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ESTRUCTURAS
Alicia M. Seldes# y Gabriela M. Cabrera
#
fallecida el 23 de enero de 2003.
1
Levy LM, Cabrera GM, Wright JE, Seldes AM; Molecules 5, 354 (2000).
OH
OH
H3CO
Cl
En el espectro de la figura 1 se observa que el ion m/z 216 está acompañado por el ion m/z
218 de un tercio de intensidad, lo cual es coherente con la presencia de un cloro en la molécula
35 37
( Cl y Cl). Estos iones son pares, lo que concuerda con el hecho de que no tienen nitrógeno. Se
observan los fragmentos m/z 171 y 173 que corresponden a la fragmentación β al anillo aromático
+ + +
(M–OCH2CH3) y los fragmentos m/z 143, (m/z 171 – CO) , y 145, (m/z 173 – CO) . En ambos
pares se observa la relación de intensidad 3:1, característica de la presencia de un átomo de cloro.
Se observan además fragmentos característicos de anillo aromático unido a O, a m/z 108 y los
fragmentos aromáticos característicos m/z 77, 65 y 51.
Cuando el ion molecular es muy pequeño en abundancia y para confirmar su identidad se
puede realizar el espectro a 25 eV en lugar de 70 eV, que es el potencial de ionización aplicado
cuando se quiere obtener mayor grado de fragmentación. El resultado se observa en la figura 2.
Como puede observarse, el ion molecular tiene una intensidad de cerca del 15%, en lugar del 7%
obtenido a 70 eV. Con esta técnica suele verse un incremento en la intensidad del ion molecular y
una disminución de la intensidad de los fragmentos de masas bajas, que no son importantes desde el
punto de vista diagnóstico, ya que representan iones simples, productos de múltiples
OH
OH
H3CO
Cl
Otra técnica que permite obtener un incremento sustancial en la intensidad de los ¨iones
moleculares¨ es la técnica de Ionización Química, en la cual la muestra es bombardeada por iones
de un gas reactivo en lugar de electrones. Por esta técnica se observan los iones cuasimoleculares
+ +
(M+H) o aductos (M+X) donde X= Et, NH4, NO, etc, o mezclas de ambos, dependiendo del gas
+
reactivo utilizado (CH4, NH3, NO respectivamente). Con NO también se observa el (M-H) ya que
la afinidad protónica (AP) del NO es mayor que la de la mayoría de los compuestos orgánicos. En
la tabla 1 se muestra la identidad de los iones cuasimoleculares más comunes que se obtienen según
sea el gas reactivo utilizado.
Tabla 1. Iones cuasimoleculares observados en modo positivo para los gases reactivos más
empleados.
OH
OH
H3CO
Cl
Cuando los compuestos a analizar son termolábiles, polares y/o de alto peso molecular
pueden emplearse otras técnicas como FAB (fast atom bombardment), MALDI (matrix assisted
laser desorption ionization) o ESI (electrospray ionization) en las cuales las muestras introducidas
en una matriz (FAB, MALDI) o disueltas en el solvente apropiado (ESI) son impactadas por átomos
- +
O SO3 Na
- +
Figura 4. a) Espectro FAB (matriz glicerol), b) Espectro FAB (matriz glicerol+NaI)
2
Roccatagliata AJ, Maier MS, Seldes AM, Zea S, Duque C; J. Nat. Prod. 60, 285 (1997).
O O OH
OH
3
Levy LM, Cabrera GM, Wright JE, Seldes AM; Phytochemistry 62, 239 (2003).
Tabla 2. Resultados de la determinación con alta resolución por EI de la masa del ion m/z 208 de
aporpinona A. DBE representa el número de insaturaciones. Notar que debe ser un valor entero para
un ion molecular.
4
NIST Chemistry WebBook, http://www.chemweb.com/databases/
10
CH2OH
O O aglicona
CH2OH OH
AH2+
O O H
OH OH
CH2OH
O O F3H2+
H
OH OH
CH2OH
O O F2H2+
OH H
OH
OH F1H2+
OH H
Figura 8. Fragmentaciones características de glicósidos.
5
Cabrera GM, Deluca ME, Seldes AM, Gros EG, Oberti JC, Crockett J, Gross ML; Phytochemistry 32, 1253
(1993).
11
OH
Glic-O
H
b)
-2 (162) - 144
+ -
Figura 9. a) Espectro FAB -EM/EM del ion m/z 987 (M+H)+ y b) Espectro FAB -EM/EM
del ion m/z 985 (M-H)-.
