Compartimientos ] a intracelulares y clasificacidn de proteinas |, jopenmnsinsem Loe + Hltransporte de moléculas hhaea dentro yhacia fuera del mcs + Hl transporte de protefnas a interior de mitocondrias de eloroplstos = Peroxisomas + Blrerfculoendoplasmético A diferencia de las bacterias, que generalmente constan de un tinico compart miento rodeado por una membrana plasmatica, la célula eucariota esté subdivi- dida en compartimientos rodeados por membrana, que son funcionalmente dit tintos. Cada compartimiento u orgdnulo contiene su propia coleccién de enzimas, otras moléculas especializadas y un complejo sistema de distribucion que transporta especificamente los compuestos de un compartimiento a otro. Para entender la célula eucariota es necesario conocer lo que sucede en cada uno de estos compartimientos, cémo se desplazan las moléculas entre ellos y ‘emo se generan los compartimientos a sf mismos y se conservan. Las proteins juegan un papel central en la compartimentacidn de una célula ‘eucariota. Catalizan las reacciones que tienen lugar en cada orgénulo y transpor- tan selectivamente pequefias moléculas hacia dentro y hacia fuera de su interior © lumen. También actiian como marcadores especificos de superficie de los orgé- rnulos que dirigen el destino de proteinas y de lipidos al orgénulo apropiado. Una célula de mamifero contiene aproximadamente 10 mil millones (10) de molécu- las de proteina, de unos 10 000 tipos distintos. La sintesis de la mayorfa de todas estas protefnas empieza en el citosol, el espacio comiin que engloba a os organu- Jos. Una vez sintetizada, cada proteina es transportada espectficamente al com- partimiento celular que la necesita. Por ello el tema central de este capitulo y tambien del siguiente serd el tréfico intracelular de proteins, El conocimiento de este tréfico de proteinas desde un compartimiento a otro permite empezar a comprender el desconcertarte laberinto de membranas intracelulares. La compartimentacién de las células superiores En esta secci6n introductoria vamos a dar una visién general de los distintos compartimientos de la células y de las relaciones que existen entre ellos. Para poder hacerlo, hemos organizado los orgénulos conceptualmente en un peque- fo mimero de familias, revisando cémo las proteinas se dirigen a orgdnulos es- ppectficos y cémo atraviesan las membranas de los orgénulos. ‘Todas las células eucariotas tienen la misma coleccién basica de orgdnulos rodeados de membrana’ Muchos procesos bioquimicos vitales ocurren en o sobre superficies de mem- brana. Asi, el metabolismo lipidico esta catalizado mayoritariamente por enzi-lendosoma cnosot | compisjo de Gogh peroxisoma ‘etiulo endoplasmético }— ton potirioosomas ‘hides a a membrana potiribosomas Moe requieren una membrana semipermeable para acoplar el transporte de H’ con la sint de ATP. Ademés, los sistemas de membranas intracelulares no sdlo proporcio- nan un érea extra de membrana, sino que crean compartimientos que estan se- parados del citosol, dando a la célula espacios acuosos funcionalmente especia~ lizados. Como la bicapa lipfdica de los orgénulos de membrana es impermeable a la mayoria de las moléculas hidrofficas, la membrana de cada orgénulo ha de disponer de proteinas transportadoras que son responsables de la importacion 0 exportacién de metabolitos especificos. Cada membrana de un orgénulo ha de tener también un mecanismo de importacién y de incorporacién al orgénulo de las proteinas espectficas que hacen que dicho orgénulo sea tinico. En la Figura 12-1 se ilustran los compartimientos mas importantes comunes a todas las células eucariotas. El muicleo contiene el genoma principal y es el lu- gar més importante de sintesis de DNA y de RNA. El citoplasma que lo circunda consiste en el cizasol y los orgdnutos citoplasméticos suspendidos en él. El citosol constituye un poco mas de la mitad del volumen total de la c¢lula y es el lugar donde no sélo tiene lugar la sintesis de proteinas sino también donde se desa- rrollan la mayoria de las teacciones del