3-P-GLICERATO

(5.4.2.1)

2-P-GLICERATO

Otras mutasas son: Fosfoglucomutasa (5.4.2.2), lisina-2,3-amino mutasa (5.4.3.2)

y -lisina-5,6-amino mutasa (5.4.3.3).

2.5.5
ISOMERASAS DE GRUPO FUNCIONAL:
Catalizan la
interconversin de un par de ismeros estructurales de grupo funcional. Las
ms comunes interconvierten los grupos aldehdo y cetona:

H C O

TRIOSA FOSFATO
ISOMERASA

CH2OH

CHOH

C O

CH2OP

CH2OP

GLICERALDEHDO
3-FOSFATO

(5.3.1.1)

DIHIDROXIACETONA
FOSFATO

Otras isomerasas de esta subclase son: la fosfoglucoisomerasa, tambin

conocida como fosfohexoisomerasa, cuyo cdigo E.C es 5.3.1.9, la
fosfomanoisomerasa con el cdigo 5.3.1.8 y la ribosa-5-fosfato isomerasa,
conocida como fosforiboisomerasa, que tiene el cdigo 5.3.1.6.
En esta subclase tambin se ubican las tautomerasas, encargadas de
interconvertir grupos enoles y cetnicos, como la dopacromo tautomerasa
(5.3.2.3), que acta sobre el cido 5,6-dihidroxiindol-2-carboxlico, o
simplemente dopacromo.

22

2.6

LIGASAS

Se agrupan aqu las enzimas que catalizan la formacin de nuevas sustancias,

ya sea agregando a un sustrato grupos como CO2, NH3, HSCoA, o condensando
varias sustancias para generar otra diferente. Tales sntesis y condensaciones
requieren el consumo de energa, expresamente contenida en un nucletido
como ATP y GTP. La subclase indica el enlace nuevo que se forma (C-O, C-S,
C-N, C-C), y la subsubclase especifica los grupos que contienen a esos enlaces:
ster, tioster, amino, amido, etc.
Las ligasas ms frecuentes son las carboxilasas y las sintetasas.

2.6.1 CARBOXILASAS:
Son las enzimas que adicionan CO2 a un sustrato,
pero a diferencia de las descritas en la seccin de las liasas, stas si requieren
energa proveniente de un nucletido:

COO-

COO-

PIRUVATO
CARBOXILASA

C O

CO2

C O

(6.4.1.1)

CH2

CH3
ADP + Pi

ATP + H2O

PIRUVATO

COOOAA

Otras carboxilasas son: Acetil CoA carboxilasa (6.4.1.2) y propionil CoA

carboxilasa (6.4.1.3).

2.6.2 SINTETASAS:
Condensan varios sustratos para formar o sintetizar
diversas molculas como: acil CoA, aminocidos, pptidos, polinucletidos:
Formacin de acetil CoA:

O
CH3 C OH

HSCoA

ACETIL CoA
SINTETASA

ATP

AMP + PPi

O
CH3 C SCoA

(6.2.1.1)

23

Formacin de glutamina:

COOH

COOH
H2N CH
CH2

NH3

GLUTAMINA
SINTETASA

H2N CH
CH2

(6.3.1.2)

CH2

CH2

ATP

ADP + Pi

COOH

GLUTAMATO

NH2

GLUTAMINA

Esta enzima tambin se conoce con el nombre de glutamato, amonio ligasa.

Formacin de un pptido:

CH3
CH
COOH

H2N

CH3
D-ALANIL ALANINA
SINTETASA

CH
H2 N

CH3
CH
H2 N

ATP
COOH

ADP + Pi

O
C

NH
C

CH

CH3

OH

(6.3.2.4)

D-ALANIL ALANINA

Esta enzima se puede llamar tambin D-alanina, D-alanina ligasa.

Otras sintetasas son: asparagina sintetasa (6.3.5.4), succinil CoA sintetasa
(6.2.1.4), carbamoil fosfato sintetasa I (6.3.4.16).

