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Guia - Practico Enzimas 1
Guia - Practico Enzimas 1
El informe de este laboratorio debe ser entregado al finalizar el prctico. Por tal
motivo, se exigir que los grupos de trabajo ingresen con un informe parcial.
Debe estar escrito a mano, en cuadernillo cuadriculado, tamao oficio, siguiendo
el formato de identificacin y contenidos acostumbrado.
Debe contener portada (1 hoja), Introduccin y objetivos (1 hoja), Aspectos
tericos (1 hoja mx.), Materiales y Mtodos (2 hojas mx.). Objetivos claros,
que no se confundan con actividades;
Tablas de datos, clculos y grficos correspondientes a los ensayos 1 y 2 de la
gua.
Las tablas de datos, clculos y grficos correspondientes a los ensayos 3 y 4,
deben ser agregados durante el prctico. Las tablas preliminares pueden estar
incorporadas, listas para agregar los datos donde corresponda, a medida que los
obtenga. Tablas y grficos deben ser claros. Los grficos en papel milimetrado,
indicando ttulo y rtulos de los ejes, con las respectivas unidades de medida.
La discusin y conclusiones finales no deben exceder de media pgina cada una
y limitarse a demostrar una evaluacin de los datos obtenidos y su nexo con la
teora.
Contener un desarrollo de ideas lgico y coherente con la secuencia de
actividades propuestas. Ser relevante la ortografa y redaccin.
PRCTICO
DETERMINACIN DE ACTIVIDAD ENZIMTICA
INTRODUCCIN
Espectrofotometra
La Enzimologa que se ocupa del estudio de la velocidad de las reacciones
catalizadas por enzimas y las causas de su variacin. Los ensayos enzimticos se
emplean rutinariamente en muchos laboratorios clnicos para el diagnstico de
numerosas enfermedades, ya sea observando velocidades de reaccin anormales o bien
niveles enzimticos inadecuados en el plasma u otros tejidos.
Un ensayo enzimtico se basa en la capacidad de una enzima de transformar un
sustrato en un producto especfico. Normalmente ya sea sustratos o productos son
coloreados, es decir absorben fotones a una longitud de onda determinada. Ello permite
seguir el avance de la reaccin mediante Espectrofotometra. Por otro lado, el empleo
de reactivos especficos que reaccionan con sustratos o productos generando
compuestos coloreados facilita el seguimiento de un ensayo enzimtico.
La espectrofotometra es el mtodo de anlisis ptico ms usado en las
investigaciones qumicas y biolgicas. Se aprovecha la propiedad de ciertos compuestos
o molculas de absorber radiacin electromagntica. Todas las sustancias pueden
absorber radiaciones dentro del espectro UV- Visible. Por ejemplo, el vidrio
transparente absorbe radiacin de longitudes de ondas que no pertenecen al espectro
visible, en tanto que el agua absorbe fuertemente en la regin del infrarrojo. Las
longitudes de onda de las radiaciones que una molcula puede absorber y la eficiencia
con la que se absorben dependen de la estructura atmica y de las condiciones del
medio (pH, temperatura, fuerza inica, constante dielctrica), por lo que dicha tcnica
constituye un valioso instrumento para la determinacin y caracterizacin de
biomolculas.
Los diferentes tipos de radiacin electromagntica: rayos X, luz ultravioleta
(UV), luz visible, luz infrarroja (IR), ondas de radio, etc., se propagan a la misma
velocidad, pero difieren en longitud de onda y frecuencia. El ojo humano detecta la
radiacin en un rango de longitudes de onda de 400 a 780 nm, llamada luz visible (1
nm=10-9m). La luz del espectro visible y del UV cercano (200 a 400 nm) posee la
energa necesaria para producir sobre ciertos compuestos, llamados cromforos,
transiciones de electrones desde un orbital de menor energa a otro de mayor energa.
Las sustancias coloreadas absorben luz visible y su color corresponde a la radiacin no
absorbida. La absorcin de las radiaciones ultravioletas, visibles e infrarrojas, depende
de la estructura de las molculas, y es caracterstica para cada sustancia qumica.
Adems, la absorcin y transmitancia de luz depende de la concentracin del
cromforo.
Ley de Lambert-Beer
La relacin entre la absorcin de la luz y la concentracin de una solucin se
representa por la Ley de Lambert-Beer. La Ley de Lambert-Beer seala que la cantidad
% T = It/Io x 100
La transmitancia nos da una medida fsica de la relacin de intensidad incidente
y transmitida al pasar por la muestra. La relacin entre %T y la concentracin no es
lineal, pero asume una relacin logartmica inversa.
Absorbancia
La absorbancia (A) es un concepto ms relacionado con la muestra, puesto que
nos indica la cantidad de luz absorbida por la misma, y se define como el logaritmo de
1/T, en consecuencia:
A = log 1/T = -log T = -log It/ Io
Cuando la intensidad incidente y transmitida son iguales (Io = It), la
transmitancia es del 100% e indica que la muestra no absorbe a una determinada
longitud de onda, y entonces A vale log 1 = 0.
