Tema 1. Estructura y Propiedades de Las Principales Biomoleculas

1ema 1.
Lstructura y prop|edades de |as pr|nc|pa|es b|omo|cu|as

8|oqu|m|ca Lstructura| y Metab||ca
1ema 1. Lstructura y prop|edades de |as pr|nc|pa|es b|omo|cu|as
Iess Navas Mndez
1LMA 1. Lstructura y prop|edades de |as pr|nc|pa|es b|omo|cu|as.
Composlcln qulmlca de los seres vlvos. rlnclpales blomoleculas:
amlnocldos, azucares, llpldos, bases y nucleudos. Crupos funclonales.
lsomerla. ropledades nslco-qulmlcas del agua. Solubllldad de las
blomoleculas. lnLeracclones deblles en los slsLemas acuosos. 8egulacln
del pP en los uldos blolglcos. Soluclones Lampn. rlnclpales Lampones
blolglcos.
Iess Navas Mndez
kLLACICN LS1kUC1UkA-IUNCICN
Conocer la esLrucLura de las blomoleculas permlLe expllcar
cul es su funcln blolglca en el organlsmo.
Iess Navas Mndez
IMCk1ANCIA DLL ML1A8CLISMC
- La 8loqulmlca ayuda a enLender cmo funclona el
organlsmo y a me[orar su funclonamlenLo medlanLe la
nuLrlcln y el e[erclclo nslco.
- Los clclos allmenLacln/ayuno marcan la dlreccln de
las vlas meLabllcas.
Iess Navas Mndez
Los seres v|vos son muy var|ados y muy comp|e[os.
Sus componentes estn muy organ|zados.
Iess Navas Mndez
La 8loqulmlca es la clencla que esLudla los seres
vlvos a nlvel molecular medlanLe Lecnlcas y
meLodos nslcos, qulmlcos y blolglcos.
8ICUIMICA: DLIINICICN kINCIICS
Iess Navas Mndez
Iess Navas Mndez
Iess Navas Mndez
CCMCSICICN DL LCS SLkLS VIVCS
SolamenLe unos 30 elemenLos qulmlcos, de los ms de 90 presenLes en la
naLuraleza son, esenclales para los seres vlvos.
La mayorla uenen un numero aLmlco ba[o, por deba[o de 34.
Los ms abundanLes son: P, C, C, n (esLos cuaLro consuLuyen ms del 93
de la masa celular), , S, na, k, Cl (3 de la masa celular).
CllgoelemenLos: le, Mn, Mg, Zn, Mo, Se, eLc. (> 0,01 de la blomasa).
lmpresclndlbles para la acuvldad de clerLas proLelnas.
Iess Navas Mndez
Iess Navas Mndez
LL CAk8CNC
- oco abundanLe en la corLeza LerresLre (0,027). Se encuenLra puro
(graLo, dlamanLe) y comblnado formando sales (carbonaLos).
- Su lmporLancla radlca en su presencla en los seres vlvos.
- Pace 130 anos se le denomln compuesLo orgnlco.
- Cran facllldad para enlazarse con oLros Lomos pequenos. lorma enlaces
senclllos, dobles y Lrlples.
- Ll dlxldo de carbono (CC
2
) es un componenLe secundarlo de la aLmsfera.
ConLrlbuye al llamado efecLo lnvernadero. Ls la fuenLe de C para Lodas las
moleculas orgnlcas halladas en los organlsmos.
- Ll monxldo de carbono (CC) es un gas Lxlco porque lnLerere en la
capacldad de la hemogloblna de unlrse al oxlgeno.
Iess Navas Mndez
8ICMCLLCULAS
La mayorla son compuestos
orgn|cos (esqueleLo
carbonado).
Los C pueden formar cadenas
llneales, ramlcadas y
clrculares.
Al esqueleLo carbonado se le
anaden grupos de oLros
Lomos, llamados grupos
func|ona|es.
Las propledades qulmlcas
vlenen deLermlnadas por los
grupos funclonales.
n de carbono, prote|nas, ||p|dos y c|dos nuc|e|cos.
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GkUCS IUNCICNALLS LN UIMICA CkGNICA
(Lehnlnger)
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kINCIALLS GkUCS IUNCICNALLS
Pldroxllo.
Carbonllo.
Carboxllo.
Amlno.
Sulmldrllo.
losfaLo.
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LS1kUC1UkA
(puede escr|b|rse nC)
NCM8kL DL LCS CCMULS1CS
A|coho|es (sus nombres espec|hcos
norma|mente term|nan en !"#$.
Ltano|, e| a|coho| presente en |as
beb|das a|coh||cas.
kCILDADLS IUNCICNALLS
Ls po|ar, como resu|tado de| tomo de
ox|geno e|ectroneganvo que arrastra
e|ectrones hac|a s| m|smo.
Atrae mo|cu|as de agua, |o que
ayuda a d|so|ver compuestos
orgn|cos, como |os azcares.
LILMLC
Iess Navas Mndez
LS1kUC1UkA
Cetonas, s| e| grupo carbon||o est
dentro de| esque|eto carbonado.
A|deh|dos, s| e| grupo carbon||o est
a| hna| de| esque|eto carbonado.
LILMLC
Una cetona y un a|deh|do son
|smeros estructura|es con d|ferentes
prop|edades, como es e| caso de |a
acetona y e| propana|.
Acetona, |a cetona ms s|mp|e.
ropana|, un a|deh|do
Iess Navas Mndez
LS1kUC1UkA
c|dos carbox|||cos, o c|dos orgn|cos.
LILMLC
1|ene prop|edades c|das porque es una fuente
de |ones h|drgeno.
c|do acnco, que |e da a| v|nagre
su gusto agr|o.
L| en|ace cova|ente entre e| ox|geno y e|
h|drgeno es tan po|ar que |os |ones h|drgeno
nenden a d|soc|arse de forma revers|b|e.
c|do acnco In acetato
Ln |as c|u|as se encuentra en forma |n|ca y
se denom|na grupo carbox||ato.
Iess Navas Mndez
LS1kUC1UkA
Am|na.
LILMLC
Deb|do a que tamb|n nene un grupo carbox||o,
|a g||c|na es tanto una am|na como un c|do
carbox|||co, |os compuestos con ambos grupos se
denom|nan am|noc|dos.
Acta como una base, puede captar
un protn de |a so|uc|n c|rcundante:
(no |on|zado)
