UNIVERSIDAD TECNICA PARTICULAR DE LOJA

BIOQUIMICA
INTEGRANTES:
 Edwin Álvarez
 Guadalupe Berru
 Rita Guanga
 Andrea Iñiguez
 Sisa Macas
 Alex Sánchez
TEMA: Resumen Capitulo 1
FUNDAMENTOS QUÍMICOS
La unidad fundamental de la materia es el átomo, es una partícula de tamaño reducido, a su vez
constituida por subpartículas: protón, neutrón y electrón.

En condiciones normales, los átomos no presentan carga neta. Sin embargo, existen átomos
cargados, denominados iones, con una diferencia de carga.
Los protones y neutrones se localizan en el núcleo del átomo en el que se con centra toda la
masa.
Los orbitales atómicos quedan definidos por números cuánticos
Los electrones se localizan en orbitas atómicas, que son las zonas que rodean el núcleo donde
existe la máxima probabilidad de encontrar estos electrones.
Para cada átomo concreto existe un numero definido de orbitales que se caracterizan por poseer
una determinada energía potencial:

 El primero conocido como numero cuántico principal.

 El segundo se conoce como numero cuántico azimutal.
 Un tercer número denominado número cuántico magnético.
Por lo tanto, estos tres números definen perfectamente los orbitales atómicos respecto a su
energía, tamaño, forma y orientación espacial.
¿Que determina el orden de los elementos en la tabla periódica?
Los elementos químicos están ordenados en la tabla periódica por su número atómico. Este
ordenamiento deja ver comportamientos y características similares entre los elementos por
columnas.
Los elementos se combinan y forman moléculas
Un elemento es mucho más estable cuando se aproxima a una configuración electrónica en que
sus orbitales estén completos. La unión entre los átomos se establece a través de enlaces
químicos y estos nuevos agregados poliatómicos se comportan como unidades elementales de
nuevas sustancias.
Para entender la formación de los enlaces resulta útil la regla del octeto que se basa en el
comportamiento químico de los denominados gases nobles.
Según esta regla de octeto postulada por Lewis, los átomos son mas estables cuando consiguen
ocho electrones en la capa de valencia.

Orbitales híbridos. La tetravalencia del carbono

Los elementos del segundo periodo de la tabla, carbono, nitrógeno y el oxígeno, los orbitales s y
p de la última capa están tan próximos en su nivel de energía que pueden interaccionar
formando orbitales híbridos que combinan caracteres de ambos orbitales
Enlace covalente coordinado o dativo
En los enlaces covalentes estudiados hasta ahora cada electrón del par de electrones compartido
lo aporta uno de los átomos que participa en el enlace
Polaridad y enlaces polares
Cuando dos átomos de electronegatividad muy diferentes forman un enlace covalente, los
electrones no son compartidos en igual medida por los dos átomos

La molécula de agua presenta enlaces covalentes polares, fundamentales para explicar la

solubilidad de las diferentes moléculas biológicas en agua.
Los grupos funcionales determinan las interacciones entre biomoléculas
Tiene la capacidad de formar cuatro enlaces con ángulos muy abiertos, son enlaces covalentes
no polares y muy estables.
Una biomolécula debe estar en constante cambio, así formarán asociaciones muy importantes,
bien entre ellas o con el agua, ya que éste es el medio en el que se van a encontrar los elementos
químicos fundamentales en la reactividad de las biomoléculas van a ser el O y el N, ambos
átomos electronegativos, que harán reaccionar entre sí a las moléculas que los porten.

Interacciones débiles determinan la función de la molécula

Todo proceso biológico se produce gracias a las interacciones débiles establecidas entre
moléculas. Estas interacciones son débiles, pero la suma de muchas de ellas en la posición
correcta, hará que la unión sea altamente específica y fuerte, además de ser vital para la vida en
la célula.

Puente de Hidrogeno
Para que se forme un puente de hidrógeno es necesaria la presencia de un átomo de hidrógeno
(H) unido covalentemente a un átomo electronegativo (habitualmente el O y N) que, debido a su
carga parcial positiva, será atraído por otro átomo electronegativo presente en una molécula
diferente

Enlace iónico o puente salino

En la célula, los iones (ejemplo, Na, Ko, CI) van a establecer entre sí, interacciones de tipo
electrostático (entre cargas opuestas), también denominadas puente salino una interacción débil,
ya que al estar el ion en solución acuosa se encuentra solvatado (rodeado de moléculas de agua)
reduciendo la fuerza del enlace entre los iones de carga opuesta.

EL AGUA COMO PRINCIPAL DISOLVENTE BIOLÓGICO

El agua es considerada como el medio liquido fundamental en el que se lleva a cabo la mayor
parte de las reacciones químicas de la célula, es por ello que se lo considera como principal
disolvente biológico; La molécula de agua muestra las características químicas de comportarse
como un dipolo: donde el átomo de O, con una carga parcialmente negativa, y los dos H con
una carga parcial positiva.
Las interacciones débiles que establece una molécula de agua con las de su alrededor se da a
través de puentes de hidrogeno, este tipo de enlace es fundamental ya que permite la formación
y rotura de enlaces sin embargo muy rara vez una molécula de agua se disocia en dos especies
llamadas iones hidronio e ión hidroxilo.
Generalmente se denomina protón (H+) como el catión disociado de una molécula de agua:

H2O = H++ OH-

En la naturaleza el protón se encuentra asociado a otra molécula logrando la formación de un
hidronio:
H2O + H2O = H3O+ + OH-
Por lo tanto, el número de protones va ser igual al número de iones hidronio

Quimica de los acidos y de las bases

El comportamiendo de la ionizacion del agua es la base para entender la deficion de acido y
base, la mas aceptada es la teoria de lewis donde dice que una base es una sustancua con un par
de electrones disponibles para la formacion de un enlace covalente dativo, encambio un acido se
concidera como una molecula en la que existe un atomo capaz de aceptar un par de electrones
que se dispone de un orbital externo libre.
Otra teoria aceptable en muchos casos es la de Bronsted-Lowry donde relata que un acido se
define como una sustancia que puede ceder un proton y una base es quella que puede aceptar un
proton al reaccionar con un acido.
Dada esta teoria concluye que cuando el acido pierde el protón se convierte en una sustancia
que tiende a recuperarlo y es por ello que ha esta segunda forma se denomina su base
conjugada.
En la siguiente grafica se puede observar como el carboxilo se comporta como un acido debil y
dona su proton al agua que actua de base en este caso el grpupo carboxilo sera la base
conjugada y la molecula de agua capta el proton convirtiendose en un ion hidronio que sera una
especie acida.

El pH y el pKa
La acidez de una solución se calcula por la concentración de iones hidronio y protones que
presente, esta concentración abarca un rango desde 1 molar (1 M) en una solución muy acida
hasta una concentración de 10-14M en una solución muy alcalina o básica es así que para evitar
el uso de números tan pequeños se decidió convertir dichas concentraciones a una escala
logarítmica denominada escala pH que alcanza el valor de 0 a 14.
Se define el pH= log10 [H+] donde [H+] es la concentración molar: numero de moles de H + por
litro de disolución.
Las soluciones tampón regulan el pH de la célula.
Ciertos grupos funcionales presentes en las moléculas biológicas pueden comportarse como
ácidos o bases débiles por ello su estado de ionización depende de la concentración de protones
del medio. Si se tiene encuentra que la mayoría de las enzimas van a presentar este tipo de
grupos ionizables en su centro activo.

H2PO-4= H++HPO2-4
El principal tampón sanguíneo es el sistema de tampón bicarbonato, compuesto por el
ácido débil carbónico y la base conjugada bicarbonato.
H2PO3= H++HCO2-3

LAS REACCIONES QUIMICAS EN LA CELULA

Equilibrio de una reacción química
En una reacción química, los reactivos interaccionan para formar productos. Pero, en la mayoría
de las reacciones químicas, la reacción no finaliza cuando todo el reactivo se ha convertido en
producto. En lugar de ello, llega un momento en el que le producto formado comienza a
reaccionar para dar un nuevo reactivo.
La gran mayoría de las reacciones que tiene lugar en la célula son reacciones reversibles, y por
lo tanto tienden a alcanzar el equilibrio químico.
La velocidad de una reacción viene determinada por una constante de velocidad (k) y por la
concentración de reactivo siendo k constante de velocidad de la reacción haciendo delante y k -1
constante de velocidad de reacción marchas atrás.
A=B
La velocidad de formación de B: VB=K1
La velocidad de formación de A: VB=K-1
En el equilibrio: k1[A] = K-1
k 1 [B ]
Luego, = =K de equilibrio
k −1 [ A]
En el equilibrio, las velocidades se igualan, y la relación entre la concentracion de reactivos y
productos es constante

REACTIVIDAD DE LAS MOLECULAS BIOLOGICAS

La presencia de grupos funcionales en las biomoléculas proporcionar sitios reactivos,
donde dichas moléculas van a unirse a otras o a reaccionar y transformarse.
Los sitios reactivos pueden ser nucleófilos o electrófilos, según la capacidad de atraer o
no electrones.
Centros nucleófilos: son grupos ricos en electrones y pueden tener carga negativa,
pares de electrones no enlazantes o pares solitarios, o poseer una densidad electrónica
típica de dobles enlaces
Centros electrófilos: tienen atracción por las cargas negativas, es decir, ricas en
electrones, debido a su carencia de electrones en capa de valencia

Las reacciones de condensación o deshidratación son un tipo de reacción química que va a tener
un papel fundamental en la formación de las macromoléculas. A continuación, se describen los
diferentes tipos de enlaces covalentes de condensación que se establecen entre los distintos
grupos funcionales y que van a dar lugar a la gran variedad de moléculas biológicas
EL CONTEXTO CELULAR
Los niveles de organización molecular de la célula permiten observar que, en el primer nivel o
nivel molecular, los componentes celulares son los monómeros o sillares con los que se va a
construir la célula, esos monómeros se asociaran en polímeros mediante reacciones de
condensación, para dar el segundo nivel o nivel macromolecular. Y el ultimo nivel en la
jerarquía será el nivel celular o los orgánulos celulares que delimitan los espacios donde van a
tener lugar las diferentes reacciones.
En una célula eucariota los compartimientos celulares están claramente diferenciados y sus
funciones bien especializadas. Esta especialización en orgánulos se puede llevar a cabo de
forma muy eficiente porque cada orgánulo está delimitado por una membrana celular cuyas
características químicas permiten disposición en forma de bicapa lipídica, lo que separa dos
medios hidrofílicos.