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JORNADAS DEL AÑO INTERNACIONAL DE LOS SUELOS

EL IRNAS Y EL SUELO: Alianza y Complicidad


IRNAS-CSIC, 30 Octubre 2015
Jornada AIS-2015 Año Internacional de los Suelos, Sevilla 30 Octubre 2015
Jornada AIS-2015 Año Internacional de los Suelos, Sevilla 30 Octubre 2015

Presentación

El hecho de la celebración del Año Internacional de los Suelos nos obligaba como
Instituto de Recursos Naturales y Agrobiología de Sevilla, dedicado desde su
fundación al estudio de los mismos, a hacer una reflexión sobre nuestro papel en la
Ciencia del Suelo y echar a la vez una mirada a nuestro futuro. Así se me encargó por
parte de la dirección y con la ayuda de todos, espero que esta Jornada sirva un poco
para ver que hemos hecho, pero sobre todo que estamos haciendo y qué queremos
hacer. El título elegido no es banal, creo que si los grupos de suelos seguimos siendo
fuertes en nuestro instituto en cuanto a captación de fondos, producción científica e
indicadores científicos es porque hubo mucho de “Alianza y Complicidad” para resistir
la escasez de recursos y la mala “prensa” que la Edafología tuvo durante los años 85-
95 en nuestra casa. Sin duda, creo que estas dificultades nos sirvieron de acicate para
abrirnos a otros horizontes y disciplinas que enriquecieron nuestra Ciencia,
aumentando el carácter multidisciplinar que ya tenía.

Repitiendo las palabras de Claire Chenu en la web del año internacional de suelo: hoy
existe una febril y cabal preocupación por la seguridad alimentaria, la seguridad
energética, la seguridad hídrica, la biodiversidad y el cambio climático, pero no se
presta la misma atención a la seguridad de los suelos, que está íntimamente ligada a
los considerados grandes problemas para la población mundial. Es totalmente
necesario velar por la calidad y salud de los suelos desde la investigación, pero
desgraciadamente la Ciencia también está sujeta a los avatares de las modas y los
indicadores de las revistas dedicadas a la Ciencia de Suelo bajan peligrosamente cada
año. Sigue siendo un reto para los científicos actuales de suelo, volver a hacer nuestra
ciencia puntera, atractiva y capaz de afrontar retos imaginativos y de riesgo, que
permitan dar saltos cualitativos y hacer que nuestra investigación compita en Nature,
Science o PENAS. Los medios y equipamientos actuales tanto analíticos,
espectroscópicos, microscópicos, computacionales, de grandes instalaciones,
etc….han avanzado enormemente, de forma que solo hay que ponerle ganas, tiempo,
rigor y sobre todo pasión a nuestro trabajo, aliándonos con las ciencias más punteras y
novedosas: ahí está el reto actual y como siempre desde el IRNAS sabremos
responder.

M. Carmen Hermosín

Profesora de investigación

Ciencias Agrarias CSIC

IRNAS-CSIC
Jornada AIS-2015 Año Internacional de los Suelos, Sevilla 30 Octubre 2015

RESUMENES DE LAS
CONFERENCIAS
Jornada AIS-2015 Año Internacional de los Suelos, Sevilla 30 Octubre 2015

El suelo, desde su cartografía tradicional a la sistemática actual de evaluación

Diego de la Rosa

Real Academia Sevillana de Ciencias

Se lleva a cabo una revisión somera de los primeros estudios cartográficos para el
reconocimiento de los suelos (Soil Survey <> Soil Mapping), con especial referencia a
los desarrollados en el Centro de Edafología y Biología Aplicada del Cuarto,
actualmente Instituto de Recursos Naturales y Agrobiología de Sevilla. Justo con los
avances tecnológicos de los años 80 en el campo de la Teledetección, las
Matemáticas y la Informática (Information and Communication Tecnologies), que
permitían capturar, almacenar, analizar y visualizar grandes volúmenes de
información, se produce el abandono del reconocimiento sistemático de los suelos.
Hoy se considera este abandono un grave error para el desarrollo y aplicación de la
investigación científica en suelos, que se produjo también en los demás institutos
edafológicos del CSIC y en otros centros de diferentes países. La extraordinaria
variabilidad geográfica de los suelos, aun por explorar, obliga a retomar los estudios
cartográficos a escalas detalladas, de inventario y monitorización, haciendo
obviamente uso de dichos avances tecnológicos (ej.: GPS, GPR, PXRF, RS, GIS).

A partir de la voluminosa información que facilitan los reconocimientos de suelos, se


desarrollan los estudios de evaluación o interpretación práctica de datos y
conocimientos (Land Evaluation <> Soil Survey Interpretation). En la actualidad y a
modo de una aplicación de datos masivos o megadatos (Big Data), las posibilidades
de procesar e interpretar los datos de suelos han aumentado extraordinariamente
como consecuencia del avance arrollador de las tecnologías de la información. Para
ello la predicción científica es un factor clave, en especial las predicciones más
sofisticadas o plenamente científicas que tienen un nexo de unión con las matemáticas
y se abordan a través de la modelización computacional (Computational Modelling).
La sistemática actual en evaluación de suelos investiga de esta forma las múltiples
maneras de combinar el conocimiento científico de los suelos con la experiencia
práctica sobre su comportamiento agrícola (ej.: ES, GA, ANN).

La degradación creciente de los recursos naturales en general, y la desertificación de


los suelos en particular, ha hecho que el concepto de sostenibilidad global se haya
convertido ya en un objetivo de consenso indiscutible para la comunidad internacional
(Laborare et Curae). Como consecuencia, el enfoque integrado agro-ecológico, para el
mejor uso y protección de los suelos, es actualmente mucho más que una simple
necesidad. Las nuevas investigaciones en este campo se centran en el desarrollo y
aplicación de los sistemas de ayuda a la decisión (DSS). A partir del reconocimiento
de los suelos, la aplicación de estos sistemas computacionales permite definir
estrategias específicas de agricultura sostenible para cada lugar (Soil-specific Farming
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<> Precision Agriculture). En otras palabras, se trata de “cultivar los suelos en vez de
los campos” siguiendo un tratamiento individualizado de acuerdo con las
potencialidades y limitaciones edáficas.
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La química del suelo en el IRNAS: de la química coloidal a la química ambiental,


pasando por Aznalcóllar

Francisco Cabrera Capitán

IRNAS, CSIC

El IRNAS (fundado CEBAC) ha desarrollado una importante labor de investigación en


temas de Química del suelo. En un principio, en su Sección de Fisicoquímica de Suelo
se llevaron a cabo estudios de caracterización de los minerales de la arcilla y de la
materia orgánica de los suelos de Andalucía. En su laboratorio de Química del suelo y
Radioquímica, se realizaban estudios sobre la precipitación de los fosfatos solubles, la
relación de los fosfatos precipitados con los distintos componentes del suelo, y la
determinación mediante cambio isotópico, de la labilidad de las diversas fracciones de
este elemento en el suelo. Más tarde, se aborda el estudio del proceso de adsorción
de fosfatos sobre los distintos componentes del suelo, como una causa muy
importante de la pérdida de solubilidad (fijación) de este elemento en el suelo, lo que
condujo a los estudios de las propiedades superficiales de los minerales del suelo
(carga eléctrica, propiedades electroquímicas) y su relación con los nutrientes de las
plantas N, P y K. La Química del suelo clásica cambia a la Química coloidal del suelo
que puede explicar prácticamente todos los procesos (reacciones) que ocurren en el
suelo.

A partir de los años 70, debido a la preocupación por los problemas ambientales, los
objetivos de los estudios de Química coloidal del suelo, centrados fundamentalmente
en la dinámica de los nutrientes, se desplazan haciala dinámica de los contaminantes.
Los elementos traza y los plaguicidas, principales contaminantes potenciales del aire,
agua, y suelo, se convierten en el objetivode muchos estudios desarrollados en el
CEBAC, no sólo en los suelos, sino también en las aguas y los sedimentos. Esta
circunstancia, entre otras, lleva al cambio de su denominación a la de IRNAS, y a su
reestructuración en ocho Unidades, en tres de las cuales se desarrollaban estudios de
Química ambiental del suelo, relacionados con diversos tipos de contaminantes, con la
utilización de residuos orgánicos (residuos de almazara, vinazas, composts, etc.) como
fertilizantes, enmiendas o acondicionadores orgánicos, con la caracterización de
sustancias orgánicas en sedimentos y suelos, etc.

El accidente de Aznalcóllar en 1998, vino a poner en valor los estudios realizados 10-
15 año antes y a ampliar las investigaciones sobre los elementos traza: diagnóstico y
recuperación de los suelos contaminados, monitorización de la contaminación en
suelos sometidos a recuperación, así como de la vegetación natural o introducidaen lo
que hoy es el paisaje protegido ‘Corredor Verde del Guadiamar’, etc.

En la actualidadlas investigaciones sobre suelos contaminados con elementos traza se


centran en la diagnosis de la efectividad de las enmiendas para la estabilización de la
contaminación (recuperación natural asistida), así como a la utilización de suelos
contaminados enmendados, para la producción de biomasa. También, siguen en auge
en el IRNAS los estudios sobre sustancias húmicas, plaguicidas y otros contaminantes
orgánicos, y aparecen nuevos temas relacionados la nanotecnología y el “biochar”, así
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como la utilización de nuevas técnicas (NMR en estado sólido, GC/MS, Pyr-GC/MS,


HT/TC-IRMS y Pyr-GC-HT/TC-IRMS).
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Untie the knot of soil organic matter chemistry enables additional differentiation
among soils and their managements

Alessandro Piccolo

Centro Interdipartimentale di Ricerca per la Risonanza Magnetica Nucleare per


l’Ambiente, l’Agro-alimentare e i Nuovi Materiali (CERMANU). Università di Napoli

Humic Substances (HS) represent the most stable fraction of soil organic matter and it
affects the soil physical-chemical and biological properties, being fundamental for its
quality and fertility. The heterogeneous and complex nature of humic components
represents the main difficulty against the elucidation of the structure and dynamics of
soil organic matter. Our recent findings have provided significant experimental
evidence supporting the model of HS as supramolecular associations of relatively small
molecules held together by hydrophobic and hydrogen bonds. These results were
based on a series of experiments which showed that the conformations of humic
suprastructures were altered by additions of small amounts of organic acids, while
those of real macropolymers were not. Mono- and di-alkanoic acids acids were found
to disrupt the weak association of humic molecules, whereas such disruption was not
observed for the covalently stabilized polymers.

