Enfoque 

metabolómico para
la determinación de multibiomarcadores
 para investigar la infección por el virus
del dengue en pacientes humanos (2017)
Autores: Nurul Shahfiza, Hasnah Osman, Tang Thean Hock, Abdel-Hamid Zak
DOI: 10.18388/abp.2015_1224

Estudiante: Julio Coloma

Problema
• +50 millones de casos
anuales
• Características clínicas
inespecíficas
• El diagnosis serológico es
una alternativa poco
desarrollada
• Existe una demanda alta
de métodos de detección
rápida

Tamaño de la muestra
Recolección de muestras
calculado en Sample Size
Program
Muestras de orina de 96
pacientes con dengue y 50
pacientes sanos
Metodología
Los contenedores de las
Preparación de muestras
muestras fueron guardados
en una caja fría.
Centrifugadas a 1500 x g por
10 minutos
Alícuotas de 1 ml de las
muestras son colocadas en
tubos de 1.5 ml y guardadas a
-80°C previo a la
espectrometría por RMN
Los espectros de protones de
análisis quimiométrico
Procesamiento de archivos NMR y
RMN de las muestras fueron
sometidas a análisis
quimiométrico.
Usando el software Chenomx
5.1, las señales promedio de
datos de RMN de protons se
sometieron a ACP y análisis
discriminante de mínimos
cuadrados.
Análisis de componentes
Reconocimiento de patrones
principales (PCA) y el análisis
discriminante de mínimos
cuadrados parciales
ortogonales (OPLS-DA), con el
software SIMCA-P+.
Se utilizó el diagrama S de
OPLS-DA para proponer
posibles multibiomarcadores.
Se aplicaron diferentes
algoritmos de
preprocesamiento de datos,
como la normalización y la
variación normal estándar
(SNV), en sujetos infectados
con dengue versus control
sano

Para los espectros agrupados,
inicialmente se aplicó el análisis
de componentes principales
(PCA) para el agrupamiento de
datos. El análisis de PCA no
pudo revelar los resultados del
agrupamiento entre estas dos
clases.
Resultados
Se observó un agrupamiento muy
estrecho para las muestras sanas.
Mientras que el otro grupo clasificado
con la enfermedad del dengue se
dispersó en el gráfico de puntuación
que destacó la heterogeneidad de los
perfiles metabólicos.
Los metabolitos que estaban
lejos del origen y cerca del eje
vertical de la gráfica S (Fig. 3)
fueron los responsables de la
separación observada en la
figura 2.
 Resultados

La variación descubierta en los metabolitos podría ser una evidencia de que las diferentes rutas de
los metabolitos se ven afectados por la infección del dengue. En general, los metabolitos
identificados estaban relacionados con el metabolismo energético mitocondrial, el nivel de
metabolitos relacionados con el músculo y los metabolitos relacionados con los ritmos circadianos
dependía del momento de la recolección de la orina.