Hay numerosas técnicas de espectrometría de masas tándem que pueden emplearse para
determinar los iones hijo de un determinado ion precursor y todas pueden usarse para secuenciar6. A
veces es necesario usar en forma complementaria distintas técnicas de ionización para obtener toda
la información requerida.
En la figura 8 se observan los iones fragmento obtenidos por ESI-EM/EM y FAB-EM/EM del
ion precursor m/z 1631, correspondiente al ion (M+H)+ del péptido integramida A, aislado del
extracto del hongo Dendrodochium sp. Como puede advertirse, por ambas técnicas se obtienen
distintos fragmentos, aunque todos corresponden a rupturas α CO-N, características de péptidos7.
6
Mc Laferty FW. Tandem Mass Spectrometry. Wiley, New York, 1983.
7
Singh SB, Herath K, Guan Z, Zink D, Dombrowski A, Polishook JD, Silverman KC, Lingham RB, Felock
PJ, Hazuda DJ; Org. Lett. 4, 1431 (2002).
12
m/z 142
O O
H m/z 1160
H N H O O
NH O O N N N
N NH O
O H H
N O O N
N H O m/z 665 HN
m/z 835
OH NH
HO m/z 467 O m/z 1245
m/z 255
O
O N
NH
O OH
HN
O m/z 1358
HO N
H
O
+ H ]+ m/z 1457
m/z 1556
m/z 1631
__
Figura 10. Fragmentos observados por ESI-EM/EM ( ) y FAB-EM/EM (---) del ion precursor m/z
1631.
Otra posible solución para subsanar la ausencia de fragmentos necesarios para establecer una
secuencia, es realizar espectrometría de masas tándem con iones fragmentarios en lugar de los iones
cuasimoleculares. En el ejemplo de la figura 8, podría haberse realizado ESI-EM/EM de los iones
de m/z 1457, 1160 y 255 para tratar de detectar los iones de m/z 1358, 948 y 142 respectivamente.
En realidad, en forma estricta, debería realizarse tándem sobre cada fragmento para asegurar la
relación de parentesco entre fragmentos sucesivos.
8
Zuleta IA, Vitelli ML, Baggio R, Garland MT, Seldes AM, Palermo JA; Tetrahedron 58, 4481 (2002).
13
10'
O +
O CH2
7' N 5' O O
6'
8' NHC O
N N
*
9'
8a'
5a' N
H
* O H
N 4' 13'
1' N N N
3' N N
2' 11' 12'
N O
N O
O O O N
N O
O
O N α
m/z 362
H β C20H20N5O2
4
5 4a 3 12'' 13'' 2
2
1 11'' 4''
6
7a N 3'' N O
7 H 5a''
2'' 5''
1'' N N 6'' 10''
8a'' 8''
7''
N
9'' O
1
Figura 11. Pseudoanchynazina A (1), un producto de su metanólisis (2) y la posible
estructura del fragmento m/z 362.
14
m/z 331
OCH3
OCH3 m/z 229
CO2CH3
7
H3C O OCH3
m/z 115
m/z 217
Figura 12. Iones diagnóstico obtenidos por ionización química con isobutano.
Empleando técnicas de espectrometría de masas tándem sobre sales de litio de ácidos grasos
en modo positivo, o de los correspondientes carboxilatos en modo negativo y colisionando con alta
energía, es posible observar fragmentaciones remotas de carga, por medio de las cuales se puede
determinar la posición de dobles enlaces11. En este caso, lo que se observa son fragmentos distantes
de 14 u correspondientes a las fragmentaciones con transferencia de H, que corresponden a
eliminaciones en paralelo de CH4, C2H6, etc, y que son producidas en las distintas posiciones de la
cadena alifática, excepto en aquellas posiciones ocupadas por el doble enlace y, en menor medida
las posiciones vinílicas. Se muestra en las figuras 11 y 12, el espectro FAB- EM/EM con alta
energía correspondiente al ácido oleico y la descripción de las fragmentaciones observadas en dicho
espectro, respectivamente.
9
Minnikin D E; Chem. Phys. Lipids 21, 313 (1978).
10
Suzuki M, Ariga T, Sekine E, Araki E, Miyatake T; Anal. Chem. 53, 985 (1981).
11
Gross M L. Int. J. of Mass Spectrom. & Ion Processes 116/119, 137-165 (1992).