The understanding that soil organic matter is arranged in supramolecular structures


comprising molecules with a mass less than 1000 Da has prompted a number of
consequent Science. First of all, if the humic supramolecular structure is composed by
relatively simple molecules held together by weak bonds, it implies that the single
compounds can be selectively separated and quali-quanti-tatively characterized with
appropriate analytical methods, such as NMR and mass spectrometry (MS). A
comprehensive description of a Humeomics Science will be presented together with
the strucutral identification of molecules in the supramolecular structure. The
understanding of the molecular composition of HS would signify an important
achievement for research in soil and soil management. Then, the supramolecular
structure of loosely bound and small soil humic molecules can be stabilized by their
covalent coupling under a photo-oxidative reaction catalyzed by biomimetic
homogeneous and heterogeneous catalysts. The catalyzed photo-polymerization of
SOM can be achieved directly in situ on agricultural soils causing an effectively
significant carbon sequestration in soil. This technology can become a practical means
to reduce carbon losses from soil and contribute to mitigate global changes.
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El suelo como factor clave para entender el futuro de los ecosistemas terrestres
ante el Cambio Global

Lorena Gómez Aparicio

IRNAS-CSIC

Los ecosistemas terrestres están compuestos por dos subsistemas, uno aéreo y otro
subterráneo, que han sido históricamente estudiados en gran parte por separado. Sin
embargo, en la última década se ha puesto de manifiesto que el entendimiento de la
respuesta de los ecosistemas al Cambio Global sólo puede ser alcanzado mediante la
consideración de los procesos de retroalimentación planta-suelo y su papel en la
regulación de la estructura de las comunidades y los ciclos biogeoquímicos.Por
ejemplo, se ha demostrado que características físicas del suelo como la textura
pueden condicionar el signo y la magnitud de la respuesta de las plantas a
incrementos en la concentración atmosférica de CO2 o a los cambios previstos del
clima. Así mismo, la consideración del componente biótico del suelo ha permitido
encontrar nuevas respuestas a viejas preguntas, como por ejemplo cuáles son los
factores que permiten a una especie exótica convertirse en invasora. Estudios
recientes muestran que las especies de plantas invasoras son aquellas que han
conseguido escapar al control por patógenos edáficos que actúan como reguladores
de su abundancia en las zonas de origen pero están ausentes en los suelos de las
zonas invadidas.

Cada vez es más evidente que los distintos componentes del Cambio Global no sólo
pueden implicar pérdidas de biodiversidad de plantas y animales terrestres, sino
también importantes alteraciones en la composición y diversidad de la comunidad
edáfica. Lo que es más, dado que las características intrínsecas de los organismos del
suelo (ciclos de vida corto, rápidos procesos evolutivos) les confieren una capacidad
de respuesta a los cambios ambientales mucho más rápida que la de las plantas se ha
sugerido que podrían ser ellos los que, mediante la introducción de nuevos rasgos o
estrategias de vida, dirijan la re-organización y adaptación de las comunidades
vegetales a las nuevas condiciones reinantes en un mundo cambiante. En conclusión,
la investigacióny gestión de los sistemas terrestres ante el Cambio Global no puede
ser entendida sin la consideración explícita del factor suelo, cuyo reconocimiento como
modulador clave de la respuesta de las plantas a los distintos factores de cambio no
ha hecho más que empezar.
Jornada AIS-2015 Año Internacional de los Suelos, Sevilla 30 Octubre 2015

PÓSTERS DE GRUPOS
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PRESENTACIONES
Jornada AIS-2015 Año Internacional de los Suelos, Sevilla 30 Octubre 2015

José Enrique Fernández


El IRNAS, qué somos y adónde vamos

EL IRNAS Y EL SUELO: Alianza y Complicidad


JORNADA DEL AÑO INTERNACIONAL DE LOS SUELOS
30 de octubre de 2015
Servicios centrales, Madrid

Fundado en 1907 Fundado en 1952

132 institutos ( ~150 personas) 139 personas + 6-8 en La Hampa


16 institutos relacionados con agricultura 4 Departamentos
11 de CC.AA.
13 Grupos de Investigación
2 de RR.NN.

El IRNAS: indicadores J.E. Fernández


OBJETIVO

Investigar sobre el uso y conservación de los recursos suelo, agua


y planta, tanto en sistemas agrícolas como forestales,
especialmente de zonas áridas y semiáridas como Andalucía.

Se trata de aumentar la productividad a la par que se protege el


medio ambiente y se asegura la sostenibilidad de los recursos.

El IRNAS: indicadores J.E. Fernández


Número de artículos por percentil de citas

En 2014, el IRNAS tuvo 5 trabajos


entre el 1% más citado de CC.AA.,
y 30 entre el 10% más citados.

Invest. plantilla CEBAS: 58


“ “ IRNAS: 36

El IRNAS: indicadores J.E. Fernández


7 de los 36 investigadores del IRNAS están entre los más citados de España (h > 34)
El EEZ (59 inv.) tiene 7, el CEBAS (58 inv.) tiene 3 y el IAS (36 inv.) ninguno

Prof. Hermosín - Premio de Investigación sobre Temas Andaluces ‘Plácido Fernández Viagas’ (XVIII ed., 2012)

Grupo de Materiales Lignocelulósicos de Interés Industrial - Premio de Investigación Universidad de Sevilla-BRUKER,


ediciones 2012 y 2015
Prof. H. Knicker - Concesión de la medalla Duchafour, 2015.

Prof. D. de la Rosa - Académico Numerario de la Real Academia Sevillana de Ciencias, 2013.

Dr. J.J. Ortega - Presidente para 2016 de la Sociedad Europea de Toxicología y Química Ambiental

El IRNAS: indicadores J.E. Fernández


MO del suelo, Humus, Compost y Biocarbón

1960s: caracterización estructural de SUSTANCIAS HUMICAS y su aplicación a la evaluación de efectos de


factores ecológicos diversos sobre la MO del suelo.

Composición de residuos orgánicos de interés agronómico y sus efectos en el suelo, efectos de incendios forestales
en el status de la MO del suelo, análisis del origen y composición química de formas refractarias de materia
orgánica en suelos.
Impacto de factores ambientales en los
ciclos biogeoquímicos del C y N, su
implicación en la sostenibilidad de los
ecosistemas, en el secuestro de C y N y en
el cambio climático global.

Caracterización, aplicaciones y efectos en


el medio ambiente de materiales
carbonosos altamente refractarios:
black carbon y biochar.

¿Qué se hace en el IRNAS? J.E. Fernández


MO del suelo, Humus, Compost y Biocarbón

Utilización agronómica de compost, restauración y


fitoestabilización del suelo, uso de biofertilizantes (consorcios de
bacterias y fertilizantes minerales) y fitogeles: efectos en los
cultivos y en las propiedades del suelo.

Micorrizas, la comunidad microbiana y los patógenos del suelo.


Evaluación de servicios ecosistémicos en sistemas
agroforestales. Secuestro de carbono, protección y fertilidad del
suelo.

¿Qué se hace en el IRNAS? J.E. Fernández


El accidente minero de Aznalcóllar (1998)
y la contaminación de las cuencas de los ríos Agrio y Guadiamar

- Medidas paliativas (balsa de decantación; depuradora)

- Evolución de los contaminantes en suelos tratados


de diversas maneras: enmiendas con carbonato cálcico
y óxidos de Fe, Al y Mn, incorporación de M.O.,
fitorremediación con plantas hiperacumuladoras.

¿Qué se hace en el IRNAS? J.E. Fernández


Reducción de la contaminación por agroquímicos

Caracterización de los minerales de la fracción arcilla de los


suelos de Andalucía Occidental (localización, constitución y
propiedades de vermiculitas, pirofilita, esmectitas, caolinitas,
sepiolita…)

Interacción de plaguicidas y otros compuestos orgánicos con


suelos y sus componentes coloidales

¿Qué se hace en el IRNAS? J.E. Fernández


Reducción de la contaminación por agroquímicos
Relevancia de la fracción arcilla del suelo y de enmiendas
orgánicas y biocarbones en la retención de plaguicidas.

Comprensión de los mecanismos de interacción entre


plaguicidas y coloides organominerales del suelo, mediante
el empleo de adsorbentes-modelos.

Diseño de filtros o barreras inmovilizantes de plaguicidas y


otros contaminantes.

Liberación Controlada de Plaguicidas, mediante su


encapsulación en matrices constituidas por polímeros
biodegradables y por minerales de la arcilla

¿Qué se hace en el IRNAS? J.E. Fernández


Acción microbiana en el suelo
Bacterias degradadoras colonizando un hidrocarburo
500
Bacterial motility in sunflower exudates
450

400

350

Y-Coordinates (mm)
300

250

200

150

100

50

0
0 100 200 300 400 500 600 700
X-Coordinates (mm)

Aspectos microbianos y vegetales de la biodisponibilidad de contaminantes

¿Qué se hace en el IRNAS? J.E. Fernández


Acción microbiana en el suelo

Biomineralización por bacterias termófilas: influencia en los ciclos de C, S y N

¿Qué se hace en el IRNAS? J.E. Fernández


Acción microbiana en el suelo

Microbiología ambiental, participación de bacterias y hongos en el ciclo biogeoquímico


de los elementos, conservación de conjuntos arqueológicos y monumentos

¿Qué se hace en el IRNAS? J.E. Fernández


Laboreo de conservación

Finca Experimental La Hampa, 1991. Después en fincas


comerciales de Cádiz, Huelva, Córdoba y Badajoz.

Colaboraciones con Aula Dei (Zaragoza), IAS (Córdoba),


Univ. de Lérida y grupos alemanes y estadounidenses.

Caracterización de la MO bajo distintos sistemas de laboreo,


por espectrometría de resonancia magnética nuclear,
mediante técnicas de polarización cruzada y directa.

Influencia sobre las propiedades físicas del suelo y


su capacidad para almacenar agua.

¿Qué se hace en el IRNAS? J.E. Fernández


Estudios edafológicos

1960s 1980s 1980s

¿Qué se hace en el IRNAS? J.E. Fernández


Sistemas de Ayuda a la Decisión

1990s 2009 2015

¿Qué se hace en el IRNAS? J.E. Fernández


Propagación vegetal y obtención de nuevas variedades

Propagación de especies con interés agrícola o forestal.

Uso de especies silvestres como recursos fitogenéticos.

Fitorremediación.

Obtención, por métodos biotecnológicos, de plantas más


tolerantes a estreses abióticos.

¿Qué se hace en el IRNAS? J.E. Fernández


Propagación vegetal y obtención de nuevas variedades
Elongación de estambres
por acumulación de K Captura de K por raíces Tolerancia al estrés oxidativo extremo de germínulas 35S:A9

Reguladores de proteínas transportadores de sodio,


potasio y cloruro, y su aprovechamiento
biotecnológico en plantas sometidas a estrés hídrico Modificaciones genéticas para la protección
y salino. frente a estreses abióticos: falta de luz o de
nutrientes, estrés hídrico, temperatura elevada.
Portainjertos silvestres y poliploides para
la mejora del rendimiento y la tolerancia a
estreses bióticos y abióticos.

¿Qué se hace en el IRNAS? J.E. Fernández


Sistemas Forestales Mediterráneos

Regeneración y restauración de especies arbóreas


mediterráneas de alta relevancia ecológica y socio-económica
(Quercus suber, Olea europea).

Viabilidad, persistencia y funcionalidad de comunidades de


plantas mediterráneas en escenarios de Cambio Global.

Microorganismos del suelo en sistemas agroforestales


mediterráneos.

¿Qué se hace en el IRNAS? J.E. Fernández


Optimización del uso del agua en agricultura

Mejora del riego a partir del estudio de las propiedades físicas del
suelo, de la ecofisiología del cultivo y del uso de nuevos
indicadores de estrés hídrico.

Modelos mecanísticos de transpiración y fotosíntesis.

Estrategias de riego deficitario.

Aplicación de la telemática al riego.

