CODIGO GENETICO

¿Qué mecanismo tiene la célula para poder traducir un lenguaje escrito en nucleótidos a
otro escrito en aa?
Esta traducción se lleva a cabo en un centro de traducción denominado ribosomas.
Los ribosomas son ribo nucleoproteínas grandes que están en el citosol. También están en
procariotas, en mitocondrias y cloroplastos.
Se dedican a la síntesis de proteínas utilizando como información el ARN.
 Siempre se traduce en una única dirección. Es decir,
de ARN o ácidos nucleicos o nucleótidos a proteínas o
aa. Nunca se traduce al revés.
Este código nos dice que un conjunto de tres
nucleótidos se denomina codón o triplete.
Un codón es un conjunto de tres nucleótidos. Cada
codón en nuestro código representa un aa.
Combinaciones de tres nucleótidos diferentes pueden
representar un mismo aa.
Hay aminoácidos que están representados por más de un codón y otros por un único codón.
En total todas las combinaciones posibles de un nucleótido representan 64 codones. De esos 64 hay tres
que están en rojo, estos son codones de terminación.
Estos codones de stop son codones que no representan ni codifican ningún aa.
De los 64 posibles codones que existen solo 61 codifican algún aa.
Estos codones de stop cuando aparecen en la secuencia de un ARN simbolizan una detención porque
cuando el ribosoma los encuentra se detiene en esos codones.
Los aminoácidos que necesitamos para sintetizar una proteína; la síntesis ocurre en ribosomas,
generalmente se encuentran en un pool de aa que están ubicados en el citosol de la célula. Estos aa
que están en el pool en el citosol de la célula son transportados hasta el ribosoma gracias a otro tipo de
ARN (ARNt) que se dedican a cumplir esa tarea.
Se unen a un aa especifico y lo transportan al ribosoma para la síntesis de proteína.
Los ARNt tienen una secuencia complementaria a cada uno de estos codones, que sería anticodón por lo
tanto debería haber 61 ARNt. Pero hay aproximadamente 30 ARNt diferentes y estos llevan los 20 aa a
la síntesis de proteínas y adaptarse a los 61 codones del código genético.
La unión entre el ARNm y el ARNt no es exacta porque va a haber codones y anticodones apareados
que no encajan perfectamente y esto se llama degeneración del código genético.
Cuando un codón se aparea con un anticodón y no lo hace de manera exacta es una degeneración del
código genético.
El termino sinónimos se refiere que un aa puede ser codificado por varios codones.
En el caso de la leucina es uno de los que mayor cantidad de codones lo codifican. Estos codones son
sinónimos entre sí.
Por lo tanto, el termino de degeneración del código genético hace referencia a que el sistema funciona
con menos ARNt del que esperaríamos porque hay menos anticodones que codones y también muchos
codones simbolizan lo mismo como en el caso de la leucina.
Uno de los que solo tiene un único codón y no tiene sinónimos es el de la metionina. Lo mismo para
triptófano.
Los codones de stop se pueden decir que también son sinónimos
En los ARNm existe un conjunto de tres nucleótidos (codón) que simboliza un aa o varios (si son
sinónimos)
Este codón tiene que ser reconocido por una secuencia complementaria llamada anticodón. Es
decir que, si en el ARNm tengo AUG, en el anticodón debería tener UAC y esto traducido en aa
siempre es metionina. Así se verifica un apareamiento exacto entre el codón y el anticodón.
Cuando hay una degeneración del código genético hay ciertos codones que no se aparean de
manera exacta con los anticodones.
Esto se debe a que hay una especie de bamboleo que se verifica a nivel molecular que permite
que el apareamiento no sea completamente exacto.

El tercer nucleótido del codón (pintado

de verde abajo) Siempre el primer
nucleótido de un codón se lo describe
en dirección 5' a 3' por lo tanto en la
diapositiva como el 5' esta hacia la
derecha el tercer nucleótido de este
codón es el que está pintado en verde
más fuerte (guanina). Ese es el tercer
nucleótido del codón del ARNm y ese
varia generalmente entre sinónimos.
En el caso de las posibilidades para leucina, en dos casos comienza con uracilo y en los otros cuatro
casos con citosina. De los que comienzan con uracilo el segundo nucleótido siempre es uracilo y el
que varía es el último nucleótido (A o G) mientras que los que comienzan con citosina siempre el
segundo nucleótido es uracilo y varía el tercer nucleótido.
En el caso de prolina, siempre el primer nucleótido es citosina, el segundo es igual y varía el tercer
nucleótido.
Entonces en el tercer nucleótido del ARNm esta la variación. Existe la posibilidad de una variación.
El tercer nucleótido del codón se aparea con el primer nucleótido del anticodón.

