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PRÁCTICA N° 4

CAMBIOS DE LAS FRECUENCIAS GÉNICAS: MUTACIÓN, MUTACIÓN


SELECCIÓN Y LASTRE GENÉTICO

I. INTRODUCCION.-

MUTACIONES.- Las mutaciones son errores en la transmisión de información genética


de padres a la descendencia. El proceso de mutación es la última fuente de variación
genética en las poblaciones naturales. No obstante, esta variación tiene un costo, porque
la mayoría de las mutaciones tienen un efecto fenotípico que es deletéreo. Las mutaciones
ocurren en el nivel cromosómico y en el nivel molecular. Pueden o no pueden tener un
efecto perceptible en el fenotipo de individuos.

Sea µ la tasa de mutación del alelo A hacia otro alelo a. Si pt es la frecuencia del alelo A
en la generación t, si qt = 1 – pt es la frecuencia del alelo a y si no hay otras causas que
cambien las frecuencias alélicas, el cambio de la frecuencia alélicas es

Δp = pt - pt-1= µpt-1

Donde pt-1 es la frecuencia de la generación anterior. Esto nos indica que la frecuencia de
A disminuye (y la de a aumenta) proporcionalmente a la tasa de mutación µ y a la
proporción p de todos los alelos que están disponibles para mutar. Por lo tanto, Δp se hace
más pequeño a medida que la frecuencia de p disminuye (cada vez hay menos alelos A
que se convierten en a). Así, después de n generaciones de mutación

pn= poe-nµ

donde e es la base de los logaritmos naturales. Esta es la relación entre las frecuencias
alélicas y el número de generaciones; por ejemplo, para µ = 10-5 y después de 10 000
generaciones mutación recurrente de A→a,

p = poe- (10000) x (0.00001) = poe- 0.1 = po0.904

También se puede utilizar la siguiente relación

pn= po (1 - µ)n

Cada alelo tiene una tasa de mutación característica en la población. La tasa de mutación
regresiva (retromutación) y la tasa de mutación progresiva no suelen ser equivalentes. Si
la frecuencia inicial del alelo A1 es po y del alelo A2 es qo, la tasa de mutación progresiva
de A1 a A2 es µ y la retromutación de A2 a A1 es v. El cambio de de frecuencia del alelo
A2(Δq) en una generación de presión de mutación es:

Δq = µpo – vqo

Y el desequilibrio inicial en las frecuencias génicas disminuye progresivamente en las


generaciones sucesivas hasta que se logra el equilibrio
Δq = 0 = µp - vq

µ 𝐯
̂=
𝒒 𝒚 ̂=
𝒑
µ + 𝒗 µ + 𝐯

De manera que:
̂ = {v / (u + v)} / {μ / (μ + v)} = v / μ
̂/𝒒
𝒑

̂ = 0.625 y de
Por ejemplo, si 𝝁 = 0.00005 y v = 0.00003, la frecuencia en el equilibrio de 𝒒
̂
𝒑 = 0.375. La velocidad con la que se alcanza esta frecuencia de equilibrio por medio de
mutaciones es bastante lenta y se puede estimar a partir de Δq:

(μ + v)n = loge {(qo – 𝒒


̂) / (qn – 𝒒
̂)}

Donde n es el número de generaciones necesarias para alcanzar qn empezando en la


generación qo. Para el ejemplo anterior:
0.125 − 0.625
(0.00008)n = loge 0.375 − 0.625

n = 8,664 generaciones

EQUILIBRIO ENTRE SELECCIÓN Y MUTACIÓN.- El cambio en la frecuencia


génica por generación para un a recesivo deletéreo cuya frecuencia es q es igual a:

sq2(1 – q) / (1 – sq2)

Si s es pequeño el denominador puede tomarse como 1, por lo tanto la disminución de la


frecuencia es:
sq2 (1 – q)

Sin embargo, la frecuencia de los genes de nueva mutación a equivale a la tasa de


mutación (μ) de A → a multiplicada por la frecuencia de A, que es equivalente a 1 – q.
De esta manera la pérdida de genes a producida por selección se encuentra equilibrada
exactamente por la aparición de genes a por nueva mutación:

sq2 (1 – q) = μ (1 – q)

sq2 = μ
𝝁
q2 = 𝒔

𝝁
q = √𝒔

OBJETIVOS
- Demostrar que las mutaciones son un tipo de fuerzas naturales que cambian las
frecuencias alélicas en una población.
- Demostrar que las mutaciones están sujetas a la selección natural.
- Utilizar las hoja Excel como simulador virtual, para comprender de forma
esquemática el cambio de las frecuencias alélicas por procesos de mutación
selección.

