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Qu es un gen?

Regulacin de la informacin gnica

Dr. Carlos Fernando Prada Q.

Es una secuencia de nucletidos en la molcula de ADN, equivalente a una unidad de transcripcin. Contiene la informacin, a partir de la cual se sintetiza un polipptido, una enzima, un cido ribonucleico: mensajero, de transferencia o ribosomal. En el genoma humano la mayora de los genes son nicos y se expresan en forma independiente. Los genes segregan cuando ocurre la meiosis.

MODELO OPERN Flujo de informacin gentica en la clula eucariotica] Jacob, Monod y colaboradores analizaron el sistema de la lactosa en E. coli, de manera que los resultados de sus estudios permitieron establecer el modelo gentico del Opern que permite comprender como tiene lugar la regulacin de la expresin gnica en bacterias. Jacob y Monod recibieron en 1965 el Premio Nobel pos estas investigaciones Francois Jacob Jacques Monod

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Son pequeos fragmentos circulares de ADN, adems de su cromosoma principal, contienen de 2 a 30 genes. Algunos tienen la capacidad para incorporarse o salir del cromosoma bacteriano

Se denomina episoma a un plsmido incorporado al cromosoma bacteriano. Los plsmidos se replican en manera similar al cromosoma bacteriano. El ADN procariota se organiza en paquetes coherentes denominados OPERONES, en los cuales se encuentran los genes para funciones interrelacionadas.

El modelo opern de la regulacin de los genes procariotas fue propuesto en 1961 por Francois Jacob y Jacques Monod

MODELO OPERON

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Un Opern es grupo de genes estructurales cuya expresin est regulada por elementos de control o genes (promotor y operador) y genes reguladores

El promotor es la parte del ADN en donde se pega la ARN polimerasa antes de abrir el segmento de ADN a ser transcripto Un segmento del ADN que codifica para un polipptido especfico se conoce como un gen estructural.

Un opern consiste en: un operador: controla el acceso de la ARN polimerasa al promotor un promotor: donde la ARN polimerasa reconoce el sitio de inicio de la transcripcin un gen regulador: controla el tiempo y velocidad de transcripcin de otros genes un gen estructural: codifican las enzimas relacionadas o las protenas estructurales El gen regulador codifica para una protena que se pega al operador, obstruyendo al promotor (y por lo tanto a la transcripcin), del gen estructural.

Cuando se remueve la protena represora, puede producirse la transcripcin. El operador y el promotor son sitios de unin sobre el ADN y no se trasncriben.

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Los operones son inducibles Positivamente Reprimibles o negativos, de acuerdo al mecanismo de control

OPERONES INDUCIBLES
El Opern lactosa, que abreviadamente se denomina Opern lac, es un sistema inducible. La protena reguladora, producto del gen regulador , es un represor que impide la expresin de los genes estructurales en ausencia del inductor.

El inductor en este caso es la lactosa

Cuando hay lactosa en el medio (intestinos de un mamfero durante la lactancia), sta funciona como inductor, se une al represor cambiando su forma lo que evita que se pueda unir al operador, de este modo la polimerasa puede transcribir los genes correspondientes. Este opern lac slo se activa cuando hay lactosa en el medio y ausencia de glucosa.

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Opern lactosa en ausencia de lactosa

Cuando no hay lactosa en el medio, la protena represora se encuentra unida al operador impidiendo la transcripcin de los genes para las enzimas que metabolizan la lactosa.

En ausencia del inductor (la lactosa), la protena represora producto del gen i se encuentra unida a la regin operadora e impide la unin de la ARN-polimerasa a la regin promotora y, como consecuencia, no se transcriben los genes estructurales.

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Operones reprimibles

Cuando un producto del metabolismo, el triptofano por ejemplo, est en cantidades suficientes la bacteria puede dejar de fabricar las enzimas que los sintetizan. En este sistema, el producto funciona como correpresor unindose al represor y de este modo detiene la sntesis proteica.

