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QUIMIOLITOTROFIA
Se puede definir el quimiolitotrofismo como el sistema metablico que genera energa a
partir de la oxidacin de compuestos inorgnicos. Esta definicin no afecta ni al tipo e
sustrato utilizado como fuente de carbono ni al hecho de que alternativa, simultanea o
secuencialmente se obtenga energa a partir de compuestos orgnicos. En cualquier
caso, podemos decir que una bacteria es quimioolitotrofa cuando esta es capaz en un
momento dado, de obtener toda la energa necesaria para el crecimiento a partir de la
oxidacin de compuestos minerales.
Quimiolitotrfica: la energa para mantenimiento y crecimiento es obtenida a partir de la
oxidacin de compuestos reducidos de azufre y oxidacin de ion ferroso. Adems, son
capaces de oxidar hidrogeno y compuestos orgnicos en algunos casos.
298
299
Cuadro N 8.1.
REACCION
E0 (V)
-0,54
H2 2H+ + 2 e-
-0,41
NAD(p) H NAD(P)+ + H+ 2 e-
-0,32
H2S S0 +2H+ 2 e-
-0,27
+0,05
NH2OH + H2O NO 3+ 5H +4 e
-
0,28
+0,07
+0,42
Fe2+ Fe3+ + e-
+0,77
H2O O2 +2H+ + 2 e-
+0,82
300
Muchos organismos son capaces de usar hidrogeno (H2) como fuente de energa.
Previamente se han mencionado varios mecanismos de oxidacin anaerobio del
hidrogeno (por ejemplo, la reduccin del sulfato y las bacterias acetognicas), pero
adems el hidrogeno se puede utilizar tambin como fuente de energa aerobia. En
estos organismos, el hidrogeno es oxidado por una hidrogenasa citoplasmtica para
generar un potencial reducido bajo la forma de NADH, que se usara posteriormente
para fijar el dixido de carbono va el ciclo de Calvin.
Los organismos que oxidan del hidrogeno, tales como Ralstonia eutrophaeutropha,
viven a menudo en las zonas de transicin oxigenadas-anxicas de la naturaleza para
aprovechar el hidrogeno producido por los organismos fermentantes anaerobios
mientras que todava pueden acceder al oxigeno.
8.1.1. Las bacterias del Hidrogeno y otros Auttrofos facultativos
Bacterias con la capacidad de utilizar el hidrogeno libre como sustancia del proceso
respiratorio.
La reaccin qumica entre el hidrogeno y el oxigeno es conocida con el nombre de
reaccin del gas detonante por su carcter explosivo. Las bacterias que oxidan
hidrogeno con oxigeno llevan a cabo la misma reaccin y por esto se incluyen bajo la
denominacin general de bacterias del gas detonante.
La primera identificada fue Bacillus pantotrophus, cuyo nombre especifico indica el
gran numero de sustratos orgnicos que puede utilizar como fuente de energa. Por
tanto, esta bacteria posee la propiedad de crecer heterotrfica como quimicorganotrofo
aerobio en una gran diversidad de medios. No obstante, tambin es capaz de oxidar
hidrogeno molecular con oxigeno y de utilizar la energa liberada para fijar el anhdrido
carbnico a travs del ciclo de Calvin. En estas condiciones se comporta como un
quimiolitotrofo auttrofo. Posteriormente se descubrieron otras bacterias que presentan
un comportamiento facultativo anlogo al de Bacillus pantotrophus.
301
desarrollo
autotrfico
despus
del
subcultivo
en
medios
orgnicos,
el
302
303
Se han descrito dos familias de hidrogenasas, una soluble y otra particulada. Se trata
en todos los casos de metaloproteinas con hierro y azufre que contiene nquel. La
familia de las solubles incluye protenas tetramericas que presentan la capacidad de
reducir el NAD+, mientras que la familia de las particuladas incluye enzimas dimericos,
ligados a membrana, que transfieren los electrones del hidrogeno directamente a la
cadena respiratoria, al nivel de la quinona.
