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Presentación
El hecho de la celebración del Año Internacional de los Suelos nos obligaba como
Instituto de Recursos Naturales y Agrobiología de Sevilla, dedicado desde su
fundación al estudio de los mismos, a hacer una reflexión sobre nuestro papel en la
Ciencia del Suelo y echar a la vez una mirada a nuestro futuro. Así se me encargó por
parte de la dirección y con la ayuda de todos, espero que esta Jornada sirva un poco
para ver que hemos hecho, pero sobre todo que estamos haciendo y qué queremos
hacer. El título elegido no es banal, creo que si los grupos de suelos seguimos siendo
fuertes en nuestro instituto en cuanto a captación de fondos, producción científica e
indicadores científicos es porque hubo mucho de “Alianza y Complicidad” para resistir
la escasez de recursos y la mala “prensa” que la Edafología tuvo durante los años 85-
95 en nuestra casa. Sin duda, creo que estas dificultades nos sirvieron de acicate para
abrirnos a otros horizontes y disciplinas que enriquecieron nuestra Ciencia,
aumentando el carácter multidisciplinar que ya tenía.
Repitiendo las palabras de Claire Chenu en la web del año internacional de suelo: hoy
existe una febril y cabal preocupación por la seguridad alimentaria, la seguridad
energética, la seguridad hídrica, la biodiversidad y el cambio climático, pero no se
presta la misma atención a la seguridad de los suelos, que está íntimamente ligada a
los considerados grandes problemas para la población mundial. Es totalmente
necesario velar por la calidad y salud de los suelos desde la investigación, pero
desgraciadamente la Ciencia también está sujeta a los avatares de las modas y los
indicadores de las revistas dedicadas a la Ciencia de Suelo bajan peligrosamente cada
año. Sigue siendo un reto para los científicos actuales de suelo, volver a hacer nuestra
ciencia puntera, atractiva y capaz de afrontar retos imaginativos y de riesgo, que
permitan dar saltos cualitativos y hacer que nuestra investigación compita en Nature,
Science o PENAS. Los medios y equipamientos actuales tanto analíticos,
espectroscópicos, microscópicos, computacionales, de grandes instalaciones,
etc….han avanzado enormemente, de forma que solo hay que ponerle ganas, tiempo,
rigor y sobre todo pasión a nuestro trabajo, aliándonos con las ciencias más punteras y
novedosas: ahí está el reto actual y como siempre desde el IRNAS sabremos
responder.
M. Carmen Hermosín
Profesora de investigación
IRNAS-CSIC
Jornada AIS-2015 Año Internacional de los Suelos, Sevilla 30 Octubre 2015
RESUMENES DE LAS
CONFERENCIAS
Jornada AIS-2015 Año Internacional de los Suelos, Sevilla 30 Octubre 2015
Diego de la Rosa
Se lleva a cabo una revisión somera de los primeros estudios cartográficos para el
reconocimiento de los suelos (Soil Survey <> Soil Mapping), con especial referencia a
los desarrollados en el Centro de Edafología y Biología Aplicada del Cuarto,
actualmente Instituto de Recursos Naturales y Agrobiología de Sevilla. Justo con los
avances tecnológicos de los años 80 en el campo de la Teledetección, las
Matemáticas y la Informática (Information and Communication Tecnologies), que
permitían capturar, almacenar, analizar y visualizar grandes volúmenes de
información, se produce el abandono del reconocimiento sistemático de los suelos.
Hoy se considera este abandono un grave error para el desarrollo y aplicación de la
investigación científica en suelos, que se produjo también en los demás institutos
edafológicos del CSIC y en otros centros de diferentes países. La extraordinaria
variabilidad geográfica de los suelos, aun por explorar, obliga a retomar los estudios
cartográficos a escalas detalladas, de inventario y monitorización, haciendo
obviamente uso de dichos avances tecnológicos (ej.: GPS, GPR, PXRF, RS, GIS).
<> Precision Agriculture). En otras palabras, se trata de “cultivar los suelos en vez de
los campos” siguiendo un tratamiento individualizado de acuerdo con las
potencialidades y limitaciones edáficas.
Jornada AIS-2015 Año Internacional de los Suelos, Sevilla 30 Octubre 2015
IRNAS, CSIC
A partir de los años 70, debido a la preocupación por los problemas ambientales, los
objetivos de los estudios de Química coloidal del suelo, centrados fundamentalmente
en la dinámica de los nutrientes, se desplazan haciala dinámica de los contaminantes.
Los elementos traza y los plaguicidas, principales contaminantes potenciales del aire,
agua, y suelo, se convierten en el objetivode muchos estudios desarrollados en el
CEBAC, no sólo en los suelos, sino también en las aguas y los sedimentos. Esta
circunstancia, entre otras, lleva al cambio de su denominación a la de IRNAS, y a su
reestructuración en ocho Unidades, en tres de las cuales se desarrollaban estudios de
Química ambiental del suelo, relacionados con diversos tipos de contaminantes, con la
utilización de residuos orgánicos (residuos de almazara, vinazas, composts, etc.) como
fertilizantes, enmiendas o acondicionadores orgánicos, con la caracterización de
sustancias orgánicas en sedimentos y suelos, etc.