15
m/z 237
H m/z 209
H m/z 181 m/z 113
H H
O-
H H O
m/z 195 m/z 127
H
m/z 223
Figura 14. Fragmentaciones remotas de carga observadas para el ácido oleico.
16
O
sn-1
R1CH2 C O CH2
sn-2
R2CH2 C O CH O
O CH2 O P O CH2
- O CH OH
CH2 OH
PG-
-
Figura 15. Espectro ESI del extracto crudo de membrana de Lactobacillus acidophilus CRL 800.
Los iones m/z 431, 523 y 505, que se observan en la figura 14, corresponden a fragmentos, a
partir del precursor m/z 788, donde el ácido graso que se elimina, es el de la posición sn-2, mientras
que los iones m/z 417, 509 y 491 son los fragmentos equivalentes con eliminación del ácido en
12
posición sn-1 . Los iones m/z 431 y 417 son los fragmentos resultantes de la pérdida de 74 u
(C3H6O2 del glicerol) y RCO2H, los iones m/z 523 y 509 resultan de la pérdida de RCHO y H2O y
los iones m/z 505 y 491, la pérdida de RCHO, donde R es la cadena del ácido graso. Teniendo en
cuenta los valores numéricos de esos iones y las pérdidas que representan, es posible determinar que
el ácido graso que se encuentra en posición sn-2 es un ácido de 18 carbonos con una insaturación
mientras que el que se encuentra en posición sn-1 es uno de 19 carbonos con una insaturación.
12
Cabrera GM, Fernández Murga ML, Font de Valdez G, Seldes AM; J. Mass Spectrom. 35, 1452 (2000).
17
O
sn-1
R1CH2 C O CH2
sn-2
R2CH2 C O CH O
O CH2 O P O CH2
- O CH OH
CH2 OH
PG-
-
Figura 16. Espectro de iones producto del ion precursor de m/z 788 [M – H] del extracto de
Lactobacillus acidophilus CRL 800 obtenido por ESI-EM/EM.
Cabe destacar que la muestra cruda también contenía glicolípidos y glicéridos que no se
detectaron en modo negativo, mientras que sí lo hicieron en modo positivo. Efectuando un análisis
similar por FAB+ EM/EM se determinó la composición de dichos componentes.
Otra forma de obtener este tipo de información, cuando se conocen las fragmentaciones
características de los compuestos cuya presencia se quiere determinar, es seleccionar en un segundo
analizador un fragmento común a dichos compuestos, colisionar los iones entre el primer y el
segundo analizador, y realizar un barrido en el primer analizador (barrido de padres). De este modo
se obtiene un espectro en el cual se observan todos los iones precursores que se fragmentan dando
el fragmento seleccionado. Por ejemplo, las catequinas producen un fragmento m/z 125
correspondiente al anillo A (figura 15).
18
OH
Figura 17. Ion m/z 125 característico de catequinas.
OH
OH CO2H
HO O
OH HO OH
OH OH
Se puede comprobar a partir de estos ejemplos que conociendo las fragmentaciones de los
compuestos de interés, es posible planificar un gran número de estrategias y experimentos para
obtener información estructural importante aún partiendo de pequeñas cantidades de extractos
crudos.
Es importante mencionar que todas los experimentos planteados en este capítulo pueden
aplicarse tanto a muestras que se introducen en forma directa, como a picos cromatográficos,
eluídos tanto de GC como de HPLC. El sistema de introducción de la muestra se elige de acuerdo a
13
Miketova P, Schram K H, Whitney J, Li M, Huang R, Kerns E, Valcic S, Timmermann B N, Rourick R,
Khlor S; J. Mass Spectrom. 35, 860 (2000).
19
Bibliografía general:
Mc Lafferty FW, Turecek F; Interpretation of Mass Spectra. 4th Ed. Univ. Science Books, 1993.
Davis R, Frearson M; Mass Spectrometry. John Wiley and Sons, 1987.
Chapman JR; Practical Organic Mass Spectrometry. 2nd Ed. J. Wiley and Sons, 1993.
Rose ME, Johnstone RAW. Mass Spectrometry for Chemists and Biochemists. Cambridge University Press,
1982.
Budzikiewicz H, Djerassi C, Williams DH; Mass Spectrometry of Organic Compounds. Holden Day Inc.,
1967.
Hoffman EDe, Charette J, Stroobant V; Mass Spectrometry. Principles and Applications. J. Wiley and Sons,
1996.
20