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TRADUCCIN
INTRODUCCIN
El ltimo paso en el flujo de la informacin gentica es el proceso de sntesis de protenas, de-
nominado traduccin. A travs de este proceso la informacin almacenada en los cidos nuclei-
cos, especficamente en el ARN mensajero, permite la construccin de las protenas.
En este complejo proceso biosinttico intervienen ms de 300 molculas, muchas de ellas orga-
nizadas de manera precisa en el ribosoma. Su coordinacin debe ser muy estrecha para poder
desarrollar las correspondientes reacciones a una elevadsima velocidad (en Escherichia coli, un
polipptido de 100 aminocidos se sintetiza en tan slo 5 segundos). Debido a la gran variedad y
al gran nmero (millares) de protenas distintas que necesita la clula, se requiere una gran do-
tacin de recursos materiales y energticos para esta ruta metablica. Se ha estimado que la
sntesis proteica consume alrededor del 90% del total de energa que la clula destina a sus ru-
tas biosintticas, lo que da una idea de la magnitud e importancia de este proceso.
Genetic Code Chart ( NIH).
La secuencia de aminocidos de una protena ha de provenir de la informacin almacenada en la
secuencia de bases de los cidos nucleicos, en concreto en la secuencia del ARNm. Esta informa-
cin escrita en un lenguaje de cuatro letras, las bases nitrogenadas (A, G, C, T), debe ser tradu-
cida a un lenguaje diferente, un lenguaje que se sustenta en 20 aminocidos. La relacin exis-
tente entre ambos lenguajes se conoce como cdigo gentico, y sirve, a manera de dicciona-
rio para pasar de uno a otro. La secuencia de bases del ARN mensajero es quien determina la
secuencia aminoacdica, y la utilizada, por consiguiente, para la descripcin del cdigo.
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CDIGO GENTICO
El Cdigo est formado por un grupo de tres bases nitrogenadas (triplete) o codones (unida-
des de codificacin), cuya presencia en la cadena polinucleotdica del ARNm codifica o da lugar
a la presencia de un aminocido en la cadena polipeptdica. Si la correspondencia se estable-
ciese entre una base y un aminocido, o lo que es lo mismo, si cada base codificase un amino-
cido, al existir slo cuatro bases tan slo podran encontrarse cuatro aminocidos; si se com-
binasen dos bases para cada aminocido, se podra hacer una correspondencia entre las dieci-
sis combinaciones de bases (4
2
) con diecisis aminocidos. La existencia de veinte aminoci-
dos indica que son necesarias al menos combinaciones de tres bases para codificar un amino-
cido. Los experimentos genticos confirmaron que un grupo de tres bases codifica un amino-
cido, existiendo por lo tanto, 64 tripletes o codones (4
3
combinaciones posibles) que constitu-
yen las palabras del cido nucleico.
Caractersticas principales del Cdigo Gentico
La secuencia de codones y el ordenamiento de los mismos en la molcula de ARNm, es la clave
de la organizacin de la informacin gentica que especifica una protena. Se hallan en el cdigo
una serie de cualidades, que justifican el procedimiento de lectura y traduccin de la informacin
escrita bajo la forma de secuencia de bases.
1) Existen 64 codones, de los que 61 codifican aminocidos y tres son seales para la termi-
nacin de la cadena. Comparados con el nmero existente de aminocidos, que es bastante
menor, se deduce que muchos aminocidos estn codificados por ms de un triplete. Basn-
dose en esta caracterstica, se dice que el cdigo es degenerado. Un aminocido concreto
puede ser especificado por ms de un codn. Existe una correlacin directa entre el nmero
de codones que tiene cada aminocido con su frecuencia de aparicin en las protenas.
2) Los codones que especifican al mismo aminocido se les denomina sinnimos.