Mientras que algunas especies presentan solamente la hidrogenasa soluble, como es
el caso Nocardia opaca y de Alcaligenes denitrificans. Es mucho ms frecuente la
presencia de una hidrogenasa ligada a membrana, siendo el ejemplo mejor
caracterizado el de Paracoccus denitricans. Tambin un pequeo grupo de especies
dispone de dos hidrogenasas, una soluble y otra particulada, siendo Alcaligenes
eutrophus un ejemplo caracterstico. Las hidrogenasas catalizan la oxidacin del
hidrogeno segn la siguiente estequiometria:
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Las bacterias del hidrogeno obtienen ATP por fosforilacion oxidativa mediante una
cadena respiratoria. En este grupo los componentes del sistema de transporte de
electrones son esencialmente del mismo tipo que los encontrados en otras bacterias y
en las mitocondrias. De hecho, la cadena respiratoria de Paracoccus denitrificans, muy
parecida a la de Alcaligenes eutrophus, es muy similar a la del sistema mitocondrial.
Por otra parte, la naturaleza del crecimiento, ya sea proporciones cualitativas de los
citocromos de la cadena respiratorio.
En muchas bacterias del hidrogeno, el determinante gentico de este tipo de
metabolismo ha podido ser asociado a plsmidos, muchos de ellos conjugativos.
As, la cepa H16 de A. eutrophus codifica un mega plsmido conjugativo de 450 kb, el
cual, adems de incorporar la informacin gentica para la oxidacin del hidrogeno,
incorpora otras muchas actividades metablicas como, por ejemplo, la fijacin del
CO2.
En
algunas
especies,
tales
como
Paracoccus
denitrificans
Alcaligenes
305
306
El amonio es una fuente de nitrgeno utilizable por todas las bacterias del hidrogeno
estudiadas. El nitrato o el nitrito tambin pueden ser utilizados por algunas cepas. Por
lo que respecta a las fuentes orgnicas de nitrgeno, la urea es una buena fuente de
nitrgeno. La misma es hidrolizada por una ureasa inducible. Otras fuentes de
nitrgeno orgnicas tales como diferentes aminocidos, acido rico, alantoina, guanina.
xantina, hipoxantina, etc., tambin pueden ser utilizadas, por las bacterias del
hidrogeno aunque no siempre.
Una situacin especial la representan aquellas bacterias del hidrogeno que son
capaces de fijar el nitrgeno elemental. El grupo de bacterias del hidrogeno
caracterizado inicialmente por su capacidad de fijar nitrgeno molecular incluye
microorganismos corineformes pigmentados de color amarillo, que se incluyen dentro
del gnero Xantobacter. Tales microorganismos pueden crecer en una atmosfera de
N2, H2, O2 y CO2, utilizando el nitrgeno molecular como nica fuente de este elemento,
siendo la fijacin de N2 relativamente sensible a la presin parcial de oxigeno (por
ejemplo, mientras que la mxima tasa de crecimiento con amonio como fuente de
nitrgeno se consigue a una presin parcial de O2 de 0,15 bar, cuando se utiliza N2
dicha presin parcial ha de ser de 0,014 bar).
307
308
FP: flavoprotenas; MD: metanol deshidrogenasa; Nar: nitrato reductasa; Nir: nitrito
reductasa; Nor: oxido ntrico reductasa; Nos: oxido nitroso reductasa
Fuente: Leininger, S., et al. (2006)
309
El sulfato puede ser reducido con hidrogeno molecular por los miembros del genero
Desulfovibrio. Estas bacterias son potencialmente capaces de desarrollo autrofico.
Figura N 8.2.
310
DEL
AZUFRE
311
Los organismos que oxidan el azufre generan el potencial reductor para la fijacin del
dixido de carbono va el ciclo de Calvin usando el flujo inverso de electrones, un
proceso que requiere energa que mueva a los electrones en contra del gradiente
termodinmico para producir NADH.