Ion|zado, con carga 1+, en cond|c|ones ce|u|ares.
G||c|na.
(|on|zado)
Iess Navas Mndez
LS1kUC1UkA
(puede escr|b|rse nS)
1|o|es.
LILMLC
Ltanono|.
Dos grupos su|m|dr||os pueden
|nteractuar para ayudar a
estab|||zar |a estructura prote|ca.
Iess Navas Mndez
LS1kUC1UkA
Iosfatos orgn|cos.
LILMLC
G||cero| fosfato.
Iorma un an|n en |a mo|cu|a de
|a que forma parte.
uede transfer|r energ|a entre
mo|cu|as orgn|cas.
Iess Navas Mndez
NIVLLLS DL CCMLLIIDAD DL LAS
8ICMCLLCULAS
Moleculas senclllas: meLabollLos y unldades esLrucLurales (glucosa,
plruvaLo, cldos grasos).
Macromoleculas: cldos nuclelcos, llpldos, proLelnas, pollsacrldos.
Iess Navas Mndez
LS1kUC1UkA 1kIDIMLNSICNAL
Lstereoqu|m|ca: dlsLrlbucln de los Lomos de una molecula en el
espaclo Lrldlmenslonal.
Lstereo|smeros: moleculas que conuenen los mlsmos enlaces
qulmlcos pero con dlferenLe conguracln o dlsLrlbucln espaclal.
Iess Navas Mndez
Ismeros estructura|es
Ismeros geomtr|cos
Lnannmeros
Iess Navas Mndez
CCNIIGUkACICN MCLLCULAk
8elacln espaclal enLre los grupos susuLuyenLes de un C. vlene denlda
por la presencla de dob|es en|aces o centros qu|ra|es. La unlca manera
de camb|ar la conguracln es medlanLe la rotura de enlaces covalenLes.
Iess Navas Mndez
CCNICkMACICN MCLLCULAk
oslcln de los Lomos en el espaclo resulLanLe de la roLacln
alrededor de enlaces slmples y sln que lmpllque roLura de enlaces
covalenLes.
C C
P
P
P
P
P
P
Iess Navas Mndez
LAS LS1kUC1UkAS DL LAS 8ICMCLLCULAS LS1N DLIINIDAS
Ck SU CCNIIGUkACICN CCNICkMACICN
La esLrucLura Lrldlmenslonal de las blomoleculas (comblnacln de
conguracln y conformacln) es clave para sus lnLeracclones blolglcas.
L[emplo: unlones enzlma-susLraLo y hormona recepLor.
CrlsLalograna de rayos x.
Ln el clLoplasma las moleculas esLn dlsuelLas o asocladas con oLros
componenLes celulares.
Iess Navas Mndez
LAS IN1LkACCICNLS LN1kL
8ICMCLLCULAS SCN LS1LkLCLSLCIIICAS
D-g|ucosa nLkCUINASA
Iess Navas Mndez
IMCk1ANCIA DL LA 8ICUIMICA LN
LAS CILNCIAS DL LA SALUD
1odas las enfermedades (excepLo las
Lraumucas), uenen un componenLe
molecular.
Los modernos meLodos de
dlagnsuco y las nuevas Leraplas han
senLado las bases de la ato|og|a
Mo|ecu|ar.
Iess Navas Mndez
LILMLCS DL LNILkMLDADLS
MCLLCULAkLS
- Lnfermedades de orlgen heredlLarlo (hemolla, anemlas hemollucas).
- Crandes enfermedades somucas (dlabeLes, cncer).
- Lnfermedades de euologla exgena (lnfecclones, declLs de vlLamlnas).
- Lnfermedades neurolglcas (esqulzofrenla, enfermedades
neurodegenerauvas).
Iess Navas Mndez
AVANCLS LN A1CLCGIA MCLLCULAk
Las leslones moleculares que orlglnan la anem|a fa|c|forme, hbros|s
qu|snca, hemoh||a y oLras enfermedades geneucas han sldo
deLermlnadas a nlvel bloqulmlco.
Se han ldenucado algunos de los mecan|smos mo|ecu|ares que
conLrlbuyen al desarrollo del cncer (enLre ellos, muLaclones en algunos
enzlmas del C1C).
ulseno raclonal de nuevos frmacos, por e[emplo, lnhlbldores de
enzlmas necesarlos para la repllcacln o el clclo vlLal de los vlrus, como
el vlP, o lnhlbldores de proLeln-klnasas como anucancerosos.
8acLerlas y oLros organlsmos pueden usarse como facLorlas para
produclr proLelnas de gran valor, como la lnsullna y esumuladores del
desarrollo de celulas sangulneas.
Iess Navas Mndez
DIAGNCS1ICC
Modlcaclones del pP de uldos blolglcos (orlna y sangre) ree[o
de una paLologla.
ueLeccln de mlcroorganlsmos (bacLerlas y vlrus) medlanLe ensayos
enzlmucos, moleculares (proLelnas y An) e lnmunolglcos
(anucuerpos).
revencln y dlagnsuco de malformaclones congenlLas por anllsls
de celulas feLales.
ueLeccln de marcadores de celulas Lumorales.
Iess Navas Mndez
L| agua es e| med|o b|o|g|co de |a 1|erra y,
pos|b|emente, de otros p|anetas tamb|n.
L| agua es e| d|so|vente de |a v|da.
Iess Navas Mndez
IMCk1ANCIA DLL AGUA AkA LCS
SLkLS VIVCS
- AdapLacln de los organlsmos vlvos al medlo acuoso y
aprovechamlenLo de las propledades del agua.
- Ll agua consuLuye el 60 del peso LoLal de nuesLro organlsmo.
Iess Navas Mndez
CCMAk1IMLN1CS LIUIDCS LN LL
CkGANISMC DL UN VAkCN MLDIC (70 kG)
- Agua corpora| tota| (40 ||tros):
- 23 llLros de llquldo lnLracelular.
- 13 llLros de llquldo exLracelular.
- L|qu|do extrace|u|ar (1S ||tros):
- 10 llLros de llquldo lnLersuclal.
- 3 llLros de sangre.
Iess Navas Mndez
LL AGUA LS LL DISCLVLN1L
DL LA VIDA
- 8ana nuesLras celulas.
- ulsuelve y LransporLa compuesLos en la sangre.
- roporclona un medlo para el LransporLe de moleculas al
lnLerlor de la celula y por los comparumenLos celulares.
- Separa las moleculas cargadas.
- ulslpa el calor.
- aruclpa en las reacclones qulmlcas.
Iess Navas Mndez
Pto. Fusin
C
Pto. Ebull.
C
Q vaporiz.
(J/g)
Agua
0 100 2.260
Metanol
-98 65 1.100
Acetona
-95 56 523
Butano
-135 -0,5 381
CH Cl
3

