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Guia de Problemas de Genética 2007
Guia de Problemas de Genética 2007
Gua de
Problemas
Segundo Cuatrimestre de 2007
Profesores responsables:
Dres. Esteban Hopp, Beatriz Saidman y Liliana Mola
Gua terica:
1) Qu son, de dnde se obtienen y para qu sirven
las enzimas (mejor llamadas endonucleasas) de restriccin? Cmo hacen las bacterias que producen ER
para evitar que su genoma se vea afectado por las
mismas? Qu tipos de especificidad presentan? Qu
tipos de extremos pueden generar en el ADN sustrato?
R: Las endonucleasas de restriccin son producidas
por bacterias como mecanismo de defensa contra los
fagos. El genoma se encuentra protegido por metilacin especfica del sitio de restriccin mediante una
metilasa con igual especificidad que la endonucleasa.
Cortan el ADN en sitios especficos (secuencias definidas de ADN de 4 6 bases, generalmente). Algunos
dejan extremos cohesivos, otros dejan extremos romos. Siempre el sitio blanco (de reconocimiento) es
un palndrome, aunque el sitio de corte puede no coincidir con el sitio de reconocimiento. Los fragmentos
generados se pueden separar fcilmente mediante
electroforesis en geles de agarosa o poliacrilamida. La
velocidad de los fragmentos depende de su longitud:
los ms pequeos migran ms rpido.
2) En qu consiste la tcnica de secuenciacin de
Sanger? Qu trascendencia tuvo y tiene en Gentica
y Genmica? Porqu desplaz a la tcnica de Maxam
& Gilbert? Cul es la ventaja de la secuenciacin
automtica y en qu se diferencia de la manual?
R: En la secuenciacin manual, se suele marcar con
radioistopos y se corren 4 calles por secuencia (una
para cada nucletido). Se revela por autoradiografa.
Secuenciacin de Sanger (ver esquema de libro): secuenciacin por dideoxinucletidos
- ADN simple cadena
- Oligonucletido iniciador (primer)
- Incubacin c/ 4 diferentes dideoxinucletidos
(uno para cada calle)
- (Mono)deoxinucletidos (uno de ellos marcado,
usualmente [32P]dCTP)
- Electroforesis en gel de poliacrilamida
Existen mtodos no radiactivos (como tincin con
nitrato de plata), pero son menos utilizados. En la secuenciacin automtica se marca con fluorocromos
(aqu se marca el primer, con un color distinto para
cada nucletido a detectar) y se corren las cuatro reacciones en el mismo carril (que suele ser un capilar).
Los fragmentos se detectan mediante un lser a la salida del gel que distingue los 4 fluorocromos. No requiere detener la corrida electrofortica, por lo que
revela un mayor nmero de nucletidos. Permiti la
Problemas:
1) Suponiendo un alineamiento al azar de nucletidos
en un fragmento de ADN, cul es la probabilidad de
que una endonucleasa de restriccin cuyo sitio de reconocimiento consta de cuatro bases pueda cortar el
ADN? y para una enzima de seis bases? y para una
de ocho?
R:
A
T
C
G
4 bases
X X X *
( )4 = 3.9 10-3
*(probabilidad de que c/base se encuentre y que al
lado se encuentre una base cualquiera)
6 bases
( )6 = 2.4 10-4
8 bases
( )8 = 1.5 10-5
Frmula general: (1/4)n, donde n = longitud de la secuencia que se busca.
A medida que aumenta el nmero de bases disminuye
la probabilidad de encontrar un sitio blanco de restriccin.
2) Un fragmento de ADN clonado, con extremos cohesivos generados por EcoRI, lleva el gen que codifica para un polipptido de la cpside de un virus que
infecta a humanos, pero que enferma slo a personas
B) BamHI
C) E + B
5,5 kpb
4,5 kpb
4 kpb
4 kpb
3,5 kpb
3 kpb
2,5 kpb
1 kpb
BamHI
3
2,5
5,5
BamHI
4,5
3,5
1
BamHI
EcoRI
4 kpb
R:
Sonda 1
Sonda 2
8 kpb
6 kpb
EcoRI
2 kpb
EcoRI
western bloot representattivo utilizanddo anticuerppos anti-interfernn . Los indiividuos 1 y 2 no son afeectados
(sanos). Enn base a los resultados obtenidos
o
enn Southern, northeern y westernn:
Southern
1 2
3 4
Nortthern
1 2
3 4
W
Western
1 2
3 4
1. DIVIS
SIN CEL
LULAR
b) mitosis y meiosis II
c) meiossis I y meiosiis II
Co
onsidere las diferencias
d
taanto en el mecanismo coomo
en los productoos finales.
3) El grfico representa
r
la variacin del contenidoo de
AD
DN durante el
e ciclo vital de una clulla:
Bibliograffa:
I
II
__________A____________
_______________________
A
__________a____________
_______________________
I
a
II
#10) En qu organismos esperara la mayor variabilidad:
a) en los que se reproducen asexualmente en los que
lo hacen sexualmente?
b) Suponga que el proceso meitico nunca hubiera
aparecido en la evolucin biolgica: cul piensa Ud.
que habra sido la consecuencia?
c) En las especies animales que poseen una meiosis
masculina aquiasmtica, hay recombinacin gentica
en esas especies?
11) IMPORTANTE La direccin
www.biologia.arizona.edu/cell/tutor/mitosis/01q.html
contiene problemas relacionados al tema de divisin
celular y cada uno de ellos trae cuatro opciones de
respuesta siendo solo una la correcta. Es til como
mtodo de ejercitacin y de autoevaluacin.
2. LEYES
S DE MEND
DEL Y EXTENSIONES DEL ANLISIS
A
M
MENDELI
IANO I
Bibliografa: Griffiths y col. Cap. 2 y 4
Gua tericca
1) Seale la importanncia del conncepto de seegregacin, por unn lado, e inddependencia,, por el otro, de la
herencia dee caracteres derivada
d
de las leyes dee Mendel. Cul es la importtancia de la diploida enn todo
esto? Seraa lo mismo si
s las arvejass fueran monnoploides en vez de
d diploides??
R: Adems de repasar las
l leyes de Mendel, se resalta
que la segreegacin e inndependenciaa de la herenncia de
los caracterres es, valga la redundanncia, indepenndiente
de si los orrganismos soon haploides o diploides y permite la recoombinacin, entendida como
c
nuevass combinaciones de alelos de
d distintos genes. Se puede
hacer, comoo ejercicio, qu
q hubiese pasado
p
con las
l generaciones paternales,
p
F1
y F2 si las arvejaas fueran haploides. Ahora biien, la segreggacin de aleelos se
ve enmascaarada en los diploides poor las interaccciones
de dominanncia-recesividdad. Por eso, antes de Mendel,
M
no se le enccontraba lgiica a que 2 inndividuos dee fenotipo dominaante, tuvieraan descendieentes con feenotipo
recesivo, por ejemplo. Destacar la importanccia del
anlisis num
mrico-estaddstico para establecer
e
esstas leyes y que poocos aplicaroon previamennte.
2) Por quu procesos recombinann los genes en la
meiosis?
R: Despus de Mendeel se pudierron incorporrar los
conceptos derivados
d
dee los avancees en citogeentica
(teora crom
mosmica dee la herenciaa) y reformuular, en
su acepcinn moderna que
q los gennes situados sobre
diferentes cromosomas
c
recombinann mediante la segregacin al
a azar de los cromosom
mas en la anaafase y
los genes siituados en ell mismo crom
mosoma se recomr
binan por medio
m
del enttrecruzamiennto.
3) a) Qu es un monohhbrido? Quu es un hbrrido en
h
sentido agrronmico o comercial (ppor ej. un hbrido
superrendiddor para Claarn Rural)? b) Qu siggnifica
hacer un cruuzamiento diihbrido o triihbrido?
R:a) Monohbrido es sinnimo
s
de heterocigotta para
un nico gen.
g
Un hbrrido comercial es tambiin un
heterocigotaa (pero con sobredomina
s
ancia para el carcter rendimieento). No se lo debe conffundir con hbridos
interespecfficos que soon resultadoss de cruzam
mientos
interespecfficos y se verrn en la guaa de alteracioones.
b) Hacer unn cruzamientoo dihbrido o trihbrido siignifica analizar varios
v
pares de alelos, doos (Aa Bb) o 3 (Aa
Bb Cc) resppectivamentee, siempre heeterocigotas.
4) Qu es retrocruza?
r
cruzamiennto prueba?
Y
R: Un cruzaamiento prueeba es un cruuzamiento enntre un
heterocigotaa y el padre recesivo paara las caractersticas en estuddio
AA x aa
A
Aa
Se hace
h
Aa x aa (cruzamientto prueba)
Laa retrocruza es
e un cruzam
miento entre el
e heterocigoota
(F1) o cualquieera de las sigguientes geneeraciones y
cualquiera de los padres originales.
5)En qu conssiste la pruebba de compleementacin?
R: Cruzamientto entre dos mutantes ho
omocigotas con
c
fen
notipo similaar (por ejempplo albino) para
p
determiinar
si la F1 tiene fenotipo sallvaje (indicaativa de que las
mu
utaciones esttn localizaddas en distintos genes). Es el
casso tpico dee una va m
metablica dee varios passos.
Taanto si hay una
u mutacinn para el priimer paso dee la
vaa, como paraa el segundo, la consecueencia es quee no
se formar el producto finnal (por ejem
mplo antociaanas
de color rojo, dando albinismo). Si se cruza una mum
tan
nte para el geen codificantte para la prim
mera enzimaa de
la va metabliica con otro para la segu
unda, la F1 ser
s
hetterocigota para ambos ggenes. Como
o generalmeente
loss alelos salvvajes (enzimaa normal acttiva) son dominan
ntes, las ennzimas sintettizadas se complementa
c
arn
parra restaurar la va metabblica, indep
pendientemeente
de que los allelos salvajees estn en
n repulsin (en
ans). El 100% de la F1 es salvaje. Esta pruebaa se
tra
con
ntrasta con la prueba de recombinaciin (lo que conc
fun
nde a los aluumnos). En la prueba de recombinaciin,
pu
uede ocurrir que las mutaantes indepeendientes se correespondan al mismo gen pero en nuccletidos disttintoss, lo que possibilita que se produzca un entrecruuzamiiento entre las 2 posicioones mutadass generando un
reccombinante salvaje.
s
En eeste caso, la F1
F ser de feenotip
po mutante en un 100%
% (los alelo
os mutados del
miismo gen no se pueden coomplementarr, salvo algunos
cassos muy exccepcionales llamados dee complemenntaci
n intragnicca). En la F
F2, en una proporcin
p
m
muy
pequea (por ejemplo 1x110-4) apareceen salvajes por
reccombinacinn. Claramennte, no son
n proporcioones
meendelianas. Este
E tipo de experimento
os le sirvieroon a
Benzer para establecer las distancias mnimas o problemas que se refieren a estos ejemplos dado que,
unidades de recombinacin en sus experimentos con experimentalmente, cuando se obtiene una progenie
fagos. Hoy sabemos que esta distancia o unidad es el segregante, normalmente no se sabe de antemano si el
comportamiento es de tipo episttico y menos an a
nucletido.
6) Qu ventajas tiene el uso de caracteres, genes o qu variante de epstasis se corresponde. En este conmarcadores codominantes (respecto a los dominantes) texto, resulta til disponer del cuadrito de abajo que
muestra algunos ejemplos del tipo de proporciones
en un anlisis gentico de segregacin?
R: Se puede distinguir los heterocigotas de los homo- fenotpicas posibles.
cigotas, por lo que se dispone de mayor informacin Problemas:
(estadstica) en una
Tipo de interaccin gnica
9
3
3
1
Razn
F2, por ejemplo. ReA-BA-bb
aaBaabb
fenotpica
trocruzar F1 con el
Ninguna (cuatro fenotipos distintos)
9
3
3
1
9:3:3:1
doble recesivo (cruAccin
gnica
complementaria
9
7
9:7
zamiento prueba), en
Supresin
dominante
de
A
sobre
el
alelo
dominante
B
12
3
1
13:3
vez de autofecundar.
Epstasis recesiva de aa sobre los alelos B y b
9
3
4
9:3:4
7) Cul es la base
Epstasis dominante de A sobre los alelos B y b
12
3
1
12:3:1
molecular de las inGenes duplicados
15
1
15:1
teracciones gnicas,
1)
Si
dispone
de
las
siguientes
cepas
de
Drosophila
dominancia, semidominancia, codominancia, sobreii) salvaje y
iii) bw_vg ;
dominancia (=heterosis o vigor hbrido), y dominancia i) bw e ;
bw e
bw vg
incompleta?
R: Repasar concepto un gen-un polipptido y qu im- y desea comprobar las leyes de Mendel, indique:
plica a nivel de fenotipo (ej. grupos sanguneos). Es a) Todos los cruzamientos que le permitiran hacerlo y
la segregacin de qu carcter (o caracteres) estudiara
decir, en la codominancia se expresan los dos alelos.
La sobredominancia implica que la F1 supera en el en cada caso.
carcter estudiado (usualmente rendimiento agron- b) Es equivalente el cruzamiento directo al recproco?
mico) a ambos padres.
Dominancia incompleta: el heterocigota presenta ras- c) Deben usarse hembras vrgenes en todos los cagos intermedios entre cada tipo de homocigota, no es sos?
2) Si dos pares de genes A:a y B:b se transmiten inigual a ninguno de ellos.
dependientemente y se sabe que A es dominante sobre
8) Normalmente, de un carcter autosmico doa
y B dominante sobre b, cul es la probabilidad de
minante relacionado con alguna enfermedad se
obtener:
espera que cada individuo afectado tenga al menos un progenitor tambin afectado. Pero, puede a) una gameta AB a partir de un individuo AaBb?
b) una gameta Ab a partir de un individuo AA Bb?
suceder que ambos padres no manifiesten la enc) una cigota AABB a partir de aabb X AABB?
fermedad?
d) un fenotipo AB a partir de AaBb X AaBb?
R: Penetrancia (incompleta)
e) un fenotipo AB a partir de AABB X aabb?
f) un fenotipo aB a partir de AaBb X AaBB?
3) Considere el cruzamiento AaBbCcDdEe x
aa
aaBbccDdee. (a) Qu proporcin de la descendencia
ser fenotpicamente como: 1) el primer parental, 2) el
segundo parental, 3) cualquiera de los dos parentales y
Aa
4) ninguno de ellos? (b) y genotpicamente? Suponga
9) A qu se denomina interacciones gnicas?
que la segregacin es independiente.
R: Interaccin entre dos o ms genes de distintos loci
4) Enumere las proporciones genotpicas y fenotpicas
en la que uno interfiere o modifica la expresin feque puede formar el trihbrido AaBbDd cuando es
notpica de otro. Generalmente se denomina hiposttiautofecundado (o cruzado por uno de constitucin
co al gen que slo se manifiesta fenotpicamente
genotpica similar) suponiendo que A y B son domicuando otro locus (episttico) presenta determinado
nantes y que D tiene dominancia incompleta sobre d.
genotipo.
Epstasis = modificaciones de las proporciones fe- 5) Se sabe que existe una serie de 4 alelos en determinada especie diploide (2n); cuntos estaran presentes
notpicas debidas a interaccin gnica
b) un par cromosmico?
Los casos de epstasis son muy numerosos en genti- en: a) un cromosoma?
c)
un
individuo
de
la
especie?
ca, muchos ms de los que aparecen en los libros de
texto. Sin embargo, varios textos tratan con detalle e d) sobre la misma base: cuntas combinaciones difeincluso dan definiciones de algunos de estos ejemplos. rentes de alelos se espera que ocurran en la poblacin
No es de inters para esta materia que los estudiantes completa?
memoricen estos ejemplos y mucho menos las defini- 6) En el ratn, el gen para el albinismo presenta una
ciones de cada uno de ellos. Sin embargo, hay algunos serie de alelos mltiples. Cuatro de estos alelos (clasi-
Madre Padre
Normal Curva
Curva
3
4
5
Curva
Norma
Curva
Curva
Hijas
Hijos
Todas curvas Todas normales
0,5 curvas
0,5 curvas
Normal
0,5 normales
0,5 normales
Normal Todas curvas
Todas curvas
Normal Todas normales Todas normales
Curva Todas curvas
Todas curvas
0,5 curvas
Curva Todas curvas
0,5 normales
10
emplumadas y slo 1 sin plumas. Diagrame los cruzamientos y explique los resultados.
16) En la rata, dos parejas allicas A:a y R:r interactan de la siguiente forma:
A_R_: pelaje gris.
aaR_: pelaje negro.
A_rr: pelaje amarillo. aarr: pelaje color crema.
Estos genotipos slo pueden expresarse en presencia
de un alelo dominante de un tercer gen, D, mientras
que su alelo recesivo d causa albinismo. Cuatro lneas
albinas homocigotas diferentes fueron cruzadas con
una lnea pura de color gris, y estos cruzamientos produjeron las correspondientes F1 grises. Estas F1 produjeron las siguientes F2:
Lneas Cantidad de individuos en las distintas F2
albinas Gris Amarillo Negro Crema Albino
174
0
65
0
80
1
48
0
0
0
16
2
104
33
0
0
44
3
292
87
88
32
171
4
a) Cul es el genotipo de cada lnea albina?
b) Qu tipo de interaccin -si la hay- est implicada
en estos cruzamientos?
IMPORTANTE: Una vez resueltos los problemas de
la gua, las siguientes direcciones de Internet contienen problemas que, a manera de repaso, permiten incursionar en las tcnicas de autoaprendizaje con autoevaluacin.
http://www.biologia.arizona.edu/mendel/sets/mono/m
ono.html (cruza monohbrida)
http://www.biologa.arizona.edu/mendel/sets/di/02Q.h
tml (cruza dihbrida)
3. MAPEO CROMOSMICO
Bibliografa: Griffiths o cualquier otro libro de gentica.
Gua Terica:
1) Cmo y cuando se encontr el fenmeno de ligamiento entre genes? Por qu contradice las leyes de
Mendel?
R: A principios del siglo XX se encontraron genes
que no respondan a la segunda ley de Mendel. En ese
momento no se conoca la base fsica (teora cromosmica de la herencia) pero el descubrimiento del
ligamiento ayud mucho a postular esta hiptesis,
luego comprobada. Actualmente se sabe que, en los
organismos diploides, hay 2 copias homlogas de cada cromosoma que pueden llevar alelos distintos del
mismo gen. Estas copias segregan en igual proporcin
que las gametas, de acuerdo a la primera ley de Mendel. Si consideramos 2 genes ubicados en cromosomas
diferentes, stos segregarn al azar, obtenindose proporciones similares de gametas parentales y recombinantes (primera ley de Mendel). Si, en cambio, los 2
genes se ubican en el mismo cromosoma, no segregan
en forma independiente sino que tendern a segregar
juntos. Se dice, entonces, que estos genes se encuentran ligados. En este caso las gametas sern nicamente parentales, no formndose recombinantes. Es como
si los dos genes fueran en realidad uno slo. Sin embargo, durante la primera fase de la meiosis, se producen entrecruzamientos entre cromosomas homlogos
que resulta en un intercambio fsico como lo demostraron Creighton y Mc Clintock en 1931 utilizando
marcadores citolgicos combinados con marcadores
genticos. Estos entrecruzamientos se visualizan como
quiasmas a nivel citolgico. Si imaginamos una distribucin aleatoria de los entrecruzamientos a lo largo
del cromosoma, la probabilidad de que ocurra un entrecruzamiento es aproximadamente proporcional a la
distancia que separa a los genes en el cromosoma:
cuanto ms separados se encuentren, ms probable es
que ocurra un entrecruzamiento entre ellos. En consecuencia, determinando la frecuencia de recombinantes, podemos obtener una medida de la distancia entre
los genes ligados. Esta es la base para la construccin
de mapas genticos.
El mapeo gentico se realiza mediante anlisis de cruzamientos planificados, pruebas de progenie y anlisis
de pedigr. Es decir, mediante el anlisis comparativo
de fenotipos recombinantes. El mapeo fsico se realiza mediante el anlisis de clones genmicos (mediante
mapeo de contigs de los cuales se conocen, por ejemplo, sus mapas de restriccin), combinado con secuenciacin nucleotdica, por hibridacin in situ, u
otros mtodos que no involucran cruzamientos y anlisis de recombinantes. En este caso, las distancias se
calculan en nucletidos o mediante medicin de cromosomas.
2) Cundo se dice que 2 genes estn en acoplamiento o en repulsin?
R: Alelos mutantes ubicados en el mismo cromosoma
o separados en los 2 cromosomas homlogos.
Acoplamiento: AB ; Repulsin: Ab
ab
aB
3) Qu relacin existe entre ligamiento y mapeo?
R: Establecer el ligamiento y calcular la distancia
permite en base a las distancias relativas de muchos
genes establecer un mapa gentico.
4) Cul es la base fsica del mapeo gentico? Qu
relacin tienen los estudios de mapeo gentico con los
entrecruzamientos y quiasmas que se observan en las
meiosis? Qu similitutes, relaciones y diferencias
existen entre el mapeo gentico y el mapeo fsico o
genmico?
R: Los genes son segmentos de ADN pertenecientes a
una larga molcula que constituye un cromosoma. Los
recombinantes para genes pertenecientes al mismo
cromosoma surgen porque en la meiosis hay entrecruzamientos (que se pueden visualizar microscpicamente en la forma de quiasmas) entre cromosomas
homlogos.
El mapeo gentico se realiza mediante anlisis de cruzamientos planificados, pruebas de progenie y anlisis
de pedigr. Es decir, mediante el anlisis comparativo
de fenotipos recombinantes. El mapeo fsico se realiza
mediante el anlisis de clones genmicos mediante
mapeo de contigs (de los cuales se conocen, por ejem-
11
plo, sus mapas de restriccin), combinado con secuenciacin nucleotdica, por hibridacin in situ, u
otros mtodos que no involucran cruzamientos y anlisis de recombinantes.
Las distancias se calculan en nucletidos o mediante
medicin de cromosomas.
El orden fsico de los genes en el cromosoma coincide
con el orden que surge de su mapeo gentico. Existe,
adems, una correspondencia proporcional relativa
entre distancia gentica y distancia calculada en nucletidos, aunque la correspondencia no es absoluta y
vara en distintas partes del cromosoma. Es decir, una
unidad de mapa significa un nmero distinto de nucletidos cerca del centrmero que cerca del telmero,
porque las frecuencias de entrecruzamiento (formacin de quiasmas) son distintas. La vecindad de regiones heterocromticas tambin afecta la frecuencia de
aparicin de quiasmas y la relacin absoluta entre distancia gentica/distancia fsica.
5) Qu es y cmo se hace una prueba de 2 puntos?
Qu significa la palabra punto en prueba de 2 puntos? Implica ligamiento?
R: Se estudia el ligamiento en cruzamientos de dobles
heterocigotas por dobles recesivos (Ver libro para una
explicacin ms completa)
6) Qu es una unidad de mapa? Es sinnimo de
centiMorgan, frecuencia de recombinacin o de unidad de recombinacin? A cuntos nucletidos equivale una unidad de mapa?
R: Se define como unidad de mapa a la distancia entre
genes (o marcadores) para los cuales se observa un
recombinante con una probabilidad de uno en 100
productos de la meiosis. Una unidad de mapa sera,
entonces, equivalente a una frecuencia de recombinacin del 1%. Es decir, que se calcula mediante la
frmula del % de recombinantes sobre totales y es
sinnimo de unidad de recombinacin. Los cM tienen
otra frmula de clculo que toma en cuenta la posible
existencia de dobles entrecruzamientos y la interferencia. No siempre coinciden. Como se mencion, la
unidad de mapa gentico vara (en nmero de nucletidos) segn la especie, el cromosoma y localizacin
dentro del mismo cromosoma. Groseramente, 1 cM
equivale a 1 megabase (un milln de pares de bases)
en humanos.
