Proyecto del Genoma Humano

El Proyecto del Genoma Humano (PGH) ha constituido ser uno de

los retos cientfico-tecnolgicos ms grandes que ha enfrentado la
humanidad. Si bien este proyecto inici oficialmente en 1990,
resulta fundamental reconocerlo en el contexto de la evolucin del
conocimiento en torno a la herencia humana.
Antecedentes y desarrollo
El estudio de la gentica humana se reconoce desde los trabajos
pioneros de Gregor Mendel, quien en 1866 describi las bases de
la herencia monognica que hoy continan vigentes, ahora con
pleno conocimiento de sus bases moleculares. Fue hasta casi 80
aos despus que se reconoci al cido desoxirribonucleico
(ADN) como el material de la herencia. Unos aos mas tarde, en
1953, Francis Crick y James Watson, apoyados en trabajos
previos desarrollados por Rosalind Franklin y Maurice Wilkins,
describieron la estructura de doble hlice del ADN. El ADN est
formado de 3,200 millones de ncleotidos, de los que existan
cuatro tipos: Adenina (A), Timina (T), Citocina (C) y Guanina (G).
En 1963 se esclareci el cdigo gentico, base de la traduccin
gentica para la sntesis de protenas.
Mas adelante, en los aos 70 comenz el auge de la
manipulacin del ADN dando lugar a las tecnologas
recombinantes y, posteriormente, a las tecnologas para la
secuenciacin del ADN.
Mas adelante, en 1985 se hizo la primera propuesta formal de
una iniciativa para secuenciar los 3,200 millones de nucletidos
del genoma humano. En 1990, esta iniciativa se consolid, dando
inicio as, al proyecto cientfico tecnolgico mas importante de
finales del siglo XX: el Proyecto del Genoma Humano. El PGH,
patrocinado en su mayora por el gobierno de los Estados Unidos,
a travs de su Departamento de Energa y de los Institutos
Nacionales de Salud, estuvo inicialmente bajo la direccin de
James
Watson,
transfirindose
esta
responsabilidad
posteriormente a Francis S. Collins, Director del Instituto de

Investigaciones sobre el Genoma Humano de los Institutos

Nacionales de Salud de los Estados Unidos. As, el producto del
PGH consisti fundamentalmente en la secuencia completa del
genoma humano y en la elaboracin de un mapa que ubica cada
gen dentro de los 23 pares de cromosomas en que se organiza el
genoma humano. Este Proyecto cont adems con la
participacin del Reino Unido, Francia, Alemania, China y Japn.
El Proyecto lleg a trmino dos aos antes de lo previsto y a un
menor costo del originalmente presupuestado, en gran medida
debido al desarrollo de nuevas tecnologas para la secuenciacin
de ADN, que diera como resultado la capacidad de secuenciacin
a gran escala y a un menor costo. Al inicio del Proyecto el costo
por letra secuenciada era superior a $10 USD, el da de hoy el
costo es de $0.09 USD. De ah que el costo total del Proyecto
fuera de $2,700 millones de dlares, de los cuales entre 3 y 5%
fue dedicado al estudio de las implicaciones ticas, legales y
sociales que esta informacin tendr. Al da de hoy todas las
metas del Proyecto fueron cumplidas con creces.
En 1995, la compaa Celera Genomics, bajo la direccin de J.
Craig Venter, anunci que llevara a cabo la secuenciacin del
genoma humano en forma paralela al Proyecto del gobierno de
los Estados Unidos, empleando una tecnologa novedosa
conocida como shot gun. Este proyecto culmin al mismo tiempo
que el PGH financiado por el gobierno de los Estados Unidos, y
fueron anunciados en forma conjunta mediante sendas
publicaciones. en las revistas Nature y Science.
La culminacin del Proyecto en trminos tcnicos significa que se
obtuvo la totalidad de la secuencia de la molcula del ADN con
una gran exactitud, es decir, con menos de un error por cada
10,000 letras. nicamente 0.01% de la cadena no pudo
secuenciarse con la tecnologa disponible, lo que dar lugar a
proyectos especficos para secuenciar estas regiones del genoma
humano. Al da de hoy contamos con ms del 99% de la
secuencia en su formato final, reduciendo el nmero de espacios
sin secuenciar solo 250.

