DPANN

(Redirigido desde �Nanoarqueas�)

Ir a la navegaci�nIr a la b�squeda
Symbol question.svg DPANN
25K15pA9Def4sec Arman 4 Box1.png
C�lula ARMAN encontrada en una mina de hierro
Taxonom�a
Dominio: Archaea
Superfilo: DPANN
Rinke et al. 2013
Filos
Aenigmarchaeota
Altiarchaeota
Diapherotrites
Huberarchaeota
Mamarchaeota
Nanoarchaeota
Nanohaloarchaeota
Micrarchaeota
Pacearchaeota
Parvarchaeota
Undinarchaeota
Woesearchaeota
[editar datos en Wikidata]
DPANN es un supergrupo de arqueas de peque�o tama�o que al momento de su
descubrimiento (2002), se observ� que dado su tama�o se pueden medir en nan�metros
(nm)1? por lo que son un tipo de nanoorganismos y ocasionalmente se denominaron
nanoarqueas.2? DPANN constituye un clado al que se asigna usualmente la categor�a
de superfilo. Fue propuesto en 2013 por Rinke y colaboradores3? para englobar a un
grupo de arqueas relacionadas con las nanoarqueotas (las �nicas cultivadas). DPANN
es un acr�nimo formado por las iniciales de los cinco primeros grupos descubiertos,
Diapherotrites, Parvarchaeota, Aenigmarchaeota, Nanoarchaeota y Nanohaloarchaeota.
El superfilo DPANN agrupa filos con una variedad de distribuci�n ambiental y
metabolismo, que van desde formas simbi�ticas y term�filas obligatorias como
Nanoarchaeota, acid�filos como Parvarchaeota y no extrem�filos como Aenigmarchaeota
y Diapherotrites.

�ndice
1 Caracter�sticas
2 Clasificaci�n
3 Filogenia
4 Referencias
Caracter�sticas
Se caracterizan por su peque�o tama�o (tama�o nanom�trico), en consonancia con su
peque�o genoma, por lo que tienen capacidades catab�licas limitadas pero
suficientes como para llevar una vida libre, aunque muchas son episimbiontes que
dependen de una asociaci�n simbi�tica o parasitaria con otros organismos. Muchas de
sus caracter�sticas son similares o an�logas a las que poseen las bacterias
ultrapeque�as (grupo CPR).

Las capacidades metab�licas limitadas son producto del peque�o genoma y se refleja
en que muchos carecen de v�as biosint�ticas centrales para nucle�tidos, amino�cidos
y l�pidos; por lo que la mayor�a de las arqueas DPANN, como por ejemplo las arqueas
ARMAN, que dependen de otros microbios para cumplir con sus requisitos biol�gicos.
Pero las que tienen el potencial de vivir libremente son heter�trofos aerobios y/o
fermentativos.4?

En su mayor�a son anaerobias que no pueden cultivarse. Habitan en entornos extremos

como term�filas, hiperacid�filas, hiperhal�filas o metaloresistentes; o tambi�n en
el entorno templado de los sedimentos marinos y lacustres. Raramente se encuentran
en el suelo o en oc�ano abierto.4?

Clasificaci�n
Diapherotrites. Encontradas mediante el an�lisis filogen�tico de los genomas
recuperados de la filtraci�n de aguas subterr�neas de una mina de oro abandonada en
EE.UU.5?6?
Parvarchaeota y Micrarchaeota. Descubiertas en 2006 en aguas residuales fuertemente
�cidas de una mina de EE.UU..7?8?9? Son de muy peque�o tama�o y provisionalmente se
las denomin� ARMAN (Archaeal Richmond Mine Acidophilic Nanoorganisms) y son
simbiontes obligados de los Thermoplasmata.
Woesearchaeota y Pacearchaeota. Se han identificado tanto en sedimentos como en
aguas superficiales de acu�feros y lagos, abundando especialmente en condiciones
salinas.10?11?
Aenigmarchaeota. Encontradas en las aguas residuales de minas y en sedimentos de
fuentes termales.12?
Nanohaloarchaeota. Distribuidas en ambientes de alta salinidad.13? Son simbiontes
obligados de las haloarqueas.
Nanoarchaeota. Fueron las primeras descubiertas (en 2002) en una fumarola oce�nica
pr�xima a la costa de Islandia. Viven como simbiontes obligados de las
crenarqueas.14?15?16?
Filogenia
Utilizando un algoritmo de m�xima verosimilitud (RAxML con modelo PROTCATLG) basado
en secuencias del genoma que contienen 14 prote�nas ribos�micas (L2, L3, L4, L5,
L6, L14, L15, L18, L22, L24, S3, S8 , S17 y S19), se ha obtenido el siguiente
�rbol:4?