Normalmente los sinnimos comparten las dos primeras bases del triplete o codn, siendo la
tercera base del triplete la menos importante (UC codifica serina, independientemente de
cual sea la tercera base UCU, UCC, UCA, UCG).
3) Cada codn o triplete slo codifica un aminocido, se dice que el cdigo no presenta ambige-
dad (UCU slo codifica el aminocido serina, ningn otro aminocido dispone de este codn).
4) El cdigo tiene codones que no codifican aminocidos. Estos codones tienen funciones espe-
ciales, uno de ellos es el triplete de iniciacin, AUG. Este codn no slo marca el inicio de la
sntesis proteica, en eucariotas y en procariotas, sino que tambin codifica metionina cuando
est situado en el interior de la secuencia polinucleotdica. En procariotas, esta seal de ini-
ciacin marca el primer aminocido que es un derivado de la metionina, la formil-metionina.
Existen, adems, tres tripletes o codones de terminacin, que son UAA, UAG y UGA, que
marcan el final de la sntesis de la cadena peptdica. Son denominados codones de detencin
o codones sin sentido.
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5) El cdigo es continuo, los tripletes son traducidos uno tras otro de forma secuencial y
continua sin solaparse las bases de uno con otro, y sin dejar bases intermedias que no
pertenezcan a ningn triplete. Se dice que no hay comas o huecos, ni yuxtaposiciones
entre las bases. La direccin de lectura es fija del extremo 5' del ARNm al extremo 3'.
6) El cdigo es prcticamente universal; desde virus y bacterias hasta organismos superio-
res utilizan el mismo cdigo. Sin embargo, ha de puntualizarse que las mitocondrias pre-
sentan un cdigo ligeramente distinto.
SNTESIS DE PROTENAS
Para realizar el proceso biosinttico se requiere que estn presentes en el citoplasma celular
los veinte aminocidos proteicos, el conjunto de 300 molculas que se mencionaron en la in-
troduccin y el suministro energtico adecuado en forma de ATP. De todos los elementos que
participan, se van a detallar previamente dos de ellos; el primero es una agrupacin de mol-
culas que forma un orgnulo celular: el ribosoma; y el segundo, es una molcula de cido ribo-
nucleico, el ARNt, que funciona como adaptador en el proceso de traduccin.
Estudio del ribosoma
Una clula de Escherichia coli posee unos
15.000 o ms ribosomas, formados por un
35% de protenas y un 65% de ARNr. Las pro-
tenas y el ARN ribosmico se ensamblan en
dos subunidades de diferente tamao, la ma-
yor denominada 50S y la menor 30S, que for-
man conjuntamente un ribosoma de 70S. Las
diferentes molculas de ARN forman una es-
tructura espacial a manera de armazn, soste-
nida por enlaces entre cadenas, en dicha estructura se asientan las distintas protenas. Los riboso-
mas eucariticos son ms grandes 80S y ms complejos que los descritos de procariotas. Estn
formados por dos subunidades de 60S y 40S.
Las dos subunidades ribosmicas presentan una extraa morfologa, al acoplarse forman una
hendidura a travs de la cual pasa el ARNm segn se desplaza el ribosoma a lo largo del mis-
mo. De la hendidura se origina, tambin, la cadena polipeptdica recin sintetizada.
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Estudio de los ARN transferentes
La estructura del ARNt determina su fun-
cin de adaptador en el proceso de sn-
tesis proteica. Por una regin de su mol-
cula se une a un codn especfico de la
molcula de ARNm, y por otra al amino-
cido especfico para este codn. De esta
forma, los aminocidos quedan alineados
de acuerdo con la secuencia de codones
del ARNm. Cada uno de los veinte amino-
cidos tiene, como mnimo, un tipo de
ARNt asignado aunque la mayora de los
aminocidos tienen varios. Adems de
esta funcin de adaptador, tambin des-
arrolla una segunda funcin consistente
en activar el aminocido a travs de un
enlace rico en energa entre el extremo
carboxilo del aminocido y el ARNt.
