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Capítulo 12. Control de La Expresión Genética. Envoltura Nuclear
Capítulo 12. Control de La Expresión Genética. Envoltura Nuclear
factores de proteínas, es probable que los riboswitches sean otro utilización de la información genética, el núcleo de una célula
legado de un mundo de RNA ancestral (p. 429). eucariota tiene, a primera vista, una morfología que se distingue
bastante poco (FIGURA 12-5). Los contenidos del núcleo están
presentes como una masa viscosa y amorfa de material encerrada
por una envoltura nuclear compleja que forma un límite entre el
REPASO
núcleo y el citoplasma. Incluidos dentro del núcleo de una célula
1. Describa la cascada de eventos responsables de los cambios de interfase típica (es decir, no mitótica) están 1) los cromosomas,
repentinos en la expresión genética de una célula bacteriana que están presentes como fibras de nucleoproteínas muy extendi-
después de la adición de lactosa. ¿Cómo se compara esto das, denominadas cromatina; 2) uno o más nucléolos, que son es-
con los eventos que ocurren en respuesta a la adición de trip-
tructuras electrodensas de forma irregular que funcionan en la
tófano?
síntesis de RNA ribosómico y el ensamblaje de ribosomas (discu-
2. ¿Cuál es el papel del AMP cíclico en la síntesis de β-galactosi-
tido en la página 413); y 3) el nucleoplasma, la sustancia fluida en
dasa?
3. ¿Qué es un riboswitch?
la que se disuelven los solutos del núcleo.
La separación del material genético de una célula del citoplas-
ma circundante puede ser la característica más importante que
distingue a los eucariotas de los procariotas, lo que hace que la
aparición de la envoltura nuclear sea un hito en la evolución bio-
12.2 Estructura de la envoltura nuclear lógica. La envoltura nuclear consiste en dos membranas celula-
res dispuestas paralelas entre sí y separadas por 10 a 50 nm (FI-
Una diferencia principal entre los organismos procariotas y euca- GURA 12-6). Juntas, estas membranas contienen más de 60 pro-
riotas es la presencia de un núcleo en las células eucariotas. teínas transmembrana distintas, incluidas varias especies que
Además, la mayoría de los organismos eucariotas tienen genomas unen la membrana nuclear externa con elementos del citoesque-
mucho más grandes, que están presentes como moléculas de leto (figura 12-6a). Las membranas nucleares inteRNA y exteRNA
DNA de doble cadena dispuestas en cromosomas lineales que se fusionan en sitios que forman poros circulares que contienen
pueden visualizarse con facilidad durante la mitosis (como en la conjuntos complejos de proteínas. La célula promedio de los ma-
figura 12-22b). Antes de examinar la regulación de la expresión míferos contiene varios miles de poros nucleares. Por lo general,
genética en eucariotas, primero se analizarán las consecuencias la membrana externa está tachonada con ribosomas y es continua
de la compartimentación de los genomas dentro de los núcleos y con la membrana del retículo endoplasmático rugoso. El espacio
cómo los grandes genomas se empaquetan en complejos de DNA- entre las membranas es continuo con la luz del ER (figura 12-6a).
proteína llamados cromatina. El DNA en organismos procario- La superficie interna de la envoltura nuclear de las células ani-
tas no está empaquetado en cromatina, como resultado, las pro- males está unida por proteínas de membrana integrales a una red
teínas de unión a DNA, tales como la RNA polimerasa, los filamentosa delgada, llamada lámina nuclear (FIGURA 12-7). La
represores y los complejos CRP-cAMP pueden unirse directa- lámina nuclear proporciona soporte mecánico a la envoltura nu-
mente a sus sitios de unión preferidos. En contraste, las proteínas clear, sirve como un sitio de unión para las fibras de cromatina en
Envoltura nuclear
Poro nuclear
Heterocromatina
Envoltura nuclear
Nucléolo
Nucléolo
Nucleoplasma
Cromatina
a) b)
FIGURA 12-5 Núcleo de la célula. a) Micrografía electrónica de un núcleo interfásico de células HeLa. La heterocromatina (p. 469) es evidente alrededor
de toda la superficie interna de la envoltura nuclear. Se ven dos nucléolos prominentes, y se pueden observar grupos de cromatina diseminados por to-
do el nucleoplasma. b) Dibujo esquemático que muestra algunos de los principales componentes del núcleo.
Fuente: a) Tomado de Werner W Franke. Int Rev Cytol 1974;suppl 4:130, con permiso de Elsevier.
461
NPC NM
Citoplasma
Filamentos de actina
Filamentos intermedios Ribosoma
la periferia nuclear (figura 12-6b) y tiene un papel poco conocido progeria syndrome), que se caracteriza por el envejecimiento pre-
en la replicación y transcripción de DNA. Los filamentos de la maturo y la muerte durante la adolescencia por un ataque cardia-
lámina nuclear tienen aproximadamente 10 nm de diámetro y es- co o accidente cerebrovascular. La figura 12-7c) muestra los nú-
tán compuestos de polipéptidos, llamados laminillas. Las lamini- cleos deformados de las células de un paciente con HGPS, lo que
llas son miembros de la misma superfamilia de polipéptidos que demuestra la importancia de la lámina nuclear como determinan-
se ensamblan en los filamentos intermedios de 10 nm del citoplas- te de la arquitectura nuclear. Es interesante observar que el feno-
ma (véase tabla 9-2). El desensamblaje de la lámina nuclear antes tipo representado en la figura 12-7c) se ha rastreado hasta una
de la mitosis se induce por fosforilación de las laminillas. mutación sinónima, es decir, una que generó un codón diferente
Las mutaciones en uno de los genes laminares (LMNA) son para el mismo aminoácido. En este caso, el cambio en la secuen-
responsables de una serie de diversas enfermedades humanas, cia de DNA altera la forma en que se empalma la transcripción
entre las que se incluye una forma rara de distrofia muscular (lla- del gen, lo que lleva a la producción de una proteína acortada,
mada EDMD2), en la que las células musculares contienen nú- que es lo que causa el fenotipo alterado. Este ejemplo ilustra cómo
cleos excepcionalmente frágiles. Las mutaciones en LMNA tam- la secuencia de un gen sirve como un “código múltiple”: uno que
bién se han relacionado con una enfermedad, llamada síndrome dirige la maquinaria de traducción y otros que dirigen la maqui-
de progeria de Hutchinson-Gilford (HGPS, Hutchinson-Gilford naria de empalme y el plegamiento de proteínas.