MATERIALES Y METODOS
Utilizar problemas modelos y la hoja exel para realizar las simulaciones predictivas para
el comportamiento de p y q tras eventos de mutación y selección.

Experimento 1.
1. Se investigó una mutación dominante A (Acondroplácia) en humanos que se
expresa al nacer. Los registros mostraron seis casos 40 000 nacimientos. Las
genealogías familiares mostraron que, en dos de los casos las mutaciones ya se
presentaban en uno de los padres.

p0 0.9
q0 0.1

Mutantes
6 -2 = 4
(novo)
Gametos 40000*2 =
AA = Acondroplácia Totales 80000

 Calcule la taza de mutación espontanea:


𝑁ú𝑚𝑒𝑟𝑜 𝑑𝑒 𝑖𝑛𝑑𝑖𝑣𝑖𝑑𝑢𝑜𝑠 𝑚𝑢𝑡𝑎𝑛𝑡𝑒𝑠 (𝑛𝑜𝑣𝑜)
Taza de mutación () = 𝑔𝑎𝑚𝑒𝑡𝑜𝑠 𝑡𝑜𝑡𝑎𝑙𝑒𝑠

 = 4 / 80000 = 5 x 𝟏𝟎−𝟓

 Si la frecuencia del alelo normal A+ es de 0,999 en la población cuánto


vale q en la siguiente generación:

P1 = P0 (1-)

P1 = 0.9 (1-5 x 𝟏𝟎−𝟓 )


P1 = 0.899955
Q1 = 0.100045

 P disminuye en 0.00045
 Q incrementa en 0.00045
 Si la mutación espontanea se da en cada generación, cuantas generaciones
son necesarias para que A llegue a 0,5:

𝑃𝑛
ln ( ) P0 0.9
𝑃0
N=
ln (1−𝜇) Pn 0.5

0.5
ln ( ) −0.5877866649
0.9
N= = = 11765 𝑔𝑒𝑛𝑒𝑟𝑎𝑐𝑖𝑜𝑛𝑒𝑠
ln (1− 𝟓 𝐱 𝟏𝟎−𝟓 ) −5.000125004 𝑥 10−5

N = 11765 x 25 (Edad reproductiva promedio)


N = 294125

2. La acodroplasia es una mutación en el gen del factor de crecimiento de


fibroblastos (FGFR3), y este en condiciones de homocigosis es letal.

 ¿Cuál será la frecuencia real del alelo q en la siguiente generación?

Inicio: G0
p 0.9
q 0.1
Genotipos A1A1 A1A2 A2A2
0.81 0.18 0.01

Después de los eventos de Mutación: G1


p1 0.899955
q1 0.100045
Genotipos A1A1 A1A2 A2A2
0.809919 0.180072 0.010009

POBLACIÓN DE 106 PERSONAS:


A1A1 A1A2 A2A2
Genotipos
(normales) (Acondroplácia) (Letal)
809919 180072 10009
Partiendo de las frecuencias de q1 halle q2 y q3, y calcule el lastre genético.