Son molculas pequeas de las que exis-
ten al menos 32 variedades distintas, in-
cluso en algunas clulas ms, con una serie de caractersticas comunes:
1) Presentan bases modificadas en al menos ocho de sus nucletidos.
2) Su extremo 5' suele llevar una guanina, mientras que su extremo 3' lleva una secuencia fi-
ja de CCA.
3) El brazo AA o aminoacdico es el punto de unin del aminocido. A travs del grupo carbo-
xilo del aminocido se forma un enlace ster con el C 2' o 3' de la adenosina situada en el
extremo 3' del ARNt.
4) El brazo del anticodn contiene la secuencia de tres bases complementaria y antiparalela
del codn. La interaccin codn-anticodn se realiza por apareamiento antiparalelo, me-
diante la formacin de puentes de hidrgeno entre las bases complementarias del ARNm y
del ARNt. La relacin codn-anticodn presenta una caracterstica que se conoce con el
nombre de hiptesis de balanceo. En esta relacin se observa que la parte ms especfica
del codn la forman las dos primeras bases, debido a que es a travs de las mismas como
se enlazan ms fuertemente el triplete del codn con el del anticodn. La tercera base (de
balanceo) del codn contribuye a la especificidad, pero al unirse ms dbilmente facilita la
rpida separacin entre ambos, incrementando la velocidad de la sntesis proteica. Para tra-
ducir los 61 codones no se necesitan 61 ARNt sino que es suficiente con un mnimo de 32.
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Fases de la sntesis proteica
1. Activacin de los aminocidos
Antes de comenzar la sntesis se necesita que los aminoci-
dos se unan a sus correspondiente ARNt, esta unin se rea-
liza con consumo energtico en el citoplasma celular. Las re-
acciones de unin estn catalizadas por 20 enzimas activa-
doras dependientes de Mg
++
, denominadas aminoacil-ARNt
sintetasas, cada una de ellas es especfica para un amino-
cido exclusivo y su o sus correspondientes ARNt. La molcu-
la formada se llama aminoacil-ARNt o complejo de
transferencia y la reaccin a travs de la que se forma es:
Aminocido + ARNt + ATP ! aminoacil-ARNt + AMP + PPi
Este paso es el ms importante en la sntesis, ya que des-
pus de unido el aminocido no se vuelve a comprobar que
sea el correcto, y su identificacin es ahora realizada nica-
mente por la secuencia anticodn que porta el ARNt.
2. Fase de inicio
Para el inicio de la sntesis proteica en procariotas se necesitan los siguientes elementos: ARNm,
el aminoacil-ARNt inicial o formilmetionina-ARNt (fMet-ARNt
fMet
), subunidades ribosmicas diso-
ciadas, un grupo de protenas denominadas factores de iniciacin (IF-1, IF-2 y IF-3), energa en
forma de GTP y Mg
++
.
La secuencia de etapas que se suceden es la siguiente:
- El factor IF-3 se une a la subunidad pequea del ribosoma impidiendo la incorporacin in-
mediata de la subunidad grande.
- El ARNm, portador de la informacin para la construccin del polipptido, se fija a la subu-
nidad ribosmica menor; esta unin es posible por la existencia de una secuencia de un-
cletidos en el extremo 5', secuencia lder, de 8 a 13 pares de bases que no es traduci-
da, pero que proporciona una correcta ubicacin a la molcula de ARNm sobre el riboso-
ma. La molcula de ARNm es traducida desde su extremo 5' hasta el extremo 3', y el poli-
pptido formado se sintetiza desde el extremo amino del primer aminocido hasta el car-
boxilo del ltimo.
- A continuacin se produce el ensamblamiento del aminoacil-ARNt iniciador que se coloca so-
bre el primer codn o AUG del ARNm. Dentro del ribosoma hay dos sitios denominados sitio
A o aminoacilo y sitio P o peptidilo, el aminoacil-ARNt se sita en el sitio P. El factor IF-2 ac-
tivado con GTP se acopla al mismo tiempo que el aminoacil-ARNt.