Riego de precisión.

Actuaciones sobre el suelo para la captación del agua de lluvia.

¿Qué se hace en el IRNAS? J.E. Fernández


Fabricación de productos renovables y biocombustibles

Composición química de maderas, plantas herbáceas


y residuos agrícolas diversos.

Valorización de cultivos agroforestales y energéticos:


aprovechamiento más completo y racional de la
biomasa vegetal como materia prima para la fabricación
de productos renovables y biocombustibles.

¿Qué se hace en el IRNAS? J.E. Fernández


En resumen:

La actividad del IRNAS sigue los criterios del “Periodo Integrador” que comenzó a
principios 1990s, en el que se contempla la multifuncionalidad del suelo.

Se trabaja en el marco del concepto de Sostenibilidad (Conferencia de las Naciones


Unidas para el Medio Ambiente, Río de Janeiro, 1992).

Se consideran escenarios de cambio climático y de aumento de la población.

Se hace ciencia de calidad sin olvidar la necesidad de dar una respuesta a los
retos sociales que plantea el uso del suelo.

¿Qué se hace en el IRNAS? J.E. Fernández


Gracias por su atención
Diego de la Rosa
AIS-2015, Año Internacional de los Suelos

IRNAS-CSIC, 30 Octubre 2015

El suelo, desde su cartografía tradicional


a la sistemática actual de evaluación

Diego de la Rosa
Reconocimiento de suelos*

(*) Estudio geográfico de los suelos mediante la cartografía,


inventario o monitorización, y la elaboración de mapas.
Centro de Edafología y Biología Aplicada del Cuarto

Mas información: Arambarri P, 1996. Semblanza historica,. Memoria IRNAS.


CEBAC

CEBAC-CSIC, 1953-1987 => IRNAS-CSIC, 1987-


Artífices de la Edafología

Vasily Dokuchaev (1846-1903) Curtis Marbut (1863-1935) Philip Duchaufour (1912-2000) Guy D Smith (1907-1981)

Walter Kubiena (1897-1970) José M. Albaréda (1902-1966) Emilio Huguet del Villar (1871-1951)
Salidas al campo

Curso Internacional de Edafología dirigido por José L Mudarra, 1974


El suelo no es el mismo en todas partes

La gama de suelos es extremadamente variada: Más de 100.000 tipos diferentes


Caracterización del individuo-suelo
Paisaje Perfíl vertical

Suelo Mollic Hapludalf

Los suelos se clasifican taxonómicamente como los animales o las plantas


Caracterización de suelos: Principales variables
Variables físicas
Textura Pedregosidad Drenaje
Estructura Densidad aparente Infiltración
Porosidad Retention de agua Conductividad
Costras Compación Profundidad útil
Variables químicas
Arcilla Salinidad Carbonatos
Color Nutrientes Saturación en sodio
Reacción Oxidos de hierro Elementos tóxicos
Variables biológicas
Materia orgánica Abundancia de organismos
Actividad biológica: índice de respiración, actividad enzimática, etc.

Las determinaciones cuantitativas han ido sustituyendo a las cualitativas


Mapa de suelos detallado

Primer documento cartográfico del CEBAC

González F, Guerra A, Chávez M, Mudarra JL., 1954. Mapa de suelos del Cortijo de Cuarto.
Mapa de suelos generalizado, 1/250.000

González-García et al., 1962. Estudio agrobiológico de la provincia de Sevilla


.
Los estudios de suelos más emblemáticos del CEBAC
Los estudios de suelos más numerosos del CEBAC
Mapa de suelos semidetallado, 1/50.000

De la Rosa D, Mudarra JL, Cardona F, Moreno R, 1976 Reconocimiento de suelos del Viar.
Mapa de suelos exploratorio, 1/1.000.000

Ultima versión: Instituto Geográfico Nacional, 1992. Atlas Nacional de España.


USDA Suborders

La contribución edafológica más importante del CEBAC


Atlas de suelos, 1/1.000.000

www.jrc.cec.eu.int/soil-atlas
Crisis de la Edafología tradicional

- En la década de los 1980s

- Disminución de los fondos dedicados a los reconocimientos de suelos

- Relegación de los estudios de campo y auge de los de laboratorio y, sobre todo,


los de despacho

- Sustitución del interés agrario por la preocupación medioambiental

- Evidencia de la multifuncionalidad del suelo, no solo ambiental o agraria

- Los importantes cambios en las políticas de investigación. Los programas europeos

- En la Unión Europea, el menor interés político por el suelo en comparación con el


aire, el agua y el clima. Además de la dispersión y descoordinación administrativa

- En España, el impacto del desafortunado modelo territorial de las autonomías

- Irrupción de las nuevas tecnologías. La euforia tecnológica


RS: Remote Sensing

USDA Suborders

Aumento continuo de la resolución y periodicidad de estas técnicas


GPS: Global Positioning System

Las coordenadas reales de un punto con una precisión de hasta centímetros


GPR: Ground Penetration Radar
0

A1

25

A2
50

75

B
100
Identificación del perfil del suelo sin necesidad de perforar ni abrir
PXRF: Portable X-ray Fluorescence

Excelente instrumento para la investigación edafológica in situ


GIS: Geographic Information System

Ejemplo de cartografía automática de propiedades edáficas


Perfiles de suelos informatizados

González, Chaves, Paneque, Mudarra et al.


Más de 1.000 perfiles y 15.000 sondeos de suelos del IRNAS
Ejemplo de perfil de suelo informatizado

Fuente: SEISnet, Sistema Español de Información de Suelos sobre Internet


Recopilar, armonizar y transferir la información de suelos
Cartografía, inventario y monitorización

Sofisticada herramienta para una nueva generación de información sobre suelos


Catalogo de suelos de Andalucía

Fuente: De la Rosa et al., 1984. Catalogo de Suelos de Andalucía


Desértico Al-06 Volcánico Al-05 Salino SE-05 Yermo GR-06 Arenoso H-04 Vega CO-07 Albariza CA-05 Albariza JA-06

Bujeo CO-02 Bujeo SE-03 Tierra negra H-03 Tierra negra CA-01 Pardo calizo MA-01 Suelo rojo CA-03 Suelo rojo SE-01 Pseudogley SE-08

Laja H-02 Greda roja Al-01 Rendsina JA-08 Terra rossa CO-06 Terra rossa CA-06 Alpino GR-02 Tierra parda CO-04 Tierra parda H-01

La mayoría de tipos de suelos mediterráneos se encuentran en Andalucía


Evaluación de suelos*

(*) A partir del mayor y más preciso conocimiento científico de los suelos,
las posibilidades de procesar e interpretar los datos han aumentado
extraordinariamente como consecuencia del avance arrollador de las
tecnologías de la información (TICs).
Vertientes del método científico

Explicación vs. Predicción


pasado ó presente futuro

Análisis Síntesis

Deducción Prescripción

Comprensión Prevención

Teorías Modelos

Predicción, vaticinando el futuro para resolver los problemas reales


Modelización biofísica del sistema suelo-uso

Suitability
Conocimiento
científico
Diseño Productividad
Formulación

Calibración

Comportamiento Validación

tecnológico Aplicación Vulnerabilidad

inputs modelos outputs

Estudiar la influencia de cientos de variables de suelo, clima y manejo


Big Data Analysis & Data Mining
Descripción del lugar ……………………….. 62 variables
Descripción de horizontes ………………….. 54* “
Análisis químico general ……………………. 33* “
Sales solubles y elementos trazas ………… 27* “
Determinaciones físicas …………………….. 9* “
Determinaciones hidraulicas ……………….. 50* “
Análisis especiales ………………………….. 10* “
Fotografías …………………………………… 4 “
Metadatos ……………………………………. 78 “
TOTAL …………………………………….… 327 “

(*) Determinaciones que se repiten en cada horizonte

Para un solo suelo de 5 horizontes se sobrepasan los 1.500 registros


Ejemplo de modelización biofísica
Modelo ACCESS
Profundidad Exposición Altitud Pedregosidad
útil

Evapo-
Temperatura transpiración Lluvia Pendiente

Capacidad
Agua Infiltración Grietas Clase de Fertilidad
retención
disponible humedad natural
agua

Capacidad Punto Tempero


Escorrentia Percolació
de campo marchitez

Calidad Riesgo de
Temperatura Necesidad Sequía
del agua erosión Manejabilidad
acumulada de riego

Fuente: Loveland et al. (1995)


APTITUD / VULNERABILIDAD DEL SUELO

Trigo Maíz Girasol Soja Algodón Patata Vid Olivo Frutales

Se pretende la mayor capacidad de explicación y predicción


para generar nuevos escenarios
Sistemas expertos (AI-ESs)
Textural class

Coarse Medium Fine

Salinity Salinity Salinity

High Moderate Light


High Moderate Light

4 4 3
pH + CEC pH + CEC pH + CEC

<7 >7+<35 >7+>35 <7 >7+<35 >7+>35 <7 >7+<35 >7+>35

4 3 3 2 2 1 2 1 1

High Moderat Light Soil contamination model:


e
Decision criterion: land Salinity
4 pH + CEC 1 characteristic
Choise: generalisation level Moderate
<7 >7+<35 >7+>35
Decision: severity level 2

2 1 1

Los AI-EEs simulan la capacidad resolutoria de los expertos humanos


Redes neuronales artificiales (AI-ANNs)
X1

X2

X3

X4

X5
Soil erosion model:

X1 = Runoff erosivity
X6 X2 = Relief hazard
X3 = Soil erodibility
X4 = Crop protection
X5 = Tillage impact
X6 = Production influence
Y = Vulnerability index

Input layer Hidden layers Output layer

Las AI-ANNs analizan sistemas no lineales de múltiples variables


Principales componentes de los DSSs

Práctica Espacialización
Herr. optimización
Interface usuario

Simulación dinámica
Redes neuronales
Sistemas expertos
Modelos estadísticos
Sistemas difusos
Redes bayesianas
Algoritmos genéticos
GIS
Teledetección
DBMS
Ciencia
Información Decisión
Los DSSs son prototipos perfectos de la predicción científica
Múltiples aplicaciones de uso de los DSSs

Uso territorial
- Identificar las mejores tierras agrícolas
- Reforestar las tierras marginales
- Diversificar la rotación de cultivos
- Segregar las zonas vulnerables
- Delimitar las zonas con problemas de fertilidad
Prácticas de manejo
- Restaurar la materia orgánica
- Precisar la intensidad de laboreo
- Considerar el tiempo de tempero
- Seleccionar la maquinaria apropiada
- Racionalizar el uso de agro-químicos
Multifuncionalidad
- Compatibilizar los cultivos bio-energéticos
- Adaptación al cambio climático
- Aprovechar la capacidad de secuestro de C

No caben normas generales, sino decisiones individualizadas


MicroLEIS DSS

Sistema agro-ecológico de ayuda a la decisión


Enfoque agro-ecológico*

(*) Nuevo enfoque para una agricultura realmente sostenible,


que trata de integrar producción y conservación mediante
una dependencia crucial del recurso suelo.