24

3. LAS ENZIMAS DENOMINADAS SINTASAS

Las sintasas no constituyen una categora o clase como tal; es un trmino que se
aplica genricamente a una serie de enzimas, cuyas actividades se concretan en
catalizar la sntesis o formacin de una sustancia sin requerir la energa de
hidrlisis de un nucletido.
Cada sintasa se ubicar en la clase o categora que se derive de su actividad
enzimtica especfica.
3.1 XIDO-REDUCTASAS
Algunas sintasas son oxido-reductasas como las siguientes:
-xido ntrico (NO) sintasa: 1.14.13.39
-Glutamato sintasa: 1.4.1.13
-Piruvato sintasa: 1.2.7.1, que cataliza la siguiente reaccin:

O
CH3 C SCoA

CO2

PIRUVATO
SINTASA

O
CH3 C COO

HSCoA

FERREDOXINA FERREDOXINA
REDUCIDA
OXIDADA

3.2 TRANSFERASAS
Otras sintasas se ubican en la clase de las transferasas:
-Timidilato sintasa: 2.1.1.45
-Almidn (glucgeno) sintasa: 2.4.1.11
-Celulosa sintasa: 2.4.1.12
-Sacarosa-6-fosfato sintasa: 2.4.1.xx
-Dihidroxiacetona sintasa: 2.2.1.3
-Lactosa sintasa: 2.4.1.22, que cataliza la siguiente reaccin:

(1.2.7.1)

25

LACTOSA
SINTASA

(2.4.1.22)

O UDP
UDP-GALACTOSA

UDP

GLUCOSA

LACTOSA

Esta enzima es realmente una galactosil transferasa.

3.3 HIDROLASAS
Tambin existen sintasas que son hidrolasas como la ATP-sintasa (o ATP-asa),
cuyo cdigo E.C es 3.6.1.36, y que cataliza en ambos sentidos la siguiente
reaccin:

ATP

H2O

ATP SINTASA

ADP

H+

Pi

(3.6.1.36)

3.4 LIASAS
Y otras sintasas pertenecen a la clase de las liasas como:
-Malato sintasa: 4.1.3.2
-Citrato sintasa: 4.1.3.7
-2-Acetolactato sintasa: 4.1.3.18
Para las dos ltimas enzimas, estas son las reacciones que catalizan:

C COO

H2C COO

OXALOACETATO

H2C COO-

CITRATO
SINTASA

CH3 C SCoA

HO C COO
H2C COO

H2 O

HSCoA
CITRATO

(4.1.3.7)

26

COOO C

O
OOC C CH3

(4.1.3.18)

CH3
PIRUVATO

2-ACETOLACTATO
SINTASA

PIRUVATO

COO- O
HO C

C CH3

CO2

CH3
2-ACETOLACTATO

Esta enzima tambin podra llamarse 2- acetolactato carboxilasa.

Sobre las dos carboxilasas que no requieren ATP descritas en el apartado de las
liasas (fosfoenolpiruvato carboxilasa y fosfoenolpiruvato carboxikinasa),
realmente podran ser dos sintasas, que no se denominan as porque tendran el
mismo nombre: oxaloacetato sintasa, y no habra forma de diferenciarlas.

27

4. ENZIMAS CON ALGUNA PARTICULARIDAD

4.1 XIDO-REDUCTASAS
4.1.1 ENZIMA MLICA (1.1.1.39). Enzima ubicua que en los vegetales
participa en la va C4 de la fotosntesis, y en los animales hace parte del sistema
de la lanzadera del citrato que impulsa la sntesis de cidos grasos en el
citoplasma. Cataliza la siguiente reaccin:

COOENZIMA MLICA

HO CH

C O

CH2
COO-

COO-

NADP+

NADPH + H+

CO2

(1.1.1.39)

CH3
PIRUVATO

L-.MALATO

Es una enzima que oxida y descarboxila a la vez sin requerir el concurso de la

coenzima tiamina pirofosfato (TPP). Es una xido-reductasa.

4.1.2. SUPERXIDO DISMUTASA (1.15.1.1). Es una xido-reductasa de

amplia distribucin que se encarga de destruir los agresivos radicales aninicos
llamados superxidos, que se pueden generar en la fase final de la cadena
respiratoria. La reaccin implicada es la siguiente:

2 O2

2H

SUPERXIDO
DISMUTASA

O2

H2O2

(1.15.1.1)

Los radicales superxidos son convertidos en perxido de hidrgeno (H2O2),

sustancia destruida luego por las peroxidasas, y especficamente por la catalasa.

4.1.3 NITROGENASA (1.18.6.1). Es una xido-reductasa presente en ciertas

especies de bacterias (bacterias fijadoras de nitrgeno), que cataliza la reduccin
del N2 atmosfrico en amonaco (NH3), usando como agente reductor a la

28

protena ferredoxina (Fe2+), y consumiendo una considerable cantidad de

energa en forma de ATP:

6 H+

N2

NITROGENASA

2 NH3

6 Fe2+ 12 ATP

12 ADP

(1.18.6.1)

6 Fe3+

12 Pi

Aunque podra considerarse como una sintetasa, prevaleci la variacin de los

estados de oxidacin de las especies para ubicarla como una xido-reductasa.

