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UNIDAD V

SISTEMAS
ENZIMATICOS
Introducción
• En los diversos compartimientos celulares transcurre un
gran número de reacciones químicas que proporcionan a la
célula energía y los componentes necesarios para su
mantenimiento.

• Por lo que la vida depende de la existencia de catalizadores


poderosos y específicos.
ASPECTOS GENERALES
• Un catalizador es una molécula que aumenta el índice de una reacción
pero no es el substrato o el producto de esa reacción

• No sufren modificación al final de la reacción.


• No cambian la constante de equilibrio de una reacción química.
• Son muy específicas.
• Aceleran varios ordenes de magnitud mayor con respecto a la reacción
no catalizada.
• Actúan en condiciones moderadas de presión y temperatura.
ASPECTOS GENERALES
• Prácticamente todas las reacciones químicas que
tienen lugar en los seres vivos están catalizadas
por enzimas.

• Los enzimas son catalizadores específicos: cada


enzima cataliza un solo tipo de reacción, y casi
siempre actúa sobre un único sustrato, el cual será
modificado para formar un producto.
ASPECTOS GENERALES
• No todas las proteínas son enzimas, pero la
mayoría de las enzimas son proteínas
ENZIMA SUSTRATO Km (mM)

Catalasa H2O2 25.0


Hexoquinasa ATP 0.4
D-Glucosa 0.05
D-Fructosa 1.5

Anhidrasa carbónicoa HCO3


- 9.0
Quimotripsina Gliciltirosinilglicina 108.0
N-Benzoiltirosinamida 2.5
-Galactosidasa D-Lactosa 4.0
Treonina deshidrogenasa L-Treonina 5.0
ASPECTOS GENERALES
• Un substrato es una molécula sobre la cual una enzima actúa
para rendir un producto.
A ------> B
Enzima
• La reacción no es cambiada por la presencia de la enzima,
pero, para una reacción favorecida, la presencia de la enzima
hace que la velocidad de reacción sea aumentada.

• Reacción con catalizador y sin catalizador


ASPECTOS GENERALES

• El sustrato se une a una región concreta del enzima,


llamada centro activo , es decir, la parte de la enzima que
hace el trabajo. El centro activo comprende (1) un sitio de
unión formado por los aminoácidos que están en contacto
directo con el sustrato y (2) un sitio catalítico, formado por
los aminoácidos directamente implicados en el mecanismo
de la reacción
• Una vez formados los productos la enzima puede
comenzar un nuevo ciclo de reacción
ENZIMAS
ENZIMAS
1.- El enzima y su sustrato 2.- Unión al centro
activo 3.- Formación de productos
Enzima

Sustrato

Sitio activo
Modelos enzimáticos
Modelo de la "llave-cerradura"
• Las enzimas son muy específicas, como
sugirió Emil Fischer en 1894.
• Dedujo que ambas moléculas, enzima y
sustrato, poseen complementariedad
geométrica.
Modelos enzimáticos
• Si bien este modelo explica la
especificidad de las enzimas,
falla al intentar explicar la
estabilización del estado de
transición que logran
adquirir las enzimas.

Estado De Transición.- Es
la velocidad de
reacción de reacciones
químicas elementales; un tipo
especial de equilibrio químico.
Modelos enzimáticos
Modelo del encaje inducido
• En 1958 Daniel Koshland sugiere una
modificación al modelo de la llave-cerradura.
• Las enzimas son estructuras bastante
flexibles y así el sitio activo podría cambiar
su conformación estructural por la
interacción con el sustrato.
Modelos enzimáticos
• El sustrato cambia ligeramente de forma para entrar en el sitio
activo. El sitio activo continua dicho cambio hasta que el sustrato
está completamente unido, momento en el cual queda
determinada la forma y la carga final.
Una enzima puede unir dos sustratos
en su sitio activo
• La gran variedad de cadenas laterales en
estas superficies o hendiduras (gpos R)
permite a la molécula establecer puentes
de hidrógeno, interacciones electrostáticas
y fuerzas de Vander Walls con otras
moléculas.
• A veces, un enzima requiere para su función la presencia
de sustancias no proteicas que colaboran en la catálisis:
los cofactores.
• Los cofactores pueden ser iones inorgánicos como el
Fe++, Mg++, Mn++, Zn++ etc. Casi un tercio de los
enzimas conocidos requieren cofactores. Cuando el
cofactor es una molécula orgánica se llama coenzima.
• Cuando los cofactores y las coenzimas se encuentran
unidos covalentemente al enzima se llaman grupos
prostéticos.
• La forma catalíticamente activa del enzima, es decir, el
enzima unida a su grupo prostético, se llama
holoenzima.
• La parte proteica de un holoenzima (inactiva) se llama
apoenzima.
ENZIMAS
ENZIMAS
NOMENCLATURA DE LOS ENZIMAS

