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CTO Bioquimica PDF
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1. edicin
Bioqumica
Ecuador
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BIOQUMICA
1. Conceptos fundamentales de la Bioqumica. El metabolismo .................................... 1
2. Respiracin celular .............................................................................................................................................................................. 2
3. El ciclo de Krebs ....................................................................................................................................................................................... 3
4. La cadena respiratoria ................................................................................................................................................................... 3
5. La fosforilacin .......................................................................................................................................................................................... 3
6. Ciclos anaerbicos ............................................................................................................................................................................... 3
7. Metabolismo de los carbohidratos ........................................................................................................................... 3
8. Metabolismo de los lpidos ................................................................................................................................................... 6
9. Metabolismo de las protenas ........................................................................................................................................... 7
10. Metabolismo de los nucletidos .................................................................................................................................. 9
Conceptos clave .................................................................................................................................................................................. 11
ERRNVPHGLFRVRUJ
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BIOQUMICA
Bioelementos: todos los seres vivos tienen en comn el estar formados por una serie de elementos qu-
micos. As pues, definimos los elementos biognicos o bioelementos como aqullos que forman parte
de los seres vivos. Dependiendo de la proporcin en la cual estn presentes, se les denomina:
Elementos primarios. Constituyen el 99,3% de la masa del cuerpo humano. Son imprescindi-
bles para la formacin de glcidos, lpidos, protenas y cidos nucleicos. Estos elementos son:
C, H, O y N.
Elementos secundarios. Constituyen el 0,7% de la masa del cuerpo humano. stos son: S, P, Cl, Na,
K, Ca, Fe y Mg.
Elementos microconstituyentes u oligoelementos. Se encuentran en proporciones nfimas. Pre-
sentan variaciones entre los distintos seres vivos, pero cuando estn, su presencia es imprescindible.
Son, entre otros: I, Mn, Cu, Co, Zn, F, Se. Los elementos secundarios y los microconstituyentes son
considerados OLIGOELEMENTOS o TRAZAS, que son elementos imprescindibles, aunque en peque-
as cantidades.
Biomolculas: los elementos biognicos se combinan entre s mediante enlaces, formando las biomol-
culas o principios inmediatos. Los principios inmediatos se clasifican en:
Orgnicos: protenas, glcidos, lpidos, cidos nucleicos y metabolitos.
Inorgnicos: agua (la ms abundante), sales minerales inorgnicas y gases (NO, CO2, O2).
Las macromolculas que forman los alimentos (glcidos, lpidos, protenas, etc.) se transforman en otras
ms sencillas (monosacridos, cidos grasos, aminocidos, etc.) debido al efecto hidroltico de las enzimas
digestivas. Este proceso es la DIGESTIN. La digestin tiene el objetivo de permitir la absorcin intestinal
de los nutrientes. Una vez absorbidos los nutrientes, pasan al torrente sanguneo o linftico (es el caso de
las grasas) y son distribuidos por el organismo. A partir de este momento, ya se puede hablar de META-
BOLISMO.
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Manual CTO 1. Edicin
catabolismo es esencial para el mantenimiento de las funciones vita- convierte en ADP), la fosfocreatina cede su fosfato al ADP, y de esta
les (bombeo cardaco, termorregulacin, sntesis de hormonas, etc.). forma se regenera el ATP. La creatina es un producto de la fosfocrea-
Las vas anablicas y catablicas son independientes. Se producen tina muscular, por lo que es un marcador del metabolismo endgeno
en distintos compartimentos celulares y son reguladas por enzimas del msculo (Figura 1).
diferentes.
Metabolismo de la biosfera
Los seres vivos requieren un continuo aporte de energa e intercambio de
materia con el medio. A nivel macroscpico (biosfera) hay tres grandes ci-
clos metablicos que definen la relacin entre los seres vivos y el entorno:
Ciclo del carbono. En funcin del modo en que los organismos con-
siguen el carbono, se dividen en:
- Auttrofos. A partir del CO2 atmosfrico y gracias a la energa
luminosa, son capaces de sintetizar molculas orgnicas carbo-
nadas. Por ejemplo, las bacterias fotosintticas, vegetales. Figura 1. Ciclo de la fosfocreatina
- Hetertrofos. Su fuente de carbono son las molculas carbona-
das que los auttrofos han sintetizado. No son capaces de utilizar
el CO2 atmosfrico, ni la energa luminosa con este propsito. La 1.3. El ATP y su importancia
energa la obtienen hidrolizando los enlaces de las macromol-
en los procesos metablicos
culas que ingieren. Por ejemplo, el hombre.