El primer nucleótido del codón es ADENINA y el primero del anticodón es CITOSINA.

Siempre la variación se verifica en el tercer nucleótido del codón (Guanina) el cual se aparea con el
primer nucleótido del anticodón.
En ese apareamiento es donde hay una cierta libertad porque varios codones que son sinónimos
entre si son reconocidos por un mismo anticodón. En este caso de metionina no lo necesita porque
es un codón con un anticodón, pero en el caso de la leucina existe la capacidad de que un anticodón
reconozca varios codones distintos.

Generalmente si los dos primeros nucleótidos del codón han sido reconocidos, no es
suficiente hace falta más para que se aparee ARNm con ARNt.
Siempre el que varía dentro de la secuencia es el tercero del codón.
En la diapositiva sale Leucina el codón es GUC y el anticodón es CAG. Acá hay un
apareamiento exacto, pero en el del lado es CUC y el anticodón GAG que también va a
reconocer ese codón.
Los sinónimos varían entre la A Y G o C Y U.
Por ejemplo: Glutamina, el tercer nucleótido varía entre A Y G. En aspartato entre C y U.
Esto quiere decir que estos los codones que son iguales en los dos primeros nucleótidos,
en el tercer nucleótido varia.
 En el primer esquema
hay una equivalencia
exacta entre codón y
anticodón, pero en el
esquema del costado el
mismo anticodón se
aparea con otro codón
AGG y el primer
nucleótido del anticodón
sigue siendo U.
El tercer codón que son
los que tienen
equivalencia (A y G)
siempre va a ser
reconocido por U (el
primer nucleótido del
anticodón)

Abajo otro ejemplo con un nucleótido distinto en el tercer codón y se aparean todos con un mismo
nucleótido en la primera posición del anticodón I (inosina).
La inosina es un nucleótido precursor dentro de la síntesis de ac nucleicos. Es una base nitrogenada
precursora de pirimidinas. A partir de la inosina se generan las bases nitrogenadas pirimidínicas.
Lo que tiene el ARNt es que habitualmente su secuencia de nucleótidos aparece bases nitrogenadas
que no son tan comunes dentro de las secuencias conocidas de ac nucleicos, acá pueden aparecer
hipoxantina, pseudouridina que son comunes que aparezcan dentro de las secuencias de ARNt.
La capacidad que tiene el ARNt que a partir de un mismo nucleótido en la primera posición del
anticodón que se pueda reconocer distintos nucleótidos en la tercera posición del codón, le llaman
bamboleo.
 Cuando se analiza la disposición de las bases nitrogenadas, dentro de lo que es el ARNt en 3D
se forma L invertida donde el extremo 3 aceptor pose el aa y la otra punta posee el anticodón.
Si se amplía la región del anticodón vemos que esta el anticodón. La 34 es el primer base, 35
segunda y 36 tercera. La que normalmente genera el bamboleo es el nucleótido núm. 34, así
se genera un apareamiento que no es exacto pero que aún así permite que un codón codifique
al mismo aa que está arriba (en el extremo 3' aceptor) gracias al sistema de sinónimos que
vimos.
El bamboleo explica a nivel molecular la degeneración del código genético.
NO INTERESA VER EL DETALLE DE COMO SE DA EL BAMBOLEO.