La Biblia, en el libro del Génesis, recoge ya el mandato de “labrar y


cuidar” la tierra (Enciclica Laudato Si, 2015)
Crecimiento demográfico y seguridad alimentaria
Población mundial, miles de millones

9
8

5
4

Fuente: Time Pub. Oct 31, 2011


3

0
1800 1927 1959 1974 1987 1998 2011 2025 2043
Años

Para 2050, la producción agraria debe crecer un 60%


Desertificación o degradación total del suelo

Erosión – Contaminación – Sellado

La degradación del suelo no suele tener efectos alarmantes,


aunque es un problema medioambiental grave
Interés científico por la degradación del suelo
Número publicaciones Scopus

Fuente: De Jong (2010)


Con relación a 1990, las publicaciones se han multiplicado por cinco
Impacto del cambio climático

Fuente: EEA ( 2011)


En 2050, el cambio climático puede reducir un 12% la producción agraria
Sostenibilidad en el uso de los suelos

Productividad
Suitability Vulnerabilidad
Vulnerability
máxima mínima

Fuente: De la Rosa (2008)


Sostenibilidad
Sustainability

Intensificación agrícola no se relaciona necesariamente con degradación del suelo


Necesidad de volver al
reconocimiento sistemático de los suelos

- En el marco de proyectos internacionales, tal y como el “Digital Soil Mapping (DSM)”

- Para progresar en el conocimiento de su distribución espacial, aún muy poco


detallado

- Para avanzar en otras disciplinas científicas sobre los suelos íntimamente


relacionadas, resaltando el papel aglutinador y de síntesis de los reconocimientos

- Para facilitar una interpretación práctica realmente útil en agricultura, ordenación del
territorio, protección del medio ambiente, mitigación y adaptación climática, etc.

- Para ello, será necesario modificar el procedimiento de evaluar los resultados


científicos: papers, mapas, informes divulgativos, modelos predictivos, paginas web,
software de aplicación, etc.
Soil-Specific Farming <> Precision Agriculture
GPS + Yiel monitor

Plant protection GPS

MF-Combine

Fuentes: Robert et al. (1993); Lal &.Stewart (2015)


Soil mapping
GPS
Fertilizing

GPS Big data analysis:


Sowing RS, GPR
Application maps GIS, DSS

Soil tillage

Una agricultura individualizada a la medida de cada suelo


Evaluación Agro-ecológica de Suelos
para un desarrollo rural sostenible

Diego de la Rosa
CSIC / Mundi-Prensa, Madrid

Libro + CD-ROM
20 capítulos, 404 páginas

ISBN 978 8484763611 (Edición impresa)


eISBN 000 6080070 (Edición digital)
NIPO 653-08-083-8

2008

http://www.paraninfo.es
Real Academia Sevillana de Ciencias

Discurso de ingreso

Una agricultura a la medida de cada suelo:


Desde el conocimiento científico y la experiencia
práctica a los sistemas de ayuda a la decisión

Diego de la Rosa

Sevilla, 2013
Francisco Cabrera
Francisco Cabrera Capitán
El CEBAC Unidades Estructurales de Investigación (U.E.I.)
•Sección de Fisicoquímica. •Bioquímica y Microbiología del Suelo
•Sección de Suelos. •Cartografía y Evaluación de Suelos
•Sección do Fertilidad, •Química del Suelo
•Sección de Ecología Vegetal. •Morfología y Génesis del Suelo
•Sección de Entomología y Zoología del Suelo •Mineralogía y Propiedades de Arcillas
•Sección de Microbiología y Bioquímica. •Física del Suelo y Bioclimatología
•Laboratorio de Química del Suelo y •Fertilidad de Suelos, Nutrición y Propagación de
Radioquímica Plantas
•Fisiología y Bioquímica Vegetal

30/10/2015 F.Cabrera 2
Sección de Fisicoquímica de Suelo

•Estudios de caracterización de los minerales de la arcilla y de la materia orgánica


de los suelos de Andalucía.

Química del suelo y Radioquímica


Destino y disponibilidad de los fertilizantes añadidos a los suelos

•Relación entre los fosfatos solubles y precipitados en los suelos


•Determinación de la labilidad de las distintas fracciones del fosfato del suelo
mediante Cambio isotópico
•Determinación de la actividad radical del olivo mediante P32

30/10/2015 F.Cabrera 3
El destino de los fertilizantes y agroquímicos añadidos al suelo

En homenaje a Juan Martínez


30/10/2015 F.Cabrera 4
Química del suelo y Radioquímica
Destino y disponibilidad de los fertilizantes añadidos a los suelos

•Relación entre los fosfatos solubles y precipitados en los suelos


•Procesos de adsorción de fosfatos sobre los distintos componentes del suelo
•Determinación de la labilidad de las distintas fracciones del fosfato del suelo
mediante Cambio isotópico
•Estudios de las propiedades superficiales de la fase coloidal del suelo (carga
eléctrica, propiedades electroquímicas) y su relación con las especies en la
disolución del suelo, especialmente los nutrientes de las plantas N, P y K.
•Determinación de la actividad radical del olivo mediante P32

30/10/2015 F.Cabrera 5
Estudios sobre la precipitación de los fosfatos solubles y su la relación de los
fosfatos precipitados con los distintos componentes del suelo y su disponibilidad,
usando los diagramas de Aslyng en los que aparecen las curvas de equilibrio de
distintos fosfatos precipitados.

30/10/2015 F.Cabrera 6
Procesos de adsorción de fosfatos sobre los distintos componentes del suelo,
como una causa muy importante de la pérdida de solubilidad (fijación) de este
elemento en el suelo
Utilización de modelos de Langmuir, Freundlich y Temkin.
•Los datos experimentales se ajustan a los tres modelos con similares niveles
de significación

Utilización de modelo de la doble


capa difusa: Stern, Gouy-Chapman

30/10/2015 F.Cabrera 7
Determinación de la actividad radical del olivo mediante P32

30/10/2015 F.Cabrera 8
La Química del suelo clásica cambia a la Química coloidal del suelo que puede
explicar prácticamente todos los procesos (reacciones) que ocurren en el suelo.

• A partir de los años 70, debido a la preocupación por los problemas ambientales,
los objetivos de los estudios de Química coloidal del suelo, centrados
fundamentalmente en la dinámica de los nutrientes, se desplazan hacia la
dinámica de los contaminantes.
• Los elementos traza y los plaguicidas, principales contaminantes potenciales del
aire, agua, y suelo, se convierten en el objetivo de muchos estudios desarrollados
en el CEBAC, en los suelos, en las aguas y los sedimentos.
• Muchas de las investigaciones pueden considerarse dentro de la Química
ambiental.

30/10/2015 F.Cabrera 9
El IRNAS •Geocologia
Nuevo edificio en 1987 •Química de interfases en procesos
medioambientales
•Sistemas naturales. •Bioquímica y dinámica de contaminantes
•Fisica y quimica ambiental. •Sostenibilidad del sistema suelo-planta-
•Biologia vegetal. atmósfera
•Biologia vegetal

•Biogeoquímica, Ecología Vegetal y


Microbiana
•Protección del sistema suelos,
planta, agua
•Agroquímica, microbiología
ambiental y conservación de suelos
•Biotecnología vegetal

30/10/2015 F.Cabrera 10
Química ambiental del suelo, estudios relacionados con

• diversos tipos de contaminantes (plaguicidas, elementos traza, etc.)


• la utilización de residuos orgánicos (residuos de almazara, vinazas, composts,
etc.) como fertilizantes, enmiendas o acondicionadores orgánicos
• la caracterización de sustancias orgánicas en sedimentos y suelos, etc.
• contaminación de las aguas superficiales y su relación con la de los suelos,
sedimentos, flora y fauna de ríos y sedimentos

30/10/2015 F.Cabrera 11
Durante 1978 y 1979 se lleva acabo el primer proyecto de investigación
sobre la contaminación del río Guadiamar

Los resultados de varios proyectos ponen de manifiesto el peligro que supone


para Doñana un río Guadiamar con aguas y sedimentos con altas

30/10/2015 F.Cabrera 12
30/10/2015 F.Cabrera 13
Valorización de alpechines y vinazas

• Utilización directa de alpechines: Land treatment o land


utilization
• Utilización de lodos de alpechineras

Compost Residuos Sólidos Urbanos (Villarrasa)


• Caracterización de los composts
• Valoración agronómica y medioambiental
(invernadero, fresas, naranjos, etc.)

Proyecto LIFE (reforestación, jardinería, cultivos agrícolas

30/10/2015 F.Cabrera 14
Proyecto CEDETI ( 26 millones de ptas)
• Utilización directa de vinazas de remolacha
• Co-Compostaje de vinazas con diversos residuos
• Aplicación agrícola de los composts de vinaza

30/10/2015 F.Cabrera 15
Suelos salinos de las Marismas. Un
laboratorio único para la investigación

• Evolución de la salinidad de un suelo


salino recuperado y del flujo de aguas y
sales bajo distintas condiciones de
cultivo, sistemas de riego y calidad de
las aguas de riego
• Modelo para estimar la salinidad real
del suelo a partir de datos obtenidos en
laboratorio

30/10/2015 F.Cabrera 16
Lixiviación de nitratos en suelos agrícolas

• Estudios de campo y en lisímetros. Comparación


de los resultados.
• Evaluación de las pérdidas de nitratos en distintas
condiciones
• Lisímetros

30/10/2015 F.Cabrera 17
Construcción de un lisímetro

30/10/2015 F.Cabrera 18
El accidente de Aznalcóllar 1998

30/10/2015 F.Cabrera 19
30/10/2015 F.Cabrera 20
30/10/2015 F.Cabrera 21
Se habían dejado de financiar investigaciones sobre el peligro para Doñana del río
Guadiamar con aguas y sedimentos con altas concentraciones de elementos
traza.
Ahora se nos conmina a dejarlo todo para dedicarnos a trabajar en el caso
Aznalcóllar. “Acordarse de Santa Bárbara cuando truena”

30/10/2015 F.Cabrera 22
Diagnóstico sobre la contaminación de los suelos y recomendaciones para
su recuperación

• 12 puntos de muestreo de suelos contaminado y de los lodos, y 6 para


determinar el fondo geoquímico

• a las dos semanas un informe sobre la naturaleza de la contaminación, el grado


de contaminación y de penetración de la misma en los suelos afectados por el
vertido

• sugerimos las tareas a realizar para la limpieza y recuperación de los suelos:


o retirada de la capa de lodo depositada sobre el suelos, así como la de
una capa de 10-20 cm de suelos contaminado,
o la mezcla de la capa superficial con la superficial para diluir la
concentración de contaminantes
o aplicación de enmiendas (v. gr.: carbonatos cálcicos, óxidos de Fe,
materia orgánica, etc.) para ayudar a la recuperación de los
suelos.(disminución de la movilidad/disponibilidad)

30/10/2015 F.Cabrera 23
Posteriormente

•Se nos excluyó de los estudios de monitorización de los suelos sometidos a


recuperación. Dejó de tronar y “a río revuelto…”, ¡¡otros se llevaron las
ganacias!!

