M.C.

Rubén de Jesús Montalvo Méndez

Contacto: rmontalvom@uanl.edu.mx
Temario

• Historia del desarrollo de la biología molecular y transmisión de la

información genética
• Componentes de los ácidos nucleicos
• Estructura primaria y secundaria de los ácidos nucleicos
• Variaciones en la estructura del DNA (A, B y Z)
• Los palíndromos y la estructura H del DNA
• La condensación del DNA en los cromosomas
• Organización del genoma eucariótico
El Dogma Central de la Biología Molecular
 Transmisión de la información genética

• Dogma central de la biología molecular

Francis Crick
 Transmisión de la información genética

• Versión actualizada del dogma central de la

biología molecular

Francis Crick
 Componentes fundamentales de los ácidos
nucleicos
• Los ácidos nucleicos (DNA y RNA) están compuestos por la unión de
numerosos nucleótidos
 Componentes fundamentales de los ácidos
nucleicos
• Los ácidos nucleicos (DNA y RNA) están compuestos por la unión de
numerosos nucleótidos
 Componente ácido: Fosfatos
• El fosfato inorgánico (Pi) es la mezcla de las especies químicas resultantes
(anión, dianión o trianión) de la disociación del ácido fosfórico (H3PO4)
 Componente ácido: Fosfatos

• El fosfato inorgánico (Pi) es la mezcla de las especies químicas resultantes

(anión, dianión o trianión) de la disociación del ácido fosfórico (H3PO4)
 Componente ácido: Fosfatos

• Cuando un nucleótido forma parte de un ácido nucleico su grupo fosfato está

esterificado con dos grupos alcohol (enlace fosfodiéster)

pKa de
ionización
similar al
pKa 1
 Componente ácido: Fosfatos

• Difosfatos y trifosfatos
Trifosfato

Pirofosfato

Adenosinmonofosfato Adenosindifosfato Adenosintrifosfato

 Componente ácido: Fosfatos

• Tipos de enlaces fosfato

 Componente neutro: azúcares

• El azúcar siempre es una pentosa: Ribosa o Desoxiribosa

• La ribosa interviene en nucleósidos y nucleótidos bajo su forma más estable:
β-D-ribofuranosa
• DNA: desoxirribosa
• RNA: ribosa
 Componente básico: Bases nitrogenadas

• Moléculas heterocíclicas,
con varios átomos de
nitrógeno, formadas por
un anillo: pirimidina
 Componente básico: Bases nitrogenadas

• Moléculas heterocíclicas,
con varios átomos de
nitrógeno, formadas por
dos anillos condensados:
purina
 Componente básico: Bases nitrogenadas

• Existencia de dipolos:
• Hidrofobia:
• Disposición coplanar
de los anillos
• Tautomería
• Propiedades ácido-
base
• Absorción de luz
ultravioleta: Debida a
su carácter aromático,
con un máximo de
absorción a los 260
nm
 Estructura de los nucleósidos

• Nucleósido= Base nitrogenada + azúcar

• Nucleótido= Nucleósido - Pi
 Estructura de los nucleósidos

• Nucleósidos que
forman parte de
los ácidos
nucleicos
 Estructura de nucleótidos

• Nucleótido= nucleósido + fosfato

• Monómeros constituyentes de los
ácidos nucléicos
 Estructura de nucleótidos

• Numero y posición del

grupo fosfato: Monofosfato,
difosfato y trifosfato

• Tipo de azúcar: ribosa y

desoxirribosa

• Tipo de base nitrogenada:

Purinas y pirimidinas
Nomenclatura de nucleótidos
 Estructura primaria de los ácidos nucleicos
• Los ácidos nucleicos son los componentes del
material genético.
• Tipo de AN: DNA y RNA
• En todo tipo de células: procariotas y eucariotas
(y virus, solo DNA o RNA)
• Transmitir y expresar la información genética.
Estructura primaria de los ácidos nucleicos

• Niveles estructurales de los ácidos

nucleicos:
1. Estructura primaria: Unión covalente
de varios nucleósidos mediante
enlaces fosfodiéster, formando un
polímero lineal.
2. Estructura secundaria: Interacción
no covalente entre dos cadenas
polinucleotidicas mediante puentes de
hidrógeno.
3. Estructuras de orden superior:
Estructuras tridimensionales que se
generan a partir de las estructuras
primaria y secundaria (cromatina,
tRNA y rRNA)
Estructura primaria de los ácidos nucleicos

Estructura primaria: Común para DNA y RNA.

