Luis Sierra

1. Ejercicio 1. Enzimología
B. Ciclo de Krebs.
Citrato Sintasa
Tipo de enzima: La Citrato sintasa es una enzima del grupo de las Liasas,
Función: cataliza la condensación del Oxalacetato y la Acetil-CoA, para
formar Citrato. Esta reacción se considera la principal vía de entrada de
Carbono al ciclo, pues la Acetil-CoA se produce en grandes cantidades
durante el catabolismo de Glucidos, Lípidos y Aminoácidos; su oxidación en
el ciclo, produce la mayor parte de la energía metabólica. Citrato Sintetasa,
Citrato Oxalacetato Liasa, Citrogenasa y Enzima Condensante, son nombres
que a recibido esta enzima a través de los años, todos hacen referencia a la
formación del citrato, pero en la nomenclatura enzimática moderna, ya no se
aconseja su empleo. La enzima es grande y estable.
Regulación:

Aconitasa:
 Tipo de enzima: Pertenece al grupo de las Liasas, porque se considera que
la isomerización reversible, se lleva a cabo a través de reacciones de
deshidratación (eliminación) e hidratación (adición) sucesivas, a través del cis-
Aconitato, que sería un intermediario unido a la enzima. Sin embargo, evidencias
espectroscópicas sugieren que el intermediario de la reacción es un ión carbonio,
capaz convertirse en Isocitrato, Citrato o cis-Aconitato. A pesar de ello, en muchos
textos se incluye el cis-Aconitato como intermediario
Función: Es una enzima notable por la especificidad de la reacción que
cataliza, convirtiendo el Citrato no quiral, únicamente en uno de los cuatro
isómeros posibles quirales del Isocitrato, el 2R,3SIsocitrato o treo-D-Isocitrato, al
transponer el Grupo OH del Carbono 3 del Citrato hacia el Carbono 2, proveniente
del Oxalacetato, y jamás al que proviene de la Acetil-CoA. Los grupos encargados
de eliminar y añadir el H2O en forma de H+ y OH- se encuentran colocados en el
sitio activo en las posiciones adecuadas para asegurar la estereoespecificidad.
Regulación:

 Es regulada por la luz

 La proteína reguladora específica, el IRP1, se une a IREs en las regiones 5' y

3', pero sólo cuando la aconitasa carece del grupo hierro-azufre. La expresión
de IRP1 en los cultivos celulares ha revelado que la proteína funciona tanto
como una aconitasa activa, cuando las células están repletas de hierro, o
como una proteína activa de unión a ARN, cuando las células carecen de
hierro.

Actividad 1.2
Vmax :

1
0.008836=
Vmax

0.008836∗Vmax=1
 1
Vmax= =¿
0.008836

Vmax=113.17

Km :

−1
−0.01198=
Km

Km∗−0.01198=−1

−1
Km= =¿
−0.01198

Km=83.47

Ejercicio 1.3

• Acetilación:
La acetilación es una reacción química, nombrada como etanoilación en la
nomenclatura establecida por la IUPAC. Esta reacción introduce un grupo
funcional del acetilo en un compuesto químico que genera un grupo del acetoxi.
Implica la substitución de un grupo acetilo por un átomo de hidrógeno. Una
reacción que conlleva la sustitución del átomo de hidrógeno de un grupo hidroxilo
con un grupo acetilo, produce un éster específico, el acetato; la acetilación es un
nuevo mecanismo que regula la oxidación del ácido graso

En el cuerpo humano, una gran parte de las proteínas sufren la acetilación. En

células vivas, se produce como una transformación postraduccional de las
proteínas.
Este proceso, es principal para algunas de las reacciones químicas que son
fundamentales en el organismo, como, por ejemplo:

 Formación de proteínas
  Reacciones accionadas por las acetiltransferasas que pueden llevar al
cáncer y otras enfermedades

 Regla del ADN y de otros elementos genéticos a través de la de la

acetilación de la histona

 MODULADOR ALOSTÉRICO POSITIVO:

