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SISTEMAS
ENZIMATICOS
Introducción
• En los diversos compartimientos celulares transcurre un
gran número de reacciones químicas que proporcionan a la
célula energía y los componentes necesarios para su
mantenimiento.
Sustrato
Sitio activo
Modelos enzimáticos
Modelo de la "llave-cerradura"
• Las enzimas son muy específicas, como
sugirió Emil Fischer en 1894.
• Dedujo que ambas moléculas, enzima y
sustrato, poseen complementariedad
geométrica.
Modelos enzimáticos
• Si bien este modelo explica la
especificidad de las enzimas,
falla al intentar explicar la
estabilización del estado de
transición que logran
adquirir las enzimas.
Estado De Transición.- Es
la velocidad de
reacción de reacciones
químicas elementales; un tipo
especial de equilibrio químico.
Modelos enzimáticos
Modelo del encaje inducido
• En 1958 Daniel Koshland sugiere una
modificación al modelo de la llave-cerradura.
• Las enzimas son estructuras bastante
flexibles y así el sitio activo podría cambiar
su conformación estructural por la
interacción con el sustrato.
Modelos enzimáticos
• El sustrato cambia ligeramente de forma para entrar en el sitio
activo. El sitio activo continua dicho cambio hasta que el sustrato
está completamente unido, momento en el cual queda
determinada la forma y la carga final.
Una enzima puede unir dos sustratos
en su sitio activo
• La gran variedad de cadenas laterales en
estas superficies o hendiduras (gpos R)
permite a la molécula establecer puentes
de hidrógeno, interacciones electrostáticas
y fuerzas de Vander Walls con otras
moléculas.
• A veces, un enzima requiere para su función la presencia
de sustancias no proteicas que colaboran en la catálisis:
los cofactores.
• Los cofactores pueden ser iones inorgánicos como el
Fe++, Mg++, Mn++, Zn++ etc. Casi un tercio de los
enzimas conocidos requieren cofactores. Cuando el
cofactor es una molécula orgánica se llama coenzima.
• Cuando los cofactores y las coenzimas se encuentran
unidos covalentemente al enzima se llaman grupos
prostéticos.
• La forma catalíticamente activa del enzima, es decir, el
enzima unida a su grupo prostético, se llama
holoenzima.
• La parte proteica de un holoenzima (inactiva) se llama
apoenzima.
ENZIMAS
ENZIMAS
NOMENCLATURA DE LOS ENZIMAS
• el sustrato preferente
• el tipo de reacción realizado
• terminación "asa”
• gliceraldehído-3-fosfato dihidroxiacetona-fosfato
Fosfotriosa
isomerasa
Dihidroxiacetona Gliceraldehído-3-
fosfato fosfato
Clase 6: LIGASAS
Catalizan la unión de dos sustratos
con hidrólisis simultánea de un
nucleótido trifosfato (ATP, GTP, etc.):
A + B + XTP A-B + XDP + Pi
• Un ejemplo es la piruvato carboxilasa,
que cataliza la reacción:
piruvato + CO2 + ATP oxaloacetato +
ADP + Pi
Factores que afectan la Actividad
catalítica enzimática
La actividad catalítica de enzimas es
influenciada por varios factores, dentro de
los cuales los más importantes son:
• las concentraciones del sustrato y de los
productos finales (catálisis enzimática)
• pH
• temperatura
• Cofactores
• presencia de inhibidores
Catálisis enzimatica
Lo primero que se observó del comportamiento de las
enzimas, fue el efecto poco común de la concentración del
sustrato sobre la velocidad de reacción enzimática
Saturación por substrato :
A concentraciones de sustrato [s],pequeñas hay una
variación lineal con la velocidad de reacción (reacción de
primer orden) pero cuando la concentración aumenta [s ] la
velocidad también aumenta hasta alcanzar un valor
constante que se vuelve independiente de la concentración
de [s]. A estas condiciones el orden de la reacción será 1
y 0
Michaelis Menten (1913) desarrollaron un modelo de
catálisis enzimática:
Catálisis enzimatica
Modelo de Michaelis Menten
En donde Km es la constante
de Michaelis y tiene dos V max
significados:
Es la concentración de
substrato a la cual la mitad ½ V max Km
de los centros activos están
ocupados
Concentración de substrato [S]
El segundo significado de Km es como constante de velocidad de las
etapas individuales de un proceso catalítico
k1
k3
[S] + [E] [ES] [P] + [E]
k2
• 1 2
EFECTO DEL pH SOBRE LA ACTIVIDAD
ENZIMÁTICA
• Los enzimas poseen grupos químicos ionizables (carboxilos
-COOH; amino -NH2; tiol -SH; imidazol, etc.) en las
cadenas laterales de sus aminoácidos.
• Según el pH del medio, estos grupos pueden tener carga
eléctrica positiva, negativa o neutra.
• Como la conformación de las proteínas depende, en parte,
de sus cargas eléctricas, habrá un pH en el cual la
conformación será la más adecuada para la actividad
catalítica. Este es el llamado pH óptimo.
EFECTO DEL pH SOBRE LA ACTIVIDAD
ENZIMÁTICA
• La mayoría de los enzimas son muy sensibles a los
cambios de pH.
• Desviaciones de pocas décimas por encima o por debajo
del pH óptimo pueden afectar drásticamente su actividad.
• Ej, la pepsina gástrica tiene un pH óptimo de 2, la ureasa lo
tiene a pH 7 y la arginasa lo tiene a pH 10. Como ligeros
cambios del pH pueden provocar la desnaturalización de la
proteína, los seres vivos han desarrollado sistemas más o
menos complejos para mantener estable el pH intracelular:
Los amortiguadores fisiológicos.
EFECTO DEL pH SOBRE LA ACTIVIDAD
ENZIMÁTICA
EFECTO DE LA TEMPERATURA SOBRE LA
ACTIVIDAD ENZIMÁTICA
•Competitivo
•No competitivo
Inhibidores enzimáticos
Inhibición Competitiva
Como su nombre lo indica en este tipo de inhibición, el
inhibidor compite con el sustrato por el sitio activo
En este mecanismo si la concentración de s aumenta es
posible desplazar al inhibidor y llevar acabo la reacción
enzimática
En estos casos el inhibidor tiene una estructura
muy similar al sustrato ya que compite por el
sitio activo
En este mecanismo puede ser altamente
específico
Sulfonamidas son inhibidores análogos del
ácido p-aminobenzoico, durante la síntesis de
ácido fólico en bacterias (síntesis de
nucleotidos)
Inhibidores enzimáticos
Inhibición No competitiva
Esta inhibición se lleva acabo por una substancia capaz de
reaccionar con un grupo químico de la apoenzima
(polipéptido) en un lugar diferente al sitio activo, pero de tal
manera que el sitio activo pierde su capacidad de aceptar
al sustrato
En este tipo de inhibición no importa las cantidades de
sustrato adicional, ya que el sitio activo no es el que se
encuentra ocupado
•Yodoacetato se combina con los grupos -SH
Inhibidores enzimáticos
En la inhibición :
Competitiva al aumentar [S] el Km de la
enzima con respecto al substrato
cambia, pero la Vmax no se altera (por
que s desplaza al inhibidor)
Inhibidores enzimáticos
En la inhibición :
No competitiva el Km de la enzima con
respecto al substrato no se altera, pero
la velocidad de reacción se ve
disminuida