El accidente de Aznalcóllar en 1998, vino a poner en valor los estudios realizados 10-
15 año antes y a ampliar las investigaciones sobre los elementos traza: diagnóstico y
recuperación de los suelos contaminados, monitorización de la contaminación en
suelos sometidos a recuperación, así como de la vegetación natural o introducidaen lo
que hoy es el paisaje protegido ‘Corredor Verde del Guadiamar’, etc.
Untie the knot of soil organic matter chemistry enables additional differentiation
among soils and their managements
Alessandro Piccolo
Humic Substances (HS) represent the most stable fraction of soil organic matter and it
affects the soil physical-chemical and biological properties, being fundamental for its
quality and fertility. The heterogeneous and complex nature of humic components
represents the main difficulty against the elucidation of the structure and dynamics of
soil organic matter. Our recent findings have provided significant experimental
evidence supporting the model of HS as supramolecular associations of relatively small
molecules held together by hydrophobic and hydrogen bonds. These results were
based on a series of experiments which showed that the conformations of humic
suprastructures were altered by additions of small amounts of organic acids, while
those of real macropolymers were not. Mono- and di-alkanoic acids acids were found
to disrupt the weak association of humic molecules, whereas such disruption was not
observed for the covalently stabilized polymers.
El suelo como factor clave para entender el futuro de los ecosistemas terrestres
ante el Cambio Global
IRNAS-CSIC
Los ecosistemas terrestres están compuestos por dos subsistemas, uno aéreo y otro
subterráneo, que han sido históricamente estudiados en gran parte por separado. Sin
embargo, en la última década se ha puesto de manifiesto que el entendimiento de la
respuesta de los ecosistemas al Cambio Global sólo puede ser alcanzado mediante la
consideración de los procesos de retroalimentación planta-suelo y su papel en la
regulación de la estructura de las comunidades y los ciclos biogeoquímicos.Por
ejemplo, se ha demostrado que características físicas del suelo como la textura
pueden condicionar el signo y la magnitud de la respuesta de las plantas a
incrementos en la concentración atmosférica de CO2 o a los cambios previstos del
clima. Así mismo, la consideración del componente biótico del suelo ha permitido
encontrar nuevas respuestas a viejas preguntas, como por ejemplo cuáles son los
factores que permiten a una especie exótica convertirse en invasora. Estudios
recientes muestran que las especies de plantas invasoras son aquellas que han
conseguido escapar al control por patógenos edáficos que actúan como reguladores
de su abundancia en las zonas de origen pero están ausentes en los suelos de las
zonas invadidas.
Cada vez es más evidente que los distintos componentes del Cambio Global no sólo
pueden implicar pérdidas de biodiversidad de plantas y animales terrestres, sino
también importantes alteraciones en la composición y diversidad de la comunidad
edáfica. Lo que es más, dado que las características intrínsecas de los organismos del
suelo (ciclos de vida corto, rápidos procesos evolutivos) les confieren una capacidad
de respuesta a los cambios ambientales mucho más rápida que la de las plantas se ha
sugerido que podrían ser ellos los que, mediante la introducción de nuevos rasgos o
estrategias de vida, dirijan la re-organización y adaptación de las comunidades
vegetales a las nuevas condiciones reinantes en un mundo cambiante. En conclusión,
la investigacióny gestión de los sistemas terrestres ante el Cambio Global no puede
ser entendida sin la consideración explícita del factor suelo, cuyo reconocimiento como
modulador clave de la respuesta de las plantas a los distintos factores de cambio no
ha hecho más que empezar.
Jornada AIS-2015 Año Internacional de los Suelos, Sevilla 30 Octubre 2015
PÓSTERS DE GRUPOS
Jornada AIS-2015 Año Internacional de los Suelos, Sevilla 30 Octubre 2015
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PRESENTACIONES
Jornada AIS-2015 Año Internacional de los Suelos, Sevilla 30 Octubre 2015
Prof. Hermosín - Premio de Investigación sobre Temas Andaluces ‘Plácido Fernández Viagas’ (XVIII ed., 2012)
Dr. J.J. Ortega - Presidente para 2016 de la Sociedad Europea de Toxicología y Química Ambiental
Composición de residuos orgánicos de interés agronómico y sus efectos en el suelo, efectos de incendios forestales
en el status de la MO del suelo, análisis del origen y composición química de formas refractarias de materia
orgánica en suelos.
Impacto de factores ambientales en los
ciclos biogeoquímicos del C y N, su
implicación en la sostenibilidad de los
ecosistemas, en el secuestro de C y N y en
el cambio climático global.
400
350
Y-Coordinates (mm)
300
250
200
150
100
50
0
0 100 200 300 400 500 600 700
X-Coordinates (mm)
Fitorremediación.