4.1.4 GLUTAMATO DESHIDROGENASA.

Es una xido-reductasa de
amplia distribucin que participa activamente en la biosntesis y degradacin
de los aminocidos. Cataliza en ambos sentidos la siguiente reaccin:

COO-

COOGLUTAMATO
DESHIDROGENASA

H2N CH
H2O

CH2
CH2
-

COO

GLUTAMATO

C O
CH2

NAD(P)+

NH3

CH2
NAD(P)H
H+

COOalfa-CETOGLUTARATO

Existen tres formas isoenzimticas, con el mismo nombre pero con diferente
cdigo:
1.4.1.2: Utiliza nicamente NAD+ como agente oxidante.
1.4.1.4: Utiliza nicamente NADP+ como agente oxidante.
1.4.1.3: Puede usar cualquiera de las dos especies como agente oxidante.

4.1.5 DESATURASAS. Son xido-reductasas de amplia distribucin que

catalizan la formacin de dobles enlaces CIS en los cidos grasos. Un ejemplo es

29

la 9 Estearoil CoA Desaturasa, cuyo cdigo E.C es 1.14.99.5, y que sintetiza

oleoil CoA de acuerdo a la siguiente reaccin:

9 ESTEAROIL CoA
DESATURASA

10

SCoA

SCoA

ESTEAROIL CoA

OLEOIL CoA
O2

2 H2O

NAD(P)H
H+

(1.14.99.5)

NAD(P)+

Estas enzimas usan un agente oxidante y dos agentes reductores. El oxgeno

molecular (O2) oxida tanto al sustrato principal como al NAD(P)H.

4.2 TRANSFERASAS

4.2.1 PIRUVATO, FOSFATO DIKINASA (2.7.9.1). Enzima vegetal que

participa activamente en la va C4 de la fotosntesis. Cataliza esta reaccin:

COOC O

Pi

PIRUVATO, FOSFATO
DIKINASA

C OP

PPi

(2.7.9.1)

CH2

CH3
PIRUVATO

COO-

ATP

AMP

PEP

Es una enzima que transfiere dos grupos fosforilos desde el ATP hacia dos
receptores: piruvato y fosfato. Por ello se llama dikinasa.

4.2.2 SACAROSA FOSFORILASA (2.4.1.7). Es una glucosil transferasa usada

por plantas y bacterias para metabolizar sacarosa y obtener fructosa libre:

30

O
SACAROSA
FOSFORILASA

(2.4.1.7)

O P O

OO
GLUCOSA-1-FOSFATO

HO P O

SACAROSA

FRUCTOSA

O-

Aparentemente esta enzima se podra mirar como una liasa que usa el dianin
fosfato para romper la molcula de sacarosa, pero su cdigo numrico la ubica
en la clase de las transferasas, indicando que el cambio qumico es en forma
preferencial una transferencia del radical glucosilo desde la molcula de
sacarosa hasta el dianin fosfato.
Otras transferasa de este tipo son:
-Glucgeno (o almidn) fosforilasa: 2.4.1.1
-Glucogenina, glucosil transferasa: 2.4.1.186

4.2.3 GLUCOSA-1-FOSFATO, UTP, URIDILTRANSFERASA (2.7.7.9). Es

una transferasa usada por plantas, animales y microorganismos para activar la
glucosa que se emplea en la biosntesis de sacarosa, lactosa y glucgeno.
Cataliza la siguiente reaccin:

GLUCOSA-1-FOSFATO,UDP,
URIDILTRANSFERASA

O P O P O

O P O

OGLUCOSA-1-FOSFATO

NH
O

UTP

O P O P OH
O-

O-

O-

UDP-GLUCOSA

O-

(2.7.7.9)

La molcula de UDP-glucosa formada es el punto de partida para la sntesis de

lactosa, sacarosa, almidn, glucgeno y hasta celulosa.

31

Lo particular de esta enzima es que en la mayora de los textos se conoce con el

nombre de UDP-glucosa pirofosforilasa, sencillamente porque la reaccin
inversa es como una ruptura de UDP-glucosa con el in pirofosfato, ubicndola
errneamente en la clase de las liasas. El cdigo E.C de la enzima indica que es
una transferasa, trasponiendo el radical uridilo desde el UTP hasta glucosa-1fosfato.
Otras enzimas similares son: galactosa-1-fosfato, UTP, uridiltransferasa
(2.7.7.10), conocida con el nombre de UDP-galactosa pirofosforilasa, y
galactosa-1-fosfato, UDP-glucosa, uridiltransferasa, conocida simplemente
como uridiltransferasa, y que tiene una funcin central en el catabolismo de la
galactosa.

