BIOQUIMICA

INTRODUCCION
INTRODUCCIÓN
Bioquímica es una ciencia médica y biológica fundamental, que estudia la
composición molecular de las células vivas, las reacciones químicas que
sufren los compuestos biológicos y la regulación de estas reacciones,
incluyendo también el estudio de las interacciones no covalentes de las
moléculas que se relacionan con la estructura y la función celular y
molecular; siendo la biología molecular, la principal rama de la
bioquímica, que estudia la estructura de los genes, su función y
regulación.

La bioquímica ayuda a comprender ciencias como: biología celular,

microbiología, nutrición, farmacología y fisiología molecular.

La complejidad de los sistemas vivos a veces es de enormes proporciones y

desconcertante, y a ella se suman los numerosos componentes que
constituyen a los seres vivos: humanos, animales, vegetales y agentes
patógenos que los infectan.

Todas las formas de vida están compuestas de unas 50 estructuras

fundamentales y el reconocimiento de estos compuestos simplifica en
gran medida el estudio de la bioquímica.
INTRODUCCIÓN
La estructura de todo ser vivo en un alto porcentaje es celular y la gran
mayoría de las reacciones biológicas ocurren dentro de las célula, las
cuales están suspendidas en una matriz extracelular, para formar tejidos y
órganos.

Los organismos vivos obedecen las leyes de la física y la química que se

observan en cualquier parte del universo, no existe ninguna fuerza vital que
gobierne la actividad biológica.

Todo compuesto biológico está hecho de los mismos elementos que se

encuentran en otras moléculas, pero el predominio de algunos elementos en
las células difiere marcadamente de su abundancia en la tierra. De la
totalidad de elementos que surgen en forma espontánea,
aproximadamente (92), de ellos, alrededor de 24 son indispensables en las
células vivas y de estos los más importantes son el C, H, N, P , S y O, éste
último porque forma el agua, la cual es abundante en los seres vivos. Otros
elementos como el Al, Si y Fe, son muy abundantes en la naturaleza, pero
se encuentran en calidad de traza en los seres vivos.
INTRODUCCIÓN
PORCETAJE ELEMENTOS COMPONENETES PRINCIPALES EN EL UNIVERSO, LA TIERRA Y LA
MATERIA VIVA
CORTEZA
ELEMENTOS UNIVERSO MATERIA VIVA
TERRESTRE
Hidrógeno 91,0 0,22 63,0
Helio 9,1 - -
Oxígeno 0,06 47,0 25,5
Nitrógeno 0,04 0,007 1,4
Carbono 0,02 0.19 9,5
Silicio 0,003 28,0 -
Neón 0,003 - -
Magnesio 0,002 2,2 0,01
Hierro 0,002 4,5 -
Azufre 0,001 - 0.05
Aluminio - 7,9 -
Calcio - 3,5 0,31
Sodio - 2,5 0,03
Potasio - 2,5 0,06
INTRODUCCIÓN
Las reacciones que se realiza dentro de la células vivas son las mismas
clases de reacciones químicas, los enlaces químicos se rompen y se forman
de acuerdo a mecanismos comunes a toda la química, en los seres vivos se
producen en reacciones catalizadas por enzimas por lo que resultan veloces.

Es indispensable para introducirnos en el estudio de la bioquímica

propiamente dicha como el concepto la define, hacer un recuento de los
conceptos o servirnos de las bases de química inorgánica y orgánica, como
son: átomo, molécula, iones; enlace: iónico, covalente (polar y apolar),
covalente coordinado; fuerzas de atracción intermolecular: ión-dipolo,
dipolo-dipolo, puentes de hidrógeno, fuerzas de Van Der Waals; compuesto
orgánico, compuesto inorgánico;
 GRUPOS FUNCIONALES COMUNES EN BIOQUÍMICA
R

Cl OH O
ACILO
R HO P O FOSFATO O R ANHIDRIDO
O
O OH

OH O
H
ALDEHIDO FOSFITO R
R P
HO OH S CH3 TIOESTER
O

OH O O
H
+
R N AMINO P O FOSFORILO HO P O P OH
DIFOSFATO
H OH OH OH

H H O H3C OH

R N
+ AMONIO SULFATO
HO S OH O P O
FOSFOESTER
H
O OH

R1
CARBONILO OH
R DOBLE
H2C CH2 R HEMIACETAL
O ENLACE
OH

O
OH
CARBOXILO R
R ESTER
O
O CH3 R OH ALCOHOL

- R
O

R CARBOXILATO O ETER R SH
CH3 TIOL
O

R AMIDA
NH2
INTRODUCCION
ORIGEN DE MACROMOLECULAS Y CELULAS PRIMITIVAS

De acuerdo a determinaciones radioactivas y otros referentes de

investigación, la tierra se originó hace aproximadamente 4500 millones
de años, y la vida apareció hace 3500 millones de años.

