SHAPIRO

Senapathy Algorithm
Genomica Estructural
Dr. Jesus Ricardo Parra Unda
Carolina Partida Zazueta
Gpo 3-2
 SHAPIRO - SENAPATHY
Dr. Periannan Senapathy ha sido pionero en la investigación de la biología del empalme de
ARN, incluida la comprensión de por qué se dividen los genes, qué son las secuencias de
unión de empalme y por qué los exones son muy cortos y los intrones muy largos.
El objetivo original del Dr. Senapathy al desarrollar un método para identificar sitios de
empalme era encontrar genes completos en una secuencia genómica no caracterizada sin
procesar que pudiera usarse en el proyecto del genoma humano.

El algoritmo Shapiro - Senapathy (S&S) es un algoritmo para predecir los sitios de empalme,
exones y genes en animales y plantas ayudando a descubrir múltiples mutaciones
 OBJETIVO
El objetivo original del Dr. Senapathy al desarrollar un método para identificar
sitios de empalme era encontrar genes completos en una secuencia genómica
no caracterizada sin procesar que pudiera usarse en el proyecto del genoma
humano.

Este algoritmo tiene la capacidad de descubrir mutaciones causantes de

enfermedades en uniones de empalme en enfermedades cancerosas y no
cancerosas que se está utilizando en las principales instituciones de
investigación de todo el mundo
BIBLIOGRAFIA
Shapiro, Marvin B .; Senapathy, Periannan (1987). "Uniones de
empalme de ARN de diferentes clases de eucariotas:
estadísticas de secuencia implicaciones funcionales expresión
génica". https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC306199/

Senapathy, P .; Shapiro, MB; Harris, NL (1 de enero de 1990).

Uniones de empalme, sitios de puntos de ramificación y exones:
estadísticas de secuencia, identificación y aplicaciones al
proyecto del genoma. https://blog.goldenhelix.com/splice-site-
algorithms/
GRACIAS