Mejora del riego a partir del estudio de las propiedades físicas del
suelo, de la ecofisiología del cultivo y del uso de nuevos
indicadores de estrés hídrico.
Riego de precisión.
La actividad del IRNAS sigue los criterios del “Periodo Integrador” que comenzó a
principios 1990s, en el que se contempla la multifuncionalidad del suelo.
Se hace ciencia de calidad sin olvidar la necesidad de dar una respuesta a los
retos sociales que plantea el uso del suelo.
Diego de la Rosa
Reconocimiento de suelos*
Vasily Dokuchaev (1846-1903) Curtis Marbut (1863-1935) Philip Duchaufour (1912-2000) Guy D Smith (1907-1981)
Walter Kubiena (1897-1970) José M. Albaréda (1902-1966) Emilio Huguet del Villar (1871-1951)
Salidas al campo
González F, Guerra A, Chávez M, Mudarra JL., 1954. Mapa de suelos del Cortijo de Cuarto.
Mapa de suelos generalizado, 1/250.000
De la Rosa D, Mudarra JL, Cardona F, Moreno R, 1976 Reconocimiento de suelos del Viar.
Mapa de suelos exploratorio, 1/1.000.000
www.jrc.cec.eu.int/soil-atlas
Crisis de la Edafología tradicional
USDA Suborders
A1
25
A2
50
75
B
100
Identificación del perfil del suelo sin necesidad de perforar ni abrir
PXRF: Portable X-ray Fluorescence
Bujeo CO-02 Bujeo SE-03 Tierra negra H-03 Tierra negra CA-01 Pardo calizo MA-01 Suelo rojo CA-03 Suelo rojo SE-01 Pseudogley SE-08
Laja H-02 Greda roja Al-01 Rendsina JA-08 Terra rossa CO-06 Terra rossa CA-06 Alpino GR-02 Tierra parda CO-04 Tierra parda H-01
(*) A partir del mayor y más preciso conocimiento científico de los suelos,
las posibilidades de procesar e interpretar los datos han aumentado
extraordinariamente como consecuencia del avance arrollador de las
tecnologías de la información (TICs).
Vertientes del método científico
Análisis Síntesis
Deducción Prescripción
Comprensión Prevención
Teorías Modelos
Suitability
Conocimiento
científico
Diseño Productividad
Formulación
Calibración
Comportamiento Validación
Evapo-
Temperatura transpiración Lluvia Pendiente
Capacidad
Agua Infiltración Grietas Clase de Fertilidad
retención
disponible humedad natural
agua
Calidad Riesgo de
Temperatura Necesidad Sequía
del agua erosión Manejabilidad
acumulada de riego
4 4 3
pH + CEC pH + CEC pH + CEC
4 3 3 2 2 1 2 1 1
2 1 1
X2
X3
X4
X5
Soil erosion model:
X1 = Runoff erosivity
X6 X2 = Relief hazard
X3 = Soil erodibility
X4 = Crop protection
X5 = Tillage impact
X6 = Production influence
Y = Vulnerability index
Práctica Espacialización
Herr. optimización
Interface usuario
Simulación dinámica
Redes neuronales
Sistemas expertos
Modelos estadísticos
Sistemas difusos
Redes bayesianas
Algoritmos genéticos
GIS
Teledetección
DBMS
Ciencia
Información Decisión
Los DSSs son prototipos perfectos de la predicción científica
Múltiples aplicaciones de uso de los DSSs
Uso territorial
- Identificar las mejores tierras agrícolas
- Reforestar las tierras marginales
- Diversificar la rotación de cultivos
- Segregar las zonas vulnerables
- Delimitar las zonas con problemas de fertilidad
Prácticas de manejo
- Restaurar la materia orgánica
- Precisar la intensidad de laboreo
- Considerar el tiempo de tempero
- Seleccionar la maquinaria apropiada
- Racionalizar el uso de agro-químicos
Multifuncionalidad
- Compatibilizar los cultivos bio-energéticos
- Adaptación al cambio climático
- Aprovechar la capacidad de secuestro de C
9
8
5
4
0
1800 1927 1959 1974 1987 1998 2011 2025 2043
Años
Productividad
Suitability Vulnerabilidad
Vulnerability
máxima mínima
- Para facilitar una interpretación práctica realmente útil en agricultura, ordenación del
territorio, protección del medio ambiente, mitigación y adaptación climática, etc.
MF-Combine
Soil tillage
Diego de la Rosa
CSIC / Mundi-Prensa, Madrid
Libro + CD-ROM
20 capítulos, 404 páginas
2008
http://www.paraninfo.es
Real Academia Sevillana de Ciencias
Discurso de ingreso
Diego de la Rosa
Sevilla, 2013
Francisco Cabrera
Francisco Cabrera Capitán
El CEBAC Unidades Estructurales de Investigación (U.E.I.)
