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Fundamentos y Técnicas de Análisis Microbiológicos Manual Bergey's - 1
Fundamentos y Técnicas de Análisis Microbiológicos Manual Bergey's - 1
Manual de Bergey
La clasificación propuesta por esta primera edición del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology
está basada en la tinción de Gram. Así, agrupa a todas las bacterias en un solo Reino: el
Procaryotae, en el que se reconocen cuatro divisiones: Gracilicutes (procariotas, con pared celular,
gramnegativas), Firmicutes (procariotas, con pared celular, grampositivas), Tenericutes
(procariotas, sin pared celular) y Mendosicutes (procariotas filogenéticamente anteriores a las
divisiones mencionadas, como las arquebacterias y otras)
En esta primera edición de la nueva etapa, las bacterias se distribuyen en secciones. Las distintas
secciones se han constituido sobre la base de caracteres descriptivos morfológicos y metabólicos,
por ejemplo, espiroquetas, cocos y bacilos aerobios gramnegativos, cocos grampositivos, etc.
En cada una de las 33 secciones que lo componen se engloban distintos rangos taxonómicos que
varían considerablemente. Algunos llegan a tratar de divisiones, en tanto que otros se ocupan de
géneros. Un carácter que se mantiene constante es el estudio de géneros y sus correspondientes
especies, categorías taxonómicas ambas que son fundamentales en su estructuración. Los que no
encajan perfectamente en alguna de las familias o secciones se les denomina «género de afiliación
dudosa» o se incluyen en el de «otros géneros». Las especies no bien descritas, definidas sin cepa
tipo, neotipo o de referencia, se catalogan como species incertae sedis.
En 2001 apareció el primero de los cinco volúmenes de la segunda edición del Bergey's Manual of
Systematic Bacteriology. Esta segunda edición se publicará en cinco volúmenes, y contendrá más
información ecológica que clínica. Hasta ahora no se han publicado más volúmenes.
Volumen I:
Trata del dominio Archaea, en su totalidad y de algunas bacterias Gram negativas especiales, como
las Cianobacterias. En este volumen no hay casi ninguna bacteria de importancia clínica.
Volumen II:
Proteobacterias, bacterias Gram negativas . Dividido en cinco secciones (alfa, beta, delta, gamma y
épsilon proteobacterias), el reino Proteobacteria agrupa a la mayor parte de las bacterias Gram
negativas de importancia clínica.
Neisseria, Brucella, Legionella, Pseudomonas, Haemophilus, Campylobacter y Enterobacterias,
pertenecen a este reino.
Volumen III:
Tratará sobre los Gram positivos con bajo contenido en G+C.
Aquí aparecerán géneros como Staphylococcus, Streptococcus, Enterococcus, Clostridium y
Bacillus
Volumen IV:
Contendrá una sola sección que agrupará a todos los Gram positivos con alto contenido en G+C
Los géneros más conocidos de este volumen serán Mycobacterium y Corynebacterium.
El Volumen V tratará de otras bacterias Gram negativas, agrupadas en ocho secciones diferentes.
No tienen ningún factor en común. Los géneros más importantes desde el punto de vista clínico
serán Chlamydia, Treponema, Borrelia o Bacteroides
A pesar de todos estos cambios y avances en los criterios de clasificación, la identificación sigue
basándose en la distinción entre géneros y especies, que apenas se han modificado. Por este motivo
podemos seguir utilizando sin mayores dificultades la novena edición del Bergey's Manual of
Determinative Bacteriology (que además es el único que poseemos) hasta que se complete la
publicación de la segunda edición del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology
A pesar de que no disponemos de más referencias sobre los restantes volúmenes de la segunda
edición, sí podemos disponer de la clasificación "oficial" que en ellos se recogerá.
El último índice publicado de la clasificación de bacterias se actualizó en abril del 2001 y está a
vuestra disposición en la página web del Manual Bergey`s.