312
313
S2 +
314
315
316
Si se analiza el porcentaje de las bases del ADN de los tiobacilos se comprueba que
existe una significativa heterogeneidad, lo que implica una notable diversidad gentica.
Esto tambin puede comprobarse si se analiza, por ejemplo, la obligatoriedad del
metabolismo quimilitotrofico en este grupo: mientras algunos de ellos son
quimiolitotrofos obligados y dependientes de la fijacin del CO2 (T. thioxoxidans, T.
thioparus, T. denitrificans) otros presentan crecimiento mixotrofo (T. novellus y T.
intermedius), entendindose por mixotrofia la capacidad de utilizar conjuntamente
productos orgnicos e inorgnicos como fuente de carbono y/o energa.
T. novellus crece tan bien en medio orgnico con o sin tiosulfato como en un medio
mineral con tiosulfato en mayor o menor grado. As la presencia en el medio de un
0.5% de glucosa, sacarosa o asparagina tiene efecto inhibidor. En estas condiciones
se reprime la sntesis de la ribulosa difosfato carboxilasa. En crecimiento autotrfico, T.
novellus incrementa su crecimiento en un factor de 4 si se le aade glutamato al 0.5%.
En estas condiciones se considera que la oxidacin del tiosulfato se lleva a cabo
simultneamente con la asimilacin del glutamato, probablemente con una baja
asimilacin auttrofa del CO2.
T. intermedius, adems de crecer en medios minerales con tiosulfato, va
incrementando su crecimiento por la adicin de glucosa, glutamato o extracto de
levadura. Con glucosa y tiosulfato se obtiene una fijacin de CO2 radioactivo de solo
10%. En estas condiciones, el nivel de ribulosa difosfato carboxilasa es del 40%.
Parece que la glucosa suministrara un carbono y el tiosulfato la energa. En medios
con extracto de levadura y glucosa, T. intermedius presenta un elevado nivel de las
enzimas de la va Entner Doudoroff y poca capacidad de oxidar tiosulfato.
T. perometabolis, es incapaz de crecer en un medio mineral con tiosulfato, y tampoco
lo hace en un medio mineral con un sustrato orgnico oxidable. Sin embargo, crece en
medios con sustrato orgnico oxidable (por ejemplo, extractos de levadura y en azcar)
y tiosulfato. Esta bacteria carece de las enzimas necesarias para la asimilacin del
CO2, por lo que es incapaz de crecimiento auttrofo. Por ello, requiere una fuente
orgnica de carbono, cuya asimilacin necesita de la oxidacin de compuesto reducido
de azufre.
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Sn
3 H2O
+4e
n SO32-
318
Para ello se forma en primer lugar APS, el cual es oxidado despus a sulfato,
transfirindose tambin los electrones a un citocromo. Figura N0 8.5.
Si se sigue esta ltima va, puede sintetizarse ATP por un mecanismo de fosforilacin a
nivel de sustrato en el paso de APS a SO4, ya que, puede sintetizarse ATP al
condensar dos molculas de ADP:
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Figura N0 8.5. Vas de oxidacin de azufre por las bacterias oxidadoras del
azufre.
(1); sulfuro oxidasa (2); azufre-oxidasa (3); azufre oxidasa (4), sulfito
oxidasa (5); APS-reductorsa (6); ADP sulfurilasa (7); (rodonasa);
enzima reductor de tiosulfato (9); complejo oxidante deltio sulfato
(10); va la formacin del tetrationato.
Fuente: (Pares I.F. y A. Jurez, 1997).
8.2.4. Cadenas respiratorias en los tiobacilos, generacin de ATP y de poder
reductor
Los electrones drenados de la oxidacin de compuestos entran en diferentes puntos
(en funcin del potencial de reduccin del compuesto del que se a drenado), y son
transportados usualmente al oxigeno a travs de una cadena de citocromo,
generndose ATP por fosforilacion oxidativa.