Opern triptfano: en presencia de triptfano

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Tanto la represin como la induccin son ejemplos de control negativo, dado que la protena represora detiene (" turn off ") la transcripcin. La lactosa, el azcar de la leche, es hidrolizada por la enzima beta-galactosidasa. Esta enzima es inducible: solo se produce en grandes cantidades cuando la lactosa, el sustrato sobre el cual opera, esta presente. En cambio, las enzimas para la sntesis del aminocido triptfano se producen continuamente a menos que el triptfano este presente en el medio de cultivo, se dice en este caso que las enzimas sintetizadoras de triptfano estn reprimidas. Opern triptfano: en ausencia de triptfano

Regulacin gentica durante el desarrollo

Totipotencia y diferenciacin Mapas de destino en el nemtodo Caenorhaditis elegans Desarrollo temprano de Drosophila
Genes maternos Genes segmentales Genes hometicos

Regulacin gnica en eucariotas

Regulacin de la transcripcin en eucariotas

Interaccin elementos cis y factores trans Metilacin del DNA

Regulacin de la expresin gnica en eucariotas

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Desarrollo ontogentico

El nemtodo Caenorhaditis elegans

959 clulas somticas Ciclo vida 3,5 das

29 30

Tres grupos de genes: Genes maternos: Se expresan durante la ovognesis, Actan en la maduracin del ovocito. Genes de segmentacin: Se expresan tras la fertilizacin Mutaciones alteran el nmero o polaridad de los segmentos. Hay tres clases de genes que actan secuencialmente.

Experimentos de transplantes mostraron la existencia de tres tipos de determinantes citoplasmticos: -Determinantes del plasma polar y formacin de las clulas germinales. -Determinantes del eje anteroposterior. -Determinantes del eje dorsoventral.

Genes hometicos: Controlan la identidad de cada segmento Mutaciones cambian la identidad segmentaria.

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GENES MATERNOS
Se expresan antes de la fertilizacin y actan tanto en clulas nutricias como en el ovocito. Se identifican cuatro sistemas de genes que definen los ejes del embrin. Cada sistema acta localizando una seal dentro del huevo, llamada morfgeno. 1) 2) 3) 4) Sistema Sistema Sistema Sistema anterior: cabeza y trax posterior: segmentos del abdmen terminal: acron y telson dorso-ventral: desarrollo dorso-ventral

GENES DE SEGMENTACION
1. Genes gap: mutantes carecen de un grupo continuo de segmentos 2. Genes de regla par: mutantes afectan a los segmentos pares o impares. 3. Genes de polaridad de segmento: mutantes pierden una parte de cada segmento.

GENES GAP
Dividen el embrin en 4 regiones anchas Son factores de transcripcin que se regulan entre ellos y a los genes de regla par.

Kruppel

Giant

Hunchback

Knirps

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GENES DE REGLA PAR

Cada uno se expresa en un patrn de 7 bandas a lo largo del embrin. Las 7 bandas identifican parasegmentos impares: Eve parasegmentos pares: Fushi tarazu Control separado dentro de cada banda

GENES HOMEOTICOS
Determinan la identidad de cada segmento. Son factores de transcripcin que regulan la expresin de otros genes hometicos o de otros genes. En Drosophila se agrupan en dos complejos ubicados sobre el cromosoma 3: Complejo Antennapedia: controla la identidad de los segmentos de la cabeza y de los 2 primeros segmentos torcicos. Complejo Bithorax: controla la identidad del tercer segmento torcico y de los segmentos abdominales.

Expresin uniforme del ARN Degradacin especfica entre bandas

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Desarrollo temprano de
Juego de herramientas genticas (Genetic toolkit): Conjunto de
herramientas comn que pueden utilizarse para crear muchas estructuras

Drosophila melanogaster

Genes Hox

Tema 9. Regulacin de la expresin gnica en eucariotas

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Genes implicados en el desarrollo temprano de Drosophila melanogaster

Genes hometicos: determinan la identidad de los segmentos. Se descubrieron a partir del estudio de mutantes hometicos

Genes implicados en el desarrollo temprano de Drosophila melanogaster

Mutante bithorax

Mutante bithorax

Mutante Antennapedia
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Mutante Antennapedia

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Situs inversus
Consiste en una alineacin errnea de los rganos dentro del cuerpo, colocndolos del lado opuesto (imagen de espejo). La Dextrocardia (el corazn situado en la parte derecha del trax) fue descrita por primera vez por Marco Severino en 1643. Sin embargo, situs inversus fue descrito un siglo ms tarde por Matthew Baillie. Asociado a otras malformaciones, tales como poliesplenia, Sndrome de Kartagener, etc. Suele representar un serio riesgo para la vida pues en la mayora de los casos va acompaado de malformaciones cardacas