Ciclo del oxgeno. En funcin de los requerimientos de oxgeno, los El ATP (trifosfato de adenosina o adenosn trifosfato) es la molcula fun-
organismos se dividen en: damental para la obtencin de energa para la clula. La capacidad de
- Aerobios. Utilizan el O2 atmosfrico para realizar las reacciones almacenamiento energtico de esta molcula radica en su naturaleza qu-
oxidativas (exergnicas) de las macromolculas. Se subdividen mica. Estructuralmente es un nucletido formado por adenina unida a un
en: azcar de cinco carbonos (la ribosa). De esta forma, en el metabolismo, los
Estrictos. En ausencia de O2 no sobreviven. balances energticos se realizan teniendo en cuenta las molculas de ATP
Facultativos. Pueden vivir en presencia o ausencia de O2. generadas o gastadas. Los procesos de sntesis o anabolismo consumen
ATP, mientras que los procesos de degradacin de molculas o catabolis-
- Anaerobios. No utilizan el O2 en sus reacciones de oxidacin. mo producen ATP. Se dice que el ATP es un intermediario energtico, ya
que sus enlaces retienen la energa necesaria para la mayor parte de los
Ciclo del nitrgeno. El N2 atmosfrico es captado y fijado por bac- procesos celulares.
terias fijadoras y convertido en amonaco (NH3). Sobre el amonaco
actan las bacterias nitrificantes de la tierra y lo convierten en ni-
tratos. Los nitratos son absorbidos por las plantas y convertidos en 2. Respiracin celular
aminocidos.
Concepto de oxidacin-reduccin El concepto de respiracin, hace referencia a la fase aerbica del cata-
Oxidacin. Es la prdida de electrones (hidrgeno) por parte de una bolismo celular. La respiracin celular puede dividirse en tres fases prin-
molcula. Se da en reacciones exergnicas, en que una molcula rica cipales:
en energa pierde hidrgenos (electrones), oxidndose y liberando Produccin del acetil-CoA mediante la oxidacin del combustible or-
energa. gnico (glucosa, cidos grasos y aminocidos).
Reduccin. Es la ganancia de electrones que experimenta una mo- Los grupos acetilo del acetil-CoA pasan por el ciclo del cido ctrico o
lcula. Una molcula aceptora se hace ms energtica porque capta ciclo de Krebs, donde son oxidados hasta la produccin de CO2, libe-
electrones (cedidos por otra) y se reduce. Se da en reacciones ender- rando energa que se conserva en los transportadores NADH y FADH2.
gnicas. Transferencia electrnica, donde los electrones transportados por
NADH y FADH2 llegan a la cadena respiratoria (cadena de transpor-
Ciclos energticos tadores electrnicos mitocondriales). Durante este proceso, se libera
Ciclo del ATP-ADP. La energa que se libera en las reacciones exer- gran cantidad de energa en forma de ATP, mediante un proceso co-
gnicas es captada por el ADP, que se convierte en ATP. El ATP es la nocido como fosforilacin oxidativa.
moneda energtica de la economa humana. Se forma en las vas ca-
tablicas y es consumido en las anablicas. En los siguientes temas, se desarrollarn cada una de las tres etapas.
Ciclo del NADPH-NADP+. En ciertas situaciones, como el ciclo de
Krebs, la energa es captada por el NADP+. En estas ocasiones, el
NADP+, al captar el hidrgeno, se reduce a NADPH (que es ms ener- 2.1. Las mitocondrias,
gtico). El NADPH entrar en la fosforilacin oxidativa para rendir
estructura general y funcin
energa o actuar como coenzima en alguna reaccin metablica.