-63 61 247
Iess Navas Mndez
kCILDADLS DLL AGUA
- Llevados calor especlco y de
vaporlzacln.
- Llevada conducuvldad Lermlca.
- Mxlma densldad a 4C.
- Cohesln. Llevada Lensln
superclal.
(Lehnlnger + CarreL)
Iess Navas Mndez
(Lehnlnger)
LNLACLS Ck ULN1L DL nIDkCGLNC
Iess Navas Mndez
CkDLN DL LLLC1kCNLGA1IVIDAD
LN1kL LLLMLN1CS
l (4,0) > C (3,S) > N, Cl (3,0) > C, S, (2,S) ~ n (2,2), (2,1)
Iess Navas Mndez
LL AGUA CCMC DISCLVLN1L
- CompuesLos polares no cargados: son solubles, debldo a los
puenLes de P en los que paruclpan oLros Lomos
elecLronegauvos como C o n.
- CompuesLos lnlcos: son solubles.
- CompuesLos llpldlcos: se asoclan enLre sl ale[ados del agua.
- Moleculas anpucas: forman mlcelas.
- Los gases apolares (C
2
y CC
2
) se dlsuelven mal en agua.
- Los gases nP
3
, nC y P
2
S son solubles en agua.
Iess Navas Mndez
LL AGUA DISULLVL SALLS CkIS1ALINAS
nIDkA1ANDC SUS ICNLS
Capa de hldraLacln alrededor de los lones
(Lehnlnger)
Iess Navas Mndez
UNA MCLLCULA ACLAk:
LIMCNLNC
Iess Navas Mndez
UNICN LN1kL MCLLCULAS nIDkCIC8ICAS LN MLDIC ACUCSC
Iess Navas Mndez
UNA MCLLCULA ANII1ICA:
ALMI1A1C SCDICC
(Lehnlnger)
Iess Navas Mndez
ICkMACICN DL MICLLAS Ck MCLLCULAS
ANII1ICAS LN SCLUCICN ACUCSA
Iess Navas Mndez
Ll agua es una molecula po|ar, forma puenLes de P
conslgo mlsma y con oLros soluLos. Ll agua es un buen
dlsolvenLe para moleculas polares y soluLos cargados.
Los compuesLos no polares se dlsuelven mal en agua.
Ln conLacLo con ese llquldo forman m|ce|as.
Las lnLeracclones o en|aces db||es son fundamenLales
para el plegamlenLo de macromoleculas como cldos
nuclelcos y proLelnas.
Algunas susLanclas hldrlas no se dlsuelven realmenLe
en el agua. Crandes moleculas o esLrucLuras del
clLoplasma no se dlsuelven slno que forman un co|o|de
(suspensln esLable de paruculas slldas en un llquldo).
Iess Navas Mndez
LA LISC2IMA LS UNA kC1LINA
SCLU8LL LN AGUA
Iess Navas Mndez
LN CCNDICICNLS NA1UkALLS LL AGUA
SL LNCULN1kA DISCCIADA
P
2
0 = 0P
-
+ P
+