El citocromo C suele ser el punto de entrada para la mayora de los compuestos, aun
cuando tambin pueden existir otros T. denitrifincans, anaerobio facultativo que puede
utilizar nitrato como aceptor terminal de electrones y que crece mejor que T.
thiooxidans.
320
Esto ltimo puede deberse al hecho de que es capaz de utilizar una flavoproteina como
aceptor de electrones, lo cual le dara un punto ms de fosforilacion en la cadena
respiratoria. Figura N0 8.6.
Al igual
FP, Flavoproteina; cit b, citocromo b; cit.c, citocromo c; cit aa3, citocromo aa3. T.
denitrificans puede utilizar NO3- como aceptor final en lugar de O2.
Fuente: Saunders AM, Mabbett AN, McEwan AG, Blackall LL. (2007).
Oxidacin del azufre
En la Figura N0 8.7 se muestra el Ciclo del azufre mostrando los cambios en los
estados de oxidacin y los microorganismos responsables.
Las formas y cantidades de azufre presentes son muy variables de un suelo a otro y
las condiciones encontradas van desde deficiencia hasta exceso. Como regla general,
-1
-2
(ppm) de SO4
321
322
Desulfomema,
Desulfobulbus,
Desulfococcus
Todos los organismos reductores del sulfato son anaerobios obligados. Puesto que el
sulfato es energticamente estable, antes de que pueda ser metabolizado debe
primero ser activado por adenilacin para formar APS (adenosina 5-fosfosulfato) de tal
modo que se consume ATP. El APS es entonces reducido por la enzima APS
reductasa a sulfito (SO32-) y AMP.
En los organismos que utilizan compuestos de carbono como donadores de electrones,
el ATP consumido es proporcionado por la fermentacin del sustrato de carbono. El
hidrgeno producido durante la fermentacin es realmente quin conduce la
respiracin durante la reduccin del sulfato.
Eventualmente, los electrones pasan de la enzima hidrogenasa a la APS reductasa,
que junto con la sulfito reductasa termina la reduccin del sulfato a sulfuro del
hidrgeno. El gradiente que mueve al protn se establece debido al hecho de que la
hidrogenasa, que convierte H2 a 2H+, se localiza en el periplasma (o fuera de la clula
en las bacterias Gram positivas).
323
324
El ion frrico producido puede luego atacar qumicamente a los sulfuros segn la
reaccin general:
325
326
327
Fuente: (Burow LC, Mabbett AN, McEwan AG, Bond PL, Blackall LL 2008)
8.3.2. Rol bioqumico y rendimiento energtico de la oxidacin del hierro
El hierro en forma reducida es abundante en la aguas de algunas fuentes y
manantiales, existiendo una flora bacteriana asociada a tal tipo de ambiente. La
oxidacin del hierro fue primeramente observada por Winogradsky en Leptotrhix
ochracea quien lo interpreto como un equivalente de la oxidacin de sustrato
orgnicos. Tanto en miembros de este gnero como en los de los gneros Gallionella o
Sphaerotilus, el crecimiento est asociado al depsito de sales de hidrxido frrico. No
obstante, el crecimiento de tales microorganismos tiene lugar en ambientes de pH
neutro o alcalino, condiciones en las cuales el ion ferroso es insoluble y se oxida
espontneamente en presencia de aire, por lo que ha sido muy difcil asociarse el
crecimiento de estos microorganismos a la oxidacin del hierro.
Solamente en Gallionella ha podido demostrarse crecimiento autotrfico, asimilando el
CO2 por el ciclo de Calvin. Adems del hierro, en estos ambientes neutros el
manganeso tambin es oxidado por algunas bacterias. Aunque el quimiolitotrofismo
basado en la oxidacin del manganeso ha sido considerado durante mucho tiempo, no
ha llegado a ser conclusivamente demostrado.
328
NH
NH
H2
G (KJ reaccin)
-203
-589
-260
-76
-237
329
-71
El potencial redox del par Fe2+ / Fe3+ (+0,77 V) est muy prximo al del oxigeno (+0.82
V), por lo que resulta evidente que una cadena de transporte de electrones establecida
entre ambos genera ATP por fosforilacin oxidativa.