Ciclo de la fosfocreatina. Es un fosfato de energa elevada, al igual
que el ATP. Su funcin es el almacenamiento temporal de grupos fos- Las mitocondrias son orgnulos rodeados de membrana, variables en for-
fato de alta energa en el msculo. Cuando el ATP se consume (se ma y nmero en funcin del tipo celular.
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Estructura: estn constituidas por dos membranas: una externa lisa que
rodea el orgnulo y una interna con invaginaciones llamadas crestas, 6. Ciclos anaerbicos
que incrementan considerablemente su superficie total.
En el interior de la membrana interna se localiza la matriz, forma- Los ciclos anaerbicos son dos: Ciclo de Embder-Meyerhoff y el Ciclo de
da por una concentracin de enzimas implicadas en el metabolismo Cori o del cido lctico que estn desarrollados en el Tema 7.
energtico.
5. La fosforilacin
7.1.1. Clasicacin
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7.2. Disacridos
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Gluclisis (ciclo de Embder-Meyerhoff): proceso de conversin de
una molcula de glucosa en dos molculas de cido pirvico.
1 glucosa 2 c. pirvico
Esta reaccin tiene lugar en el citoplasma celular y no requiere la pre-
sencia de O2. El cido pirvico obtenido puede seguir dos vas:
- Va aerobia: la ms habitual. Consiste en la transformacin del
cido pirvico en acetil-CoA.
2 c. pirvico 2 acetil-CoA
El acetil-CoA es un metabolito muy importante, se genera en el
metabolismo de los glcidos y tambin de los aminocidos, ci-
dos grasos y glicerina, incorporndose al ciclo de Krebs.
- Va anaerobia:
Fermentacin lctica: paso de cido pirvico a cido
lctico. Ocurre en ciertas clulas del organismo (fibras
musculares, principalmente) en situaciones de hipoxia o
anoxia.
Figura 4. Resumen del metabolismo glucdico
Fermentacin alcohlica: paso de cido pirvico a etanol.
No se da en el organismo humano, sino que es un proceso
industrial, aplicado en la elaboracin del vino y de la cer-
veza. 7.8. Neoglucognesis (ciclo de Cori)
Ciclo de Krebs o ciclo del cido ctrico o ciclo de los cidos tricar-
boxlicos: va final comn para la oxidacin de las molculas com- Consiste en la sntesis de glucosa a partir de precursores no glucdicos.
bustibles: glcidos, aminocidos y cidos grasos. Estos precursores son:
El acetil-CoA obtenido en la gluclisis se incorpora a una cadena cido lctico.
circular de reacciones, de la que se obtienen algunas molculas Aminocidos.
de ATP y muchas molculas de nucletidos reducidos. Este ciclo Glicerol
tiene lugar en la matriz mitocondrial y es la va comn del meta-
bolismo. Ocurre sobre todo en el hgado y tambin en el rin. Un ejemplo de
Fosforilacin oxidativa (respiracin celular): los tomos de hi- neoglucognesis est en el denominado ciclo de Cori. ste es un ciclo en
drgeno (liberados en la gluclisis y el ciclo de Krebs y captados el que participan los msculos y el hgado (Figura 5).
por los nucletidos) entran en la cadena de transporte electrnico
y son transferidos de unas molculas a las otras. El resultado de El msculo degrada la glucosa hasta lactato para obtener energa. A con-
este proceso es la obtencin de un gran nmero de molculas de tinuacin el lactato es vertido al plasma y captado por el hgado. El hga-
ATP, CO2 y H2O (a expensas del O2). Este proceso ocurre en las cres- do convierte el lactato de nuevo en glucosa.
tas mitocondriales.
Una molcula de glucosa genera 38 molculas de ATP.
7.6. Glucogenognesis
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8.1. Introduccin
8.2. Funciones
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- DENSIDAD +
9. Metabolismo de las protenas
QM VLDL LDL HDL
+ % LPIDOS -
9.1. Introduccin
Tabla 1. Lipoprotenas
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Las protenas pueden adoptar varios niveles de estructura: Entre las caractersticas de las enzimas pueden citarse las siguientes:
Primaria: secuencia (orden y tipos) de aminocidos que constituye Catalizadores de reacciones biolgicas: es decir, aumentan su ve-
el esqueleto covalente. locidad.
