PLV6.

Estudio teórico de corte con enzimas de restricción

Nombre: Shaelquy Vibian Aranzabal Guzman
Código: 161535

Enzimas de restricción:
Enzima Secuancia diana

Hae III 5’…GG/CC…3’

SacI 5’…GAGCT/C…3’

RsaI 5’…CCATC/N…3’

Secuencias:

1) JX122566.1
2) LN995453
3) X87218
4) DQ019935

Motivo1.

JX122566.1 Halobacillus litoralis

Sitio de corte de la enzima HaeIII

Secuencia de corte: GG/CC

N° de sitios de corte: 6

N° de fragmentos generados: 7
Tamaño de los fragmentos generados:
Número de corte Tamaño de
fragmento

1 13

2 184

3 75

4 22

5 570

6 34

7 458

8 129

Motivo2.
Sitio de corte de la enzima Sac I

Secuencia de corte: GAGCT/C

(GAGCTC) N° de sitios de corte:
Sequence "CTCGAG" Not Found -
Check search strands
N° de fragmentos generados: NO existe

Tamaño de los fragmentos generados:

Motivo3.
Sitio de corte de la enzima xho i

Secuencia de corte: C/TCGAG

(CTCGAG) N° de sitios de corte:
Sequence "GAGCTC" Not Found -
Check search strands
N° de fragmentos generados: No existe

Tamaño de los fragmentos generados: No existe

Motivo 4.
Sitio de corte de la enzima Rsa I

Secuencia de corte: CCATC/N

(CCATCN) N° de sitios de corte: 4
N° de fragmentos generados: 5

Tamaño de los fragmentos generados:

Número de corte Tamaño de
fragmento

1 237

2 24

3 976

4 270

LN995453 Halomonas caseinilytica

Motivo1.
Sitio de corte de la enzima HaeIII

Secuencia de corte: GG/CC

N° de sitios de corte: 6

N° de fragmentos generados: 7

Tamaño de los fragmentos generados:

Número de corte Tamaño de

fragmento

1 273
 2 85

3 317

4 172

5 34

6 96

Motivo2.
Sitio de corte de la enzima Sac I

Secuencia de corte: GAGCT/C

(GAGCTC)

N° de sitios de corte: Sequence

"CTCGAG" Not Found - Check
search strands
N° de fragmentos generados: NO existe

Tamaño de los fragmentos generados:

Motivo3.
Sitio de corte de la enzima xho i

Secuencia de corte: C/TCGAG

(CTCGAG)

N° de sitios de corte: 2
N° de fragmentos generados: 3

Tamaño de los fragmentos generados:

 Número de corte Tamaño de
fragmento

1 782

2 184

Motivo 4.
Sitio de corte de la enzima Rsa I

Secuencia de corte: CCATC/N

(CCATCN)

N° de sitios de corte: 3
N° de fragmentos generados: 4

Tamaño de los fragmentos generados:

Número de corte Tamaño de

fragmento

1 787

2 173

3 6

X87218 Halomonas eurihalina

Motivo1.
Sitio de corte de la enzima HaeIII

Secuencia de corte: GG/CC

N° de sitios de corte: 10

N° de fragmentos generados: 11

Tamaño de los fragmentos generados:

 Número de corte Tamaño de
fragmento

1 19

2 284

3 85

4 317

5 161

6 34

7 278

8 35

9 145

10 115

Motivo2.
Sitio de corte de la enzima Sac I

Secuencia de corte: GAGCT/C

(GAGCTC)

N° de sitios de corte: Sequence

"CTCGAG" Not Found - Check
search strands
N° de fragmentos generados: NO existe

Tamaño de los fragmentos generados: Not Found - Check search

strands
Motivo3.
Sitio de corte de la enzima xho i

Secuencia de corte: C/TCGAG

(CTCGAG)

N° de sitios de corte : 2
N° de fragmentos generados: 3

Tamaño de los fragmentos generados:

Número de corte Tamaño de

fragmento

1 812

2 660

Motivo 4.
Sitio de corte de la enzima Rsa I

Secuencia de corte: CCATC/N

(CCATCN) N° de sitios de corte:
Not Found - Check search strands
N° de fragmentos generados: Not Found - Check search strands

Tamaño de los fragmentos generados: no existe

DQ019935 Salicola marasensis

Motivo1.
Sitio de corte de la enzima HaeIII
Secuencia de corte: GG/CC
N° de sitios de corte: 10
N° de fragmentos generados: 11
Tamaño de los fragmentos generados:
 Número de corte Tamaño de fragmento

1 39

2 30

3 144

4 100

5 85

6 54

7 423

8 34

9 129

10 149

11 9

12 171

13 123

Motivo2.
Sitio de corte de la enzima Sac I
Secuencia de corte: GAGCT/C (GAGCTC)
N° de sitios de corte: Sequence "CTCGAG" Not Found - Check
search strands
N° de fragmentos generados: NO existe
Tamaño de los fragmentos generados: Not Found - Check search
strands

Motivo3.
Sitio de corte de la enzima xho i
Secuencia de corte: C/TCGAG (CTCGAG)
N° de sitios de corte : no existe

N° de fragmentos generados: Not Found - Check search strands

Tamaño de los fragmentos generados: Not Found - Check search
strands

Motivo 4.
Sitio de corte de la enzima Rsa I
Secuencia de corte: CCATC/N (CCATCN)
N° de sitios de corte: 2
N° de fragmentos generados: 3
Tamaño de los fragmentos generados:

Número de corte Tamaño de

fragmento

1 212

2 1279