metabolismo intermediatio celular ~es decir, el elevado ntimero de reacciones mediante las cuales algunas moléculas pequefias son degradadas y otras son sintetizadas proporcionando los elemen- tos para la construccién de las macromoléculas (se explica en el Capitulo 2). ‘Aproximadamente la mitad del érea total de membrana de una célula se uti- liza para englobar los espacios laberinticos del reticulo endoplasmatico (ER). El ER presenta muchos ribosomas unidos a su superficie citoplasmética, los cuales sintetizan proteinas integrales de membrana y proteinas solubles destinadas a ser segregadas 0 a ser transportadas a otros orgdnulos. Veremos que existe una diferencia importante entre el sistema a través del cual las proteinas son dirigidas al ER 0 a otros organulos citoplasmaticos: mientras que las protefnas son translo- cadas a otros orgdnulos solamente cuando su sintesis ha concluido, son translo- cadas al ER durante su s{ntesis, por lo que los ribosomas sobre los que se estén produciendo estan unidos ala membrana del ER. EI ER también produce los lipi- dos del resto de la célula y también actiia como almacén de iones Ca’. El comple- Jo de Golgi consiste en una serie de compartimientos organizados en forma de sa- cos discoidales llamados cisternas del Golgi: recibe lipidos y protenas del ER y las distribuye hacia diferentes destinos intracelulares, generalmente modificéndolas covalentemente durante el viaje. Las mitocondrias y (en las plantas) los cloroplastos, generan la mayor parte del ATP que se utiliza para desplazar las reacciones biosintéticas que requieren un aporte de energia libre. Los lisosomas presentan enzimas digestivas que de- 590 Capitulo 12: Compartimientos intracelulares y clasificaci6n de proteinas Figura 12-1 Les prinelpales ‘compartimientos intracelulares de ‘una célula animal. 1 citosol (gris), el reticulo endoplasmatico, el complejo de Golgi, el nicleo, las mitocondrias, Jos endosomas, los lisosomas y os peroxisomas son diferentes compartimientos que se hallan aislados del resto dela célula ‘mediante, al menos, una membrana dotada de permeabilidad selectiva.‘Tabla 12-1. Voldmenes relatives ocupados por los prinelpales'compartimlentos intracelulares en una célula hepética tipica (hepatocito) Compartimiento Porcentajedelvolumen Niimero aproximado intracelular celular total por eéhulat Citosot 54 1 Mitocondria 2 1700 Vesiculas del ER rugoso 9 1 ‘Ves{culas del ER liso y de Golgi 6 Nuicleos 6 1 Peroxisomas 1 400 Lisosomas 1 300 Endosomas 1 200 * Se eree que todas las cisternas del reticulo endoplasmatico liso y rugoso estén conectadas,for- ‘mando un tinico gran compartimiento. En cada célula el complejo de Golgi esté organizado en lun niimero dscreto de grupos de cisternas apiladas (dictiosomas) y todavia no se ha establecido claramente el grado de interconexién entre ellos. gradan tanto orgénulos muertos como macromoléculas y particulas captadas del exterior de la célula por endocitosis. En su camino hacia los lisosomas, las macromoléculas y las partfculas endocitadas primero han de pasar por una serie de compartimientos llamados endasomas. Los peroxisomas (también conocidos como microcuerpos) son pequefios compartimientos vesiculares que contienen enzimas que participan en diversas reacciones oxidativas. En general, cada orgé- nulo rodeado por membrana realiza el mismo tipo de funciones basicas en to- dos los tipos celulares pero varfa en abundancia y puede tener propiedades adi- cionales que differen de un tipo celular a otro de acuerdo con las funciones especializadas de las células diferenciadas. En su conjunto, estos orgénulos ocupan casi la mitad del volumen celular (Ta- bla 12-1), y se tequiere una gran cantidad de membranas intracelulares para fabri- carlos todos. Asf, en las dos células de mamifero que se analizan en la Tabla 12-2, ‘Tabla 12-2 Cantidades relativas de tipos de membrana en dos células eucariotas + Porcentaje de membrana celular total Célula exocrina Tipo de membrana Hepatocito* ancredtica* ‘Membrana plasmética 2 5 Membrana del ER rugoso 