Esta relacin indica que la absorbancia aumenta en forma lineal con la
concentracin (con un paso ptico constante), mientras que la transmitancia disminuye
en forma exponencial. Estas ecuaciones slo son vlidas si la radiacin incidente es
monocromtica y la absorcin ocurre en un volumen de seccin transversal uniforme.
Espectrofotmetro
El espectrofotmetro es un instrumento que permite comparar la radiacin
absorbida, o transmitida, por una solucin que contiene una cantidad desconocida de
soluto, y una que contiene una cantidad conocida de la misma sustancia.
Cuando se desea estimar la longitud de onda absorbida por un compuesto puro,
el aparato permite variar la longitud de onda (espectro visible y UV cercano) del rayo de
luz que incidir sobre una solucin de este, y medir en una fotocelda la intensidad de la
luz que logra traspasarla. Con los datos obtenidos se construye un espectro de
absorcin. Esto es, una representacin grfica que indica la cantidad de luz absorbida a
diferentes valores de , manteniendo constantes el camino ptico recorrido (b) y la
concentracin (c).
A partir de una solucin diluida de un compuesto, cuya absorbancia mxima
entra dentro del rango de medida del espectrofotmetro, se ver el valor de absorbancia
a diferentes longitudes de onda frente a un blanco que contenga el disolvente de la
solucin de la muestra a caracterizar. A partir del espectro de absorcin se obtendr el
valor de al que el compuesto presenta la mayor absorbancia (max). Dicho se
utilizar a la hora de hacer determinaciones cualitativas y cuantitativas del compuesto.
Fig. 3. Curva de calibracin para una solucin de albmina srica bobina en = 700 nm y un paso
ptico de 1 cm.
Cintica enzimtica
Las enzimas son catalizadores biolgicos de naturaleza proteica. Una
determinada enzima (E) se combina con un determinado sustrato (S) formando un
complejo enzima sustrato (E-S), el cual se descompone para dar el producto (P) y la
enzima libre (E):
E+S
ES
E+P
Fig. 4. Variacin de la concentracin de las especies qumicas que participan en una reaccin
catalizada por enzimas, en funcin del tiempo.
Tiempo transcurrido
(min)
TRABAJO PRCTICO
DETERMINACIN DE ACTIVIDAD ENZIMTICA
Para la determinacin de la actividad enzimtica se utilizar como modelo de
trabajo la enzima fosfatasa. Esta enzima es de gran inters prctico en clnica humana.
Las fosfatasas (ortofosfrico monoster fosfohidrolasa), son enzimas ampliamente
distribuidas en los sistemas biolgicos, que hidrolizan el enlace ster fosfrico entre un
grupo fosfato y un radical orgnico, liberando fosfato inorgnico. Existen dos tipos de
fosfatasas: alcalinas y cidas. Las alcalinas funcionan a pH bsico (pH ptimo entre 9 y
10) estn presentes en rin, hgado, intestino y hueso. Su concentracin en suero
aumenta en las enfermedades hepatobiliares y seas, entre otras. La medida de niveles
anormales indican la existencia de enfermedades seas degenerativas (raquitismo,
osteomalacia, hiperparatiroidismo secundario, osteosarcoma) o bien daos hepticos. El
aumento fisiolgico de los niveles plasmticos de fosfatasa alcalina se produce en
animales en fase de crecimiento (se est formando tejido seo) o en hembras gestantes
(fosfatasa alcalina de la placenta). El grado de destruccin o dao celular guarda
relacin con la cantidad de enzima presente en suero. La fosfatasa cida no tiene su
funcin an bien conocida, encontrndose principalmente en la glndula prosttica del
adulto y en los eritrocitos. Una fosfatasa cida srica elevada sugiere casi siempre un
carcinoma metastsico, como puede verse en el 80 % de los casos de carcinoma
prosttico.
Como sustrato de la fosfatasa cida utilizaremos un compuesto artificial, el pnitrofenil-fosfato (pNPP), que posee un grupo fosfato en su estructura que es
reconocido e hidrolizado por la enzima fosfatasa cida. El sustrato al ser hidrolizado
origina un producto, el p-nitrofenol (pNP), que es coloreado en medio alcalino y
absorbe a una longitud de onda de 405 nm, por lo que su aparicin en el transcurso de la
reaccin puede seguirse colorimtricamente.
Es posible detener la reaccin de la fosfatasa cida mediante la adicin de
concentraciones elevadas de NaOH, o agregando a la reaccin un exceso de fosfato, que
inhibir la actividad enzimtica.
ACTIVIDADES:
I. Anlisis de datos.
En esta parte del trabajo, usted analizar los resultados de ensayos de tipo
cintico para fosfatasa cida obtenidos por el profesor. Cada grupo de trabajo debe
determinar la concentracin ptima de enzima a utilizar para los ensayos siguientes y
obtener la curva de calibracin para p-nitrofenol.