7) Pueden 2 genes estar ligados a ms de 50 u.m.?
Por ejemplo, pueden estar a una distancia de 200
u.m.? Qu es un grupo de ligamiento y a qu se corresponde fsicamente?
R: Primero, hay que ver de dnde sale este lmite de
50 u.m. Al momento de la meiosis, cada cromosoma
del par de homlogos se halla conformado por 2
cromtides. Es decir, al momento del apareamiento en
el que se produce el entrecruzamiento tenemos 4 cadenas de ADN vecinas. Sin embargo, slo 2 de las 4
hebras participa en el entrecruzamiento, por lo que,
como resultado, slo la mitad de las gametas podrn
ser recombinantes. O sea que entre 2 genes ubicados
en el mismo cromosoma que estn lo suficientemente
lejos como para que siempre exista un entrecruzamiento entre ellos, la mxima proporcin de recombinantes ser del 50%.
Por lo tanto, 2 genes pueden estar ligados a ms de 50
u.m., pero no lo puedo determinar mediante una simple prueba de 2 puntos entre ambos genes analizados,
porque la mxima distancia determinable por este
mtodo es de 50 u.m. Necesito un gen puente (o
varios) para poder integrar a los dos genes en el mismo grupo de ligamiento. Por lo tanto, un grupo de
ligamiento est formado por el conjunto de genes (o
marcadores genticos) que se comportan como ligados
entre s en forma directa o a travs de otros genes
puente. El grupo de ligamiento se corresponde a
todos los genes o marcadores genticos localizados en
el mismo cromosoma o molcula de ADN. Se llama
desequilibrio de ligamiento al fenmeno que se da
entre dos alelos de dos genes distintos que se heredan
juntos con una probabilidad mayor que la dada por el
azar. Esto se debe en general a que los genes estn
ligados.
8) Qu es una prueba de 3 puntos? En una prueba
de 2 puntos, se puede establecer un orden de los genes? y en una de 3? hasta qu punto?
R: Cuando se estudia el ligamiento simultneo entre 3
genes (por ej. A, B y C), se puede establecer un orden
ya que (suponiendo que el orden sea ABC), la distancia (prueba de 2 puntos) entre A y C es aproximadamente igual a la suma de la distancia entre A-B + B-C.
En una prueba de 2 ptos. no se puede establecer un
orden, slo distancias relativas. En la de 3 s, pero no
se sabe si los 2 puntos extremos (A y C) estn a la
derecha o a la izquierda.
9) Porqu no hacer 2 o 3 pruebas de 2 puntos? Dan
distintos resultados? Por qu? Qu es interferencia y
cmo se calcula el coeficiente de coincidencia?
R: Pueden dar resultados distintos por el fenmeno de
subestimacin de dobles entrecruzamientos y/o de
interferencia. En el ejemplo de arriba, la distancia entre A y C (medida como prueba de dos puntos) suele
ser menor a la de A-B + B-C. Esto se debe a la presencia de de entrecruzamientos dobles entre Ay C cuyo resultado final es la formacin de gametas parentales AC y ac para estos 2 genes que se computan como
No recombinantes, cuando en realidad lo son. Si nosotros no hubiramos mapeado el gen B nunca hubiramos detectado estos dobles entrecruzamientos (ni triples, ni cudruples). Si extendemos este pensamiento,
en realidad tampoco sabemos si entre A-B hubo entrecruzamientos dobles y si tambin estamos subestimando la proporcin de recombinantes entre A y B.
Cuanto ms grande la distancia entre 2 marcadores,
ms inexacta ser la frecuencia de recombinantes como medida de la distancia entre los genes. Adems,
est el fenmeno de interferencia que se relaciona con
un impedimento estrico o fsico que reduce la probabilidad de que se produzcan Adems, est el fenmeno de interferencia que se relaciona con un impedimento estrico o fsico que reduce la probabilidad de
12
Problemas:
1) En el gusano de seda Bombix mori, el gen recesivo
l produce color amarillo limn en la larva, mientras
que el L da color blanco. El dominante B, produce
bandas negras transversales, mientras que el recesivo
b no las produce. Ambos loci estn ligados y su distancia gentica es de 30 unidades de recombinacin.
Se cruz una hembra homocigota blanca y con bandas
con un macho amarillo sin bandas negras. Los machos
de la F1 se utilizaron para fecundar hembras amarillas
y sin bandas negras. Qu segregacin fenotpica y
genotpica se obtuvo?
2) a) En Drosophila y para caracteres autosmicos,
cuando se quiere realizar un cruce de prueba se utilizan hembras heterocigotas y machos homocigotas recesivos. Por qu no se hace el cruzamiento recproco?
b) En D. melanogaster se encuentra un gen letal a que
produce, en homocigosis, la muerte de la larva, y est
ligado con un 40% de sobrecruzamiento al locus B/b.
El alelo B produce un abdomen deforme y el b un abdomen normal. Se pide la segregacin fenotpica y
genotpica observable en los adultos en un cruzamiento entre un macho heterocigota en fase de acoplamiento y una hembra heterocigota en fase de repulsin.
3) Una mosca de la fruta con genotipo B R/ b r es
retrocruzada con una de genotipo b r/ b r. En el 84%
de las meiosis no ocurren quiasmas entre los pares de
genes ligados; en el 16% ocurre un solo quiasma entre
ellos. Qu porcentaje de la progenie ser Bbrr? a)
50%; b) 4%; c) 84%; d) 25% ; e) 16%. Explique.
4) En Lathirus odoratus hay un locus que codifica
para el color de las flores: P = prpura, p = rosa, y
otro locus para la forma de la semilla: R = semilla
redonda, r = semilla alargada. En la polinizacin de
una planta, resultado del cruce de lneas puras prpura
redonda por rosa alargada, con otra descendiente del
13
cruce rosa redonda por prpura alargada, se obtuvieron los resultados indicados: PR=99, Pr=44, pR=44,
pr=3. Existe ligamiento entre ambos loci?
5) En la descendencia de un cruzamiento prueba de un
triheterocigota se obtuvieron los siguientes resultados:
Fenotipos
Frec. abs.
ABD
50
ABd
32
AbD
538
aBd
600
abD
28
abd
62
Se desea saber: a) la fase del genotipo parental;
b) el locus central; c) las distancias genticas;
d) el valor de la interferencia.
6) En los ovarios de plantas superiores se forman
ncleos haploides que resultan de una meiosis y sucesivas mitosis sin citocinesis, formando una clula multinucleada llamada gametofito femenino (el ncleo
masculino se fusiona con uno de estos ncleos, que
acta como vulo). En algunas conferas, el gametofito femenino puede ser bastante grande; este hecho
permite que pueda ser extrado y analizado electroforticamente. Un rbol de pino es heterocigota para
los alelos electroforticos "rpido" (r) y "lento" (l) de
las enzimas alcohol dehidrogenasa (AdhF/AdhS) y fosfoglucomutasa (PgmF/PgmS). Se estudi electroforticamente una muestra de 237 gametofitos femeninos y
se encontraron los siguientes fenotipos: 23 AdhF
PgmF, 24 AdhS PgmS, 93 AdhF PgmS y 97 AdhS PgmF.
a) Estn estos genes ligados?
b) Calcule la distancia entre los genes Adh y Pgm y en
qu fase estn. Otro gen que codifica para la enzima
esterasa (Est) tambin presenta dos alelos: EstF y EstS;
el mismo est ubicado entre los loci Adh y Pgm. De la
misma muestra antes estudiada se obtuvieron los siguientes resultados. Calcule la distancia:
AdhF EstF PgmF:
7
AdhS EstS PgmS:
10
AdhS EstF PgmS:
14
AdhF EstS PgmF:
16
1
AdhF EstS PgmS:
AdhS EstF PgmF:
1
F
F
S
Adh Est Pgm :
92
96
AdhS EstS PgmF:
Total
237
c) Coinciden las distancias calculadas para AdhPgm? Explique.
d) Cul es el coeficiente de coincidencia y la interferencia?
7) El padre del Sr. Spock, segundo oficial de la nave
Enterprise, proviene del planeta Vulcano y su madre
del planeta Tierra. Los vulcaneos tienen sus orejas
puntiagudas (P), ausencia de glndulas adrenales (A)
y el corazn del lado derecho (R). Todos estos alelos
son dominantes sobre los alelos terrqueos.
Estos genes son autosmicos y estn ligados, tal como
se muestra en el mapa de ligamiento:
P/p
A/a
R/r
_l___________l____________l__
l__15 um____l___20 um____l
Si el Sr. Spock se casa con una terrquea y no existe
interferencia (gnica), Qu proporcin de sus hijos
mostrarn:
a) Apariencia vulcanea para los tres caracteres?
b) Apariencia terrquea para los tres caracteres?
c) Orejas y corazn vulcaneos, pero adrenales terrqueas?
d) Orejas vulcaneas pero corazn y adrenales terrqueas?
9) Bridges y Morgan realizaron numerosos cruzamientos en Drosophila melanogaster. En cierto experimento cruzaron machos sin alas (apterous) con
hembras de cuerpo negro (black). En la F2 obtuvieron
186 individuos salvajes, 85 apterous, 99 black y ninguno con ambos caracteres. Qu se deduce de los
resultados obtenidos?. Razone la respuesta.
10) Un genetista quiere mapear los genes A, B, J, D y
E mediante dos cruzamientos de tres puntos. El primer cruzamiento lo realiza con lneas puras para los
cinco genes. Despus, el investigador cruza los individuos de la F1 con individuos homocigotas recesivos,
y el fenotipo de la descendencia es como sigue:
ABJDE
316
ABJdE
31
AbJdE
130
AbJDE
17
abJdE
314
abJDE
39
aBJDE
140
aBJdE
13
Las lneas puras utilizadas en el segundo cruzamiento
son las siguientes: AABBJJDDEE x aaBBjjDDee.
De nuevo, el investigador cruza los individuos de la
F1 con homocigotas recesivos, obteniendo los siguientes fenotipos: ABJDE 243; ABJDe 155; aBjDe
237; aBjDE 165; ABjDe 62; aBJDe 46; aBJDE 58;
ABjDE 34.
Por trabajos previos el investigador sabe que los genes
D y E tienen segregacin independiente entre s.
a) Elaborar el mapa correspondiente a estos 5 genes y
determinar, si es posible, la distancia entre ellos.
b) Existe interferencia?
Mapeo II
11) El gen de resistencia al virus del mosaico del tabaco se ha tratado de mapear en tomate respecto a
marcadores moleculares que detectan RFLP. Se supone que existe un alelo que confiere resistencia, dando
un fenotipo totalmente resistente en homocigosis, y un
fenotipo parcialmente resistente en heterocigosis.
Existe una variedad de Lycopersicum peruvianum (especie emparentada al tomate) totalmente resistente al
virus pero con otras caractersticas agronmicas indeseables; y otra que es totalmente susceptible al virus
pero potencialmente atractiva agronmicamente. Al
cruzar individuos de ambas variedades se obtuvieron
plantas hbridas F1, parcialmente resistentes. Se presentan los resultados de RFLP, para tres marcadores
moleculares diferentes, de los individuos parentales y
de 20 individuos originados por autofecundacin de la
F1 (F2), acompaados de los resultados fenotpicos
14
A1A2
A1A2
A2A2
A1A2 ?
A2A2
13) Antes que aparecieran los microsatlites, los
RFLP se utilizaron, en el pasado, como marcadores
genticos para la identificacin de parentesco. En ciertos casos, p.ej. verificacin del vnculo abuelo-nieto
en ausencia de los padres, este tipo de pruebas constituyen la nica evidencia vlida de que se dispone. El
siguiente problema representa una simplificacin de
a) Definir los haplotipos para cada individuo analizado. Cules nios pertenecen, con alta probabilidad, a
cada familia? Para cules esta experiencia no es suficiente para decidir a qu familia pertenecen? Cules,
con seguridad, no pertenecen a ninguna de las dos?
b) Cree Ud. que el hecho de no considerar la existencia de eventos de recombinacin (entre cromosomas
homlogos) dentro del gen marcador en las meiosis de
los abuelos y padres puede llevar a conclusiones errneas?
14) Una pareja afligida llega a Ud. para que le de asesoramiento gentico. Su segundo hijo falleci poco
despus de nacer debido a una enfermedad gentica y
la madre esta nuevamente embarazada. El hijo fallecido ha sido el segundo en la familia afectado por la
enfermedad (el primer afectado ha sido un hermano de
su abuela paterna). Ud. dispone, a travs de estrategias
de clonado, de una sonda de la regin cromosomal
donde se ubica el gen involucrado en esta enfermedad
autosmica recesiva. Usando esa sonda, pudo construir un mapa de restriccin de dicha regin, y
adems, obtuvo datos que muestran que, en la poblacin, existe polimorfismo para sitios reconocidos por
15
Autoradiografa correspondiente
I1 I2 II1 II2 II3 II4 II5 II6 II7 II8 II9 II10 II11
4 kpb
3 kpb
1 kpb
Explique la variacin obtenida con la sonda dibujando
la regin cromosmica correspondiente.
a) Cmo se explica el tercer hijo?
b) Con qu probabilidad aparecer un individuo enfermo con el patrn de restriccin de la madre sana?
Tendran alguna utilidad estos resultados para aconsejar a las personas de esta familia?
16) El mosquito transmisor del dengue (Aedes aegypti) es una plaga endmica de climas tropicales, pero
que desde hace pocos aos est extendiendo su distribucin hacia Buenos Aires. Se encontr una variante
de mosquito que no transmite el temible virus. El
carcter se comport como dominante mostrando un
patrn de herencia mendeliana simple. Con el objeto
de introducir este carcter en la poblacin, comenzaron a realizarse cruzamientos. Como el carcter es
muy difcil de evaluar porque se requiere (para su anlisis) que el mosquito hembra pique huspedes infectados con el virus, se analizaron en cada generacin
los patrones de 50 microsatlites con el fin de determinar ligamiento entre alguno de ellos y el carcter de
resistencia. Slo uno de los marcadores (m25) mostr
ligamiento a este carcter y a una distancia de 5 cM.
Los patrones microsatlites observados cuando se utiliz este marcador en los genotipos homocigotas notransmisor y en el transmisor, respectivamente, fueron
como se ve en la figura. Si se cruzan las dos variantes
de mosquitos (no-transmiso-res x transmisores: generacin F0) se obtienen individuos heterocigotas con
fenotipo no transmisor (F1).
a) Qu patrones de micro- Tam. Trans NO
satlites y fenotipos de mole- misor trans
misor
transmisin
y
no- cular
transmisin presentarn los
descendientes de una F1 258 pb
cruzada por la lnea parental
transmisora? y
236 pb
b) en qu proporciones?
c) Como se explic ms arriba, para la determinacin
de los fenotipos slo se pueden utilizar las hembras.
Cmo hara si quiere evaluar a los machos de la retrocruza? Qu cruzamientos hara y qu resultados
esperara?.
17) Se desea hallar un marcador molecular asociado al
locus que determina resistencia al barrenador del tallo
(Diatraea saccharalis) en maz para utilizarlo en seleccin indirecta. Por esta razn se analiz el patrn
de bandas generado por 5 RAPD utilizando una poblacin de 23 lneas recombinantes endocriados provenientes de un cruzamiento entre un padre resistente
por otro sensible al ataque del insecto.
RESISTENTES
SENSIBLES
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10111213141516171819202122 23
A
B
C=
= = = = == ==
===
D
E
a) Qu marcadores son polimrficos?
b) Qu marcadores estn ligados al locus?
c) Calcule la distancia gentica.
d) Indique qu marcadores NO estn ligados al locus.
e) Indique el/los marcadores para los que, con estos
datos, no puede afirmar que estn ligados (o no).
18) Se realiz el anlisis de ADN de una familia numerosa en la cual ocurrieron casos de una enfermedad
16
4. ALTERACIONES CROMOSMICAS
Bibliografa recomendada
Griffiths y col. Captulos:
17- Chromosome mutation I: Changes in chromosome
structure; 18- Chromosome mutation II: Changes in
chromosome number
Lacadena, J.R. Gentica General. Conceptos fundamentales. (1999) Editorial Sntesis S.A., Madrid.
13- Variaciones cromosmicas estructurales
14- Variaciones cromosmicas numricas
Gua de estudio
1) Porqu las hemoglobinas humanas constituyen un
ejemplo acerca del papel evolutivo de las duplicaciones?
2) Cundo se dice que las inversiones son supresoras
o reductoras de la recombinacin. Nos referimos:
a) Al mecanismo citolgico o a su consecuencia
gentica?
b) A homocigotas o a heterocigotas estructurales?
17
Teniendo en cuenta que todas las deleciones estudiadas son letales en homocigosis y hemicigosis, y que
las hembras utilizadas en los cruzamientos eran hijas
de machos de fenotipo normal, deduzca cul es la posicin del locus sn en el mapa de cromosomas politnicos.
3) En la descendencia de un cruzamiento entre una
hembra normal de Drosophila y un macho, white (w)Bar (B), Bridges observ que una hembra no haba
heredado el carcter Bar del padre, pero era heterocigota para el carcter white. A esta hembra se la retrocruz con un macho w B, y las proporciones que se
obtuvieron en la descendencia fueron dos hembras a
un macho.
a) Cul es la explicacin ms simple de estas proporciones anormales?
b) Cul es el fenotipo de la descendencia?
Se cruzaron las hembras heterocigotas estructurales de
la descendencia con distintos machos que eran hemicigotas para los mutantes rudimentary (r), forked (f) o
fused (fu), que estn cercanos a Bar ( como lo muestra
el siguiente mapa):
1.1
55.1 56.5
57
59.5
__l_____________l______l______l______l___
w
r
f
B
fu
En los cruzamientos con machos forked se observaron
en F1 hembras forked; sin embargo, de los cruzamientos con machos r o fu no se obtuvieron hembras r ni
fu, respectivamente.
c) Cmo explicara estos resultados?
4) En un cromosoma de Drosophila persimilis se han
reconocido citolgicamente 8 regiones denominadas
a,b,c,d,e,f,g,h. Dentro de estas especies 4 razas diferentes tienen el siguiente orden cromosmico:
a) a h b d c f e g. b) a e d c f b h g. c) a h b d g e f c
d) a e f c d b h g.
Suponiendo que cada raza evolucion por una inversin paracntrica simple a partir de otra raza, muestre
cmo pudo haberse originado cada una.
5) En un heterocigota estructural para una inversin
paracntrica, un cromosoma tiene una ordenacin
12.3456789 y su homlogo 12.3765489.
a) En un meiocito se produce un entrecruzamiento en
la regin 4-5, durante paquitene qu se observara en
anafase I?
b) Cmo se observara la anafase I de otro meiocito
en el que se produce un entrecruzamiento en la regin
6-7?
c) En cul de los dos meiocitos ser mayor el tamao
del fragmento formado en Anafase I?
6) En cierta especie de Drosophila, que tiene los
cromosomas telocntricos, se conocen los loci A,a,
que est muy prximo al centrmero, B,b situado a 30
cM del anterior y C,c a 15 cM de B,b y a 45 cM de
Aa. Un macho de fenotipo normal capturado en el
campo se cruz con una hembra, perteneciente a una
poblacin de laboratorio, que es normal en todos los
aspectos, salvo recesiva para los tres caracteres antedichos. Toda la descendencia del cruzamiento fue de
fenotipo dominante. Cuando las hembras de este cruzamiento se sometieron a un cruzamiento de prueba
con machos de la poblacin de laboratorio se obtuvo
la siguiente descendencia:
Fenotipo
Nmero de individuos
ABC
4250
Abc
490
aBC
510
abc
4480
a) Explique por qu aparecen slo cuatro fenotipos.
b) De los datos de la tabla se deduce que la fraccin
de recombinacin entre A,a y B,b es 0,1. Cmo se
puede explicar esta discrepancia con los datos del
enunciado?
7) En hembras de D. melanogaster heterocigotas para
las siguientes 3 mutaciones: Bristle (Bl), mutacin
dominante ubicada en el cromosoma 2; Dichaete (D),
mutacin dominante ubicada en el cromosoma 3, y
eyeless (ey), mutacin recesiva ubicada en el cromosoma 4, fueron cruzados individualmente con machos
homocigotas para ey. La mayora de los cruzamientos
producen las 8 clases fenotpicas esperadas:
Bl D ey+; Bl D ey; Bl D+ ey+; Bl D+ ey; Bl+ D ey+; Bl+
D+ ey+; Bl+ D+ ey; Bl+ D ey
Seis hembras produjeron un nmero limitado de fenotipos que es el siguiente:
a) Bl D ey+; Bl D ey; Bl+ D+ ey+; Bl+ D+ ey.
b) Bl D ey; Bl D+ ey+; Bl+ D ey; Bl+ D+ ey+
c) Bl D ey; Bl D+ ey; Bl+ D ey+; Bl+ D+ ey+.
d) Bl D+ ey+; Bl D+ ey; Bl+ D ey+; Bl+ D ey.
e) Bl D ey+; Bl D+ ey; Bl+ D ey+; Bl+ D+ ey.
f) Bl D ey+; Bl D+ ey+; Bl+ D ey; Bl+ D+ ey.
Para cada una de estas hembras d la explicacin ms
simple de la causa que pudo restringir el nmero de
fenotipos de la descendencia (considere que los
quiasmas son terminales).
8) En el cultivar de centeno Ails (2n=14), que presenta polimorfismo para translocaciones recprocas, se
cruz una planta heterocigota para una translocacin,
que a su vez era heterocigota para 4 loci distintos
(AaBbCcDd), por una planta homocigota estructural
para la ordenacin normal, que tambin era homocigota recesiva para los 4 loci.
Los resultados obtenidos en este cruzamiento se indican en la tabla:
Configuracin meitica en metafase I
de los descendientes
Loci
5 II + 1 IV
7 II
.
A,a
Aa:50 aa: 9
Aa: 7 aa:57
B,b
Bb:33 bb:26
Bb:31 bb:33
C,c
Cc:59 cc: 0
Cc: 0 cc:64
D,d
Dd:30 dd:29
Dd:32 dd:32
a) Indique si alguno de los loci se comporta como ligado a la translocacin.
b) Cmo explica la ausencia de individuos cc con 5
II y 1 IV, y la de individuos Cc con 7 II?
18
1+
+
2n
n=26. Los hbbridos entre estas especies muestran los
sig
guientes arregglos cromosmicos duran
nte la meiosiis:
HIIBRIDO
C
Configuraciin meittica
een metafasee I
G. hirsutum x G. thurberi 13 II pequeoss + 13 I grandees
G.h
hirsutum x G.herbaceum 13 II grandes + 13 I pequeoos
G.tthurberi x G.hherbaceum 13 I grandes + 13 I pequeos
5. GENM
MICA Y P
POSTGEN
NMICA
A
Gu
ua de estud
dio
1) Para qu siirven los marrcadores gen
nticos (moleecularres y no moleeculares)?
R: Para mapeaar. Existen distintos mto
odos de mappeo:
fsico y gentiico. Los mappas fsicos se
s construyeen a
parrtir de la seecuenciacin del ADN y otras tcniicas
19
moleculares, como el mapeo con enzimas de restriccin (como se vio en la gua 1 Biologa Molecular-)
usando o no Southern blot, la hibridacin in situ, la
alineacin de insertos genmicos clonados en BAC y
YAC, caminatas cromosmicas, comparacin sintnica de genomas filogenticamente relacionados, etc.
Los mapas genticos se construyen a partir de anlisis
de ligamiento en poblaciones segregantes posteriores
a la recombinacin y sumando distancias entre loci
sucesivos lo ms prximos posibles (ver gua 7 de
mapeo). Ambos mapas no coinciden en cuanto a las
unidades utilizadas (nmero de nucletidos o pares de
bases versus unidades de recombinacin) ni en las
distancias relativas (las frecuencias de recombinacin
no son parejas a lo largo de todo el cromosoma), pero
s en el orden de los marcadores.