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- La hidrlisis del GTP y la liberacin de GDP y Pi da lugar a la liberacin de los factores de ini-
ciacin y al simultneo ensamblamiento de la subunidad grande, formndose el complejo
de iniciacin, que contiene el ribosoma completo, el ARNm y el fMet-ARNtf
Met
.
3. Fase de elongacin
La cadena polipeptdica se alar-
ga mediante la creacin de unio-
nes covalentes entre aminoci-
dos. La elongacin requiere ade-
ms del complejo de iniciacin y
los aminoacil-ARNt necesarios,
un conjunto de tres protenas ci-
toplasmticas denominadas fac-
tores de elongacin (EF-Tu, EF-
Ts y EF-G) y energa en forma
de GTP.
El segundo aminoacil-ARNt pe-
netra en el sitio A unido a EF-Tu
-GTP, la hidrlisis del GTP libera
el complejo EF-Tu-GDP que se re-
cicla a travs del factor EF-Ts.
La actividad enzimtica peptidil transferasa cataliza la formacin del enlace peptdico. A continua-
cin se produce la translocacin del ribosoma que se desplaza la distancia de un codn sobre el
ARNm. Para este movimiento se necesita la presencia del factor EF-G (o translocasa) que me-
diante la hidrlisis de otro enlace de alta energa proporcionado por el GTP permite el desliza-
miento. El ARNt ya sin aminocido se separa del sitio P, que ahora es ocupado por el dipeptidil-
ARNt, dejando el lugar A vaco para permitir la entrada del 3 aminocido y una nueva secuencia
de elongacin. El ribosoma se mueve de codn en codn a lo largo del ARNm, desde su extremo
5' hacia el extremo 3', aadiendo cada vez un aminocido a la cadena en crecimiento. La cadena
polipeptdica siempre se encuentra unida al ltimo ARNt, y esta unin garantiza que el proceso de
sntesis contine y puedan seguirse adicionando aminocidos.
4. Fase de terminacin
La presencia de cualquiera de los codones de detencin o terminacin sobre la cadena de ARNm
determina, que en ese punto, no entre ningn nuevo aminoacil-ARNt. El sitio A es ocupado por
tres protenas denominadas factores de terminacin o de liberacin (RF
1
, RF
2
y RF
3
), que se
unen especficamente a cada uno de los codones de terminacin. Esta unin provoca la hidrlisis
del enlace entre el peptidil y el ARNt, la liberacin del polipptido libre y la disociacin de las
subunidades del ribosoma.
Interaction of mRNA at the ribosomal level to produce
strings of amino acids or proteins ( DNADude).
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:
BALANCE DE LA SNTESIS PROTEICA
Si se analiza el balance energtico, la incorporacin de un aminocido a una cadena peptdica
se realiza con el siguiente consumo energtico:
2 ATP en el proceso de la activacin.
1 GTP en el proceso de inicio para colocar el aminocido.
1 GTP para la translocacin.
Se consumen cuatro enlaces de alta energa para formar un enlace peptdico, lo que supone un
gasto muy elevado. Pero ha de observarse que la formacin de un enlace peptdico no entre
aminocidos cualesquiera, sino entre aminocidos especficos, y en secuencias que contienen
no slo molculas, sino tambin informacin es un proceso costoso en energa.
La tasa de error en la traduccin es ligeramente mayor que en la replicacin (1 error por 10
4

aminocidos adicionados), pero las consecuencias no son tan relevantes, ya que la protena
errnea puede degradarse y ser eliminada. An as, la fidelidad con que se realiza la sntesis
proteica es suficientemente alta como para asegurar que en su mayora las protenas formadas
no contengan errores.