• Hay varias formas mediante las cuales


se asigna un nombre a un enzima:
• nombres particulares
• nombre sistemático
• código de la comisión enzimática
(enzyme comission)
NOMBRES PARTICULARES

• Antiguamente, los enzimas recibían nombres


particulares, asignados por su descubridor.
Al ir aumentando el número de enzimas
conocidos, se hizo necesaria una
nomenclatura sistemática que informara
sobre la acción específica de cada enzima y
los sustratos sobre los que actuaba.
NOMENCLATURA DE LA COMISIÓN ENZIMÁTICA

• El nombre de cada enzima puede ser identificado por


un código numérico, encabezado por las letras EC
(enzyme commission), seguidas de cuatro números
separados por puntos.

• El primer número indica a cual de las seis clases


pertenece el enzima,
• El segundo se refiere a distintas subclases dentro de
cada grupo,
NOMENCLATURA DE LA COMISIÓN ENZIMÁTICA

• El tercero y el cuarto se refieren a los grupos


químicos específicos que intervienen en la reacción.

• Así, la ATP:glucosa fosfotransferasa


(glucoquinasa) se define como EC 2.7.1.2. El
número 2 indica que es una transferasa, el 7 que es
una fosfotransferasa, el 1 indica que el aceptor es un
grupo OH, y el último 2 indica que es un OH de la D-
glucosa el que acepta el grupo fosfato.
NOMBRE SISTEMÁTICO

• El nombre sistemático de un enzima consta


actualmente de 3 partes:

• el sustrato preferente
• el tipo de reacción realizado
• terminación "asa”

• Un ejemplo sería la glucosa fosfato isomerasa que


cataliza la isomerización de la glucosa-6-fosfato en
fructosa-6-fosfato.
NOMBRE SISTEMÁTICO
• Muchos enzimas catalizan reacciones reversibles.

• No hay una manera única para fijar cual de los dos


sentidos se utiliza para nombrar al enzima.
CLASIFICACIÓN DE LOS ENZIMAS

• Las enzimas se agrupan en seis clases


importantes en base al tipo de reacción que
catalizan
• Clase 1: OXIDORREDUCTASAS
• Clase 2: TRANSFERASAS
• Clase 3: HIDROLASAS
• Clase 4: LIASAS
• Clase 5: ISOMERASAS
• Clase 6: LIGASAS
Clase 1: OXIDORREDUCTASAS

• Catalizan reacciones de oxidorreducción, es decir,


transferencia de hidrógeno (H) o electrones (e-) de
un sustrato a otro, según la reacción general:
• AH2 + B A + BH2

• Catalasa.- Transforma dos moléculas de H2O2 en dos moléculas de


agua con desprendimiento de oxígeno.
• H2O2 + H2O2 2H2O + O2
catalasa
Clase 2: TRANSFERASAS
• Catalizan la transferencia de un grupo químico
(distinto del hidrógeno) de un sustrato a otro,
según la reacción:
• A-B + C A + C-B
• Aminotransferasas.- Transfieren grupos aminos de
un aminoácido a un alfa ceto ácido.
Clase 3: HIDROLASAS

• Catalizan las reacciones de hidrólisis:


A – B + H2O AH + B-OH
• Un ejemplo es la lactasa, que cataliza la
reacción:
Lactosa + agua glucosa + galactosa

Hidrólisis de la pectina con la


enzima poligalacturonasa
poligalacturonasa

pectina Ac. D galacturonico


Clase 4: LIASAS
• Catalizan reacciones de ruptura o soldadura
de sustratos:
A-B A+B
• Un ejemplo es la acetacetato
descarboxilasa, que cataliza la reacción:
ácido acetacético CO2 + acetona