GENERACIÓN 1:

Despues de los eventos de Mutación: G1


p1 0.899955
q1 0.100045
Genotipos A1A1 A1A2 A2A2
0.809919 0.180072 0.010009
P disminuye en 0.00045
Q incrementa en 0.00045

GENERACIÓN 1 A1A1 A1A2 A2A2


Antes de la selección 0.809919 0.180072 0.010009

Selección (S) 0 0 1
W (1-S) 1 1 0 W absoluta
Frecuencia despues de la S
0.809919 0.180072 0 0.989991
(W*Frec. Antes de la S)
Frecuencia nuevas
despues de la S (Frec. 0.818107 0.181893 0 1
Después de la S/W
Población 106 818107 181893 0
P1 (1/2*FA1A2+FA1A1) 0.909054
Q1 (1-P1) 0.090946

GENERACIÓN 2:

P1 0.909054
Q1 0.090946

MUTACIÓN
p2 0.909054 (1- 5 x 10−5 ) = 0.909009
q2 0.090991
Genotipos A1A1 A1A2 A2A2
0.826297 0.165423 0.008279
P disminuye en 0.000045
Q incrementa en 0.000045
GENERACIÓN 2 A1A1 A1A2 A2A2
Antes de la selección 0.826297 0.165423 0.008279

Selección (S) 0 0 1
W (1-S) 1 1 0 W absoluta
Frecuencia despues de la S
0.826297 0.165423 0 0.99172
(W*Frec. Antes de la S)
Frecuencia nuevas
despues de la S (Frec. 0.833196 0.166804 0 1
Después de la S/W
Población 106 833196 166804 0
P2 (1/2*FA1A2+FA1A1) 0.916598
Q2 (1-P1) 0.083402

GENERACIÓN 3:

P2 0.916598
Q2 0.083402
MUTACIÓN
p3 0.916598 (1- 5 x 10−5 ) = 0.916552
q3 0.083448
Genotipos A1A1 A1A2 A2A2
0.840068 0.152969 0.006964
P disminuye en 0.000046
Q disminuye en 0.000046
GENERACIÓN 3 A1A1 A1A2 A2A2
Antes de la selección 0.840068 0.152969 0.006964

Selección (S) 0 0 1
W (1-S) 1 1 0 W absoluta
Frecuencia despues de la S
0.840068 0.152969 0 0.993037
(W*Frec. Antes de la S)
Frecuencia nuevas
despues de la S (Frec. 0.845958 0.154042 0 1
Después de la S/W
Población 106 845958 154042 0
P3 (1/2*FA1A2+FA1A1) 0.922979
Q3 (1-P1) 0.077021
LASTRE GENÉTICO:

L = 1-W  1 – 0.993037 = 0.006963 frecuencia de personas que no contribuyen


a la eficacia biológica.
3. Realice similar trabajo cundo u = 0,0008 con coeficiente de selección de 0,3 con
desventaja solo de los recesivos.

GENERACIÓN 1:
P0 0.9
Q0 0.1

Despues de los eventos de Mutación: G1


p1 0.9 ( 1 - 0.0008) = 0.89928
q1 0.10072
Genotipos A1A1 A1A2 A2A2
0.808705 0.181151 0.010145
P disminuye en 0.00072
Q incrementa en 0.00072
GENERACIÓN 1 A1A1 A1A2 A2A2
Antes de la selección 0.808705 0.181151 0.010145

Selección (S) 0 0 0.3


W (1-S) 1 1 0.7 W absoluta
Frecuencia despues de la S
0.808705 0.181151 0.007102 0.996958
(W*Frec. Antes de la S)
Frecuencia nuevas despues de la
S (Frec. Después de la S/W 0.811173 0.181704 0.007123 1
absoluta)
Población 106 811173 181704 7123

P1 (1/2*FA1A2+FA1A1) 0.902025

Q1 (1-P1) 0.097975

GENERACIÓN 2:
P1 0.902025
Q1 0.097975

MUTACIÓN
p2 0.902025 (1 - 0.0008) = 0.901303
q2 0.098697
Genotipos A1A1 A1A2 A2A2
0.812347 0.177912 0.009741
P disminuye en 0.000722
Q incrementa en 0.000722
GENERACIÓN 2 A1A1 A1A2 A2A2
Antes de la selección 0.812347 0.177912 0.009741