•Sección de Fisicoquímica. •Bioquímica y Microbiología del Suelo
•Sección de Suelos. •Cartografía y Evaluación de Suelos
•Sección do Fertilidad, •Química del Suelo
•Sección de Ecología Vegetal. •Morfología y Génesis del Suelo
•Sección de Entomología y Zoología del Suelo •Mineralogía y Propiedades de Arcillas
•Sección de Microbiología y Bioquímica. •Física del Suelo y Bioclimatología
•Laboratorio de Química del Suelo y •Fertilidad de Suelos, Nutrición y Propagación de
Radioquímica Plantas
•Fisiología y Bioquímica Vegetal
30/10/2015 F.Cabrera 2
Sección de Fisicoquímica de Suelo
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El destino de los fertilizantes y agroquímicos añadidos al suelo
30/10/2015 F.Cabrera 5
Estudios sobre la precipitación de los fosfatos solubles y su la relación de los
fosfatos precipitados con los distintos componentes del suelo y su disponibilidad,
usando los diagramas de Aslyng en los que aparecen las curvas de equilibrio de
distintos fosfatos precipitados.
30/10/2015 F.Cabrera 6
Procesos de adsorción de fosfatos sobre los distintos componentes del suelo,
como una causa muy importante de la pérdida de solubilidad (fijación) de este
elemento en el suelo
Utilización de modelos de Langmuir, Freundlich y Temkin.
•Los datos experimentales se ajustan a los tres modelos con similares niveles
de significación
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Determinación de la actividad radical del olivo mediante P32
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La Química del suelo clásica cambia a la Química coloidal del suelo que puede
explicar prácticamente todos los procesos (reacciones) que ocurren en el suelo.
• A partir de los años 70, debido a la preocupación por los problemas ambientales,
los objetivos de los estudios de Química coloidal del suelo, centrados
fundamentalmente en la dinámica de los nutrientes, se desplazan hacia la
dinámica de los contaminantes.
• Los elementos traza y los plaguicidas, principales contaminantes potenciales del
aire, agua, y suelo, se convierten en el objetivo de muchos estudios desarrollados
en el CEBAC, en los suelos, en las aguas y los sedimentos.
• Muchas de las investigaciones pueden considerarse dentro de la Química
ambiental.
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El IRNAS •Geocologia
Nuevo edificio en 1987 •Química de interfases en procesos
medioambientales
•Sistemas naturales. •Bioquímica y dinámica de contaminantes
•Fisica y quimica ambiental. •Sostenibilidad del sistema suelo-planta-
•Biologia vegetal. atmósfera
•Biologia vegetal
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Química ambiental del suelo, estudios relacionados con
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Durante 1978 y 1979 se lleva acabo el primer proyecto de investigación
sobre la contaminación del río Guadiamar
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30/10/2015 F.Cabrera 13
Valorización de alpechines y vinazas
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Proyecto CEDETI ( 26 millones de ptas)
• Utilización directa de vinazas de remolacha
• Co-Compostaje de vinazas con diversos residuos
• Aplicación agrícola de los composts de vinaza
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Suelos salinos de las Marismas. Un
laboratorio único para la investigación
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Lixiviación de nitratos en suelos agrícolas
30/10/2015 F.Cabrera 17
Construcción de un lisímetro
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El accidente de Aznalcóllar 1998
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30/10/2015 F.Cabrera 20
30/10/2015 F.Cabrera 21
Se habían dejado de financiar investigaciones sobre el peligro para Doñana del río
Guadiamar con aguas y sedimentos con altas concentraciones de elementos
traza.
Ahora se nos conmina a dejarlo todo para dedicarnos a trabajar en el caso
Aznalcóllar. “Acordarse de Santa Bárbara cuando truena”
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Diagnóstico sobre la contaminación de los suelos y recomendaciones para
su recuperación
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Posteriormente
•Proyectos (CICYT. FEDER) en colaboración con el ITGE: efecto del vertido en los
suelos y aguas subterráneas
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Más de 50 publicaciones, tesis, DEA, proyectos fin de carrera, etc. sobre suelo
(monitorización, evolución de la contaminación en suelos sin limpiar, etc.), plantas y
animales (caracoles, caballos)
En el capítulos 7 del libro se citan las publicaciones hasta 2007
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En la actualidad las investigaciones sobre suelos contaminados con elementos traza
• efectos que la propia vegetación forestada puede tener sobre las propiedades del
suelo (Proyecto europeo RECARE).
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NA
LESL
SL BC
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En la actualidad las investigaciones sobre suelos contaminados con elementos traza
• efectos que la propia vegetación forestada puede tener sobre las propiedades del
suelo (Proyecto europeo RECARE).
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Plantas de Pawlonia en suelos contaminados
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En la actualidad las investigaciones sobre suelos contaminados con elementos traza
• efectos que la propia vegetación forestada puede tener sobre las propiedades del
suelo (Proyecto europeo RECARE).