b) c)
a)
FIGURA 12-7 Lámina nuclear. a) Núcleo de una célula humana cultivada que ha sido teñida con anticuerpos marcados con fluorescencia contra la lámina
A/C, para revelar la lámina nuclear (roja), que se encuentra en la superficie interna de la envoltura nuclear. Una proteína que se propone formar parte de
una matriz nuclear (o andamiaje nuclear) aparece en verde. b) Micrografía electrónica de una envoltura nuclear liofilizada sombreada con metal de un
ovocito de Xenopus que se ha extraído con el detergente no iónico Tritón X-100. La lámina aparece como una malla bastante continua que comprende fi-
lamentos orientados aproximadamente perpendiculares entre sí. El recuadro muestra un área bien conservada a partir de la cual se han eliminado de ma-
nera mecánica los poros nucleares. c) Estas micrografías muestran el núcleo dentro de un fibroblasto que se había cultivado tanto de un paciente con
HGPS (fila inferior) como de un sujeto sano (fila superior). Las células se tiñen para la proteína laminar A (columna izquierda), para DNA (columna central) o
se muestran en un estado vivo bajo el microscopio óptico de contraste de fase (columna derecha). El núcleo de la célula del paciente con HGPS se defor-
ma debido a la presencia en la lámina nuclear de una proteína laminar A truncada.
Fuente: a) Tomado de HMa, AJ Siegel y R Berezney. J Cell Biol 1999;146:535, fig. 2. Reproducido con permiso de la Rockefeller University Press;
b) Tomado de U Aebi, J Cohn, L Buhle y L Gerace. Nature 1986;323:561. Reimpreso con permiso de Macmillan Publishers Limited; c) Tomado de Anna
Mattout, et al. Cortesía de Yosef Gruenbaum. Curr Opin Cell Biol 2006;18:338, con el permiso de Elsevier.
462 El complejo de poros nucleares y su papel
en el tráfico nucleocitoplasmático
La envoltura nuclear es la barrera entre el núcleo y el citoplasma,
y los poros nucleares son las vías de acceso a través de esa barre-
CAPÍTULO 12 • Control de la expresión genética
Filamentos
citoplasmáticos
Membrana
a) Andamio central nuclear
interna
Canal central
Anillo nuclear
Nucleoplasma Cesta nuclear
a)
Proteína de
membrana
NE
Anillo de
ONM
nucleoporina
NE
transmembrana
INM
Nucleoporinas FG
b)
b) FIGURA 12-10 Modelo de un complejo de poro nuclear vertebrado
(NPC). a) Representación esquemática de un NPC vertebrado como está
situado dentro de la envoltura nuclear. Esta elaborada estructura consta
de varias partes, incluido un andamio y un anillo transmembrana que an-
cla el complejo a la envoltura nuclear, un anillo citoplasmático y nuclear,
una cesta nuclear y ocho filamentos citoplasmáticos. Las nucleoporinas
que contienen FG alinean un canal central con sus dominios desordena-
NEL dos que contienen FG que se extienden dentro de la abertura y forman
una malla hidrofóbica. b) Reconstrucción tridimensional de una porción de
un complejo de poro nuclear que muestra la localización de moléculas de
nucleoporinas individuales dentro de la estructura. Las nucleoporinas de
FG se muestran en verde. Varias nucleoporinas transmembrana atraviesan
la membrana del poro, formando un anillo exterior que ancla el NPC a la
envoltura nuclear.
Fuente: b) Tomado de: Javier Fernández-Martínez y Michael P Rout. Curr
Opin Cell Biol 2009;21:604, con el permiso de Elsevier.
Citoplasma
Ran-GTP
Importina β
Ran-GDP
Importina α
Proteína NLS 1 2 3 4 5
a)
b)
tación comienza cuando la proteína de carga que contiene NLS basa en un mecanismo en el que la célula mantiene una alta con-
se une a un heterodimérico, receptor soluble de NLS denomina- centración de Ran-GTP en el núcleo y una concentración muy
do importina α/β, que reside en el citoplasma (paso 1, figura 12- baja de Ran-GTP en el citoplasma. El gradiente pronunciado de
11a). Se cree que el receptor de transporte escolta la carga de Ran-GTP a través de la envoltura nuclear depende de la compar-
proteína a la superficie externa del núcleo, donde probablemente timentación de ciertas proteínas accesorias (véase figura 15-21b
se acopla con los filamentos citoplasmáticos que se extienden para análisis adicional). Una de estas proteínas accesorias (llama-
desde el anillo exterior del NPC (paso 2). La figura 12-11b) mues- da RCC1) está secuestrada en el núcleo, donde promueve la con-
tra un número de partículas de oro unidas a estos filamentos; versión de Ran-GDP a Ran-GTP, manteniendo así el alto nivel
estas partículas fueron recubiertas con una proteína nuclear que nuclear de Ran-GTP. Otra proteína accesoria (llamada RanGAP1)
contiene NLS, que estaba siendo transportada a través del com- reside en el citoplasma, donde promueve la hidrólisis de Ran-
plejo de poro nuclear. El complejo receptor-carga se mueve enton- GTP a Ran-GDP, manteniendo así el bajo nivel citoplasmático de
ces a través del poro nuclear (paso 3, figura 12-11a) participando Ran-GTP. Por tanto, la energía liberada por la hidrólisis de GTP
en una serie de interacciones sucesivas con los dominios FG de se usa para mantener el gradiente Ran-GTP a través de la envol-
las nucleoporinas que contienen FG, permitiendo el paso del tura nuclear. Como se verá más adelante, el gradiente Ran-GTP
complejo receptor-carga a través del NPC. impulsa el transporte nuclear por un proceso que depende única-
Una vez que la carga atada avanza a través del NPC, una pro- mente de la difusión mediada por el receptor; no se han implica-
teína de unión a GTP llamada Ran impulsa la liberación de la do proteínas motoras o ATPasas.