•Programa de Investigación del Corredor Verde del Guadiamar (PICOVER) y


SECOVER y varios convenios más: seguimiento de la relación suelo-plantas en la
zona afectada

•Proyectos (CICYT. FEDER) en colaboración con el ITGE: efecto del vertido en los
suelos y aguas subterráneas

•Proyectos CICYT: la recuperación de los suelos afectados

30/10/2015 F.Cabrera 24
Más de 50 publicaciones, tesis, DEA, proyectos fin de carrera, etc. sobre suelo
(monitorización, evolución de la contaminación en suelos sin limpiar, etc.), plantas y
animales (caracoles, caballos)
En el capítulos 7 del libro se citan las publicaciones hasta 2007

30/10/2015 F.Cabrera 25
En la actualidad las investigaciones sobre suelos contaminados con elementos traza

• diagnosis de la efectividad de las enmiendas para la recuperación mediante la


estabilización de dichos elementos en los suelos: recuperación natural asistida.
 técnica blanda o de bajo impacto
 constituye un enfoque más natural y respetuoso con el medio natural; no altera
negativamente las propiedades químicas, físicas y biológicas del suelo.

• posible utilización de suelos contaminados con elementos traza enmendados, para la


producción de biomasa; plantas de crecimiento rápido (Paulownia)

• efectos que la propia vegetación forestada puede tener sobre las propiedades del
suelo (Proyecto europeo RECARE).

30/10/2015 F.Cabrera 26
NA

LESL

SL BC

El Vicario: Suelos contaminados limpios, en recuperación: NA, sin


emnienda; SL, con espuma de azucarera; BC, con compost de
biosólidos; LESL, con Leonardita + espuma de azucarera
30/10/2015 F.Cabrera 27
27
30/10/2015 F.Cabrera 28
28
Experimentos en contenedores

30/10/2015 F.Cabrera 29
En la actualidad las investigaciones sobre suelos contaminados con elementos traza

• diagnosis de la efectividad de las enmiendas para la recuperación mediante la


estabilización de dichos elementos en los suelos: recuperación natural asistida.
 técnica blanda o de bajo impacto
 constituye un enfoque más natural y respetuoso con el medio natural; no altera
negativamente las propiedades químicas, físicas y biológicas del suelo.

• posible utilización de suelos contaminados con elementos traza enmendados, para la


producción de biomasa; plantas de crecimiento rápido (Paulownia)

• efectos que la propia vegetación forestada puede tener sobre las propiedades del
suelo (Proyecto europeo RECARE).

30/10/2015 F.Cabrera 30
Plantas de Pawlonia en suelos contaminados

30/10/2015 F.Cabrera 31
En la actualidad las investigaciones sobre suelos contaminados con elementos traza

• diagnosis de la efectividad de las enmiendas para la recuperación mediante la


estabilización de dichos elementos en los suelos: recuperación natural asistida.
 técnica blanda o de bajo impacto
 constituye un enfoque más natural y respetuoso con el medio natural; no altera
negativamente las propiedades químicas, físicas y biológicas del suelo.

• posible utilización de suelos contaminados con elementos traza enmendados, para la


producción de biomasa; plantas de crecimiento rápido (Paulownia)

• efectos que la propia vegetación forestada puede tener sobre las propiedades del
suelo (Proyecto europeo RECARE).

30/10/2015 F.Cabrera 32
Buscando y compartiendo soluciones para proteger nuestros suelos

30/10/2015 F.Cabrera 33
Otros temas de actualidad de Química en el IRNAS

Siguen en auge los temas de investigación sobre

• Características de las sustancias húmicas


• Plaguicidas

Aparecen nuevos temas y técnicas

• Aplicaciones agrícolas y medioambientales de la nanotecnología:


retención de contaminantes, formulación de agroquímicos de liberación
lente, etc.

• Aplicación de nuevos productos para aumentar la fertilidad física y


química de los suelos, como el “biochar”

• NMR en estado sólido, GC/MS, Pyr-GC/MS, HT/TC-IRMS y Pyr-GC-HT/TC-


IRMS

30/10/2015 F.Cabrera 34
El futuro de la Química del suelo en el IRNAS

Como siempre ha sido, las tendencias serán las mismas que se preconizan en todos los
libros modernos de esta disciplina

En opinión de Donald L. Sparks, los avances nacerán de la combinación de las nuevas


tecnologías y la investigación interdisciplinar;
“Las investigaciones a escala molecular están ya abriendo las nuevas fronteras de la
Química del Suelo”

30/10/2015 F.Cabrera 35
Esas investigaciones incluyen estudios de

 Especiación
•Mecanismos
•Distribución espacial
•Transformaciones químicas
•Toxicidad
•Biodisponibilidad
•Estrategias de recuperación
•Impacto sobre la salud humana
 Ciclos de los elementos traza, C, N, S y su impacto en el Cambio Climático
Global
 Modelos de predicción de la velocidad, destino y transporte de los
contaminantes
 Esclarecimiento de los mecanismos de transformación microbiológico de
los contaminantes
 Preciso conocimiento de la estructura de la materia orgánica del suelo
 Comprensión de la Química de la rizosfera

30/10/2015 F.Cabrera 36
En mi opinión, y a la vista del trabajo que ya se está
realizando, estamos en el buen camino

Felicitaciones a todos

GRACIAS POR SU PACIENCIA Y ATENCIÓN

30/10/2015 F.Cabrera 37
Alessandro Piccolo
JORNADA DEL AÑO INTERNACIONAL DE LOS SUELOS
EL IRNAS Y EL SUELO: Alianza y Complicidad
IRNAS‐CSIC, 30 Octubre 2015

Untie the knot of soil organic matter


chemistry enables additional
differentiation among soils and their
managements

Università di Napoli Federico II, Italy


Prof. Alessandro Piccolo
Centro di Ricerca Interdipartimentale sulla Risonanza
Magnetica Nucleare (NMR) per l'Ambiente, l'Agro-Alimentare
ed i Nuovi Materiali (CERMANU)
A little dialectic on
what is Humic Matter?

SUPRAMULECULAR
VS
MACROPOLYMERIC STRUCTURE
Humic substances (humic and fulvic acids) had been
traditionally described as macropolymers (10-500 KDa),
similarly to biopolymers, and their synthesis accounted to
extracellular enzymatic catalysis.

The assumed monomer of such a humic macropolymer has been


from time to time described with a hypothetical structure,
progressively updated according to the advance of analytical
techniques.

Stevenson, 1982
The macropolymeric theory
has never been
unambiguously proved by
direct experimental
evidence

Nevertheless, a number of
idealized structures, either
linear or branched, but all
stabilized by COVALENT
BONDS, became common in
textbooks and scientific
reports.
THE SUPRAMOLECOLAR STRUCTURE
HPSEC experiments indicated that conformations of humic substances
are altered by small amounts of organic acids.
These pioneered experiments undermined the macropolymeric theory

SIZE-EXCLUSION CHROMATOGRAPHY

CH3COOH

100 100
50 50
25 25

Void Volume Retention Volume Void Volume Retention Volume


Total Volume

Total Volume
Piccolo et al., 1996. European Journal of Soil Science, 47:319-328;
Piccolo et al. 1999. European Journal of Soil Science, 50:687-694
A reverse experiment: HA in different HPSEC eluents
A= NaNO3 pH 7; B= +CH3OH pH 6.9; C=+HCl pH 5.54; D=+CH3COOH pH 5.7

UV 280 nm RI

D
D

Conte, Piccolo. Environmental Science & Technology (1999) 33:1682-1690


The Hypochromic effect due to
interactions of dipole moments of
chromophores with light.

A=control HA (0.05M NaCl) pH 7,


I=0.05

B=as in A but 4.6x10-7 M in CH3OH,


pH 6.97

C=as in A but to pH 5.54 with HCl


(<10-6M)

D=as in A but 4.6x10-7 M in


CH3COOH, pH 5.69

Piccolo (2001). Soil Science, 166:810-833


MINIMIZATION OF CONFORMATIONAL ENERGY
POLYMERIC-COVALENT MODEL

Traditional humic
macropolymeric model
MW=6326 Da
Energy = 627.4 Kcal.mol-1

Conformational variation
induced by the adsorption
of 10 molecules of acetic
acid
Gain in
conformational Energy = 617.26 Kcal.mol-1
energy = 1.6 %
HYPERCHEM software

PICCOLO et al. In: D.K. Benbi and R. Nieder, Editors. Handbook of processes and modelling in soil-plant system.
Haworth Press, New York, pp. 83-120 (2003).
MINIMIZATION OF CONFORMATIONAL ENERGY
SUPRAMOLECULAR MODEL
Supramolecolar Humic
Model. Association of different
small molecules (aminoacid,
glucose, fatty acids, cinnamic
acids)
total MW = 3065 Da
HYPERCHEM software
Energy = 114.0 Kcal.mol-1

Conformational variation
Gain in energy = 20.0 % induced by the approach of
10 molecules of acetic acid
Energy= 91.2 Kcal.mol-1

Conformational variation
induced by the adsorption of
Gain in energy = 26.3 % 10 molecules of acetic acid
Energy= 84.0 Kcal.mol-1

PICCOLO et al. In: D.K. Benbi and R. Nieder, Editors. Handbook of processes and modelling in soil-plant system.
Haworth Press, New York, pp. 83-120 (2003).
WHAT IS THE REAL MASS OF
HUMIC MOLECULES?
The evaluation of absolute molecular masses by ESI-MS
Electrospray ionization (ESI) is a soft technique to obtain
unfragmented and single-charged ions of humic molecules in
aqueous solution for compatible measurements by mass-
spectrometry

Humic solutions are conveyed


through a capillary to the tip of a
cone where are ionized and
released in a droplet. The
droplets are progressively size-
reduced by temperature until the
ions repel each other and enter
separated into the mass analyzer
in vacuum
No molecular mass larger than 1500 Da was noted by
FT-IRC-MS for terrrestrial humic matter
Ultra-high-resolution Mass Spectrometers (FT IRC-MS 11.7 Tesla) showed
that aquatic humic substances contain up to 6.000 different molecular
masses, while terrestrial humic sustances may contain more than 20.000
different masses
Bruker Daltonics, Bremen, D

Piccolo, Nebbioso and Spiteller (2010) Anal Bioanal Chem 397: 3071-3078
Diffusion Ordered NMR SpectroscopY (DOSY-NMR)
A nominal molecular weigh of
humic matter was calculated from
133 mg/mL
a DOSY calibration curve built with
+ 5 mL standards of known MW
of Peat HA
of AcOH

+ 5 mL
5 mg/mL
of AcOH
of Peat HA

Alteration of the conformational


Calibration of Diffusion Coefficients (DC)
structure of humic matter by with standard compounds: glucose, sucrose,
addition of acetic acid was raffinose, -cyclodextrin, maltodextrins, insulin
oxidized chain A, insulin dimer.
visible also by DOSY
Simpson. Magnetic Resonance Chemistry, 2002, 40: S72–S82
THE NEW CONSENSUS
• Humic substances are composed of a multitude of
relatively small ( 1-1.5 kDa) and heterogeneous
molecules that self-assemble in supramolecular
associations held together by weak bonds
(hydrophobic and H bonds) in only apparently large
molecular sizes.
• The humic molecules are compounds surviving the
biochemical degradation of cellular components, they
randomly associate in hydrophobic-hydrophilic
phases which are either contiguous to or contained in
each other. Their environmental reactivity is dictated
by their hydrophobic/hydrophilic ratio.
• The energetically fragile supramolecular associations
may be altered by interactions with organic acids and
metals that make bonds stronger than the hydrophobic
ones which stabilize the original humic conformation.
Piccolo. 2002. Advances in Agronomy, 75:57-134
Humic matter is a GENERIC MOLECULAR ENTITY that adjust
to different conditions, while cell biomolecules are SPECIFIC
since they are called to reproduce always the same
biochemical work