Ln el agua pura se dlsocla solamenLe una
molecula de cada 334 mlllones.
[P
+
] = [CP
-
] = 10
-7
M
Aunque la dlsoclacln del agua es
reverslble y esLadlsucamenLe rara, es
muy lmporLanLe para la vlda, ya que los
lones producLo son muy reacuvos.
Iess Navas Mndez
Lscala de pP y valores de pP de algunas soluclones acuosas.
Iess Navas Mndez
CUkVA DL 1I1ULACICN DLL
CIDC ACL1ICC
(CarreL and Crlsham)
lnLervalo de LamponamlenLo: pP 3,76 - 3,76
Iess Navas Mndez
La regu|ac|n de| pn es una acuvldad unlversal y
esenclal de los seres vlvos.
1ampones b|o|g|cos: slsLemas acuosos que
amoruguan las varlaclones en el pP cuando se
anaden pequenas canudades de cldo o de base.
Iess Navas Mndez
LILC1C DLL pn SC8kL LA
AC1IVIDAD LN2IM1ICA
Iess Navas Mndez
VALCkLS DL pn IISICLCGICC
Sangre: enLre 7,36 y 7,44.
lnLracelular: 7,1 (enLre 6,9 y 7,4).
LnLre 6,8 y 7,8 pueden manLenerse la
acuvldad meLabllca del hlgado, los
laudos del corazn y la conduccln
de los lmpulsos nervlosos.
Iess Navas Mndez
Iess Navas Mndez
CIDCS ML1A8CLICCS
AMCk1IGUADCkLS
La acuvldad meLabllca produce P
+
y CC
2
.
Ll cldo producldo se ellmlna como CC
2
en el
alre explrado y como lones en la orlna pero
anLes neceslLa amoruguarse.
Iess Navas Mndez
kINCIALLS SIS1LMAS
AMCk1IGUADCkLS DLL CkGANISMC
8lcarbonaLo (llquldo exLracelular).
Pemogloblna (glbulos ro[os).
losfaLo (lnLracelular).
roLelnas (lnLracelular y plasma).
Iess Navas Mndez
(Lehnlnger)
1AMCN 8ICAk8CNA1C
pka=6,1
Iess Navas Mndez
CC
2