2) Compare el uso de marcadores genticos moleculares, bioqumicos y morfolgicos.
R: Su uso para mapeo gentico es similar, salvo cuando los marcadores morfolgicos estn determinados
por ms de un locus (epstasis) o son de distribucin
continua (cuantitativos). Pero an en estos casos
existen formas de utilizarlos que se vern en otras guas. Los marcadores morfolgicos pueden verse influidos por el ambiente, el momento de desarrollo, el
rgano y otros factores. A menos que se conozca su
base molecular (secuencia nucleotdica) no pueden ser
usados para mapeo fsico (salvo que sean marcadores
citogenticos = morfologa cromosmica). Los marcadores bioqumicos (fundamentalmente patrones de
electroforesis de protenas e isozimas), tienen particularidades intermedias.
3) En qu medida los marcadores moleculares permiten relacionar los mapas genticos con los mapas fsicos?
R: Porque se puede relacionar su localizacin gentica con su hibridacin y mapeo fsico en clones genmicos alineados de BACs y YACs. Una serie de clones solapados se denomina contig. Para formar el contig, se emplean secuencias cortas y nicas presentes
en los insertos clonados como si fueran marcas distintivas (por ejemplo, un sitio de restriccin en el contexto de la secuencia nucleotdica de un gen que se puede
revelar mediante un RFLP). Esas marcas especficas
se denominan STS (sequence-tagged sites). Es decir
que un RFLP determinado puede ser un STS. Debido
a lo tedioso y poco automatizable de la tcnica de
RFLP; como usualmente se conoce la secuencia nucleotdica, se la convierte en una tcnica basada en
PCR llamada CAPS. Como estos mismos RFLP
(CAPS) pueden mapearse poblaciones segregantes,
esto permite superponer el mapa gentico con el mapa
fsico.
4) Cmo clasificara de acuerdo a la metodologa a
las distintas tcnicas conducentes a obtener marcadores genticos moleculares (RFLP, AFLP, RAPD, SSR,
SNP). Haga una comparacin entre ellas.
R: Los RFLP fueron los primeros marcadores de ADN
en ser utilizados. Surgen de comparar los patrones de
20
ciador (primer) en la reaccin de PCR. Son polimorfismos para fragmentos de ADN amplificados al azar
del genoma, obtenindose una serie de bandas de distintos tamaos segn donde se haya pegado ese primer. Este conjunto de bandas sirve como una huella
de ADN que puede emplearse para caracterizar a un
individuo. Se dice que es al azar pues se utilizan primers que no se sabe en qu lugar del genoma hibridan. Por eso se dice que son annimos porque se desconoce la secuencia y (salvo mapeo especfico) su
localizacin cromosmica. Como son oligonucletidos de 10 bases, en general pegan en varias regiones
del genoma, por lo que al correr el producto de la PCR
en geles de agarosa, generalmente se observan varios
fragmentos, que miden hasta 2 kpb. Otra desventaja es
que son marcadores dominantes (no se puede diferenciar al heterocigota del homocigota) y problemas de
reproducibilidad. Su mayores ventajas son los costos y
la posibilidad de usarlos con cualquier genoma de
cualquier especie aunque se desconozca absolutamente todo de su secuencia genmica. Al igual que los
RFLPs, se los puede mejorar secuenciando y convirtiendo en marcadores de PCR especfica (en este caso
se llaman SCARs). Los AFLP representan una sofisticacin ms reproducible que combina restriccin con
endonucleasas y amplificacin selectiva por PCR. Si
bien comparte desventajas y ventajas con los RAPD
(son dominantes y annimos, no requieren de informacin genmica previa), son ms costosos pero su
mayor costo se ve compensado por la generacin de
muchas ms bandas polimrficas por corrida (data
points) y mayor reproducibilidad.
RFLP
AFLP
RAPD
SSR
SNP
4) Cul es el origen de la variacin genmica (mutaciones) detectada por cada una de ellas y cul es su
magnitud?
RFLP
AFLP
RAPD
SSR
SNP
21
22
el cual se someti
s
a coorte por una enzima de restricr
cin apropiiada y posterior electrofforesis, cuyoo Southern blot see analiz porr hibridacinn con el fagoo M13
(sonda de Jeffreys,
J
Natuure 314 [19885]: 67-72). En un
carril paraleelo se corri, en idnticaas condicionees, una
muestra de DNA de liinfocitos dell sospechosoo Jack
Destripadorrius. En la figgura se muesstra el resultaado de
la corresponndiente autorrradiografa:
I.- Si Ud. fuera
f
Watsoon (no James), cul de las siguientes afiirmaciones creera
c
correccta para asessorar a
Sherlock?:
a) Jack es presumiblem
mente culpabble porque laa sonda
hibrida tantto con el DN
NA de la maancha como con el
de Jack. La diferencia enn el patrn de
d bandas se debe a
que el sem
men contienee gametas y estas refleejan la
constitucinn haploide. Para
P
confirm
mar la culpabbilidad
habra que repetir el annlisis con una
u muestra de semen de Jackk.
b) Jack noo es culpablee porque los patrones sonn diferentes a peesar de que ambos DNA
As hibridan con la
sonda y com
mparten buenna parte del patrn
p
de banndas.
c) El presuunto culpable pas a ser el hermano prfugo de Jackk (con anteccedentes polliciales) porqque el
patrn de bandas de Jacck no coincidde, pero las bandas
b
comunes (aaproximadam
mente la mitad
m
de toddas las
bandas) haccen sospechaar de l. Se requiere, siin embargo, un annlisis del DNA
D
del joveen escurridizzo para
confirmar esta hiptesiss.
II.- Dado que
q estas secuencias son tan hipervarriables
(muy polim
mrficas), se supone
s
que la
l tasa de muutacin
(creacin de
d nuevos alelos por el mecanismo de recombinacin desiguaal o porr deslizam
mientoresbalamiennto de la DN
NA polimeraasa) en gameetas es
considerable (se calculaa un = 0,0001). Cree Ud.
U que
se puede ussar este tipo de anlisis para
p
tests de paternidad?
III.- Qu % de bandass coincidentees se esperarra encontrar, com
mparando loss patrones dee bandas de perso:
nas relacionnadas por loss siguientes parentezcos?
p
- madre e hijo
- abuelo y nieto
- to y sobbrino
2) Mediantee hibridacinn in situ, se pudieron localizar
5 YACs dee DNA humaano (YAC-A
A a YAC-E) en
e una
regin crom
mosmica detterminada deel genoma huumano
y se desea hacer un mapa
m
fsico de
d alineamiennto de
dichos clonnes (mapa dee contigs). Los 5 clones fueron
evaluados mediante
m
hibridacin conn 3 STS (sequuencetagged sitees o sitios de secuenncia indicaddora
marcadora-)).
Para obteneer los STS, se
s digiri DN
NA con una enzima
e
de restriccin y se connstruy una genoteca enn fago
lambda conn los fragmenntos resultanntes. Se anallizaron
varios de loos clones de esta genoteca mediantee hibridacin conn DNA genmico
YAC
humano, descartando
d
todos STS
S A B C D E
aquellos cloones que hibrida- 1
+ + + - ban con DN
NA repetitivvo. De 2
- + + + aquellos quue hibridaban con
3
+ + - - +
23
c) Podr hacer
h
una esttimacin de qu proporccin de
los genees est impliicado, directta o indirectaamente
con el proceso
p
de essporulacin?
d) A qu se dedica el resto de los 6000 genes??
4) Pas sin llamar muchho la atencin una pelcuula estrenada hacce unos
llamada
aos
GATTACA
A (que
no debe su nombre
a una gatta muy
agresiva sinno a una
secuencia nucleotdica y a la vez
nombre de un centro de viajees al espacio del futuro
cercano). Se
S trata
de un tpicoo thriller
con ambieente de
ciencia-ficccin que
se plantea un
u escenario futurro muy
inquietante (ms
detalles
en:http://ww
ww.spe.sony.com/Picturees/SonyMviees/mov
ies/Gattaca//home.html).. Gracias a la tecnologga del
genoma hum
mano, se poddr predecir con
c bastantee precisin las proobabilidades de morir, por
p ejemplo, de un
ataque carddaco antes de los 30 aoos. Hasta aquu nada
nuevo que no hayan deestacado toddos los diariios comentando las posibilidaades de la ciiencia real a partir
de la secuenciacin dell genoma huumano. La pelcula
avan-za en otro aspecto que es la poosibilidad de planificar la com
mposicin genntica (a-leloos) de los hi--jos de
una pareja. No lo hacee en un senttido tan decllaradad ojos
mente fasciista (que todos sean arios, rubios y de
azules estiloo Los nios de Brasil)), sino tratanndo de
evitar los alelos
a
de la llamada
l
cargga gentica (alelos
que predispponen a enfe
fermedades coronarias,
c
c
cncer,
neurolgicaas, etc.). No se
s trata de cclonar un Hitler
H
o
un premio Nbel,
N
sino de
d elegir entrre los futuros hijos
posibles dissponibles, los mejores alelos
a
del padre
p
y
la madre deel futuro hijjo/a, sin desspreciar los clsicos color de
d ojos, coefi
ficiente inteleectual o alturra.
a) Le pareece que esto sea factible en la cienciaa real?
Si Ud. fueraa un cientficco convenciddo de las bonndades
de liberar a la especie humana de su carga genntica,
basndose en
e las tcniccas que apreendi sobre clonacin e ingenniera gentica en animaales (que no es
e este
caso) Cm
mo diseara un sistema de anlisis de
d este
tipo?
b) Si bien en
e una parte de la pelcuula, en menoos de 5
minutos puueden generaar un largo diploma
d
con la secuencia nuccleotdica de una muestraa sacada de un pelo, an en el mejor esscenario futuuro (en el sentido
s
cientfico), no se podrn secuenciarr los 30.000 genes
humanos paara una apliccacin masiva como la menciom
nada Qu tipo de maarcadores moleculares
m
t
tendra
qu
ue utilizar parra esta detecccin? Podr detectar toodas
lass mutacioness posibles? D
Discuta este punto.
p
c) Despus de resolver el ltimo probllema de la gua
g
de mutaciones le parece qque librar a laa humanidadd de
tod
dos los aleloos deletreoss es un objeetivo alcanzaable
po
or mejoramiiento?
Para
P
premiaar la planifficacin gen
ntica familiaar,
la sociedad dee GATTACA
A se divide en
e 2 clases bien
b
diferenciadas. Aquellos que fueron planificaddos
tieenen acceso a los mejoores empleoss, mientras que
q
aq
quellos que son hijos ddel azar so
on considerados
in
nvlidos o de-gen-eraados y slo pueden ser barreenderos o tenner profesionnes mal pagaas. En la pelcula, una familiaa tiene 2 heermanos (uno
o de cada cclasee). El hermaano no planifficado genticamente innferio
or logra enngaar al sisstema y acceeder a un buuen
em
mpleo aproveechando la ccomplicidad de una persoona
g
genticamentte calificada que le da muestras
m
de tejit
do
o (de su DNA
A, bah). Toddo va bien haasta que se prop
du
uce un asesinnato y.... no le vamos a contar la paarte
su
ustanciosa dee la pelculaa. El tema es
e que hay una
u
cchica linda (ni
( ms ni m
menos que Um
mma Thurm
man)
qu
ue se enamorra del muchaacho que, si bien ser geenticamente infeerior, es tam
mbin tan bueno
b
y linndo!
Bu
ueno, la chicca lleva peloos a una em
mpresa que, por
pocos dlares, le analiza ((por computaadora) la hueella
dig
gital gentica de identiddad del muchachito (obvviameente tiene suus dudas y nno es cuesti
n de juntar sus
aleelos con un desconocido)
d
).
d) Es esto poosible? Qu tcnicas utilizara para poderr hacer una cosa as? (noo estamos haablando de prep
dissposicin a enfermedades
e
s, sino de ideentidad).
5) Mgy y coolaboradoress (Genome Biology,
B
20002)
pu
ublicaron un trabajo de iidentificacin
n de ESTs (se(
cuencias transccriptas) espeecficamentee expresadas en
el corazn. Enntre los ESTss identificados encontrarron:
NA
ADH dehidrogenasa, ubiiquinona, miosinas, troopomiiosina y actinna (involucraados en la co
ontraccin musm
cular), coliginaa (interactaa con el colgeno cardacco),
13 no mostraroon poseer fuunciones relaacionadas (haasta
estte trabajo) con
c el corazn y 11 no tenan funccin
alg
guna conocidda. Adems, 5 de ellos (TG114,
(
TG
G13,
TG
G131, TG1332_7, TG78)) fueron rellacionados prep
viaamente con problemas
p
caardacos. Es decir, la enffermeedad se relacciona con la malfuncin de los mism
mos.
Laa figura muesstra la topolooga de la reg
gin regulatooria
en el extremo 5
5 de 17 prom
motores de genes
g
cardaccos.
Fig
gura CAAT
T, GC, TAT
TA y CAP son secuenccias
con
nsenso relacionadas a la unin de la RNA polimeerasa II. Otros mootivos llamaados TRANS
SFAC y MEM
ME
se representan como puntaas de flecha. Los cuadrados
osccuros (GKLF
F) representaan sitios de unin
u
de un facf
torr de transcripcin pareciido al Krpp
pel de Drossophilla. Similarm
mente, (Tcf111 _Rora, TC
Cf11_API_C)) se
rep
presentan otrros motivos nnucleotdicoss identificadoos.
a) Qu son y qu funcinn cumplen estas
e
secuenccias
en la regin 5 no codificannte de estos genes?
g
24
25
le esquematizar (en el opern lac) un segundo operador que es el sitio de unin (reconocimiento) de la
protena CAP, que servira para que el opern lac
constituyera un ejemplo de regulacin negativa (represor) y positiva (activador CAP). No se suele esquematizar tampoco el promotor del gen I, ni los terminadores de transcripcin correspondientes y otras
secuencias no codificantes importantes del futuro
mensajero (por ej. la secuencia de unin a ribosomas
llamada Shine Dalgarno), los codones de iniciacin
(que muchos estudiantes suelen confundir con el nucletido +1) y los codones de terminacin de lectura.
2)
Qu mecanismos moleculares co y posttranscripcionales conoce que sean capaces de producir
una sustancial modificacin en la secuencia de un
transcripto primario? Describa los 4 tipos de procesamiento (splicing). Describa la edicin del RNA.
R: El procesamiento del ARN genera un ARNm maduro (para genes que codifican para protenas) o
ARNr a partir del transcripto primario. El capping
(agregado de una metilguanosina en el extremo 5), la
poliadenilacin (agregado de una cola de poli A en el
extremo 3), el splicing (remocin de intrones) son
ejemplos de modificacin co-transcripcional, mientras
que el editing (cambio de bases) y el NMD (nonsense
mediated decay) son ejemplos de mecanismos de modificacin post-transcripcional. Mediante sileciamiento post-transcripcional (o interferencia o quelling)
tambin se produce degradacin o inactivacin especfica de ARNs. Otro mecanismo muy utilizado en
bacterias es la utilizacin de aptmeros (secuencias
complementarias
de ARN ubicadas en la regin 5no
En el caso de genes procariotas, la situacin es ms
codificante
del
ARNm)
que, segn el tipo de plegacompleja dado que los genes individuales pueden
miento
secundario,
pueden
inducir terminacin temcompartir sus secuencias regulatorias con otros genes
prana
de
la
transcripcin
(atenuacin)
o el autoclivaje
formando operones (no siempre, el gen I del represor
del
ARN
mediante
ribozimas
autocatalticas.
del opern lactosa no conforma un opern sino que se
parece, en este sentido a los genes eucariticos). De- Muchos transcriptos sufren splicing alternativo, remobido a esto, en los libros se suele encontrar esquemas cin de intrones y unin de los exones de un gen.
de operones y no de genes individuales (ej. opern lac Como consecuencia de esta modificacin cotranscripcional se producen diferentes secuencias de
formado por los genes Z,Y,A, ver abajo).
ARNm que codifican distintas formas de protenas los
P
I
O
Z
Y
A
P
cuales sern tejido especficas.
Otro mecanismo de procesamiento es el ARN editing.
En este proceso la informacin contenida en una
molcula de ARN se ve alterada. Se trata de mecanismos que incluyen deaminaciones de C a U y de A a
I, y tambin inserciones y deleciones. Afecta ARNt,
Transcripcin
ARNr y ARNm. En este ltimo caso, se ve afectada la
En estos esquemas se suele incluir, adems de los 3 secuencia aminoacdica de la protena, de manera que
genes que conforman el opern, el gen del factor de la misma difiere de lo que se puede predecir a partir
transcripcin (I = represor) que est fsicamente liga- de la secuencia de nucletidos en la molcula de
do a 5 del opern, pero no a otros genes reguladores ADN. Se da mayormente en eucariotas y se relaciona
igualmente importantes (como el que codifica a la con la presencia de variantes de protenas segn el
protena CAPCRP- en el caso operon lac). No se sue- tejido.
26
27
28
secuencia). Estas estructuras secundarias se ven afectadas porque la propiedad de inters de estos aptmeros es que tienen una afinidad muy fuerte de unin a
un metabolito regulador (parecido al de una enzima
por su sustrato), cuya presencia modifica el patrn de
plegamiento del ARN desencadenando su degradacin
por una ribozima o por terminacin temprana de
transcripcin porque esta estructura secundaria acta
como terminador informando a la transcriptasa que
debe detener la transcripcin.
15) Qu relacin existe entre los cromosomas politnicos de Drosophila con la resistencia a metotrexato en fibroblastos?
R: En ambos casos se produce gran amplificacin de
ADN, programada a nivel de desarrollo y afectando
cientos de genes en el primer caso y como respuesta al
antibitico localizada en el gen de la dihidro folato
reductasa (DHFR) en el segundo.
16) El mapa del opern lac es: I P-O Z Y A
El promotor (P) es el sitio donde se une la RNA polimerasa antes de comenzar la sntesis de mRNA. El
operador (O) es donde se une el represor (en ausencia
de inductor) codificado por el gen I. Dados los genotipos de los siguientes diploides parciales, completar la
siguiente tabla con "+" si espera actividad de la protena codificada por "Z" (-galactosidasa) y de la codificada por "Y" (permeasa) o con "-" si no espera
actividad. Considere que las mutaciones indicadas por
"-" impiden:
que las correspondientes regiones no codificantes
del opern se unan al ligando especfico.
que las correspondientes regiones codificantes del
opern puedan originar por traduccin una protena
biolgicamente activa.
Is: gen del represor con una mutacin que origina una
protena incapaz de unirse al inductor (pero su capacidad de unirse al operador est intacta).
Genotipo
I+ P+ O+ Z+ Y+/I+ P+ O+ Z+ Y+
I- P+ O- Z+ Y-/I+ P+ O+ Z- Y+
I+ P- O- Z- Y+/I- P+ O- Z+ YIs P+ O+ Z+ Y-/I+ P+ O+ Z- Y+
Is P+ O+ Z+ Y+/I- P+ O+ Z+ Y+
I- P+ O- Z+ Y-/I- P+ O+ Z- Y+
I- P- O+ Z+ Y+/I- P+ O- Z+ YI+ P+ O+ Z- Y+/I- P+ O+ Z+ Y-
galac- Permeasa
tosidasa
+lac -lac -lac +lac
R:
galac- Permeasa
tosidasa
Genotipo
+lac -lac -lac +lac
I+ P+ O+ Z+ Y+/I+ P+ O+ Z+ Y+ +
+
I- P+ O- Z+ Y-/I+ P+ O+ Z- Y+
+
+
+
I+ P- O- Z- Y+/I- P+ O- Z+ Y+
+
Is P+ O+ Z+ Y-/I+ P+ O+ Z- Y+
Is P+ O+ Z+ Y+/I- P+ O+ Z+ Y+
I- P+ O- Z+ Y-/I- P+ O+ Z- Y+
+
+
+
+
I- P- O+ Z+ Y+/I- P+ O- Z+ Y+
+
I+ P+ O+ Z- Y+/I- P+ O+ Z+ Y+
+
Problemas:
1) La figura muestra la estructura de un plsmido. El
gen R del fago lambda codifica un represor que reprime la transcripcin de ciertos genes del fago controlados por el promotor/operador PL; pero en este
caso, R tiene una mutacin tal que la protena codificada resulta termosensible: reprime a 30C, pero no
reprime a 42C porque su estructura 3-D se altera dramticamente. El gen R lleva su
R
PL
propio promotor PRM que, a
los efectos de este problema,
PRT Zrev
consideraremos constitutivo.
El gen Zrev contiene la secuencia codificante de la gal de E.coli en orientacin antisentido con respecto a
su promotor: PL. Con este plsmido se transforman
mutantes de E.coli con distintas caractersticas genotpicas, las cuales se detallan en la tabla. Completar con
+ o con "-", segn si espera o no actividad enzimtica.
pls
Actividad -gal
mi30 C
42 C
do s/IPTG c/IPTG s/IPTG c/IPTG
I-P+O+Z+
S
I+P-O+Z+
No
I-P+O-Z+
S
I+P+O-ZS
IsP+O+ZNo
I-P+O+Z+/ I+P+O+Z- S
Para aquellos casos en los que indic que no hay actividad de -gal, indique adems, para cada uno, si se
debe a:
I- inhibicin de la transcripcin
II- inhibicin de la traduccin
III- Produccin de una -gal inactiva
genotipo
genotipo
pls
mido
I-P+O+Z+
I+P-O+Z+
I-P+O-Z+
I+P+O-ZIsP+O+ZI-P+O+Z+/ I+P+O+Z-
Si
No
Si
Si
No
Si
Actividad -gal
30 C
42 C
s/IP c/IP s/IP c/IP
TG TG TG TG
+
+
II
I
+
+
II
- 30CIII/42CII
42C I
+
- 30CI/42CII*
2) La ribulosa bisfosfato carboxilasa (abreviada "rubisco") es una enzima localizada en el interior de los
cloroplastos. Permite fijar CO2 en la sntesis de triosas
en el estroma cloroplstico. Rubisco est formada por
dos tipos de subunidades, la subunidad grande (LSU),
codificada en el genoma del cloroplasto, y la subunidad chica (SSU), codificada en el genoma nuclear e
importada desde el citoplasma. Ambas son ensambladas entre s dentro del cloroplasto con ayuda de una
chaperona. El estudio de la regulacin de la expresin
de los genes LSU y SSU despert el inters de mu-
29
Luz
Osc.
(-90/-4)
eliminado
Luz
Osc.
Luz
Osc.
(-973/-90)
eliminado
1)
luz
oscuridad
luz
2)
oscuridad
d) De acuerdo a los resultados obtenidos, Qu tipo de
elemento regulatorio est contenido en la secuencia 973/-772 aislada del gen SSU?
3) Imagine que las sin-herculitis son una serie de enfermedades genticas en humanos producidas por defectos recesivos en la expresin del gen de la herculina, una protena asociada al desarrollo y tono muscular. La enfermedad no es mortal pero se caracteriza
por una tendencia a la flaccidez y la pereza.
Para analizar los distintos tipos de la enfermedad, se
dispone de biopsias musculares de individuos sanos
homocigotas, es decir no portadores (S) y de enfermos
(homocigotas) (X1, X2 , ...), adems de un mapa de
restriccin del gen de la herculina, un clon de cDNA
de longitud completa y anticuerpos anti-herculina.
Para comenzar se realiza una serie de experiencias de
Southern (DNA genmico cortado con la enzima
BamHI), northern y western blots que se muestran en
la figura.
Gen sano
E1
E2
500 pb
200 pb
BamHI
Luz
Osc.