proteína transportada al compartimiento nuclear. Al igual que Ahora se puede volver a la descripción de la vía clásica de
otras proteínas unidas a GTP, como Sar1 (p. 283) y EF-Tu (p. 445) importación NLS. Cuando el complejo de importina-carga llega al
tratadas en capítulos anteriores, Ran puede existir en una forma núcleo, se encuentra con una molécula de Ran-GTP, que se une
unida a GTP activa o en una forma inactiva unida a GDP. El papel al complejo y provoca su desensamblaje, como se indica en el
de Ran en la regulación del transporte nucleocitoplasmático se paso 4, figura 12-11a). Esta es la función aparente del alto nivel de
Ran-GTP en el núcleo: promueve el desensamblaje de complejos DNA a partir de un solo cromosoma de más de 10 cm de longi- 465
importados del citoplasma. La carga importada se libera en el tud. ¿Cómo es posible colocar los 46 cromosomas en un núcleo
–5
nucleoplasma, y una parte del receptor NLS (la subunidad β im- que tiene solo 10 μm (1 × 10 m) de diámetro y, al mismo tiempo,
portina) se envía de vuelta al citoplasma junto con el Ran-GTP mantener el DNA en un estado accesible para las enzimas y las
H1
DNA
a)
b)
FIGURA 12-12 Organización nucleosomal de la cromatina. a) Diagrama esquemático que muestra la estructura de una partícula nuclear de nucleosoma
y una molécula de histona H1 asociada. La nuclear en sí misma consiste en, aproximadamente, 1.8 vueltas (146 pares de bases) de DNA negativamente
superenrollado envuelto alrededor de ocho moléculas de histona nuclear (dos de cada una de H2A, H2B, H3 y H4). El enlazador histona H1 se une
cerca de los sitios donde el DNA entra y sale del nucleosoma. Se muestran dos posiciones alternativas de la molécula H1. b) Micrografía electrónica de
fibras de cromatina liberadas del núcleo de una célula de Drosophila. Las partículas nucleares del nucleosoma tienen un diámetro de alrededor de 10 nm
y están conectadas por cadenas cortas de DNA desnudo enlazador, que tienen cerca de 2 nm de diámetro.
Fuente: b) Cortesía de Oscar L Miller, Universidad de Virginia.
7
N
0
C
N N 1
H3'H3
H4 6
C
H3
N 2
H2A H4
H2B
H2A 5
H2B C
3
H3 N
N 4
H4
H2A H3
H2A H3
H2B H4
H2B H4
a) b) c)
FIGURA 12-13 Estructura de un nucleosoma. a) Representación esquemática de una partícula nuclear de nucleosoma con su octámero de histonas com-
puesto por cuatro heterodímeros de histona (dos dímeros H3/H4 y dos dímeros H2A/H2B). b) Estructura cristalográfica de rayos X de una partícula nu-
clear del nucleosoma vista en el eje central de la superhélice de DNA, que muestra la posición de cada una de las ocho moléculas de histona del octá-
mero del núcleo. Las histonas están organizadas en cuatro complejos diméricos. Cada dímero de histona se une a 27 a 28 pares de bases de DNA, con
contactos que se producen cuando el surco menor del DNA se enfrenta al núcleo de la histona. c) Modelo simplificado y esquemático de la mitad de una
partícula nuclear del nucleosoma, que muestra un giro (73 pares de bases) de la superhélice de DNA y cuatro moléculas de histona nuclear. Las cuatro
histonas diferentes se muestran en colores separados, como lo indica la clave. Se considera que cada histona nuclear consta de 1) una región globular,
llamada “pliegue de histonas”, que consta de tres hélices α (representadas por los cilindros) y 2) una cola N-terminal flexible y extendida (indicada por la
letra N) que se proyecta fuera del disco de histonas y pasa la doble hélice de DNA. Los puntos intermitentes de interacción entre las moléculas de histo-
na y el DNA están indicados por ganchos blancos. Las líneas discontinuas indican la parte más externa de las colas de las histonas, que son sitios de mo-
dificación. Estas colas flexibles carecen de una estructura terciaria definida y, por tanto, no aparecen en la estructura de rayos X que se muestra en la
parte b.