Una copia de este índice está a vuestra disposición en el Laboratorio de Microbiología, y sobre
dicha copia debéis establecer los rangos taxonómicos del microorganismo que os ha sido asignado.
Aunque la novena edición del Bergey's Manual of Determinative Bacteriology contiene mucha información
derivada de los cuatro volúmenes del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, no debería ser
considerada una versión resumida de éste último. En cambio, trata específicamente de un aspecto de
taxonomía bacteriana: la identificación de las bacterias. Este libro ha sido diseñado especialmente para
aquellas personas que están comprometidas inicialmente en la identificación de las bacterias, y a las cuales
no concierne la clasificación (ordenación de microorganismos en taxones). Además, ha sido actualizado con
vistas a los diversos cambios de nomenclatura y nuevos taxones que han sido descritos desde que los
volúmenes del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology fueron publicados.
Aunque este libro contiene muchos datos necesarios para la identificación bacteriana, no contiene la
abundancia de información descriptiva sobre géneros y especies que proporciona el Bergey's Manual of
Systematic Bacteriology. Por ejemplo, no contiene información detallada de las especies, ni información
concerniente a la clasificación o nomenclatura de las bacterias, o métodos para el enriquecimiento o
aislamiento de diversas especies. Además, no incluye esquemas de identificación para ciertos grupos de
géneros o especies porque alguno de ellos requiere métodos muy sofisticados para el cultivo y/o
identificación. (p.ej. las rickettsias) o carecen de suficientes características diferenciales (p. ej. especies de
Bacillus).
Los esquemas de identificación no son los esquemas de clasificación, aunque pueda existir una
cierta similitud. Un esquema de identificación para un grupo de microorganismos será establecido
solo después de que el grupo haya sido clasificado inicialmente ( es decir, siendo reconocido como
diferente de otros microorganismos); está basado en uno o más caracteres o sobre un patrón de
caracteres que todos los miembros del grupo tienen y que otros grupos no tienen.
Los caracteres usados no son generalmente aquellos que se utilizan en la clasificación del grupo;
por ejemplo, la clasificación puede estar basada en un estudio de hibridación del DNA/DNA,
mientras que la identificación puede basarse sobre caracteres fenotípicos que se correlacionan bien
con la información genética.
En general, los caracteres escogidos para un procedimiento de identificación deben ser fácilmente
determinables, mientras que aquellos que son usados para la clasificación pueden ser bastante
difíciles de determinar (tales como los valores de homología del DNA).
Los caracteres estudiados deberían ser también pocos en cantidad, mientras que la clasificación
puede involucrar un gran número de características, tal y como sucede en el estudio de la taxonomía
numérica.
Las reacciones serológicas, que generalmente tienen un valor limitado en la clasificación, a menudo
tienen enorme valor para la identificación. Los test de aglutinación en porta, las técnicas de
anticuerpos fluorescentes, y otros métodos serológicos, pueden ser realizados sencilla y
rápidamente y generalmente suelen ser muy específicos; por esta razón ofrecen los medios
necesarios para la identificación presuntiva y rápida de las bacterias. Su especificidad no es del
100%, y es necesaria la confirmación de la identificación por test bioquímicos o fisiológicos
adicionales.
En algunos géneros y especies, la identificación puede basarse no en unos pocos tests, sino sobre un
patrón dado por la aplicación de un batería completa de tests. Los miembros de la familia
Enterobacteriaceae representan un ejemplo típico de esto. Para disminuir la necesidad de inocular
un gran número de medios en tubo, se han desarrollado una gran variedad de sistemas multitest
rápidos y adecuados para usar en la identificación de diversos taxones, sobre todo aquellos de
importancia médica.
Categoría I
(Eubacterias Gram-negativas que tienen pared celular); Grupos 1-16.