(-972/-722)
eliminado
E3
800 pb
BamHI
BamHI
1000 pb
4000 pb
S X1 X2 X3 X4 X5
S X1 X2 X3 X4 X5
1,5 kpb
1 kpb
1)
-973
SSU
-772
P nos
cat
Southern
2)
-772
SSU
-973
Pnos
cat
Northern
S X1 X2 X3 X4 X5
50 kDa
Western
30
Dado que los pacientes X4 y X5 presentaban el mismo patrn de bandas en el Southern, en el northern y
en el western, y con el fin de determinar si ambos pacientes presentaban la misma alteracin, se realiz
otro experimento que consisti en la construccin de
plsmidos mediante fusin de: la zona 5' de un clon
genmico de la herculina de individuos enfermos con
un patrn tipo X4 y X5 (homocigotas) o de un individuo sano (S) + la parte codificante del gen de la gal. Luego se realizaron los siguientes experimentos
de transfeccin:
Lnea celular
Plsmido
Activ. -gal
Fibroblastos 3T3
p5S / CAT
--Fibroblastos 3T3
p5X4 / CAT --Fibroblastos 3T3
p5X5 / CAT --Mioblastos L6
p5S/CAT
+++
Mioblastos L6
p5X4 / CAT +++
Mioblastos L6
p5X5 / CAT --b) Cmo explica los resultados del experimento de
transfeccin?
c) Qu fenotipos tendrn individuos heterocigotas
con genotipos S/X1, S/X4, S/X5 y X4/X5?
d) Dibujar el resultado de Southerns (con enzima
BamHI) de individuos que sean portadores sanos de
los alelos recesivos X1, X2, X3 y X4.
e) En qu casos el polimorfismo de sitios de restriccin con la enzima BamHI ser til para el diagnstico prenatal de la enfermedad?
f) Si se crea un ratn transgnico con una copia del
gen humano sano completo y sabiendo que el gen sano de la herculina de ratn tiene el siguiente mapa de
restriccin para la enzima BamHI, dibujar los resultados de los Southern de ratones sanos (homocigotas)
transgnicos y no transgnicos hibridizados con una
sonda de herculina humana, a alta y baja sal.
BamHI
Fragmento
-1263 a 877
Extracto -
Fragmento
525 a 226
10C 28C
BamHI
BamHI
1800 pb
a) Qu conclusiones obtiene de los resultados de medicin de actividad de luciferasa en las plantas transgnicas?
b) Qu controles agregara al experimento con plantas transgnicas?
El resultado sorprende al estudiante por lo que se decide a realizar experimentos para determinar qu secuencias en cis regulan la transcripcin del gen. Para
ello asla los fragmentos 1263 a 877 y 525 a 226
y los marca en uno de los extremos 5, los incuba con
preparaciones de protenas nucleares de plantas de
tabaco cultivadas a distintas temperaturas, los trata
con DNasa I y separa los fragmentos por electroforesis en gel de poliacrilamida. De este experimento de
footprinting obtiene el siguiente autorradiograma:
5000 pb
4) Un estudiante de doctorado est decidido a encontrar los factores que regulan la transcripcin del gen
OMEGA8 en plantas. Se sabe que los niveles de
mRNA de OMEGA8 aumentan cuando se exponen las
plantas de tabaco a baja temperatura, aunque la funcin real de OMEGA8 es desconocida. Para lograr su
objetivo, el estudiante realiza una serie de construcciones gnicas donde fusiona fragmentos de la regin
5 upstream del gen OMEGA8 a la regin codificante del gen de la luciferasa. Acto seguido introduce dichas construcciones por transformacin en plantas de
tabaco. Cuando obtiene las lneas transgnicas, analiza
la respuesta del transgn a la temperatura y obtiene los
siguientes resultados:
Nota: bloque blanco = regin 5 upstream del gen
OMEGA8, +1= sitio de iniciacin de la transcripcin,
bloque negro = regin que codifica para luciferasa.
31
bas enzimas son estructural y bioqumicamente idnticas. El gen en cuestin tiene la siguiente estructura:
E1
E2
E3
Luc
Luc
3UTR
Con estas construcciones transfect clulas pancreticas y las someti a condiciones de stress o control durante 8 horas. Finalmente midi la actividad de luciferasa:
Construccin 1 Construccin 2
Control
3000
400
Stress
3000
2000
d) Qu puede decir del papel de la regin 3UTR en
la regulacin de la expresin de la enzima X?
7) Se desea desarrollar un mecanismo para expresar
genes en el cerebro de ratn en un determinado momento de su vida. Para ello Chen y col. disearon una
estrategia utilizando el sistema Tet off. El sistema
funciona de la siguiente manera: el gen de inters se
clona ro abajo de un promotor (pTetOp) inducible
por el factor de transcripcin tTA. A su vez el gen
tTA se clona ro abajo de un promotor tejido especfico. El mecanismo es el siguiente:
32
7. GENTICA DE POBLACIONES
Gua de Estudio:
1) a) En una poblacin en equilibrio:
Cul es la frecuencia de heterocigotas que puede
haber?Cul es la de homocigotas dominantes?Cul
es la de homocigotas recesivas?
b) La invariabilidad de las frecuencias gnicas de una
generacin a otra, implica que est en equilibrio (de
Hardy Weinberg) la poblacin parental?
c) La estructura gentica de una poblacin, viene
dada por sus frecuencias gnicas o por las genotpicas?
d) El conocimiento de las frecuencias gnicas de una
poblacin, implica conocimiento de su estructura genotpica? Y si la poblacin est en equilibrio H-W?
R:a) Frecuencias heterocigotas H=2.p.q < 0.50 (si hay
dos alelos), H = 1 - pi (si hay ms de dos alelos)
Frecuencia homocigotas dominantes
D=p2
Frecuencia de homocigotas recesivos
R=q2
b) La invariabilidad de las frecuencias gnicas de una
generacin a otra no implica que la poblacin parental
est en equilibrio. La generacin parental puede tener
D, H, R p 2, 2pq, q 2, pero llega al equilibrio en una
generacin de panmixia. Para que hablemos de equilibrio deben mantenerse constantes las frecuencias
gnicas y genotpicas.
c) La estructura gentica de una poblacin viene dada
por sus frecuencias gnicas y genotpicas. Si (D, H, R)
(p 2, 2pq, q 2 ) puede deberse a que no hay panmixia,
o que hay seleccin, deriva, mutacin, etc., que afectan la estructura gentica.
d) El conocimiento de las frecuencias gnicas de una
poblacin no implica el conocimiento de su estructura
genotpica, a menos que la poblacin est en equilibrio de Hardy-Weinberg.
2) En el caso de loci ligados a cromosomas sexuales,
cundo se considera que una poblacin se encuentra
en equilibrio?
R:En estos casos, el sexo heterogamtico presenta
solo dos genotipos, y el homogamtico tres. Por lo
tanto podemos describir sus frecuencias genotpicas
poblacionales de la siguiente manera:
AA
Aa
aa
A
a
P
H
Q
R
S
pBfB = frec. del alelo A en la poblacin femenina
qBfB = frec. del alelo a en la poblacin femenina
pBmB = frec. del alelo A en la poblacin masculina
qBmB = frec. del alelo a en la poblacin masculina
En este caso, 2/3 de los alelos totales de la poblacin
son transportados por el sexo homogamtico y 1/3 por
el sexo heterogamtico. Las frecuencias gnicas en
cada uno de los sexos sern diferentes si la poblacin
no est en equilibrio.
Siguiendo la nomenclatura asignada para cada uno de
los genotipos, la frecuencia del alelo A en las hembras
ser igual a:
pf = P + H
y en los machos
pm = R
En la poblacin total ser igual a: p = 2/3 pf + 1/3 pm
Si las frecuencias en ambos sexos no son iguales en
un comienzo, y se produce apareamiento aleatorio, las
frecuencias irn oscilando en los dos sexos hasta alcanzar el equilibrio cuando: pf = pm = p
Los machos obtienen sus genes ligados al sexo de la
madre, por lo tanto:
pm = pf de la generacin anterior (identificada con el
apstrofe).
Las hembras obtienen sus genes en igual proporcin
de los progenitores, por lo tanto,
pf = (pm + pf ) de la generacin anterior
En cada generacin se reduce a la mitad la diferencia
de las frecuencias gnicas entre los dos sexos, lo que
se desprende de la siguiente ecuacin:
pf - pm=pm+pf - pf=pm - pf= - (pm+pf)
Por lo tanto, el equilibrio no se alcanza en una sola
generacin de apareamiento aleatorio, sino en varias.
Las frecuencias se van acercando asintticamente al
valor medio poblacional, momento en el cual se alcanza el equilibrio.
3) Por qu, en teora, la consanguinidad no favorece
un incremento en la frecuencia de alelos recesivos en
una poblacin sino que solamente afectara la distribucin de alelos entre genotipos?
R:La falta de panmixia no modifica las frecuencias
gnicas sino las genotpicas. Entonces, por la consanguinidad p y q no cambian. El apareamiento entre parientes no afecta las frecuencias gnicas conjuntas,
sino que aumenta la frecuencia de homocigotas. La
consanguinidad har que los genes recesivos raros se
presenten en homocigosis con una mayor frecuencia
que si existiese apareamiento aleatorio en poblaciones
de tamao grande.
Problemas:
1) Una condicin anmica en el hombre llamada talasemia es determinada por un par de alelos codominantes. El genotipo homocigtico dominante TmTm produce una anemia grave (talasemia mayor) y el genotipo heterocigtico TmTn produce una anemia benigna
(talasemia menor). Los individuos normales son homocigticos TnTn. Se encontr que la distribucin de
esta enfermedad en una muestra de una poblacin italiana era de 4 con talasemia mayor, 400 con talasemia
33
EST
Nde indiv.
observados
1272
652
76
ADULTOS
Nde indiv.
observados
1032
508
60
EST
Nde indiv.
observados
1008
364
ADULTOS
c) Calcule
las
frecuencias allicas de este locus en esta poblacin y
diga si estn en equilibrio tanto en estado larvario
como adulto.
d) Compare la supervivencia larva-adulto de los tres
genotipos.
e) El producto nuevo utilizado afecta diferencialmente
algn genotipo? Por qu?.
34
P H
M
P H M
P H M
__ 117 __ __
157
__ __ 195
__ 155 __
193
__ __
113 __
153
__ __ 111
__ __ 149 __ __ __ 179
Locus 2
Locus 3
Locus 4
P H M
P H M
P H M
__ 166 __
205 __ __
104
__ __ 199
__ __ __ 156
__ 195
__ __ 88
__ __
185
Locus 5
Locus 6
P H M
__ __
115
__ __ __ 109
Locus 8
Locus 7
P H M
__
__ __
__ __
__
232
214
184
182
Locus 9
Frecuencias allicas:
Locus 2: 117= 0.18; 113= 0.16; 111= 0.1
Locus 3: 149= 0.01; 153= 0.32; 155= 0.1; 157=0.16
Locus 4: 179= 0.16; 193= 0.09; 195= 0.01
Locus 5: 156= 0.65; 166= 0.05.Locus 6: 185= 0.025;
195= 0.05; 199= 0.25; 205=0.13.
Locus 7: 88= 0.58; 104= 0.28
Locus 8: 109= 0.3; 115= 0.16
Locus 9: 182= 0.13; 184= 0.29; 214= 0.01; 232= 0.01.
A partir de estos datos calcule el ndice de paternidad
para cada locus (razn de verosimilitud hijo/ no hijo).
y el valor acumulado para
todos los loci.
8.- MUTACIONES
Guia de estudio
1) Explique los conceptos
siguientes:
- mutacin inducida
- mutacin espontnea
- clastgeno
- mutacin somtica
- mutacin germinal
- mutacin letal
- mutacin condicional
- mutacin polar
- reversin
R: clastgenos son mutgenos que producen ruptura
cromosmica. Son en general fsicos (Radiacin X,
por ejemplo) y no son detectables por el test de Ames.
Se requiere de ensayos cromosmicos (como el intercambio de cromtides hermanas) para ser detectados.
2) Indique las formas ms habituales de expresar la
probabilidad de que ocurra una mutacin.
3) Describa un proceso selectivo para aislar microorganismos revertantes de auxtrofos. Cmo se puede
demostrar que esas mutaciones revertantes son previas
al momento del contacto con el agente selectivo?
4) Defina los siguientes conceptos y d ejemplos:
- transicin (los 4 casos posibles)
- transversin (los 8 casos posibles)
- mutacin silenciosa
- mutacin neutra
- mutacin por corrimiento del marco del lectura (o
"frame-shift")
- mutacin por sustitucin "missense"
- mutacin por sustitucin "nonsense"
- mutacin supresora intragnica
- mutacin supresora extragnica
5) Diferencie los siguientes mecanismos de mutacin
espontnea:
- errores en la replicacin del ADN.
- lesiones espontneas
6) Con relacin a los errores en la replicacin del
ADN, con qu base se aparean por puentes de hidrgeno los siguientes nucletidos:
- la forma imino de C?
- la forma enol de T?
- la forma imino de A?
- la forma enol de G?
7) Indique dos tipos de lesiones espontneas que, de
no ser reparadas, pueden generar mutaciones.
8) Explique la causa por la cual las posiciones de 5metilcitosina constituyen "hotspots" para transiciones
C T G A.
Cul es la funcin de la uracil-DNA glicosidasa?
Cun especfica es la uracil-DNA glicosidasa?
Por qu no sera ventajoso para una clula tener uracilo como constituyente normal en su DNA? Qu
significado evolutivo tiene el hecho de que en eucariotas las zonas no codificantes tienen una mayor cantidad de A-T que las codificantes?
9) Describa un proceso selectivo para aislar microorganismos revertantes de auxtrofos. Cmo se puede
demostrar que esas mutaciones revertantes son previas
al momento del contacto con el agente selectivo?
35
36
13) Qu procedimiento y sistema selectivo se le ocurren a Ud. para obtener plantas resistentes a una sustancia txica?
R: Desde los aos 70 se sabe que las plantas que regeneran in vitro en ciertas condiciones son propensas
a sufrir mutaciones aunque algunos autores opinan
que las mutaciones pueden producirse previamente, en
las clulas somticas que originan el explante (tejido
vegetal del cual se parte para iniciar el cultivo de tejidos). Este fenmeno de mutagnesis por cultivo de
tejidos es conocido en la literatura como variacin
somaclonal (variacin por mutacin y somaclonal
porque las plantas se derivan clonalmente de clulas
somticas por regeneracin in vitro). El cultivo de
tejidos in vitro ofrece varias de las ventajas que tiene
el manejo de microorganismos, fundamentalmente, la
posibilidad de seleccionar en frascos aplicando un
agente selectivo al medio de cultivo, por ejemplo, un
antibitico (que es una sustancia txica). La frecuencia de variacin somaclonal puede ser incrementada
por el agregado de mutgenos al medio.
14) Explique el modo de accin de los siguientes
mutgenos y el tipo de mutacin (a nivel molecular)
que producen:
- los anlogos de bases (ej., el 5-bromouracilo)
- los modificadores de bases, como los agentes alquilantes (ej., etilmetanosulfato y nitrosoguanidina)
- aflatoxina B1
- los agentes intercalantes (ej., proflavina, naranja de
acridina, bromuro de etidio)
R: el 5-bromouracilo es un anlogo de T pero forma,
con mucha mayor frecuencia que sta un tautmero,
que en su forma enlica adquiere propiedades de apareamiento como las de C.
- etilmetanosulfato y nitrosoguanidina son capaces de
conferir alquilos a nucletidos, preferencialmente G,
confirindole propiedades de apareamiento iguales a
las de A.
- la Aflatoxina B1 producida por el hongo Fusarium,
est muy frecuentemente presente en alimentos (cereales, manes,etc.) y es un modificador de bases muy
especial, que forma un derivado de G, el cual es eliminado enzimticamente, generando un sitio apurnico. (Los sitios apurnicos pueden inducir un mecanismo de reparacin imperfecto, introduciendo una A
enfrente de esos sitios.)
- Los agentes intercalantes se ubican entre bases obligando a la polimerasa a producir inserciones o deleciones.
15) Mencione los mecanismos biolgicos de naturaleza enzimtica ms importantes en la reparacin del
ADN daado.
16) Explique en qu consiste el test de Ames. Por
qu se usan varias cepas mutantes de Salmonella?
17) Cules son las diferencias entre mutaciones
somticas y germinales? y entre mutgenos y oncgenos o cancergenos?
R: mutaciones somticas son aquellas que se producen en clulas pertenecientes a tejidos no reproducti-
37
R: A veces, el agente inductor no es de por s mutagnico sino que es metabolizado por alguna enzima celular especfica en condiciones especficas de pH, por
ejemplo, para producir un mutgeno/oncgeno. Para
investigar el potencial mutagnico de este tipo de
compuestos en los que el agente es un subproducto
metablico, el test de Ames puede ser adecuado convenientemente mediante el agregado de extractos celulares de los tejidos/rganos que se desea detectar, se
trata de un sistema bactetiano que guarda diferencias
con el de los humanos. Debido a esto, se desarrollaron
en los ltimos aos varios modelos murinos transgnicos. Por ej. el MutaMouse es un sistema que se
basa en un ratn transgnico que contiene unas 40
copias repetidas en tndem del genoma completo de
un vector comn en ingeniera gentica (el gt10) el
cual, a su vez, tiene una copia funcional del gen de la
-galactosidasa del opern lac. Al extraer DNA total
del ratn y mezclarlo con un extracto de empaquetamiento, estas copias del genoma de se encapsidan y
pueden infectar clulas de E. coli (lac-) y expresarse
generando placas azules en presencia de IPTG y Xgal. Si se recuperan placas translcidas, se atribuye a
mutacin y puede ser verificada por secuenciacin del
clon. La relacin entre placas blancas y las totales genera un coeficiente que se denomina frecuencia de
mutacin.
posible mutgeno o
carcingeno
extraccin
de DNA
de rganos
Problemas:
1) Se est estudiando un gen de E. coli que especifica
cierta protena. Una parte de la secuencia de la misma
es ala-pro-trp-ser-glu-lys-cys-his. Se obtuvo una serie
de mutantes de este gen que no mostraban actividad
enzimtica. Aislando los productos enzimticos mutantes se encontraron las siguientes secuencias:
Mutante 1: ala-pro-trp-arg-glu-lys-cys-his
Mutante 2: ala-pro
Mutante 3: ala-pro-gly-val-lys-asn-cys-his
a) Cul es la base molecular ms probable de cada
mutacin?
b) Cul es la secuencia de ADN ms probable que
especifica esta parte de la protena? Utilice el cdigo
gentico.
2) Un hombre (H.S.), empleado durante varios aos
en la planta nuclear de Springfield, se convierte en
padre de un varn hemoflico (B.S.), el primer caso en
el rbol genealgico tanto suyo como de su esposa
(M.S.). Otro trabajador de la misma planta durante
varios aos tiene un hijo enano acondroplsico, tambin el primer caso en su familia y en la de su esposa.
Los dos compaeros de trabajo demandan a su empleador (Mr. M.B.). Como genetista, lo llaman a Ud.
espontnea
5-Br-U
aflatoxi- Bromuro de
na
etidio
1
0
0
0
0
2
10-8
10-5
10-8
10-8
-8
-8
-5
3
10
10
10
10-8
-8
-8
-8
4
10
10
10
10-5
-5
-5
-5
5
10
10
10
10-5
a) Qu mutantes eligira para usar en el test de Ames
con el objeto de evaluar la potencial mutagenicidad
del nuevo edulcorante?
b) Si la mezcla de las mutantes elegidas + muestra a
analizar + extracto heptico produce crecimiento bacteriano en ausencia de histidina exgena (1 colonia de
cada 10.000 bacterias plaqueadas), otorgara Ud. el
permiso para la venta libre del edulcorante?
6) La 2-amino-3-metilimidazo[4,5-f]quinolina (IQ) es
una amina heterocclica aromtica que se podra formar durante la coccin de ciertas comidas. Como algunos compuestos de esta familia son genotxicos, se
38
c) A la luz de
d estos resuultados Conssidera Ud quue la
IQ produce una respuestta mutagnicca generalizaada o
especfica de
d tejido?
Para estudiaar si el mecannismo de acccin tiene alggo que
ver con el hipotetizado,
h
se secuenciaaron todas las placas blancas derivadas dee DNA de hgado y se tabbularon los porccentajes relattivos de tipo de mutacinn en
los controlees y en las traatadas con IQ
Q (recordar que
q se
trata de porccentajes relaativos y que si
s IQ producee, en
algn caso algn
a
porcenntaje menor al
a control, esso no
significa quue haya generrado un nm
mero absolutoo menor de placaas blancas quue el control))
Control IQ
Tipo mutaciin
Transicin
G
GC
AT
38% 15%
1
A
AT
GC
9%
1%
Transversin
G
GC
TA
25% 52%
5
G
GC
CG
16%
7%
A
AT
TA
3%
4%
Cambio de marco
+
+1
6%
1%
Cambio de marco
1
3%
1
19%
Delecin 2 pb
0%
1%
d) Detecta Ud algn tippo de mecannismo prefereencial?
Cul?
e) Todo lo anterior result importaante para la deteccin de muutaciones som
mticas (com
mo las oncoggnicas
o carcinognicas) Le parece que los ratones transgnicos tam
mbin podrann servir paraa estudiar muutaciones germinaales? Qu tejido
t
se le ocurre
o
que sera
s
el
ms apropiaado para estuudiar este asppecto?
10.- TRAN
NSPOSONE
ES
1) Expliquee la siguiente terminologa
- secuencias de insercinn
- transposonnes
- repeticionees invertidas
Secuencias dee insercin: traduccin
n de inserttion
seq
quences o IS,
I que fuerron descubiertas como taales
en genomas baacterianos, dee all su nom
mbre. Son traansposones simplees, autnomoos, ya que co
odifican paraa las
enzzimas que permiten
p
su ttransposicin
n (una transsposassa). En sus extremos coontienen secu
uencias inveertipor
das repetidas (casi idnticaas), que son reconocidas
r
la transposasa. Cuando se iinsertan en el
e genoma huusped, se produccen pequeaas repeticionees (direct reepeatss) a cada ladoo del transpoosn.
Trransposones: son fragmeentos discreto
os de ADN que
q
tienen la capaccidad de mooverse a otro
os sitios del genoma. Contrarriamente a loo que ocurree con plsmidos
y fagos,
f
su moovimiento see restringe all genoma huusped.
Reepeticiones invertidas:
i
inverted reepeats, los extreemos de los transposonees se caracteerizan por teener
seccuencias sim
milares (de all repeticion
nes) en orienntaci
n invertida la
l de un extrremo respecto
o de la del ottro.
2) Explique, a nivel moleccular, la form
ma de chupeetn
observada al microscopioo electrnico
o adoptada por
cad
denas simplees de DNA qque contieneen transposonnes,
lueego de desnaaturalizacin y lenta renatturalizacin.
R: Cuando seccuencias connteniendo traansposones son
desnaturalizadaas y renaturaalizadas, los extremos reepetid
dos invertidoos pueden reaaccionar en forma intram
moleccular, formanndo una estruuctura doblee cadena. Coomo
la transposasa no tiene regiiones repetid
das, se mantiene
com
mo ADN dee simple caddena. Los ex
xtremos inveertidos forman la base
b
de la esstructura de chupetn,
c
miientraas que la trannsposasa form
ma el cuerpo de la mismaa.
3) Cmo se cree
c
que hann evolucionad
do las bacterrias
ue hoy son reesistentes a vvarios antibi
ticos al missmo
qu
tiempo?