Fuente: a) Tomado de C David Allis, et al. Epigenética, fig. 3.5, p. 30, copyright 2007. Reimpreso con autorización de Cold Spring Harbor Laboratory
Press; b) Tomado de Karolin Luger y Timothy J Richmond, et al. Nature 1997;389:252, fig. 1. Reimpreso con permiso de Macmillan Publishers Limited; c)
Tomado del dibujo por D Rhodes; © 1997, por Macmillan Publishers Limited.
soma obtenida mediante cristalografía de rayos X. Las ocho mo- mento C terminal de H2A) toman la forma de una cola larga y
léculas de histona que comprenden una partícula nuclear del flexible (representada por las líneas discontinuas de la figura
nucleosoma se organizan en cuatro heterodímeros: dos dímeros 12-13c) que se extiende a través de la hélice de DNA que está
H2A-H2B y dos dímeros H3-H4 (figura 12-13a,b). La dimeriza- envuelta alrededor de la partícula del núcleo. Durante muchos
ción de las moléculas de la histona está mediada por sus domi- años, se pensó en las histonas como moléculas estructurales e
nios C terminal, que consisten principalmente en hélices α (re- inertes, pero los segmentos N-terminal que se extienden son ob-
presentadas por los cilindros de la figura 12-13c) plegadas en una jetivos de las enzimas clave que desempeñan un papel en hacer
masa compacta en el núcleo del nucleosoma. En contraste, los que la cromatina sea accesible para las proteínas. De esta manera,
segmentos N-terminal de cada histona nuclear (y también el seg- la cromatina es un componente celular dinámico en el que las
histonas, las proteínas reguladoras y una variedad de enzimas se Niveles más altos de la estructura 467
mueven dentro y fuera del complejo de nucleoproteínas para fa-
de la cromatina
cilitar las complicadas tareas de transcripción, compactación, re-
plicación, recombinación y reparación de DNA. Una molécula de DNA envuelta alrededor de partículas nucleares
Fibra de
30nm
c)
b)
FIGURA 12-14 Fibra de 30 nm. a) Micrografía electrónica de una fibra de cromatina de 30 nm liberada
de un núcleo después de la lisis de la célula en una solución salina hipotónica. b) Modelo para la estruc-
tura de la fibra de 30 nm que se basa en el ajuste de estructuras atómicas de nucleosomas en datos de
microscopía crioelectrónica. Las histonas se muestran en rojo y verde. El DNA se muestra en azul, dora-
do y morado. Los nucleosomas se alinean para formar una doble hélice con pares de nucleosomas suce-
sivos en la cadena (representados aquí por el mismo color de DNA) que alternan entre las dos hélices,
con DNA enlazador que se extiende a través de la mitad de la doble hélice. c) Esquema de la estructura
de la fibra, que muestra 12 nucleosomas numerados N1-N12, que se acumulan en pares. Estos pares se
asocian entonces de extremo a extremo para formar las dos cadenas de una doble hélice. El DNA enla-
zador se muestra en verde.
Fuente: a) Cortesía de Barbara Hamkalo y Jerome B Rattner; b, c) Tomado de: Feng Song, et al. Science
a) 2014;344:376-380.
468
Anillo de
CAPÍTULO 12 • Control de la expresión genética
cohesina
Andamio
b)
FIGURA 12-15 Asas de cromatina: un nivel más alto de la estructura de la
cromatina. a) Micrografía electrónica de un cromosoma mitótico que se ha-
bía tratado para eliminar histonas. El cromosoma sin histonas muestra asas
a) de DNA que están unidas en sus bases a un andamio de proteína residual.
b) Modelo simplificado por el cual los anillos de cohesión podrían desempe-
ñar un papel en el mantenimiento de las asas de DNA de interfase.
histonas nucleares de los nucleosomas adyacentes pueden inte- Fuente: a) Tomado de: James R Paulson y UK Laemmli. Cell 1977;12:823,
ractuar entre sí por medio de sus colas largas y flexibles. Los es- con permiso de Elsevier.
tudios estructurales indican, por ejemplo, que la cola N-terminal
de una histona H4 de una partícula nuclear del nucleosoma
puede alcanzar y hacer un contacto extenso tanto con el DNA
enlazador entre partículas del nucleosoma, como con el dímero Doble hélice de DNA
H2A/H2B de partículas adyacentes. Se cree que estos tipos de (2 nm de diámetro)
interacciones median el plegamiento del filamento nucleosomal
en una fibra más gruesa. De hecho, las fibras de cromatina pre-
paradas con histonas H4 que pierden sus colas no pueden plegar- DNA Histona H1
se en fibras de orden superior.
Se cree que la próxima etapa en la jerarquía del empaqueta- Partícula nuclear
miento de DNA ocurre cuando la fibra de cromatina de 30 nm se del nucleosoma Histonas
reúne en una serie de asas o dominios grandes superenrollados, nucleares
que pueden compactarse en fibras incluso más gruesas (80-100 (8 subunidades)
nm). Las asas de DNA aparentemente se unen a sus bases para
formar proteínas que pueden ser parte de un andamio nuclear
poco definido. Normalmente, las asas de fibras de cromatina se Filamento de nucleosoma
extienden dentro del núcleo y no se pueden visualizar, pero su (10 nm de diámetro)
presencia puede revelarse en ciertas circunstancias. Por ejemplo,
cuando los cromosomas mitóticos aislados se tratan con solucio-
nes que extraen histonas, se puede ver que el DNA libre de histo-
nas se extiende hacia afuera como asas de un andamio de proteína
(FIGURA 12-15a). Entre las proteínas que se cree que desempeñan
un papel clave en el mantenimiento de estas asas de DNA se en- Fibra de 30 nm
Andamio de
cuentra la cohesina, que se conoce mejor por su función en la re-
proteínas
tención de moléculas de DNA replicadas juntas durante la mitosis
(sección 14.7). La cohesina es una proteína con forma de anillo
que puede actuar como se muestra en la FIGURA 12-15b).