1. *.Espiroquetas
2. * Bacterias Gram-negativas aeróbicas o microaerófilas, móviles, helicoidales o vibrioides
3. - Bacterias Gram-negativas curvadas no móviles o rararamente móviles
4. * Cocos y bacilos Gram-negativos aeróbicos o microaerófilos
5. * Bacilos Gram-negativos anaerobicos facultativos
6. * Bacilos Gram-negativos, anaerobicos, rectos, curvados, y helicoidales
7. - Bacterias desasimiladoras de azufre o reductoras de sulfatos
8. - Cocos anaeróbicos Gram-negativos
9 * Rickettsias y Chlamydias
10 - Bacterias fotosintéticas anoxigénicas
11 - Bacterias fotosintéticas oxigénicas
12 - Bacterias quimiolitotroficas aeróbicas y microorganismos relacionados
13 - Bacterias con apéndice y/o que geman
14 - Bacterias con vaina
15 - Bacterias deslizantes no fotosintéticas, no frutescentes
16 - Bacterias deslizantes frutescentes: Myxobacteriales
Categoría II
(Eubacterias Gram-positivas que tienen pared celular); Grupos 17-29.
17 * Cocos Gram-positivos
18 * Cocos y bacilos Gram-positivos formadores de esporas
19 * Bacilos Gram-positivos no formadores de esporas con morfología regular
20 * Bacilos Gram-positivos no formadores de esporas con morfología irregular
21 * Mycobacterias
22 * Actinomycetos nocardioformes
23 - Generos con esporangio multilocular
24 - Actinoplanetos
25 - Streptomycetos y géneros relacionados
26 - Maduromycetos
27 - Thermomonospora y géneros relacionados
28 - Thermoactinomycetos
29 - Otros Géneros
Categoría III
(Eubacterias carentes de pared celular: Mycoplasmas o Mollicutes); Grupo 30.
30 * Mycoplasmas
Categoría IV
(Archaeobacteria); Grupos 31-35.
31 - Metanógenos
32 - Archaeal reductoras de sulfato
33 - (Halobacteria) Archaeobacteria extremadamente halofílicas
34 - Archaeobacteria sin pared celular
35 - Metabolizadoras de sulfato extremadamente termofílicas e hipertermofílicas
The Category I
(Gram-negative eubacteria that have cell walls); Groups 1-16.
1. The Spirochetes
2. Aerobic/microaerophilic, Motile, Helical/Vibrioid Gram-negative bacteria
3. Nonmotile (or rarely motile), Gram-negative curved bacteria
4. Gram-negative aerobic/microaerophilic Rods and Cocci
5. Facultatively Anaerobic Gram-negative Rods
6. Gram-negative, Anaerobic, Straight, Curved, and Helical Rods
7. Dissimilatory sulfate- or sulfur-reducing Bacteria
8 Anaerobic Gram-negative Cocci
9 The Rickettsias and Chlamydias
10 Anoxygenic Phototrophic Bacteria
11 Oxygenic phototrophic Bacteria
12 Aerobic Chemolithotrophic bacteria and associated organisms
13 Budding and/or appendaged Bacteria
14 Sheathed Bacteria
15 Nonphotosynthetic, Nonfruiting Gliding Bacteria
16 Fruiting Gliding Bacteria: The Myxobacteria
The Category II
(Gram-positive eubacteria that have cell walls); Groups 17-29.
17 Gram-positive Cocci
18 Endospore-forming Gram-positive Rods and Cocci
19 Regular, Nonsporing Gram-positive Rods
20 Irregular, Nonsporing Gram-positive Rods
21 The Mycobacteria
22 Nocardioform Actinomycetes
23 Genera with Multilocular sporangia
24 Actinoplanetes
25 Streptomycetes and related genera
26 Maduromycetes
27 Thermomonospora and related genera
28 Thermoactinomycetes
29 Other Genera
The Category IV
(Archaeobacteria); Groups 31-35.
31 The Methanogens
32 Archaeal sulfate reducers
33 Extremely halophilic archaeobacteria (Halobacteria)
34 Cell wall-less archaeobacteria
35 Extremely thermophilic and hyperthermophilic S0-metabolizers