Si se analizan 50 especies se pueden obtener 3 x 1076 árboles
diferentes Máxima parsimonía El método de máxima parsimonia se basa en la filosofía de que la explicación más simple, la que requiere menos cambios debe ser la correcta.
Mediante este método se obtienen árboles que ordenan las
ramas de modo tal que se minimiza el número de mutaciones que deben haber ocurrido. Máxima parsimonía Máxima parsimonía Máxima parsimonía Máxima parsimonía Máxima probabilidad Busca el árbol más verosímil, es decir, el árbol que es más probable que haya generado los datos que hemos observado.
En este método partimos de los datos y de un modelo de
evolución. Partiendo de esta base se calcula la probabilidad de que nuestros datos hayan sido generado por los distintos árboles posibles y se devuelve el árbol que presenta una máxima probabilidad.
Para poder calcular uno de estos árboles es imprescindible
elegir un modelo de mutación a priori. Máxima probabilidad Evaluación de los árboles filogenéticos Bootstrapping
Es un método de medición de la precisión que realiza un
proceso repetitivo de construcción de árboles que se producen después de una alteración discreta de un mismo set de datos Evaluación de los árboles filogenéticos