Alcances y estado actual

Como resultado del PGH se obtuvo la secuencia completa de los
3,200 millones de nucletidos o letras (A, G, T, C) que lo
componen, el mapa que ubica a los cerca de 30,000 genes que
ah se albergan y el anlisis de cerca de 1,400 genes causantes
de enfermedades monognicas. Adems, se demostr que los
seres humanos compartimos 99.9% de esta secuencia. El 0.1%
restante vara entre cada individuo, siendo las variaciones mas
comunes aquellas en que cambia una sola letra, es decir, los
polimorfismos de un solo nucletido, conocidos como SNPs
(pronunciados snips) por sus siglas en ingls. Estas variaciones
se encuentran a lo largo de toda la cadena, en promedio una
cada 600 a 800 nucletidos y hasta el momento se han
identificado mas de 3.2 millones de estas variaciones. Esto
significa, por ejemplo, que algunos individuos podemos tener una
"T" en determinada posicin del genoma, en donde otros pueden
tener una "G". El nmero de posibles combinaciones que resultan
de la variacin genmica, da como resultado que cada miembro
de nuestra especie tenga caractersticas genmicas nicas. As,
la individualidad genmica da lugar a la individualidad bioqumica,
responsable de la predisposicin a padecer enfermedades
comunes. La siguiente fase de este proyecto consistir en la
identificacin de las variaciones genmicas entre las distintas
poblaciones, as como la produccin de aplicaciones prcticas
derivadas de este conocimiento.
El PGH ha estimulado el desarrollo de la genmica comparativa,
cuyo propsito es entender cmo las especies han evolucionado
y cul es la funcin de los genes y las regiones no codificantes
del genoma, mediante el anlisis y la comparacin de genomas
de diferentes especies. El definir la estructura y funcin de los
genes humanos favorecer el desarrollo de estrategias para
predecir, prevenir y combatir enfermedades humanas. Hasta el
momento se ha completado la secuencia de los genomas de
varios organismos, entre los que destacan dos especies de
mosca de la fruta, dos gusanos, el ratn, la rata, el perro, un gran
nmero de hongos, el mosquito transmisor del paludismo, as

como del parsito que lo causa, el arroz, la semilla de la mostaza

y una larga lista de bacterias y virus. Actualmente existen
proyectos para la secuenciacin de los genomas de ms de 50
organismos, entre los que figuran de chimpanc, el pollo, la vaca,
el gato, el cerdo, la rana, el pez cebra, la abeja de la miel, la
amiba,
el
maz
y
el
trigo,
entre
otros
(www.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/static/EG_T.html).
Nuevos horizontes de la investigacin genmica
La culminacin de los trabajos de secuenciacin del genoma
humano ha dado lugar a una nueva era en la investigacin
genmica, al ofrecer una gran cantidad de informacin tendr
gran impacto en diferentes reas de la investigacin cientfica. Al
culminar el Proyecto del Genoma Humano se hizo pblica la
metfora desarrollada por el Instituto de Investigaciones sobre el
Genoma Humano de los Institutos Nacionales de Salud de los
Estados Unidos.
Se trata de un gran edificio que simboliza el desarrollo de la
investigacin genmica cuya base descansa en el conocimiento
del genoma humano. Los tres pisos de la estructura representan
a la genmica para la biologa, la genmica para la salud y la
genmica para la sociedad respectivamente. Si bien los tres pisos
resultan importantes para el futuro de la investigacin genmica,
el desarrollo pleno de estas reas solo se podr dar si existen
seis elementos fundamentales para mantener la cohesin de las
tres reas de investigacin.
Estos elementos estn simbolizados por las columnas del edificio
y son: los recursos financieros para llevar a cabo la investigacin
responde; la tecnologa que permita el anlisis de reas
especficas del genoma y su expresin; la bioinformtica o
biologa computacional que permitir el manejo de esta gran
cantidad de informacin, la comparacin de secuencias en forma
masiva, el anlisis de bases de datos, as como el estudio de la
expresin de los genomas; la formacin de recursos humanos
que

tengan la capacidad de uso y anlisis de la informacin genmica

para la creacin de nuevos desarrollos derivados de este
conocimiento; el desarrollo paralelo de la investigacin sobre los
aspectos ticos, legales y sociales de la medicina genmica, a fin
de asegurar que se lleve a cabo con apego estricto a los
principios ticos universales, dentro de los marcos jurdicos
vigentes; finalmente, la educacin a la sociedad resulta
fundamental con el fin de asegurar que la investigacin genmica
se incorpore al conocimiento comun, a fin de que los beneficios
que de ella emanen puedan ser aprovechados por las sociedades
y los retos sociales puedan ser enfrentados exitosamente.
Se prev que el desarrollo integral de los tres pisos de este gran
edificio firmemente mantenidos en su estructura por sus seis
columnas indispensables, generar una nueva revolucin
cientfica, tecnolgica, social y financiera basada en la
investigacin genmica.
Al trmino del Proyecto del Genoma Humano se identificaron los
retos ms importantes una vez completada la secuenciacin del
genoma humano y se definieron cinco reas principales en las
que se invetirn esfuerzos y recursos durante los prximos aos.
Estas reas estarn dedicadas a convertir la informacin
genmica en realidades tangibles para la poblacin general,
mediante el estudio de la estructura y funcin de los genes y las
protenas.
1. El proyecto internacional del HapMap. Este proyecto tiene
corno meta principal la produccin de la "nueva generacin" del
mapa del genoma humano, que ser de gran utilidad para
acelerar el descubrimiento de los genes relacionados con
enfermedades comunes como asma, cncer, diabetes y
enfermedades cardiovasculares, entre otras. Este mapa
identificar las posiciones en las que existen variaciones dentro
del genoma humano, es decir, las variaciones que confieren
individualidad a cada miembro de nuestra especie. Especial
inters tendrn aquellas variaciones relacionadas con la
susceptibilidad a enfermedades comunes. El proyecto se llevar a