Modified after Hertkorn et INSIDE THE LIVING CELL


al. (2006) Geochim
Cosmochim Acta
The genetic code controls the
synthesis of the discrete and
ripetitive molecules

OUTSIDE THE CELL

Casual Synthesis of humic


molecules, controlled only by
thermodynamics and kinetics within
the environmental boundaries

The complex heterogeneity of humic matter derives by its causual formation


without repetitive pathways

The difficulty in their analytical determination is due to its complex


supramolecular nature that inhibits reproducible identification of NOM
components
How do we exploit the supramolecular
theory to serve as an Episteme (Science)
for an innovative Techné (Technology)?
A challenge for agricultural and environmental chemists is to
improve understanding of the structure and spacial
arrangement of organic molecules in soils and their influence
on plant nutrition
A detailed molecular characterization of soil organic matter
would allow a Structure-Activity Relationship between
humic molecules and their activity on plants

To reach this goal, as for other field of Science (Genomic,


Proteomic, Metabonomic, Petroleomic),
HUMEOMICS was introduced to enable a detailed structural
mapping of humic molecules
Humeomics
•The supramolecular concept implies that the small and
heterogeneous molecules forming the humic associations
may be selectively separated and analytically determined
one by one

•Humeomics is defined by a standardized procedure to


separate and characterize humic molecules

•Humeomics is possible due to the relatively weak forces


holding together humic molecules

•Humeomics implies no significant nor deliberate Carbon-


Carbon bond destruction
Nebbioso and Piccolo, Biomacromolecules 2011, 12, 1187–1199
Nebbioso and Piccolo, Analytica Chimica Acta, 2012, 720: 77– 90
Nebbioso et al. RSC Advance 2014. 4, 23658-65
Nebbioso et al. Biology and Fertility of Soils 2015, 51, 443–451
Nebbioso et al. Chemical and Biological Technologies in Agriculture 2014, 1:24
Humeomics consists into a sequential separation
of molecules and their analytical determination

1. Organic solvent extraction for molecules


structurally unbound to the humic matrix
2. Transesterification (BF3-MeOH) for molecules
weakly bound to the humic matrix through
ester bonds
3. Alkaline hydrolysis in MeOH for molecules
strongly bound to the humic matrix through
ester bonds
4. HI treatment for molecules strongly bound to
the humic matrix through ether bonds
The fractionation strategy
HA from a soil (RES0) Acidic subfraction
Increasing
Extract (ORG1) non- homogenity
covalent bound Neutral subfraction

Residue (RES1) Devoid


of unbound compounds Acidic subfraction
Alcoholic Org. Fr. (ORG2)
extract of loose Neutral subfraction
ester- bound
compounds Aq. Fr. (AQU2)
Residue (RES2) Devoid
of loose ester-bound
compounds Acidic subfraction

Alcoholic Org. Fr. (ORG3)


extract of tight Neutral subfraction
ester- bound
Aq. Fr. (AQU3)
Residue (RES3) Devoid compounds
of tight ester-bound
BF3 12% inHOMeOH,
O
HO
O
HO
O
HO
O

compounds 90°C,
KOH 1M 8h
in MeOH,
reflux, 2hH I HO
HO
H
Extract (ORG4) Alkyl HI 47% in H2O, COOH
iodides from ether cleavage 70°C, 48h
OH
I
F OF
B
O
OH
O
OH
F O
OH
FO
OH

O
+
B R R'
Residue (RES4) Devoid O
CH2Cl2/MeOH; RT; R R'
O O FHO HO
O
OO F
O
of ether-bound compounds HO
8h O O O
R'R'
HO
R'R' HO
R R OO H R R OIO H
+
I O H COOH
OH
HO
OH
I
F F R R
F
F
B R' B
O
OH
+ HOO OHR'
O
R' O F O O F OH
OH O HO
O

H R'
R O R R OO
I R' O H OO OH
HO
R
Humeomic fractionation

RES0

ORG1 ORG2 AQU2 ORG3 AQU3 ORG4 RES4


Applied Instrumental Methods
13C-CPMAS-NMR
Solid Residues
TMAH-Thermochemolysis-GC-MS
HPSEC-ESI-MS

Organosoluble fractions 1D- and 2D-NMR


GC-MS

1D- and 2D-NMR


Hydrosoluble fractions TMAH-Thermochemolysis-GC-MS
HPSEC-ESI-MS

Nanjing 2012
Elaborating results: GC-MS, ESI-MS and NMR
74
74 O
100

O 87 O

87
87

55
M-43
69
M+
83
143 M-31
97 129 227 270
115 157 171 185 199 213 239
0 m/z
67 87 107 127 147 167 187 207 227 247 267

In GC-MS, fatty acids are derivatized and characterized by comparing their


fragmentation profile with a database
74 57 O
100
29 O COSY experiments correlate protons TOCSY experiments correlate protons
on adjacent carbons on the same chain
87

55 M-57
69 143 199 H H H O
97 M-29 M+
115 129 213
157 171 185 227 256
281
H
0
46 66 86 106 126 146 166 186 206 226 246 266 286
m/z
n OH
H
Likewise branched structures are revealed H H H H

283.1016 283.2619
C10H19O9 C18H35O2

HSQC experiments show to which carbon


each proton is bound

Elettrospray source can characterize due to exact mass measurement.


However this route can not reveal isomerism
Humeomics on a HA extract
from a volcanic forest soil
GC-MS (TIC)
chromatograms
of:

(A) ORG1,

(B) ORG2
neutral
subfraction,

(C) ORG2
acidic
subfraction,

(D) ORG3
Nebbioso and Piccolo,
Biomacromolecules 2011,
12, 1187–1199
Amount (μg g-1 of original HA weight) of compound
classes detected by GC-MS in Humeomics fractions
from HA

Nebbioso and Piccolo, Biomacromolecules 2011, 12, 1187–1199


HPSEC-ESI-MS chromatograms and mass spectra of RES0 and AQU2

Nebbioso and Piccolo, Biomacromolecules 2011, 12, 1187–1199


HPSEC-ESI-MS (TIC) chromatogram of HA (RES0) HPSEC-ESI-MS (TIC) chromatogram of AQU2
Amount (μg g-1 of original HA weight) of compound
classes detected by by HPSEC-ESI-MS in Humic
Fractions Separated by Humeomics

Nebbioso and Piccolo, Biomacromolecules 2011, 12, 1187–1199


1H-NMR 13C-CPMAS-NMR

1H-NMR spectra
and 13C-CPMAS-
NMR of humic
fractions separated
by Humeomics.

Nebbioso and Piccolo,


Biomacromolecules 2011, 12,
1187–1199
Weight yield of Humeomics on a HA extract
from a volcanic soil
100

80
% Yield of fractionation

Unaccounted weight = 40.20% due to losses of


60 inner water molecules, decarboxylation, and
volatile small compounds

40

20

0
RES0 ORG1 ORG2 AQU2 ORG3 RES4

Separated Fractions
Nebbioso and Piccolo, Biomacromolecules 2011, 12, 1187–1199
RES4 shows 66 % of quaternary sp2 carbon
Integral areas
Spectral 150-185 95-150 0-60
region ppm ppm ppm

CPMAS 1.00 3.42 1.30


DD 1.00 2.47 0.42

2.47/3.42=~0.66

What are these quaternary


carbons?

Nebbioso and Piccolo,


Biomacromolecules 2011, 12, 1187–1199
Further HPSEC fractionation of RES4

f1
f10 f2

f9 f3
RES4
f8 f4

f7 f5
f6

Preparative HPSEC-UV chromatogram (280 nm)


of RES4: 5 mL of 0.2 mg/mL conc.
Gravimetric Yields
RES4f 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Tot Inj
mg 4.7 8.8 7.3 7.4 6.7 3.9 3.1 1.1 1.5 0.5 45 50

Nebbioso et al., 2014. RSC Advance 4, 23658-65


Empirical Bulk Size-Fractions Sum of
formula RES4 fractions

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
Amount (µg g-1 of
Alkanoic acids total HA) of molecular
C10H20O2 77 18 23 27 35 28 34 31 37 45 201 479 components
C12H24O2 48 27 29 35 47 33 83 54 40 61 103
C14H28O2 179 256 298 289 146 187 667 484 266 343 607
512
3544
(empirical formulae)
C15H30O2 191 389 411 317 431 230 791 545 229 372 400 4113 found by hyphenated
C16H32O2 324 1000 1190 655 908 341 784 896 450 468 1090
C17H34O2 25 144 242 98 132 57 179 143 53 96 134
7782
1278
HPSEC-ESI-MS for
C18H36O2 8 122 145 104 422 25 67 160 50 59 99 1254 RES4, ten size-
Unsaturated alkanoic acids fractions, and sum of
C14H26O2 46 37 52 64 80 36 168 106 53 98 117 812
C16H30O2 326 537 708 828 1032 518 2054 1290 496 1035 899 9397
size-fractions, as
C18H34O2 59
341 713 423 13108 168 507 415 150 678 625 empirical formulae
17127
Unsaturated hydroxyacids
C6H10O3 33 15 24 24 38 58 34 65 32 46 176 511
C7H12O3 23 17 28 13 33 35 38 42 27 21 93 346
C18H34O3 22 46 21 50 72 29 49 41 18 106 243 675
Other unsaturated oxygenated acids The sum of each
C15H22O4
C17H26O4
9
13
22 24 12 73 67 186 368 71 217 426 1467 specific molecule in
60 21 44 37 41 59 450 163 154 111 1138
C17H26O5 19 12 9 6 40 36 65 233 59 103 80 642
the 10 fractions was
C18H34O4 22 9 5 9 13 3 14 12 6 23 16 110 always significantly
C18H36O4 4 33 8 8 43 2 7 5 3 22 27
C18H34O5 4 31 4 3 125 2 1 3 2 51 34
157
257
large that than found
C19H30O5 2 28 10 8 10 19 23 391 9 103 12 611 in the orginal RES4
C19H28O4N2 0
7 0 0 5 0 0 0 2 7 4
26
C19H30O6 8 7 7 2 23 25 54 256 26 125 52 576
C20H24O3 9 25 21 8 6 4 8 24 6 29 30 161
C21H26O3 8 19 16 3 4 2 5 12 3 15 16 94
C21H34O6 0 15 3 3 3 12 8 265 4 67 7 385
Cyclic acids
C7H6O2 4336 16336 17068 19570 10345 9587 12093 14422 47210 12619 34382
193632
C6H4O5 7888 27484 9568 54330 28015 19636 23654 24775 55316 18970 53960 Nebbioso et al., 2014. RSC
315708 Advance 4, 23658-65
C7H6O8 9158 11842 9711 65224 16093 9249 9092 7834 8826 5427 3518
146816
Structural characterization of some quaternary
carbons through HPSEC-ESI-MS/MS