Corte de los enlaces glucosídicos de la


pectina mediante transeliminación con las
enzimas pectinliasas o
pectintranseliminasas pectina
Ac. D galacturonico
Clase 5: ISOMERASA
Catalizan la interconversión de isómeros:
A B
• Son ejemplos la fosfotriosa isomerasa

• gliceraldehído-3-fosfato dihidroxiacetona-fosfato

Fosfotriosa
isomerasa

Dihidroxiacetona Gliceraldehído-3-
fosfato fosfato
Clase 6: LIGASAS
Catalizan la unión de dos sustratos
con hidrólisis simultánea de un
nucleótido trifosfato (ATP, GTP, etc.):
A + B + XTP A-B + XDP + Pi
• Un ejemplo es la piruvato carboxilasa,
que cataliza la reacción:
piruvato + CO2 + ATP oxaloacetato +
ADP + Pi
Factores que afectan la Actividad
catalítica enzimática
La actividad catalítica de enzimas es
influenciada por varios factores, dentro de
los cuales los más importantes son:
• las concentraciones del sustrato y de los
productos finales (catálisis enzimática)
• pH
• temperatura
• Cofactores
• presencia de inhibidores
Catálisis enzimatica
Lo primero que se observó del comportamiento de las
enzimas, fue el efecto poco común de la concentración del
sustrato sobre la velocidad de reacción enzimática
Saturación por substrato :
A concentraciones de sustrato [s],pequeñas hay una
variación lineal con la velocidad de reacción (reacción de
primer orden) pero cuando la concentración aumenta [s ] la
velocidad también aumenta hasta alcanzar un valor
constante que se vuelve independiente de la concentración
de [s]. A estas condiciones el orden de la reacción será 1
y 0
Michaelis Menten (1913) desarrollaron un modelo de
catálisis enzimática:
Catálisis enzimatica
Modelo de Michaelis Menten
En donde Km es la constante
de Michaelis y tiene dos V max
significados:
Es la concentración de
substrato a la cual la mitad ½ V max Km
de los centros activos están
ocupados
Concentración de substrato [S]
El segundo significado de Km es como constante de velocidad de las
etapas individuales de un proceso catalítico
k1
k3
[S] + [E]  [ES] [P] + [E]
k2

Km= K2+ K3/ K1


Catálisis enzimatica
La velocidad de formación del complejo enzima sustrato [ES] es igual a :
K1[S] [E]
La velocidad de destrucción del complejo enzima sustrato [ES] es igual a
:
(K2+ K3)[ES]
Mientras que la velocidad catalítica esta determinada por :
K3 [ES]

En estado estacionario las concentraciones de los intermediarios no


cambian, mientras que las de substrato y productos cambian durante el
proceso de transformación.
En estado estacionario las velocidades de formación y destrucción son
iguales :
K1[S] [E]=(K2+ K3) [ES]
[ES]= [S] [E]/Km
Catálisis enzimatica
Cuando tenemos bajas concentraciones de substrato tenemos una
reacción de orden 1 donde la velocidad de la reacción es dependiente
de la concentración de subtrato de acuerdo con la sig expresión

V=Vmax { [s] / [s] + Km}


La velocidad máxima de reacción ocurre cuando todos los centros
activos están saturados con substrato esto es cuando
[S] Km
A concentraciones altas de substrato la velocidad de reacción es
independiente de [s] = reacción de orden cero y la velocidad de catálisis
es igual a
Vmax=K3[E] *
Donde [E] *= a la concentración total de enzima
EFECTO DE LAS CONCENTRACIONES DEL
SUSTRATO SOBRE LA ACTIVIDAD
ENZIMÁTICA
• La velocidad de una reacción enzimática depende de la
concentración de sustrato. La Figura 1 muestra la
velocidad de una reacción enzimática a 6 concentraciones
distintas de sustrato.

• Además, la presencia de los productos finales puede


hacer que la reacción sea más lenta, o incluso invertir su
sentido (Figura 2 ).

