RESULTADOS-PRACTICA-1.

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Análisis Biómico

3º Grado en Biotecnología

Facultad de Ciencias Experimentales

Universidad Pablo de Olavide

Reservados todos los derechos.

No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
 Análisis Biómico 2022-23
Cuadernillo de Resultados de Prácticas

RESULTADOS PRÁCTICA 1
Nombre: Guadalupe
Apellidos: Estrella Guisado

1- ¿Hay algún spot que no se haya identificado bien?

Sí, el spot 10 debido a que solo se tomarán como significativas aquellas que tengan una puntuación mayor a 70
no existiendo dicha. La puntuación máxima que tiene una de las proteínas de la base de datos que coincide es
50, y no se podrá tener en cuenta.

2- ¿Se puede saber qué ruta utiliza TFB para degradar el ftalato hasta protocatecutao? ¿La que dioxigena
los carbonos 3 y 4 o la que dioxigena los carbonos 4 y 5?

Sí, tal y como se observa en el spot 5 la enzima 3,4-dihidroxi-3,4-dihidroftalato deshidrogena es la segunda con
más puntuación. Su valor es de 147, siendo significativo porque se tendrán en cuenta aquellas que tengan una
puntuación mayor a 76. Si observamos la ruta de degradación de ftalato hasta protocatecuato, nos daremos
cuenta que esta enzima participa dioxigenando los carbonos 3 y 4.

3- ¿Qué ruta usa TFB para degradar el protocatecuato? ¿La intradiólica o la extradiólica?

TFB para degradar el protocatecuato utiliza la ruta intradiolica debido a que tanto en el spot 6 como el 9
aparecen dos enzimas que pertenecen a dicha. En el caso del 6 observaremos la 3-oxoácida CoA transferasa 1
y en el 9 la 3-oxoadipil CoA tiolasa, ambas con puntuaciones superheroes a las significativas.

4- ¿Podemos saber a qué tipo de dioxigenasa pertenece la proteína identificada en el spot 3? Truco: Haz
un BlastP con las secuencias de los péptidos que propone Mascot.

Realizaremos un BlastP con las correspondientes secuencias de los péptidos, FATEHAWTEDPPSR y

TQRIGESLPFDDALHLQAHR. De esta forma podremos saber de que tipo será fácilmente (Figura 1)

Figura 1

Concluyendo que el tipo de la dioxigenasa en el punto 3 es ftalato 3,4-dioxigenasa.

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