R: Existen traansposones ccompuestos, que llevan secuencias del husped.
h
Un ejemplo so
on aquellos forf
maados por dos IS. Dos IS ccercanos pueeden comporttarse como un nnico transpossn y llevar consigo las sel separan. En algunos de estos cassos,
cuencias que los
alg
gunas de las IS perdi la capacidad de
d transposiccin
y todo
t
se transspone como uuna unidad. En otros cassos,
am
mbas IS son funcionaless, pero con una frecuenncia
bajja suelen traansponer en conjunto, lleevando conssigo
lass secuencias que los sepparan. Si bien
n estos evenntos
son
n de baja freecuencia, cuuando las seccuencias quee se
traansponen lleevan resisteencia a antiibiticos, esstos
eventos son seeleccionadoss y aparecen
n con ms fref
cuencia. Los trransposones no se transfi
fieren entre bacb
terrias, pero s lo hacen loss plsmidos en
e los que puep
den
n insertarse los transposoones; de ah que la mayoora
de las bacteriaas con multiresistencias lleven las mism
maas en plsmiddos.
no
4) Marque lass diferenciass entre los mecanismos
m
rep
plicativo y replicativo dee transposiciin. Qu ennzimaas participan?
39
Problemas
1) En 1938, Marcus Rhoades analiz genticamente el
maz negro (pigmentado) mexicano. De la autopolinizacin de una variedad totalmente pigmentada, surgi
una progenie con los siguientes fenotipos:
12/16: granos totalmente pigmentados
3/16: granos blancos con manchas pigmentadas
1/16: granos blancos
Estos resultados fueron confirmados por su contempornea Barbara McClintock quien, profundizando
sobre el tema, logr interpretar agudamente sus observaciones citogenticas, lanzando, en los '50s, una teora muy resistida en su momento sobre genes "mviles". Tres dcadas ms tarde, la Gentica Molecular
permiti la interpretacin de esos datos, al identificar
un gen dominante P que determina la pigmentacin y
otro gen dominante (situado en otro cromosoma) que
controla la reversin a un alelo Pm mutado por insercin de un elemento mvil.
a) Cules son los genotipos de la planta parental y de
la progenie?
b) Qu tendr el gen controlador que le falta al transposn que se meti en el gen de la pigmentacin?Qu deben tener en comn los dos?
c) En qu tipo de clulas (somticas o germinales) y
en qu momento del desarrollo ocurri la reversin en
los granos mosaico?
d) Cul sera el resultado de un Southern de las partes blancas y pigmentadas de los granos mosaico,
usando el gen P como sonda?
2) Una estrategia alternativa a los marcadores moleculares para el clonado de genes es el "transposon tagging", es decir etiquetado de genes mediante transposones. Se realiz la transformacin -va Agrobacterium- de Arabidopsis thaliana resistente al hongo
Cladosporium fulvum, con el elemento Ds a unas
plantas, y con un elemento Ac defectivo a otras plantas. Como resultado, se obtuvieron algunas transgni-
40
kpb
kpb
15-13--
7-6--
hsp/+ ; hsp/+
3-Sonda: Ds
Sonda: Ac
+/+ ; +/+
Temp. % progenie
(c/ ojos rojos)
25
8
37
17
25
18
37
48
25
1
37
2
41
Gua de estudio:
1) Qu significa "clonar" un gen? Defina la expresin "ADN recombinante", "vector" e "inserto" Mencione un mtodo que sirva para reconocer fcilmente
colonias de bacterias que llevan plsmidos que contienen insertos.
42
Cos). Muchos de ellos fueron modificados para incorporar orgenes de eplicacin de E. coli para as poder
replicar tambin en bacterias, especialmente cmodo
para producirlos en buena cantidad. Por eso se los denomina: de combinacin (shuttle). En levaduras tambin se desarrollaron cromosomas artificiales (YACs),
que fueron los primeros en utilizarse para clonar grandes fragmentos que fueron secuenciados en los albores de la genmica estructural. Posteriormente fueron
sustitudos por otro tipo de vectores com los BACs
(Bacterial Artificial Chromosomes).
4) Qu es una genoteca (o library genmica) y cmo
se construye? Qu diferencia tiene con una clonoteca
(habitualmente
llamada
library)
de
ADNc
(cDNA)?Cmo se realiza una bsqueda, prospeccin,
relevamiento (habitualmente llamado screening)?
Cmo se puede marcar una sonda? Cmo se procede para identificar bacterias que llevan una construccin de inters, luego de haber sido transformadas con
una mezcla de ligacin?
R: Genoteca o genomoteca es una biblioteca de
ADN donde, en vez de colecciones de biblios. (que
significa libros) dispongo de colecciones de segmentos de genomas. En general son especficas de un organismo determinado. Se utiliza ADN genmico que
se corta ya sea con enzimas de restriccin o por mtodos fsicos y se liga a un vector, que puede ser un
plsmido, un fago o un BAC. Este material se utiliza
para transformar bacterias competentes (preparadas
fisiolgicamente para permitir la entrada de ADN extracelular) o para infectarlas, si se utiliza un fago. La
poblacin de bacterias obtenidas representa a todos
los posibles fragmentos del ADN genmico original.
En el caso de la clonoteca o library de cDNA se
utiliza ADNc en lugar de ADN genmico, pero el
proceso es similar, salvo que no es necesario cortar el
ADNc.
Hay varias formas de marcar sondas, las que numeramos a seguir.
Random priming: se incuba el fragmento con una
poblacin de oligonucletidos (hexmeros y/o octmeros) en presencia de fragmento Klenow (fragmento
de la ADN polimerasa de E. coli), dNTPs, alguno de
los cuales est marcado en Alpha (primer fosfato) y
Mg2+. Despus de un proceso de desnaturalizacin y
renaturalizacin se agrega la enzima, los oligonucletidos se unen al ADN y son utilizados como sustrato
por la enzima. Actualmente el ms usado.
Nick translation: si una de las cadenas de un
plsmido se corta exponindo un extremo 3OH, la
ADN polimerasa I utiliza ese extremo como sustrato e
inicia la sntesis de ADN, desplazando a la cadena
existente, y corriendo el nick. Aqu tambin se lleva a cabo la reaccin con dNTPs, alguno de los cuales
est marcado y Mg++, adems de la ADN Polimerasa
I de E. coli.
Marcacin terminal: se puede marcar el extremo de
un fragmento utilizando una quinasa especfica y ATP
marcado en gama.
PCR: la reaccin de PCR puede utilizarse introduciendo un dNTP marcado en la reaccin o utilizando
un primer previamente marcado en su extremo 5
con una quinasa. Lo mismo puede hacerse con hexmeros de secuencia al azar.
Ribroprobes: con el plsmido adecuado , en presencia de una ARN polimerasa como la T7 y de ribonucletidos, se puede transcribir un gen in vitro y
marcarlo pasa ser utilizado como sonda.
En el caso de las genotecas, se llama screening a la
bsqueda del clon que contiene el fragmento de nuestro inters. Existen esencialmente dos formas. La primera es utilizar un fragmento y oligonucletido de
nuestro gen marcado. Este fragmento se hibrida con
una membrana obtenida de una placa de petri conteniendo mltiples colonias o playas de lsis, dependiendo del vector utilizado. El ensayo es anlogo al
Southern blot. La marca (sea radiactiva o no radiactiva) indicar las colonias o placas positivas, las cuales se pueden recuperar de la placa madre. La segunda
forma es utilizar una forma de detectar la protena expresada, en caso de los vectores de expresin. En general puede hacerse utilizando anticuerpos que detectan la protena producida y nos darn la posicin de la
colonia o playa de lisis positiva, en un ensayo que es
anlogo al de un western blot.
Para identificar bacterias que llevan una construccin
de inters, luego de haber sido transformadas con una
mezcla de ligacin y seleccionadas para la presencia
de plsmidos: Se preparan plsmidos a partir de un
cierto nmero de clones positivos y se los chequea
por restriccin, es decir se los digiere para comprobar el mapa de la construccin realizada. A veces se
hace PCR con primers especficos directamente de las
colonias positivas (la Taq pol es mucho ms barata
que las enzimas de restriccin y permite analizar muchos clones a la vez).
5) Cul es la diferencia entre una transformacin y
una transfeccin?
R: En animales, transformacin se refiere a la conversin de una clula o tejido en neoplsico, por lo que
no es correcto sinonimizarlo con transfeccin. En bacterias, tambin es preferible decir transfeccin porque
la transformacin natural que vimos en gentica
bacteriana tiene diferencias con la artificial que se usa
en ingeniera gentica. En plantas son sinnimos.
6) En qu situaciones usara Ud. las siguientes enzimas?:
retrotranscriptasa
ligasa
Taq polimerasa
DNAasa I
RNAsa H
R: RT: Es una ADN polimerasa dependiente de ARN
por lo que se la usa para fabricar ADN a partir de
ARN por ejemplo en el proceso de clonado molecular
de ARNm. Nota: raramente se la puede usar como
ADN polimerasa dependiente de ADN cuando hay
dificultades en la secuenciacin manual de regiones
43
44
45
Problemas:
1) Se desea clonar el gen que codifica a una entomotoxina proteica con propiedades insecticidas que se
encuentra en Bacillus thuringiensis (bacteria del suelo originalmente aislada de insectos muertos), pensando en producir soja transgnica resistente a lepidpte- Cla I
pTEros. Para cumplir con la primera etapa del objetivo
ORF
ampR
TORF
Cla I
planeado, se cort el DNA total de B.t. con MboI en
Cla I
cantidad limitante (tubo 1). Por otra parte, el plsmido
R
pAMP
6 kpb
Bluescript (parecido al pUC19) fue incubado con
5
kpb
BamHI (tubo 2, ver tabla de sitios de reconocimiento
en la gua 1 y comparar BamHI y MboI). Despus se
mezclaron los contenidos de los tubos 1 y 2 en pre- El plsmido recombinante pTETORFAMP se obtuvo
sencia de ligasa, incubndose durante la noche a 16 C por transformacin en una cepa de E. coli recA (in(tubo 3). Luego se transformaron clulas competentes capaz de hacer recombinacin homloga). Las bacte(permeabilizadas con CaCl2) de una cepa de E. coli rias transformadas con la ligacin se crecieron a
que era RecA-, AmpS, lac- en presencia de ampicilina, 30C. Posteriormente, el plsmido obtenido fue introIPTG y X-gal (X-gal es un sustrato cromognico de la ducido por transformacin en una cepa de E. coli sal-
46
47
+ 48pb
LUCIF.
% Act. Prom
relativa a 1
100
Pit-1
LUCIF.
80
LUCIF.
LUCIF.
100
80
48
Gua de estudio:
1) Qu caractersticas particulares permiten diferenciar los caracteres de herencia cuantitativa y aquellos
de herencia cualitativa?
Diferencias de grado
Diferencias de clase
Variacin continua:
Variacin discontinua:
Clases fenotpicas que forman Clases fenotpicas discretas
un espectro mtrico continuo
Muchos genes involucrados Pocos genes
en determinacin del carcter
Efectos individuales de los Efectos individuales de los
genes no discernibles, por ser genes discernibles
pequeos y afectados por el
ambiente
El anlisis gentico se realiza El anlisis gentico se realiza
mediante estimaciones es- por conteo y proporciones
tadsticas de los parmetros de
la poblacin, como media y
varianza
2) Qu es la heredabilidad de un carcter?
Se refiere a la proporcin de la variabilidad fenotpica
total de un carcter que es genticamente heredable
en una poblacin (h2 = VA/VP, VA = varianza gentica aditiva, Vp = varianza fenotpica; en otras palabras
h2 es la proporcin de la varianza fenotpica que se
debe a la varianza gentica aditiva).
3) Una heredabilidad de 0,4, significa que para un determinado carcter, un individuo presenta el 40% de
su fenotipo determinado genticamente, y un 60%
determinado por el medio ambiente?
R: No!!!!, es un parmetro poblacional, por lo tanto
significa que en una poblacin, slo el 40% de la variabilidad fenotpica total observada para ese carcter
est determinada genticamente.
4) Por qu es importante conocer el valor de este parmetro en el marco de programas de mejoramiento?
R: Porque permite que el mejorador tenga un indicio
de cual es la respuesta potencial a la seleccin que se
est aplicando sobre el carcter. De esta manera se
disean los cruzamientos adecuados para obtener la
mejor respuesta (mejora del carcter) evitando la depresin endogmica y la disminucin drstica del tamao poblacional.
49
len ser derivadas de un cruzamiento entre dos parentales altamente divergentes (contrastantes) para uno o
ms rasgos cualitativos o cuantitativos representando
diferentes combinaciones aleatorias de alelos que estaban fijados en las lneas parentales. Se parte de una
F2 (o retrocruza de F1 por un parental). Es una alternativa al cruzamiento prueba dado que todos los segregantes sern homocigotas dominantes o recesivos.
Otra ventaja es que la autofecundacin (o endocra) de
las lneas mantiene el genotipo (no hay segregaciones), lo que permite su mantenimiento (inmortalizacin) y distribucin entre distintos grupos que compatibilizan mapas genticos. Los haploides duplicados
tienen las mismas caractersticas, pero se obtienen por
un mecanismo distinto. En muchas plantas es posible
cultivar anteras (gametas) in vitro de forma de generar
plantas haploides. Partiendo de una F1 se obtienen,
entonces, gametas haploides que generan plantas que
combinan genes de distintos loci de las dos lneas paternas. Cuando se las trata con colchicina, se pueden
duplicar los cromosomas dando individuos diploides
que son homocigotas porque los cromosomas homlogos representan copias idnticas del mismo cromosoma del haploide original.
Problemas:
1) Suponga que dos pares de genes con dos alelos cada uno Aa y Bb, determinan en una poblacin la altura de las plantas en forma aditiva. El homocigota
aabb tiene una altura de 30 cm y el AABB, 50 cm.
a) Cul es la altura de la F1 de un cruzamiento entre
estas dos cepas homocigotas?
b) Despus de un cruzamiento F1xF1, qu genotipos
de la F2 presentarn una altura de 40 cm?
c) Cul ser la frecuencia de estas plantas en la F2?
d) Si se seleccionaran los individuos de 45 cm o ms
de altura para obtener la siguiente generacin, cul
sera la altura media de sta?
2) Se cruzaron dos razas diferentes de maz, cada una
con una altura media de 1,72 m y se obtuvo una F1
con una altura media tambin de 1,72 m. En la F2 haba una considerable variacin que iba de 0,91 m a 2,5
m. De las 1942 plantas consideradas, 8 alcanzaban
una altura de 2,5 m y 7 una de 0,91 m. La altura del
maz, sera para Ud. un carcter cualitativo o cuantitativo? Por qu? Cuntas parejas de genes estn implicadas en la determinacin del carcter segregaron
en la F2? Explique estos resultados en trminos gnicos asumiendo que el ambiente fue mantenido constante en todos los casos.
3) Johannsen midi el peso de las semillas de porotos
de la variedad Princesa. Los porotos son autgamos
(autofertilizados) y por lo tanto esta variedad es una
lnea pura. Los pesos en centigramos de una muestra
pequea pero representativa se enumeran a continuacin:
19 31 18 24 27 28 25 30 29
22 29 26 23 20 24 21 25 29
a) Calcule el peso promedio y la desviacin estndar
de las alubias en esta muestra.
b) Calcule la varianza ambiental.
50
Padre valiente
10 2,8
Padre temeroso
0,9 0,3
Clase 1
1 0,5
Clase 2
9 2,5
Clase 3
10 2,6
Clase 4
9,5 2,4
Clase 5
0,8 0,4
Clase 6
1 0,6
Clase 7
8,5 2,3
Clase 8
0,9 0,6
Clase 9
1,3 0,7
En el esquema 1 se representa una regin del cromosoma 1 en las distintas familias recombinantes (negro
perteneciente al padre temeroso, blanco perteneciente
al padre valiente). De cada clase recombinante esquematizada se obtuvieron al menos 50 ratas que fueron ensayadas biolgicamente mediante un diseo
estadstico apropiado. Para cada clase recombinante se
obtuvo un promedio y un desvo estndar. Indique
cmo se hizo para ordenar los distintos marcadores en
el cromosoma 1
b) Porqu se utilizaron 50 ratas de cada una de las
lneas recombinantes y no solamente una?
c) Qu conclusiones puede sacar acerca de la localizacin gentica del temor? Est este QTL ubicado en
el cromosoma 1? Podra Ud localizar ms de un
QTLs en el esquema 1? Supone que puede estar ubicada en otras partes del genoma? Por qu?
d) Podra haber utilizado otro mtodo alternativo pa-
Clases Recombinantes
3 4 5 6 7 8
51
Gua de Estudio:
1) Cmo es la estructura de una clula bacteriana?
Como est organizado su genoma?
R: La clula bacteriana (gram-) contiene dos membranas externas que encierran el espacio periplsmico y
una pared celular, generalmente de pptidoglucano,
que le otorga rigidez y protege de los shocks osmticos. La membrana interna encierra al citoplama, separndolo del periplasma. En el citoplasma encontramos toda la maquinaria necesaria para la sntesis de
cidos nucleicos y protenas. La membrana interna es
compuesta por una bicapa lipdica mayormente de
fosfolpidos, mientras que la externa contiene una
hemimembrana interna similar y una capa externa de
lipopolisacrico. Las bacterias gram+ no tienen membrana externa y la pared de peptidoglicano es ms
gruesa que la de las gram-.
Si bien no existe un ncleo, como en las clulas eucariotas, el ADN se encuentra organizado en el nucleoide, que es una masa de ADN y protenas (80% ADN),
que puede ser observado por microscopa. El nucleoide contiene dominios cuyo grado de superenrrollamiento no es afectado por los dominios vecinos. Este
grado de independencia sugiere que los dominos estn
asociados a una matriz que impide que se transfieran
las tensiones entre ellos. El cromosoma bacteriano no
est tan empaquetado como el de los eucariotas, pero
se encuentra asociado a una serie de protenas que
cumplen funciones anlogas a las de las histonas, como ser HU, HN-S, Fis e IHF.
En la mayora de los casos conocidos, las bacterias
poseen un nico cromosoma circular que se replica en
forma bidireccional. Pueden contener plsmidos grandes (el factor F o el plsmido Ti, por ejemplo, pueden
llegar a tener 200 kpb y pueden servir como vectores
para ingeniera gentica: BAC).
2) Cmo se multiplican las bacterias?
R: Se reproducen asexualmente por divisin binaria
(aunque no es la nica forma). Es asexual y en los libros viejos se la llama fisin). Incluso las bacterias
que esporulan (Bacillus y Clostridium) lo hacen
asexualmente y son un ejemplo del fenmeno de diferenciacin celular.
3) Qu es un cultivo lquido? Y uno slido? Para
qu se utiliza cada uno?
R: Medio de cultivo lquido: es un medio que no tiene
soporte slido, donde los microorganismos crecen en
suspensin y los nutrientes difunden libremente, por
lo que existe competencia por ellos entre los microorganismos. El medio lquido se puede realizar en tubos
de ensayo (pocos ml), Erlenmeyers (decenas o cientos
de ml) o en fermentadores de varias escalas.
Medio de cultivo slido: difiere del lquido en el agregado de una matriz inerte que sirve de sostn para el
crecimiento bacteriano. Esta matriz es por lo gene-
ral de gar, un polmero extrado de algas, de consistencia similar a una gelatina. El crecimiento bacteriano ocurre sobre la superficie del gar, de forma que
los microorganismos no pueden moverse libremente y
forman colonias aisladas. Los componentes solubles
del medio difunden lentamente, por lo que disminuye
considerablemente la competencia entre los microorganismos que comparten el medio de cultivo. El medio slido se suele realizar en cajas de Petri (de varios
tamaos y formas), o en frascos chatos (de Roux, utilizados para clulas tipo fibroblastos). Cada microorganismo origina una colonia, que en muchos casos,
por sus caractersticas, permite la identificacin del
microorganismo que la gener.
Los medios de enriquecimiento permiten aumentar la
proporcin de un microorganismo determinado en una
poblacin heterognea. Para ello debe haber competencia entre las distintas cepas microbianas, de forma
tal que aumente la proporcin de aquellas para las
cuales el medio de cultivo es adecuado. Es por ello
que los medios de enriquecimiento son lquidos, de
forma de facilitar la difusin de nutrientes y/o de inhibidores que se utilicen.
El medio slido sirve para aislar colonias (clones) individuales (purificar). El medio lquido sirve para obtener masa (gran cantidad) de clulas, por ejemplo,
para obtener plsmidos en forma preparativa.
4) Qu diferencia un medio selectivo de medio diferencial. R: Un medio selectivo es aqul donde slo
crecern determinadas cepas o especies. Es un caso
extremo de medio de enriquecimiento, pero dado que
la competencia entre microorganismos no es necesaria, se utilizan medios slidos. Un ejemplo de medio
selectivo es el que utiliza un antibitico que slo permite el crecimiento de las cepas resistentes.
Un medio diferencial es aquel que permite diferenciar
al menos una de las distintas cepas/especies de una
muestra. Los medios diferenciales son slidos, para
permitir el crecimiento aislado de las distintas colonias, de forma tal que puedan distinguirse. El medio
diferencial no impide el crecimiento, simplemente
permite diferenciar. (ej. bacterias lac+ vs lac- en presencia de X-gal).
5) Diferencie entre un medio completo y uno definido
Para qu los utilizara? R: Medio completo es el que
contiene todos los nutrientes incluyendo fuentes de
carbono y nitrgeno necesarias para el crecimiento
pero no estn bien definidos en su composicin que
puede variar levemente de partida a partida. Por ej. la
triptona del medio LB es un hidrolizado de casena
con tripsina, el extracto de levadura es un extracto
soluble de levaduras hidrolizadas. El medio definido,
en cambio, contiene componentes y concentraciones
de aminocidos individuales y vitaminas (por ejemplo
biotina para E. coli) perfectamente establecidos y
constantes.
6) Qu es la tcnica de plaqueo en rplica (replica
plating)? Para qu sirve?
52
53
manteniendo en general una copia por clula. Las cepas F+, son las que contienen el plsmido F como episoma. Como el plsmido F tiene algunas secuencias
homlogas a secuencias cromosmicas (transposones
llamados elementos IS), en algunos casos ocurren
eventos de recombinacin, donde el plsmido F se
integra al cromosoma. En estos casos, el oriT y los
genes tra siguen siendo funcionales, y promueven la
transferencia del cromosoma, que puede llegar incluso
a ser completa. La transferencia cromosmica es la
causa de la alta frecuencia de recombinacin de estas
cepas y de all su nombre Hfr.
La cointegracin del plsmido (la cual se produce,
usualmente, por entrecruzamiento via recombinasa
(rec A combinada con recBCD) entre el cromosoma y
el factor F en regiones con secuencias homlogas,
usualmente transposones duplicados en ambos ADNs
o, ms raramente, como producto de una transposicin
sin resolucin). Resolucin quiere decir: separacin
de los 2 crculos cointegrados despus de que se produjo la copia o transferencia del transposn entre el
crculo de ADN dador al receptor).
10) Qu es un F' y cmo se origina?
R: Un F es un plsmido derivado del F que contiene
fragmentos de ADN cromosmico. Cuando un
plsmido F se escinde de una cepa Hfr (resolucin),
en general ocurre por recombinacin entre los sitios IS
flanqueantes (los mismos que permitieron la integracin). Hay casos en que los eventos de recombinacin
ocurren entre secuencias ms lejanas (otros elementos
IS o secuencias homlogas) y el plsmido que se escinde es mayor que el original y contiene el fragmento
cromosmico que estaba contenido entre las secuencias que recombinaron. Estos plsmidos F se denominan F. Tambin se pueden generar plsmidos F por
otros mecanismos como ser la transposicin.Un F es
una forma natural (in vivo) de clonado molecular en
un vector plasmdico, sin uso de enzimas de restriccin, muy usada por los genetistas bacterianos. Los
genetistas bacterianos suelen utilizar, para ello, un
virus-que es, al mismo tiempo, un transposn llamado
fago .
11) Cmo determinara orden y distancia entre genes
utilizando la tcnica de "apareamiento interrumpido"?