A partir de 1960 un grupo de bioquímicos visualiza el origen de la vida

como un fenómeno de autoensamble o asociación de varios elementos
termodinámicamente espontáneos.

El curso de la evolución se puede dividir en varias etapas:

1.Origen del universo: Evolución de estrellas y elementos, formación de

moléculas sencillas como: CH4, NH3, CO, H2CO, HCN, H2O y
condensación de gases.

2.Formación del sistema solar: Condensaciones y escapes gaseosos.

INTRODUCCION
3. Tierra primitiva (atmósfera primaria): Emisiones gaseosas volcánicas y
reacciones fotoquímicas.

4. Tierra primitiva (atmósfera secundaria): Reductora conteniendo: NH3,

CH4, CO2, N2, N2O. Con descargas eléctricas, radiaciones UV y calor.

5. Organomoléculas primarias: Aminoácidos, nucleótidos, carbohidratos,

ácidos grasos, condensaciones químicas.

6. Macromoléculas y sistemas protocelulares.

7. Organismos anaerobios: formación química y fotosintética de oxígeno.

8. Organismos aerobios.

9. Tierra actual: atmósfera oxidante.

INTRODUCCION
La época de actividad volcánica y la gran interacción energética sobre la
corteza terrestre es posible que generaran las condiciones para que se formen
las primeras moléculas orgánicas como aminoácidos, nucleótidos,
carbohidratos y ácidos grasos.

Las teorías de Oparin y Haldene, y los experimentos de Miller y Urey parecen

confirmar el aparecimiento de las moléculas biológicas fundamentales en la
tierra primitiva, las que posteriormente darían lugar a su ensamblaje para
formar los biopolímeros y originarían las formas de vida primitivas.

Estudios actuales postulan al ARN como la primera biomolécula, debido a sus

propiedades catalíticas e informativas. A principios de 1980 se descubrió un
tipo de ARN ribosomal en Tetraymena (protozoario), con capacidad catalítica
para autocortarse y empalmarse en sitios específicos, eliminando segmentos
de su propia molécula sin la participación de enzimas, dicho descubrimiento ha
generado hipótesis que tienden a explicar la formación de los primeros
sistemas replicativos de los ácidos nucleicos y de la síntesis dirigida de
proteínas, procesos que tuvieron necesariamente que ocurrir en los primeros
seres vivos primitivos.
INTRODUCCION
Todo ser vivo requiere de la replicación de su material genético y de la
síntesis de sus proteínas. El ADN no se puede replicar sin la participación
de algunas proteínas (enzimas) y la síntesis de proteínas requiere de la
dirección de los ácidos nucleicos. Lo cuál plantea el problema de cual fue
primero (el huevo o la gallina). Lo que se resuelve con el aparecimiento
del primer ADN sin la necesidad de enzimas y su papel en la codificación
de proteínas, proceso que se cree se desarrollaron conjuntamente.

Célula

La célula constituye la unidad anatómica y funcional de todo ser vivo y es

la expresión de la materia viva. En general son un sistema abierto que
contiene diversas substancias químicas disueltas en un medio acuoso y
limitado por una membrana.

La concentración de moléculas dentro de la célula es selectiva, y su

organización va de acuerdo a las funciones que cumplen dentro de las
células.
INTRODUCCION
En los organismos multicelulares, las células se encuentran organizadas
en tejidos, órganos, aparatos y sistemas, en los cuales funcionan
coordinadamente como si fuese una sola unidad, y la organización
biológica es función de la especificidad de las características fisico-
químicas de cada molécula.

Así mismo la materia viva tiene la capacidad de producir, conservar y

utilizar la energía necesaria para autorregularse y autoduplicarse.

La célula actual más simple es el micoplasma, semejantes a las bacterias

y parásitos de animales, vegetales y el hombre. Tienen diámetros de 0,3
um, rodeados de una fina membrana de 8 nm de espesor que delimita al
citoplasma, conteniendo material líquido con diversas substancias. En la
parte central se encuentra una molécula de ADN muy plegada y en el
citoplasma varias moléculas de ARN y ribosomas de 20 nm donde se
realiza la síntesis de proteínas.
INTRODUCCION
DIMENSIONES DE ALGUNAS ESTRUCTURAS BIOLOGICAS
ESTRUCTURA DIMENSION (nm)
Alanina 0,5
Glucosa 0,7
Fosfolípido 3,5
Mioglobina 3,6
Hemoglobina 6,8
Ribosoma (E. coli) 18
Virus (Poliomielitis) 30
Miosina 160
Mitocondria 1000
Escherichia coli 2000
Cloroplasto 8000
Célula hepática 20000
INTRODUCCION
Las células se clasifican en dos grupos: procariotas y eucariotas, del
griego Karyon = nuez, semilla o núcleo

Procariota significa antes del núcleo

Eucariota con núcleo bien formado.