Regulacin transcripcin: Interaccin elementos cis y factores trans Elementos cis: promotores, intensificadores (enhancers) y silenciadores Factores trans: factores de transcripcin con dos dominios. Unin DNA e Inicio transcripcin (algunos deben unirse antes a la RNA pol) Dominios unin al DNA (diferentes clases) Motivo dedo de zinc Motivo hlice-giro-hlice Motivo cremallera de leucina Motivo puos de cobre Hormonas esteroides Remodelamiento de la cromatina por protenas y activacin gnica Metilacin del DNA Regulacin postranscripcional Procesamiento alternativo iRNA

Regulacin de la expresin gnica en eucariotas

Regulacin de la expresin gnica en eucariotas

Regulacin transcripcin: Interaccin elementos cis y factores trans

A C

Que es la posicin cis ty trans?

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Factores de transcripcin
Factores especficos de tejidos -- Genes hepticos -- Genes neuronales -- Genes de las clulas b pancreticas

Clasificacin de los dominios de unin al DNA

Protenas con:
Homeodominio Protenas con dedos de zinc Hlice alada (en lengeta de flecha) Con cremallera o zipper de leucina Con hlice-bucle-hlice

Factores modulados por seales extracelulares: -- Genes modulados por hormonas esteroideas -- Genes modulados por productos bacterianos -- Genes modulados por insulina......

Los factores de transcripcin

Estructuras caractersticas de dominios de interaccin con el DNA Dominios que permiten su unin al DNA. Dominios que permiten su interaccin con otras protenas del complejo transcripcional.
Dedos de Zinc

Cremalleras de leucina

Dominio de activacin Homeodominios Dominio de unin al DNA

Dominios que permiten la unin de dos protenas : Dominios de dimerizacin

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Protena de Engrailed de Drosophila Nombre de genes hometicos (produce la transformacin de una parte del cuerpo en otro en el desarrollo. Regin de 60 residuos de aa muy conservada

Homeodominio

Dominio estructurado con un ion Zn2+ en el centro de un plegamiento de residuos de aa. Secuencia consenso La forma de dedo se ve en un diagrama bidimensional El zinc se fija entre las 2 Cys y la 2 His. Se le llama dedo C2H2
Tyr/Phe-Cys-X2-4-Cys-X3-Phe/Tyr-X5-Leu-X2-His-X3-4-His

El alfa-hlice que se forma es muy compacto Se inserta en el surco mayor del DNA Otro tipo de dedos de zinc C4 se encuentra en otros factores de trascripcin (receptores a esteroidesnucleares) Cys-X2-Cys-X13-Cys-X2-Cys-X14-15-Cys-X5Cys-X9-Cys-X2-Cys

Protenas con dedos de zinc

Protenas con dedos de zinc

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Los dominios C2H2 y C4 son estructuralmente distintos. Los C2H2 tienen tres dedos repetitivos o ms y se fijan como monmeros. Los C4 tienen en general dos dedos y se fijan como homodmeros o heterodmeros. Con simetra rotacional doble (fig. siguiente b)

Dedos de zinc C2H2 (a)y C4(b)

Protenas con dedos de zinc

Protena GL1 Receptor a glucocorticoides

Alfa-beta

Dedos de Zinc

Dominios de fijacin de la histona H5 Se unen al DNA como monmeros Pueden unirse al DNA Z.

Estructuras alfas y betas unidas por un tomo de Zinc que interacciona con Cys e His

Protenas de unin a ADN

Protenas con hlice alada

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Hay un residuo de leucina cada 7 aminocidos en la regin C terminal del dominio de unin. Se unen al DNA en forma de dmeros, la leucina es necesaria para la dimerizacin. Presenta dos a-hlices extendidas que agarran al DNA como pinzas en dos surcos mayores en la regin N terminal. Pueden ser homodmeros o heterodmeros.

Interaccin de Gnc4 con el DNA

Cremallera o zipper de leucina

Un bucle no helicoidal de la cadena polipeptdica separa dos regiones ahelicoidales. Tienen aminocidos bsicos para aumentar la interaccin con el DNA.

Interaccin de un dominio hlice-bucle-hlice con el DNA

Hlice bucle hlice

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Mecanismos postranscripcionales..

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