Para la realizacin de los ensayos realizados y propuestos, se utiliza una
preparacin comercial de fosfatasas cidas, extrada de germen de trigo (Sigma).
MATERIALES Y MTODOS
Ensayo 1: Curva de calibracin para p-nitrofenol.
Se realiz un ensayo espectrofotomtrico para determinar la relacin entre
cantidad de p-nitrofenol (moles p-nitrofenol) y Absorbancia (A, 405 nm). La curva
permitir establecer la cantidad de producto formado en una reaccin enzimtica, a
intervalos de tiempos determinados y en condiciones ptimas de pH y temperatura.
Se tom 6 tubos de ensayo y se agreg 0, 1, 2, 3, 4 y 5 ml de una solucin 60
M de p-nitrofenol (preparada en NaOH 20 mM), respectivamente. Luego, a cada tubo
se aadi suficiente solucin de NaOH 20 mM hasta completar un volumen final de 5
ml. La solucin obtenida fue mezclada y transferida a un tubo de espectrofotmetro y
se midi la absorbancia a 405 nm. El tubo sin p-nitrofenol, fue utilizado como blanco
para ajustar la absorbancia del colormetro a cero.
Ensayo 2: bsqueda de una dilucin adecuada de enzima y Curva de progreso.
El ensayo enzimtico que se utiliza para fosfatasas normalmente es un ensayo de
tiempo fijo, por lo que se debe determinar en primer lugar la dilucin adecuada de
enzima, de modo de obtener una velocidad de aparicin de producto (Vo) constante
durante el tiempo de ensayo. Esto es de vital importancia en el caso de fosfatasas,
debido a que sufren inhibicin por producto.
Dos diluciones de extracto enzimtico fueron preparadas a partir de una solucin
stock de 1 mg/ml. Para esto se tom 0,5 ml de la solucin stock y se complet a 5 ml
con una solucin de BSA al 0,1%. De esa manera obtuvo una dilucin 1:10 del extracto
enzimtico, con concentracin de 0,1 mg/ml. Desde esta dilucin 1:10, se tom una
alcuota de 0,5 ml y se agreg 4,5 ml de una solucin de BSA al 0,1%, obteniendo una
dilucin enzimtica 1:100 (concentracin de la enzima 0,01 mg/ml).
Se prepar 3 tubos, que contenan 2 ml de tampn 0.1 M citrato (pH 4,8) y 2 ml
de 2,5 mM p-nitofenil fosfato disdico (pNPP). Los tubos fueron incubados durante
unos minutos en un bao termoregulado a 37C, para permitir que la solucin alcanzara
la temperatura del ensayo.
La reaccin fue iniciada mediante la adicin de 1 ml de la dilucin enzimtica
indicada anteriormente (sin diluir, dilucin 1:10 y 1:100) en cada tubo, respectivamente.
Resultados:
Ensayo 1: Curva de calibracin para p-nitrofenol.
Tubo
1
2
3
4
5
6
Volumen (ml)
60 M pNP
0
1
2
3
4
5
Concentracin
moles pNP
Absorbancia
405 nm
0,000
0,151
0,296
0,460
0,594
0,746
a) Grafique Abs 405 nm (eje y) versus moles de p-nitrofenol en la muestra (eje x).
Recuerde que la curva de calibracin obtenida ser posteriormente utilizada para la
determinacin enzimtica de la fosfatasa cida.
b) De acuerdo a los resultados obtenidos, indique si la determinacin de p-nitrofenol
obedece la Ley de Lambert-Beer.
Tiempo
(minutos)
0
10
20
30
40
Absorbancia 405 nm
Dilucin 1:10
Extracto enzimtico
(0,1 mg/ml)
(1 mg/ml)
0,091
0,013
0,389
0,059
0,638
0,102
0,835
0,149
0,926
0,184
Dilucin 1:100
(0,01 mg/ml)
0,009
0,022
0,027
0,033
0,135
absorbancia determinada para cada tubo a tiempo 0 a cada uno de los tubos de la serie.
Este valor de Abs distinto a 0 corresponde a coloracin propia de cada mezcla de
reaccin, debido probablemente al extracto enzimtico o degradacin de sustrato.
Tiempo
(minutos)
0
10
20
30
40
c) Grafique la cantidad de producto formado versus tiempo. Decida con cul de las
diluciones enzimticas empleadas se observa un aumento constante en la formacin
del producto (pNP) durante el tiempo de ensayo. Utilice la dilucin enzimtica
seleccionada para sus futuras determinaciones.
e) Calcule la velocidad inicial de reaccin (Vo) en cada caso.
[NOTA: Para la realizacin de los clculos de la cantidad de p-nitrofenol formado, no
olvide que el volumen del ensayo es de 5 ml y que la alcuota del ensayo utilizada (0,5
ml) fue diluida a 5 ml para la determinacin de producto (absorbancia a 405 nm)].