30/10/2015 F.Cabrera 32
Buscando y compartiendo soluciones para proteger nuestros suelos
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Otros temas de actualidad de Química en el IRNAS
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El futuro de la Química del suelo en el IRNAS
Como siempre ha sido, las tendencias serán las mismas que se preconizan en todos los
libros modernos de esta disciplina
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Esas investigaciones incluyen estudios de
Especiación
•Mecanismos
•Distribución espacial
•Transformaciones químicas
•Toxicidad
•Biodisponibilidad
•Estrategias de recuperación
•Impacto sobre la salud humana
Ciclos de los elementos traza, C, N, S y su impacto en el Cambio Climático
Global
Modelos de predicción de la velocidad, destino y transporte de los
contaminantes
Esclarecimiento de los mecanismos de transformación microbiológico de
los contaminantes
Preciso conocimiento de la estructura de la materia orgánica del suelo
Comprensión de la Química de la rizosfera
30/10/2015 F.Cabrera 36
En mi opinión, y a la vista del trabajo que ya se está
realizando, estamos en el buen camino
Felicitaciones a todos
30/10/2015 F.Cabrera 37
Alessandro Piccolo
JORNADA DEL AÑO INTERNACIONAL DE LOS SUELOS
EL IRNAS Y EL SUELO: Alianza y Complicidad
IRNAS‐CSIC, 30 Octubre 2015
SUPRAMULECULAR
VS
MACROPOLYMERIC STRUCTURE
Humic substances (humic and fulvic acids) had been
traditionally described as macropolymers (10-500 KDa),
similarly to biopolymers, and their synthesis accounted to
extracellular enzymatic catalysis.
Stevenson, 1982
The macropolymeric theory
has never been
unambiguously proved by
direct experimental
evidence
Nevertheless, a number of
idealized structures, either
linear or branched, but all
stabilized by COVALENT
BONDS, became common in
textbooks and scientific
reports.
THE SUPRAMOLECOLAR STRUCTURE
HPSEC experiments indicated that conformations of humic substances
are altered by small amounts of organic acids.
These pioneered experiments undermined the macropolymeric theory
SIZE-EXCLUSION CHROMATOGRAPHY
CH3COOH
100 100
50 50
25 25
Total Volume
Piccolo et al., 1996. European Journal of Soil Science, 47:319-328;
Piccolo et al. 1999. European Journal of Soil Science, 50:687-694
A reverse experiment: HA in different HPSEC eluents
A= NaNO3 pH 7; B= +CH3OH pH 6.9; C=+HCl pH 5.54; D=+CH3COOH pH 5.7
UV 280 nm RI
D
D
Traditional humic
macropolymeric model
MW=6326 Da
Energy = 627.4 Kcal.mol-1
Conformational variation
induced by the adsorption
of 10 molecules of acetic
acid
Gain in
conformational Energy = 617.26 Kcal.mol-1
energy = 1.6 %
HYPERCHEM software
PICCOLO et al. In: D.K. Benbi and R. Nieder, Editors. Handbook of processes and modelling in soil-plant system.
Haworth Press, New York, pp. 83-120 (2003).
MINIMIZATION OF CONFORMATIONAL ENERGY
SUPRAMOLECULAR MODEL
Supramolecolar Humic
Model. Association of different
small molecules (aminoacid,
glucose, fatty acids, cinnamic
acids)
total MW = 3065 Da
HYPERCHEM software
Energy = 114.0 Kcal.mol-1
Conformational variation
Gain in energy = 20.0 % induced by the approach of
10 molecules of acetic acid
Energy= 91.2 Kcal.mol-1
Conformational variation
induced by the adsorption of
Gain in energy = 26.3 % 10 molecules of acetic acid
Energy= 84.0 Kcal.mol-1
PICCOLO et al. In: D.K. Benbi and R. Nieder, Editors. Handbook of processes and modelling in soil-plant system.
Haworth Press, New York, pp. 83-120 (2003).
WHAT IS THE REAL MASS OF
HUMIC MOLECULES?
