INSTITUTO POLITÉCNICO NACIONAL

UNIDAD PROFESIONAL INTERDISCIPLINARIA DE INGENIERÍA CAMPUS

GUANAJUATO
Biotecnología y
Farmacia —----------------------------------------------- 21 06 22
Extraordinario Academia Validación Academia Fecha
Unidad de aprendizaje: Ingeniería Celular Valor total exámen (puntos): 100 % de evaluación departamental: 100

Profesor: Juan Antonio Paniagua Luna Grupo: 6BM1

Alumno: Diaz Gonzalez Derek Sebastian No. Boleta: 2019660457

Sección I: Elige la respuesta correcta (valor 2 cada una)

1. En ausencia de glucosa, la proteína reguladora CRP recluta polimerasa al promotor lac, donde se somete
espontáneamente a la isomerización del complejo abierto. CRP es un ejemplo de:
a) Regulación negativa b) Activador
c) Proteína de unión al ADN de cadena sencilla d) Represor

2. La transición de la ARN polimerasa de complejo cerrado a abierto que induce cambios conformacionales
es un mecanismo llamado:
A) Unión cooperativa b) Bucle de ADN c) Allostery d) Traducción de proteínas

3. Los sitios que se acercan entre sí por medio de la flexión del ADN se llaman:
A) Bucle de ADN b) Unión cooperativa c) Allostery d) Transcripción de proteínas

4. Enzimas que hibridan ADN extraño con vectores como plásmidos.

A) Enzimas de restricción b) Polimerasas c) Helicases d) Ligasas

5. Las expresiones cinéticas biológicas son a menudo empíricas así:

A) En un modelo, no asumen una variable clave, sino que representan completamente todas las reacciones
bioquímicas.
B) Proporcionan una visión simplificada e idealizada del mecanismo biológico complejo.
C) No necesita una formulación adecuada de los mecanismos involucrados.
D) Se basan en balanzas de masa, calor, momentum y catalizadores inorgánicos.

6. Modelos que utilizan una única variable para describir la biomasa, y la población celular se trata como
un componente soluto.
A) modelo no estructurado no estructurado
b) modelo estructurado no segregado
C) modelo segregado no estructurado
d) modelo segregado estructurado

7. La construcción del modelo comienza definiendo:

A) Coeficientes de estequiometría para el sustrato
B) Coeficientes de estequiometría para el producto metabólico
C) Coeficientes de estequiometría para el componente de biomasa
D) Todo lo anterior

8. Estas variables pueden ser establecidas por el operador

1
A) Variables intermedias b) Variables de estado c) Variables operativas

9. Cantidad de biomasa formada dividida por unidad de volumen por unidad de tiempo
A) Tasa de crecimiento volumétrico b) formación volumétrica del producto c) absorción volumétrica del
sustrato

10. Si seleccionamos una región de control y descubrimos que las variables de interés no son uniformes,
entonces:
A) Seleccionar como región de control heterogénea
B) Seleccionar límites y establecer más de una región de control
C) Modelo sin región de control
D) Asumir que la región de control es homogénea

11. Una característica esencial de la ingeniería metabólica.

A) Sintetizar nuevos genes sin clonación
B) Los mismos que la ingeniería genética
C) Identificar y orientar una reacción bioquímica específica.
D) Cuantificar los flujos de material y energía fuera de la célula

12. Supongamos que usamos el mismo sustrato de entrada en diferentes cultivos con las mismas
condiciones:
A) La célula formará el mismo producto de salida utilizando diferentes enzimas
B) La célula no formará ningún producto de salida
C) La célula formará el mismo producto de salida usando las mismas enzimas.
D) La célula formará producto de salida diferente

13. Después de determinar los parámetros clave del control de flujo:

A) Se termina un experimento de flujo metabólico
B) Carga las secuencias en bases de datos
C) Se optimizan los bioprocesos
D) Implantar los cambios mediante la ingeniería genética

14. Enfoque de la ingeniería metabólica

A) Optimizar el bioprocesamiento y la ampliación
B) Optimizar las herramientas genéticas para la ingeniería genética
C) Optimizar el propio biocatalizador
D) Optimizar km y Vmax

15.- Explica qué es un motivo y ¿cómo se hace la evolución de motivos?.(4 puntos)

R= Es un elemento en la secuencia de aminoácidos, que se asocia con una función concreta. Y su evolución va en asenso de
acuerdo a la secuenciación del ADN

16.- Explica que es la dinámica de redes respecto a los TF y ¿cómo se relaciona con los TFBS.? (4 puntos)

17.- Explica que es un Gene neighbourhood y ¿cómo se le conoce en procariotas a estos conjuntos?.(4
puntos)
R= Es un par de gen que tiene como referencia una similitud topológica en el genoma de las procariotas
Sección II

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La evolución y creación de redes genéticas es una investigación que se está desarrollando donde los motivos están tomando
un especial interés en el control y desarrollo de las redes genéticas.
Realizar el modelado de un FFL incoherente de tipo 1
Consideraciones Cualquier promotor vale 10-9
Volumen del sistema en mL 1.66 x 10 -15
Cualquier interacción para la formación de un complejo 109
Cualquier TF que se utilice será degradado.
Concentración de cualquier TF 1.5 x 10 -6
Constantes de desintegración 0.00116
Cualquier constante de producción 0.5
Constante de unión de un TF a un TFSB 105
Constante de desacoplamiento de un TF en un TFSB
Constante de desacoplamiento de un complejo formado por más de un TF 10

Generar un diagrama para la producción de un producto de interés utilizando el modelado de un FFL incoherente de tipo 1
Utilizar mínimo 6 TF y relacionarlos con sus TFSB, Generar las reacciones del sistema y solo la ecuación de producción de su
producto de interés.(30 puntos).

Realizar la simulación en COPSI teniendo en cuenta las indicaciones y los valores colocados (30 puntos)
Dejar el archivo solo con las gráficas de los productos de interés para que funcione su sistema y las concentraciones de cada
producto. (30 puntos)