Selección (S) 0 0 0.3


W (1-S) 1 1 0.7 W absoluta
Frecuencia despues de la S
0.812347 0.177912 0.0068187 0.997078
(W*Frec. Antes de la S)
Frecuencia nuevas despues de la
S (Frec. Después de la S/W 0.814728 0.178433 0.006839 1
absoluta)
Población 106 814728 178433 6839
P2 (1/2*FA1A2+FA1A1) 0.903945
Q2 (1-P1) 0.096055

GENERACIÓN 3:
P2 0.903945
Q2 0.096055

MUTACIÓN
p3 0.903945 (1 - 0.0008) = 0.903222
q3 0.096778
Genotipos A1A1 A1A2 A2A2
0.815810 0.174824 0.009366
P disminuye en 0.000721
Q incrementa en 0.000721
GENERACIÓN 3 A1A1 A1A2 A2A2
Antes de la selección 0.81581 0.174824 0.009366

Selección (S) 0 0 0.3


W (1-S) 1 1 0.7 W absoluta
Frecuencia despues de la S
0.81581 0.174824 0.0065562 1.000000
(W*Frec. Antes de la S)
Frecuencia nuevas despues de la
S (Frec. Después de la S/W 0.815810 0.174824 0.006556 1
absoluta)
Población 106 815810 174824 6556
P3 (1/2*FA1A2+FA1A1) 0.903222
Q3 (1-P1) 0.096778

LASTRE GENÉTICO:

L = 1-W  1 – 1 = 0 frecuencia de personas que no contribuyen a la eficacia


biológica. No hay variación genética; no hay genotipos deletéreos.
4. Si u= 0,0005 y v 0,0015 por generación en una población con p = 0,8 y q= 0,2,
calcule los valores de las frecuencias alélicas de equilibrio.


A1 >>>>> A2

0.8 0.2

P1 = P0 – P0 + Q0

Calcule los valores de q en las tres generaciones siguientes:

P1 = 0.8 - 0.8 (0,0005) + 0.2 (0,0015)


P1 = 0.7999
Q1 = 0.2001

P2 = 0.7999 - 0.7999 (0,0005) + 0.2001 (0,0015)


P2 = 0.799800
Q2 = 0.200200

P3 = 0.799800 - 0.799800 (0,0005) + 0.200200 (0,0015)


P3 = 0.799700
Q3 = 0.200300

Calcule el número de generaciones necesario para incrementar q de 0,2 a 0,21.

1 𝑃0−𝑃𝑒𝑞
N = + ln 𝑃𝑛−𝑃𝑒𝑞

Peq = (+) = 0.0015 (0.0015 + 0.0005) = 0.75


Qeq = 0.25

1 0.2−0.25
N = 0.0005+0.0015 ln 0.21−0.25 = 111.57 = 112 generaciones.

Si existe selección en contra de los recesivos (s=0,7), halle la q de equilibrio y el


lastre genético durante 5 generaciones:

P1 = 0.8 - 0.8 (0,0005) + 0.2 (0,0015)


P1 = 0.7999
Q1 = 0.2001
GENERACIÓN 1:

GENERACIÓN 1 A1A1 A1A2 A2A2


Antes de la selección 0.6398 0.3200 0.0400

Selección (S) 0 0 0.7

W (1-S) 1 1 0.3 W absoluta


Frecuencia despues de la S
0.6398 0.32 0.012000 0.971800
(W*Frec. Antes de la S)
Frecuencia nuevas despues de
la S (Frec. Después de la S/W 0.658366 0.329286 0.012348 1
absoluta)
Población 106 658366 329286 12348 0.164643

P1 (1/2*FA1A2+FA1A1) 0.823009

Q1 (1-P1) 0.176991

GENERACIÓN 2:
P 0.823009
Q 0.176991

MUTACIÓN
p2 0.823009 (1 - 0.0005) = 0.822597
q2 0.177403
Genotipos A1A1 A1A2 A2A2
0.676666 0.291862 0.031472
P disminuye en 0.000412
Q incrementa en 0.000412