CC
2

n
2
CC
3

n
2
C
nCC
3
-

n
+
keacc|ones metab||cas
Anhldrasa
Carbnlca
nILkVLN1ILACICN ! ba[a la conc. P
2
CC
3
! alcalosls meLabllca.
nICVLN1ILACICN ! sube la conc. P
2
CC
3
! acldosls meLabllca.
(Marks, Marks and SmlLh)
Iess Navas Mndez
CIDC ICSICkICC
Iess Navas Mndez
CCN1kCL DLL pn IN1kACLLULAk
1ampn fosfaLo.
P
2
C
4
-
= PC
4
2-
+ P
+
pka = 7,2
roLelnas.
Iess Navas Mndez
(Lehnlnger)
lmldazol
LL IMIDA2CL DL LAS nIS1IDINAS
AC10A CCMC 1AMCN
pka = 6,0
Iess Navas Mndez
LUILI8kIC CIDC-8ASL
u|mones. ConLrolan el lnLercamblo de dlxldo de carbono
y oxlgeno enLre la sangre y la aLmsfera exLerlor.
Lr|troc|tos. 1ransporLan gases enLre los pulmones y los
Le[ldos (hemogloblna).
k|ones. ConLrolan la concenLracln de blcarbonaLo en el
plasma y excreLan el ln hldrogeno en la orlna.
Iess Navas Mndez
ACIDCSIS ALCALCSIS ML1A8CLICAS
Acldemla (pP sangre <7,33). Causas:
- roduccln exceslva de cldos en los Le[ldos.
- erdlda de bases de los llquldos corporales.
- lallo de los rlnones para excreLar cldos.
Ln la dlabeLes melllLus y en slLuaclones de lnanlcln el pP<7,
depresln del SnC que conduce al coma y a la muerLe.
Alcalemla (pP sangre >7,43).
- vmlLos prolongados.
- lngesun de frmacos alcallnos en exceso.
Se sobreexclLa el SnC y los musculos enLran en esLado de espasmo.
Sl no se corrlge, se producen convulslones y parada resplraLorla.
Iess Navas Mndez
CIDC ICSICkICC
Iess Navas Mndez
kINCIALLS SIS1LMAS
AMCk1IGUADCkLS DLL CkGANISMC
8lcarbonaLo (llquldo exLracelular).
Pemogloblna (glbulos ro[os).
losfaLo (lnLracelular).
roLelnas (lnLracelular y plasma).
Iess Navas Mndez
8I8LICGkAIIA
!"#$%$&"' )'%$*%+,"- ./ 0%.*#"1%-2'3. 3 ed. lreeman, 2009. Caps 1, 2.
45'67- 05-%* 4"8%*5, 0%.*#"1%-2'3. A cllnlcal approach. 3 ed. LWW., 2008. Caps 4, 3.
leduchl y cols. 0%.9:;1%*5< *.$*"+2.- "-"$*%5,"-. anamerlcana, 2011. Cap 3.
8erg, 1ymoczko and SLryer. 0%.*#"1%-2'3= 7 ed. WP. lreeman, 2011. Cap 1.
voeL and voeL. 0%.*#"1%-2'3= 4 ed. Wlley, 2011. Caps 1, 2.
Carreu and Crlsham. 0%.*#"1%-2'3. 4 ed. 2009. Caps 1, 2.
uevlln. >"?2@..6 ./ 0%.*#"1%-2'3 A%2# B,%$%*5, *.''",5C.$-. 7 ed. Wlley, 2010. Cap 1.

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