De hecho, el rendimiento energtico de las clulas que oxidan Fe2+ se basa en el
ambiente extremadamente acido en el que viven (pH = 2) teniendo en cuenta que el pH
del citoplasma del medio externo es muy superior a la del citoplasma podra generar
ATP va ATPasa. No obstante, esto implicara una acidificacin del citoplasma que ha
de ser neutralizada. De hecho, la oxidacin del hierro es una reaccin que consume
protones:
330
Los electrones liberados por el ion ferroso son aceptados en el periplasma por la
rusticianina una protena con Cu de alto potencial redox, que a su vez los transfiere al
oxigeno va un citocromo c de alto potencial que est asociado a la membrana y un
citocromo a1, desde el cual son transferidos los electrones al O2.
Los protones necesarios para formar H2O se obtienen del citoplasma, por lo que,
mientras exista ion ferrosodisponible, la clula pueda bombardear protones al medio
externo, con la consiguiente sntesis de ATP.
Por lo que respecta a la formacin de poder reductor, al igual que en el caso de las
bacterias nitrificantes, el alto potencial del par Fe2+ / Fe3+ imposibilita reducir
directamente al NAD+, por lo que se establece una cadena de transporte inverso de
electrones a expensas del ATP generando en la oxidacin del hierro. Nuevamente,
esto redunda en un pobre rendimiento en biomasa, ya que tiene que oxidar grandes
cantidades de hierro, que precipita, para generar pequeas cantidades de biomasa.
T. ferrooxidans puede crecer tambin a expensas de compuestos reducidos de azufre
y tambin oxidando simultneamente compuestos de hierro y azufre, adems es capaz
de crecer heterotrficamente, metabolizando simultneamente la glucosa por la vas de
Entner Doudoroff y de la hexosa monofosfato. Figura N0 8.12.
Al igual que en las bacterias del hidrogeno, puede darse tambin un crecimiento
mixotrofo, es decir; utilizando simultneamente vas de metabolismo quimiolitotrofico y
quimiorganotrofico.
331
glucosa y CO2.
332
333
334
Fuente: (Capone, D. G., Popa, R., Flood, B., and Nealson, K. H. 2006).
335
Grupo
Grupo nitroso
Nitrosomonas
Morfologia
Motilidad
Hbitat
Bacilos
Nitrosospira
Nitrosococcus
Espirales
Cocos
Nitrosolobus
Pleomorficos
+
+
+
+
Grupo nitro
Nitrobacater
Bacilos cortos
Nitrospina
Nitrococcus
Nitrospira
+
Bacilos Largos y finos
Cocos
+
Grandes
Clulas
helicoidales a
vibrioides
Suelo
Suelo, Aguas
aguas saladas
Aguas saladas
dulces,
Aguas saladas
Aguas saladas
La Oxidacin del amonio a nitrito tiene lugar en varias etapas. En la primera de ellas se
genera hidroxilamina mediante la accin de una monooxigenasa, no se produce
energa en este proceso.
336
El flujo de electrones que se genera en la cadena respiratoria solo sirve para producir
ATP, ya que los potenciales de oxido-reduccin de las parejas NH+4/NH2OH (+899mV)
y NO-2/NH2OH (+66Mv) son demasiado positivos como para deducir el NAD+. Por ello,
la generacin de poder reductor implica el funcionamiento de una cadena de transporte
inverso de electrones a partir del ATIP derivado de la cadena respiratoria.
337
Pero, en funcin del potencial redox del par NO-2/NH2OH, los electrones entran a nivel
del citocromo C, con o que solamente pueden utilizarse un punto de fostorilacion en la
cadena respiratoria establecida, Teniendo en cuenta el bajo rendimiento del ATP del
proceso respiratorio, la necesidad de invertir ATP para obtener poder reductor que
estas bacterias necesitan para poder fijar el CO2 por el ciclo de Calvin, el rendimiento
en biomasa de esos microorganismos y de otros quimiolitotrofos es muy bajo. La
sntesis de un gramo de clulas (peso seco) implica el consumo de cantidades de
sustrato muy superiores a las que consume cualquier otro microorganismos de distinto
tipo fisiolgico y, como consecuencia de ello, la tasa de duplicacin es muy baja.