The evaluation of absolute molecular masses by ESI-MS
Electrospray ionization (ESI) is a soft technique to obtain
unfragmented and single-charged ions of humic molecules in
aqueous solution for compatible measurements by mass-
spectrometry
Piccolo, Nebbioso and Spiteller (2010) Anal Bioanal Chem 397: 3071-3078
Diffusion Ordered NMR SpectroscopY (DOSY-NMR)
A nominal molecular weigh of
humic matter was calculated from
133 mg/mL
a DOSY calibration curve built with
+ 5 mL standards of known MW
of Peat HA
of AcOH
+ 5 mL
5 mg/mL
of AcOH
of Peat HA
compounds 90°C,
KOH 1M 8h
in MeOH,
reflux, 2hH I HO
HO
H
Extract (ORG4) Alkyl HI 47% in H2O, COOH
iodides from ether cleavage 70°C, 48h
OH
I
F OF
B
O
OH
O
OH
F O
OH
FO
OH
O
+
B R R'
Residue (RES4) Devoid O
CH2Cl2/MeOH; RT; R R'
O O FHO HO
O
OO F
O
of ether-bound compounds HO
8h O O O
R'R'
HO
R'R' HO
R R OO H R R OIO H
+
I O H COOH
OH
HO
OH
I
F F R R
F
F
B R' B
O
OH
+ HOO OHR'
O
R' O F O O F OH
OH O HO
O
H R'
R O R R OO
I R' O H OO OH
HO
R
Humeomic fractionation
RES0
Nanjing 2012
Elaborating results: GC-MS, ESI-MS and NMR
74
74 O
100
O 87 O
87
87
55
M-43
69
M+
83
143 M-31
97 129 227 270
115 157 171 185 199 213 239
0 m/z
67 87 107 127 147 167 187 207 227 247 267
55 M-57
69 143 199 H H H O
97 M-29 M+
115 129 213
157 171 185 227 256
281
H
0
46 66 86 106 126 146 166 186 206 226 246 266 286
m/z
n OH
H
Likewise branched structures are revealed H H H H
283.1016 283.2619
C10H19O9 C18H35O2
(A) ORG1,
(B) ORG2
neutral
subfraction,
(C) ORG2
acidic
subfraction,
(D) ORG3
Nebbioso and Piccolo,
Biomacromolecules 2011,
12, 1187–1199
Amount (μg g-1 of original HA weight) of compound
classes detected by GC-MS in Humeomics fractions
from HA
1H-NMR spectra
and 13C-CPMAS-
NMR of humic
fractions separated
by Humeomics.
80
% Yield of fractionation
40
20
0
RES0 ORG1 ORG2 AQU2 ORG3 RES4
Separated Fractions
Nebbioso and Piccolo, Biomacromolecules 2011, 12, 1187–1199
RES4 shows 66 % of quaternary sp2 carbon
Integral areas
Spectral 150-185 95-150 0-60
region ppm ppm ppm
2.47/3.42=~0.66
f1
f10 f2
f9 f3
RES4
f8 f4
f7 f5
f6
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
Amount (µg g-1 of
Alkanoic acids total HA) of molecular
C10H20O2 77 18 23 27 35 28 34 31 37 45 201 479 components
C12H24O2 48 27 29 35 47 33 83 54 40 61 103
C14H28O2 179 256 298 289 146 187 667 484 266 343 607
512
3544
(empirical formulae)
C15H30O2 191 389 411 317 431 230 791 545 229 372 400 4113 found by hyphenated
C16H32O2 324 1000 1190 655 908 341 784 896 450 468 1090
C17H34O2 25 144 242 98 132 57 179 143 53 96 134
7782
1278
HPSEC-ESI-MS for
C18H36O2 8 122 145 104 422 25 67 160 50 59 99 1254 RES4, ten size-
Unsaturated alkanoic acids fractions, and sum of
C14H26O2 46 37 52 64 80 36 168 106 53 98 117 812
C16H30O2 326 537 708 828 1032 518 2054 1290 496 1035 899 9397
size-fractions, as
C18H34O2 59
341 713 423 13108 168 507 415 150 678 625 empirical formulae
17127
Unsaturated hydroxyacids
C6H10O3 33 15 24 24 38 58 34 65 32 46 176 511
C7H12O3 23 17 28 13 33 35 38 42 27 21 93 346
C18H34O3 22 46 21 50 72 29 49 41 18 106 243 675
Other unsaturated oxygenated acids The sum of each
C15H22O4
C17H26O4
9
13
22 24 12 73 67 186 368 71 217 426 1467 specific molecule in
60 21 44 37 41 59 450 163 154 111 1138
C17H26O5 19 12 9 6 40 36 65 233 59 103 80 642
the 10 fractions was
C18H34O4 22 9 5 9 13 3 14 12 6 23 16 110 always significantly