Consiste en la unión de nucleósidos mediante un
enlace fosfodiéster

La unidad monomérica es el nucleótido o

nucleósido-monofosfato

La secuencia siempre se indica en dirección 5´- 3´

Estructura primaria de los ácidos nucleicos
Tipos de ácidos nucleicos según su composición
 Estructura primaria de los ácidos nucleicos

Nomenclatura:
1. Formula completa
2. Representaciones
esquemáticas
3. Representaciones
abreviadas
 Estructura secundaria del B-DNA

• Maurice Wilkins y Rosalind

Franklin en 1950 lograron
purificar DNA y realizaron
cristalografía de rayos X
• Erwin Chargaff calculó la
proporción de las bases
nitrogenadas
• Watson y Crick
propusieron la estructura
de la doble hélice
 Estructura secundaria del B-DNA

• En un principio se creyó
que la unidad fundamental
del DNA era un
tetranucleótido
• Erwin Chargaff observó
distintas proporciones de
los 4 nucleótidos en
distintos organismos
 Estructura secundaria del B-DNA

• Células y tejidos de
dintintos organismos
• Dentro de una misma
especie tienen
idéntica composición
que no cambia con la
edad, nutrición o el
entorno
• Específica de especie
 Estructura secundaria del B-DNA

• Reglas de Chargaff:
1. Relación entre bases. En prácticamente
todas las especies el contenido de A se
aproxima al de T y el contenido de G se
aproxima al de C, excepto en especies
monocatenarias.
2. . Relación entre purinas y pirimidinas.
El contenido de bases purinicas se
aproxima al de bases pirimidínicas (50%
purinas y 50% pirimidinas)
3. . Relación entre aminobases y
oxobases. Al observarse A/T=G/C=1,
también se cumple que (A+C) + (T+G)= 1
 Estructura secundaria del B-DNA

• La razón de asimetría.
A+T/G+C= No es 1
Es diferente en cada
especie.
En animales, plantas
superiores y hongos es
superior a 1
En bacterias y virus
son mas variados
 Estructura secundaria del B-DNA

Modelo de Watson y Crick: La forma B del

DNA
• Postulada en 1953, es la estructura de
referencia para las propiedades del DNA
• La forma B del DNA es la mas común en
las células y la forma más estable que
puede adoptar el DNA en condiciones
fisiológicas
 Estructura secundaria del B-DNA

Complementariedad de las
bases nitrogenadas
• La estructura de las bases
nitrogenadas permite la
formación de enlaces por
puentes de hidrógeno
• Cuando los nucleótidos
interaccionan de forma
específica mediante puentes
de hidrógeno se le conoce
como “par de bases”
 Estructura secundaria del B-DNA

Complementariedad de las bases nitrogenadas

• A-T forman 2 puentes de hidrógeno
• G-C forman 3 puentes de hidrógeno
 Estructura secundaria del B-DNA

También son posibles otro tipo

de enlaces denominados tipo
“Hoogsteen”
Son menos frecuentes y no
forman parte del DNA tipo B
Se encuentran en:
• El RNA
• Codón-anticodón
• Interacción entre 3 bases
 Estructura secundaria del B-DNA

También son posibles otro tipo

de enlaces denominados tipo
“Hoogsteen”
Son menos frecuentes y no
forman parte del DNA tipo B
Se encuentran en:
• El RNA
• Codón-anticodón
• Interacción entre 3 bases
 Estructura secundaria del B-DNA

También son posibles otro tipo

de enlaces denominados tipo
“Hoogsteen”
Son menos frecuentes y no
forman parte del DNA tipo B
Se encuentran en:
• El RNA
• Codón-anticodón
• Interacción entre 3 bases
 Estructura secundaria del B-DNA

Consecuencias de la
complementariedad
• Es fundamental para su papel
como portador de la
información genética
• Se reduce la posibilidad de
que se modifiquen sus bases
• La información está
duplicada, permite la
corrección de errores
 Estructura secundaria del B-DNA

Diferentes
Ambas cadenas son
totalmente diferentes
Antiparalelismo
El emparejamiento de las
hebras exige que:
• Sean complementarias
• Esten en sentidos opuestos
 Estructura secundaria del B-DNA

Geometría de la helice
Dextrorsa: si gira a la
derecha
Sinistrorsa: si gira a la
izquierda

La forma B es
dextrorsa
 Estructura secundaria del B-DNA

Parámetros cuantitativos
• Diámetro: 2.37nm
• Distancia entre par de bases: 0.34nm
• Paso de hélice: 3.54nm (10 pb)
• Ancho surco menor: 1.2nm
• Ancho surco mayor: 2.2nm
 Estructura secundaria del B-DNA