En el núcleo de las eucariotas se encuentra el material genético, es muy

complejo y lo rodea una membrana. En las procariotas se encuentra en el
cuerpo nuclear o nucleoide que no posee membrana que lo rodee.

Las procariotas son microorganismos unicelulares, sencillos y pequeños,

conocidos generalmente como bacterias, y son las células más
abundantes sobre la corteza terrestre.

Las células eucariotas están representadas por organismos unicelulares y

pluricelulares, los primeros constituyen el reino protista o protozoarios
(los primeros animales).
INTRODUCCION
En los multicelulares, las células se agrupan en tejidos y órganos con
funciones especializadas funcionando como una unidad debido a la
existencia de comunicación entre las células individuales. Todas las
células eucariotas de un mismo tejido contienen el mismo material
genético debido a que proceden de un tronco común el huevo
fecundado o cigoto.

La diferenciación celular no es función de la ganancia o pérdida de genes,

sino de la expresión genética, la que está determinada por factores
externos (ambientales) e internos (hormonales, etc). La diferencia
entre la estructura y la función de los tejidos depende de los grupos
de genes que están activos o reprimidos.

La comunicación intercelular es una habilidad desarrollada por los

organismos multicelulares, lo que ha permitido su organización,
regulación y desarrollo en tejidos, para controlar su división,
crecimiento y coordinar sus diversas actividades.
INTRODUCCION
La comunicación celular se lleva a cabo en forma directa por uniones
intercelulares o indirecta por medio de señales químicas que viajan a
distancia de un grupo celular a otro.

Las moléculas que actúan como mensajeros químicos se clasifican en tres

grupos:

1.Mediadores químicos locales: ejercen su efecto sobre células cercanas

2.Hormonales: secretados por células endocrinas y transportados por el

torrente sanguíneo a células blanco.

3.Neurotransmisores: llevan a cabo su acción en la célula blanco

adyacente (paracrino)

Cada uno de estos mensajeros se unen a receptores en la membrana de

la célula blanco o ingresan al citoplasma cuando se trata de mensajeros
hidrófobos, y hacen que las células blanco lleven a cabo funciones
específicas.
INTRODUCCION
EL AGUA

“Al ver correr el agua en sus causes naturales, tenemos la idea de un

recurso inagotable, las tres cuartas partes del planeta están cubiertas
de agua y las espectaculares fotografías tomadas en el espacio
exterior revelan un hermoso planeta azul bañado en agua y cubierto
en forma parcial por un tenue velo de vapor; pero su importancia
para la vida, nos hace pensar que debe ser de libre acceso a todo ser
vivo de la tierra”.

Solamente el 3% del agua existente en toda la tierra es utilizable, el

restante 97% es agua salobre.

Antiguamente los habitantes de estepas y desiertos consideraban el agua

como elemento sagrado, y es así como Tales de Mileto en su época
aseguró que el agua era el origen del mundo.
INTRODUCCION
Actualmente el tema del agua se encuentra en conflicto, por ser el bien
más preciado para los seres vivos; todos somos seres de origen acuático,
estamos constituidos por ella en un 70%, con un sinnúmero de
substancias en disolución, y es en ella donde se llevan a cabo casi todas
las reacciones que tienen lugar en los organismos; es el medio de
transporte de nutrientes, hormonas y metabolitos, participa en procesos
enzimáticos y se relaciona con la transferencia de energía química.

El origen y evolución de la vida se moduló por el medio en el cual ocurrió;

por tanto, estructura y función celulares se adaptaron a las propiedades
físico-químicas del agua, de gran importancia biológica y que hacen de
ella una sustancia extraordinaria, acertadamente se señaló que "El
estudio de la humanidad se encuentra en el hombre" y "El estudio
adecuado del agua es la molécula del agua“

Son propiedades del agua:

INTRODUCCION
Estructura Puentes de hidrógeno

104.5°

H H
INTRODUCCION
Capacidad calorífica

Durante la congelación, el agua libera más calor que otros compuestos, es

más por cada cambio de temperatura el agua absorbe o libera más calor
que muchas otras substancias y a esto se llama capacidad calorífica,
resultando por ello un medio efectivo de transferencia de calor.