C18H36O4 4 33 8 8 43 2 7 5 3 22 27
C18H34O5 4 31 4 3 125 2 1 3 2 51 34
157
257
large that than found
C19H30O5 2 28 10 8 10 19 23 391 9 103 12 611 in the orginal RES4
C19H28O4N2 0
7 0 0 5 0 0 0 2 7 4
26
C19H30O6 8 7 7 2 23 25 54 256 26 125 52 576
C20H24O3 9 25 21 8 6 4 8 24 6 29 30 161
C21H26O3 8 19 16 3 4 2 5 12 3 15 16 94
C21H34O6 0 15 3 3 3 12 8 265 4 67 7 385
Cyclic acids
C7H6O2 4336 16336 17068 19570 10345 9587 12093 14422 47210 12619 34382
193632
C6H4O5 7888 27484 9568 54330 28015 19636 23654 24775 55316 18970 53960 Nebbioso et al., 2014. RSC
315708 Advance 4, 23658-65
C7H6O8 9158 11842 9711 65224 16093 9249 9092 7834 8826 5427 3518
146816
Structural characterization of some quaternary
carbons through HPSEC-ESI-MS/MS
SOIL NOM
Weakly Strongly
Ether Mineral
Sample Unbound Ester Ester
bound bound
bound bound
2000
1250mg
1500
mg
1000
500
0
Percent yield of OM extraction
2500 186%
2000
100%
1500
mg
1000
500
0
Elemental Analysis
C H N
250
163.9mg C
200
150 72.5mg C
mg
100
50
0
The distribution of molecular
components in SOM by Humeomics
van Krevelen plots are built by Fourier Transform Ion
Cyclotron Resonance Mass Spectrometry (FTICR-MS)
Top-down approach by
FTICR-MS: get the
empirical formulae but not
the structure
Buttom-up approach by
Humeomics: get the
structural fomulae first and
then build a real van
van Krevelen Plot Krevelen Plot
1.5
1.0
0.5
35
Relevant % Percentage
30
25
20
15
10
0
AA
BA
DA
FA
HA
PA
RA
SA
AM
IM
ET
ST
HO
AC
AD
HN
PH
SU
ES
KE
PAH
PE
SE
AL
Humeomics
Unbound ORG1
Aliphatic C
HO
O
Unbound ORG1
3.0 ORG1
2.5
39 compounds Identified
1.5
1.0
0.5
50
45
40
35
30
25
20
15
10
5
0
AA
BA
DA
FA
HA
PA
RA
SA
AM
IM
ET
ST
HO
AC
AD
HN
PH
SU
ES
PAH
KE
PE
SE
AL
Weakly Ester bound ORG2 Humeomics
C=O C-O
HO OH
HO O OH
O OH
HO
HO OH
OH
HO
HO
O
Weakly Ester bound ORG2
3.0 ORG2
2.5
19 compounds Identified
1.5
1.0
0.5
50
45
40
35
30
25
20
15
10
5
0
AA
BA
DA
FA
HA
PA
RA
SA
AM
IM
ET
ST
HO
AC
AD
HN
PH
SU
ES
PAH
KE
PE
SE
AL
Weakly Ester bound AQU2
24% Benzoic
acids
27% Amides
12 10 8 6 4 2 0
H(ppm)
1
Weakly Ester bound AQU2
3.0 AQU2
2.5
33 compounds Identified
1.5
1.0
0.5
50
45
40
35
30
25
20
15
10
5
0
AA
BA
DA
FA
HA
PA
RA
SA
AM
IM
ET
ST
HO
AC
AD
HN
PH
SU
ES
PAH
KE
PE
SE
AL
Strongly Ester bound ORG3 Humeomics
Aliphatic C
C=O
HO
HO
OH
HO HO
O
O OH
OH
Strongly Ester bound ORG3
3.0 ORG3
24 compounds Identified
2.5
1.5
1.0
0.5
50
45
40
35
30
25
20
15
10
5
0
AA
BA
DA
FA
HA
PA
RA
SA
AM
IM
ET
ST
HO
AC
AD
HN
PH
SU
ES
PAH
KE
PE
SE
AL
Strongly Ester bound AQU3
28% Esters
15% Amines
4000 3500 3000 2500 2000 1500 1000 cm-1
Carbohydrates decreased 12 10 8 6 4 2 0
H(ppm)
1
Strongly Ester bound AQU3
O O
HO
NH N OH
H
NH2
CH3
CH3
O O
H3C
CH3
H3C O
OH
H3C
N
N
CH3
H N
N
N CH3
Strongly Ester bound AQU3
3.0 AQU3
40 compounds Identified
2.5
1.5
1.0
0.5
50
45
40
35
30
25
20
15
10
5
0
AA
BA
DA
FA
HA
PA
RA
SA
AM
IM
ET
ST
HO
AC
AD
HN
PH
SU
ES
PAH
KE
PE
SE
AL
Ether bound AQU4 Humeomics
N
O
O
NH
H3C O NH
N N
O N
N
H3C
CH3
N
H3C
HO
O
Ether bound AQU4
3.0 AQU4
2.5
65 compounds Identified
1.5
1.0
0.5
50
45
40
35
30
25
20
15
10
5
0
AA
BA
DA
FA
HA
PA
RA
SA
AM
IM
ET
ST
HO
AC
AD
HN
PH
SU
ES
PAH
KE
PE
SE
AL
Humeomics
Mineral bound RESOM
More Aromatic
NOM
RESOM
12 10 8 6 4 2 0
H(ppm)
1
Mineral bound RESOM
OH OH OH
HO
HO
HO
OH
O HO
O
OH
O HO O O
HO
O O
O OH
O O
O
H O
HO O OH
O OH
OH
HO
O
Fe OH
O O
O
Fe O