Nebbioso et al., 2014. RSC Advance 4, 23658-65


DIRECT APPLICATION OF
HUMEOMICS TO AN
AGRICULTURAL SOIL
Quality and quantity of humic molecules obtained by Humeomics
directly applied on a agricultural soil (Torino silty-loamy) were
compared with those in a NOM extract from the same soil

SOIL NOM

Weakly Strongly
Ether Mineral
Sample Unbound Ester Ester
bound bound
bound bound

RES3 RES4 RES OM


RES2
RES1
SOIL ORG2 ORG3 AQU4 HF
treatment
ORG1
AQU2 AQU3
HCl
treatment
Mass yield of OM extraction
2325mg
2500

2000
1250mg
1500

mg
1000

500

0
Percent yield of OM extraction
2500 186%
2000
100%
1500

mg
1000

500

0
Elemental Analysis
C H N
250
163.9mg C
200

150 72.5mg C
mg
100

50

0
The distribution of molecular
components in SOM by Humeomics
van Krevelen plots are built by Fourier Transform Ion
Cyclotron Resonance Mass Spectrometry (FTICR-MS)
Top-down approach by
FTICR-MS: get the
empirical formulae but not
the structure

Buttom-up approach by
Humeomics: get the
structural fomulae first and
then build a real van
van Krevelen Plot Krevelen Plot

HPSEC-ESI-MS Orbitrap - for hydrosoluble AQU, RESOM and NOM


fractions
GC-MS - for organosoluble fractions (ORG)
NOM extract by ESI-MS Orbitrap
3.0 NOM
23 compounds Identified
2.5

Atomic ratio of H/C


2.0

1.5

1.0

0.5

0.0 0.5 1.0 1.5


Atomic ratio of O/C
45
NOM
40

35
Relevant % Percentage

30

25

20

15

10

0
AA

BA
DA

FA
HA

PA

RA
SA
AM

IM
ET

ST
HO
AC
AD

HN

PH

SU
ES

KE

PAH

PE

SE
AL
Humeomics

Unbound ORG1
Aliphatic C

 36% Fatty acids


 49% Alkanes

4000 3500 3000 2500 2000 1500 1000 cm-1


Unbound ORG1

HO

O
Unbound ORG1
3.0 ORG1

2.5
39 compounds Identified

Atomic ratio of H/C


2.0

1.5

1.0

0.5

0.0 0.5 1.0 1.5


Atomic ratio of O/C
70
65 ORG1
60
55
Relevant % Percentage

50
45
40
35
30
25
20
15
10
5
0
AA

BA
DA

FA
HA

PA

RA
SA
AM

IM
ET

ST
HO
AC
AD

HN

PH

SU
ES

PAH
KE

PE

SE
AL
Weakly Ester bound ORG2 Humeomics

C=O C-O

 54% Fatty acids


 31% Sugars

4000 3500 3000 2500 2000 1500 1000 cm-1


Weakly Ester bound ORG2
OH

HO OH

HO O OH

O OH
HO

HO OH

OH

HO

HO

O
Weakly Ester bound ORG2
3.0 ORG2

2.5
19 compounds Identified

Atomic ratio of H/C


2.0

1.5

1.0

0.5

0.0 0.5 1.0 1.5


Atomic ratio of O/C
70
65 ORG2
60
55
Relevant % Percentage

50
45
40
35
30
25
20
15
10
5
0
AA

BA
DA

FA
HA

PA

RA
SA
AM

IM
ET

ST
HO
AC
AD

HN

PH

SU
ES

PAH
KE

PE

SE
AL
Weakly Ester bound AQU2

 24% Benzoic
acids
 27% Amides

4000 3500 3000 2500 2000 1500 1000 cm-1

12 10 8 6 4 2 0
 H(ppm)
1
Weakly Ester bound AQU2
3.0 AQU2

2.5
33 compounds Identified

Atomic ratio of H/C


2.0

1.5

1.0

0.5

0.0 0.5 1.0 1.5


Atomic ratio of O/C
70
65 AQU2
60
55
Relevant % Percentage

50
45
40
35
30
25
20
15
10
5
0
AA

BA
DA

FA
HA

PA

RA
SA
AM

IM
ET

ST
HO
AC
AD

HN

PH

SU
ES

PAH
KE

PE

SE
AL
Strongly Ester bound ORG3 Humeomics

Aliphatic C

C=O

 43% Fatty acids


 33% Phenolic
acids
4000 3500 3000 2500 2000 1500 1000 cm-1
Strongly Ester bound ORG3

HO

HO

OH

HO HO

O
O OH

OH
Strongly Ester bound ORG3
3.0 ORG3
24 compounds Identified
2.5

Atomic ratio of H/C


2.0

1.5

1.0

0.5

0.0 0.5 1.0 1.5


Atomic ratio of O/C
70
65 ORG3
60
55
Relevant % Percentage

50
45
40
35
30
25
20
15
10
5
0
AA

BA
DA

FA
HA

PA

RA
SA
AM

IM
ET

ST
HO
AC
AD

HN

PH

SU
ES

PAH
KE

PE

SE
AL
Strongly Ester bound AQU3

 28% Esters
 15% Amines
4000 3500 3000 2500 2000 1500 1000 cm-1

Carbohydrates decreased 12 10 8 6 4 2 0
 H(ppm)
1
Strongly Ester bound AQU3
O O
HO

NH N OH
H

NH2

CH3

CH3

O O
H3C

CH3
H3C O

OH

H3C
N
N
CH3
H N
N
N CH3
Strongly Ester bound AQU3
3.0 AQU3

40 compounds Identified
2.5

Atomic ratio of H/C


2.0

1.5

1.0

0.5

0.0 0.5 1.0 1.5


Atomic ratio of O/C
70
65 AQU3
60
55
Relevant % Percentage

50
45
40
35
30
25
20
15
10
5
0
AA

BA
DA

FA
HA

PA

RA
SA
AM

IM
ET

ST
HO
AC
AD

HN

PH

SU
ES

PAH
KE

PE

SE
AL
Ether bound AQU4 Humeomics

 47% Heterocyclic N Ethers


 30% Amides

4000 3500 3000 2500 2000 1500 1000 cm-1


Ether bound AQU4
H3C
H3C
O
CH3 O H
N O N

N
O

O
NH

H3C O NH
N N
O N

N
H3C
CH3
N

H3C

HO
O
Ether bound AQU4
3.0 AQU4

2.5
65 compounds Identified

Atomic ratio of H/C


2.0

1.5

1.0

0.5

0.0 0.5 1.0 1.5


Atomic ratio of O/C
70
65 AQU4
60
55
Relevant % Percentage

50
45
40
35
30
25
20
15
10
5
0
AA

BA
DA

FA
HA

PA

RA
SA
AM

IM
ET

ST
HO
AC
AD

HN

PH

SU
ES

PAH
KE

PE

SE
AL
Humeomics
Mineral bound RESOM

Aliphatic  14% Heterocyclic O


HF treated  66% Ethers

More Aromatic
NOM

4000 3500 3000 2500 2000 1500 1000 cm-1

RESOM
12 10 8 6 4 2 0
 H(ppm)
1
Mineral bound RESOM
OH OH OH
HO
HO
HO
OH
O HO
O
OH
O HO O O
HO
O O
O OH
O O
O
H O
HO O OH
O OH
OH
HO
O
Fe OH
O O
O
Fe O
Fe
Fe
Mineral bound RESOM
3.0 RESOM
31 compounds Identified
2.5

Atomic ratio of H/C


2.0

1.5

1.0

0.5

0.0 0.5 1.0 1.5


Atomic ratio of O/C
70
65 RESOM
60
55
Relevant % Percentage

50
45
40
35
30
25
20
15
10
5
0
AA

BA
DA

FA
HA

PA

RA
SA
AM

IM
ET

ST
HO
AC
AD

HN

PH

SU
ES

PAH
KE

PE

SE
AL
Humeomics improve detectability of
molecular components of SOM

ESI/MS on NOM extracted from Soil identified 23


compounds mainly aromatic esters.
ESI/MS & GC/MS on Humeomic fractions extracted
directly from Soil identified 249 compounds plus 29
isomers.
Humeomics improve detectability
3,0
3.0 AQU4
AQU2
ORG1
RESOM
AQU3
ORG2
ORG3

2.5
2,5
Atomic ratio of H/C

2.0
2,0

1.5
1,5

1.0
1,0

0.5
0,5

0.0
0,0 0.5
0,5 1.0
1,0 1.5
1,5
Atomic ratio of O/C
DIFFERENTIATING SOM
DYNAMICS IN AGRICULTURAL
SOIL BY HUMEOMICS
Soil under traditional tillage after
1 and 3 years
mg C
350
338.1mg C 256.1mg C
300
300

250 150.4mg C 250 149.8mg C


200
200

150 150

100 100

50 50

0 0

1st year 3rd year


60
2,2 TRAI ORG1 TRAI ORG1
55
2,0
AC, AD, KE 50
45
Atomic ratio of H/C

Relevant % Percentage
1,8 40
35
1,6
30
1,4 25
20
1,2 15
10
1,0
5
0,8 0
0,0 0,2 0,4 0,6 0,8 1,0

DA
BA

FA
HA

PA

RA
SA
IM

ST
AC
AD
AH

HC

PAH

PH

SU
ES

KE

PE

SE
SES
AL
Atomic ratio of O/C
60
2,2 TRAIII ORG1
TRAIII ORG1

Aliphatic Esters
55

Alkanes/alkenes
2,0 50
45
Atomic ratio of H/C

1,8 Relevant % Percentage


40
35
1,6
30

1,4 25
20
1,2 15
10
1,0
5

0,8 0
0,0 0,2 0,4 0,6 0,8 1,0
DA
BA

FA
HA

PA

RA
SA
IM

ST
AC
AD
AH

HC

PAH

PH

SU
ES

KE

PE

SE
SES
AL

Atomic ratio of O/C


60
TRAI ORG2
55 TRAI ORG2
2,0
50
1,8 45

Relevant % Percentage
Atomic ratio of H/C

40
1,6
35
1,4 30
25
1,2
20

1,0 15
10
0,8 5
0
0,0 0,2 0,4 0,6 0,8 1,0 1,2

DA
BA

FA
HA

PA

RA
SA
IM

ST
AC
AD
AH

HC

PAH

PH

SU
ES

KE

PE

SE
SES
AL
Atomic ratio of O/C
TRAIII ORG2 60
55 TRAIII ORG2
2,0
50
1,8
45

Relevant % Percentage
Atomic ratio of H/C

1,6 40
35
1,4 30
25
1,2
20
1,0 15
10
0,8 5
0
0,0 0,2 0,4 0,6 0,8 1,0 1,2
DA
BA

FA
HA

PA

RA
SA
IM

ST
AC
AD
AH

HC

PAH

PH

SU
ES

KE

PE

SE
SES
AL

Atomic ratio of O/C


2,2 60
TRAI ORG3 TRAI ORG3
55
2,0
50
Atomic ratio of H/C

1,8 45

Relevant % Percentage
1,6 40
35
1,4
30
1,2 25

1,0 20
15
0,8
10
0,6 5
0
0,0 0,2 0,4 0,6 0,8 1,0 1,2

DA
BA

FA
HA

PA

RA
SA
IM

ST
AC
AD
AH

HC

PAH

PH

SU
ES

KE

PE

SE
SES
AL
Atomic ratio of O/C
2,2 60
TRAIII ORG3 TRAIII ORG3
55
2,0
50
1,8
45 C sequestration?
Relevant % Percentage
Atomic ratio of H/C