R: Cuando una cepa Hfr conjuga con una cepa F-, el
ADN se transfiere desde el oriT. Puede llevar ms de
una hora y media la transferencia completa, lo que
generalmente no ocurre. El ADN transferido puede
recombinar con el cromosoma de la cepa aceptora.
Dado que en la suspensin, la interrupcin de la conjugacin ocurre durante todo el proceso, la frecuencia
de recombinantes cae exponencialmente con la distancia al oriT. La frecuencia de recombinacin para un
marcador es entonces una medida de la distancia al
oriT. Para determinar el orden entre dos marcadores
se analizan la cantidad de recombinantes dobles.
Cuanto mayor es la frecuencia de aparicin de los dobles recombinantes, menor es la distancia entre ellos
(menor es la frecuencia de recombinantes entre ellos).
54
Genes de salvaje
En recombinante
lisis lisogenia lisis lisis inserto lisis
17) Qu es la transformacin bacteriana? Se logra
nicamente en forma artificial o tambin ocurre en
poblaciones naturales?
R: La transformacin bacteriana es un proceso por el
cual las bacterias incorporan ADN del medio. Se logra
en condiciones de competencia, es decir, cuando las
bacterias son competentes para la transformacin. La
competencia puede ser natural, lo que se observa en
algunas especies o puede ser inducida en laboratorio.
La transformacin natural implica, entre otras cosas,
el ingreso de ADN de simple cadena en la clula receptora despus de un reconocimiento por receptores ubicados en la periferia celular, un reemplazo allico en las colonias recombinantes. En la transformacin artificial (tambin llamada transfeccin), las
clulas son forzadas a permeabilizar el ingreso de
ADN (que suele ser de doble hebra como por ejemplo
un plsmido) mediante mecanismos artificiales. E.
coli, por ejemplo, no es una bacteria que intercambia
ADN por transformacin en la naturaleza y es la bacteria que ms se transforma (= transfecta) en el laboratorio. Se puede esquematizar en un cuadro.
18) Se pueden mapear genes por transformacin?
R: S; en forma similar a la transduccin, la eficiencia
de cotransformacin es una medida de la cercana de
dos loci determinados. Contrariamente a los mapeos
utilizando cepas Hfr, pero en forma similar a la transduccin, la transformacin es til para los mapeos
finos. Al igual que en la transduccin generalizada, el
% de cotransformacin de 2 genes es inversamente
proporcional a su distancia. Estos mtodos de mapeo
gentico en bacterias han sido totalmente reemplazados, en la actualidad, por mtodos de mapeo fsico por
lo que se les prestar menor importancia a la que se le
da en los libros de texto.
19) El grfico muestra el resultado de un experimento
de apareamiento interrumpido entre las siguientes cepas de E. coli:
Hfr: a+ b+ c+ d+ strps X F-: a- b- c- d- strpr
c + strpr
a + strpr
50
d + strpr
b + strpr
5
10
15
20 Min.
55
cepa
1
genes
ja
je
ji
jo
tiempo 15 21 32 48
genes
ju
ji
jua jo
jue
57
2
tiempo 10 17 22 33
genes
jui juo juu ay
jo
jua
11 33 48
49 60
3
tiempo 6
genes
juo jui ja
ju
4
tiempo 18 23 35 45
Podr Bruno Daz construir un mapa gentico que
incluya todos estos hilarantes marcadores y sealar la
distancia de tiempo entre genes adyacentes? No se
pierda la continuacin de este batiapasionante captulo, a la misma batihora, por el mismo baticanal y en la
misma batimateria.
R: JA JE JU JI JUA JO AY JUU JUE JUO JUI y,
dando la vuelta, de nuevo JA. De una forma similar a
esta se demostr por primera vez la circularidad del
genoma de E. coli. Era la nica forma de justificar
resultados como stos.
Nota sobre el enunciado: las bacterias probiticas
(tipo la Lactobacillus casei del Actimel) suelen producir una modificacin favorable o reconstitucin de
la flora bacteriana intestinal (por ejemplo por cambio
del pH intestinal). No hay evidencia cientfica clara de
que produzcan ninguno de los efectos que muestra la
publicidad. Es ms, este tipo de publicidad est prohibida en la mayora de los pases del primer mundo.
Algunas bacterias del yogur (como el famoso Lactobacillus G de origen francs que comercializa La Serensima) estn genticamente modificadas e incluso
contienen genes de resistencia a antibiticos, aunque
fueron obtenidos por mecanismos de gentica bacteriana (como en los ejercicios de esta gua ingeniera
gentica in vivo) por lo que las legislaciones no los
consideran OGMs y los fabricantes (y los ecologistas)
niegan su transgenicidad (fueron obtenidos por mejoramiento convencional y no por ingeniera gentica).
Problemas:
1) Bitcora de vuelo: fecha espacial 1654.9. Habla e1
capitn Kirk. Toda la tripulacin del Enterprise sufre
una diarrea infernal. E1 seor Spock afirma que se
trata de una extraa bacteria intestinal proveniente de
la tercera luna del cuarto planeta de la segunda estrella
del sistema Papanpulos XXXIII. Sospecho que la
bacteria fue introducida involuntariamente por el seor Cheko despus de la ltima visita a su novia en
Nueva Creta. En el tiempo que le queda libre despus
de repartir pastillas de carbn, el doctor McCoy logr
identificar cuatro genes implicados en la regulacin de
un sistema enzimtico. Tambin aisl una mutante: Fa-,b-,c- y d- StrR, la cual normalmente da revertantes
a+, b+, c+ o d+ a una frecuencia aproximada de 1
colonia revertante por cada 107 clulas sembradas en
el medio selectivo correspondiente. Con esta cepa
aisl un clon con las mismas auxotrofas (a-b-c-d-) y
con la misma tasa de reversin hacia a+ y d+ pero
con una frecuencia de aparicin de revertantes c+ y
b+ reducida a niveles no detectables. Se utiliz esta
cepa como receptora en un experimento de apareamiento con la Hfr a+ b+ c+ d+ StrS. La figura muestra los resultados obtenidos usando medios selectivos
que carecen de a, b, c o d.
c + strpr
N recomb.
b+
c+ d+
10
20
30
40 min.
Luego se tomaron 100 colonias d+, 100 b+ y 100 c+
de las placas de 30 minutos y se ensay su genotipo
para los otros dos marcadores. Los resultados se resumen en la tabla. Explique los resultados.
2) Cuando Sledge
d+
b+
c+
Hammer le dijo al
93
93
capitn
Tronk: d+ ----95
----100
-Confe en mi, s b+
exactamente lo que c+
92
100 ---hago-, a la teniente
Dureau se le erizaron los pelitos de la nuca. Entonces
Sledge se encerr durante siete das en el laboratorio
del cuartel (despus de desalojar a punta de revlver
al mdico forense). Cuando sali, Sledge anunci que
haba resuelto el misterioso caso de los coliformes
mutantes. Ms tarde, en una ronda de prensa sensacionalista, Sledge declar: - Bueno, se trataba de un
aislamiento de la cepa bacteriana Mgnum 44 la cual
es Hfr y StrS y, lo que es ms grave, completamente
salvaje. De este condenado germen, aislamos un engendro mutante (F-StrR arg-lac-). La cuestin es que
conjugu ambos demonios pero interrumpiendo su
disgustante orga a distintos tiempos con lo que logr
56
hacerles confesar lo ms ntimo de sus genes sometindolas a un medio con estreptomicina y suplementados como se indica en la tabla, con el sencillo trmite de contar el nmero de colonias al da siguiente.
Con esto queda demostrado, una vez ms, que el crimen es la
N de colonias observadas en
profesin
menos
t (min) lac glu arg+lac arg+glu
paga des1
0 0
0
500
pus de la
5
0 128 0
491
de Estu
10
40 201 58
509
diante de 15
80 199 127
498
Biologa.
20
82 203 139
504
a) A qu
distancia del opern lac mapea el origen de transferencia en la cepa Hfr usada?
b) Cules son los genotipos de las bacterias que crecen en los distintos medios?
c) Porqu los valores de la primer columna son menores que los de la tercer columna?
d) Qu estrategia se podra seguir para clonar el gen
(salvaje) involucrado en la sntesis de arginina cuya
versin defectuosa est en la cepa F-?
3) Se realiz una coinfeccin en medio lquido (a alta
multiplicidad densidad- de fagos y sobre una cepa
sensible), con dos fagos T4 mutantes: T4m- (playas
pequeas) y T4tu (playas turbias). Una alcuota del
lisado resultante fue usada para infectar (a baja multiplicidad de infeccin) nuevas bacterias de la misma
cepa y se obtuvo un 7% de playas grandes y claras
(salvajes). Qu porcentaje de playas pequeas y turbias se habr obtenido?
4) Teodorico Snopolsky se aboc a una tarea que le
haba quitado el sueo durante la mayor parte de su
vida: obtener bacterias que sintetizaran whisky y gi-
cepa
receptora
whi- gin-
whi- gin+
whi+ gin+
whi- gin-
clases
transformadas
whi- gin+
whi+ ginwhi+ gin+
whi- gin+
whi+ ginwhi+ gin+
N
colonias
248
175
3
315
201
382
TOL
TOL
p3MB -gal
opern Trp
(A) a (C): Plsmidos que poseen origen de replicacin de amplio rango de husped (funciona en
Pseudomonas y Escherichia), contienen un gen
de resistencia a ampicilina y las siguientes caractersticas:
TOL
p3MB lacI
II
pRK2013
leu+
A
leu+
bom
plac gef
- p3MB-gal: promotor del opern que cataboliza el
3MB a 5del gen de la enzima -galacosidasa.
- p3MB-lacI: promotor del opern que cataboliza
3MB a 5del gen del represor del opern lactosa.
- lac y leu: La (delta) significa que lo que sigue
est delecionado (opern lac o leu, en este caso la
delecin involucra tambin al gen del represor I).
- tra: genes de transferencia del plsmido F
- mob: endonucleasa que corta en la regin bom
- bom: origen de transferencia del plsmido F
- ptrp : promotor opern triptofano (otro distinto)
- plac: promotor del opern lactosa
- gef: es un gen suicida, es decir que codifica para
una protena que produce la muerte de la bacteria
cuando se expresa.
Gua terica
1. Qu se entiende por determinacin sexual y diferenciacin sexual?
R: Determinacin sexual: sistemas biolgicos que determinan el desarrollo de las caractersticas sexuales
de un organismo (determinacin cromosmica, gnica, por nivel de ploida o ambiental)
Diferenciacin sexual: procesos necesarios para alcanzar las caractersticas sexuales previamente determinadas
2. Qu son los cromosomas sexuales y en qu grupos
taxonmicos se los encuentra?
R: Son los cromosomas que determinan genticamente el sexo. Se encuentran muy distribuidos en insectos,
mamferos, aves y plantas dioicas.
3. Qu se entiende por regin pseudoautosmica
(PAR)?
Solucin: regin de homologa y apareamiento entre
los cromosomas sexuales
4. Los genes relacionados con la diferenciacin sexual
estn ubicados exclusivamente en los cromosomas
sexuales? Explique
R: Nooo!! Slo es necesario que se localicen all los
genes regulatorios codificantes para los factores de
transcripcin maestros que disparan el proceso que se
describe en los libros. Existen muchos genes importantes para el sexo (incluso los que codifican para cosas tan importantes como son las hormonas sexuales)
que se localizan en los autosomas y pueden verse influidos por los cromosomas sexuales.
5. A la inversa, pueden existir genes que no tienen
nada que ver con el sexo localizados en los cromosomas sexuales? Explique.
R: S, el gen que determina la presencia de pelos en el
borde de la oreja, se encuentra en la regin diferencial
del cromosoma Y.
ptrp gef
leu
bom
57
plac gef
a) Disee una estrategia para construir (mediante conjugacin) la cepa de Pseudomonas putida que sea capaz de metabolizar el contaminante 3MB y que luego
se autodestruya, indicando cules cepas y plsmidos
elige y cmo se selecciona la bacteria de inters.
b) Justifique las/los que descarta.
c) Esquematice mediante un grfico la curva de crecimiento (nmero de bacterias en funcin del tiempo)
y el nmero de bacterias en funcin de la concentracin de 3MB.
Considere t=0 al lago conntaminado en el momento
del agregado de las bacterias limpiadoras.
d) Por qu se debe evitarel escape de la bacteria limpiadora al medio ambiente?
6. Cmo se comportan, en relacin con las leyes de
Mendel, los genes que se encuentran en los cromosomas sexuales?
R: Su herencia difiere de la de los genes ubicados en
los autosomas, ya que los alelos se heredan asociados
con el sexo de la descendencia. La misma est influida, a su vez por hemicigosis (genes del cromosoma
Y), heterocromatinizacin (genes del cromosoma X),
etc.
7. Qu diferencia existe entre genes LIGADOS, caracteres LIMITADOS a un sexo e INFLUIDOS por el
sexo?
R: Los genes ligados al sexo, son aquellos que se encuentran en la regin diferencial de los cromosomas
sexuales (ligados al X o Y). Los caracteres limitados
a un sexo, son aquellos que se expresan solamente en
un sexo aunque los genes que los determinan estn
presentes en ambos (ej. distribucin facial del vello en
hombres). Los caracteres influidos por el sexo, se expresan en ambos sexos pero con diferente relacin de
dominancia (ej. el alelo que determina la calvicie
humana, es dominante en hombres y recesivo en mujeres)
8. En qu consiste la determinacin del sexo por
equilibrio gnico?
R: En Drosophila melanogaster, el sexo est determinado por la relacin: cromosoma X/conjunto de autosomas. Siendo 1 la relacin que determina hembras y
0,5 la que determina machos.
9. Cul es el mecanismo de determinacin sexual en
humanos?
R: En humanos el sexo se determina cromosmicamente, siendo el cromosoma Y el determinante masculino (portador del gen SRY, factor determinante del
desarrollo de los testculos).
10. Qu es la compensacin de dosis gnica en
mamferos?. Qu establece la hiptesis de Lyon? D
58
A1A1
A2A2
+
Se hace el siguiente experimento, tanto en Drosophila
como en ratn. A partir de un tejido adecuado de una
hembra heterocigota A1A2 se obtiene un cultivo celular primario y de este 10 subcultivos unicelulares.
Qu patrones electroforticos se obtendrn en los
siguientes casos?
a) Cultivo primario de Drosophila.
b) Subcultivos de Drosophila.
c) Cultivo primario de ratona.
d) Subcultivos de ratona.
5) En el ratn existen dos sistemas enzimticos cuyos
productos son detectables en los glbulos rojos. Los
mismos estn determinados por las parejas allicas
A,a y B,b, cuyos loci respectivos estn situados en el
59
segmento diferencial del cromosoma X. Unas hembras diheterocigotas (hijas de machos que presentaban
las enzimas A y b) se cruzaron con machos AB, obtenindose la siguiente descendencia masculina: AB:34;
ab:26; Ab:67; aB:73.
Teniendo en cuenta la hiptesis de Lyon, de los ocho
tipos de hembras que se sealan en la tabla, Cules
sern las hermanas de los machos antes indicados?
Con qu frecuencia aparecer cada una?
Porcentaje de gbulos rojos con
Tipo de
las enzimas que se indican
Hembra
AyB
Ayb ayB ayb
100
1
2
25
25
25
100
3
4
50
50
50
25
50
50
50
50
50
50
50
8
6) Ni el Zar Nicolas II ni su esposa la Emperatriz Alexandra tenan la enfermedad conocida como hemofilia, caracterizada por estar ligada al sexo. Su hija, la
princesa Anastasia, tampoco la tena, pero el Zarevich
Alexius, su hermano, s. Podria Anastasia haber sido
portadora de la hemofilia? Si se hubiese casado con su
primo Henry, que era hemoflico, alguno de sus hijos
o hija habran sido hemoflicos?
7) Es de conocimiento popular que todo gato de 3 colores es gata (hembra). A este tipo de gatos se los llama calico. Se sabe que el pelaje blanco presente en
sectores o mosaicos proviene de un gen independiente
del que produce pelaje naranja o negro.
Se realizaron dos cruzamientos: 1) Macho blanco y
negro x Hembra blanca y
naranja
50%
machos
blancos y naranjas
50% hembras
tricolores
2) Macho blanco y naranja x Hembra blanca y negra
50% machos blancos y negros
50% hembras tricolores
a) Cul es el indicador ms evidente de la ausencia
de herencia mendeliana?
b) Por qu gatos machos no tienen nunca 3 colores?
c) Explique la base gentica de este comportamiento.
d) Cmo sera el resultado de cruzar una hembra tricolor por un macho blanco y negro?
8) Es posible que, en los humanos, un gen mutante
recesivo est localizado en el cromosoma X, si una
60
R: La organizacin genmica de mitocondrias y cloroplastos es significativamente diferente del ADN nuclear. Ambas organelas se originaron por transferencia
horizontal que involucr eventos de endosimbiosis
donde clulas eucariotas adquirieron el genoma bacteriano intacto (ver siguiente pregunta).
Cloroplastos: Genoma circular que no posee histonas
ni otras protenas cromosomales presentes en el ADN
nuclear. Muchas de las protenas utilizadas en la fotosntesis estn codificadas en el ADN de los cloroplastos. Comparado con el ADN nuclear vegetal la
tasa de evolucin es ms rpida (menor velocidad
de cambios que las mitocondrias).
Mitocondrias: genoma circular que no posee protenas
cromosomales. Las mitocondrias de plantas, hongos y
animales difieren en estructura, composicin, tasa de
evolucin y modo de herencia (ver tabla).
Tabla. Caractersticas del ADN mitocondrial
Plantas
Tamao del Extremadagenoma
mente variable
(300kb a
2400kb en una
misma familia)
Estructura Variable, circular o lineal
Informacin rRNA, tRNA,
protenas
ribosomales,
protenas
involucradas
en respiracin
Presencia de
No, pero
intrones
abundantes
regiones no
codificantes
Modo de Variable, prinherencia
cipalmente
materna
Tasa de dilenta
vergencia de
secuencia
comparada
con el correspondiente
ADN nuclear
Hongos
Animales
Muy variable Pequeas y
(26,7kb a
poco varia115kb en as- bles 16kb
comycertes
filamentosos)
circular
circular
rRNA, tRNA
,protenas
ribosomales,
protenas
involucradas
en respiracin
Si
Cualquiera de
los dos parentales
media
rRNA,
tRNA, protenas involucradas en
respiracin
No, pocas
regiones no
codificantes
materna
rpida
61
C
Cul mecanissmo de los ssiguientes pu
uede estar innvoluccrado?:
a-- Mutacin puntual somttica
b-- Reordenam
miento cromosmico
c-- Transposiciin gentica
d-- tRNAs suprresores
e-- Splicing dell RNA
f- Correccin (edicin) dell RNA ("editting")
5) Cmo se explica
e
que llas secuenciaas de aminocidos de la subuunidad III de la citocromo
o oxidasa aisslada de:
- mitocondrias
m
s de mamferros
- mitocondrias
m
s de plantas
- kinetoplastos
k
s de tripanosomtidos
esttn muy consservadas evoolutivamente, mientras quue
loss genes respeectivos guarddan muy poca homologaa
enttre s?
6) La idea del origen procaaritico de laas mitocondrrias
se ve avalada/ss por las siguuientes evideencias que inndican
n similitudess con las baccterias actuales y diferenccias
con
n el equivaleente nuclear:
a) Grado relatiivo de homoologa de seccuencias de nucleetdos de los genes ribossomales mito
ocondriales.
b) La estructurra policistrnnica del RNA
A inmaduro mitoccondrial.
c) El cdigo geentico mitoccondrial.
d) El sistema de
d replicacinn del DNA mitocondrial.
m
.
e) La secuenciia de aminocidos de las isozimas mitocon
ndriales,
f) El fenmenno de "transsplicing" y/o
o "editing" del
RN
NA mitoconddrial
g) La herencia materna de llos genes miitocondrialess.
h) E1 fenmenno de conjugaacin mitoco
ondrial.
Ind
dique las oppciones correectas y falsas y justifique..
7) Los prionees son agenttes
inffecciosos innvolucrados en
enfermedades neurodegennerattivas en los mamferos ccomo
o la conociida encefaliitis
esp
pongiforme bovina o eenferrmedad de laa vaca loca y
el scrapie enn ovejas. Enn los humano
os se incluyee la
enfermedad dee Creutzfeld--Jakob, el inssomio fatal y el
ku
uru. El aspectto ms peculliar del proceeso de infecccin
por priones es que no tiennen cidos nu
ucleicos asocciados, en personnas sanas y eenfermas se encuentran los
miismos alelos de los geness que codificcan para la prop
tena prinica. La naturalezza infecciosaa de los prioones
derriva de que la
l protena pprinica pued
de existir en dos
esttados conforrmacionales: el normal o no infeccioso
(40
0% de hlicees y casi nada de plegaamientos ) y el
anormal o infeeccioso (muyy rico en estrructuras de tipo
t
).. Cuando la protena se encuentra en
n conformaccin
inffecciosa tienne propiedadees del tipo chaperona,
, en
el sentido de que
q es capaz de convertirr protenas norn
maales en infeccciosas (mediante una reaaccin en caadena)) producienddo los agreggados neuron
nales caracteersticos de la ennfermedad. E
En enfermedades comoo el
ku
uru o de la vaca loca la conformaacin infecciiosa
62
aparece en el husped como consecuencia de la ingestin de tejido nervioso enfermo. En cambio, en enfermedades hereditarias como la de Kreutzfeld-Jakob
ciertas mutaciones en el gen prinico aumentan la
chance de aparicin espontnea de la conformacin
infecciosa sin necesidad de ingestin del agente infeccioso. A este ltimo tipo de transmisin se lo considera herencia infecciosa (un tipo especial de herencia
extranuclear). Hasta hace poco se pensaba que slo
existan priones en mamferos, pero actualmente se
tiene certeza de que tambin estn presentes en levaduras. Uno de estos priones fngicos (el PSI) tiene
una funcin biolgica conocida (es un factor de terminacin de la traduccin citoplasmtico). Esta protena
puede existir en 2 variantes: PSI+ y PSI-. La herencia
sigue un patrn de herencia infecciosa como el mencionado anteriormente.
a) Esquematice un cruzamiento entre levaduras Psi+ y
psi- y su segregacin en F1 y F2. No omita las convenciones correspondientes para la ploida, tipos de
apareamiento y proporciones genotpicas y fenotpicas
en cada una de las generaciones. Lea atentamente,
para ello, el ciclo de vida de las levaduras en su libro
de texto.
b) Dnde tendra que estar localizado el gen Psi? en
un autosoma, en un cromosoma sexual, en un plsmido o en genoma mitocondrial? por qu? Justifique.
Gen quimrico
Gen virus SV40
Gen myoDI
prom Sec. cpside viral
prom Sec. estructural
promotor
Sec. estructural
63
coloreados de azul. A continuacin se hicieron deleciones en la regin 5' de la regin promotora para analizar la contribucin de cada parte de esta regin promotora. Como resultado, se identificaron secuencias
* Regin promotora gen hairy
Regin 5'
regulatorias especficas que resultaron ser responsables, individualmente, de la formacin de cada uno de
los anillos.