DPANN
?
?
Altiarchaeota

?
?
?
Diapherotrites

?
?
Micrarchaeota

?
?
?
?
?
Undinarchaeota

?
?
?
Aenigmarchaeota

?
?
?
Nanohaloarchaeota
?
?
?
?
Nanoarchaeota

?
?
Parvarchaeota

?
?
?
?
Mamarchaeota

?
?
?
Pacearchaeota

?
?
Woesearchaeota

?
?
?
?
?
?
?
?
Anal�sis filogen�ticos han sugerido que DPANN como clado puede no ser monofil�tico
y ser�a causado por la atracci�n de ramas largas. Anal�sis filogen�ticos sugirieron
que algunos de sus filos pueden pertenecer a Euryarchaeota, sin embargo es posible
que este acercamiento se ha debido a la transferencia horizontal de genes puesto
que una parte importante de los filos son endosimbiontes de arqueas de mayor
tama�o. Un ejemplo podr�a ser la colocaci�n de Nanohaloarchaeota con sus hu�spedes
las haloarqueas. Tambi�n es m�s probable que sea parafil�tico divergiendo primero
Altiarchaeota, Micrarchaeota, Diapherotrites y posteriormente las dem�s nanoarqueas
con las arqueas de mayor tama�o.17?

Referencias
Huber H, Hohn MJ, Rachel R, Fuchs T, Wimmer VC, Stetter KO. (2002). �A new phylum
of Archaea represented by a nanosized hyperthermophilic symbiont.�. Nature 417
(6884): 27 - 8. PMID 11986665.
Brochier C. et al. 2005 Nanoarchaea: representatives of a novel archaeal phylum or
a fast-evolving euryarchaeal lineage related to Thermococcales? Genome Biol.
2005;6(5):R42. Epub 2005 Apr 14.
Rinke, C., Schwientek, P., Sczyrba, A., Ivanova, N. N., Anderson, I. J., Cheng, J.
F., ... & Dodsworth, J. A. (2013). Insights into the phylogeny and coding potential
of microbial dark matter. Nature, 499(7459), 431-437.
Cindy J. Castelle & Jillian F. Banfield 2018, Major New Microbial Groups Expand
Diversity and Alter our Understanding of the Tree of Life. PERSPECTIVE, VOL 172,
Issue 6, P1181-1197, 2018, DOI:https://doi.org/10.1016/j.cell.2018.02.016
Genomes Online Database
Comolli LR, Baker BJ, Downing KH, Siegerist CE, Banfield JF (2009) Three-
dimensional analysis of the structure and ecology of a novel, ultra-small archaeon.
ISME J 3:159�167.
Baker, B. J., Tyson, G. W., Webb, R. I., et al.(2006) �Lineages of acidophilic
archaea revealed by community genomic analysis,� Science, 314(5807):1933�1935.
Murakami, S., Fujishima, K., Tomita, M., Kanai, A.(2012) Metatranscriptomic
analysis of microbes in an ocean-front deep subsurface hot spring reveals novel
small RNAs and type-specific tRNA degradation. Applied and Environmental
Microbiology 78(4):1015-22.
B. J. Baker, L. R. Comolli, G. J. Dick, L. J. Hauser, D. Hyatt, B. D. Dill, M. L.
Land, N. C. VerBerkmoes, R. L. Hettich, J. F. Banfield. Enigmatic, ultrasmall,
uncultivated Archaea. Proceedings of the National Academy of Sciences (2010).
Castelle, C. J., Wrighton, K. C., Thomas, B. C., Hug, L. A., Brown, C. T.,
Wilkins, M. J., ... & Taylor, R. C. (2015). Genomic expansion of domain archaea
highlights roles for organisms from new phyla in anaerobic carbon cycling. Current
Biology, 25(6), 690-701.
Ortiz-Alvarez, R., & Casamayor, E. O. (2016). High occurrence of Pacearchaeota and
Woesearchaeota (Archaea superphylum DPANN) in the surface waters of oligotrophic
high-altitude lakes. Environmental microbiology reports.
Takai, K., Moser, D. P., DeFlaun, M., Onstott, T. C. & Fredrickson, J. K. Archaeal
diversity in waters fromdeep south african gold mines. Appl. Environ. Microbiol.
67, 5750�5760 (2001).
Narasingarao, P. et al. (2012). "De novo metagenomic assembly reveals abundant
novel major lineage of Archaea in hypersaline microbial communities". ISME J. 6
(1): 81�93.
Waters, E., Hohn, M. J., Ahel, I., Graham, D. E., Adams, M. D., Barnstead, M.,
Beeson, K. Y., Bibbs, L., Bolanos, R., Keller, M., Kretz, K., Lin, X., Mathur, E.,
Ni, J., Podar, M., Richardson, T., Sutton, G. G., Simon, M., Soll, D., Stetter, K.
O., Short, J. M., Noordewier, M. (2003).
�The genome of Nanoarchaeum equitans: insights into early archaeal evolution and
derived parasitism�. Proc Natl Acad Sci U S A 100 (22): 12984�8.
Podar, M., Makarova, K. S., Graham, D. E., Wolf, Y. I., Koonin, E. V., Reysenbach,
A. L. (2013). Insights into archaeal evolution and symbiosis from the genomes of a
nanoarchaeon and its inferred crenarchaeal host from Obsidian Pool, Yellowstone
National Park. Biol. Direct 8:9
Nina Dombrowski, Tom A. Williams, Jiarui Sun, Benjamin J. Woodcroft, Jun-Hoe Lee,
Bui Quang Minh, Christian Rinke & Anja Spang (2020). Undinarchaeota illuminate
DPANN phylogeny and the impact of gene transfer on archaeal evolution. Nature.