35 60 ‘Membrana del ER liso 16 <1 Membrana del complejo de Golgi 7 10 Mitocondrias Membrane externa 7 4 Membrana intema 32 " Nuicleo Membrana interna 02 o7 ‘Membrana de las ves{culas secretoras no determinado 3 ‘Membrana de los lisosomas oa no determinado Membrana de los peroxisomas 0 no determinado Membrana del endosoma oa no determinado Estas dos células son de tamaho muy diferente, ya que el hepatocito lene como promedio un volumen de 5000 ym, en comparacién a los 1000 jm? de la eélula exocrina pancredtica, Las reas totales de membrana celular se estiman en 110 000 ym y 13 000 yn, respectivamente, ‘La compartimentacién de las eélulas superioresratculo endoplismatco si peroxisomes mitcondiae el reticulo endoplasmatico tiene una superficie de membrana total que es 25 y 12, ‘veces mayor respectivamente que la membrana plasmaitica. En términos de su- perficie y de masa, pues, en la mayorfa de la células eucariotas la membrana plasmética es s6lo una membrana minoritaria (Figura 12-2), Los organulos rodeados de membrana no se hallan distribuidos al azar en el citosol; por el contrario, a menudo ocupan posiciones caracteristicas. Asi, en la mayoria de células el complejo de Golgi esta cerca del nuicleo mientras que la red de ttibulos del ER se extiende a partir del nticleo por todo el citosol. Estas dis- tribuciones caracteristicas parecen depender de las interacciones de los orgénu- Jos con el citoesqueleto: por ejemplo, la localizacién del ER y del complejo de Golgi depende de la red de microtuibulos. Si se despolimerizan experimental- ‘mente los microtiibulos con una droga, el complejo de Golgi se fragmenta y se dispersa por toda la célula y la red del ER se colapsa hacia el centro celular, 0 ccentrosoma, a partir del cual emerge la red de microtibulos (véase Capitulo 16). La relaci6n topolégica de los orgénulos rodeados de membrana puede ser interpretada en términos de sus origenes evolutivos? Para entender la relacién que existe entre los compartimientos de la célula, re- sulta ttil considerar c6mo pueden haber evolucionado. Se cree que los precur- sores de las primeras células eucariotas fueron organismos parecidos @ bacte- rias, los cuales generalmente tienen membrana plasmatica pero no membranas internas. En estas células, por lo tanto, la membrana plasmética realiza todas las funciones dependientes de membrana, como el bombeo de protones, a sintesis de ATP, y la sintesis de lipidos. No obstante, las células eucariotas actuals tie- 592 Capftulo 12: Compartimientos intracelulares y clasificacién de proteinas Figura 12-2 Blectronmicrogratia de ‘una parte de una eélula hepatica vista ‘en secel6n transversal. Se indica ‘ejemplos dela mayoria de los principales compartimientos Intracelulares. (Por cortesfa de Daniel S. Friend.) ® © Figura 12-3 Organizacién de ‘membranas espectalizadas en las Dacterias. (A) Zonas (patches) dela superficie celular, consistentes en lizadas de ‘membrana plasmatica que incrementan la cantidad de membrana disponible para funciones ‘especializadas, como por ejemplo, para fotosintesis. (C) Internalizacién de las zonas invaginadas de ‘membrana, formando vesiculas cuya ‘cara interior es topoldgicamente ‘equivalente ala cara exterior de la ‘célula. En algunos tipos de bacterias {otosintéticas se presentan vesiculas dde membrana de este tipo; su relacién, topol6gica con la superficie dela célula es similar a la del ER, fa del complejo de Golgi, lade los cendosomas y lade ls lisosomas en las células eucatiotas.nen una dimensi6n lineal entre 10 y 30 veces mayor y un volumen entre 1000 y 10 000 veces mayor que una bacteria tipica como E, coli. Se puede proponer que la profusi6n de membranas internas responde en parte a una adaptaciGn a este incremento en tamafio: las células eucariotas tienen una relacién entre superfi- cie y volumen mucho menor, de forma que probablemente el drea de su mem- brana plasmética es demasiado pequefia para contener la gran cantidad de fun- clones vitales ligadas a membrana que presenta una célula. Evidentemente, la evolucién