DESCUBRIMIENTO Y

DESARROLLO DE FÁRMACOS 
ÁNGELES CORREA JUAN DIEGO, GARCÍA ALVARADO SUSANA DOMINIQUE,
FLORES VERASTEGUI DOMINIQUE, HERNÁNDEZ PÉREZ ESCARLET, HURTADO
ORTEGA DAYRA, PÉREZ GUEVARA SANSÓN, VILLAGRÁN QUIROZ ABIGAIL
GABRIELA 
INTRODUCCIÓN

 El desarrollo de fármacos es un proceso complejo, inicia identificando

compuestos que se unen a un blanco terapéutico o que generan un
efecto biológico.
 Las moléculas que muestran un actividad biológica se denominan hits.

 Los hits son encontrados por un tamizaje de un gran numero de

moléculas.
 Los compuestos llamados “lideres” o “cabezas de serie” deben tener
propiedades farmacéuticas atractivas como baja toxicidad, solubilidad
acuosa adecuada entre otras propiedades farmacocinéticas, estos
compuestos son desarrollados a través de hits modificados
químicamente.
 Considerando el numero de moléculas que pueden ser factibles se debe
recurrir a el uso de técnicas computacionales para su análisis.
DISEÑO Y DESARROLLO DE FÁRMACOS.

 Un objetivo del descubrimiento y desarrollo de fármacos es descubrir

y desarrollar medicamentos con efectos clínicos benéficos y efectos
secundarios mínimos.
 Anteriormente se analizaban estos medicamentos con métodos
experimentales y por el uso de métodos de computo (in silico) nos
permite codificar con precisión modelos teóricos y son capaces de
procesar grandes cantidades de información.
 Con estos modelos computacionales podemos entender los
mecanismos de acción del principio activo, mejorar las propiedades
de los medicamentos, reducir los efectos secundarios o buscar
actividades biológicas potenciales de algún compuesto.
ETAPAS DEL DESARROLLO DE FÁRMACOS
 Productos naturales
Síntesis química
ESTRATEGIAS
PARA 
DESCUBRIMIENTO  Semi-síntesis
Análisis
computacionales 
Optimización
VENTAJAS Y DESVENTAJAS DE LOS PRODUCTOS NATURALES
COMO FUENTES DE FÁRMACOS

Ventajas:
 Costo bajo
Desventajas:
 Bajo rendimiento
 No se tiene que sintetizar
 Complejidad estructural imposible
 Diversidad estructural
de sintetizar
 Diversidad de métodos de
 Poseen varios centros quirales
obtención
 Posibilidad de modificación
estructural
 Este tipo de compuestos poseen de
antemano una acción fisiológica
OBTENCIÓN DE FÁRMACOS A PARTIR DE PRODUCTOS
NATURALES

Cromatografía
Fraccionamien
to de los
extractos
Obtención de Evaluación
los extractos biológica
Selección de la
Evaluación
especie a
biológica
estudiar
Identificación
botánica
 Criterio etnomédico: Medicina
tradicional
 Criterio quimiotaxonómico: Buscas
compuestos
 Criterio taxonómico: Buscas aspectos
OBTENCIÓN DE FÁRMACOS A
PARTIR DE PRODUCTOS Identificación
NATURALES
Evaluación biológica: Técnicas
 Ensayos in vitro
cromatográfica
s
 Cultivos celulares
Purificación
 Cultivos microbiológicos Cristalización
Extracción en
fase sólida
Separación de
los
componentes Extracción
del extracto líquido-líquido

Técnicas
Columna HPLC
cromatográfica
preparativa
s
 ESTRATEGIA ACTUAL PARA EL DESCUBRIMIENTO DE NUEVOS
FÁRMACOS A PARTIR DE PRODUCTOS NATURALES
Estrategias
para evitar
repetir
Recogida de Derreplicar resultados
Analizar
macros & extractos
extractos
micros encontrados Desarrollo
Identificar el
preclínico &
líder
clínico
IMPORTANCIA DE LOS PRODUCTOS NATURALES EN EL
DESCUBRIMIENTO DE FÁRMACOS

 Fitofármacos: Los extractos de plantas medicinales exhiben su efecto terapéutico a través del
efecto aditivo o sinérgico de sus componentes
• Efecto sinérgico: Patologías multifactoriales que deben ser tratadas con una combinación de
compuestos con diferentes mecanismos de acción.
Los fitofármacos deben cumplir con 3 aspectos:
 Identificación de sus principios activos
 Cuantificación de sus principios activos
 Determinación de su toxicidad
MARCADORES QUÍMICOS

Son constituyentes de un extracto herbal que son de interés para propósitos de control de calidad,
independientemente de su actividad terapéutica.
 Marcadores activos: Aquellos constituyentes que contribuyen a la actividad terapéutica

 Marcadores analíticos: Empleados solamente en función de la cuantificación del extracto herbal

Requisitos para marcadores químicos activos:

 Presencia constante del compuesto en todas las muestras obtenidas en diferentes condiciones