Se ha visto que el código genético está diseñado de un modo tal que se puedan reducir los efectos
de algunas mutaciones.
Cuando hay un cambio de bases pirimidínicas (mutaciones génicas) un tipo de mutación son las
transiciones cuando cambio una base pirimidínica por otra pirimidínica.
Las bases pirimidínicas que están en la 2 posición del codón codifican aa hidrofóbicos casi siempre.
Entonces si cambio una base pirimidínica C por U, aunque pueda cambiar el aa, el aa presenta la
misma característica o sea hidrofóbico y se comporta de una forma similar dentro de la cadena
peptídica como lo haría el aa original, o sea tendera a ir hacia dentro en la molécula de proteína para
no interaccionar con el agua.
Si en la segunda posición hay una base púrica generalmente los aa que codifican esos codones son
aa polares, estos son más hidrofílicos por lo tanto si en la mutación una A cambia por G siempre va a
tender a codificar un aa con comportamiento polar y dentro de la cadena peptídica se va a comportar
de manera similar.
Este mecanismo está diseñado para disminuir o amortiguar el efecto de mutaciones en esa posición
del codón.
El código genético se describió hace más de 50 años. Lo primero que se pudo establecer es que el
ARNt que transporta al aa necesitaba reconocer tres nucleótidos dentro del ARNm para dejar un aa y
eso se logró gracias a que artificialmente se pudieron crear ARNm con secuencias específicas de
nucleótidos y lo que hicieron los científicos es crear cada vez ARNm más largos. Cuando pusieron
tres nucleótidos lograron que un ARNt se una dentro del ribosoma y deje el aa transportado.
Esta fue la demostración científica o molecular de que existía un código genético que estaba
diseñado por codones de tres nucleótidos.
A pesar de que los científicos podían generar ARNm de tres nucleótidos esto no era suficiente para
saber cómo era la combinación de codones y anticodones.
Cuando las técnicas fueron más efectivas se sintetizaron ARNm con secuencias más definidas donde
se generan codones que pueden ser CUC o UCU. A medida que se iban fabricando ARNm con
distinta secuencia iban viendo qué tipo de polímeros peptídicos se fabricaban y así se diseñó el
código genético.
Básicamente se comenzó por lo más simple con un ARNm con el mismo nucleótido, por ej. (AAA) o
(CCC) cuando tenían mensajeros de ese tipo se sintetizaban proteínas con el mismo aminoácido.
Entonces a partir de ahí se dedujo como trabajaba el código genético. Esto se comprobó
experimentalmente de que el código genético estaba especificado en tres nucleótidos y que estos
simbolizaban un aa especifico.
En la actualidad se pueden crear ARNm con secuencias complejas de nucleótidos que codifican
proteínas complejas.
 Para que el código genético
funcione implica el cumplimiento de
tres reglas que se deben respetar.
Siempre la lectura del mensajero
se va a producir en dirección 5' a 3'
por lo tanto el apareamiento de los
anticodones es de 3' a 5'
Los codones son continuos no
hay espacio entre ellos. No existen
nucleótidos sueltos entre codón y
codón.
La información se lee a partir de
un solo marco de lectura.