de las membranas internas ha sido paralela a la especializacién de la funcién de las membranas. En algunas bacterias actuales existen zonas (patches) especializadas de la membrana plasmética en las que se presentan una coleccién determinada de proteinas de membrana que realizan luna serie de funciones relacionadas (Figura 12-3A). Estas porciones especializadas de membrana, tales como la “membrana purpura” en Halobacterium que contie- ne bacteriorrodopsina (se discute en el Capftulo 10) 0 los cromatéforos en las bac- terias fotosintéticas (se discute en el Capftulo 14), representan orgénulos primiti- vos. En algunas bacterias fotosintéticas, estas zonas de membrana se han transformado en zonas més elaboradas concreténdose en invaginaciones de la membrana plasmética (Figura 12-3B), mientras que en otras bacterias parece que estas invaginaciones se han separado completamente de la membrana plasmética formando vesiculas cerradas intracelulares rodeadas de membrana, especializa- das en la fotosintesis (Figura 12-30). Puede esperarse que un orgénulo eucariota que se haya originado por el procedimiento que se ilustra en la Figura 12-3 tenga un interior topolégicamen- te equivalente al exterior de la célula. Veremos que éste es el caso del ER, del complejo de Golgi, del endosoma y del lisosoma -asf como del gran niimero de intermediarios vesiculares de las vias secretora y endocttica (vesfculas de trans- porte). Podemos por tanto pensar que todos estos orgénulos son miembros de la misma familia y que, tal como veremos en detalle en el prdximo capitulo, sus in- teriores se comunican intensamente entre sf y con el exterior de la célula via ve- sfculas de transporte que emergen por gemacién de un orgénulo y se fusionan con otro (Figura 12-4). En bacterias los ribosomas se hallan unidos ala cara cito- s6lica de la membrana plasmética por lo que el origen evolutivo de la membrana del ER a partir de la membrana plasmatica puede explicar por qué en las células ceucariotas los ribosomas se encuentran unidos ala membrana del ER. Este esquema evolutivo también ofrece una explicacién razonable para la arquitectura del nticleo, con su doble membrana. En las bacterias un tinico cro- ‘mosoma esté unido a puntos especiales del interior de la membrana plasméti- a. Es por lo tanto posible que la doble envoltura nuclear se originara como una invaginaci6n profunda de la membrana plasmitica, tal como se muestra en la Figura 12-5A. Este esquema podrfa explicar por qué el compartimiento nuclear 8 topoldgicamente equivalente al citosol. De hecho, en las células eucariotas superiores la envoltura nuclear se rompe durante la mitosis, permitiendo que el contenido nuclear se disperse por el citosol, una situacién que nunca sucede con el contenido de ningtin otro orgénulo delimitado por membrana, Tal y ‘de Goigh de secreccion Lacompartimentacién de las células superiores Figura 12-4 Relaciones topolégicas entre os compartimlentos de una ‘Alulaeucariota. Los espacios topologicamente equivalentes se Presentan en rojo. Los ciclos de gemacion y fusion permiten en Principio que cualquier umen se comunique con cualquier otroy con él ‘enterior celular. La fechas azules indican la direecin de salida det traico de vestculas desde el ERhastael complejo de Golgi lamembrana plasmética (os lsosomes)ylos puntos negrosrepresentan proteinas ‘que son segregadas porla élula. Algunos organulos sin embargo ~de_ forma més notable as mitocondriasy (en plantas) los cloroplastos-no participan en esta comunicacién vesicular por lo que estén aslados del ‘wafico entre orginulos que se muestra aqut 593w riclo 80801 too endaplasmaticn nceswa ‘ membrana ’ -nvclesr Q-D B= OMA reespembranae——-mesosome halla on el ER: la cétula vive transfeccién de la célula mutante con un vector plasmidico de levadura en el \WE orausreolowe on’ "Sue ge han clonade fragmentas el sz de DNA genomico: el ragmento Re ae etry mee aurea bon yeioee] pee vane temperatura elovada serd ol que codifica la versién salvaje del gen mutante. apacato de transioacion, mutant 