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Traducción

ARN policistronico (ORFs)


ARN monocistronico (ORF)

Tres posibles lecturas en un ARNm


ORF un marco de lectura codante
• El Ribosoma
La ARN polimerasa procariota y los ribosomas actúan sobre el mismo ARNm.
Composición de los ribosomas procarióticos y eucarióticos.
Se indican la longitud del ARNr y el número de proteínas ribosomales para cada subunidad.
Resumen de los eventos de traducción: el ciclo del ribosoma.
El ribosoma tiene tres sitios de unión a ARNt. La ilustración esquemática del ribosoma
muestra los tres sitios de unión (E, P y A) que abarca cada uno las dos subunidades.
Inicio de la
traducción

El 16S ARNr interactúa con el RBS (Ribosome


binding site) para colocar el AUG en el sitio P.
Esta ilustración muestra un ARNm con la
separación ideal entre el RBS y el AUG inicial.
Muchos ARNm tienen espacios no ideales
entre RBS y AUG que conducen a una tasa
reducida de iniciación a la traducción. Otro
ARNm carecen de RBS por completo y reclutan
el ribosoma por distintos mecanismos.
Traducción en Procariotes
Traducción en eucariotes
Identificación del AUG por el 48S PIC y la
subunidad mayor ribosomal durante la
traducción eucariota iniciación.
Elongación
EF-Tu transporta el aminoacyl-
ARNt al sitio A del ribosoma.

Los ARNt cargados están


unidos a EF-Tu-GTP primero
interactúan con el sitio A del
ribosoma. Cuando se produce
la interacción codón-
anticodón correcto, EF-Tu
interactúa con el centro de
unión, hidroliza su unión GTP.
Después de la liberación de
EF-Tu -GDP, el ARNt rota al
centro de la posición P peptidil
transferasa del ribosoma.
Tres mecanismos aseguran el
emparejamiento correcto entre el ARNt
y el ARNm.
(a) Se forman enlaces de hidrógeno
adicionales entre dos residuos de
adenina del 16S ARNr y el surco
menor del par anticodón-codón solo
cuando las dos primeras bases del
anticodón- y los pares del codon
forman los pares correctos de
Watson-Crick.
(b) Base correcta de codón-anticodón. El
emparejamiento facilita que EF-Tu se
une al aminoacil-tRNA para
interactuar con el centro de unión
del factor induciendo Hidrólisis de
GTP y liberación de EF-Tu.
(c) Solo quedan aminoacil-tRNA
correctamente emparejados de
bases asociados con el ribosoma a
medida que giran a la posición
correcta para la formación de enlaces
peptídicos. Esta rotación se
denomina acomodación de ARNt.
Rol propuesto para el 2’-OH del tRNA del sitio P en la formación de enlaces peptídicos.
El 2’-OH de la "A" final en el peptidil-tRNA es fundamental para la formación de enlaces
peptídicos. Se ha propuesto que el 2’-OH participa en un "protón lanzadera ”. En este modelo, el
oxígeno 3’ extrae un hidrógeno (resaltado amarillo) del 2’-hidroxilo, y el El oxígeno 2’, a su vez,
extrae un hidrógeno (resaltado verde) del grupo amino que ataca al carbonilo. Las flechas rojas
muestran la dirección propuesta del movimiento de electrones durante el enlace peptídico
formación.
La translocación requiere EF G GTP
La liberación de polipéptidos es
catalizado por dos factores de
liberación.

El factor clase l de liberación (RF1)


reconoce el codón STOP y estimula la
liberación a través de un motivo GGQ
que es localizado en el centro de la
peptidil transferasa.
El factor de liberación de clase II (RF3) se
une solo después de la liberación del
polipéptido e impulsa la disociación del
factor de liberación de clase I.
Ribosome
recycling factor
(RRF) coopera
con EF-G e IF3
para reciclar los
ribosomas
Terminación de la
traducción eucariota y
reciclaje de ribosomas.
La presencia la cola poli-A contribuye a la eficiencia de la traducción en eucariotas. Una posible
circularización estaría mediada por interacciones entre eIF4G, la proteína de unión a poli-A y la
cola de poli-A.
Regulación del inicio de la traducción bacteriana mediante la inhibición de la subunidad 30S.
(a) La unión de proteínas a sitios cercanos al RBS evita el acceso del rRNA 16S al RBS. En en este caso, la
proteína codificada por el ARNm se une a su propio RBS. (b) Base intramolecular el emparejamiento del
ARNm puede interferir con el emparejamiento de bases por el ARNr 16S. En muchos casos, esta inhibición
está modulado por la traducción de otros genes en el mismo operón. Si la región del ARNm que es el
emparejamiento de bases con la región proximal de RBS está dentro de un ORF, cuando ese ORF se traduce,
la interferencia el apareamiento de bases se interrumpe, lo que permite que un segundo ribosoma
reconozca el RBS previamente bloqueado.
No todos los polipéptidos eucariotas están codificados por un ORF que comienza con el AUG
que está más próximo al extremo 5’. Los uORF regulan la traducción de ORF. En algunos casos,
después de que un ribosoma traduce un uORF, el pequeño La subunidad permanece en el
ARNm y reanuda la exploración para un segundo AUG. Solo puede identificar un segundo AUG
cuando se une a un nuevo ARNr iniciador.
Los IRES (internal Ribosome
entry sites)pasan por alto los
requisitos normales para el
inicio de la traducción.
Los virus codifican con
frecuencia secuencias IRES que
se pliegan en estructuras de
ARN que eluden la necesidad de
uno o más factores de
traducción eucariotas.
(a) El IRES de poliovirus pasa
por alto el requisito para 5’
uniéndose directamente a
eIF4G.
(b) El virus de la parálisis de
Cricket codifica un ARNm
con un IRES que se pliega
para parecerse a un ARNt
que se une directamente al
sitio P de las subunidades
ribosómicas 40S y 60S. El
ARNm en el sitio A codifica
un Ala como el primer
aminoácido.
El código genetico
EL CÓDIGO ES CASI UNIVERSAL

† UGA no es una señal de STOP, sino


códigos de triptófano. Por tanto, el
anticodón de la tRNATrp
mitocondrial reconoce tanto a UGG
como a UGA, como si obedeciera a
la reglas tradicionales de oscilación.

† La metionina interna está


codificada por AUG y AUA.

† En las mitocondrias de mamíferos,


AGA y AGG no son codones de
arginina (son codones STOP). Por
tanto, hay cuatro codones de parada
(UAA, UAG, AGA y AGG) en el código
mitocondrial de mamíferos.

† En las mitocondrias de la mosca de


la fruta, AGA y AGG tampoco son
codones de arginina sino de serina.

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