La velocidad con que se efecta la sntesis proteica es muy alta, permitiendo que la concentra-
cin de una protena determinada pueda modificarse de forma muy rpida. Adems, una mis-
ma cadena de ARNm puede ser traducida por mltiples ribosomas; stos se organizan en unas
estructuras denominadas polisomas formadas por conjuntos de 10 a 100 ribosomas unidos por
la cadena de ARNm, que a modo de hebra conectora, es traducida simultneamente por todos
los ribosomas.
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;
PLEGAMIENTO Y MADURACIN DE LA CADENA POLIPEPTDICA
Esta podra ser considerada como la ltima fase de la sntesis proteica. La cadena polipeptdica
se pliega adoptando espontneamente su conformacin nativa, debido a la formacin de todos
los enlaces de naturaleza dbil que le permiten alcanzar su forma biolgica activa. Este proce-
so puede transcurrir mientras la cadena est sin separar del ribosoma o bien una vez liberada.
En algunos casos, para alcanzar su conformacin definitiva necesitan pasar por una serie de
cambios post-traduccin. Estas modificaciones, de las cuales hay descritas ms de cien, permi-
tirn obtener una protena madura.
1) Cambios en los extremos de la cadena polipeptdica.
2) Modificaciones de las cadenas laterales de los aminocidos.
3) Unin de diferentes molculas orgnicas, glcidos en las cadenas laterales de las gluco-
protenas, grupos isoprenilo, grupos prostticos de muy diversa naturaleza.
4) Modificacin proteoltica: La ruptura o separacin de un segmento de la cadena polipept-
dica permite que algunas protenas se sinteticen en forma de precursores inactivos.
5) Eliminacin de las secuencias seal. Las protenas citoplasmticas permanecen en el lu-
gar de sntesis; mientras que las protenas que forman parte de las membranas, o estn
localizadas en los lisosomas, mitocondrias u otros orgnulos y las destinadas a la secre-
cin celular, disponen de una secuencia de aminocidos en el extremo amino denomina-
da secuencia seal. Las protenas que no permanecen en el citoplasma se forman en ri-
bosomas unidos al retculo endoplsmico. Cuando el pptido en crecimiento tiene una ca-
dena de unos 70 aminocidos y la secuencia seal, que oscila de 13 a 36 aminocidos,
est ntegramente formada, el ribosoma se fija a un complejo denominado partcula de
reconocimiento de la seal, formado por un ARN y varias protenas. El complejo se une
a un receptor especfico para l, situado en la cara externa o citoplasmtica del retculo,
pasando el polipptido a un complejo de translocacin que con consumo de ATP le intro-
duce en el interior del retculo. En la luz del retculo, una vez sintetizado completamente,
se producen los correspondientes cambios de maduracin entre los que se incluye la ac-
cin de una peptidasa que elimina la secuencia seal.
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DEGRADACIN DE LAS PROTENAS
Las protenas sintetizadas adems de
llevar seales que determinan su des-
tino geogrfico, tambin transportan
seales que determinan su vida me-
dia. En todas las clulas son degrada-
das de manera continua para que no
se acumulen si no son necesarias y
para eliminar las deterioradas o anor-
males, facilitando de esta forma la re-
serva de aminocidos suficientes para
la sntesis de novo y el recambio pro-
teico.
La degradacin es un proceso com-
plejo y bien medido, ya que la vida
media de las protenas no es unifor-
me, pudiendo ir en clulas eucariotas
desde tiempos inferiores al minuto
hasta muchas horas e incluso das.
Otro sistema que funciona en euca-
riotas es el marcaje de aquellas pro-
tenas destinadas a la eliminacin;
este proceso se realiza unindoles
una protena de 76 aminocidos, la
ubiquitina, molcula presente en to-
dos los eucariotas, que reconoce a
travs de los diferentes residuos ami-
no terminales las protenas que han
de ser degradadas y las que no.