Fe
Fe
Mineral bound RESOM
3.0 RESOM
31 compounds Identified
2.5
1.5
1.0
0.5
50
45
40
35
30
25
20
15
10
5
0
AA
BA
DA
FA
HA
PA
RA
SA
AM
IM
ET
ST
HO
AC
AD
HN
PH
SU
ES
PAH
KE
PE
SE
AL
Humeomics improve detectability of
molecular components of SOM
2.5
2,5
Atomic ratio of H/C
2.0
2,0
1.5
1,5
1.0
1,0
0.5
0,5
0.0
0,0 0.5
0,5 1.0
1,0 1.5
1,5
Atomic ratio of O/C
DIFFERENTIATING SOM
DYNAMICS IN AGRICULTURAL
SOIL BY HUMEOMICS
Soil under traditional tillage after
1 and 3 years
mg C
350
338.1mg C 256.1mg C
300
300
150 150
100 100
50 50
0 0
Relevant % Percentage
1,8 40
35
1,6
30
1,4 25
20
1,2 15
10
1,0
5
0,8 0
0,0 0,2 0,4 0,6 0,8 1,0
DA
BA
FA
HA
PA
RA
SA
IM
ST
AC
AD
AH
HC
PAH
PH
SU
ES
KE
PE
SE
SES
AL
Atomic ratio of O/C
60
2,2 TRAIII ORG1
TRAIII ORG1
Aliphatic Esters
55
Alkanes/alkenes
2,0 50
45
Atomic ratio of H/C
1,4 25
20
1,2 15
10
1,0
5
0,8 0
0,0 0,2 0,4 0,6 0,8 1,0
DA
BA
FA
HA
PA
RA
SA
IM
ST
AC
AD
AH
HC
PAH
PH
SU
ES
KE
PE
SE
SES
AL
Relevant % Percentage
Atomic ratio of H/C
40
1,6
35
1,4 30
25
1,2
20
1,0 15
10
0,8 5
0
0,0 0,2 0,4 0,6 0,8 1,0 1,2
DA
BA
FA
HA
PA
RA
SA
IM
ST
AC
AD
AH
HC
PAH
PH
SU
ES
KE
PE
SE
SES
AL
Atomic ratio of O/C
TRAIII ORG2 60
55 TRAIII ORG2
2,0
50
1,8
45
Relevant % Percentage
Atomic ratio of H/C
1,6 40
35
1,4 30
25
1,2
20
1,0 15
10
0,8 5
0
0,0 0,2 0,4 0,6 0,8 1,0 1,2
DA
BA
FA
HA
PA
RA
SA
IM
ST
AC
AD
AH
HC
PAH
PH
SU
ES
KE
PE
SE
SES
AL
1,8 45
Relevant % Percentage
1,6 40
35
1,4
30
1,2 25
1,0 20
15
0,8
10
0,6 5
0
0,0 0,2 0,4 0,6 0,8 1,0 1,2
DA
BA
FA
HA
PA
RA
SA
IM
ST
AC
AD
AH
HC
PAH
PH
SU
ES
KE
PE
SE
SES
AL
Atomic ratio of O/C
2,2 60
TRAIII ORG3 TRAIII ORG3
55
2,0
50
1,8
45 C sequestration?
Relevant % Percentage
Atomic ratio of H/C
1,6 40
35
1,4
30
1,2 25
1,0 20
15
0,8
10
0,6 5
0
0,0 0,2 0,4 0,6 0,8 1,0 1,2
DA
BA
FA
HA
PA
RA
SA
IM
ST
AC
AD
AH
HC
PAH
PH
SU
ES
KE
PE
SE
SES
AL
Cambio
Global
Current scenario
Warmer scenario (Δ3ºC)
Centaurea maculosa
Phytophthora
cinnamomi
Los efectos indirectos mediados por el suelo de los animales sobre las
plantas pueden ser más importantes que los efectos directos
0.72 0.60
BIRDS SALINITY STRESS
2
r2 = 0.52 r = 0.35
- 0.94
-0.38
HEALTH
2
r = 0.88
-0.76 0.86
CT CDI
Mayor respuesta en
suelos heterogéneos
Consecuencias del Cambio Global sobre la biodiversidad
Importantes pérdidas en distintos grupos de animales y plantas
Relación diversidad-función
-20% -58%
Brassica rapa
Dry plants
Wet plants
Rompiendo fronteras
•Aprendiendo del pasado:
•La alianza y complicidad por parte de los grupos de Ciencia de Suelo del IRNAS del 85-95
nos hizo sobrevivir, resistir y crecer en un entorno desfavorable
•Aumentamos nuestro carácter pluridisciplinar
•Mirando al presente
•Mantenemos buenos niveles de captación de fondos, producción científica e indicadores
científicos
•Los indicadores de las revistas de suelos bajan peligrosamente cada año, no están de
moda
•Mirando al futuro:
•Hay que hacer una ciencia más básica, imaginativa, de riesgo y puntera
•Crear alianzas con las ciencias más punteras e innovadoras: romper fronteras
•Emplear tecnicas innovadoras y de ultima generación: son accesibles
•Hacer nuestros resultados atractivos para Nature, Science, PENAS,…
•Poniendo esfuerzo, rigor, ganas, imaginación y sobre todo pasión: la recompensa es grande
Jornada del Año Internacional de los Suelos
EL IRNAS Y EL SUELO: Alianza y Complicidad
Sevilla, 30 Octubre 2015