cabo en diferentes poblaciones del mundo, inicialmente la

europea, la africana y la asitica. Mxico es el nico pas de
Amrica Latina que ha sido invitado a participar en esta segunda
fase del Proyecto del Genoma Humano, a travs del Consorcio
Promotor del INMEGEN. La participacin de Mxico en el
HapMap representa una gran oportunidad para conocer, en forma
sistemtica, la informacin genmica de la poblacin mexicana.
Se espera que este proyecto concluya hacia el final del ao 2005.
2. Desarrollo de la Enciclopedia de los Elementos del ADN
(ENCODE). Este proyecto estar bajo el liderazgo del Instituto de
Investigaciones sobre el Genoma Humano de los Institutos
Nacionales de Salud de los Estados Unidos. El objetivo principal
de ENCODE es el desarrollo de estrategias eficientes y de gran
precisin para la identificacin y localizacin de todos los genes
que codifican para protenas, de aquellos que no codifican para
protenas y de otros elementos funcionales basados en
secuencias genmicas. La creacin de este monumental trabajo
de referencia contribuir a que los cientficos podamos utilizar e
interpretar de la secuencia del genoma humano, a la comprensin
mas profunda de la biologa humana, a predecir riesgo potencial
para enfermedades y a desarrollar nuevas estrategias para la
revencin y el tratamiento de stas.
3. Genmica qumica. El desarrollo de esta rea resulta de gran
importancia para comprender mejor la funcin de los genes. Se
trata de integrar una coleccin pblica de entre 500,000 y
1000,000 de compuestos qumicos orgnicos, a fin de ser
empleados en el esfuerzo de caracterizar las vas del metablicas
a mayor resolucin. Las ventajas de esta estrategia, complemento
de las estrategias genmicas convencionales, se basan en las
caractersticas qumicas particulares de cada molcula, en su
capacidad de interactuar con determinados genes, su habilidad
en muchos casos, para penetrar fcilmente a las clulas y desde
luego, el hecho de que frecuentemente sirven como puntos de
inicio para el desarrollo de nuevos frmacos.
4. Genomas para la vida. Este programa del Departamento de

Energa de los Estados Unidos est enfocado a microorganismos.

Su meta principal es el entendimiento de los intrincados detalles
sobre
los procesos de la vida microbiana a un nivel tal que puedan
desarrollarse modelos computacionales capaces de describir y
predecir sus respuestas a cambios en el ambiente. Esta
informacin permitir utilizar las capacidades de los microbios
para resolver muchos de los retos actuales en las reas de
energa y medio ambiente.
5. Establecimiento del Consorcio para la Genmica Estructural. La
genmica estructural consiste en la identificacin sistemtica y a
gran escala de la estructura tridimensional de las protenas.
Cuando se estudia la genmica estructural de cualquier
organismo, la meta final es la descripcin completa de todas las
protenas codificadas en el genoma de ese organismo. Esas
estructuras tridimensionales sern cruciales para el diseo
racional de nuevos medicamentos, para el diagnstico y
tratamiento de enfermedades, y para el avance en el
entendimiento de la biologa.En abril de 2003, se anunci la
creacin del Consorcio para la genmica estructural que se
establece con el fin de impulsar los esfuerzos internacionales en
esta rea. Esta organizacin estar formada por la Wellcome
Trust del Reino Unido con un grupo de compaas farmacuticas
y otras empresas, se comprometern ha hacer pblicas las
estructuras proteicas que identifiquen.
Sin duda, la evolucin de la investigacin genmica continuar su
marcha superando estos nuevos desafos y enfrentando retos tan
complejos como la identificacin de los genes causantes de
enfermedades humanas y la regulacin de la expresin de los
genes, lo que tendr que ir en conjunto con el desarrollo de
nuevas y mas poderosas tecnologas que permitan el anlisis
masivo de los genomas, logrando al mismo tiempo el abatimiento
de sus costos. Esto con estricto apego a los principios ticos
universales.