El cromosoma mitótico representa lo último en cromatina
compactada; 1 μm de longitud del cromosoma mitótico por lo Dominios
común contiene aproximadamente 1 cm de DNA, lo que repre- en asas
senta una relación de empaque de 10 000:1. Esta compactación se
produce por un proceso poco conocido que se analiza en la sec-
ción 14.7. En la FIGURA 12-16 se muestra una visión general de los
12.4 • Heterocromatina
del cromosoma Y en los mamíferos machos. El DNA de la hetero-
1. ¿Cuál es la relación entre las histonas y el DNA de una partí- cromatina constitutiva consiste sobre todo en secuencias repeti-
cula nuclear de nucleosoma? ¿Cómo se reveló por primera das (p. 384) y contiene relativamente pocos genes. De hecho,
vez la existencia de nucleosomas? ¿Cómo se organizan los cuando los genes que son por lo común activos se mueven en una
nucleosomas en niveles más altos de cromatina? posición adyacente a estas regiones como resultado de la transpo-
sición o translocación, tienden a silenciarse transcripcionalmen-
te, un fenómeno conocido como efecto de posición. Se entiende
12.4 Heterocromatina que la heterocromatina contiene componentes cuya influencia
puede extenderse hasta cierta distancia, afectando genes cer-
Una vez que se ha completado la mitosis, la mayor parte de la canos. La propagación de heterocromatina a lo largo del cromo-
cromatina en los cromosomas mitóticos altamente compactados soma está bloqueada, en apariencia, por secuencias de barrera
vuelve a su condición de interfase difusa. Sin embargo, alrededor especializadas (elementos de límite) en el genoma. La heterocroma-
de 10% de la cromatina permanece, por lo general, en una forma tina constitutiva también sirve para inhibir la recombinación ge-
condensada y compactada en toda la interfase. Esta cromatina nética entre secuencias repetitivas homólogas. Este tipo de re-
compactada y densamente teñida se concentra normalmente cer- combinación puede conducir a duplicaciones y eliminaciones de
ca de la periferia del núcleo, a menudo cerca de la lámina nuclear, DNA (véase figura 10-23).
como se indica en la figura 12-5a. La cromatina que permanece La heterocromatina facultativa es la cromatina que se ha
compactada durante la interfase se llama heterocromatina, para inactivado específicamente durante ciertas etapas de la vida de un
distinguirla de la eucromatina, que vuelve a un estado activo organismo o en ciertos tipos de células diferenciadas (como en la
disperso. Cuando se administra un precursor de RNA marcado figura 17-9b). Se puede ver un ejemplo de heterocromatina facul-
3
radiactivamente, como [ H] uridina a las células que se fijan, sec- tativa al comparar los cromosomas sexuales en las células de un
cionan y autorradiografían con posterioridad, las agrupaciones mamífero hembra con los de un macho. Las células de los machos
de heterocromatina se mantienen en gran parte sin marcar, lo tienen un cromosoma Y diminuto y un cromosoma X mucho más
que indica que tienen una actividad transcripcional relativamente grande. Debido a que los cromosomas X y Y tienen sólo unos po-
pequeña. Se cree que las regiones periféricas del núcleo contie- cos genes en común, los machos tienen una copia única de la
nen factores que promueven la represión transcripcional, lo que mayoría de los genes que se transportan en los cromosomas se-
las convierte en un entorno favorable para la localización de la xuales. Aunque las células de las hembras contienen dos cromoso-
heterocromatina. Como se verá más adelante, el estado de una mas X, sólo uno de ellos es transcripcionalmente activo. El otro
región particular del genoma, ya sea eucromático o heterocromá- cromosoma X permanece condensado como un grupo heterocro-
tico, se hereda de forma estable de una generación de células a la mático (FIGURA 12-17a) llamado cuerpo de Barr, por el investigador
siguiente. que lo descubrió en 1949. La formación de un cuerpo de Barr ga-
La heterocromatina se divide en dos clases. La heterocroma- rantiza que las células de ambos sexos tengan el mismo número
tina constitutiva permanece en estado compactado en todas las de cromosomas X activos y así sinteticen cantidades equivalen-
células en todo momento y, por tanto, representa DNA que se tes de los productos codificados por genes vinculados a X.
a) b) c)
FIGURA 12-17 Heterocromatina facultativa: el cromosoma X inactivo. a) El cromosoma X inactivado aparece como una estructura heterocromática con
tinción oscura, llamada cuerpo de Barr (flechas). b) La inactivación aleatoria de cualquiera de los cromosomas X en diferentes células durante el desarro-
llo embrionario temprano crea un mosaico de parches de tejido y es responsable de los patrones de color en los gatos calicó. Cada parche comprende
los descendientes de una célula que estaba presente en el embrión en el momento de la inactivación. Estos parches son visualmente evidentes en los
gatos calicó, que son heterocigotos con un alelo para el color del pelaje negro que reside en un cromosoma X y un alelo para el pelaje naranja en el otro
X. Esto explica por qué los calicós machos son prácticamente inexistentes, porque todas las células del macho tienen el alelo de color del pelaje negro o
anaranjado. (Las manchas blancas en este gato se deben a un gen de color de pelaje autosómico diferente.) C) Este gatito fue clonado del gato que se
muestra en b. Los dos animales son genéticamente idénticos, pero tienen diferentes patrones de pelaje, un reflejo de la naturaleza aleatoria del proceso
de inactivación X (y probablemente otros eventos aleatorios de desarrollo).
Fuente: a) Cortesía de EG (Mike) Bertram; b-c) Cortesía de la Facultad de Medicina Veterinaria y Ciencias Biomédicas, Texas A & M University.