Embrin transfectado
transcripcin
1234567
1
2
6
Para estudiar la accin de estas secuencias, se tom la construccin responsable de la formacin del anillo 6, y
con ella se transformaron embriones de moscas mutantes hometicas deficientes para el gen "knirps" y para el
gen "Krppel", y otra que expresa el gen "Krppel" en forma constitutiva, con los siguientes resultados:
Salvaje
- knirps
- Krppel
expresin constitutiva Krppel
Con anticuerpos especficos e hibridaccin "in situ" del mRNA, se ensay la concentracin relativa de los productos de los genes knirps y Krppel en el embrin de las moscas salvajes, observndose la siguiente distribucin:
protena Krppel
protena knirps
Anillo 6
a) Por qu se utiliz una secuencia estructural de -galactosidasa en lugar de la secuencia estructural del mismo
gen, pudiendo disponer de anticuerpos para detectar la expresin de la protena "hairy"?
b) Por qu no se elimin la regin promotora conteniendo las CAT y TATA boxes en los experimentos de delecin?
c) Cmo explica la disminucin en nmero, de 7 a 1, de los segmentos "teidos" con X-gal en las deleciones?
d) En base a los experimentos con mutantes y de deteccin de productos de los genes knirps y Krppel qu
funcin cumplen estos productos? En su contestacin considere la posibilidad de que sean receptores de membrana, hormonas, factores de transcripcin, reguladores positivos, negativos, segundos mensajeros y/o protenas
especficas de tejidos diferenciados como podra ser la hemoglobina de los glbulos rojos de vertebrados.
e) Proponga un modelo de regulacin (un esquema al estilo del opern lactosa) para explicar la funcin de la
secuencia regulatoria estudiada en la expresin del gen hairy
INTERFERENCIA/SILENCIAMIENTO E IMPRONTA
3) La impronta genmica ("genomic imprinting") es
una rara propiedad que presentan algunos genes de
transcribir y expresar slo el alelo derivado del progenitor de un determinado sexo, es decir o del padre exclusivamente, o de la madre exclusivamente y no del
otro; mientras que el alelo proveniente del progenitor
del otro sexo no se expresa. El alelo que no se expresa
es el que se dice que est imprinteado. Cada gen
tiene su patrn de imprinting especfico. Se cree que
este fenmeno est relacionado con los casos epigenticos de silenciamiento pretranscripcional descriptos
en plantas dado que la metilacin representara una
64
1.25
Cantidad
1
Relativa
0.7
de
mRNA 0.50
0.25
TIR1
ABF
ABF
miR39
1
Cantidad
relativa
de mRNA
GFP
TIR1 ABF
ABF
miR39
65
ciona. De esta forma se consigue la expresin (transitoria) de las construcciones genticas bombardeadas
en las clulas impactadas y su fcil visualizacin en
forma de puntos azules (fig.2).
Nota: No se grafican las transgnicas con la construccin ATG-rep porque dan casi igual que las no codific-rep.
b) Para qu se hicieron los experimentos de la Fig.
2? Interprete los resultados:
i) Cmo me doy cuenta de cunto afecta a la actividad GUS la fusin con la replicasa? Qu resultados
comparo para evaluarlo?
ii) Para qu sirven, adems, los experimentos realizados con la construccin 2 (GUS slo)?
iii) A qu atribuye las diferencias entre A1 y A2
y entre S1 y S2? Qu relacin tiene con la resistencia?
iv) Cul mecanismo (mediado por protena, mediado
por bloqueo de la traduccin antisentido-, mediado
por silenciamiento posttranscripcional) media la resistencia?
Aclaraciones: GUS-rep: construccin gentica capaz
de expresar una protena (y su mRNA) de fusin
GUS+replicasa, GUS: Idem slo
GUS. uid-A: gen codificante para GUS;
A1 y A2 son 2 plantas transgnicas representativas
para la construccin antisentido (Anti-rep);
S1 y S2 plantas con la construccin sentido (no codific-rep).
(S) y (R) representan plantas susceptibles y resistentes.
Ken (NT) es un control de la misma variedad de papa
que el resto (Kennebec) pero no transformada.
66
chimpanc
ZR59
HIV-1
Independientemente de esta ltima hiptesis, siempre
se especul acerca de la relacin evolutiva con la familia de SIVs (virus de inmunodeficiencia de simios)
que presentan chimpancs, mandriles y otros simios,
los cuales no son patognicos en sus huspedes pero
que, al transferirse a los humanos, pudieron haber adquirido propiedades patognicas hacia el mismo.
Debido a su particular sistema de replicacin, las enzimas que intervienen no tienen mecanismos de correccin eficientes para los posibles errores de copia
de cidos nucleicos. Por lo tanto, el reloj molecular es
mucho ms rpido que para los genes nucleares o mi-
1.
2.
3.
4.
67
Paciente C
Paciente A
Paciente G
Paciente B
Paciente E
Dentista
CL 1
CL 2
Paciente F
CL 3
CL 4
Paciente D
19
31
53
242
29
57
245
59
239
Orang ratn
250
68
combinacin homloga,
porque los alelos de los
a
genes homlogos dejan
b
de aparearse en la meio- 4
sis.
c
iii) le ayudan estos co- 3
nocimientos a entender
las diferencias de edades de los genes contenidos estos 4 segmentos 2
cromosmicos?
Por lo tanto, se postula
a
que estos resultados reflec
jan 4 eventos evolutivos
puntuados de inversin
cromosmica (y eventual
b
prdida de DNA de los
segmentos) del cromosoma Y, que llevaron a la 1
prdida de ordenamiento
por grupo de edades de
estos genes en el cromosoma Y (ver segunda figura). Esto sugiere que la
inversin ms reciente
(grupo 4) ocurri hace
30-50 millones de aos
(en la lnea de los primates), la del grupo 3 hace
80-130 Ma, etc. Desde el punto de vista de la evolucin de los grandes grupos, esto significa que el sistema de determinacin del sexo basado en cromosomas X e Y apareci muy tempranamente en la lnea
evolutiva de los mamferos.
iv) Indique si estos datos corroboran (o no) que el sistema de determinacin Z-W de las aves es independiente (o no) del de los mamferos. Qu podra decir
del sistema de determinacin del sexo de los reptiles
de los que se originaron mamferos y aves?
Otro resultado de inters es que los genes SOX3 y SRY
(genes que primariamente determinan el sexo) tienen
valores de Ks que los ubican entre los genes ms antiguos (es decir, genes originalmente homlogos y que
divergieron en el transcurso de la evolucin).
v) Por qu estos genes son importantes?
Finalmente, otro resultado de inters es el del gen
XIST, involucrado en la heterocromatinizacin de uno
de los cromosomas X en las mujeres. Este gen se ubica en el grupo de genes ms reciente, contrariando
hiptesis preexistentes que indicaban que surgi contemporneamente con la determinacin del sexo basada en el sistema X-Y.
vi) Qu funcin cumple la heterocromatinizacin del
cromosoma X y cmo supone que era la situacin antes de que sta apareciera? Podra postular si esta
heterocromatinizacin es evolutivamente tarda o
temprana?
Autosomas
Autosomas reptiles
X Y
XY monotremas
Y
XY marsupiales
4
3
69
X Y
X Y
XY en mamferos placen- XY humanos
tarios no simios
MEJORAMIENTO
5) La (kappa) -casena es una protena presente en la
leche bovina y juega un papel importante en el proceso de elaboracin de quesos. Un alelo del gen de la casena, llamado A, produce un tipo de casena que
da un queso de calidad superior a la que da otro alelo,
gtgctggag(t/c)aggtatcctag
regin codificante
pb
874
521
353
70
BIODIVERSIDAD
8) Ud. es un bilogo muy preocupado por la conservacin de la biodiversidad y le han encargado tratar de
armar una coleccin de germoplasma de una especie
vegetal o seleccionar un grupo de animales en peligro
de extincin para su conservacin en un rea protegida. Como est interesado en mantener la mayor cantidad de diversidad gentica pero el nmero de individuos que puede seleccionar es pequeo, est tratando
de establecer parmetros objetivos para su seleccin.
Decidi probar con los marcadores RAPD y debe evaluar qu primers y bandas son los ms informativos.Con el primer primer que prueba obtiene el siguiente patrn de bandas:
PICi = 1 j =1 pij2
donde p es la frecuencia del alelo j para el marcador i.
d) Como Ud. est bastante ansioso, y considera que la
muestra de individuos aqu analizados es representativo, como as tambin confa en el patrn de bandas
obtenidas, quiere avanzar y tener una medida de la
diversidad gentica, se decide a estimarla. Para ello
utiliza la frmula de Weir (1996). sta est formada
por la suma de cuadrados de las frecuencias de los
alelos
D = 1
1
i
L l
71
72
7 kb
E1
pb
prom
motor 21
de actina
a
de tomate
t
12 kb
3 kb
E2
370 pb
E3
pb
80
E4
4
130
0 pb
vector
c
en un Southerrn de DNAss genmicoss digeridos con
n
b) Aloe
A
HindIII provennientes de: a) tomate normal,
verra, c) tomatee transgnicoo; hibridando
o con una sonnda
de cDNA de loongitud comppleta.
2) Por qu habr
h
elegidoo tomate y no tabaco, por
ejeemplo?
3) Analizando la expresinn de los mRN
NAs de aloeeverin
na en distintoos tejidos deel tomate tran
nsgnico porr la
tccnica de Norrthern, usanddo como son
nda al cDNA
A de
alo
oeverina de longitud coompleta, se observ lo siRNA de
RNA d
de tomate transgnico
c) Porque es
e fcil de deetectar enzim
mticamente y los Aloe vera:
v
hoja raaz hoja rraz
fruto flor
resultados no
n son afecttados por la expresin de
d los
_
genes mce endgenos (cromosmic
(
cos) de las micom
mRNA
AI
bacterias traanformadas.
d) 100-200
mRNA
A II
e) Porque necesito
n
extraaer de una clula que expprese
la protena Rv, porque si no, nuncaa podra estuudiar
su efecto.
+
2) El Dr. Cuureta, en su eterna
e
bsquueda de la pcima
gu
uiente:
de la juventtud eterna, esstudi la estrructura y exppresin
a) Cules son los tamaoss del mRNA I y mRNA III?
del gen de la aloeverinaa que producce una proteena de
b) En el primeer esquema uubique (con flechas) la prop
maravillosaas propiedadees curativas y rejuvenecedoras
bab
ble ubicacin del codnn de iniciaciin y la del de
en Aloe verra (planta noo comestible). Este gen da
d oriterrminacin.
gen a dos protenas difeerentes en lass hojas y las races
c) Por qu el Dr. Cureta rreemplaz en
n su experim
mende la plantaa por splicinng alternativoo. Sin embarrgo, la
to el promotorr de la aloevverina por el de la actinaa de
nica que tiiene propiedaades especiaales es la de la
l hoja
tom
mate? Le parece
p
que eligi el prom
motor ms adea
que se prodduce en cantidades muy pequeas.
p
Addems,
cuado para sus propsitos? Por qu?
su purificaccin es ineficciente, con el
e agravante de
d que
d) Qu concllusiones sacaa a partir dee los resultados
sus propiedades se ven afectadas
a
poor las fenoloxxidasas
del Northern en
e cuanto a la especificidad tisular del
que se liberran de los lisoosomas cuanndo estas orgganelas
spllicing del RN
NA del gen dde la aloeveriina?
se rompen en el processo de homoggenizacin. Esta
E es
e) Qu sugerrencias expeerimentales le hara al Dr.
la estructuraa del gen de la aloeverinaa:
Cureta parra mejorar laa performancce de sus exxpe3 kb
12 kb
7 kb
rimentos y as obtener los resultado
os deseados?
Respuestaas 1) tomate, no da nadaa. Aloe veraa: 3
bandas de 7, 3 y 12 kpb. Tomaate transgniico:
E2
E3
E4
E1
1
promotor
dem. 2) Porque el tabaco tampoco
0
pb
130
pb
o es comestibble.
210 pb
70
p
b
8
3
s.
Respues
El
tomate,
sta
alternativ
va:
Si la ideaa es
Las flechas indican sitioos para la ennzima HindIIII. Los
de
mejorar
la
productiv
vidad,
el
taba
aco
(por su alta
a
la
dos mRNAss difieren poorque en unoo est presentte y en
oduccin
de
biomasa)
po
odra
haber
si
ido
una
alter
rnapro
el otro est ausente el exxn E3 de 800 pb. El Dr. Cureta
va interesantee. 3) a) 790 y 710, b) ATG: Una flecha
decidi obttener tomatees transgniicos transfecctando tiv
un
n
poco a la deerecha del exxtremo del exn
e
1 (no enn el
con un plssmido recom
mbinante con el gen clonaado de
ext
tremo
porqu
ue
siempre
ha
ay
un
extrem
mo
5
de mRN
NA
la aloeverinna en el que haba
h
reempllazado al proomotor
no
codificante
)
o
al
princ
ipio
del
ex
n
2.
Stop:
u
una
nativo de laa aloeverina por el de laa actina de toomate,
echa
un
poco
o
a
la
izquier
rda
del
extre
mo
derecho
fle
del
con el fin de analizar la expresin de
d mRNAs dee aloeex
n
4
(siempr
re
hay
un
se
egmento
3
no
n
codificant
te
a
verina en loos distintos teejidos:
1) Sabiendoo que los toomates no tienen
t
ningn gen 3 del codn dee terminacin), c) El promotor nativoo es
u
constituttivo
endgeno homlogo
h
a de la aloeverina, dibbuje el poco eficientee y lo reempplaza por uno
al
fue
erte,
pero
po
odra
haber
elegido
mejo
or
el
promottor:
patrn de bandas de hibbridacin quee esperara obtener
o
por ej. uno esspecfico de fruto de tom
mate, que ess el
73
74
4,2
2,2
75
Prom
- sin inhibidor
- (baja expr.)
Mendel y extensiones
1) En los cobayos, el color de pelo (negro vs blanco)
es determinado por el gen B. Los smbolos negros re-
presentan a los cobayos negros y los blancos a los cobayos de fenotipo blanco. Se dispone del siguiente
rbol genealgico, en el cual los individuos II1 y II4
pertenecen a lneas altamente endocriadas (asumir que
pertenecen a lneas puras).
a) Represente
I
2
1
el
genotipo
probable de
cada indiviII
1
2
3
4
duo (en los
casos de que
III
1
2
?
pueda ser ms
de uno, represente con un guin bajo, i.e. B_)
b) Calcule la probabilidad de que un descendiente del
cruzamiento entre III1 y III2 sea blanco. Para contestar es suficiente que escriba los genotipos al lado de
los smbolos en el esquema y las probabilidades (slo
de las que se usarn para hacer los clculos) sobre el
esquema (puede dibujarlo o escribir sobre este enunciado). De lo contrario, explique su razonamiento
Respuestas esperadas:
Bb 1
Bb
2/3 BB
---Bb
1
2 bb
3
4
b
BB
b
Bb 1
2 Bb
?
BB
II
III
76
77
Aa x aa
(1) Aa , (2) aa, (3) aa, (4) ? (por lo que se ve ms abajo es Aa)
c) Estar localizado (mapear) lo ms cerca posible (estrechamente ligado) al locus a diagnosticar. Me tiene
que permitir distinguir no solamente al enfermo (o que
potencialmente se va a enfermar) del no enfermo (fenotipo) sino tambin homocigotas de hetrocigotas
(sobre todo en enfermedades recesivas, que no es este
caso).
d) El marcador PV123 tiene 2 alelos: uno que se visualiza como una banda de 5 kb (alelo sano) y otro
como 2 bandas de 3 y 2 kb (alelo enfermo), respectivamente. [El polimorfismo probablemente se deba a
la aparicin de un nuevo sitio de restriccin en el segundo caso]
e) Que comience un tratamiento para amortiguar la
aparicin de la enfermedad dado que es portador del
alelo que predispone a la enfermedad.
5) Se present ante los tribunales de justicia el siguiente caso: la familia Prez reclama que cierto beb
(Juan), que les dieron en la maternidad, no les pertenece y que, en cambio, el beb Felipe, que tiene la
familia Garca, es el suyo y se lo cambiaron. La familia Garca niega este hecho, y el tribunal ordena el
examen de los grupos sanguneos de los bebes y de los
padres, con los siguientes resultados:
Ma- PaBeb
dre
dre
Familia Prez AB
O
A
(Juan)
Flia. Garca
A
O
O (Felipe)
Qu familia tiene razn y por qu?
Respuesta: la Garca. Si escribimos los genotipos
completos de los padres resulta claro que el primer
podra ser resultado de cualquiera de las 2 parejas,
pero el segundo beb slo de la segunda
Ma- Pa- Beb
dre
dre
Familia Prez
AB
OO AO
Flia Garca
AO
OO OO
Mapeo
1) En una determinada especie animal los loci A,a; B,
b y C,c se localizan en el mismo autosoma. El locus
B,b es el central. La distancia entre A,a y B,b es de 20
unidades de mapa, la distancia entre B, b y C, c es de
10 unidades de mapa y el coeficiente de coincidencia
es 0,6. Indicar la proporcin esperada de individuos
obtenidos con el fenotipo Abc.
78
Gentica Bacteriana
1) Cmo esperara que fuera la transferencia heredable del gen lac+ en cruzamientos entre cepas donoras
de E. coli lac+ a) Hfr, b) F+ y c) F'lac con cepas receptoras F- lac- incapaces de recombinar (rec-)? Justifique su respuesta
Respuesta: El nico cruzamiento capaz de transferir
el gen lac+ en forma heredable es aquel en el que interviene la donora c) F'lac debido a que el gen lac+
forma parte del plsmido transferido que no requiere
de recombinacin (entrecruzamiento) para mantenerse
establemente en la clula receptora..
La cepa b) es capaz de transferir lac+ pero la cepa receptora requiere de las funciones de recombinacin
homloga para que se produzca el reemplazo allico
(entrecruzamiento) para integrar establemente el gen
recibido. Como el segmento transferido es inestable
(es lineal, no puede replicarse correctamente y es susceptible a degradacin por nucleasasas) termina perdindose.
La cepa a) F+ slo puede transferir lac+ con muy baja
frecuencia si en alguna de sus clulas el factor F se
integra previamente al cromosoma principal (esas po-
B1
79
3) 10, 5
S19
bp26
bmp18
/
1
4) una prueba de recombinacin equiva990 bp
696 bp
p26f
p26r
p18f
p18r
lente a una prueba de 3 puntos con los 3
B + B
marcadores de este experimento. 5) Diluc
Primer evento
bujito
R
pKS26L
Kn
de entrecruza3) Un tema de inters para la medicina
sac
humana y veterinaria es el desarrollo de
Integracin del plsmido suicida
vacunas ms confiables. En el caso de la
R
2
Kn
brucelosis (que es una zoonosis, es deluc
bp26
bp26
bmp18
/
sacB
cir, enferma a animales y a humanos) se
a
b
desarrollaron vacunas para el ganado
Segundo evento
Seleccin con sacarosa
vacuno que consisten en bacterias vivas
de entrecruzaatenuadas por diferentes procedimientos
N
B
de cultivo. En este contexto, en la Arluc
bmp18
3
/
1837 bp
990 bp
gentina se utiliza la cepa S19 que tiene
p26f
p26r
p18f
p18r
algunos problemas porque no est sufi+
bmp18
cientemente atenuada. Con el adveniR
Primer
evento
pSD18
miento de la ingeniera gentica se puAp
de
entrecruzadieron caracterizar genes como el bp26
sacB
y el bmp18 que, al ser mutados, prctiIntegracin del plsmido suicida
camente eliminan la virulencia, tal como
4
lo publican Campos y col (Veterinary
R
sacB
Ap
bmp18
bmp18
luc
Microbiology, 2002). En un trabajo pre/
a
vio, lo demostraron mediante el desarrob
Segundo
evento
llo de mutantes knock-out para ambos
Seleccin con sacarosa
de entrecruzagenes.
a) Indique una estrategia de cmo
5
bmp18
hubiese obtenido Ud. esta mutante INTA2
luc
/
694 bp
1837 bp
knock-out. Utilice exclusivamente esp26f
p26r
p18f
p18r
quemas para su respuesta
distinguir
animales
vacunados
de
infectados en forma
Debido a que no resulta deseable la liberacin de organismos modificados genticamente conteniendo sencilla, barata y masiva. Tradicionalmente, el diagenes de resistencia a antibiticos (y menos si stos gnstico se realiza mediante la deteccin de anticuerson patognicos), para la construccin de la cepa mu- pos anti-Brucella en sangre porque la bacteria es muy
tante vacunal bp26::luc bmp18 ( simboliza dele- difcil de detectar y no resulta sencillo diferenciar encin y :: simboliza insercin y que bautizaron IN- tre los animales que tienen estos anticuerpos debido a
TA2) usaron una tcnica de contraseleccin (ver Figu- que estuvieron infectados o porque fueron vacunados.
Qu solucin le parece que proponen los diseadores
ra).
de esta vacuna?
Aclaraciones: El gen sacB (de Bacillus subtilis) codiRespuestas esperadas: a) Se podra usar el mismo
fica para una levansacarasa que metaboliza la sacarosa
esquema del enunciado (parte izquierda) reemplazanen un levano que es txico para Brucella. Es decir que
do el gen luc por un gen de resistencia a antibitico
las bacterias que contienen este gen se mueren cuando
(por ej. a Tetraciclina) y manteniendo el gen de resisse agrega sacarosa al medio de cultivo. a y b sealan
tencia a kanamicina (o el SacB) para seleccionar el
secuencias homlogas (probables sitios de entrecrudoble recombinante.
zamiento). El gen luc codifica para la luciferasa de
b) i) Suponiendo que se quiera ir paso a paso (como
lucirnaga, los genes ApR y KnR para resistencia a
sugiere el flujo de esquemas) y seleccionar primero el
ampicilina y kanamicina, respectivamente. En varios
cointegrado (construccin 2) y recin despus el doble
de los genes se especifican, con flechas, oligonuclerecombinante (construccin 3): KnR servira para setidos diseados para PCR y el tamao del fragmento
leccionar en un medio conteniendo kanamicina (en
de amplificacin esperado.
ausencia de sacarosa). En un segundo paso, se pasarb) Qu funcin especfica cumplen los siguientes an las bacterias a un medio conteniendo sacarosa, en
genes marcadores en el esquema de obtencin de la ausencia de kanamicina. [De hecho, esto fue lo que
cepa vacunal?
hicieron los autores del trabajo]. Lo mismo con ApR
i) ApR y KnR (2 ptos); ii) luc (2 ptos); iii) sacB
para el gen bmp18.
c) Porqu se usaron plsmidos suicidas?
Otra respuesta correcta: Suponiendo que se quisiera
d) Disee un sistema molecular de deteccin para dis- seleccionar directamente la construccin 3, sin pasar
tinguir los 5 genotipos posibles entre s. Explquelo.
por la construccin 2 (doble recombinante directo),
e) Un punto importante en cualquier campaa de erra- KnR no tiene funcin alguna en el experimento del
dicacin de enfermedades como la brucelosis es poder
80
problema. Al utilizarse el sistema de contraseleccin PCR. En la realidad, esta ltima variante no es practibasado en SacB podra no estar presente, sin afectar cable, porque la cepa vacunal sobrevive muy poco a
con su ausencia el resultado. En este caso, su nica las defensas del animal y resulta muy lento, peligroso
funcin es ser un marcador selectivo en E. coli (otorga y poco prctico el aislamiento de bacterias patognial plsmido una ventaja selectiva que ayuda a mante- cas.
nerlo, evitando su prdida, durante su multiplicacin 4) Bacterias de una cepa de E. coli Hfr rec+ bio+ his+
en E. coli). En el caso del segundo plsmido conte- StrS son mezcladas junto a bacterias de otra cepa de E.
niendo ApR, esta aproximacin es mucho ms difcil coli F- rec+ bio- his- StrR. A diferentes tiempos, se
(aunque no imposible) porque no tengo un gen indica- inter-rumpieron las conjugaciones, se plaque en los
dor y slo puedo distinguir dobles recombinantes siguientes medios selectivos (todos conteniendo Str)
(construccin 5) de salvajes (construccin 3) mediante y al da siguiente se cont el N de colonias. (MM =
PCR de las colonias, por ej.
medio mnimo)
Tiemp N de colonias en
ii) Este gen sirve para distinguir las mutantes knock
(min)
M
MM+b MM+h MM+bio+
out para el gen bp2 que quiero seleccionar (consM
io
is
his
truccin 3) de las revertantes salvajes (construccin
5
0
0
0
503
1), dado que ambas sobreviven en el medio conte10
0
0
34
487
niendo sacarosa.