Viene determinada por la informacin gentica del ADN. Elevada especificidad: se unen de forma especfica a un sustrato o
Secundaria: ordenamiento espacial de los aminocidos prximos ligando.
entre s. Los puentes de hidrgeno son los enlaces que estabilizan Unin del ligando: se une al centro activo de la enzima.
mayormente esta estructura, que puede ser de dos tipos: Existencia de cofactores: algunas enzimas requieren un cofac-
- Lmina plegada : dos o ms dominios de la protena se sitan tor para ser funcionales. Es posible diferenciar dos tipos de co-
formando un zigzag en sentido paralelo o antiparalelo (p. ej.: la factores:
fibrina). - Inorgnicos: Fe2+, Mn2+, Zn2+.
- Hlice : la cadena se enrolla alrededor de un cilindro imagina- - Orgnicos: proceden de vitaminas. Por ejemplo, NAD+, FAD+,
rio. (p. ej.: la queratina). tambin denominados coenzimas.
Terciaria: hace referencia al ordenamiento espacial de aminocidos Termolabilidad: factores como el pH y la temperatura afectan a la
alejados entre s. Estos plegamientos requieren diferentes tipos de velocidad de la reaccin.
enlaces (mencionados ms abajo). Existen dos tipos de estructura
terciaria:
- Estructura fibrosa: las protenas que adoptan esta estructura se 9.6. Introduccin
denominan fibrosas.
Suelen tener las siguientes caractersticas:
Son muy resistentes. Una dieta deficiente en protenas puede tener repercusiones importan-
Son insolubles en agua. tes para el organismo, ya que los aminocidos obtenidos de la hidr-
Tienen funcin estructural. lisis de las protenas son imprescindibles para la sntesis de protenas
endgenas y tambin actan como precursores de ciertas molculas
El colgeno es una protena fibrosa. Es la base del tejido conjuntivo. nitrogenadas, como por ejemplo, cidos nucleicos, aminas (neurotrans-
- Estructura globulosa: las protenas que adoptan esta estructura misores), etc.
se denominan globulosas.
Se caracterizan por: Las protenas son molculas de las que se obtiene energa en situacio-
Ser solubles en agua. nes de inanicin muy prolongadas. Aun as, su funcin no es la de ser
Tener funciones dinmicas: enzimtica, de transporte, hormonal. tiles como fuente de energa.
Son protenas globulosas la mayora de enzimas, los anticuerpos, Por accin de las enzimas proteolticas digestivas, las protenas ali-
la albmina, la hemoglobina, etc. mentarias se hidrolizan y se transforman en los correspondientes ami-
nocidos. Estos aminocidos son absorbidos por transporte activo y
Cuaternaria: define la relacin entre las diferentes cadenas de una pueden tener diferentes destinos metablicos:
protena polimrica (formada por ms de una subunidad). Sntesis de protenas endgenas.
Las estructuras terciaria y cuaternaria son posibles gracias al estable- Gluconeognesis.
cimiento de diferentes tipos de enlaces: puente de azufre (enlace co- Sntesis de compuestos nitrogenados no proteicos (neurotransmi-
valente), uniones electrostticas, puentes de hidrgeno, etc. sores).
La desnaturalizacin consiste en la rotura de los enlaces intermole- Oxidacin.
culares de las protenas que configuran la estructura secundaria y ter-
ciaria. Como consecuencia stas pierden su funcin. Hay diferentes
causas de desnaturalizacin: aumento de la temperatura, variacio- 9.7. Anabolismo proteico
nes de pH.
Algunos pptidos de importancia para el organismo son la vasopresina, La sntesis de los aminocidos no esenciales es un proceso complejo y
la oxitocina, la MSH, la ACTH, las encefalinas y el glutatin. cada uno de ellos tiene su propia va de sntesis.
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9.8. Catabolismo proteico Actan como seales qumicas en los sistemas celulares, en respues-
ta a hormonas y otros estmulos extracelulares.