470 Inactivación del cromosoma X del cromosoma X; el presente debate se ceñirá a XIST. El RNA
XIST se acumula selectivamente a lo largo del cromosoma X, des-
Sobre la base de sus estudios acerca de la herencia del color del de el cual se transcribe, donde ayuda a reclutar ciertos complejos
pelaje en ratones, la genetista británica Mary Lyon propuso lo 3
proteicos que inactivan los genes en sitios seleccionados. El gen
siguiente en 1961:
CAPÍTULO 12 • Control de la expresión genética
12.4 • Heterocromatina
P Me Ac Ac Ac Ac Me
S G R G K G G K G L G K G G A K R H R K V L R D N I Q G I T K PA I R R L A R histona H4 102 aa
1 3 5 8 12 16 20
Ac Ac Ub
P
Ac Ac P Ub
FIGURA 12-18 Modificaciones de histona y el código de histonas. Las colas amino terminales de las proteínas histonas que se extienden más allá del
DNA en los nucleosomas pueden modificarse enzimáticamente mediante la adición covalente de grupos metilo, acetilo y fosfato. Se añaden grupos meti-
lo a residuos de lisina (K) o arginina (R), grupos acetilo a residuos de lisina y grupos fosfato a residuos de serina (S). La pequeña proteína ubiquitina se
puede agregar a uno de los residuos de lisina en el núcleo (en lugar de la cola) de H2A y H2B. Cada residuo de lisina puede tener uno, dos o tres grupos
metilo añadidos, y cada residuo de arginina puede tener uno o dos grupos metilo añadidos. Estas modificaciones afectan la afinidad de la histona por las
proteínas que interactúan y controlan la actividad transcripcional de la cromatina, lo que ha llevado al concepto de código de histonas. Es muy conocido
que la acetilación de lisinas conduce a la activación transcripcional. Los efectos de la metilación dependen con fuerza de cuál de estos residuos se modi-
fica. Por ejemplo, la metilación de la lisina 9 de la histona H3 (es decir, H3K9) suele estar presente en la heterocromatina y está asociada con la represión
transcripcional, como se explica en el texto. La metilación de H3K27 y H4K20 también está intensamente relacionada con la represión transcripcional,
mientras que la metilación de H3K4 y H3K36 se asocia con la activación transcripcional. Del mismo modo que existen enzimas que catalizan cada una de
estas modificaciones, también existen enzimas (desacetilasas, desmetilasas, fosfatasas y desubiquitinasas) que las eliminan específicamente.
Fuente: Tomado de C David Allis, et al. Epigenetics, fig. 3.6, p. 31, Copyright 2007. Reproducido con permiso del Cold Spring Harbor Press.
los últimos años se han desarrollado técnicas para analizar cam- en gran parte metilado, mientras que este mismo residuo en los
bios que afectan la transcripción del genoma, como las modifica- dominios eucromáticos suele estar acetilado. La eliminación de
ciones de histonas, en el ámbito de todo el genoma, en lugar de los grupos acetilo de las histonas H3 y H4 es uno de los pasos
simplemente observar estos cambios en un gen a la vez. Esto ha iniciales en la conversión de eucromatina en heterocromatina. La
brindado una visión mucho más amplia de la importancia gene- correlación entre la represión transcripcional y la desacetilación
ral de cada uno de estos fenómenos, de lo que fue posible hace de histonas se puede observar comparando el cromosoma X
sólo unos pocos años. heterocromático inactivo de las células femeninas, que contiene
La comparación de los nucleosomas presentes dentro de los histonas desacetiladas, con el cromosoma X eucromático activo,
dominios de cromatina heterocromática versus eucromática reve- cuyas histonas presentan un nivel de acetilación anormal (FIGU-
ló una diferencia llamativa. El residuo de lisina en la posición núm. RA 12-20). La desacetilación de histona se acompaña de la meti-
9 (Lys9 o K9) de la histona H3 en dominios heterocromáticos está lación de H3K9, que es catalizada por una enzima (una histona
BPTF Brd2
CHD1 HP1 14-3-3 Rsc4 PC EAF3 CRB2
ING2 JMJD2
Ac
Me Me P Ac Me Me Me K
H3 K K K 16 12 8 H4
K S K K
4 9 10 14 27 K K
36 20
Ac Ac
Taf1 Bdf1
FIGURA 12-19 Ejemplos de proteínas que se unen selectivamente a residuos H3 o H4 modificados. Cada una de las proteínas unidas posee una activi-
dad que altera la estructura y/o función de la cromatina. Existe una complejidad adicional que no se muestra en este dibujo, en el sentido de que las mo-
dificaciones en un residuo de histona pueden influir en los eventos en otros residuos, un fenómeno conocido como diafonía. Por ejemplo, la unión de la
proteína heterocromatina HP1 a H3K9 se bloquea mediante la fosforilación del residuo de serina adyacente (H3S10), que por lo general se produce du-
rante la mitosis.
Fuente: Tomado de T Kouzarides. Cell 2007;128:696; Cell by Cell Press. Reproducido con permiso de Cell Press en el formato de reutilización en un li-
bro/libro de texto a través de Copyright Clearance Center.
472 des de unión de la proteína HP1 promueven la formación de una
red interconectada de nucleosomas metilados, lo que conduce a
un dominio de cromatina de orden superior compacto (véase
FIGURA 12-21). Lo que es más importante, este estado se transmi-
CAPÍTULO 12 • Control de la expresión genética
Transcripción
FIGURA 12-20 Demostración experimental de una correlación entre la
actividad transcripcional y la acetilación de histonas. Esta propagación 1 DNA repetido
del cromosoma metafásico se ha marcado con anticuerpos fluorescentes
para la histona H4 acetilada, que emiten fluorescencia en verde. Todos Transcripción
los cromosomas, excepto el X inactivado, se tiñen de manera brillante con
RNA transcrito
el anticuerpo contra la histona acetilada.
Fuente: Tomado de P Jeppesen y BM Turner, portada de Cell 1993;2(74),
con permiso de Elsevier. Cortesía de Peter Jeppesen.
dsRNA
2
metiltransferasa) que parece estar dedicada a esta y sólo esta fun-
ción particular. Esta enzima, llamada SUV39H1 en los humanos, Complejo Dicer
se puede encontrar localizada dentro de la heterocromatina, don- de proteínas siRNA
de puede estabilizar la naturaleza heterocromática de la región a 3
través de su actividad de metilación.