8.4.3. El Grupo Nitro
Este grupo incluye las bacterias que oxidan el nitrito hasta nitrato. Usualmente se
encuentran asociadas a las bacterias del grupo nitroso en sus hbitats naturales. El
gnero ms caracterstico es Nitrobacter, siendo N. winogradskyi probamente la
especie ms estudiada. A diferencia de la oxidacin de amoniaco a nitrito, la de este
ltimo a nitrato tiene lugar en un solo paso:
NO-2 + O2 NO -3
La oxidacin es catalizada por una nitrito oxidasa, una molibdoproteina localizada en la
parte interna de la membrana. Los electrones son transportados al oxigeno mediante
una cadena que incluye a los citocromos a1, c y aa3. Se ha podido demostrar que el
nitrito no es oxidado directamente por el oxigeno sino por el H2O que se utiliza como
dador de H2 para la reduccin concomitante del NAD+.
Debido al alto potencial redox del par NO-2/NO-3 (E0=+0,42 V), la cadena de transporte
de electrones que se establece es muy corta (Figura N0 8.16) Aun cuando la energa
liberada en la oxidacin de nitrito a nitrato (G01=-76kj) posibilitara la sntesis de dos
molculas de ATP, parece que solamente se sintetiza una. El proceso de generacin
de ATP no est completamente aclarado.
reductor no puede tener lugar directamente de la oxidacin del nitrito, por lo que tiene
que establecerse una cadena de transporte inverso de electrones para esta finalidad.
Teniendo en cuenta el bajo rendimiento energtico de su oxidacin, es necesario
338
oxidar hasta cinco molculas de nitrito para conseguir reducir una de NAD+. Por ello, el
tiempo de duplicacin de los representantes del gnero Nitrobacter es de unas 18
horas.
En los miembros del grupo nitro el quimiolitotrofismo no tiene un carcter tan
estrictamente obligado como en el grupo nitroso. Nitrobacter agilis, adems de crecer
aerobiamente a expensas del nitrito, tambin es capaz de crecer, en cierta medida,
mixotroficamente e incluso heterotrficamente.
Figura N0 8.16. Oxidacin de Nitrito a Nitrato por las bacterias del grupo Nitro.
339
cuales se utilizan, junto a la nitrato reductasa, para asimilar el nitrato. Los dos primeros
enzimas son solamente activos en condiciones anaerobias.
Por ello, se requiere una estrategia alternativa que en todos los casos consiste en el
funcionamiento a expensas de ATP de una cadena de transporte inverso de
electrones.
casos una cadena de transporte de electrones que genera solamente uno o dos moles
de ATP por mol de sustrato oxidado, y que necesita importantes cantidades de NADH
340
Se pens que los compuestos orgnicos no eran capaces de atravesar las envolturas
celulares y que quedaban adheridos a la membrana celular impidiendo la penetracin
del sustrato energtico mineral.
341
342
La incapacidad de
Por otra parte el efecto toxico de la materia orgnica se puede atribuir a la presencia
en el citoplasma de ciertos metabolitos que o bien no se degradan o bien lo hacen muy
lentamente al no existir un ciclo de Krebs funcional, lo que puede provocar alteraciones
en la regulacin metablica que redundan en una inhibicin del crecimiento, estas
alteraciones serian mucho ms drsticas que las que tienen lugar en las bacterias
hetertrofas.
Por otra parte algunos de estos efectos reguladores son idnticos a los que reprimen el
metabolismo quimiolitotrofo en las bacterias facultativas.
343
las
bacterias
del
anammox
contienen
un
orgnulo
intracelular
344