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Enzimas I PDF
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CONCEPTO DE ENZIMA
– nombres particulares
– Nombre sistemático:
3 partes:
el sustrato preferente - el tipo de reacción realizado – terminación “asa“.
Ej: glucosa fosfato isomerasa que cataliza la isomerización de la glucosa-6-
fosfato en fructosa-6-fosfato. Si es hidrólisis, el segundo componente del
nombre se omite y por ejemplo, la lactosa hidrolasa se llama simplemente
lactasa.
– código de la comisión enzimática (enzyme comission): encabezado por las
letras EC (enzyme commission), seguidas de cuatro números separados
por puntos:
Clase . Subclase . grupos químicos específicos que intervienen en la reacción.
Clase 1: OXIDORREDUCTASAS
Clase 2: TRANSFERASAS
Clase 3: HIDROLASAS
Clase 4: LIASAS
Clase 5: ISOMERASAS
Clase 6: LIGASAS
Enzimas
O O
H-Bond H
C O
H3 C C O
Ionic
C O bond
O H3 C C
H3N
O
Interacciones posibles vdw-interactions
H-Bond
van der Waals
Ionic
Mecanismos catalíticos
Catálisis ácido/base
• Histidine
+H
NH NH
N -H N
H
No-ionizada Ionizado
Actua como base Actua como ácido
(sumidero de protones) (fuente de protones)
Ataque nucleofílico
H H
H3N CO2 H3N CO2
L-Serine L-Cysteine
OH SH
Estabilizacion de
este complejo
Mecanismo de la ribonucleasa pancreatica
[ R] [ R]0 e kt 1
1
kt
ln [ R] ln [ R]0 kt [ R] [ R]0
Gráficos de primer orden
CH3NC CH3CN v= [CH3NC]
Gráficos de segundo orden
NO2 + CO NO + CO2 v= [NO2]2
Para una reacción química común, la
velocidad en el tiempo cae debido a:
PoS
tiempo
Para una enzima, la velocidad en el tiempo
cae debido a:
Disminuye la concentración de reactivo (sustrato)
• La reacción inversa se hace importante al aumentar la [P]
• El producto puede inhibir a la enzima
• Cambios de PH o temperatura pueden modificar a la
enzima en el curso de la reacción
• Al disminuir la [S] puede disminuir la saturación de la
enzima
Unidades de actividad enzimática
1/v
1/[S])
2.2. Representación de Hanes
Si multiplicamos ambos miembros de la ec. de dobles inversos, por [S], obtendremos,
1 Km 1
S
1
v V max V max S
S Km
S
v V max V max
S
La representación de [S]/v frente a [S], da una recta:
Km 1
S
v V max V max
y = b + m x
- Esta representación se conoce como representación de Hanes, representación de
Woolf o de Hanes-Woolf.
Pendiente = 1/Vmax
[S]/v corta en el eje [S]/v en un punto = Km/Vmax,
corta en el eje [S] en un punto = - Km
m = tg = 1/Vmax
- Km
Km/Vmax
[S]
¿Cómo afectarán los errores de medida de la velocidad de reacción en esta
representación?
* En esta representación, como puede verse en la siguiente figura, los errores en [S]/v
son un reflejo mucho más fiel de los errores cometidos al medir el valor de v. Por este
motivo, la representación de Hanes es preferible a otras linealizaciones de la ecuación
de Michaelis-Menten.
[S]/v
[S]
2.3.Representación de Eadie-Hofstee.
1 1 Km 1
vV max
v V max V max S
Si multiplicamos ambos miembros de la ecuación de inversos por v * Vmax
obtenemos,
Vmax = v + (Km v)/[S]
v
y reordenando
v V max Km
S
y = b - m x
m = tg = -Km
Vmax/Km
v/[S]
La representación de v frente a v/[S] nos da una recta de:
- pendiente = -Km
- corte en el eje v = Vmax
- corte en el eje v/[S] = Vmax/Km
Aspectos Positivos
Aspectos Negativos
S 0
.
5
v
k cat E 0
m
a
x
0
.
4
L v
S 0
S 0
.
3
KM 0
,
5vm
a
x
d[P]/t
0
.
2
vS K M vmax 2 0
.
1
0
.
0
K
M
0 1
0 2
0 3
0
[
S]
Competicion de sustratos
KM y Vmax dependen del enzima y del sustrato