SUV39H1
La formación de una lisina metilada en la posición núm. 9 Elemento
RNA naciente Grupo acetilo
transmite a la cola de la histona H3 una importante propiedad: se en K9 de H3 límite
vuelve capaz de unirse con alta afinidad a las proteínas que con-
tienen un dominio particular, denominado cromodominio. El geno- 4
siRNA
ma humano contiene, al menos, 30 proteínas con cromodominios,
de las cuales, la mejor estudiada es la proteína heterocromática 1 (o RNA polimerasa
HP1). La HP1 ha sido implicada en la formación y mantenimien-
Grupo metilo
to de la heterocromatina. Una vez unida a una cola de H3, se cree en K9 de H3
que HP1 interactúa con otras proteínas, incluyendo 1) SUV39H1,
la enzima responsable de metilar el residuo de H3K9 y 2) otras
moléculas de HP1 en los nucleosomas cercanos. Estas propieda- 5
HP1
Gota de sangre
Transferencia a un vial
para el cultivo
b)
Medio
11 12 13 14 15
16 17 18 Y
Gotas de X
fijador con
células
19 20 21 22
Portaobjetos
húmedo c)
FIGURA 12-23 Telómeros. a) Hibridación in situ de una sonda de DNA que contiene la secuencia TTAGGG, que se localiza en los telómeros de los cro-
mosomas humanos. b) Demostración de que ciertas proteínas se unen específicamente al DNA telomérico. Estos cromosomas se prepararon a partir de
un núcleo meiótico de una célula de levadura y se incubaron con la proteína RAP1, que posteriormente se localizó en los telómeros mediante un anti-
cuerpo fluorescente antiRAP1. Las áreas azules indican la tinción de DNA, las áreas amarillas representan el marcaje del anticuerpo antiRAP1, y el rojo
muestra el RNA teñido con yoduro de propidio. Los humanos tienen una proteína telomérica homóloga (hRAP1, que es parte del complejo de shelterina).
Fuente: a) Tomado de J Meyne, in RP Wagne. Chromosomes: A Synthesis. Wiley; 1993, © 1993. Este material se usa con el permiso de John Wiley &
Sons, Inc.; b) Tomado de Franz Klein, et al. J Cell Biol 1992;117:940, fig. 4c. Cortesía de Susan M Gasser, reproducida con permiso de la Rockefeller
University Press.
una nueva enzima, llamada telomerasa, que puede agregar nue- tar en Filadelfia, las células dejan de dividirse por completo des-
vas unidades de repetición al extremo 39 de la cadena sobresa- pués de, aproximadamente, 50 a 80 duplicaciones de población,
liente (figura 12-24c). Una vez que se ha alargado el extremo 39 de y entran en una etapa conocida como senescencia replicativa. Si se
la cadena, una DNA polimerasa convencional puede usar el seg- compara la longitud promedio de los telómeros en los fibroblas-
mento 39 recién sintetizado como una plantilla para devolver el tos al comienzo y al final del experimento, se encuentra una dis-
extremo 59 de la cadena complementaria a su longitud previa. La minución radical en dicha longitud en el transcurso del tiempo en
telomerasa es una transcriptasa inversa que sintetiza DNA utili- cultivo. Los telómeros se contraen, porque la mayoría de las célu-
zando una plantilla de RNA. A diferencia de la mayoría de las las carecen de telomerasa y no pueden evitar la pérdida de sus
transcriptasas inversas, la enzima en sí misma contiene el RNA extremos cromosómicos. Con cada división celular, los telóme-
que sirve como su plantilla (figura 12-24c). ros de los cromosomas se vuelven cada vez más cortos. El acorta-
Los telómeros son partes muy importantes de un cromosoma: miento de los telómeros continúa hasta un punto crítico, en el
son necesarios para la replicación completa del cromosoma, for- que se desencadena una respuesta fisiológica dentro de cada cé-
man casquetes que protegen los cromosomas de las nucleasas y lula, que hace que esa célula deje de crecer y dividirse. Las células
otras influencias desestabilizadoras, y evitan que los extremos de capaces de reactivar la telomerasa pueden reanudar el crecimien-
los cromosomas se fusionen entre sí. La FIGURA 12-25 muestra to y la división y convertirse en inmortales. Tales células, por lo
cromosomas mitóticos de un ratón que ha sido diseñado genéti- general, también pueden causar cáncer (véase página 710).