Considerando esa secuencia de nucleótidos en un ARNm se puede decir que AUG representa un
codón y los que siguen igual hasta el final. Eso sería un marco de lectura.
Pero si el primer codón se toma desde UGG se observa que el marco de lectura cambia.
También se puede tomar como primer codón GGC por lo tanto ese sería un tercer marco de
lectura.
Si analizo el primer codón del primer marco de lectura es AUG.
Si analizo el segundo es UGG, si analizo el codón del tercer marco de lectura es GGC.
El codón del primer marco de lectura codifica Metionina, el segundo triptófano y el primero del
tercer marco de lectura codifica glicina. Es decir que según el marco de lectura que elija el aa
cambia y genera una combinación de aa diferente que afecta a la función de la proteína.
Para saber cuál de los tres marcos de lectura tengo que usar tengo que reconocer cual es el
codón de inicio. Ese le da la pauta al ribosoma para saber cuál de sus tres marcos de lectura
tiene que usar. En la síntesis de un ARN el codón de inicio siempre es AUG.
Es decir que puedo asegurar que al comienzo todas las proteínas tienen el mismo aa que es
metionina, en el extremo N terminal. Esto se cumple tanto procariotas como eucariotas.
El código genético está diseñado de tal forma que puede minimizar el efecto de una mutación en la
segunda posición de los tres nucleótidos cuando la mutación es una transición y ocurre en la segunda
posición. Esto se minimiza porque los nucleótidos que tengan bases púricas codifican casi siempre aa
polares mientras que los codones que tengan nucleótidos con bases pirimidinas en la segunda posición
codifican aa hidrofóbicos por lo tanto cuando hay una transición en la segunda del mensajero el
efecto es menor.
No es lo mismo que en la secuencia original haya un hidrofóbico y aparezca uno hidrofílico. El
plegamiento va a cambiar y eso afecta en la función y propiedades de la proteína.
Las mutaciones afectan al código genético. Aunque sabemos que se dan en el ADN las más
importantes y se traspasan de una generación a otra.
Existen errores en la síntesis de ARNm, no es un proceso exacto como en la replicación, pero las
mutaciones especificas se producen en el ADN que son las que se transmiten de generación en
generación.
Hay dos tipos de mutaciones. Tiene que ver con la extensión o tamaño del número de nucleótidos que
afecta o incluso cromosomas enteros.
Las mutaciones puntuales afectan a nucleótidos puntuales.
Estas son las que a través del cambio de un nucleótido puede afectar de manera drástica el codón
porque como estos están unidos de manera continua la aparición de un nuevo nucleótido puede
cambiar el marco de lectura.
Estamos hablando del efecto que produce la mutación. Estas se pueden dividir en tres grupos
El efecto de la mutación cambia un único aa por otro esto se llama mutación de sentido erróneo
Mutaciones sin sentido las cuales provocan la aparición de un codón de stop que no estaba antes
en esa posición y tiene como efecto que cuando el ribosoma llega a ese codón la síntesis termina.
Mutación por cambio de lectura Estas son con las del 2 grupo las más graves porque pueden
alterar mucho la secuencia de la proteína. Estas se pueden dar por inserción o perdida de un
nucleótido. Se corre y se mueve todo el marco de lectura.
 A partir de esta secuencia de
nucleótidos el primer codón codifica
metionina, el segundo fenilalanina, el
tercero serina y el ultimo significa
tirosina.
El primer tipo de mutación según el
efecto que producen puede ser una
mutación sin sentido donde cambio
por ejemplo el primer nucleótido del
segundo codón por adenina. Entonces
en vez de ser CUC ahora es AUC y va
a estar codificando otro aa
(isoleucina).
Esto corresponde a una mutación sin
sentido.

Si en el último codón se
produce una mutación por
ejemplo cambia el primer
nucleótido de A por U el
nuevo codón que se forma
es UAG y este codón es de
stop por lo tanto la proteína
se corta en ese codón.

En la secuencia original la secuencia de aa continua hacia la derecha, pero en la secuencia mutada

se detiene ahí. Este es el segundo tipo de mutación que genera codones de terminación.

Mutación de cambio de marco de lectura: Sobre la secuencia original, la mutación se puede dar por la
inserción o deleción de un nucleótido o de varios. Mientras no sean múltiplos de 3 el cambio de
marco de lectura se verifica. Es decir que, si agrego un nucleótido o dos el marco de lectura cambia,
pero si agrego tres el marco de lectura se vuelve a recuperar luego de la última mutación.
Si saco un nucleótido o dos nucleótidos el marco de lectura cambia, pero si saco tres el marco de lectura
se vuelve a recuperar es decir que el marco de lectura luego de la mutación se vuelve a recuperar.
Si saco la G del primer codón el marco de lectura cambia, el primer codón seria AUC y así
sucesivamente.
Las mutaciones que producen cambios en el marco de lectura son las más complejas y que mayores
consecuencias graves tienen porque allí cambia toda la proteína a partir de la mutación., desde el punto
que se produce la mutación hacia el extremo N terminal puede ser todo igual, pero a partir de la
mutación todo cambia y la proteína se convierte en otra proteína. Incluso podría aparecer un codón de
stop y provocar que la síntesis de proteína cese antes de lo normal.