1,6 40
35
1,4
30
1,2 25
1,0 20
15
0,8
10
0,6 5
0
0,0 0,2 0,4 0,6 0,8 1,0 1,2
DA
BA

FA
HA

PA

RA
SA
IM

ST
AC
AD
AH

HC

PAH

PH

SU
ES

KE

PE

SE
SES
AL

Atomic ratio of O/C


Fatty acids as a SOM marker
Originating from plant decay
TRA I TRA III
saturated FA
82%
75%
ORG1
unsaturated FA
18%
25%
saturated FA
90%
95%
ORG2
unsaturated FA
10%
5%
saturated FA
95%
87%
ORG3
unsaturated FA
5%
13%

Originating from microbial activity possibly


because of the high sugar content of ORG2
Conclusions
Humeomics applied directly on agricultural soils provide the
molecular link between agricultural practices and SOM, and
carbon pools dynamics.
SOM evaluation by direct humeomics allow larger molecular
detectability than by NOM extraction.
Increased analytical yields for both fractionated and
unfractionated humic matter
Simplified readability of spectra and chromatograms of
humic matter after Humeomic fractionation
Unprecedented characterization of highly oxygenated cyclic
compounds containing non aromatic quaternary carbons
Significant enhancement of humic molecules separation
from soil
GENERAL CONCLUSIONS
Overall findings support understanding of humic matter as
SUPRAMOLECULAR ASSOCIATIONS of different classes of
molecules which are susceptible of structural identification
An improved and standardized of chemical fractionation, the
HUMEOMIC SCIENCE, may lead to a complete identification of the
molecular composition of humic superstructures.
Development of Humeomics may contribute to solve the Structure-
Bioactivity relationship and cast the foundations of a modern
sustainable Agriculture
Advance knowledge of SOM molecular composition by Humeomics
may enable better understanding of soil processes and
technological control of organic carbon in soil (SOM dynamics
in different land use, OC sequestration in soil and its sink capacity,
fertility and soil quality maintanance).
THANKS TO YOU FOR ATTENTION
Special thanks for the essential collaboration to Dr Marios
Drosos and Dr. Antonio Nebbioso, post-docs at CERMANU

More information on www.suprahumic.unina.it


Lorena Gómez-Aparicio
El suelo como factor clave para entender el futuro de
los ecosistemas terrestres ante el Cambio Global

Lorena Gómez Aparicio


Grupo de Investigación en Sistemas Forestales Mediterráneos (SIFOMED)
Dpto. Biogeoquímica, Ecología Vegetal y Microbiana
Uniendo el compartimento aéreo y subterráneo de los
ecosistemas terrestres
Uniendo el compartimento aéreo y subterráneo de los
ecosistemas terrestres
Interacciones planta-suelo y cambio global
Incremento de CO2

Cambio Climático Deposición de N

Cambio
Global

Especies invasoras Cambios en los usos


del suelo
Interacciones planta-suelo e incremento de CO2
La textura del suelo modula la respuesta de la producción primaria al
incremento de CO2 atmosférico

The LYCOG (Lysimeter CO2 Gradient) facility


Blackland prairies (Texas, USA)

“Understanding soil-mediated controls in ecosystem responses


to increased CO2 is critical for predicting how future ecosystem
carbon cycling may differ across the landscape”
Interacciones planta-suelo y cambio climático

La textura del suelo modula el efecto de cambios en la precipitación


sobre la supervivencia arbórea

Current scenario
Warmer scenario (Δ3ºC)

n = 755 parcelas de alcornoque (Q. suber) por toda Andalucía


Interacciones planta-suelo y cambio climático

La capacidad de almacenamiento de agua del suelo modula el efecto


de eventos de sequía extrema sobre la supervivencia arbórea
Bosques mixtos de Pinus edulis y Juniperus osteosperma

Peterman et al (2013) Ecohydrology


Interacciones planta-suelo y cambio climático
Considerar el factor suelo en los Modelos de Distribución de Especies
es fundamental para mejorar el realismo de sus predicciones

Climate Climate + Soil

Climate Climate + Soil


Interacciones planta-suelo y cambio climático
Considerar el factor suelo en los Modelos de Distribución de Especies
es fundamental para mejorar el realismo de sus predicciones
Interacciones planta-suelo y especies invasoras

Los organismos del suelo como determinantes del carácter invasor de


las especies vegetales

“Enemy release hypothesis” aplicada al suelo…

Centaurea maculosa

El éxito invasor de muchas especies de


plantas se explica gracias al “escape” de
microorganismos patógenos reguladores
Nativa Exótica
de su abundancia
Callaway et al (2004) Nature
Interacciones planta-suelo y especies invasoras

Algunas de las especies invasoras más destructivas son microorganismos


edáficos con efectos letales sobre las plantas…

Decaimiento de encinas (Quercus ilex) y alcornoques


(Quercus suber) en la Península Ibérica

Phytophthora
cinnamomi

Brasier et al (1992) Nature


Interacciones planta-suelo y especies invasoras

Algunas de las especies invasoras más destructivas son microorganismos


edáficos con efectos letales sobre las plantas…

… cuya abundancia está fuertemente determinada por la textura del suelo


Interacciones planta-suelo y especies invasoras

Los efectos de especies animales invasoras sobre la vegetación


pueden estar mediados por su impacto sobre las propiedades del suelo

Kardol et al (2014) Journal of Ecology


Interacciones planta-suelo y eutrofización

Los efectos indirectos mediados por el suelo de los animales sobre las
plantas pueden ser más importantes que los efectos directos

δ15 NS NestFreq EC 0-10 EC10-25 δ13 CL

0.87 0.93 0.87 0.98 0.81

0.72 0.60
BIRDS SALINITY STRESS
2
r2 = 0.52 r = 0.35

- 0.94
-0.38

HEALTH
2
r = 0.88

-0.76 0.86

CT CDI

García et al (2011) Biological Conservation


Interacciones planta-suelo y eutrofización

La heterogeneidad espacial de los recursos del suelo condiciona la


respuesta de la vegetación a la cantidad de recursos

Mayor respuesta en
suelos heterogéneos
Consecuencias del Cambio Global sobre la biodiversidad
Importantes pérdidas en distintos grupos de animales y plantas

Porcentaje de especies amenazadas de extinción

Relación diversidad-función

Chapin et al (2000) Nature

Cardinale et al (2012) Nature


Consecuencias del Cambio Global sobre la biodiversidad
La importancia de mirar a la biodiversidad edáfica…
Consecuencias del Cambio Global sobre la biodiversidad
La importancia de mirar a la biodiversidad edáfica…
Consecuencias del Cambio Global sobre la biodiversidad
La rápida respuesta de las comunidades edáficas al cambio global
puede controlar la dinámica vegetal en los nuevos escenarios

Bardgett & van der Putten (2014) Nature


Consecuencias del Cambio Global sobre la biodiversidad
La rápida respuesta de las comunidades edáficas al cambio global
puede controlar la dinámica vegetal en los nuevos escenarios

-20% -58%

Brassica rapa

Dry plants
Wet plants

Lau & Lennon (2012) Proceedings of the National


Academy of Sciences of USA
En resumen…

 La respuesta de la vegetación a los distintos componentes del


cambio global está fuertemente determinada por las características
físicas, químicas y biológicas del suelo

 El realismo y precisión de los modelos que traten de predecir los


efectos del cambio global sobre la vegetación mejorará
sustancialmente si se tiene en cuenta el suelo

 Son necesarios mejores y más abundantes datos de suelos a las


escalas relevantes para la vegetación
En resumen…

“… the need to identify edaphic


physiological tresholds beyond
which species are not able to
survive”

No sólo importa identificar condiciones


óptimas para las especies, sino las
condiciones extremas que son capaces de
tolerar
Gracias por vuestra asistencia y
atención
M. Carmen Hermosín
Jornada del Año Internacional de los Suelos
EL IRNAS Y EL SUELO: Alianza y Complicidad
Sevilla, 30 Octubre 2015

Rompiendo fronteras
•Aprendiendo del pasado:
•La alianza y complicidad por parte de los grupos de Ciencia de Suelo del IRNAS del 85-95
nos hizo sobrevivir, resistir y crecer en un entorno desfavorable
•Aumentamos nuestro carácter pluridisciplinar

•Mirando al presente
•Mantenemos buenos niveles de captación de fondos, producción científica e indicadores
científicos
•Los indicadores de las revistas de suelos bajan peligrosamente cada año, no están de
moda

•Mirando al futuro:
•Hay que hacer una ciencia más básica, imaginativa, de riesgo y puntera
•Crear alianzas con las ciencias más punteras e innovadoras: romper fronteras
•Emplear tecnicas innovadoras y de ultima generación: son accesibles
•Hacer nuestros resultados atractivos para Nature, Science, PENAS,…
•Poniendo esfuerzo, rigor, ganas, imaginación y sobre todo pasión: la recompensa es grande
Jornada del Año Internacional de los Suelos
EL IRNAS Y EL SUELO: Alianza y Complicidad
Sevilla, 30 Octubre 2015

Caracterized by: X-ray Difraction, UV-VIS and Mossbauer spectrocopy


Jornada del Año Internacional de los Suelos
EL IRNAS Y EL SUELO: Alianza y Complicidad
Sevilla, 30 Octubre 2015

Imágenes por Fluorescencia


de O2 y pH
MALDI-IMS (Matrix-assisted
laser desorption/ionisation
imaging mass spectrometry)

*La combinacion de la imagen permite elegir zonas radiculares y


de suelo en relación con la riqueza de oxigéno y pH.
*La presencia del fungicida metalaxil está relacionada con la
abundancia de oxigéno y su comportamiento enantioselectivo
con el pH.
Este trabajp abre puertas interesantísimas para el estudio de
procesos en los microespacios de la interfase suelo-raiz
Jornada del Año Internacional de los Suelos
EL IRNAS Y EL SUELO: Alianza y Complicidad
Sevilla, 30 Octubre 2015

La MFA proporciona imágenes a escala subnano (casi capas


monomoleculare) de sólidos: Aplicación a la disolucion de biotita a
pH de suelos agrícolas (4,6 y 8) y en ácidos orgánicos del entorno
radicular (rizosfera: interfase raiz-suelo)

Muestra las marcas y relieves formados en la biotitas que


confirman que su disolucion-transformacion ocurre
simultaneamente a todos los pH, produciendo un recubrimiento de
sales que impiden el avance de la disolución y pudieran estabilizar
la microestructura del suelo en manejos a largo plazo
Jornada del Año Internacional de los Suelos
EL IRNAS Y EL SUELO: Alianza y Complicidad
Sevilla, 30 Octubre 2015

*Estos ejemplos transgreden fronteras de otras ciencias como la química de


orgonometálicos, la bioquímica fundamental o la ciencia de materiales

*Si queremos, podremos hacer frente a estos retos…aunque además….

…..trabajar para las empresas…..

GRACIAS POR SU ATENCION Y ASISTENCIA!!!

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