camente para carecer de telomerasa. Muchos de los cromosomas Curiosamente, la telomerasa está ausente de la mayoría de las
se han sometido a fusión de extremo a extremo, lo que conduce células del cuerpo, pero hay excepciones importantes. Las células
a consecuencias catastróficas, ya que los cromosomas se desga- germinales de las gónadas conservan la actividad de la telomera-
rran en divisiones celulares posteriores. Experimentos recientes sa, y los telómeros de sus cromosomas no se contraen como re-
sugieren roles adicionales para los telómeros, por lo que se han sultado de la división celular. En consecuencia, cada descendien-
convertido en un centro de investigación actual. te comienza su vida como un cigoto que contiene telómeros de
Supongamos que un investigador realiza una pequeña biop- longitud máxima. Del mismo modo, las células madre ubicadas
sia de su piel, aísla una población de fibroblastos de la dermis y en el revestimiento de la piel y el intestino, y las células madre
permite que estas células crezcan en un medio de cultivo enrique- hematopoyéticas de los tejidos que forman la sangre también ex-
cido. Los fibroblastos se dividirían más o menos cada día en el presan esta enzima, lo que permite que estas células sigan proli-
cultivo y, finalmente, cubrirían el plato. Si se eliminara una frac- ferando y generando la gran cantidad de células diferenciadas
ción de estas células del primer plato y se volviera a colocar en un requeridas en estos órganos. La importancia de la telomerasa se
segundo plato, proliferarían una vez más hasta cubrir también revela por una rara afección, en la que los individuos tienen nive-
el segundo plato. Se podría pensar que estas células pueden sub- les de telomerasa muy reducidos, ya que son heterocigotos para
cultivarse indefinidamente, como se creyó en la primera mitad el gen que codifica cualquiera de los RNA de la telomerasa o una
del siglo pasado, pero sería una equivocación. Como descubrie- de las subunidades de proteínas. Estos individuos sufren de insu-
ron en 1961 Leonard Hayflick y Paul Moorhead del Instituto Wis- ficiencia de la médula ósea, debido a la incapacidad de este tejido
476 5' 3'
3' 5'
1 Replicación
CAPÍTULO 12 • Control de la expresión genética
5' 3'
3' 5'
RNA RNA Telomerasa RNA
5' 3'
3' 5'
3' 5'
Eliminación del cebador
2 1 U
de RNA 5' C
U C
A A
5' 3' CCCCAACCCCAACCC 5' AA U
AACCCCAAC U
3' 5' GGGGTTGGGGTTGGGGTTGGGGTTGGGG 3'
5' 3'
3' 5'
Procesamiento Alargamiento
3 3' 5'
del terminal 5'
2 U
C
5' 3' U
A C
A
3' 5' CCCCAACCCCAACCC 5' AA U
AACCCCAAC U
5' 3' GGGGTTGGGGTTGGGGTTGGGGTTGGGGTTG 3'
3' 5'
a) Translocación
3' 5'
3 U
C
U C
A A
CCCCAACCCCAACCC 5' AA U
AACCCCAAC U
GGGGTTGGGGTTGGGGTTGGGGTTGGGGTTG 3'
Cadena sobresaliente
Alargamiento
5' 3' 5'
4 U
C
U C
A A
CCCCAACCCCAACCC 5' AA U
AACCCCAAC U
c) GGGGTTGGGGTTGGGGTTGGGGTTGGGGTTGGGGTTG 3'
b)
FIGURA 12-24 El problema de replicación final y el papel de la telomerasa. a) Cuando el DNA de un cromosoma se replica (paso 1), los extremos 59 de
las cadenas recién sintetizadas (rojo) contienen un segmento corto de RNA (verde), que había funcionado como un cebador para la síntesis del DNA ad-
yacente. Una vez que se elimina este RNA (paso 2), el extremo 59 del DNA se hace más corto en relación con el de la generación anterior. Los extremos
59 en cada extremo del cromosoma se procesan adicionalmente mediante actividades de nucleasa (paso 3), lo que aumenta las longitudes del saliente
de una sola cadena. b) El saliente de una sola cadena no permanece como una extensión libre, sino que invade el dúplex como se muestra aquí, despla-
zando una de las cadenas, que forma un asa. El asa es un sitio de unión para un complejo de proteínas específicas que bloquean los telómeros que pro-
tegen los extremos de los cromosomas y regulan la longitud de los telómeros. c) Mecanismo de acción de la telomerasa. La enzima contiene una molécu-
la de RNA que es complementaria al extremo de la cadena rica en G, que se extiende más allá de la cadena rica en C. El RNA de la telomerasa se une al
extremo sobresaliente de la cadena rica en G (paso 1) y luego sirve como plantilla para la adición de nucleótidos en el extremo 39 de la cadena (paso 2).
Después de que se sintetiza un segmento de DNA, el RNA de la telomerasa se desliza hacia el nuevo extremo de la cadena que se alarga (paso 3) y sir-
ve como molde para la incorporación de nucleótidos adicionales (paso 4). La brecha en la cadena complementaria se llena con las enzimas de replica-
ción polimerasa α primasa (véase figura 13-21).
Fuente: c) CW Greider y EH Blackburn, reimpreso con permiso de Nature 1989;337:336, copyright 1989. Nature by Nature Publishing Group. Reproducido
con permiso de Nature Publishing Group en el formato de reutilización en un libro/libro de texto a través de Copyright Clearance Center.
FIGURA 12-25 Integridad de la telomerasa y el cromosoma. Los cromosomas en esta micrografía son
de la célula de un ratón que carece de un gen funcional para la enzima telomerasa. Los telómeros apare-
cen como manchas amarillas después de la hibridación in situ con una sonda de telómero marcada con
fluorescencia. Algunos cromosomas carecen de telómeros por completo y varios cromosomas se han fu-
sionado entre sí en sus extremos. La fusión cromosómica produce cromosomas con más de un centró-
mero, lo que a su vez conduce a la rotura cromosómica durante la división celular. La inestabilidad gené-
tica que resulta de la pérdida de un telómero puede ser una de las principales causas de que las células
se vuelvan cancerosas.
Fuente: Tomado de María A Blasco, et al. Cell 1997; portada # 1, vol. 91. Cortesía de Carol W Greider, con
permiso de Elsevier.
formador de sangre para producir un número suficiente de célu- de leucemia crónica. Es interesante observar que los descubri- 477
las sanguíneas durante una vida humana normal. mientos iniciales de las secuencias de DNA teloméricas y la telo-
Si los telómeros son un factor tan importante para limitar el merasa se llevaron a cabo en Tetrahymena, la misma criatura de
número de veces que una célula puede dividirse, se podría espe- estanque unicelular explotada en el descubrimiento de las ribozi-
Chimpancé
Gorila
FIGURA 3 Translocación y evolución. Si los
dos únicos cromosomas de simios que no tie-
nen contrapartida en humanos están hipotéti-
camente fusionados, coinciden con el cromo- Orangután
soma humano número 2, banda por banda.
480
12.7 Epigenética: hay más
mación epigenética, las modificaciones covalentes al DNA son
de otro tipo. Este último tema se retoma en la página 500.
para heredar que DNA Los cambios inapropiados en el estado epigenético están aso-
ciados con numerosas enfermedades. También hay evidencia que
Como se describe en la sección 12.5, el DNA satélite α no es ne-
CAPÍTULO 12 • Control de la expresión genética