El modelo Watson y Crick explica que:

• Tenga una estructura regular
• Replicación:
-Separación de las cadenas
-Síntesis con una cadena de molde
• También permite la reparación de
mutaciones usando una como molde
 Variaciones a la estructura del DNA
Variantes bicatenarias: A y Z
Tienen las mismas características que la variante B: Complementariedad,
antiparalelismo, helicidad, etc.
 Variaciones a la estructura del DNA
Comparación de la forma A con la forma B

1. No se encuentra en condiciones
fisiológicas.
2. Solo en las preparaciones de muestras
cuando la humedad es inferior al 75%
(deshidratada)
3. Al igual que B, es dextrorsa
4. La hélice A es más ancha (diámetro)
5. Es más corta con el mismo numero de
nucleótidos
6. Tiene más bases por vuelta (11)
7. Su surco mayor es más estrecho y
profundo
 Variaciones a la estructura del DNA
Comparación de la forma Z con la
forma A y B

1. Presente en algunas regiones del

genoma eucariota
2. Tiene un giro sinistrorso
3. La hélice Z es más estrecha
(diámetro)
4. Es más larga con el mismo numero
de nucleótidos
5. Tiene más bases por vuelta (12)
6. Forma un solo surco estrecho y
profundo
 Variaciones a la estructura del DNA
Variaciones en torno a la estructura B del DNA

Curvatura de la doble hélice

• En ciertas secuencias los pares de bases no son

exactamente coplanares
• Los pares AT son más abiertos que los GC y esto
ocasiona una desviación del eje
• La curvatura puede ser forzada por la unión con
una proteína
 Variaciones a la estructura del DNA
Variaciones en torno a la estructura B del DNA

Palíndromos

• Regiones cuya secuencia es la misma en ambas hebras

 Variaciones a la estructura del DNA
Variaciones en torno a la
estructura B del DNA

Palíndromos
• Importancia:
1. Son dianas de enzimas de
restricción
2. Intervienen en la regulación de
la expresión génica
3. Generan estructuras
secundarias en DNA y RNA
 Variaciones a la estructura del DNA
Variaciones en torno a la estructura B del DNA

Palíndromos
Ejemplos comunes:
RADAR
ANILINA
ANITA LAVA LA TINA
DÁBALE ARROZ A LA ZORRA EL ABAD
Variaciones a la estructura del DNA
 Variaciones a la estructura del DNA
Palíndromos
“Una región de DNA es palindrómica si la
secuencia de una hebra leída de izquierda a
derecha es igual que la de la otra hebra leída de
derecha a izquierda”

Tienen un centro de simetría que es la letra

central o la posición entre las dos letras
centrales

Las dos hebras de un palíndromo tienen la

misma secuencia
 Variaciones a la estructura del DNA
Palíndromos

• Eje rotacional. Al girar el palíndromo la

secuencia se conserva
• Pueden ser interrumpidos o
ininterrumpidos
• Al separar las hebras las cadenas son
autocomplementarias
 Variaciones a la estructura del DNA
Consecuencias de los palíndromos

• DNA monocatenario: horquilla

• DNA bicatenario: doble horquilla o cruciforme
 Variaciones a la estructura del DNA

H-DNA: Triple hélice

• DNA de 3 cadenas: triple
hélice, triplex o tríplice
• Descubierta en RNA, pero
es más frecuente en DNA
• Se forma en regiones ricas
en pirimidinas en una
hebra y ricas en purinas en
la hebra complementaria
 Variaciones a la estructura del DNA

G-DNA: Triple cuadruple

• Presente en regiones teloméricas
ricas en repeticiones TTAGGG de
entre 5 y 8Kb.
• Tienen entre 100 y 200pb de
hebra sencilla que se pliegan
formando una estructura
cuádruple
Las repeticiones son agregadas por
telomerasas
 Variaciones a la estructura del DNA
Interacción de DNA con proteínas

Muchos procesos biológicos dependen de la unión del DNA con proteínas

Factores de transcripción- regulan la expresión génica reconociendo secuencias de
DNA específicas
 Variaciones a la estructura del DNA
Interacción de DNA con proteínas
El reconocimiento de la secuencia específica del DNA ocurre a través de regiones
estructurales que son solo una parte de la estructura terciaria de la proteína y que
se pueden encontrar con una estructura espacial muy similar en otras proteínas,
interviniendo en una misma función
• Motivos (motifs)