GENERACIÓN 2 A1A1 A1A2 A2A2


Antes de la selección 0.676666 0.291862 0.031472

Selección (S) 0 0 0.7


W (1-S) 1 1 0.3 W absoluta
Frecuencia despues de la S
0.676666 0.291862 0.009442 0.977970
(W*Frec. Antes de la S)
Frecuencia nuevas despues de
la S (Frec. Después de la S/W 0.691909 0.298437 0.009654 1
absoluta)
Población 106 691909 298437 9654 0.149218
P2 (1/2*FA1A2+FA1A1) 0.841127
Q2 (1-P1) 0.158873

GENERACIÓN 3:
P 0.841127
Q 0.158873
MUTACIÓN
p3 0.841127(1 - 0.0005) = 0.840706
q3 0.159294
Genotipos A1A1 A1A2 A2A2
0.706787 0.267839 0.025375
P disminuye en 0.000421
Q incrementa en 0.000421
GENERACIÓN 3 A1A1 A1A2 A2A2
Antes de la selección 0.706787 0.267839 0.025375

Selección (S) 0 0 0.7


W (1-S) 1 1 0.3 W absoluta
Frecuencia despues de la S
0.706787 0.267839 0.007613 0.982239
(W*Frec. Antes de la S)
Frecuencia nuevas despues de
la S (Frec. Después de la S/W 0.719568 0.272682 0.007750 1
absoluta)
Población 106 719568 272682 7750 0.136341
P3 (1/2*FA1A2+FA1A1) 0.855909
Q3 (1-P1) 0.144091

GENERACIÓN 4:
P 0.855909
Q 0.144091

MUTACIÓN
p4 0.855909(1 - 0.0005) = 0.855481
q4 0.144519
Genotipos A1A1 A1A2 A2A2
0.731848 0.247267 0.020886
P disminuye en 0.000428
Q incrementa en 0.000428

GENERACIÓN 4 A1A1 A1A2 A2A2


Antes de la selección 0.731848 0.247267 0.020886

Selección (S) 0 0 0.7


W (1-S) 1 1 0.3 W absoluta
Frecuencia despues de la S
0.731848 0.247267 0.006266 0.985381
(W*Frec. Antes de la S)
Frecuencia nuevas despues de
la S (Frec. Después de la S/W 0.742706 0.250935 0.006359 1
absoluta)
Población 106 742706 250935 6359 0.125468
P4 (1/2*FA1A2+FA1A1) 0.868174
Q4 (1-P1) 0.131826
GENERACIÓN 5:

P 0.868174
Q 0.131826

MUTACIÓN
p5 0.868174(1 - 0.0005) = 0.867740
q5 0.13226
Genotipos A1A1 A1A2 A2A2
0.752973 0.229535 0.017493
P disminuye en 0.001434
Q incrementa en 0.001434
GENERACIÓN 5 A1A1 A1A2 A2A2
Antes de la selección 0.752973 0.229535 0.017493

Selección (S) 0 0 0.7


W (1-S) 1 1 0.3 W absoluta
Frecuencia despues de la S
0.752973 0.229535 0.005248 0.987756
(W*Frec. Antes de la S)
Frecuencia nuevas despues de
la S (Frec. Después de la S/W 0.762307 0.232380 0.005313 1
absoluta)
Población 106 762307 232380 5313 0.116190
P5 (1/2*FA1A2+FA1A1) 0.878497
Q5 (1-P1) 0.121503

PROBLEMAS

Problema 1
En una población la tasa de mutación es D → d es 4 x 10-6. Si hoy p = 0.8, ¿cuál será el
valor de p tras 50 000 generaciones?

p0 0.8
q0 0.2

Pn = P0 (𝟏 − )𝒏
)
P50000 = Escriba
0.8 (1 −aquí
4 𝑥la10
ecuación.
−6 50000
) = 0.65

p50000 0.65
q50000 0.35
Problema 2:
Si un gen muta con una velocidad de mutación 1 x 10-6 durante tan solo una generación
en una población de 10 millones de individuos, ¿cuántos de dichos genes mutantes
pasarán probablemente a la siguiente generación si el tamaño de la población permanece
constante?