15
0
0
44
499
iii) Como dice el enunciado, este gen sirve para con20
0
0
50
503
traseleccionar (seleccionar en forma negativa) las
25
0
0
59
498
construcciones 2 y 4 en presencia de sacarosa.
30
20 30
80
501
c) Bsicamente, el que el plsmido sea suicida me
a) El experimento anterior se aprovech para mapear
permite seleccionar ms eficientemente al recombilos genes involucrados en la sntesis de biotina.
nante. Suponiendo que la seleccin de las construcUbique en el mapa gentico el gen bio. Se aclara la
ciones se hizo paso a paso [como se explica en b)
posicin donde est integrada la secuencia del
i)], si el plsmido replicara en Brucella, la seleccin
plsmido F en esta cepa Hfr, y adems la del gen his,
en presencia de kanamicina solo me dara muchsimas
previamente mapeado.
bacterias con el plsmido sin integrar y me sera exb) Un amigo suyo, estudiante de Biologa, le cuenta
tremadamente dificultoso aislar el recombinante
que hizo un experimento de conjugacin -mientras
(construccin 2) por su baja probabilidad de ocurrenmiraba videoclips de Britney Spears- con una cepa
cia.
Hfr diferente a la anterior, la cual, al conjugar con la
Ahora, suponiendo la alternativa de seleccin directa
misma F- que en el experimento
del doble recombinante [como se explica en otra resanterior, le transfiere el gen his a
puesta correcta en b) i)], el primer plsmido podra
los 20 min y el gen bio a los
no ser suicida, porque sera seleccionado en forma
F
40 min. Le creera a su
negativa en presencia de sacarosa.
amigo o pensara que se
d) Por PCR usando los primers flanqueantes de los
distrajo mientras haca los
his
genes. Las construcciones 1, 3 y 5 daran una sola
experimentos?
banda por primer (total 2 bandas), a saber 696 + 990
c) Un fago que hace
en 1, 1837 + 990 en 3 y 1837 + 694 en 5. Los cointetransduccin
generalizada
grados daran 2 bandas, para el par de primers p26 en
puede encapsidar fragmentos de
2 o para el par de primers p18 en 4. En total 3 bandas.
DNA genmico de una cepa bacteriana infectada y
Tambin se considerarn correctas respuestas con
lisada que tengan un tamao de hasta 30.000 pb. Si
otras variantes (deteccin de fluorescencia en lugar de
ese fago es usado para infectar una cepa de E. coli
la banda de 1837 combinada con PCR de los otros
salvaje, y el lisado resultante es usado, a baja
genes; RFLPs usando bp26 y bmp18 como sondas,
multiplicidad de infeccin, para infectar a la Fdeteccin de las protenas codificadas mediante Wesmencionada antes. Esperara observar colonias en
tern, etc.), siempre y cuando la respuesta permita difeMM? Justifique (1 min equivale a 20 kpb aprox)
renciar claramente los 5 genotipos.
e) Usara Ud. la cepa F- en MM para testear la mutae) La presencia de anticuerpos anti-luciferasa diferengenicidad de una sustancia en un test de Ames?
cian animales vacunados con esta cepa respecto de los
que se infectaron con una cepa salvaje no recombinan- Respuestas esperadas a) El gen bio entra a los 10
te. La ausencia (versus presencia) de anticuerpos con- y el his a los 30, por lo tanto el gen bio se encuentra a
1/3 de la distancia entre F e his.b) Le creo, seguratra bp26 y bmp18, es otra variante de la respuesta.
Tambin se considerar correcta (con la mitad de la mente tiene un Hfr distinto con el F integrado apunnota = 2,5 ptos) la respuesta que proponga el aisla- tando al revs y en otra posicin. Ntese que la dismiento de bacterias del animal, las cuales deberan no tancia entre his y bio es de 20 (igual que en este exser fluorescentes en presencia de luciferina en el caso perimento). c) No, estn demasiado lejos para ser code la cepa de campo y ser fluorescentes en el caso de transducidos. d) No, porque es una doble auxtrofa y
la cepa vacunal. Idem si la tcnica seleccionada es una por lo tanto requiero de la mutacin (reversin) si-
81
multnea de al menos 2 bases distintas y cuya reversin no necesariamente requieren del mismo mecanismo de mutacin Respuesta alternativa que, en caso
de aparecer, debe ser considerada correcta: S, si utilizo MM+ bio (o MM+ arg)
4) Un investigador est interesado en mapear y estudiar 3 genes bacterianos a, b y c involucrados en la
biosntesis de aminocidos. Se sabe que los productos
de los genes a, b y c catalizan las siguientes reacciones:
C
Leu
X
B
Val
N recombinantes
c+ StrR
a+ StrR
b+ StrR
12
16
20
24
t (min)
que
se
Alu I
muestran.
Alu I
P
AmpR
AmpR
Vector 1
Ile
vectores
82
Mutagnesis y Transposicin
1) En levaduras, el tratamiento con mutgenos permiti seleccionar, en forma independiente, varios tipos
83
LTR
Promotor
Intrn
LTR
IR
Prom HSP
Intrn
IR
84
cepa
completo,
85
i) Qu le indican
i
estoss resultados en cuanto a la determinacinn bioqumicca del coloor de las flores?
f
86
87
158
145
sionar gametas desbalanceadas. Luego repiti los cruzamientos arvejas de flores blancas por arvejas de flores rojas. Qu proporciones de plantas con flores
blancas y rojas obtuvo en la F2? Describa los genotipos simplificados de dicha F2, de la F1 que le dio origen y de los parentales poliploides (usar guiones bajos
para ejemplificar casos en que ambas variantes genotpicas resultan en fenotipos equivalentes)
Respuesta correcta:
Fig. 2
Fig. 1
c) De acuerdo a lo que muestra este trabajo. En principio, las prtesis de cromo-cobalto inducen mutaciones somticas o germinales? Es decir, podran aumentar la probabilidad de que se produzcan malformaciones genticas en la descendencia de estos pacientes?
88
Gentica cuantitativa
1) La longitud media internodal en espigas de cebada
de la variedad gran cervecera es de 4,24 mm (con
baja variancia). En la variedad imperial la media internodal es de 6,34 mm (con baja variancia). La media
de la F1 de un cruce entre las dos variedades tiene,
aproximadamente, 5,4 mm (con baja variancia). La F2
da tambin 5,4 mm pero con un rango de variacin
continuo desde un extremo parental al otro (alta variancia). El anlisis de la progenie de la autofecundacin de cada uno de los individuos de la F2 mostr 3
distribuciones entre sus descendientes: i) tipo gran
cervecera con media de 4,24 mm y baja variancia, ii)
tipo imperial de 6,34 mm y baja variancia y iii) igual a
la F2. La longitud internodal en espigas de cebada, es
un carcter discontinuo o cuantitativo?Cuntos loci
estn involucrados en la segregacin del carcter?Por
qu?
Respuesta: La respuesta puede ser de distintas maneras (ver ms abajo) pero se debe concluir que la
herencia involucra un nico locus y es tpicamente
mendeliana (en este caso semidominante ) y no de
tipo cuantitativa. Si gran cervecera es AA e imperial aa, la F1 es Aa (semidominante) y los individuos
de la F2 son AA, aa o Aa, como lo demuestra el comportamiento de las respectivas pruebas de progenie. Se
puede contestar que es un carcter discontinuo (medido cuantitativamente) o que es cuantitativo (por su
forma de medicin) pero formado por un nico locus
(QTL).
2) Una poblacin vegetal silvestre es sometida durante
muchas generaciones sucesivas a un proceso de seleccin artificial basado en sembrar cada ao nicamente
las semillas procedentes de plantas incluidas en el
20% de mayor produccin. Como consecuencia de la
seleccin practicada, la produccin media aumenta
gradualmente. Los valores de heredabilidad del carc-
ter produccin en dicha poblacin a lo largo del proceso selectivo sern a) creciente, b) decreciente, c)
primero creciente y luego decreciente d) constante.
Justifique su respuesta.
Respuesta: Decreciente. La heredabilidad est en
funcin directa con la variabilidad gentica (varianza
genotpica), la cual disminuye con el proceso de seleccin.[Respuesta alternativa: debera ser decreciente
y despus constante, una vez agotada la variabilidad
genotpica].
3) Dados los excepcionales conocimientos de Gentica que adquiri en tiempo rcord en este curso de verano y gracias a la devaluacin y sus bajas pretensiones salariales, una exitosa empresa textil exportadora
de productos regionales decide contratarlo para mejorar la productividad y la calidad de la lana de sus rebaos de llamas. El establecimiento del NOA dispone
de una poblacin de animales cuya produccin de lana
y calidad de la fibra siguen una distribucin de tipo
normal y que se muestran en A y B, respectivamente.
Tal como aprendi en Gentica I, lo primero que hace
es estudiar la heredabilidad del carcter y para ello
dividi la poblacin en 3 subgrupos cada una (denominados 1, 2 y 3 en la figura) de acuerdo a los valores
promedio de produccin o calidad X1, X2 y X3, respectivamente). Seguidamente dej que los individuos
de cada una de las subpoblaciones creadas se aparearan entre s y analiz la distribucin de valores de la
siguiente generacin. Como se ve en la figura, los valores promedio de la nueva generacin coincidieron
con los valores promedio de cada una de las subpoblaciones paternas en A (productividad). En cambio
en B (calidad) coincidieron con el promedio de la poblacin original sin seleccionar.
89
argentino) aunque de productividad de lana muy inferior. Indeciso, compra esas llamas y vuelve al establecimiento a realizar nuevos cruzamientos entre ellas y
las argentinas. Para su sorpresa, entre los descendientes no slo obtiene individuos con un aumento de la
calidad de la fibra, sino que algunos (muy pocos)
animales tienen una productividad superior a la observada en la subpoblacin seleccionada de A. Desconfiado, supone que los valores de estos pocos individuos podran estar influidos por el ambiente, por lo
que los pone aparte, deja que se crucen entre s y analiza sus hijos. Resultado: la alta productividad se mantiene y obtuvo las mejores llamas de la historia.
d) Cmo explica su buena suerte? Es decir, a qu
fenmeno gentico atribuye este resultado?
A todo esto, ya pasaron varios aos y decide ir con sus
resultados a pedir un considerable aumento de sueldo.
Sin embargo, a esta altura del partido, vuelve Cavallo
al ministerio de Economa, reimplanta la convertibilidad y la empresa entra en crisis, entre otras cosas porque, durante los aos en Ud. haca estudios genticos,
la productividad no aument y decidieron prescindir
de sus servicios por ineficiente (no vale la pena
hacer investigacin y desarrollo en la Argentina, le
argumentaron) y le vendieron las llamas a Telecom
para su famosa propaganda (porque observaron que
llamaban por telfono muy seguido a sus familiares
bolivianos).
Mientras tanto, su hermanito ms chico decide seguir
sus pasos y en la facultad aprende que un grupo en
Australia, public un trabajo en el que encuentra una
asociacin entre un RFLP correspondiente a un gen
que interviene en la sntesis de la queratina en la lana
en ovejas y que explica el 90% de la variabilidad (varianza gentica) del carcter calidad de la fibra.
e) En base a toda esta experiencia y en no ms de 10
renglones qu hubiera hecho distinto (adems de votar con conciencia) para evitar este final? Nota: se castigar con -1 punto si la respuesta excede los 10 renglones.
Respuesta: a) 1 (100%) y 0, respectivamente, b)
igual, c) Que, dada la alta heredabilidad de A, puedo
tratar de seguir seleccionando individuos en base a
produccin y que, dada la nula heredabilidad de B, no
hay variabilidad gentica y no tiene sentido seleccionar para este carcter. Deberan buscarse otras fuentes
de variabilidad. d) Segregacin transgresiva. e) Hubiera tratado de hacer mis primeras evaluaciones utilizando la mayor diversidad gentica disponible (y no
limitarme a los animales del establecimiento) y, en
paralelo, hubiera buscado la literatura cientfica relacionada para evaluar la factibilidad de encontrar marcadores moleculares para el carcter estudiado que me
sirvan para seleccionar con ms eficiencia. Por ejemplo, intentara usar el gen de oveja como sonda que, si
hibrida con el gen homlogo de la llama, podra servir
para observar si encuentro un polimorfismo til en
llama para RFLP (u otra tcnica como STS, SSCP,
etc.), es decir, ver si hay cosegregacin de un marca-
90
Xs - Xo
b) a la varianza ambiental e interaccin genotipoambiente (carcter cuantitativo, con alta componente ambiental).
c) Dado que entre los dos QTLs explican el 85 % de
la varianza gentica, es muy probable que haya
otro/s QTLs de efecto menor en otros grupos de
ligamento no detectados
d) Se esta evaluando con un marcador ligado a un
solo QTL y la resistencia moderada observada
puede deberse a la presencia de otro/s QTL/s en
esos individuos. Tambin pueden decir que hubo
recombinacin entre el marcador y el QTL, pero
dado que se dijo que estaban estrechamente ligado
se espera que deduzcan la primera respuesta
Gentica de poblaciones
1) La apolipoprotena E (apoE) fue implicada como
un factor de riesgo en las enfermedades cardiovasculares y en el Alzheimer. Se describieron 3 alelos comunes: apoE2, apoE3 y apoE4. La tabla muestra la
distribucin poblacional de los distintos genotipos:
Cul es la frecuencia del alelo apoE2?
a) 0,002 b) 0,040 c) 0,076 d) 0,175
Respuesta:b) [f(E2)= (2x2)+(64)+(7)/(937x2)=0,040]
GenotipoE2E2E2E3 E2E4 E3E3E3E4E4E4Total
N indiv 2
64 7
684 169 11 937
2) Uno de los riesgos cientficamente aceptados en el
uso de las plantas transgnicas Bt (es decir, conteniendo un transgn que codifica para la entomotoxina
de una cepa de Bacillus thuringiensis) con resistencia
a los insectos, es el que se refiere a la predecible seleccin de mutantes de insectos resistentes. Varios
factores contribuyen a predecir este desarrollo de resistencia: la historia previa de uso de insecticidas
qumicos y, ya ms especficamente, la seleccin de
insectos resistentes en cultivos orgnicos que utilizan
este insecticida como mtodo de control biolgico, el
uso generalizado de plantas resistentes que reemplazaran a las sensibles (alta presin de seleccin), la
presencia de un nico transgn codificante para una
nica protena (en lugar de varias) lo que implica que
con una nica mutacin de un gen contra esa protena
se obtendran mutantes especficamente resistentes
para esa protena, y datos de seleccin en condiciones
de laboratorio. Por ejemplo, el grupo de Gould (PNAS
89:7986, 1992) seleccion la cepa mutante YIID2
mediante alimentacin artificial en medios conteniendo dosis subptimas de la toxina por nueve generaciones. El anlisis gentico de la mutante utilizando marcadores moleculares indic la presencia de un gen de
resistencia mayor de expresin recesiva. El modo de
accin del gen es disminuir la capacidad de unin de
la toxina a las protenas intestinales. Que son blanco
de la toxina. Tambin se demostr que esta mutante es
capaz de atacar exitosamente al algodn transgnico
comercial en condiciones de invernculo. Si bien ninguno de los datos anteriores demuestra que vaya a
haber resistencia funcional en condiciones de campo,
91
92
En
n B se sombrrean: II 2, 3,, 5; III 1, 3, 4, 8,10,11; IV
tod
dos
2) El siguientee rbol muesstra una fam
milia que hereda
un
na forma seveera de hidroccefalia causaada por una mum
taccin en el gen L1CAM (llocalizado en
n el cromosooma
X)) y que pressenta una heerencia recessiva. Utilizanndo
un
n marcador inntragnico quue tiene tress alelos (12, 8 y
7) se hace el diagnstico
d
del propsitto (nombre que
q
recciben los ppacientes ppor parte dee los genetisstas
mdicos y que se inndica con una flechha).
Genticas no Mendellianas
1) La neuroopata pticaa hereditaria de Leber (N
NOHL)
es una enferrmedad rara en la especie humana quue produce una rpida atrofia del nervio ptico
y que genera
g
ceguera en adultos jveenes. Esta ennfermedad esst caracterizada por una prddida bilateraal de la visin central mientraas que se maantiene la visin perifriica. La
genealoga de la izquierrda muestra la herencia de
d esta
enfermedadd en una famiilia bastante amplia:
C
Cul fue el resultado del ddiagnstico?
a) La propsitoo es portadorra del alelo mutante
m
b) La propsitoo es heterociigota no portadora
c) La propsitoo es homociggota para el alelo
a
normal
d) El resultadoo no permitee dar un diag
gnstico precciso
sob
bre el genotipo.
Reespuesta: b)
3) En el antigguo testamento, Dios dispuso
d
que los
hijos de Isaac y su mujer cconstituiran la nacin judda.
Sin
n embargo, la
l esposa de Isaac era baastante mayoor y
sup
puestamente infecunda. Segn las co
ostumbres loocaless de la pocaa, ella eligi uuna mujer allternativa conn la
qu
ue Isaac tuvo un hijo: Esaa. Un da, laa anciana muujer
le coment a Isaac
I
que esttaba encinta y tuvo un hijo:
h
con 5 herm
maJaccobo. Posterriormente, Jaacobo se cas
nas (de otra familia)
fa
y tuuvo 13 hijos y varias hijjas.
uponiendo quue pudiera accceder a mu
uestras de tejjido
Su
de Isaac, Esa, Jacobo y de los hijos de Jacoboo y,
adems, pudieese extraer D
DNA y analizarlo:
a) Cuntos haaplotipos o ssecuencias nucleotdicas
din
ferrentes en la regin del ccromosoma Y en la reggin
del gen Sry obttendra? Justifique.
b) Cuntos tippos de secueencias nucleo
otdicas diferrentess del D-loop de DNA miitocondrial obtendra?
o
Juustifiq
que.
So
olucin: a) Uno slo: el que prov
viene de Issaac
(heerencia ligadda al sexo, etcc.)
b) 4: el de Isaaac (donado poor su madre)), el que provviene de la madree de Esa, eel que provieene de la maadre
de Jacobo y el que provienne de la mad
dre de las 5 herh
maanas (herenciia materna...)
4) Aproximadaamente el 0,,3% de la hu
umanidad tiene
na enfermedaad gentica lleve llamadaa LHON prooduun
cid
da por una mutacin
m
que substituye una
u Asn por una
u
Assp en el compplejo NADH
H mitocondriaal.
93
L
Le podr conttestar sin neccesidad de peedirle un anlisiss gentico detallado (pediigr) a la seora? Justifique
breevemente.
Evolucin
n, Mejoram
miento, Biod
diversidad
1) La papa-ocaa es un cultiivo andino de
d origen preecolom
mbino (fue, para los inccas, tan impo
ortante comoo la
pap
pa comn) que
q se cultivva en el NOA y es de gran
g
intters evolutivo, antropollgico y eco
onmico. Perrtenece a la esppecie octoploide Oxaliss tuberosa. El
n
mero bsicoo de cromosoomas permitti agrupar esta
e
esp
pecie con otrras, dentro ddel gnero y postular su orio
gen
n evolutivo por alopolipploida o auttopoliploidaa de
esp
pecies del gnero. Para ccorroborar esste agrupamiiento mediante esttudios de evvolucin molecular y cuantificcar la similituud gentica ccon otras esp
pecies del gnero,, Tosto y cool. (Plant Syystem Evol 2000)
2
utilizaaron
AF
FLP para obbtener patronnes de bandaas polimrfiicas
parra as generaar un dendroggrama.
94
Neandertal
Humanos
modernos
(incluyen
blancos, negros,
australianos,
amerindios, etc)
c) Por qu se utilizaron secuencias mitocondriales y
no secuencias nucleares?
Respuestas: a) A out of Africa porque muestra que
neandertales y cromagnones forman clusters (agrupamientos) muy separados entre s. Si fuera cierta la
hiptesis multiregional se esperaran mayores similitudes. De todos modos, hubiese sido interesado usar
un outgroup (control externo) para relativizar estos
valores.
b) S, por lo explicado en a) aunque para estar seguro
necesitara comparar con, por ejemplo, el chimpanc.
c) Porque las secuencias nucleotdicas mitocondriales
tienen una tasa de mutacin (velocidad de evolucin)
mucho mayor y permiten ajustar con mejor precisin
el reloj molecular en estas distancias evolutivas. [Sin
embargo, tambin se usa una secuencia nuclear ubicada en el cromosoma Y].
Genmica
1) Mediante el uso de marcadores moleculares se
construy un mapa de ligamiento del ratn, usando
como genotipos parentales de la poblacin de mapeo a
dos lneas endocriadas que presentan una marcada
diferencia respecto a su predisposicin a contraer
Alzheimer experimental (enfermedad caracterizada
por una acelerada desmielinizacin a nivel cerebral).
Se localiz en dicho mapa de ligamiento, adems, un
locus (gen de expresin recesiva) involucrado en dicha predisposicin. El mencionado gen (al que se denomin alz) mapea en el cromosoma 3, flanqueado a
10 cM y 13 cM por dos marcadores RFLP humanos
denominados hs3 y hs1, respectivamente (Fig. 1) (Nota: fue posible usar sondas humanas ya que muchas
sondas de esta especie hibridan con DNA de ratn
debido a su alto grado de parentesco). Recientemente,
un grupo de investigacin, clon molecularmente en
humanos, un gen (gdm) involucrado en la regulacin
de la produccin de mielina a nivel cerebral y lo mape en el cromosoma 8, flanqueado a 12cM y 15cM,
por los mismos marcadores hs3 y hs1. En la publicacin de dicho trabajo, los autores reportaron la localizacin cromosmica del gen y su secuencia completa.
Al leer este trabajo, se sospech (y con fundamento)
que el gen de ratn podra ser un homlogo del gen
95
10
13
hs3
gdm
hs1
Hum
mano
c
cM
12
1
15
hs3
alz
hs1
Ratn
qu?
b) Qu tipo dee vectores see utilizan (plsmidos, fagos,
csmidos, BAC
C o YAC) y porqu?
c) Suponiendo que los marcadores moleeculares em-pleeados (M1, M2,
M M3 y M44) son RFLP
Ps Cmo se
hace (metodolgicamente) para identifiicar los clonees
1, 2, 3 y 4 de laa figura y su ordenamien
nto posicional
(m
mapa fisico)?
d) Cul es el tamao
t
fsicoo aproximad
do (en kiloparres de bases)) de 1 unidadd de mapa geentico (1 cM
M)
en el ejemplo de
d la figura?
Por qu esta diferencia
d
de unidades? Cmo
se mide
cad
da una de elllas?
Un
na vez identificados los cclones corresp
pondientes a
estta regin cromosmica, ssus insertos se
s subdividenn
en tamaos ms chicos (paso q) para su
s subclonado y
traansferencia a plantas (passo r) para ev
valuar a estas
lttimas fenotppicamente coomo R (resisttentes) o S
(seensibles) a laa enfermedadd.
96
97
Rta I)
bcd
gen
HB
nos
mRNA
hb
mRNA cd
cd
hb
Explicacin: bcd y nos son los morfgenos de la parte anterior y posterior: bcd actua como factor de transcripcin para hb regulando positivamente su transcripcin, pero tambin es un inhibidor de la traduccin del
morfgeno cd, que es ms tardo. Anlogamente, nos es un inhibidor del morfgeno ms tardio de la parte anterior, hb.
II) Explicacin: bcd es el morfgeno principal anterior, ya que donde se coloca, se generan zonas que darn
lugar a estructuras anteriores (cabeza y torax). El esquema del primer experimento sera anlogo a una complementacin (mutante bcd-, con fenotipo WT por el agregado del morfgeno anterior en la zona correspondiente).
Desarrollo normal
inyectado adelante
inyectado al medio
98