4.3 LIASAS

4.3.1 FOSFOENOLPIRUVATO CARBOXIKINASA (PEPCK) (4.1.1.32).

Enzima esencial en la ruta gluconeognica. Cataliza la siguiente reaccin:

COO-

COO-

C O

PEPCK

C OP

CH2
COOOAA

GTP

GDP

CO2

(4.1.1.32)

CH2
PEP

Aunque es una liasa en la direccin como normalmente ocurre porque

descarboxila, tambin cumple la funcin cataltica de transferir un grupo
fosforilo desde el GTP. En sentido inverso se aprecia como una carboxilasa, y en
sentido directo como una kinasa; de ah el nombre que tiene.

4.3.2 ACONITASA (4.2.1.3). Es una liasa del Ciclo del cido Ctrico que
cataliza en los dos sentidos la siguiente reaccin:

32

H2C COO-

ACONITASA

H2C COO-

HO C COO

H C COO

H2C COO

HO HC COO

CITRATO

(4.2.1.3)

ISOCITRATO

Aunque interconvierte un par de ismeros estructurales de posicin, no es una

isomerasa porque su mecanismo de accin incluye una deshidratacin del
citrato, y luego una hidratacin estereoselectiva del producto anterior (cisaconitato).

4.4 COMPLEJO PIRUVATO DESHIDROGENASA

Es un conjunto de enzimas y coenzimas que cataliza y regula un paso
estratgico en la oxidacin aerbica de carbohidratos y algunos aminocidos,
como es la conversin de piruvato en acetil coenzima A:

COMPLEJO PIRUVATO
DESHIDROGENASA

O
CH3 C COO

PIRUVATO

HSCoA
NAD+

NADH + H+

O
CH3 C SCoA

CO2

ACETIL CoA

Este complejo comprende tres enzimas catalticas y dos enzimas reguladoras,

que son las siguientes:
4.4.1 PIRUVATO DESHIDROGENASA (1.2.4.1): Es una xido-reductasa que
posibilita la descarboxilacin del piruvato con el concurso de la coenzima TPP.
Esta enzima provoca que el grupo acetilo quede unido temporalmente a otra
coenzima denominada cido lipoico (o lipoamida cuando est unida a la
respectiva enzima):

33

O
CH3

S
COO

PIRUVATO
DESHIDROGENASA

CH2 CO2H
4

CH3

C S

SH

(1.2.4.1)

CH2 CO2H
4
CO2

CIDO LIPOICO

CIDO ACETIL
DIHIDROLIPOICO

4.4.2 DIHIDROLIPOIL TRANSACETILASA (2.3.1.12): Es una transferasa

que posibilita el traspaso del grupo acetilo desde el cido hidrolipoico hasta la
coenzima A:

O
CH3

C S

SH
CH2 CO2H
4

DIHIDROLIPOIL
TRANSACETILASA

SH

HS

CH2 CO2H
4
O

CIDO
S-ACETIL DIHIDROLIPOICO

HSCoA

CH3

(2.3.1.12)

CIDO
DIHIDROLIPOICO

SCoA

4.4.3 DIHIDROLIPOIL DESHIDROGENASA (1.8.1.4):

Es una xidoreductasa que regenera la forma oxidada del cido lipoico, para que ste pueda
intervenir en otro ciclo del complejo piruvato deshidrogenasa:

HS

DIHIDROLIPOIL
DESHIDROGENASA

SH
CH2 CO2H
4

CIDO DIHIDROLIPOICO

S
CH2 CO2H
4

NAD+

NADH + H+

CIDO LIPOICO

(1.8.1.4)

34

4.4.4 PIRUVATO DESHIDROGENASA KINASA (2.7.1.99): Es una enzima

reguladora del complejo, que lo inactiva al fosforilar con ATP la primera
enzima del mismo, es decir, a la piruvato deshidrogenasa. Es una
fosfotransferasa.

4.4.5 PIRUVATO DESHIDROGENASA FOSFATASA (3.1.3.43): Es la otra

enzima reguladora que activa el complejo, hidrolizando el enlace fosfoster
formado por la kinasa. Pertenece a la clase de las hidrolasas.

35

BIBLIOGRAFA

DEVLIN, Thomas M. BIOQUMICA. Tercera Edicin. Editorial Revert, S. A.

1999.
HELDT, Hans-Walter. PLANT BIOCHEMISTRY. Tercera Edicin. Elsevier
Academic Press. 2005.
HORTON, H. Robert; MORAN, Laurence A. y otros. PRINCIPIOS DE
BIOQUMICA. Cuarta edicin. Pearson Educacin. 2008.
PURICH, Daniel L. y ALLISON, R. Donald. HANDBOOK OF BIOCHEMICAL
KINETICS. Academic Press. 2000.