• 1 2
EFECTO DEL pH SOBRE LA ACTIVIDAD
ENZIMÁTICA
• Los enzimas poseen grupos químicos ionizables (carboxilos
-COOH; amino -NH2; tiol -SH; imidazol, etc.) en las
cadenas laterales de sus aminoácidos.
• Según el pH del medio, estos grupos pueden tener carga
eléctrica positiva, negativa o neutra.
• Como la conformación de las proteínas depende, en parte,
de sus cargas eléctricas, habrá un pH en el cual la
conformación será la más adecuada para la actividad
catalítica. Este es el llamado pH óptimo.
EFECTO DEL pH SOBRE LA ACTIVIDAD
ENZIMÁTICA
• La mayoría de los enzimas son muy sensibles a los
cambios de pH.
• Desviaciones de pocas décimas por encima o por debajo
del pH óptimo pueden afectar drásticamente su actividad.
• Ej, la pepsina gástrica tiene un pH óptimo de 2, la ureasa lo
tiene a pH 7 y la arginasa lo tiene a pH 10. Como ligeros
cambios del pH pueden provocar la desnaturalización de la
proteína, los seres vivos han desarrollado sistemas más o
menos complejos para mantener estable el pH intracelular:
Los amortiguadores fisiológicos.
EFECTO DEL pH SOBRE LA ACTIVIDAD
ENZIMÁTICA
EFECTO DE LA TEMPERATURA SOBRE LA
ACTIVIDAD ENZIMÁTICA

• En general, los aumentos de temperatura aceleran


las reacciones químicas: por cada 10ºC de
incremento, la velocidad de reacción se duplica.
• Las reacciones catalizadas por enzimas siguen esta
ley general. Sin embargo, al ser proteínas, a partir
de cierta temperatura, se empiezan a desnaturalizar
por el calor.
• La temperatura a la cual la actividad catalítica es
máxima se llama temperatura óptima. Por encima
de esta temperatura, el aumento de velocidad de la
reacción debido a la temperatura es contrarrestado
por la pérdida de actividad catalítica debida a la
desnaturalización térmica, y la actividad enzimática
decrece rápidamente hasta anularse.
Inhibidores enzimáticos
Si la actividad de una o mas enzimas es inhibida por
encima de cierto límite se puede causar la muerte de la
célula
Las sustancias químicas que disminuyen la actividad
enzimática se llaman inhibidores.
Hay dos tipos de inhibidores:
•Irreversibles
•Reversibles

Los inhibidores irreversibles


Hacen a las enzimas permanentemente inactivas
Estos inhibidores actúan de una manera inespecífica y
causan la desnaturalización de la enzima
Incluyen varias sustancias muy tóxicas tales como los
iones del ion del cianuro y del metales pesados
Inhibidores enzimáticos

Los inhibidores reversibles presentan dos tipos de


mecanismos de inhibición:

•Competitivo
•No competitivo
Inhibidores enzimáticos

Inhibición Competitiva
Como su nombre lo indica en este tipo de inhibición, el
inhibidor compite con el sustrato por el sitio activo
En este mecanismo si la concentración de s aumenta es
posible desplazar al inhibidor y llevar acabo la reacción
enzimática
En estos casos el inhibidor tiene una estructura
muy similar al sustrato ya que compite por el
sitio activo
En este mecanismo puede ser altamente
específico
Sulfonamidas son inhibidores análogos del
ácido p-aminobenzoico, durante la síntesis de
ácido fólico en bacterias (síntesis de
nucleotidos)
Inhibidores enzimáticos
Inhibición No competitiva
Esta inhibición se lleva acabo por una substancia capaz de
reaccionar con un grupo químico de la apoenzima
(polipéptido) en un lugar diferente al sitio activo, pero de tal
manera que el sitio activo pierde su capacidad de aceptar
al sustrato
En este tipo de inhibición no importa las cantidades de
sustrato adicional, ya que el sitio activo no es el que se
encuentra ocupado
•Yodoacetato se combina con los grupos -SH
Inhibidores enzimáticos

La inhibición No competitiva es poco específica, puesto que


todos los residuos de aminoácidos dentro el polipéptido
que puedan reaccionar con el inhibidor reaccionarán
Inhibidores enzimáticos

En la inhibición :
Competitiva al aumentar [S] el Km de la
enzima con respecto al substrato
cambia, pero la Vmax no se altera (por
que s desplaza al inhibidor)
Inhibidores enzimáticos

En la inhibición :
No competitiva el Km de la enzima con
respecto al substrato no se altera, pero
la velocidad de reacción se ve
disminuida

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