598 Panel 12-1 Estudio de as secuencias sefial y de la translocacin de proteinas a través de membranas.se requiere la informacién epigenética en forma de al menos una pro- teina caracterfstica en la membrana del orgénulo, y esta informacién es transmi- tida desde la célula padre a las de la progenie en forma del propio orgénulo. Pro- bablemente esta informacién es esencial para la propagacion de la organizacién celular en compartimientos, al igual que la informacién en DNA es esencial para Ja propagacién de las secuencias de nuclestidos y de aminodcidos. Resumen. Las células eucariotas contienen membranas intracelulares que encierran casi la mi- tad de su volumen total en compartimientos intracelulares individualizados lama- dos orgdnulos. En todas las células eucariotas los principales tipos de orgdnulos ro- deados de membrana son el reticulo endoplasmatico, el complejo de Golgi, el micleo, Jas mitocondrias, los lisosomas, los endosomas y los peroxisomas; las células vegeta- les contienen, ademds, plastos, como por ejemplo los cloroplastas. Cada orgénulo contiene protefnas caractertsticas que desarrollan sus funciones caracteristicas. ‘Cuando la protetna de un orgdnulo acaba de ser sintetizada, encuentra el ca- ‘ino espectfico que ha de seguir desde el ribosoma donde ha sido sintetizada hasta el orgdnulo donde actuard, guiada por una seftal espectfica que se halla presente en su secuencia de aminodcidos y que actiia como un péptido seftal o como una re- 4gi6n sefal. Los péptidos y las regiones sehal son reconocidos por protefnas recepto- ras complementarias presentes en los orgdnulos de destino. Las protefnas queactiian ‘enel citosol no presentan péptidos o regiones seftal y por lo tanto permanecen en el citosol después de ser sintetizados. El transporte de moléculas hacia dentro y hacia fuera del nticleo® La envoltura nuclear encierra el DNA y define el compartimiento nuclear. Esta formada por dos membranas concéntricas que, tal como hemos visto, son conti- nuas con el reticulo endoplasmatico. A pesar de que la membrana nuclear inter- na y la externa son continuas, las dos membranas presentan distinta composi- ci6n proteica. La membrana nuclear interna contiene protefnas especificas que acttian como lugares de unin de la idmina nuclear que la soporta. Esta mem- brana est rodeada por la membrana nuclear externa, la cual se parece enor- ‘memente a la membrana del reticulo endoplasmatico, que forma un continuo con ella (Figura 12-9). Como la membrana del ER rugoso, esta membrana exter- na estd generalmente tapizada por ribosomas que se hallan trabajando en la sin- tesis de protefnas. Las proteinas fabricadas en estos ribosomas son transporta- das al espacio entre las membranas interna y externa (el espacio perinuclear) el ‘cual a su vez es continuo con la luz del ER (véase Figura 12-9), Existe un trafico bidireccional continuo entre el citosol y el nticleo. La gran cantidad de protefnas que actian en el nticleo -incluyendo las histonas, las DNA y RNA polimerasas, las proteinas reguladoras de genes y las proteinas de procesamiento del RNA- son importadas de forma selectiva desde el citosol hacia el compartimiento nuclear, donde son fabricadas. Al mismo tiempo, los tRNA y mRNA son sintetizados en el compartimiento nuclear y luego son ex- portados al citosol. Al igual que el proceso de importacién, el proceso de ex- portacién es selectivo; por ejemplo, los mRNA s6lo son exportados si han sido modificados correctamente en el nticleo por reacciones de procesamiento de RNA. En algunos casos el proceso de transporte es complejo: por ejemplo, las proteinas ribosGmicas son fabricadas en el citosol, importadas al nticleo -don- de se ensamblan con RNA ribos6micos recién fabricados, formando particulas— y luego son exportadas de nuevo al citosol como parte de la subunidad ribos6- ‘mica, cada uno de estos pasos implica transporte selectivo a través de la envol- ‘ura nuclear. Eltransporte de moléculas hacia dentro y hacia fuera del nticleo 'SUPERFICIE CELULAR. (VESICULAS De ‘SECRECION 599