Son componentes estructurales de algunos cofactores enzimticos e
La degradacin de las protenas empieza con la hidrlisis, que conduce intermediarios metablicos.
a la obtencin de los aminocidos correspondientes. La posterior degra- Son los constituyentes de los cidos nucleicos: cido desoxirribo-
dacin de stos sucede de forma diferente segn cada una de sus partes nucleico (ADN) y cido ribonucleico (ARN), que son los deposita-
constituyentes: rios moleculares de la informacin gentica. La estructura de cada
Grupo amino: altamente txico y, por tanto, debe ser eliminado del una de las protenas y, en ltimo trmino, de todas las biomolcu-
organismo. Se realiza mediante un proceso denominado ciclo de la las y de cada uno de los componentes celulares, producto de la in-
urea, que ocurre en el hgado y consiste en la sntesis de urea a partir formacin programada en la secuencia de nucletidos de la clula.
de amonaco y CO2. NH4+ + CO2 + ATPUrea La capacidad de almacenar y de transmitir informacin gentica
La urea se elimina por la orina y es un marcador del catabolismo pro- de una generacin a la siguiente es un requisito bsico de la vida.
teico. Este proceso consume ATP. Cualquier alteracin de este ciclo Los cidos nucleicos son polmeros de unas unidades bsicas denomina-
puede provocar un aumento en los niveles sanguneos de amonaco, das nucletidos, los cuales estn formados por tres molculas diferentes:
hecho que recibe el nombre de hiperamoniemia. Pentosa: cada cido nucleico contiene una pentosa caracterstica.
Oxidacin del esqueleto carbonado: todos los aminocidos (aun- - Ribosa (ARN).
que por distintas vas) finalmente producen metabolitos que se in- - Desoxirribosa (ADN).
corporan al ciclo de Krebs y se oxidan completamente.
Base nitrogenada: las derivadas de la purina son adenina y guanina;
las que derivan de la pirimidina son timina, uracilo y citosina.
9.9. Catabolismo de las nucleoprotenas cido fosfrico.
El ADN contiene la informacin gentica, que tiene que pasar de una ge-
10. Metabolismo de los nucletidos neracin a otra. Por ello tiene que duplicarse. Este proceso es denomina-
do replicacin (Figura 8).
Los nucletidos desempean una amplia variedad de funciones en el La replicacin semiconservativa, segn el modelo de Watson y Crick,
metabolismo celular: es el proceso de duplicacin del material gentico que tiene lugar durante
Garantizan los intercambios. la divisin celular. Este modelo postula que el ADN se separa en sus dos
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cadenas constituyentes y cada una de stas sirve como molde para la sn-
tesis de una cadena complementaria. El resultado es la obtencin de dos
molculas de ADN bicatenarias (formada cada una de dos cadenas).
Figura 7. Transcripcin
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Conceptos clave
Los seres vivos estn formados por un conjunto de elementos qumicos o bioelementos en distintas propor-
ciones. Estos forman en un nivel mayor de organizacin las biomolculas.
Las protenas son macromolculas cuyos elementos estructurales o monmeros son los aminocidos. Entre
sus funciones ms importantes estn la estructural y la cataltica.
Las enzimas son protenas capaces de acelerar determinadas reacciones del organismo. Se unen de forma
especca a un sustrato a travs del centro activo para llevar a cabo su actividad.
Los glcidos desempean distintas funciones en el organismo. Los mas sencillos son los monosacridos,
que pueden unirse para formar disacridos o glcidos ms complejos. Su funcin principal es la de ser la
principal fuente de energa para la clula.
Los lpidos constituyen un grupo de macromolculas que pueden desempear funciones diversas: estruc-
tural , energtica, etc.
Los cidos nucleicos son polmeros de nucletidos, que son los monmeros o unidades bsicas. Cada nu-
cletido est formado por una pentosa, una base nitrogenada y el acido fosfrico. Existen dos tipos princi-
palmente que son el ADN y el ARN.
El metabolismo es el conjunto de reacciones qumicas encadenadas.
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