Densidad

La congelación del agua es diferente de la de otros líquidos, el arreglo

cristalino que producen los puentes de hidrógeno, tiene estructura inusual
abierta, formado huecos en su interior (clatrato). Cada molécula de agua
es un tetraedro, rodeada por cuatro moléculas vecinas unidas por puentes
de hidrógeno, esto hace que el hielo se expanda más allá de su volumen
líquido original, de forma que su densidad es menor que la del líquido y
por ello flota, si no fuese de este modo, los lagos se congelarían
empezando desde el fondo y la vida como la conocemos no existiría.
INTRODUCCION
Tensión superficial

Las fuerzas de atracción de las moléculas de agua líquida se dirigen en

todas las direcciones, pero en la superficie del líquido, sólo son efectivas
las fuerzas laterales y hacia abajo, debido a la distinta naturaleza de la
superficie (atmósfera), las moléculas se aglomeran más estrechamente en
ella, constituyendo una especie de membrana muy delgada, que incluso
soporta el peso del polvo y algunos insectos, que son más densos que el
agua, sin romper la interfase.

Presión osmótica

Es de importancia lo que ocurre en las soluciones acuosas y está

relacionado con los materiales disueltos, más que con el agua misma. Si
entre dos compartimentos conteniendo soluciones con diferente
concentración de soluto, separados por una membrana semipermeable
(sólo permite el paso del agua), se establece un flujo de agua de la de
menor concentración a la más concentrada; la fuerza que se debe aplicar
para impedir el flujo de agua se denomina presión osmótica
INTRODUCCION
Disolvente universal

Frecuentemente el agua se denomina como el solvente universal, pero

esta propiedad del agua también deriva de la polaridad y de los enlaces de
hidrógeno. Las moléculas de agua en contacto con un cristal se orientan
de tal manera que tienden a neutralizar las fuerzas de cohesión entre los
iones en la estructura cristalina, los iones libres por la acción del agua se
hidratan y el agua evita que se recombinen y recristalicen; este efecto se
explica por la elevada constante dieléctrica del agua. La conductividad de
las aguas naturales proporciona una medida de su contenido en minerales
disueltos.
INTRODUCCION
Ionización del agua

H2O → H+ + OH-

Keq =  H+  OH- /  H2O Keq =  H+  OH- / 55.5 M

De donde

(55.5 M) (Keq) =  H+  OH- = Kw

(55.5 M) (1.8 x 10-16 M ) =  H+  OH-
99.9 x 10-16 M2 =  H+  OH-
1 x 10-14 M2 =  H+  OH- = Kw (a 25C, refuerza el concepto de que el
agua representa un pH neutro).

Kw =  H+  OH- =  H+2

 H+ =  Kw =  1 x 10-14 M2
H+ =  OH- = 10-7 M

Kw es la base de la escala de pH
INTRODUCCION
pH = log 1/  H+ = - log  H+
p denota logaritmo negativo de.
pH = log 1/ 1 x 10-7 = log 1.0 + log 107 = 0 + 7.0 = 7.0

LAS SOLUCIONES AMORTIGUADORAS BUFFER O TAMPON

RESISTEN LOS CAMBIOS DE pH

Si el pH de una solución permanece constante cuando se añade cantidades

pequeñas de ácido fuerte o base fuerte, se dice que la solución está
amortiguada. La capacidad de una solución para resistir los cambios de pH
se conoce como capacidad amortiguadora y es máxima cuando las
concentraciones del ácido débil y su base conjugada, o la base débil y su
ácido conjugado son iguales o dicho de otra forma cuando el pH = pKa o
pH = pKb.

REACCIÓN BIOQUÍMICA

Es un proceso por el cual uno o más sustratos (reactivos) son convertidos

o cambiados a uno o más metabolitos (productos) diferentes.
INTRODUCCION
Las moléculas orgánicas que las células adquieren como nutrientes se
usan no solo para proporcionar energía, sino también para utilizar los
átomos de carbono en la síntesis de diversa clase de moléculas que
forman la estructura celular. La utilización de los nutrientes se lleva a cabo
por medio de numerosas reacciones químicas las cuales están cruzadas
por cientos de enzimas que trabajan en cadena, de tal forma que el
producto de una reacción es el sustrato de la siguiente. Esta serie de
transformaciones químicas se denominan vías metabólicas.

Metabolismo

Deriva del griego y significa cambio, se refiere a todas las reacciones

químicas de un organismo.

Catabolismo: se relaciona con la conversión de moléculas grandes,

complejas en metabolitos más pequeños y simples. Algunas de estas
reacciones producen energía química que se captura como ATP.
INTRODUCCION
Anabolismo: se relaciona con la conversión de moléculas pequeñas en
moléculas grandes durante el proceso de biosíntesis. Las reacciones
anabólicas requieren de energía química, la cual es obtenida finalmente
del ATP.

El ATP: además de proporcionar energía para el anabolismo, sirve como

fuente de energía química para los diferentes procesos fisiológicos. Sirve
como moneda común de intercambio de energía en todos los sistemas
vivos. El ATP es el compuesto bioquímico más importante en la vida en la
tierra, y dispara procesos bioquímicos endergónicos para formar
intermediarios comunes o activados. La alta reactividad química del ATP
reside en los trifosfatos de la molécula.