En determinadas ocasionas (raras) una segunda mutación puede revertir el efecto de una primera
mutación y ahí aparecen estos dos tupos de mutaciones:

Mutaciones inversas: cuando se produce la segunda mutación la secuencia retorna al estado

original es decir que si la primera mutación fue un cambio de A por C la segunda mutación se produce
en el mismo sitio y se cambia C por A y vuelve a la secuencia original. Estas son muy difíciles de
descubrir porque no voy a notar el cambio de secuencia si la segunda mutación me retorna a la
secuencia original. El tiempo que demora entre la primera y segunda mutación pueden ser años o siglos.
Mutaciones supresoras: no revierten la secuencia al estado original pero el efecto de esta
segunda mutación provoca que el gen o la proteína recupere su actividad normal es decir que vuelva a
trabajar de manera normal. esto se puede conseguir con una mutación supresora en el mismo gen
(intragenica) o a partir de una mutación supresora en otro gen (intergenica) que de manera
complementaria trabaja con la proteína que tiene la primera mutación y provoca un efecto que
minimiza la alteración de la primera proteína.
Dos tipos de mutaciones que revierten o minimizan el efecto de una primera mutación (mutación
inversa) que retorna a la condición original y las mutaciones supresoras que provocan que la proteína
que se sintetizo vuelva a tener la misma actividad de la original.
Mutación supresora intragenica (ocurre en el mismo gen)
Hay una deleción de un nucleótido durante la replicación. Cuando se inserta o saca un nucleótido
de la secuencia se corre el marco de lectura. A partir de esta deleción tengo un ADN mutante que
codifica un ARNm distinto al original. Ese ARNm a partir de ese punto cambia su marco de lectura
(naranja cambio de aa) a cierta distancia aparece un codón de stop que provoca que el ribosoma
termine la síntesis de manera abrupta allí. La última parte de los aa no son los que deberían estar
y faltan aa en la secuencia.
Para revertir esto, a partir del ADN mutante en otro lugar o muy cercano al lugar de la mutación se
produce la INSERCION de un nucleótido (en la primera mutación era una perdida) para recuperar
el marco de lectura y la mutación va a tener efecto en términos de aa y corrige el marco de
lectura, pero si la segunda mutación ocurre muy lejos de la primera todavía entre una mutación y
otra va a existir un corrimiento de marco de lectura erróneo que codifica aa diferentes.
Si en el mismo punto donde se perdió el nucleótido vuelvo a insertar la mutación y sería una
mutación inversa que retorna la secuencia a la original.
Mutación supresora intergenica: dos genes. Un gen mutante que produce un codón sin sentido porque
ahí aparece un codón de stop UAG en medio de lo que sería la secuencia de la proteína. El ribosoma
ahí va a detener.
Una segunda mutación no en el mismo lugar, en otro gen. Acá el que se muta es el gen que codifica
el ARNt porque todos están codificados en el ADN. Esta mutación cambia el anticodón y ahora lo que
era codón de stop puede ser leído por el ARNt y en esa posición va a agregar un aa en este caso
tirosina. No necesita ser el mismo aa que se codifica originalmente, mientras sea un aa el ribosoma va
a poder continuar con la síntesis de proteína a pesar de que ahí hay un codón de stop y el efecto va
a ser menor que si allí permaneciera el codón de stop.
Este es un ejemplo de mutación supresora intergenica. porque la mutación se está produciendo en el
ADN que codifica el ARNt.
Si esto ocurre en un ARNt único para un determinado aa esto trae consecuencias graves porque este
ARNt estaría poniendo aa erróneos en todos los codones de todas las proteínas que se sinteticen.
Pero generalmente hay varios genes para un mismo ARNt en el ADN así que como están repetidos
esos genes, que cambie uno no altera en gran medida el efecto total de ese ARNt.
Por lo tanto, si la mutación ocurre en uno de esos genes que codifican ese ARNt va a haber otros
genes alternativos para ese mismo ARNt que lo van a sustituir y van a poner el aa original. La
mutación va a afectar solo a los ARNt que se codifiquen a partir del gen mutado mientras que los
otros genes de ese mismo ARNt que están repetidos en el genoma van a seguir codificando el ARNt
original y el efecto se va a minimizar y no se va a multiplicar en todos los ARNt solamente el que
esta mutado en ese gen.
Dentro de las mitocondrias hay un código genético específico
para mitocondrias donde hay ciertas variantes. Por ejemplo,
hay 4 codones de stop en vez de 3 como en el normal.
Dentro de la mitocondria esta su genoma, su propio ARN y sus
propios ribosomas, de la misma manera que cloroplastos.
Existen algunas diferencias sutiles entre códigos genéticos de
eucariotas y procariotas.
Pero es evidente que el código genético es universal.