 Abundancia del compuesto

 Actividad biológica

 Contar con un método de detección y cuantificación sencillo

SÍNTESIS QUÍMICA
Química Combinatoria -> Generación de compuestos análogos 
 Disciplina que tiene como objetivo sintetizar y desarrollar de
manera rápida y eficiente gran cantidad de moléculas
diferentes entre sí pero parecidas en su estructura.
 Inicialmente el objetivo era la preparación en fase sólida de
millones de compuestos en forma de mezclas
 Posteriormente se buscó la preparación de bibliotecas más
reducidas con compuestos más o menos caracterizados.
 Actualmente se buscan bibliotecas de 150 compuestos aprox.
Con purezas superiores al 95% y con todos sus miembros
caracterizados
 Permite la síntesis de una gran cantidad de compuestos de
manera simultanea (bibliotecas)
 Permite realizar estudios sobre la relación estructura –
actividad
HIGH TROGHPUT SCREENING (HTS)
 Identifica moléculas bioactivas de una biblioteca con base a un criterio específico

 Consiste en evaluar grandes colecciones de compuestos químicos o productos naturales

 En HTS se usan robots para evaluar en pocas horas colecciones con miles o millones de moléculas

Ventajas

• Util para identificar ligandos de Desventajas

receptores, enzimas, cánales iónicos
• Son ensayos de alta especificidad y • Es necesario conocer el blanco
sensibilidad terapéutico 
• Ofrecen una respuesta simple y sin • El ensayo de evaluación debe estar
ambigüedades perfectamente estandarizado.
• Requieren de una cantidad mínima de
muestra
 El DIFAC tiene como principio
entender las relaciones estructura-
actividad biológica o farmacológica
de compuestos
ANÁLISIS
COMPUTACIONALES

Objetivos
Diseño o
identificación de Seleccionar
Optimizar líderes
nuevos candidatos.
compuestos.
  Acoplamiento molecular automatizado

Consiste en buscar la conformación y posición

óptima de un ligando dentro de una diana
molecular.
 Modelado del farmacóforo

Se define como un arreglo tridimensional de las

MÉTODOS características mínimas necesarias estéricas y
COMPUTACIONALES
COMUNES electrónicas para asegurar interacciones óptimas
con un blanco farmacológico específico
 Cribado virtual

Es un filtrado computacional de moléculas para

seleccionar candidatos computacionales, para su
evaluación experimental, reduciendo el número de
ensayos biológicos que se harían si no hubiera una
selección de compuestos.
  Quimioinformática

Es una herramienta que surge de la combinación de

recursos informáticos y datos químicos, empleada en el
manejo, visualización y análisis sistemático de información
química.
 Bases de datos públicas

MÉTODOS Bases de datos moleculares, colecciones usadas con

COMPUTACIONALES frecuencia en descubrimiento de fármacos son ZINC,
COMUNES DrugBank, ChEMBL, Binding Database y PubChem,
contienen información para realizar cribado virtual,
quimiogenómica, análisis estructura-actividad y
reposicionamientos de fármacos, entre otros.
 Relaciones estructura-actividad
 QSAR y métodos comunes

Implementan el uso de descriptores abarcando efectos

hidrófobos, estéricos y electrostáticos.QSAR 2D y QSAR 3D
OPTIMIZACIÓN 
El objetivo de la optimización de los compuestos líderes es disminuir
los efectos negativos asociados con los compuestos y hacerlos más
efectivos y selectivos. Los científicos optimizan los compuestos líderes
al cambiar sus estructuras y probando estas variaciones (análogos).

En esta fase de optimización se tiene que estudiar aquella

combinación de parámetros que llevan a la consecución de una
mejora en la calidad del producto, la mejora del rendimiento del
proceso, un tiempo adecuado del mismo y un coste razonable. 
METODOS DE OPTIMIZACIÓN 

Espectro de
actividad 

Farmacinética
Modificaciónes  (farmacomodulació
n=

Mejora de
Optimización  De distribución 
estabilidad 

Sustitutos y copias
terapéuticas 
OPTIMIZACIÓN

Durante esta etapa se realizan modificaciones en las moléculas para mejorar su efecto. En el
proceso de cribado identifica "cabezas de serie": las moléculas interactúan con el objetivo. 
Dichas moléculas suelen tener únicamente un efecto leve y por lo tanto no serían factibles para
fases más avanzadas del desarrollo.
Los químicos, por lo tanto, modifican la molécula "cabeza de serie" seleccionada añadiendo o
eliminando elementos. 
La molécula de un fármaco ya existente podría también modificarse para mejorar o modificar su
efecto. La tecnología informática puede ayudar a diseñar estas moléculas.
 Las moléculas modificadas se someten entonces a pruebas para determinar cuál es la
estructura más eficaz y de mejor tolerancia (seguridad). 
 Estos estudios ayudan a los científicos a comprender mejor la farmacología de la molécula; es
decir, cómo trabaja esta en el organismo. 
 Las moléculas con una mejor eficacia y seguridad pueden someterse entonces a nuevas pruebas
en calidad de "fármaco candidato". 
 Aproximadamente en esta fase, la información científica y técnica sobre
el compuesto candidato, como su estructura molecular y sus efectos, suele registrarse, o
patentarse, para protegerlo como propiedad intelectual.