BIOTECNOLOGÍA PRÁCTICA

Practica 3

TEMA: Aplicación del sofware Swiss-model y RasMol para análisis proteicos

OBJETIVO: Analizar una proteína de interés biotecnológico utilizando los sofwares Swiss-
model y RasMol para estudios estructurales y funcionales de biomoléculas

MATERIALES Y METODOLOGIA

(Puede utilizar las secuencias trabajadas en la práctica 2)

 Descargue una secuencia de aminoácidos de una proteína de su interés guárdelo
en formato fasta en un bloc de notas.
 Ingrese 2 mutaciones a la secuencia tipo silvestre y guárdelo en formato fasta en
un bloc de notas.
 Ingrese en el programa Swiss-model y obtenga el modelo teórico de sus proteínas:
https://swissmodel.expasy.org/
 Guarde la secuencia del modelo teórico en formato .pdb para ser abierto en el
programa RasMol
 Obtenga el modelo 3D, seleccione regiones mutadas y compare entre los modelos
teórico vs mutado, utilizando el programa RasMol: http://www.openrasmol.org
 Analice resultados, ¿cómo cambio la estructura de las proteínas en estudio?

. RESULTADOS

· DISCUSIÓN DE LOS RESULTADOS

· CONCLUSIONES Y RECOMENDACIONES

. EVALUACION: Desarrollo del trabajo (2 puntos); Análisis de resultados (3 puntos).

BIBLIOGRAFIA
Manuales de Swissmodel y Rasmol subidos a la plataforma Moodle
Tutoriales: Shttps://www.youtube.com/watch?v=P7iaRxuUR_k
Bruce Alberts. 2010. Biología Molecular de la Célula. ISBN 978-84-282-1507-7
Krap Gerald. 2011. Biología Celular y Molecular. ISBN 978-6-07-150504-0
Zhao, B., Katuwawala, A., Oldfield, C. J., Dunker, A. K. 2021. Describe: database of amino
acid-level protein structure and function predictions. Nucleic Acids Research, 49.
Son, J., & Jeong, K. J. (2020). Recent Advances in Synthetic Biology for the Engineering of
Lactic Acid Bacteria. Biotechnology and Bioprocess Engineering, 1-12.

ANEXOS. Anexe las hojas de trabajo en clase SOLO de aquellos que hayan dejado su
evidencia en la plataforma TEAMS durante las 3 horas de clase. Y Mas detalles que
necesite evidenciar del trabajo en grupo
TAREA: Presentar informe de práctica de acuerdo al formato establecido para las
prácticas.