Un modulador alostérico (PAMs), es un fármaco que cumple una función

de regulación alostérica incrementando o disminuyendo indirectamente el efecto
de un agonista o agonista inverso sobre un receptor celular mediante la activación
del sitio catalítico en la proteína. Un modulador alostérico positivo incrementa la
actividad del receptor; la mayoría de las benzodiazepinas actúan como PAMs en
el GABA A receptores
Los positivos o también llamados activadores al interactuar con la enzima
permitirán que con concentraciones de sustrato menores obtengamos mayores
velocidades de reacción debido a que incrementan la acción de la enzima, el
centro alostérico en donde se une un efector positivo se conoce como centro
activador.
Existen dos sistemas de modulación alostérica:
Sistemas R
Se caracteriza por tener afinidades diferentes tanto por sustrato como por ligando.
Su actividad se regula ya sea positiva o negativamente por cambios en la afinidad
por el sustrato. Kcat no cambia, siendo Vmax constante, sólo cambia K0,5, como
se observa en la gráficas de las hojas.
Sistemas V
Se caracteriza porque tanto R como T presentan la misma afinidad por el sustrato,
con lo que se da en enzimas alostéricas sin cooperatividad (recordemos las
premisas). La diferencia, por tanto, entre las dos conformaciones es de distinta
Kcat. Es esto lo que permite que estos sistemas tengan representación sigmoide.
El trabajo del efector consiste en desplazar el equilibrio R"T, de modo que, si
predomina la forma de menor Kcat, disminuye la velocidad, siendo entonces un
inhibidor y viceversa.
Cooperatividad
En este modelo, son las interacciones entre las subunidades, bien positivas o
negativas, las que favorecen o impiden la unión de ligando a la adyacente. De este
modo llamamos cooperatividad positiva a las interacciones favorecedoras de la
unión de ligando y negativa a las desfavorecedoras.

2. Ejercicio 2. Bioenergética
B. FADH a FADH2
El flavín adenín dinucleótido o dinucleótido de flavina y adenina (abreviado FAD en
su forma oxidada y FADH2 en su forma reducida) es una coenzima que interviene
en las reacciones metabólicas de oxidación-reducción
El FAD es una molécula compuesta por una unidad de riboflavina (vitamina B2),
unida a un pirofosfato (PPi), éste unido a una ribosa y ésta unida a una adenina.
Por tanto, la molécula es en realidad ADP unido a riboflavina; o
también AMP unido a la coenzima FMN.
El FAD es una coenzima que interviene como dador o aceptor
de electrones y protones (poder reductor) en reacciones metabólicas redox; su
estado oxidado (FAD) se reduce a FADH2 al aceptar
dos átomos de hidrógeno (cada uno formado por un electrón y un protón), según
la siguiente reacción:

Por tanto, al reducirse capta dos protones y dos electrones, lo que lo capacita para

intervenir como dador de energía o de poder reductor en el metabolismo. Por
ejemplo, el FAD (y también el NAD) se reduce en el ciclo de Krebs y se oxida en
la cadena respiratoria (respiración aeróbica).
La función bioquímica general del FAD es oxidar los alcanos a alquenos, mientras
que el NAD+ (una coenzima con similar función) oxida
los alcoholes a aldehídos o cetonas. Esto es debido a que la oxidación de un
alcano (como el succinato) a un alqueno (como el fumarato) es
suficientemente exergónica como para reducir el FAD a FADH2, pero no para
reducir el NAD+ a NADH.
La reoxidación del FADH2 (es decir, la liberación de los dos electrones y dos
protones capturados) tiene lugar en la cadena respiratoria, lo que posibilita la
formación de ATP (fosforilación oxidativa).
Muchas oxidorreductasas, requieren FAD como coenzima para oxidar los
substratos. Pero en el enzima succinato deshidrogenasa, que oxida
el succinato a fumarato en el ciclo de Krebs, el FAD es realmente un grupo
prostético, ya que está unido fuerte y permanentemente a la enzima mediante
un enlace covalente.