𝑁ú𝑚𝑒𝑟𝑜 𝑑𝑒 𝑖𝑛𝑑𝑖𝑣𝑖𝑑𝑢𝑜𝑠 𝑚𝑢𝑡𝑎𝑛𝑡𝑒𝑠 (𝑛𝑜𝑣𝑜)


Taza de mutación () = 𝑔𝑎𝑚𝑒𝑡𝑜𝑠 𝑡𝑜𝑡𝑎𝑙𝑒𝑠

𝑁ú𝑚𝑒𝑟𝑜 𝑑𝑒 𝑖𝑛𝑑𝑖𝑣𝑖𝑑𝑢𝑜𝑠 𝑚𝑢𝑡𝑎𝑛𝑡𝑒𝑠 (𝑛𝑜𝑣𝑜)


1 x 10-6 = = 10 genes mutantes
10000000

Problema 3
Si un gen tiene una velocidad de mutación de A → a de 3 x 10-7 y no existe mutación en
sentido inverso, ¿cuál será la frecuencia de A después de a) 10 b) 100 c) 10,000 d)
1’000,000 generaciones de mutación?

Partimos de una frecuencia de 0.5

Si p0 es la frecuencia inicial de un alelo A que muta al alelo a con una frecuencia u por
generación, en la siguiente generación la frecuencia de A (p1) será:
p1 = p0 - up0 = p0 (1 - u)
En una generación más, la nueva frecuencia de A será:
p2 = p1 - up1 = p1 (1 - u) = p0 (1 - u) (1 - u) = p0 (1 - u)2
En n generaciones:
Pn = p0 (1 − u)𝑛

Por tanto, dado que p0 = 0,5 y u = 3𝑥10−7:


a) Tras 10 generaciones, la frecuencia de A será:
p10 = 0.5 (𝟏 − 𝟑𝒙𝟏𝟎−𝟕 )𝟏𝟎
10 = 0.499999

b) En 100 generaciones:
p100 = 0.5 (𝟏 − 𝟑𝒙𝟏𝟎−𝟕 )𝟏𝟎𝟎
100 = 0.499985

c) En 100.000 generaciones:
p100.000 = 0.5 (𝟏 − 𝟑𝒙𝟏𝟎−𝟕 )𝟏𝟎𝟎𝟎𝟎𝟎
100.000 = 0.485223

d) En 1000000 generaciones:
P1000000 = 0.5 (𝟏 − 𝟑𝒙𝟏𝟎−𝟕 )𝟏𝟎𝟎𝟎𝟎𝟎𝟎
1000000 = 0.370409

Problema 4
Cierta cepa de Drosophila presenta una velocidad de mutación de ojo normal (w+) a ojo
eosin (we) de 1.3 x 10-4 y una velocidad de mutación en sentido inverso de we → w+
de 4.2 x 10-5
Si la tasa de mutación w+ → we es u y la tasa de mutación we → w+ es v, y siendo las
frecuencias iniciales de w+ y we, p0 y q0, respectivamente

(a) ¿cuál es el valor de equilibrio de we?

En el equilibrio, no debe haber cambios en las frecuencias alélicas; por tanto, ∆p


= 0. Llamando pe y qe a las frecuencias alélicas de equilibrio y sabiendo que pe +
qe = 1

∆pe = vqe - upe = 0.


Así: upe = vqe
Y, por tanto: upe = v (1 - pe) = v - vpe; pe = v / (u + v)
De la misma manera: vqe = u (1 - qe) = u - uqe; qe = u / (u + v)

 = w+ → we = 1.3 x 10-4

 = we → w+ = 4.2 x 10-5

1.3 𝑥 10−4
𝑉𝑞𝑒 = 1.3 𝑥 10−4 + 4.2 𝑥 10−5 = 0.76

(b) ¿cuántas generaciones serán necesarias para que we pase de 0.1 a 0.5?

1 𝑄0−𝑄𝑒𝑞
N = + ln 𝑄𝑛−𝑄𝑒𝑞

1 0.1−0.76
N = 1.3 𝑥 10−4 + 4.2 𝑥 10−5 ln 0.5−0.76 = 5416.036069 = 5416 Generaciones.

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