DNA VIRUS

DNA VIRUS
1.
2.

DNA ds >>> DNA ss

No fragmentados

3.

Tamao del genoma (1.8 kb-800 kb) capacidad de codificacion 4. Promotores y secuencias enhancers 5. Factores de transcripcin viral 6. RNA polimerasa II 7. Preparacin de la clula para la replicacin viral.
8. Replicacin del DNA.

4. Replicacion de DNA virus

4.1 Fase prereplicativa Transcripcin de genes inmediatamente tempranos (IE) genes - tempranos (E) o genes 4.2. Fase replicativa Replicacin del DNA 4.3. Fase postreplicativa Transcripcin de genes tardos (L) o genes

 SV40 5 kbp 2 units, 6 proteins, economical heavy reliance on host to get started uses splicing to generate multiple mRNAs Adenovirus 35 kbp, 8 units, 40 proteins minimal # of transcription regulatory sequences Herpesviruses 150 kbp, ~80 units, more proteins Encode transcriptional activators some autoregulate - T, ICP4, others just activate EIA

Proteinas codificadas por el virus

DNA polimerasa y proteinas accesorias Timidina quinasa Ribonucleotido reductasa dUTPasa Exonucleasas Helicasas Proteinas de union al Origen de replicacin

Replicacin genmica de virus DNA

Reconocimiento del origen de replicacin y priming. Iniciacin de la sntesis de DNA y elongacin. Terminacin de la sntesis. Resolucin y procesamiento de los productos replicados.

Procesamiento del RNA

1.- Moficaciones covalentes durante el procesamiento del pre-mRNAviral.
1.1.- Adicin de la estructura CAP en el extremo 5. 1.2. Adicin de la cola de poli (A) en el extremo 3 1.3. Splicing del pre-mRNA viral. 1.4.Edicin del mRNA viral.

2.- Exportacin de los RNAm celulares y virales desde el Ncleo al citoplasma. REGULACION
1.- Regulacin post-transcripcional de la expresin de genes celulares y virales por protenas virales. 2.- Regulacin del tournover de los RNAmv y celulares en el citoplasma.

CONTROL TRADUCCIONAL DE LA EXPRESION GENICA VIRAL.

1.- Mecanismo de la sintesis proteica en clulas eucariotas. -Estructura general del RNAm eucariota -Maquinaria de traduccin -Iniciacin -Elongacin y Terminacin 2.- Diversas estrategias de traduccin viral. Sntesis de poliprotena Leaky scanning Reiniciacin Supresin de la terminacin Cambio del frente de lectura por los ribosomas. 3.- Regulacin de la traduccin durante la infeccin viral. Inhibicin de la iniciacin durante la infeccin viral Regulacin de la actividad de eIF4F

DNA virus. Regulacin en cascada de la transcripcin

ESTRUCTURA DEL Ori de SV40

Regulacin de la replicacin del DNA viral

Replicacin exponencial del DNA viral

Induccin de la sntesis de protenas celulares de replicacin. Replicacin del DNA viral por protenas virales. Sntesis demorada de protenas virales estructurales. Inhibicin de la snteisis de DNA celular. Localizacin del DNA viral en compartimientos cel. especializados.

Replicacin limitada del DNA viral

Replicacin como parte del genoma celular (integracin). Regulacin a travs de diferentes orgenes: EBV. Regulacin a travs de un nico origen: papillomavirus

Replicacin del DNA: 1. Requerimientos

Requiere la expresin de genes virales siempre Replicacin DNA es un evento retardado en el ciclo de infeccin. Replicacin es siempre 5 - 3, extensin a partir de un 3OH libre Se inicia en un origen definido altamente especfico, requiere un primer Terminacin - no es tan especfica

Centros de Replicacin
Contienen templado DNA protenas de replicacin Se forman en sitios discretos Proteinas virales y celulares pol, pol, pol, ligasa, topoisomerasa I y II Alta concentracin local de proteinas de replicacin y orgenes de replicacin del DNA Facilita el reclutamiento del producto de un ciclo de replicacin como templado para el siguiente.

Replicacin del DNA: 1. Requerimientos

Reconocimiento de un Ori - segmento mnimo de DNA -usualmente rico en AT -necesario para la iniciacin de la replicacin -usualmente une una protena al ori Problemas del templado - circular vs. lineal -como copian el extremo de una cadena lineal cuando la sntesis de la cadena es discontinua Primers para la sntesis de DNA - puede ser RNA, DNA o protena - utilizan protenas celulares y virales Elongacin - celular o viral Terminacin

Replicacin de SV40

Sntesis a partir de primers DNA y RNA (HSV)

Regulacin por Factores del hospedadors Virus usan protenas especificados por el virus o el hospedador. protenas de algunos virus se unen a factores sintetizados por la clulas Frecuencia de sitio y la ocupacin o especificidad puede limitar la replicacin SREs, NFkb Organizacin modular protenas regulatorias DBP activador interactor dominios dimerizacin Especificidad por reconocimiento de coactivadores

DNA virus HSV-1

Splicing alternativo en transcriptos de genes tardios

Virus de la hepatitis B (HBV)

Replication initiation alone depends on many specifi c interactions, including the TP and RT/RH domains of P protein, RNA, and different chaperones.

Bibliografa Principles of Virology. Flint, Enquist, Racaniello y Skalka.

Ed.: ASM Press. 2004. 2da Edicin.

Fields Virology. Knipe, Howley. Ed.:Lippincott Williams

ans Wilkins. 2007. 5ta. Edicin

Basic Virology. Wagner, Hewlett. Ed.: Blackwell

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